Caractérisation morpho-physiologique et écologie de la germination d'espèces indigènes et endémiques de La Réunion d'intérêt mellifère et ...

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Caractérisation morpho-physiologique et écologie de la germination d'espèces indigènes et endémiques de La Réunion d'intérêt mellifère et ...
Caractérisation morpho-physiologique et
                   écologie de la germination
       d’espèces indigènes et endémiques de La Réunion
                d’intérêt mellifère et médicinal

                                     JOURNÉE DES DOCTORANTS 2019

                                   DOCTORANTE          Maëva NAZE

DIRECTRICE   DE THÈSE   Dr HDR Isabelle FOCK-BASTIDE                CO-ENCADRANT   Eric RIVIERE
Caractérisation morpho-physiologique et écologie de la germination d'espèces indigènes et endémiques de La Réunion d'intérêt mellifère et ...
Parcours                     Comment je suis devenue doctorante

                                                                                                               PROJET DE THÈSE

     2012-2014          2014-2015                     2015-2017                          2017-2018                  2019-2022

DUT Génie          Licence 3              Master Ville et                      Chargée d’études             Doctorante
Biologique         Biologie des           Environnements Urbains               en environnement
Option Génie de    Organismes
l’Environnement    et Populations         Compétences en aménagement           Production d’évaluation
                                          du territoire et en environnement    environnementale de plans,      Financement :
                                                                               schémas et programmes           Allocation Régionale
2 stages dont :    Connaissances en       2 stages dont :                                                      de Recherche
Premier stage de   biologie et en         Stage de Recherche de 4 mois                                         (Région Réunion)
Recherche de       écologie générale      sur deux espèces indigènes
3 mois au sein                            de La Réunion en lien avec la
de l’UMR PVBMT                            conservation de la biodiversité et
                                          l’écologie de la germination

                                                                                                                                      2
Caractérisation morpho-physiologique et écologie de la germination d'espèces indigènes et endémiques de La Réunion d'intérêt mellifère et ...
Contexte        En 2019, au 4ème congrès international sur l’agroforesterie …

           Our planet needs more trees. / Make our planet treed again!
                 Notre planète a besoin de plus d’arbres. / Reboisons notre planète !

                                                                                        3
Caractérisation morpho-physiologique et écologie de la germination d'espèces indigènes et endémiques de La Réunion d'intérêt mellifère et ...
Contexte        Notre vision pour ce projet de Recherche

           L’Homme a besoin de plus d’arbres sur la planète qui l’abrite ...

                                                                               4
Caractérisation morpho-physiologique et écologie de la germination d'espèces indigènes et endémiques de La Réunion d'intérêt mellifère et ...
Contexte                 Pourquoi ?

                                         … pour en récolter les services écosystémiques

D’après :
WWF, 2016
Millenium Ecosystem Assessment, 2005                                                      5
Caractérisation morpho-physiologique et écologie de la germination d'espèces indigènes et endémiques de La Réunion d'intérêt mellifère et ...
Contexte                            À La Réunion ?

   Quelques exemples de services écosystémiques rendus par la biodiversité indigène de La Réunion

 Les Pitons, Cirques et Remparts inscrits                               22 plantes médicinales de La Réunion
 au Patrimoine mondial de l’UNESCO                                      inscrites à la Pharmacopée Française
 sur deux critères :
                                                                        (Giraud-Techer et al., 2016)
 - Biodiversité exceptionnelle
 - Paysage

                                                                                                               6
Caractérisation morpho-physiologique et écologie de la germination d'espèces indigènes et endémiques de La Réunion d'intérêt mellifère et ...
Contexte             Biodiversité singulière mais menacée

                                                                   Prairie de haute altitude

      +70% des habitats indigènes détruits en 4 siècles ...        Végétation éricoïde

                                                                   Végétation éricoïde sur lapillis

                                                                   Fourrés à Petit tamarin des hauts

                                                                   Forêt tropicale humide sous le vent

                                                                   Forêt tropicale humide au vent

    Avant              L’arrivée de l’Homme              Après     Forêt à Tamarins des hauts

                                                                   Fourrés 'perhumides' à Pimpins des hauts

                                                                   Fourrés à Branles

                                                                   Forêt tropicale humide sous le vent
                          Destruction et
                                                                   Forêt tropicale humide au vent
                          fragmentation
                                                                   Fourrés 'perhumides' à Pimpins
                          d’habitats
                                                                   Forêt semi-sèche des fonds de cirque

                                                                   Étangs
                          Espèces exotiques
                          envahissantes                            Coulées de lave récente

                                                                   Végétation littorale

                          Surexploitation                          Savane à lataniers
                          des espèces                              Forêt tropicale de basse altitude

                                                                   Forêt semi-sèche
                          Braconnage

                                                                 Strasberg et al., 2005                   7
Caractérisation morpho-physiologique et écologie de la germination d'espèces indigènes et endémiques de La Réunion d'intérêt mellifère et ...
Contexte    Biodiversité singulière mais menacée

                                  … et dans le futur ?

    Avant     L’arrivée de l’Homme                   Après   Futures menaces ?

                                                                     +
                Destruction et
                fragmentation                                 Pression sur le
                d’habitats                                    foncier avec la
                                                              croissance
                                                              démographique
                Espèces exotiques
                envahissantes

                Surexploitation
                des espèces

                Braconnage

                                                               Strasberg et al., 2005   8
Caractérisation morpho-physiologique et écologie de la germination d'espèces indigènes et endémiques de La Réunion d'intérêt mellifère et ...
Contexte       Verrou

                            Manque de connaissances sur la biologie et l’écologie
                            des espèces indigènes et endémiques de La Réunion

                                  Évaluation du niveau de remplissage des fiches ITP
                                                        DAUPI
Extrait bilan DAUPI, 2018                                                              9
Caractérisation morpho-physiologique et écologie de la germination d'espèces indigènes et endémiques de La Réunion d'intérêt mellifère et ...
Contexte             Une des clés : la Recherche-Action

              « Accroître le savoir par l’action et rendre l’action plus efficace par le savoir »
#DAUPI

         Démarche
         Aménagement
         Urbain                                                                                         GERMENDEMIK

         et Plantes                                                                                     Thèse de
         Indigènes                                                                                      Cédric Leperlier
                                                 ACTION                         RECHERCHE                      (2016-2019)

                                                                                                        Thèse de
                                                                                                        Maëva Naze
                                                                                                               (2019-2022)

                                                                                 In Mémento du forestier tropical      10
Thèse                  Objectifs et structure de ma thèse

                  Elargir les données écologiques, physiologiques et génétiques
 sur un cortège d’espèces indigènes et endémiques de La Réunion d’intérêt mellifère et médicinal

                                  Semencier

                                              Caractériser les formes florales du Tan rouge et ses implications physiologiques
          Volet 1    TAN ROUGE                sur la production de semences

                                              Evaluer la différenciation phénotypique et génétique du Fleur jaune
          Volet 2   FLEUR JAUNE               le long d’un gradient altitudinal

                                              Etudier le comportement à la conservation et les stratégies de germination
          Volet 3      CORTÈGE                d’un cortège d’espèces ciblé

                                  Semences

                                                                                                                                 11
Volet 1                Weinmannia tinctoria Sm., Tan rouge

                        Une espèce d’intérêt mellifère d’intérêt scientifique

                                  Semencier

                                               Caractériser les formes florales du Tan rouge et ses implications physiologiques
          Volet 1    TAN ROUGE                 sur la production de semences

                                               Evaluer la différenciation phénotypique et génétique du Fleur jaune
          Volet 2   FLEUR JAUNE                le long d’un gradient altitudinal

                                              Etudier le comportement à la conservation et les stratégies de germination
          Volet 3      CORTÈGE                d’un cortège d’espèces ciblé

                                  Semences

                                                                                                                                  12
Weinmannia tinctoria Sm.
Volet 1
          Tan rouge                  Une espèce d’intérêt mellifère d’intérêt scientifique

           Question(s)         Existe-t-il différentes "formes sexuées" chez Weinmannia tinctoria
          de recherche         et comment les caractériser ?

                          3 formes sexuées potentielles ?

                                                                                              Caractérisation des traits floraux

                                                                                             Au niveau du pistil et des étamines

                                                                                              Caractérisation du pollen

                                                                                             Test de la vigueur du pollen in vitro

                 Mâle ?          Femelle ?                  Hermaphrodite ?

                                                                                                                  JM SARRAIHL        13
Weinmannia tinctoria Sm.
Volet 1
          Tan rouge                         Une espèce d’intérêt mellifère d’intérêt scientifique

           Question(s)               Existe-t-il différentes "formes sexuées" chez Weinmannia tinctoria
          de recherche               et comment les caractériser ?

                         Caractérisation des semences par
                                                                                Eléments du protocole
                         type de semencier/forme florale

                          Au niveau du fruit
                                                                           Comptage
                         Nombre de graines

                          Au niveau de la graine                           Coupe de 50 graines par individu
                                                                           sous loupe binoculaire
                         Caractérisation interne                            2 modalités (pleine ou vide)

                                                                           Test de germination à 20°C, photopériode 12/12H
                          Pouvoir germinatif
                                                                           pour chaque individu

                                                                                                                             14
Weinmannia tinctoria Sm.
Volet 1
          Tan rouge                  Une espèce d’intérêt mellifère d’intérêt scientifique

           Question(s)        Existe-t-il différentes "formes sexuées" chez Weinmannia tinctoria
          de recherche        et comment les caractériser ?

                          Suivi phénologique mensuel
                         sur 10 individus par population                                 Traits phénologiques suivis

                                                                                     •     Boutons
                                                                                     •     Fleur
                                                                                     •     Fruits verts/fruit mûrs
                                                                                     •     Jeunes feuilles/perte de feuilles

                                                                                         Suivi phénophase par classe

                                                                                     1. Aucune feuille, ni fleur, ni fruit
                                                                                     2. 0 à     5%
                                                                                     3. 5 à 25 %
                                                                                     4. 25 à 50 %
                                                                                     5. 50 à 100 %

                                                                                                       Méthode de Dafni (1992)
                                                                                                         avec classes adaptées   15
Volet 2                Hypericum lanceolatum Lam., Fleur jaune

                            Une plante médicinale d’intérêt scientifique

                                  Semencier

                                              Caractériser les formes florales du Tan rouge et ses implications physiologiques
          Volet 1    TAN ROUGE                sur la production de semences

                                              Evaluer la différenciation phénotypique et génétique du Fleur jaune
          Volet 2   FLEUR JAUNE               le long d’un gradient altitudinal

                                              Etudier le comportement à la conservation et les stratégies de germination
          Volet 3      CORTÈGE                d’un cortège d’espèces ciblé

                                  Semences

                                                                                                                                 16
Hypericum lanceolatum Lam.
Volet 2
           Fleur jaune               Une plante médicinale d’intérêt scientifique

      Intérêt anthropique              Intérêt scientifique
    Inscrite à la Pharmacopée         Deux sous-espèces et
    Française depuis 2013             des formes intermédiaires
                                                                                              2400m

                                                                           Hypericum lanceolatum
                                                                            subsp. augustifolium
                                                                                                                    Feuille X2    Pistil X2
                                                                         1900m

                                                                1800m              Formes
                                                                             intermédiaires

                                                      1500m

                                    Hypericum lanceolatum
                                      subsp. lanceolatum
                                                                                                                                 © Maëva Naze
          Feuille X2   Pistil X2
                                   550m           Gradient altitudinal

                                                                                                   Flore des Mascareignes, Bösser             17
Hypericum lanceolatum Lam.
Volet 2
              Fleur jaune                                   Une plante médicinale d’intérêt scientifique

              Question(s)                                 Quelles sont les différentes formes morpho-physiologiques
             de recherche                                 d’Hypericum lanceolatum le long d’un gradient altitudinal ?

                                                                                                      Mesures morphométriques
                                                            Dioré
                                         Plaine des
                                Roche                                                     Exemples de                   Exemples de
                                          Fougères
                                Ecrite                                                    traits floraux                traits foliaires

                                                                                                                                                              Définition de
                  Maïdo                                                                                                                                         groupes
                                                                                                                                                             morphologiques

                                                                                                                                   
                                                      Massif du
              Makes                                                                           Largeur de l’ovaire         Présence/absence de
                                                      Piton de la                             Longueur de l’ovaire        nervures secondaires
                                                      Fournaise
                                                                                              Couleur du pistil

                                                                                                                                             Définition de
          Populations ciblées
                                                                Suivi phénologique sur 90 individus (30 pour 3 populations)                    patrons
          prioritairement                                                                                                                   phénologiques
                                                                                                                                                                      18
Hypericum lanceolatum Lam.
Volet 2
           Fleur jaune                     Une plante médicinale d’intérêt scientifique

            Question(s)
           de recherche               Quelle est la plasticité phénotypique d‘H. lanceolatum ?

                                                              L’altitude la plus élevée

                                                                   2 pépinières sur
                                                              la commune du Tampon

                                                              L’altitude la plus basse

                                                                 Stations du 3P +
             © Maëva Naze                                        de l’ARMEFLHOR

                                                             Répartition de 50 plants     Suivi de l’évolution des traits
          200 plants microbouturés par sous-espèce
                                                             par station                  morphologiques et physiologiques

                                                                                                                             19
Hypericum lanceolatum Lam.
Volet 2
          Fleur jaune        Une plante médicinale d’intérêt scientifique

           Question(s)   Les différences morphologiques et le patron phénologique observés
          de recherche   sont-ils congruents avec une différenciation génétique ?

                                                      Marqueurs microsatellites (en cours de développement)
                                                                         16 amorces marquées à tester

                                           Echantillonnage de feuilles des populations ciblées (30 individus/population)
                                         Mêmes individus étudiés pour la caractérisation morpho-physiologique et le suivi phénologique

                                                                         Génotypage et analyse

                                                                                                                                         20
Volet 3                Cortège

                        Ecologie de la germination sur un cortège d’espèces
                      indigènes et endémiques d’intérêt mellifère et médicinal

                                  Semencier

                                              Caractériser les formes florales du Tan rouge et ses implications physiologiques
          Volet 1    TAN ROUGE                sur la production de semences

                                              Evaluer la différenciation phénotypique et génétique du Fleur jaune
          Volet 2   FLEUR JAUNE               le long d’un gradient altitudinal

                                              Etudier le comportement à la conservation et les stratégies de germination
          Volet 3      CORTÈGE                d’un cortège d’espèces ciblé

                                  Semences

                                                                                                                                 21
Ecologie de la germination sur un cortège d’espèces
Volet 3
          Cortège                               indigènes et endémiques d’intérêt mellifère et médicinal

                                    Peut-on définir des stratégies de germination et un comportement
           Question(s)
          de recherche              à la conservation communs aux espèces indigènes et endémiques
                                    dans les habitats où l'on rencontre W. tinctoria et H. lanceolatum ?

                         H. lanceolatum

                                                                         Hubertia tomentosa         Phylica nitida

                                      Forgesia racemosa

                                                                                                    Erica reunionensis
                                                                      Stoebe passerinoides

                              W. tinctoria

                                  Nuxia verticillata
                                                                                                              © Maëva Naze

                         Espèces ciblées sur Cyathea glauca
                             en forêt tropicale humide                 Espèces ciblées dans la végétation ericoïde
                                                                                                                             22
Ecologie de la germination sur un cortège d’espèces
Volet 3
          Cortège                          indigènes et endémiques d’intérêt mellifère et médicinal

                                     Peut-on définir des stratégies de germination et un comportement
           Question(s)
          de recherche               à la conservation communs aux espèces indigènes et endémiques
                                     dans les habitats où l'on rencontre W. tinctoria et H. lanceolatum ?

                                                            Test de conservation

            Modalités de température                                         Modalités de temps de conservation

               Température ambiante                    T0         T+3 mois             T+6 mois                                  T+12 mois

               Chambre froide (6-8°C)
                                                                Lancement de test de germination pour chaque modalité de température
                                                                (5 répétitions de 20 graines)

               Congélateur (-18°C)

                                                                                                                                             23
Ecologie de la germination sur un cortège d’espèces
Volet 3
          Cortège                        indigènes et endémiques d’intérêt mellifère et médicinal

                                  Peut-on définir des stratégies de germination et un comportement
           Question(s)
          de recherche            à la conservation communs aux espèces indigènes et endémiques
                                  dans les habitats où l'on rencontre W. tinctoria et H. lanceolatum ?

                                          Test de germination (5 répétitions de 20 graines)

                    Variable

             Traitement pré-germinatif      Ex : acide gibbérellique

             Température                        15, 20 ou 25°C                                        © Maëva Naze

                                                                                  Réglage
                                                                                 armoire      1 répétition de 20 graines de
                                                                                climatique    Forgesia racemosa sur coton
             Photopériode                           12/12H

                                                                                                                          24
Ecologie de la germination sur un cortège d’espèces
Volet 3
            Cortège                              indigènes et endémiques d’intérêt mellifère et médicinal

           Rendre l'action plus              Comment optimiser le taux et la vitesse de germination et les étapes
          efficace par le savoir ...         post-germination de « petites graines » potentiellement photosensibles ?

                                                            •   L’acide gibbérellique pourrait-il lever la photosensibilité des graines ?
                       Traitement pré-germinatif            •   L’eau fumée peut-elle se substituer à ce produit relativement cher à
                                                                grand volume ?

                                                            Test de matériaux de substitution au broyat de fougères
                             Substrat de semis
                                                             Fibre de coco

                                                                                                                                            25
Conclusion

                                                    Objectif général
                              Elargir les données écologiques, physiologiques et génétiques
                                    sur un cortège d’espèces indigènes et endémiques
                                        de La Réunion d’intérêt mellifère et médicinal

    Quelles retombées possibles ?                                                      Quels bénéficiaires ciblés ?
                                                        Caractérisation
•    Scientifique : contribuer au                 morpho-physiologique et            Communauté scientifique
     renforcement des connaissances sur           écologie de la germination         Aménageurs
     les espèces indigènes en milieu                d’espèces indigènes et           Pépiniériste
     insulaire tropical                          endémiques de La Réunion            Gestionnaire de la Nature
•    Socio-économique : mettre au              d’intérêt mellifère et médicinal      Population
     point des itinéraires techniques
     (depuis la récolte)
•    Territoire : valoriser le patrimoine
     naturel et culturel de La Réunion

                                                                                                                  26
Références bibliographiques

Dafni, A. (1994). Pollination Ecology: A Practical Approach. Brittonia. 46. 10.2307/2807163.

Giraud-Techer, S., Amédée J., Girard-Valenciennes, E., Thomas, H., Brillant, S, Grondin, I. et al. (2016). Plantes médicinales de La Réunion
inscrites à la Pharmacopée française Ethnopharmacologia 56:7–33.

Jankova, E., & Yurukova-Grancharova, P., & Vitkova, A. (2013). Reproductive biology of the Balkan endemic Sideritis scardica (Lamiaceae).
Botanica Serbica. 37. 83-87.

Louppe, D. & Mille,. (2015). Le Mémento du forestier tropical. Versailles : Ed. Quae, 1198 p. ISBN 978-2-7592-2340-4

MEA (Millenium EcosystemAssessment). (2005). Rapport de synthèse de l’Évaluation des Écosystèmes pour le Millénaire. Rapport technique.

Rivière, J.-N, Hivert, J. & Schmitt, L., Derroire, G., & Sarrailh, J.-M & Baret, S. (2008). Rôle des fougères arborescentes dans l'installation des
plantes à fleurs en forêt tropicale humide de montagne à La Réunion (Mascareignes, Océan Indien). Revue d'écologie (Terre et Vie). 63. 199-
207.

Strasberg, D., Rouget, M., Richardson, D. M., Baret, S., Dupont, J., & Cowling, R. M. (2005). An assessment of habitat diversity and
transformation on La Réunion Island (Mascarene Islands, Indian Ocean) as a basis for identifying broadscale conservation priorities.
Biodiversity & Conservation. 14(12), 3015-3032.

                                                                                                                                                      27
Merci de
votre attention !
   maeva.naze@univ-reunion.fr

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