DATA MANAGEMENT PLAN (DMP) - COMMENT REMPLIR LE DMP DU FNS ? - Université de Genève

 
CONTINUER À LIRE
DATA MANAGEMENT PLAN (DMP) - COMMENT REMPLIR LE DMP DU FNS ? - Université de Genève
DATA MANAGEMENT PLAN (DMP)

       COMMENT REMPLIR LE DMP DU FNS ?
researchdata-info@unige.ch               Mars 2019

Division de l’information scientifique
DATA MANAGEMENT PLAN (DMP) - COMMENT REMPLIR LE DMP DU FNS ? - Université de Genève
2

                PLAN

A propos des données de recherche et des
exigences du FNS

Découverte du plan de gestion des données
(Data Management Plan – DMP)

L’essentiel en bref

Nos services pour rédiger votre DMP
DATA MANAGEMENT PLAN (DMP) - COMMENT REMPLIR LE DMP DU FNS ? - Université de Genève
3

WWW.UNIGE.CH/RESEARCHDATA
DATA MANAGEMENT PLAN (DMP) - COMMENT REMPLIR LE DMP DU FNS ? - Université de Genève
4

                POLITIQUE UNIGE

 Adoption par le rectorat, après concertation
   avec les décanats

 1ère haute école de Suisse avec une politique
   sur la gestion des données de recherche

 Définition des responsabilités :
      de l’Université
      des chercheuses et chercheurs

https://www.unige.ch/researchdata/fr/services/all/politique/
DATA MANAGEMENT PLAN (DMP) - COMMENT REMPLIR LE DMP DU FNS ? - Université de Genève
5

          DONNÉES DE LA RECHERCHE                                          ?

Enregistrements factuels (chiffres, textes, images et
sons), qui sont utilisés comme sources principales
pour la recherche scientifique et sont généralement
reconnus par la communauté scientifique comme
nécessaires pour valider des résultats de recherche.

Principes et lignes directrices de l'OCDE pour l'accès aux données de la recherche
financée sur fonds publics, 2007, p. 18
http://www.oecd.org/fr/sti/sci-tech/38500823.pdf
DATA MANAGEMENT PLAN (DMP) - COMMENT REMPLIR LE DMP DU FNS ? - Université de Genève
6

  TYPES DE DONNÉES DE RECHERCHE

observationnelles             dérivées /
                              compilées

                 simulées /
                 modélisées

expérimentales                   de références
DATA MANAGEMENT PLAN (DMP) - COMMENT REMPLIR LE DMP DU FNS ? - Université de Genève
7

            DONNÉES DE RECHERCHE EN SHS
                                                                                Données
          Données
                                                                                résultats
          sources
                                                                               (générées)

                      • Documents texte                                                       •    Textes
                        (corpus)                                                              •    Tableaux
                      • Enquêtes et                                                           •    Bases de données
                        entretiens                                                            •    Visualisations ou modèles
                      • Observations                                                               multidimensionnels
                      • Expériences                                                           •    Enregistrements audio
                      • Archives                                                              •    Enregistrements
                      • Statistiques                                                               audiovisuel
                      • Photos d’objets                                                       •    Photos
                      • Documents audio                                                       •    Cartes et plans
                      • Documents                                                             •    Programmes et
                        audiovisuels                                                               applications
                      • …                                                                     •    …

Selon : Prost, Hélène & Schöpfel, Joachim. Les données de la recherche en SHS. Une enquête à l’Université de Lille 3. Lille, 2015
DATA MANAGEMENT PLAN (DMP) - COMMENT REMPLIR LE DMP DU FNS ? - Université de Genève
8

SOURCES -> DONNÉES -> PUBLICATIONS

                                            Thèses, Livres, Articles,
                                                  Rapports

                                               Publication

                                Données de recherche
                                 Bibliographies, transcriptions, analyses,
                                           essais, simulations..

                                      Sources primaires
                         Documents d’archives, lettres, littérature, partitions,
                                relevés, séquençage, enquêtes..

Selon : Andorfer P. Forschen und Forschungsdaten in den Geisteswissenschaften: Zwischenbericht einer
Interviewreihe: Niedersächsische Staats-und Universitätsbibliothek Göttingen; 2015.
DATA MANAGEMENT PLAN (DMP) - COMMENT REMPLIR LE DMP DU FNS ? - Université de Genève
9

 CYCLE DE VIE DES DONNÉES

                  CRÉATION
                 des données

RÉUTILISATION                  TRAITEMENT
 des données                   des données
                   Data
                Management
                   Plan
    MISE À                      ANALYSE
 DISPOSITION
 des données                   des données

                PRÉSERVATION
                 des données
DATA MANAGEMENT PLAN (DMP) - COMMENT REMPLIR LE DMP DU FNS ? - Université de Genève
10

        FAIR = BONNES PRATIQUES

Trouvables,                                       Lisibles,
Cherchables                                    Accessibles
(machine)                                        (humain)

                                               Structurées,
Exploitables,                                        Liées,
Réutilisables                                  Compatibles
                http://www.datafairport.org/
11

PLAN DE GESTION DES DONNÉES

            • Gagner du temps

            • Augmenter l’impact de
              votre recherche

            • Participer à la science
              ouverte

            • Faciliter de nouvelles
              découvertes
12

DÉPÔT D’UNE REQUÊTE AU FNS
13

LE DMP SUR MYSNF
14

     1. Collecte des données et documentation

 Type

 Format

 Volume

Lettres      STM 1        SSH       STM 2       Suite
15

Les données existantes qui seront réutilisées dans le cadre du projet incluent des
transcriptions de textes, des images en fac-similé, et des fichiers audio qui font partie de la
base de données Australian Drama Archive
https://www.austlit.edu.au/australiandramaarchive
Le projet lui-même génèrera les types de données suivants :
• Des transcriptions de textes de pièces de théâtre plus anciennes que celles actuellement
  dans la base Australian Drama Archive. Celles-ci seront produites en au format XML ouvert
  .docx en cours de projet.
• Des images. Quand pertinent, des photographies seront faites pour rendre compte de
  certaines caractéristiques des textes originaux ou publications éphémères identifiés au
  cours des recherches menées dans divers services d’archives. Environ 500 photographies
  seront réalisées en haute résolution (2000 x 3000 pixels) au format .jpg
• Tableaux et données chiffrées au format .xlsx, relevant diverses caractéristiques des
  monologues trouvées dans les pièces de théâtre plus anciennes.
On estime à ce stade que le volume total de données générées n’excédera pas 20 GB mais ce
chiffre sera affiné en fin de phase de recherches dans les divers services d’archives, en fin de
première année.

     Lettres               STM 1                  SSH                 STM 2              Suite
16

This project will generate three main types of raw data:
  1. Images from transmitted-light microscopy
  2. Images from confocal microscopy
  3. Western blot data.
Measurements and quantification of the images will then be recorded in
spreadsheets.
Images will be stored as .tif Data in spreadsheets will be stored as .csv Data in
freetext documents will be stored as .txt.
Micrograph data is expected to total between 100GB and 1TB over the course of
the project. Scanned images of western blots are expected to total around 1GB
over the course of the project. Other derived data (measurements and
quantifications) are not expected to exceed 10MB.

    Lettres            STM 1              SSH              STM 2           Suite
17

Notre étude va produire deux types de données :
  • Des entretiens avec les étudiant·e·s sélectionné·e·s ; ils seront enregistrés
      en format .wav, retranscrits en format PDF (via Word) puis synthétisés
      dans un fichier Excel.
  • Des tests de connaissance, passés par les mêmes étudiant·e·s, sous forme
      de questionnaires en ligne ; les résultats seront sauvegardés sous forme de
      fichiers Excel.
D’après nos estimations, nous produirons environ 1 T de fichiers audio, 10 Mo
de fichiers PDF et 5 Mo de fichiers Excel.

    Lettres           STM 1              SSH             STM 2          Suite
18

Qualitative (e.g. phenotyping data for cell lines), quantitative (e.g. cell counts), mass
spectrometry and image data will be generated. Raw data will be analysed and expressed
as graphs, tables and annotated images.
Data generated will be in various formats and sizes of datasets. They include:
1. Cell images e.g. phase and fluorescence, and electron micrographs (~5,000 images
    over project). Software used includes OpenLab, Softworx and IN Cell Investigator, with
    data saved as software-specific files e.g liff and lg3 files, as well as generic formats such
    as jpeg, tiff etc.
2. mass spectrometry spectra (from
19

       1. Collecte des données et documentation

 Standards

 Méthode

 Versions et noms des fichiers

  Lettres      STM 1         SSH      STM 2       Suite
20

Tous les fichiers de données descriptives crées par les assistants de recherche suivront les
conventions de nommage définies par la requérante. Par exemple, chaque fichier en lien avec
un fragment de papyrus devrait être nommé avec : la date de transcription, les initiales de
l’assistant de recherche, le nom de la collection, l’ « identifiant sujet » unique du fragment (par
ex: BF18954) qui forme la base du nom de fichier, l’étape dans le processus de recherche.

        Ex : un fichier résultant de l’étape de collecte sera nommé :
        20180528_BC_ Oxyrhynchus_BF18954_collecte.txt

La requérante est en charge d’effectuer le contrôle de la qualité des données, quand celles-ci
sont téléchargées de façon hebdomadaire par les assistants de recherche.

     Lettres               STM 1                  SSH                 STM 2             Suite
21

Giemsa-stained squashed larval brains will be used for transmitted-light microscopy and of
immunostained whole-mounted larval brains will be used for confocal microscopy.
All samples on which data are collected will be prepared according to published standard
protocols in the field. All microscopes used for sample examination are serviced and
recalibrated regularly. All Drosophila lines used in experiments are checked periodically for
phenotypic markers. Drosophila are maintained in live culture according to standard methods
in the field.
Files will be named according to a pre-agreed convention:
   for images from transmitted-light microscopy (TLM) and from confocal microscopy (COM)
   and for quantifications (QUA), we will add the date (YYMMDD), the initials of the
   researcher (XY) and the version number V1, V2…):
     TLM_YYMMDD_TLM_XY_V1.tif
     COM_ YYMMDD_TLM_XY_V1.tif
     QUA_ YYMMDD_TLM_XY_V1.csv

     Lettres              STM 1                 SSH                STM 2            Suite
22

Les données seront récoltées selon des méthodes standardisées, respectant la pratique
en vigueur dans les sciences sociales.
Le dossier contenant les résultats de l’étude sera organisé ainsi :
  • Etude FNS
     • Entretiens
          • Fichiers audio
          • Transcriptions
          • Synthèse
     • Questionnaires
Chaque dossier et sous-dossier contiendra les documents à jour et un sous-dossier
nommé ‘Archives’ dans lequel seront stockés les versions précédentes des documents.
Les documents seront systématiquement nommés selon la convention suivante :
 • [type de donnée]_[type de fichier]_[date de collecte] _[initiales du
   chercheur]_[numéro de l’enregistrement dans la journée] _[version]
        Ex. : entretien_transcription_20181102_GB_2_v1

     Lettres             STM 1                 SSH                STM 2      Suite
23

All samples on which data are collected will be prepared according to published standard
protocols in the field.
Quality of analytical data will be guaranteed through calibration of devices and
comparison with internal standards. Appropriate experimental design, data recording and
data validation (controls, randomization/ blinding, sampling/replicates, experimental
versus hypothesis driven-protocol) will be used, ensuring internal validity.
Methods and materials will be recorded using an Electronic Lab Notebook (ELN). All
experimental data will be automatically imported into a Laboratory Information
Management System (LIMS) from the measurement device.
Files will be named according to a pre-agreed convention including a short, unique
identifier for the project, a summary of the content, the date (YYYYMMDD format) and the
document version. Ex. filename structure: YYYYMMDD_ProjectIDX_ContentSummary_V01
We will organize the project’s datasets and documents into a pre-defined folder structure,
which will be accompanied by a README file describing the directory hierarchy.
Peer review will be employed as an additional step of quality control in the form of regular
supervision and lab meetings.                               (eg from DMP Canva Generator, VitalIT)

       Lettres              STM 1                 SSH                 STM 2             Suite
24

       1. Collecte des données et documentation

 Infos nécessaires pour futurs utilisateurs

 Annotations

  Lettres       STM 1         SSH          STM 2   Suite
25

Chaque jeu de données sera accompagné d’un fichier readme.txt avec notamment le nom du
projet, les noms des assistants de recherche et de la requérante, les dates de première et de
dernière créations de données, et un résumé de la méthodologie ainsi que des outils
analytiques utilisés pour la collecte et le traitement de ce jeu de données-
Tous les jeux de fichiers de données descriptives au format XML seront basés sur le standard
de métadonnées Dublin Core. Parmi ce standard, un ensemble commun d’éléments/tags sera
choisi dès le lancement du projet par l’ensemble de l’équipe pour assurer la cohérence des
données.
Ces choix seront documentés et accessibles à tous les membres de l’équipe pour toute la
durée du projet et viendront s’ajouter, sous forme d’un fichier readme.txt, aux jeux de
données en fin de période de financement.
Avec l’aide des services informatiques de l’institution, la requérante préparera aussi la
documentation technique sur le logiciel VSim développé pour les besoins du projet
(informations sur l’environnement de développement, caractéristiques des différentes
versions jusqu’à la version finale…).

     Lettres               STM 1                 SSH                 STM 2             Suite
26

The dataset will be accompanied by a README file which will describe
the directory hierarchy and filenaming convention. Each directory will
contain an INFO.txt file describing the experimental protocol used in that
experiment. It will also record any deviations from the protocol and
other useful contextual information. Microscope images capture and
store a range of metadata (field size, magnification, lens phase, zoom,
gain, pinhole diameter etc) with each image. This should allow the data
to be understood by other members of our research group and add
contextual value to the dataset should it be reused in the future.

    Lettres         STM 1            SSH             STM 2        Suite
27

Un fichier de métadonnées, intitulé README, sera sauvegardé au premier
niveau de l’arborescence du dossier ‘Etude FNS’. Il contiendra les informations
suivantes :
    • Les noms des chercheurs ayant participé à l’étude
    • Une description des méthodes employées pour collecter les données
    • Les dates auxquelles la collecte a eu lieu
    • Une description de l’arborescence du dossier, des types de données qui
       se trouvent dans chaque sous-dossier et de la convention de nommage
       des fichiers
    • Une explication des intitulés et conventions utilisés dans les fichiers
    • Les conditions d’accès aux données (licence), durant l’étude et après
       celle-ci

   Lettres           STM 1              SSH             STM 2          Suite
28

A README file will describe the directory hierarchy.
The version of each software and library will be documented for each set of results in a
text file e.g. INFO.txt.

The final datasets as deposited in the chosen data repositories will be accompanied by the
relevant metadata documentation. Specifically:
• For our Microscopy image dataset, associated metadata will be compliant with OME-
   XML standard (https://docs.openmicroscopy.org/ome-model/5.5.7/ome-
   xml/index.html).
• For our Molecular Biology dataset, associated metadata will be compliant with DataCite
   standard (https://schema.datacite.org/).
This will ensure that our produced data can be analyzed together with other data types
during the project and following project completion
                                                             (eg from DMP Canva Generator, VitalIT)

       Lettres             STM 1                SSH                STM 2                Suite
29

    SOURCE POUR LES MÉTADONNÉES

• Utilisez dans la mesure du
  possible des standards de
  métadonnées existants

• Documentez votre schéma
  de métadonnées le plus tôt
  possible

• Ex. de métadonnées : auteur,
  titre, date, type et marque
  des appareils…

      http://www.dcc.ac.uk/resources/metadata-standards
30

     2. Questions éthiques, légales et de sécurité

 Protection des données
 Confidentialité
 Permissions
 Gestion des données sensibles

  Lettres       STM 1       SSH         STM 2        Suite
Le projet n’utilise pas et ne génère pas de données personnelles
ou sensibles. Il n’y pas de mesures particulières prises dans ce
cadre.

   Lettres        STM 1           SSH          STM 2        Suite
All data are anonymized, and as such, we are in line with the Swiss
Federal Act on Data Protection as described on the page of the
Swiss Federal Official Responsible for Data Protection and
Transparency (Préposé Fédéral à la Protection des Données et à la
Transparence, PFPDT).

   Lettres        STM 1           SSH           STM 2       Suite
La collecte des données s’effectuera dans le cadre des règlements éthiques de
l’UNIGE et de la Faculté ; elle sera validée par la Commission universitaire
d'éthique.
Un fichier de consentement imprimé sera rempli par chaque participant·e aux
entretiens enregistrés. Il indiquera précisément comment et sous quelle forme
le contenu des entretiens sera utilisé et diffusé.
En préambule du questionnaire en ligne figurera une demande de
consentement de la participante ou du participant quant à l’utilisation de ses
réponses. Si elle ou il n’accorde pas son consentement, il ne sera pas possible
d’accéder à la suite du questionnaire.
Toutes les données seront anonymisées lors de leur préparation pour une
diffusion plus large, en fin d’étude. Si, pour une raison ou une autre, il ne devait
pas être possible d’anonymiser une partie des données, celle-ci ne sera pas
diffusée.

    Lettres            STM 1              SSH               STM 2          Suite
In our study there will be use of human samples.
Therefore, specific care will be taken to handle security and anonymization of
sensitive data. Sensitive data transfers will be end-to-end encrypted and
encryption keys will be managed only by authorized employees.
The human experimentation part of this grant has been approved by an ethics
committee [please specify which].
All human data will be handled consistently with pre-signed formal consent
agreements.
All personal data will be anonymized in such a way that it will be impossible to
attribute data to specific persons.
                                                   (eg from DMP Canva Generator, VitalIT)

      Lettres           STM 1              SSH               STM 2            Suite
35

      QUELLE COMMISSION D'ÉTHIQUE ?

          Recherche                               Commission cantonale
          relevant de                  OUI           d'éthique et de
           la LRH* ?                               recherche (CCER)

             NON

          Recherche
          en FPSE,                     OUI        Commission facultaire
         FTI ou SdS ?

                                                      Commission
                                       NON        universitaire d'éthique
                                                        (CUREG)
* Loi relative à la recherche sur l'être humain
36

               RESSOURCES À L’UNIGE

Charte éthique générique
    c) Each individual engaged in research is responsible for ensuring integrity in his or
    her quest for knowledge and in the interpretation of results.
Directive sur l’intégrité de la recherche
    Le responsable de projet doit veiller à ce que les données de base soient
    conservées en sécurité pendant cinq ans au moins après le terme de la recherche.

Loi fédérale relative à la recherche sur l'être humain (LRH)

Commission cantonale d’éthique de recherche (CCER)

Commission universitaire d’éthique (CUREG)

Commissions facultaires :

Psychologie et Sciences de l’éducation
Traduction et Interprétation
Sciences de la Société
37

     2. Questions éthiques, légales et de sécurité

 Sécurité des données
    Numérique
    Physique
 Droits d’accès

  Lettres       STM 1       SSH         STM 2        Suite
Etant donné que le projet est littéraire et historique par nature et
n’utilise pas de données sensibles ou confidentielles, l’accès à la
base de données par les membres de l’équipe du projet sera
simplement protégé par mots de passe. La liste des personnes
autorisées sera gérée par le requérant. Ce niveau de sécurité
permet aussi d’assurer une protection d’accès aux documents
provenant de tiers que nous analyserons.

    Lettres        STM 1           SSH           STM 2        Suite
Our data is stored on the academic NAS managed by the UNIGE IT
department (DiSTIC). Access to the data is limited to rights holders
(central authentication). The head of the laboratory that owns this
disk space manages access himself, with the possibility of
registering additional users.

   Lettres         STM 1           SSH           STM 2       Suite
Les données collectées seront stockées sur le poste de travail du
PI, situé dans son bureau à l’Université de Genève. Des backups
seront effectués
• quotidiennement sur le serveur NAS de l’UNIGE
• chaque fin de semaine sur un disque dur externe stocké dans le
   coffre-fort du bureau du PI (voir point 3.1).

Seul le PI aura accès à son poste de travail et à son coffre-fort.
L’accès au serveur NAS sera limité aux membres de l’équipe de
recherche.

   Lettres        STM 1            SSH           STM 2        Suite
The main risks to data security are loss or damage to laboratory notebooks and loss or
corruption of electronic data. Data will be safeguarded by the following measures:
1. Data in lab notebooks will, as described above, also be recorded in electronic form
   that is backed up daily to secure against loss or damage of the notebook.
2. Access to electronic data (prior to publication as described above) will be limited
   to the members of the research group and relevant collaborators via limiting
   access to shared drives on the University server.
3. Access to laboratories and offices are controlled by card access to reduce the
   likelihood of malicious loss/damage; all computers used in this project will run
   Standard Staff Desktop, whereby firewalls and antivirus software are automatically
   upgraded and secure remote access to data is enabled; staff will lock their
   workstation whenever they are away from it.
                                                                         (source of this eg.)

       Lettres            STM 1               SSH               STM 2              Suite
42

     2. Questions éthiques, légales et de sécurité

 Qui est le propriétaire des données ?
 Quelle licence appliquer ?

  Lettres      STM 1           SSH        STM 2      Suite
Les éditions spécifiques de certains textes analysés dans le cadre du
projet sont soumises à des droits d’auteur, et ne pourront être
diffusés. Dans ces quelques cas, des accords seront établis avec les
propriétaires des collections concernées permettant une diffusion au
grand public d’un nombre limité d’images et d’extraits de texte sur le
site web et les autres interfaces de diffusion.
Le service juridique de l’Université est sollicité sur ce point pour
apporter un conseil expert et valider les accords.
De nouvelles données dérivées (tableaux, diagrammes, compilations
de données chiffrées, annotations…) de l’analyse de textes qui est au
cœur du projet seront accessibles à tous.

   Lettres         STM 1           SSH           STM 2        Suite
Research data generated by UNIGE collaborators in the
performance of their duties is the property of the institution. As
the data is not subjected to a contract and will not be patented, it
will be released as open data under Creative Commons CC0
license.

    Lettres        STM 1           SSH           STM 2        Suite
Les données obtenues au cours de l’étude seront la propriété de
l’Université de Genève.
Une licence CC-BY (attribution) leur sera appliquée.

   Lettres        STM 1          SSH          STM 2        Suite
All data is the property of the sponsor institution (HUG), and is under the direct
responsibility of the sponsor.
Intellectual Property Rights are defined as follows:
This project is being carried out in collaboration with an industrial partner. The intellectual
property rights are set out in the collaboration agreement. The intellectual property
generated from this project will be fully exploited with help from the institutional
Technology Transfer Office. The aim is to patent the final procedure and then publish the
work in a research journal and to publish the supporting {anonymised data / metadata}
under an open Creative Commons Attribution (CC BY) license

                                                                      (eg from DMP Model, HUG CRC)

       Lettres              STM 1                 SSH                STM 2             Suite
CHOISIR SA LICENCE
                                                        Respect du contrat/licence
Données sous licence/contrat ?                   oui    Contacter Unitec
                                           non

     Présence de données                                   Vérifier l’anonymisation
                                                       oui Contacter la Biblio
     personnelles ou sensibles ?
                                                 non
                                                                   Contacter
         Usage commercial potentiel ?                        oui   Unitec
                                                       non

                                                                         Contacter
             Réutilisation libre possible ?                        non   Bibliothèque
                                                             oui

                 Publier vos données avec une
                 licence CC0 ou CC-BY

Voir aussi : https://creativecommons.org/choose/
48

        3. Stockage et préservation des données

Capacité et lieu de stockage
Sauvegardes

  Lettres       STM 1       SSH        STM 2      Suite
Comme les fichiers seront sauvegardés quotidiennement sur les
serveurs gérés par les services informatiques de l’Université, et
disponibles par duplication dans des locaux distincts sur deux sites
différents du campus, le risque de perte de données est très faible.
Puisque le système de stockage et de sauvegarde permet aux
utilisateurs d’accéder rétroactivement aux versions des fichiers
crées dans les six semaines précédent un disfonctionnement
éventuel, toute corruption potentielles des données pourra être
efficacement et facilement corrigée.

   Lettres         STM 1          SSH           STM 2        Suite
Storage and back up will be in three places: 1.On Laptop of [Name
of Researcher] 2. On a portable storage device (hard drive) 3. On
institutional collaborative storage.
[Name of Researcher] will be responsible for the storage and back
up of data. This will be done weekly. Backups on the institutional
infrastructure are automated.

   Lettres        STM 1           SSH          STM 2        Suite
Au cours de la recherche, le dossier décrit au point 1.2 sera
enregistré sur le disque dur du poste de travail du PI. Il sera
sauvegardé
  • chaque semaine sur un disque dur externe, stocké dans le
     coffre-fort de ce même bureau ; cette sauvegarde sera
     effectuée par le PI
  • quotidiennement sur le serveur NAS de l’UNIGE, suivant une
     procédure automatique
Les formulaires de consentement imprimés seront également
conservés dans le coffre-fort du bureau.

    Lettres        STM 1          SSH          STM 2       Suite
Our data is stored on the academic NAS managed by the University
of Geneva's IT department - the Information and Communication
Technologies and Systems Division (DiSTIC).
This academic NAS follows common protocols and best practices to
ensure maximum security, integrity and availability.
It extends over two distinct physical locations (UniDufour and
Campus Biotech) and automatically performs a snapshot of files
every 4 hours, with a retention of copies of 6 weeks.

    Lettres        STM 1         SSH          STM 2       Suite
53

  BONNES PRATIQUES DE SAUVEGARDE

 Toujours stocker trois copies des données

                1. L'original

                2. Une copie sur un dispositif
                   externe sur place

                3. Une copie sur un dispositif
                   externe ailleurs
54

        3. Stockage et préservation des données

Données à conserver, sauver
Formats de fichiers pour préservation

  Lettres       STM 1        SSH         STM 2    Suite
Parmi les 10 GB que nous estimons devoir générer au cours du
projet, la partie la plus utile pour de futures recherches, en plus
des résultats qui seront publiés, réside dans certaines séquences
vidéo, dont le volume global se situera probablement entre 4 et 6
GB. Le volume exact sera précisé ultérieurement.

   Lettres         STM 1          SSH           STM 2        Suite
Datasets from this work which underpin a publication will be
deposited in Enlighten: Research Data, the University of Glasgow’s
institutional data repository, and made public at the time of
publication. Data in the repository will be stored in accordance
with funder and University data policies.
The retention schedule for data in Enlighten: Research Data will be
10 years from date of deposition in the first instance, with
extensions applied to datasets which are subsequently accessed.
This complies with both University of Glasgow guidance and
funder policies.

   Lettres        STM 1           SSH           STM 2       Suite
Les enregistrements audio des entretiens et leurs transcriptions
seront conservés en format .wav et .pdf pour une période
minimale de 10 ans sur un disque dur se trouvant dans le coffre-
fort du bureau du PI.
Les formulaires de consentement seront conservés 10 ans dans le
même coffre-fort.
Les synthèses d’entretiens et les résultats des questionnaires,
après anonymisation, seront diffusés avec une licence CC-BY, en
format .csv.
Les données qu'il n'aura pas été possible d'anonymiser ne seront
pas diffusés.

   Lettres       STM 1          SSH           STM 2       Suite
At the end of the project, the entire database will be archived in a reusable
format. Archives encompass all raw data, meta-data, transformed data,
transformation operations, deviations, version history, and audit trails.
Redeployment of the entire database is therefore possible whenever needed.
The comprehensive archive will remain propriety of the sponsor and will be
preserved during a minimum period of [10 | 15 for medical devices] years. UIC
will also ensure an electronic copy of the archive will be stored within the DSI
infrastructure for a theoretical infinite period of time.
Data will be provided to authorised third parties as much as possible in non-
proprietary formats (text, CSV, XML, PDF).
                                                            (eg from DMP Model, HUG CRC)

      Lettres           STM 1              SSH             STM 2             Suite
59

           4. Partage et réutilisation des données

 Quel dépôt pour le partage ?
 Comment les utilisateurs vont trouver mes données ?

 Lettres          STM 1        SSH         STM 2     Suite
A l’achèvement du projet, les données seront stockées dans le
dépôt national suisse qui sera opérationnel en 2019, comme
annoncé dans le cadre du projet Data Life Cycle Management
(DLCM). L’Université de Genève est l’une des institutions
partenaires. Ce choix permettra de garantir un archivage et un
partage des données conformes aux principes FAIR.

   Lettres        STM 1           SSH          STM 2       Suite
Datasets from this work which underpin a publication will be
deposited in Enlighten: Research Data, the University of Glasgow’s
institutional data repository, and made public at the time of
publication.

Metadata about datasets held in the University Registry will be
publicly searchable and discoverable and will indicate how and on
what terms the dataset can be accessed.

   Lettres        STM 1           SSH          STM 2       Suite
Les données seront partagées sur le futur repository suisse qui
sera créé dans le cadre du projet DLCM. Elles seront
accompagnées du fichier de métadonnées README décrit au point
1.3.

   Lettres       STM 1          SSH         STM 2       Suite
Datasets from this work which underpin a publication will be deposited in the , and made public at the time of publication. Data in the repository
will be stored in accordance with funder’s data policies.
Files deposited in the  will be given a Digital Object Identifier (DOI).
The retention schedule for data will be set to 10 years from date of deposition in the
first instance, with possible extension for datasets which remain in regular use.
The DOI issued to datasets in the repository can be included as part of a data citation
in publications, allowing the datasets underpinning a publication to be identified and
accessed.
Metadata about datasets held in the  will be publicly searchable and
discoverable and will indicate how and on what terms the dataset can be accessed.
                                                       (Adapted from DMP template by DLCM)

       Lettres            STM 1                SSH               STM 2           Suite
64

          4. Partage et réutilisation des données

 Conditions de mise à disposition
 Timing
 Délais

Lettres          STM 1        SSH         STM 2     Suite
Les données seront disponibles sous une licence Creative
Commons de type CC-BY dès publication des résultats de la
recherche, sans qu’il soit nécessaire de définir une période
d’embargo. Des autorisations, via des formulaires de
consentement, seront obtenues de toutes les personnes
interviewées avant tournage, pour permettre le partage des
séquences vidéo.

   Lettres        STM 1           SSH          STM 2           Suite
Personal data will be anonymized before diffusion based on the
recommendations from the Federal Act on Data Protection (FADP)
https://www.admin.ch/opc/en/classifiedcompilation/19920153/index.html.
The package SDC-Micro (https://cran.rproject.org/package=sdcMicro) will
be used to assess the risk of identification: we will make sure that
each data set has a k-anonymity of 3 at least.

    Lettres        STM 1            SSH            STM 2        Suite
Les données anonymisées mentionnées au point 3.2 seront
publiées dès la fin de l’étude, avec une licence CC-BY.

   Lettres       STM 1         SSH          STM 2         Suite
Individual research subjects’ data cannot legally nor ethically be
made available to non authorised people (HRA, cf. §2.1). Only the
sponsor, the investigation team, reviewers, auditors and inspection
authorities are entitled to access such data.
No personal data or data that may easily identify subjects will be
provided, with respect to the Swiss law on human research (Federal
Act on Research involving Human Beings (HRA)) and its applicable
ordinance ClinO/KlinV/OClin/OSRUm.
                                               (eg from DMP Model, HUG CRC)

     Lettres        STM 1          SSH           STM 2           Suite
69

    4. Partage et réutilisation des données

  [checkbox]

 oui / non   [radio button]
70

 ARCHIVAGE ET DIFFUSION

            générique
             (multi-disciplinaire)
 Dépôt
- FAIR -    disciplinaire
            institutionnelle

            service proposé par
              une revue
            serveur d’un projet ou
              groupe, site personnel
71

    MON « DÉPÔT » EST-IL FAIR ?

  • DLCM                    Dryad

  • Zenodo

Pour tous les autres dépôts, consultez :
72

           COÛTS DE GESTION

Le FNS permet de demander au
maximum 10’000.- CHF en plus
pour :

- Préparation et validation des
  données
- Chargement (upload) des
  données sur un repository FAIR
  non-commercial
73

             L’ESSENTIEL EN BREF

   Déblocage des fonds subordonné à la soumission
    d'un DMP « plausible »

   DMP modifiable durant toute la durée de vie du
    subside (doit évoluer au cours du projet)

   Obligation de mettre à jour le DMP à la fin du subside
    pour être examiné en même temps que le rapport
    scientifique final

   Version finale du DMP mise à disposition dans la
    base de données P3 du FNS
74

ECRIRE UNE ÉBAUCHE DE VOTRE DMP
75

WWW.UNIGE.CH/RESEARCHDATA
76

               MODÈLES DE DMP

                                            https://dmp.vital-it.ch/

Voir : https://www.unige.ch/researchdata > Planifier >
Remplir le DMP du FNS
77

                                      MERCI BEAUCOUP

                                    researchdata-info@unige.ch

                            http://www.unige.ch/researchdata

            Illustrations :

          Bibliothèque de l’UNIGE, 2019
          Ce document est sous licence Creative Commons Attribution - Partage dans les mêmes conditions 4.0 International : http://creativecommons.org/licenses/by-sa/4.0/deed.fr.

Division de l’information scientifique
Vous pouvez aussi lire