DÉCOUVRIR OU REDÉCOUVRIR LE WEB OF SCIENCE-WOS CORE COLLECTION-FÉVRIER 2019 - INRA

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DÉCOUVRIR OU REDÉCOUVRIR LE WEB OF SCIENCE-WOS CORE COLLECTION-FÉVRIER 2019 - INRA
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       février 2019
DÉCOUVRIR OU REDÉCOUVRIR LE WEB OF SCIENCE-WOS CORE COLLECTION-FÉVRIER 2019 - INRA
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DÉCOUVRIR OU REDÉCOUVRIR LE WEB OF SCIENCE-WOS CORE COLLECTION-FÉVRIER 2019 - INRA
Qu’est-ce que le WoS Core Collection?

                                         des articles
Multidisciplinaire                      scientifiques,
                      Internationale
sciences, sciences                       des actes de
 sociales, arts et   à prédominance      congrès, des
    humanités        anglo - saxonne       chapitres
                                       d’ouvrages, etc.

   Antériorité
                       + de 18 000     Interrogation sur
pour l’abonnement                         les citations
       INRA :            revues
                       dépouillées     (times cited/cited
 1956 → articles                          references)
      2000 →         252 catégories
   proceedings        disciplinaires    alertes et profils
2005 → ouvrages
                                                             4
DÉCOUVRIR OU REDÉCOUVRIR LE WEB OF SCIENCE-WOS CORE COLLECTION-FÉVRIER 2019 - INRA
L’UNIVERS DU WEB OF SCIENCE                                                                                   Accessibles à            5

                                                                                                                  l’Inra

                                 Plus de 32800 revues actives uniques
                                              Plus de 18000 revues
                                                   WEB OF                                  1600 revues
                 1037 revues                      SCIENCE                                CHINESE SCIENCE
                             FOOD                                                         CITATION INDEX
                          SCIENCE &             Core Collection
                                                                                                                       2356 revues
                         TECHNOLOGY
          8054 revues
                                                                                                  KOREAN JOURNAL
                          ABSTRACTS                                                                 DATABASES
                    CAB                  Science Citation Index Expanded                                     SCIELO
                 ABSTRACTS
                                          Social Sciences Citation Index            REVUES                  CITATION
                                                                                                             INDEX
                                                                                                                        880 revues
       4464 revues                       Arts & Humanities Citation Index
                                       Conference Proceedings Citation Index
                                                                                  RÉGIONALES
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                        HÉBERGÉES              Book Citation Index
                                                                                                               CITATION   3108 revues
                                         Emerging Sources Citation Index                                        INDEX

                                                                                  BASES
                                                                               THÉMATIQUES
                                    AUTRES
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                                                                                                            RECORDS     4967 revues
                             FORMATS (Brevets/Données)
                                                                                                BIOSIS
                                                                                               CITATION
                     DERWENT                                                                    INDEX
                                                                                                       5346 revues
                 INNOVATION INDEX
                                                                               MEDLINE
        30M d’inventions                                                          5500 revues
                               DATA CITATION INDEX
                                    6,5 M jeux de données

+9M proceedings, 1M Ouvrages/chapitres, 2.6M composés chimiques
et 1M réactions
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Qu’est-ce qu’une base de données
bibliographiques ? (1)
   Elle donne accès aux références de documents, appelées notices
    bibliographiques, regroupées et organisées en fichier informatique

   La notice bibliographique :
    •   Décrit les éléments d'une source d'information : ouvrage, article,
        conférence, etc.
    •   L'information est inscrite dans des champs (fields) spécifiques : auteur,
        titre, éditeur, etc.

   Elle fournit une information à valeur ajoutée :
    •   Organisée, structurée
    •   Sélectionnée, validée
    •   Normalisée

                                                                                    6
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Qu’est-ce qu’une base de données
bibliographiques ? (2)

             Auteur(s) : Suau, A ..
                                                        Notice 1
             Titre : Direct analysis of genes..
             Journal : Applied and
             environmental microbiology             Notice 2
             Date :1999
             Vol : 65                                       Notice 3
             N° : 11
             Pages : 4799-4807                          …
             Mots-clés : PHYLOGENETIC ANALYSIS;
             MICROBIAL DIVERSITY; QUANTITATION; …

                                                    Base de données
 Article        Notice bibliographique               bibliographiques

                                                                        7
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Conditions d’accès
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    (personnel non Inra des UMR compris)
    • dossier administratif INRA RH-Access à jour

   Paramétrer son navigateur avec la procédure
    Revelec
    http://www.inra.fr/reselec/Aides/Comment-acceder-aux-
    ressources

                                                            12
Rechercher dans le
             WoS
Les différentes étapes d’une recherche bibliographique

  Rechercher
  • Méthodologie de recherche

      Consulter les résultats
      • Consulter, affiner, analyser les
        résultats, modifier la recherche

          Gérer les résultats
          • Exporter les références, sauvegarder
            l’historique de recherche, créer une alerte

                                                          14
Rechercher
   La recherche peut porter sur plusieurs critères :
    •   un nom d’auteur,
    •   un titre de journal,
    •   un nom d’organisation,
    •   des mots-clés libres, etc.

   Ces critères peuvent être combinés entre eux avec des opérateurs

                                                                       15
Exemple pour une interrogation thématique

                 Effets de la pollution des sols et de l’eau par les
                       métaux lourds sur la santé publique

 Extraire les         pollution         pollution      métaux      santé
 concepts-clés        des sols          de l’eau       lourds     publique

   Traduire en           soil            water         heavy       public
   mots-clés           pollution        pollution      metals      health

 Penser aux
 synonymes,          ground pollution   groundwater   actinium,   Cancer, …
 termes                                 pollution…    barium,
                     contamination                    bismuth…
 génériques,
 termes              accumulation…
 spécifiques

                                                                              16
Méthode de recherche (1)
Les opérateurs booléens et de proximité

       • Réduit la recherche
 AND   • Exemple : soil AND pollution

       • Elargit la recherche
 OR    • Exemple : soil OR pollution

       • Exclut de la recherche
 NOT   • Exemple : soil NOT pollution

     • Deux termes se trouvant dans la même phrase (champ address)
SAME • Exemple : INRA SAME narbonne

     • Deux termes à distance de x mots
NEAR • Exemple : soil NEAR/5 pollution

                                                                     17
Méthode de recherche (2)

      • Les guillemets = pour retrouver une expression exacte
« »   • Exemple : « soil pollution » OR « ground pollution »

      • Zéro ou plusieurs caractères (avant ou après)
 *    • Exemple : *carbon* pour hydrocarbon, polycarbonate…

      • Zéro ou un seul caractère
 $    • Exemple : colo$r pour color, colour

      • Un seul caractère
 ?    • Exemple : en?oblast pour entoblast, endoblast

      • Parenthèses pour grouper des termes reliés par un opérateur
 ()     booléen

                                                                      18
Un exemple de recherche assistée (1)
                                                                          Champs de recherche
                                                                     Topic = Titre + Mots-clés + résumé
                                                               Author Identifiers = ResearcherID ou ORCID iD
                                                                 Funding Agency = Agence de financement
                                                                                      ...

     La lemmatisation est automatiquement appliquée :
 elle permet de retrouver les variantes d’un même mot                       Add row = ajouter
 pluriel (ex : woman/women), les formes conjuguées d’un
 verbe, etc. Cette fonction est désactivée lorsqu’il y a une                  un champ de
 troncature à gauche : ex : *oxide                                             recherche
                                                                                                          19
Un exemple de recherche assistée (2)

                     AND implicite entre les termes

 Opérateurs booléens = AND, OR, NOT

                                                      20
Limiter sa recherche

                             Timespan = limiter la             Dates de
                           recherche dans le temps             publication

                                                                Dates
                                                                d’entrée
                                                                dans
                                                                le WoS
Sous - bases interrogées

                                                     Suggestions sur
                                                       les titres de
                                                          revues

                                                     Choix du nombre
                                                     initial de champs
                                                     de recherche sur
                                                     la page d’accueil
                                                                 21
                                                     « basic search  »
Aides à la recherche : suggestion des noms de journaux

                                                  22
Les différentes étapes d’une recherche bibliographique

  Rechercher
  • Méthodologie de recherche

      Consulter les résultats
      • Consulter, affiner, analyser les
        résultats, modifier la recherche

          Gérer les résultats
          • Exporter les références, sauvegarder
            l’historique de recherche, créer une
            alerte

                                                   23
Consulter les résultats (1)
               Tri des résultats

                                                Citations
                                                 reçues

                                                   Nombre de
                                                consultations du
                                                texte intégral sur
                                               le site de l’éditeur
   Nb de                                               et de
                                                  récupérations
résultats et            Texte intégral ou        dans un outil de
détail de la        localisation d’une revue          gestion
 recherche                                       bibliographique      24
Consulter les résultats (2): accès au texte intégral

                                  Visualisation directe de l’article
                                     sur le site de l’éditeur du
                                               journal

                                     SFX, s’il ne trouve pas de
                                        version électronique
                                      disponible, conduira à la
                                   consultation de BeL-Inra pour
                                    retrouver une version papier
                                         disponible dans une
                                        bibliothèque INRA et
                                        demander une copie

                                                               25
Consulter les résultats (3): accès au texte
intégral
   Vous ne trouvez pas le document que vous recherchez ?

Utilisez le service
ou contactez un documentaliste de proximité géographique qui assure
ce service

                      est accessible à tout utilisateur de l’institut et est
    gratuit.

       Envoyez les coordonnées du document demandé à ist-
dedoc@inra.fr

           Plus d’informations à : https://intranet.inra.fr/ist/Chercher-
Trouver/Demander-un-document

                                                                                26
Consulter les résultats (4) : Affichage d’une référence

                          Informations
                          sur le journal

                                                     27
Consulter les résultats (5) : Affichage d’une référence

                                                    Author Keywords :
                                                     mots-clés auteurs
                                                    Keywords + : mots
                                                   clés obtenus avec un
                                                     algorithme à partir
                                                       des titres des
                                                     références citées

                                Informations sur
                                   les auteurs

                                                                  28
Consulter les résultats (6) : Affichage d’une référence
=> les citations

                                                      Les citations
                    Nb de citations dans Wos Core
                       Collection et classement
                    possible dans les Highly cited
                        paper et/ou Hotpaper

                      Créer une alerte sur citation

                    Citations dans les autres bases
                              de données

                                                               29
Les citations : Les Highly Cited Papers

Intégration dans le WoS des données issues de l’Essential Science Indicators. Les Highly cited
papers sont des papiers appartenant au top 1% des articles les plus cités dans le domaine
thématique de la revue et pour l’année de publication de l’article                       30
Les citations : Les Hot Papers

Intégration dans le WoS des données issues de l’Essential Science Indicators.
Les Hot Papers sont des papiers publiés dans les 2 dernières années et appartenant au top
0,1% des articles les plus cités dans le domaine thématique de la revue                31
Consulter les résultats (7) : View journal information

           Intégration dans le WoS de données issues des Journal Citation Reports.
           En cliquant sur le nom de la revue, vous accédez aux indicateurs fournis
           par le JCR (facteurs d’impact à 2 ans et à 5 ans, rank, quartiles, etc.)

                                                                               32
Affiner les résultats (1)

       Préciser les résultats sur différents critères   33
Affiner les résultats (2) : liste des critères

                                                 34
Selon le WoS
                             http://images.webofknowledge.com/WOKRS5
     Le filtre Open Access   29JR13/help/WOS/hp_results.html?hlsource=
                             Refine_OA_learnmore
                             The OA status of a document can be one of
                             the following:
                             •Gold: A freely accessible final version of an
                             article. Articles are located at a publisher
                             website in one of the following:
                                      •    A journal that publishes only open
                                           access articles.
                                      •    A journal that allows individual
                                           articles to be open access in an
                                           otherwise subscription-based
                                           journal.
                             •Bronze: A freely accessible final version of an
                             article on a publisher's website. These items
                             may reflect archival or promotional content as
                             well as content that the publisher chooses to
                             make free-to-read for the public good. Bronze
                             OA on Web of Science can contain free-to-read
                             copyrighted "public access" versions and free-
                             to-read versions where license information
                             was unidentifiable.
                             •Green: A freely accessible version of an
                             article located in a subject-based repository
               Détails       such as PubMed Central or in an institutional
                             repository. This version of the article may vary
                             from a peer-reviewed accepted manuscript to
Nombre total de              the final published version based on the
                             journal’s policies. Because accepted
publications en OA           manuscripts may vary from the final published
dans les résultats de                                                35 Green
                             versions, they are labelled distinctly as
                             Accepted and Green Published, respectively.
recherche
Analyser les résultats (1)
                  pour savoir quels sont les catégories
                 disciplinaires, les auteurs, les revues, les pays, les
                 institutions qui ressortent le plus dans les résultats

                                                                  36
Analyser les résultats (2)

 Sélection du
critère pour les
    analyses

                             37
Analyser les résultats (3)
                         Affichage des   Télécharger
         Choix de la
                            résultats     une image
         visualisation
                          (jusqu’à 25)    du graphe

                                                          Vue
                                                       graphique
                                                          des
                                                        résultats

                                                          38
Analyser les résultats (4)

     Tri des résultats
         par ordre
    décroissant du nb                                    Mise à jour du tableau
    de publications ou    Affichage des   Seuil du nb      après changement
         par ordre           résultats         de        d’une sélection ou d’un
     alphabétique du      (jusqu’à 500)   publications           critère
    critère sélectionné

                                                               Tableau des
                                                                 résultats

                                                                        39
Analyser les résultats (5)

                                                     Tableau
                                                       des
                                                     résultats

     Pour exclure         Pour voir les
     des résultats   publications du résultat   Export vers un
                           sélectionné
                                                        40
                                                   tableur
Analyser les citations (1)                     pour avoir des indicateurs de
                                                   visibilité sur un ensemble de
                                                   publications

Evolution du nombre      Calcul du H-index et     Total des citations
                                                                        Total des articles qui
d’articles au cours du    de la moyenne de       reçues par les 3023
                                                                           citent les 3023
         temps           citations par article          articles
                                                                          articles (avec ou
                                                 ( avec et sans auto-
                                                                        sans auto-citations)
                                                                                       41
                                                      citations)
Analyser les citations (2)

Les chiffres « cliquables » permettent de naviguer dans le réseau de citations

                                                                            42
Analyser les citations (3)

     Evolution du nombre
     de citations au cours
           du temps

                             Tri des résultats
                                                  Nb de
                                                 citations
                                                    par
                                                  année
                                                    par
                                                  article
                                                      43
Les différentes étapes d’une recherche bibliographique

    Rechercher
    • Méthodologie de recherche

     Consulter les résultats
     • Consulter, affiner, analyser les
       résultats, modifier la recherche

       Gérer les résultats
       • Exporter les références, sauvegarder
         l’historique de recherche, créer une
         alerte

                                                  44
Exporter les résultats
   directement

                                        Exporter vers EndNote (Desktop),
                                              vers EndNote on line
                                         (EndNoteWeb), ResearcherID

                                        Exporter vers les formats Bibtex
                                            (Zotero, Mendeley…),
                                                 Tab-delimited

                Export de 5000 réfs
Imprimer,    (champs author, title et
 envoyer      source au format Tab-
par email   delimited). Au préalable,
            être connecté avec son
               login/password WoS                                  45
Exporter via un panier = Marked List (1)

 pour sauvegarder des listes de références (jusqu’à 50) au cours des différentes
recherches dans le WoS. Chaque liste peut contenir jusqu’à 50 000 références.
 pour avoir plus de choix dans les informations à exporter

                                                                              46
Exporter via un panier = Marked List (2)

                                                50000 réf max/ Marked List
                                               Export par tranche de 500 max

                                            Pour vider le panier

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                                    Gérer* ses
  une Marked
                                   Marked Lists
   List et la
   nommer

   * Condition : avoir créé son compte et                                           47
être identifié dans le WoS (Sign in)
                                                      Choix des champs à exporter
Exporter via un panier = Marked List (3)

                                           Possibilité d’analyser
                 Pour quitter la           les résultats stockés
                  Marked List               dans la Marked List

  Décocher pour enlever
       du panier

                                                               48
Historique de recherche = Search history
              pour sauvegarder ses requêtes, les combiner, les éditer, créer
             des alertes

  Afficher les notices

                                                 Création
                                               d’une 3ème
                                                  étape                     49
Sauvegarder un profil / Créer une alerte (1) :
alerte mail ou flux RSS

                          OU

  L’alerte envoie les
 références nouvelles
    sur la dernière
       question                Condition : avoir créé son compte et
                               être identifié dans le WoS (Sign in)50
S’identifier sur le WoS (1)

Permet :

 - d’enregistrer ses paramètres de recherche

 - de sauvegarder son historique de recherche Saved Searches

 - de sauvegarder jusqu’à 50 Marked Lists

- de mettre en place des alertes Citation Alert

 - de créer une bibliothèque Endnote Online et y exporter les références
trouvées

                                                                           51
S’identifier sur le WoS (2)

   La première fois utiliser « Register » pour
                 s’enregistrer
                                                 52
S’enregistrer sur le Wos (1)

                               Mail reçu

                                     53
S’enregistrer sur le Wos (2)

                               Respecter les
                                « password
                                guidelines »
                                               54
Sauvegarder un profil / Créer une alerte (2) :
alerte mail ou flux RSS

                                        Cocher pour une alerte par email

 Chaque notice reçue en alerte
 contient un lien vers la notice WoS.
 Email au format EndNote : après
 sauvegarde dans un fichier texte,              Flux RSS
 import à l’aide du filtre ISI-CE                                    55
Exécuter / Modifier les profils
  et alertes

   « Open » pour
                          « Renew » pour renouveler
rejouer la recherche
                             l’alerte après 6 mois    56
    sauvegardée
Créer une alerte et recevoir par mail l’alerte
au format pour EndNote (1)

                                     Etape 1 : Dans le
                                     WoS, enregistrer
                                     l’alerte au format
                                     EndNote

                                                          57
Créer une alerte et recevoir par mail l’alerte
au format pour EndNote (2)

                                  Etape 2 : Réception des
                                  résultats dans votre
                                  boîte mail au format
                                  EndNote

                                  Rq : tout en bas du
                                  message, la procédure
                                  pour importer dans
                                  EndNote est expliquée

                                                            58
Créer une alerte et recevoir par mail l’alerte
au format pour EndNote (3)

                                    Etape 3 : Enregistrer le
                                    mail au format fichier .txt

                                                                  59
Créer une alerte et recevoir par mail l’alerte
au format pour EndNote (4)

                           Etape 4 : Ouvrir EndNote,
                           aller dans
                           File>Import>File

                           Etape 5 : Choisir votre
                           fichier .txt et le filtre
                           d’import ISI-CE

                           Etape 6 : Visualiser les
                           références importées
                           dans EndNote

                                                       60
Fonctions avancées
Mode de recherche avancée
                 Plus de champs interrogeables
                 Écrire son équation de recherche directement

                                       Liste des zones
                                        interrogeables

                                                         62
Recherche de références citées (1)

                       1/ Pour trouver les citations de travaux,
                       dont les sources ne sont pas référencées
                       dans le WoS

                                                           63
Recherche de références citées (2)

                       Sélection des
                        références

                                       64
Recherche de références citées (3)

         Les résultats peuvent être affinés
           avec Refine Results, Analyse
                     Results…
                                              65
Recherche de références       2/ pour trouver le nombre précis
citées (4)                    de citations d’un article (car le Time
                              Cited ne concerne que les
                              références exactes et ne prend pas
                              en compte les références erronées)

                 Exemple : combien de fois l’article Barré-Sinoussi F, et
                 al., Isolation of a T-lymphotropic retrovirus from a
                 patient at risk for acquired immune deficiency
                 syndrome (AIDS).Science. 1983 (220):868-871 a été
                 réellemment cité ?

                                                     11 articles citent l’article de
                                                     Barré-Sinoussi et al. de façon
                                                     erronée (mauvaise page,
                                                     erreur de titre, etc.). Ces
                                                     articles ne sont pas pris en
                                                     compte dans le calcul du
                                                     times cited de la référence
                                                     exacte.

                                                        La référence exacte de
                                                        l’article est citée par
                                                        5304 articles

                                                                        66
Recherche assistée d’auteur (1)

                                  67
Recherche assistée d’auteur (2)

                                  68
Recherche assistée d’auteur (3)

                                  69
Pour aller plus loin
Travailler par étapes
 Effets de la pollution des sols et de l’eau par les métaux
               lourds pour la santé publique

Etape 1 : (Soil* OR ground*) AND (pollut* OR contamin* OR
accumulat*)
Etape 2 : (Water* OR groundwater* OR "ground water*" OR
sediment* OR mud*)
Etape 3 : ("heavy metals" or actinium OR barium OR bismuth
OR cadmium OR cesium OR chromium OR cobalt* OR copper*
OR gallium OR germanium OR lead)
Etape 4 : (“public health“ OR cancer)
Etape 5 : Etape-1 AND Etape-2 AND Etape-3 AND Etape-4
                                                         71
WOS : interrogation en langage « libre »
Soil pollution =
 •   (Soil* OR ground*) AND (pollut* OR contamin* OR
     accumulat*)

Water pollution =
 •   (Water* OR groundwater* OR "ground water*" OR
     sediment* OR mud*)

Heavy metals =
 •   ("heavy metals" or actinium OR barium OR bismuth OR
     cadmium OR cesium OR chromium OR cobalt* OR copper*
     OR gallium OR germanium OR lead)
                                  "lead" homonyme "lead to"
Public health =
 •    (« Public health » OR Cancer…)

     « Bruit » apporté par le langage naturel du WoS          72
D’autres supports à votre disposition
   Les tutoriels de Clarivate Analytics

    •   Web of Science training : https://www.youtube.com/user/WoSTraining

    •   Guide complet : http://clarivate.libguides.com/home

                                                                             73
Catalogue des infodoc express                        Service Question / Réponse

                                                      Vous avez des questions sur le processus
                                                        de publication (soumission, réponse à
                                                      l’appel d’un éditeur…), sur la recherche
                                                        d’information ou de sa gestion, sur la
                                                              veille pour votre sujet…?
                                                         Q/R en IST vous répond en 3 jours
ist.blogs.inra.fr/ist/categorie-produit/formations/       ist.blogs.inra.fr/questionreponses
                                                                                                 74
Merci de votre écoute

 formadoc@inra.fr
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