Identification des maladies prioritaires : méthodologie et tableaux des maladies

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Identification des maladies prioritaires : méthodologie et tableaux des maladies
Rapport n° 17125

            Analyse du rôle des îles de la Méditerranée
          dans l’introduction, l’émergence et la diffusion
  de maladies animales et végétales dans le bassin méditerranéen -
         conséquences en matière d’épidémiosurveillance

                                  Cahier n° 2
                            Volet animal
Identification des maladies prioritaires :
méthodologie et tableaux des maladies
                                    établi par

                                 Édith AUTHIÉ
                  Inspectrice générale de santé publique vétérinaire

                                  février 2020
Démarche d’identification des maladies prioritaires ........................................................................................ 3

Tableau des maladies animales présentes dans au moins une île de la Méditerranée, en 2018 ..................... 7

Maladies animales « exotiques » aux îles de la Méditerranée [non détectées entre le 1/1/2018 et le
31/12/2018, dans aucune île] ......................................................................................................................... 17

CGAAER n° 17125 – cahier 2                                                                                                          Page 2/30
Démarche d’identification des maladies prioritaires

Les maladies des espèces bovines, ovines, caprines, porcines, équines, ainsi que les maladies des volailles
et des abeilles, sont concernées par cette démarche. Des agents pathogènes animaux qui n’affectent pas les
espèces citées ne sont pas retenues pour la priorisation (par exemple des agents pathogènes zoonotiques
dont le réservoir est une espèce animale sauvage).

On définit les « maladies présentes » comme étant des maladies détectées au moins une fois, dans au moins
une île de la Méditerranée, au cours de l’année 2018. Les « maladies exotiques » sont des maladies qui n’ont
été détectées dans aucune île de la Méditerranée en 2018.

Deux listes de départ, pour les maladies présentes, d’une part, et pour les maladies exotiques, d’autre part,
ont été constituées de la façon la plus large possible en utilisant les ressources bibliographiques (listes de
maladies notifiables à l’OIE et à l’UE ; rapports et avis de l’Anses et de l’EFSA ; site de la plateforme ESA etc.).

Des critères d’exclusion et d’inclusion ont été appliqués aux listes de départ, permettant d’établir deux listes
de maladies retenues (présentes/exotiques).

CRITERES D’EXCLUSION ET D’INCLUSION DES MALADIES

    1. Maladies présentes dans certaines îles en 2018

Sont exclues (= ne sont pas retenues pour être notées) des maladies qui sévissent sur un mode enzootique
ou sporadique dans plusieurs états membres de l’UE incluant des territoires riverains de la Méditerranée.
(NB. Il peut néanmoins être important de surveiller ces maladies - certaines d’entre elles font d’ailleurs l’objet
de mesures communautaires ou nationales de surveillance et de lutte).

    -   Sauf si elles sont zoonotiques ;

    -   Sauf si les (/des) îles offrent des conditions favorables à l’introduction et/ou la diffusion de ces
        maladies, qui présentent alors des enjeux de surveillance particuliers.

Compte tenu de ces critères, ne sont pas retenues :

            -    Besnoitiose, diarrhée virale bovine / maladie des muqueuses (BVD), campylobactériose
                 génitale, rhinotrachéite infectieuse bovine (IBR), leucose bovine enzootique,
                 paratuberculose, trichomonose, maladie de Schmallenberg
            -    Arthrite encéphalite caprine à virus (CAEV), infection par Chlamydia abortus, Salmonellose à
                 S. abortusovis, tremblante du mouton et de la chèvre, Visna Maedi
            -    Métrite contagieuse équine, influenza équin, piroplasmose équine, infection par
                 l’herpèsvirus équin (EHV-1) ; artérite virale équine ; anémie infectieuse des équidés
            -    SDRP, GET, influenza porcin, diarrhée épidémique porcine (souches Indel)
            -    Chlamydiose aviaire, bronchite infectieuse, laryngotrachéite infectieuse, mycoplasmoses
                 aviaires, hépatite virale du canard, virus influenza aviaires autres que HP, maladie de
                 Gumboro, pullorose typhose et autres salmonelloses aviaires non zoonotiques,
                 rhinotrachéite de la dinde
            -    Loques, varroase et nosémose des abeilles
Sont retenues en tant que maladies zoonotiques (par ordre alphabétique) :

             -   Botulisme
             -   Brucelloses
             -   Cysticercose
             -   Encéphalite spongiforme bovine (ESB)
             -   Fièvre charbonneuse
             -   Fièvre Q
             -   Hépatite E
             -   Hydatidose (échinococcose cystique)
             -   Infection à virus West Nile (et infection par le virus Usutu)
             -   Leptospiroses
             -   Maladie de Newcastle
             -   Maladie de Lyme
             -   Salmonelloses aviaires à S. enterica subsp enterica, divers sérotypes dont S. Enteritidis
             -   Toxoplasmose
             -   Trichinose
             -   Tuberculose bovine
             -   Tularémie

Sont retenues en raison d’enjeux de surveillance particuliers dans les îles :
             -   Agalactie contagieuse (et autres mycoplasmoses) des petits ruminants
             -   Epididymite contagieuse
             -   FCO à sérotypes non exotiques (basé sur zones réglementées au 1/1/2018 : sérotypes 1, 2,
                 4, 6, 8, 9, 11 et 16)
             -   Hémoparasitoses transmises par des tiques (anaplasmoses, babésioses, theilériose
                 méditerranéenne à T. annulata)
             -   Maladie d’Aujeszky
             -   Peste porcine africaine (PPA)
             -   Les autres maladies listées dans le tableau des maladies présentes.

    2. Maladies « exotiques » aux îles de la Méditerranée
Sont exclues les maladies vectorielles pour lesquelles il n’y a actuellement pas (en 2018) de vecteur
compétent identifié dans le bassin méditerranéen (par ex. East Coast Fever, trypanosomoses transmises par
les mouches tsétsé). Ces maladies peuvent être introduites accidentellement, mais les risques actuels
d’installation et de diffusion de la maladie sont quasi nuls.

CGAAER n° 17125 – cahier 2                                                                       Page 4/30
Les autres maladies exotiques sont incluses, notamment (par ordre alphabétique) :
             -   Aethina tumida* (petit coléoptère de la ruche)
             -   Clavelée et variole caprine
             -   Cowdriose
             -   Dermatose nodulaire contagieuse
             -   Diarrhée épidémique porcine (souches non Indel)
             -   Dourine
             -   Encéphalite spongiforme bovine
             -   Encéphalites virales (Nipah, japonaise, vénézuélienne)
             -   Fièvre aphteuse
             -   Fièvre catarrhale ovine (FCO) due à des sérotypes exotiques
             -   Fièvre de la Vallée du Rift
             -   Fièvre hémorragique Crimée Congo
             -   Influenza aviaire
             -   Maladie hémorragique épizootique des cervidés (EHD)
             -   Maladie vésiculeuse des suidés
             -   Morve
             -   Péripneumonie contagieuse bovine
             -   Peste des petits ruminants
             -   Peste équine
             -   Peste porcine classique
             -   Pleuropneumonie contagieuse caprine
             -   Rage
             -   Stomatite vésiculeuse
             -   Surra
             -   Trypanosomose à T. vivax
             -   Tropilaelaps spp
             -   Les autres maladies listées dans le tableau des maladies exotiques.
*NB. En 2018 le petit coléoptère de la ruche n’était présent dans aucune île de la Méditerranée ; en juin 2019
des foyers ont été déclarés en Sicile (suite à une introduction depuis la Calabre)

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NOTATION DES MALADIES RETENUES

Chaque maladie retenue a reçu une note de 0, 1, 2, 3 selon son intérêt pour la mission :

             -   0/1 : intérêt très faible à faible

             -   2 : intérêt modéré

             -   3 : intérêt élevé pour la mission. La maladie est considérée comme prioritaire dans le
                 contexte des îles de la Méditerranéen, et doit faire l’objet de mesures de surveillance ; la
                 mission pourra être amenée à faire des recommandations pour cette surveillance.

Deux critères sont pris en compte pour l’attribution d’une note par maladie :

1. Le risque global représenté par cette maladie pour les îles de la Méditerranée, à savoir la combinaison
de son occurrence et de son impact avéré ou potentiel. Pour définir ce risque, sont considérés :

    -   L’épidémiologie de la maladie

             o   Pour les maladies présentes dans une ou plusieurs îles : le mode (sporadique / enzootique /
                 épizootique), la prévalence et la distribution géographique actuelles ;

             o   Pour les maladies absentes de toutes les îles : le risque d’introduction et le risque potentiel
                 de diffusion si la maladie est introduite dans une ou plusieurs îles.

    -   L’impact de la maladie, sur l’homme, l’animal et l’environnement dans le bassin méditerranéen.

NB. En théorie, le risque lié à une maladie ne devrait pas être estimé de façon globale, mais pour chaque île
(pour les maladies exotiques, il s'agirait du risque de diffusion inter-îles ou d'une île à un territoire du
pourtour méditerranéen). Il n'a pas été possible de faire cet exercice de façon systématique, notamment en
raison des données limitées disponibles pour chaque île. Néanmoins l'analyse combinée de l'épidémiologie
d'une maladie dans le bassin méditerranéen et des caractéristiques de certaines îles (telles que la proximité
géographique avec des territoires non indemnes, l'intensité de certains mouvements d'animaux ou de
personnes) doit permettre d'identifier des risques particuliers à certaines îles (ex. risque particulier BTV16 /
BTV4 pour les îles proches de la Turquie et de la Grèce respectivement).

2. L'importance et la faisabilité de la surveillance de la maladie en question dans tout ou partie des îles de
la Méditerranée - et donc l’intérêt spécifique pour cette mission - qui dépend notamment des éléments
suivants :

    -   Le rôle éventuel d'une ou plusieurs îles dans l’épidémiologie de la maladie (par ex. relais de
        diffusion) ;

    -   L’existence de spécificités insulaires qui renforcent l’importance de la surveillance de cette maladie ;

    -   L’existence et la disponibilité de données chiffrées pour les îles (NB. Les données concernant les îles
        sont difficilement disponibles car elles sont agrégées dans les statistiques européennes avec données
        des États membres dont elles font partie)

Les notes des maladies ont été attribuées « à dires d’expert » et d’après les éléments bibliographiques.

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Tableau des maladies animales présentes
                                                                                dans au moins une île de la Méditerranée, en 2018

                                                                                         Pays du bassin                                          Commentaires

                                                                                                                                                                                                                                              Importance**
                                  Cat. France   Espèces
                                                                 Modalités de
                                                                                Réservo méditerranéen où la Iles où la
                                                                                                                                                 épidémio, impact,
                                                                                                                                                                                                                Questions &
Agent           Maladie                                          transmission                                                                    risque d'introduction
                                                réceptives (Re)                 ir faune maladie est        maladie est                                                          Surveillance (S)               Commentaires
pathogène       zoonose*                                         (T) / Vecteurs                                                                  dans les zones
                                                / sensibles (Se)                sauvage présente (sans      présente                                                                                            surveillance (S)
                                                                 compétents (V)          préjuger du statut                                      indemnes du bassin
                                                                                               officiel des pays)                                méditerranéen
B. melitensis, Brucellose ovine    1            Surtout ovins,    id              Ruminants Espagne, Portugal, Italie       Sicile               Grande importance dans le       France (dont Corse) :          France :la déclaration des     3
principalement et caprine*                      caprins ; autres                  sauvages  (2017, 2018), Balkans (         (prévalence 5-       bassin méditerranéen.           réseau intégré à la lutte      avortements des petits
Biovar 3 dans                                   espèces, dont                               Grèce, Bosnie, incursions       10 % et des cas      Risque d'introduction dans      collective obligatoire : S     ruminants reste
le bassin                                       camélidés ; homme                           en Croatie), Turquie,           humains) et          les régions indemnes : idem     passive (avortements) et       insuffisante. La brucellose
méditerranéen                                   (zoonose majeure)                           Afrique du Nord (Algérie :      Crète ; les autres   B. abortus. Introductions       active (dépistage              n'est pas echerchée si
                                                                                            nombreux cas humains            îles (dont la        illégales de petits ruminants   sérologique en élevage) ;      avortements isolés.
                                                                                            en 2018), Égypte, Proche        Sardaigne) sont      à partir de la Turquie ou du    importance de la S des         Problème des faux-
                                                                                            et Moyen Orient (Syrie,         indemnes (sauf       Maghreb                         avortements en ovins           positifs en sérologie.
                                                                                            Israël, Iran)                   la partie turque                                     caprins lait cru (dispositif   Iles : manque
                                                                                                                            de Chypre, et                                        OSCAR) ; Crète : S active ;    d’informations sur la S
                                                                                                                            incertitude sur                                      Sardaigne et Sicile : S        (avortements ?) et la
                                                                                                                            certaines îles                                       passive et active              situation sanitaire.
                                                                                                                            grecques                                                                            Possible insuffisance de S
                                                                                                                                                                                                                dans certaines îles. La
                                                                                                                                                                                                                Crète a mis en place un
                                                                                                                                                                                                                programme d'éradication
                                                                                                                                                                                                                et interdiction des
                                                                                                                                                                                                                mouvements de petits
                                                                                                                                                                                                                ruminants depuis le
                                                                                                                                                                                                                continent.
Mycobacteriu    Tuberculose        1            Multi-espèces,    T directe /     Sangliers,   France, Italie (surtout      Des foyers en        Réservoir sauvage en            France : Plan national de      Prévalence sous-estimée        3
m bovis         bovine*                         dont homme        indirecte       autres       sud), Espagne                Corse, Malte,        Sardaigne et en Corse :         lutte contre la tuberculose    en Corse; difficultés de la
M. caprae, M.                                                                     espèces      (Andalousie, prévalence      Baléares, Crète,     circulation de l'infection      bovine 2017-2022 ; Corse :     prophylaxie. Voir
tuberculosis                                                                                   troupeaux 15%),              Sardaigne, et        entre bovins, sangliers /       plan de lutte 2016 ; Crète,    chapitre Tuberculose
                                                                                               Portugal, Grèce, Bulgarie,   surtout Sicile.      porcs en liberté.               Sardaigne, Sicile : S active   bovine en annexe 9
                                                                                               Arménie                      Sardaigne a 5        La souche bactérienne           (dispositif de type réseau)    (D. Guériaux)
                                                                                                                            provinces sur 8      sarde est différente des
                                                                                                                            indemnes             souches corses

         CGAAER n° 17125 – cahier 2                                                                                                  Page 7/30
Pays du bassin                                               Commentaires

                                                                                                                                                                                                                                                    Importance**
                                     Cat. France
                                                                    Modalités de                                                                         épidémio, impact,
                                                   Espèces                         Réservo méditerranéen où la Iles où la                                                                                               Questions &
Agent            Maladie                                            transmission                                                                         risque d'introduction
                                                   réceptives (Re)                 ir faune maladie est        maladie est                                                              Surveillance (S)                Commentaires
pathogène        zoonose*                                           (T) / Vecteurs                                                                       dans les zones
                                                   / sensibles (Se)                sauvage présente (sans      présente                                                                                                 surveillance (S)
                                                                    compétents (V)          préjuger du statut                                           indemnes du bassin
                                                                                                          officiel des pays)                             méditerranéen
Brucella         Brucellose           1            Surtout bovins,     T directe (dont        Ruminants   Espagne, Portugal, sud de Crète, Malte,        Risque d'introduction par      France (dont Corse) :           Voir chapitre Brucelloses   2-3
abortus          bovine*                           buffles ;           vénérienne) et         sauvages    l'Italie (2017), Croatie  Chypre, Sicile       les échanges (surtout si       réseau intégré à la lutte       en annexe 9
(plus rarement                                     nombreuses autres   indirecte ;            (bouqueti   (2017, 2018), Grèce,                           mouvements illicites           collective obligatoire : S      (D. Guériaux).
B. melitensis)                                     espèces, dont       Homme : surtout        ns)         Turquie, Syrie, Égypte,                        d'animaux vivants) ; cas       passive (avortements) et        France : besoin d’analyse
                                                   homme               par voie orale (lait               Algérie (bovins, cas                           humains liés à la              active (dépistage               des données de S ;
                                                                       et produits laitiers               humains en 2018), Israël                       consommation de lait cru       sérologique en élevage,         problème des faux-
                                                                       contaminés, non                    (2017). France indemne                                                        contrôle aux introductions).    positifs en sérologie.
                                                                       pasteurisés)                       (cas sporadiques)                                                             Crète : S active

Coxiella         Fièvre Q*            _            Ruminants (surtout T directe par           ?           France (638 cas humains     Corse (Rapport     Germe hautement résistant      France : S intégrée dans la S   Manque de données sur        2
burnetii                                           moutons, chèvres), inhalation                          confirmés en 2018),         FRGDSB20           à la dessication et à la       des avortements des petits      l’infection animale dans
                                                   homme              d'aérosols                          Espagne cas humains en      2017) ; Crète      chaleur => grande              ruminants. Sardaigne, Sicile    le bassin méditerranéen ;
                                                                      infectieux (spores)                 2018, 2019 (Madrid, Pays                       persistance dans               et Crète : S passive            maladie qu'il importe de
                                                                      issus des secrétions                Basque, Andalousie)                            l'environnement. Risque                                        surveiller à cause de la
                                                                      / excrétions liées à                Autres pays d’Europe                           d'introduction en Sicile                                       densité élevée de petits
                                                                      parturition et                                                                     selon CVO italien                                              ruminants et des modes
                                                                      lactation ; T                                                                                                                                     d’élevage
                                                                      indirecte par tiques

Mycoplasma       Agalactie            2  Petits ruminants              T directe et           _           Probablement dans tout      Sardaigne ;        Rôle des mouvements de         France : réseau national de     Situation mal connue
agalactiae (et   contagieuse (AC)   (AC)                               indirecte (très                    le bassin méditerranéen.    probablement       caprins entre Sardaigne et     S des mycoplasmes des           dans les îles - des
autres           et autres                                             contagieuse)                       En France : enzootique en   Corse chez les     Corse dans la diffusion        ruminants : VIGIMYC             enquêtes de prévalence
mycoplasmes)     mycoplasmoses                                                                            Pays Basque (brebis).       chèvres (rapport                                                                  seraient utiles (+mise en
                                                                                                                                                                                                                                                    1-2
                                                                                                                                      FRGDS20, 2017)                                                                    place d’une S si
                                                                                                                                                                                                                        nécessaire)
Anaplasma        Anaplasmose          _            Caprins, ovins       V = tiques            ?           ?                           Prévalence         Impact clinique si associé à   Enquêtes ponctuelles            Idem
ovis             ovine                                                                                                                élevée en Corse    d'autres infections /                                                                      1-2
                                                                                                                                      (FRGDS 20)         infestations

Brucella ovis    Epididymite          _            Ovins, caprins      T. vénérienne          _           Distribution et prévalence ?                   Résurgence depuis l'arrêt      France : S réglementaire        Recommandation de S et
                 contagieuse                                           (surtout mâles,                    mal connue ; rapportée                         de la vaccination Rev1 dans    des reproducteurs ovins         de lutte dans les pays du
                                                                       mais les brebis                    notamment en France,                           les pays ayant éradiqué                                        bassin méditerranéen à
                                                                       peuvent jouer un                   Italie, Croatie, Espagne                       Brucella melitensis                                            forte population ovine
                                                                                                                                                                                                                                                    1-2
                                                                       rôle dans la                       Roumanie, Serbie.
                                                                       diffusion)                         Probablement enzootique
                                                                                                          dans plusieurs pays

           CGAAER n° 17125 – cahier 2                                                                                                          Page 8/30
Pays du bassin                                              Commentaires

                                                                                                                                                                                                                                                   Importance**
                                     Cat. France
                                                                    Modalités de                                                                        épidémio, impact,
                                                   Espèces                         Réservo méditerranéen où la Iles où la                                                                                              Questions &
Agent              Maladie                                          transmission                                                                        risque d'introduction
                                                   réceptives (Re)                 ir faune maladie est        maladie est                                                              Surveillance (S)               Commentaires
pathogène          zoonose*                                         (T) / Vecteurs                                                                      dans les zones
                                                   / sensibles (Se)                sauvage présente (sans      présente                                                                                                surveillance (S)
                                                                    compétents (V)          préjuger du statut                                          indemnes du bassin
                                                                                                          officiel des pays)                            méditerranéen
Leptospira spp. Leptospirose*         _            Multi-espèces,        T directe et        Rongeurs     Mondiale ; incidence en   Corse              Sporadique                       Pas de S hormis cas            Intérêt d’enquêtes dans
surtout L.                                         nombreux animaux      indirecte, voie     sauvages     augmentation en France,   (décharges,                                         humains                        les zones offrant des
interrogans, 24                                    domestiques           transmuqueuse,      (rats) et    notamment en Corse        zones humides) ;                                                                   écosystèmes favorables
sérogroupes,                                       (chiens, bovins,      transcutanée        lagomorph                              probablement
300 sérotypes                                      porcins) et                               es, mais                               aussi dans
                                                                                                                                                                                                                                                   1-2
                                                   l’homme                                   aussi                                  d’autres îles avec
                                                                                             autres                                 zones humides
                                                                                             espèces
Borrelia spp       Maladie de                      Multi-espèces,        V = tiques du genre Petits       France et probablement    Corse (cas équins Incidence croissante en           S des cas humains              La S des tiques vectrices
                   Lyme*                           dont chevaux,         Ixodes, surtout I.  vertébrés    la majorité des pays du   et humains)       Europe en 2019 ; situation                                       est importante y compris
                                                   homme                 ricinus en Europe   (rongeurs,   bassin méditerranéen                        dans les îles mal connue,                                        dans les îles               1-2
                                                                                             reptiles,                                                sauf par des enquêtes
                                                                                             oiseaux)                                                 ponctuelles
Anaplasma          Anaplasmose        _            Bovins, autres        V = 17 espèces de   ?            Portugal, France          Probablement      Difficile à maîtriser une fois    pas de S                       Serait à surveiller dans
marginale          bovine                          ruminants             tiques,                          (sporadique), Croatie     présente dans     installée dans les élevages                                      toute la zone
                                                                         Rhipicephalus et                 (août 2018, 1er cas)      plusieurs îles    (antibiotiques)                                                  méditerranéenne, en
                                                                         Boophilus en                                                                                                                                  raison du changement
                                                                         Afrique, ainsi que                                                                                                                            climatique et de             1
                                                                         des V mécaniques                                                                                                                              l'extension des zones de
                                                                         (stomoxes)                                                                                                                                    distribution des tiques
                                                                                                                                                                                                                       vectrices
B. suis biovar 2   Brucellose         2            Suidés ; autres       Contact direct et   Sangliers    Biovar 2 en Europe :              ?           Élevages plein air :            France : contrôle              La situation des îles est    1
                   porcine*                        espèces, dont         indirect                         sporadique en France                          transmission aux porcs par      sérologique annuel pour le     mal connue.
                                                   l’homme (biovars 1                                     (foyer en 2019 dans les                       les sangliers, puis diffusion   maintien de la qualification   Des enquêtes de
                                                   et 3 sont les plus                                     Hautes Pyrénées),                             possible d’élevage à élevage    indemne de brucellose          prévalence seraient à
                                                   pathogènes, mais                                       Espagne, Portugal                             Les sangliers corses seraient   porcine ; contrôle             effectuer ou à renouveler
                                                   absents en Europe)                                     NB. Biovars 1,3, 5                            peu infectés : prévalence       sérologique des                (Corse)
                                                                                                          présents hors Europe,                         sérologique < 3% lors du        reproducteurs.
                                                                                                          notamment Egypte                              programme de S 2000-
                                                                                                                                                        2004.
Ehrlichia          "Anaplasmose"      _            Multi-espèces,        Tiques (surtout     Cervidés,  Surtout présente dans       ?                   Pas de particularité île        Pas de S                       S des tiques dans le
(Anaplasma)        ou erhrlichiose                 dont bovins, ovins,   Ixodes spp)         sangliers, des pays nordiques, mais                                                                                       bassin méditerranéen
phagocytophil      granulocytaire                  équins, homme)                            renards,   rapportée en Israël
um (plusieurs      (EG)*                                                                     micromam                                                                                                                                              0-1
biovars)                                                                                     mifères

          CGAAER n° 17125 – cahier 2                                                                                                            Page 9/30
Pays du bassin                                                     Commentaires

                                                                                                                                                                                                                                                    Importance**
                                  Cat. France
                                                                 Modalités de                                                                               épidémio, impact,
                                                Espèces                         Réservo méditerranéen où la Iles où la                                                                                                 Questions &
Agent             Maladie                                        transmission                                                                               risque d'introduction
                                                réceptives (Re)                 ir faune maladie est        maladie est                                                                   Surveillance (S)             Commentaires
pathogène         zoonose*                                       (T) / Vecteurs                                                                             dans les zones
                                                / sensibles (Se)                sauvage présente (sans      présente                                                                                                   surveillance (S)
                                                                 compétents (V)          préjuger du statut                                                 indemnes du bassin
                                                                                                           officiel des pays)                               méditerranéen
Salmonella        Salmonellose     2            Oiseaux (poulets,      T directe ou            _            TIAC dans de nombreux       Chypre, Malte       Pas de particularité île      Programme de S et de lutte   Intérêt du partage des
enterica,         aviaire*                      dindes), homme :       indirecte (par                      pays européens (près de      concernées par                                    dans les pays de l’UE        données entre pays pour
divers                                          TIAC                   ingestion de                        1700 cas dus au st.          des cas de TIAC                                                                tracer l’origine des TIAC.
sérotypes (st.)                                                        produits                            Enteritidis entre 2012 et    dus au st.                                                                     Pas d'enjeu particulier de
dont                                                                   contaminés)                         2020 dus à des œufs          Enteritidis en                                                                 S dans les îles
                                                                                                                                                                                                                                                    0-1
Enteritidis                                                                                                contaminés provenant         2018
                                                                                                           principalement de
                                                                                                           Pologne)
Clostridium       Botulisme*       1            Multi-espèces,         T indirecte             _           Probablement partout         ?                   Sporadique ; pas de           S des cas humains            Pas d'enjeu de S dans les
botulinum                                       dont homme             (ingestion de                                                                        spécificité îles                                           îles                          0
                                                                       spores)
Bacillus          Fièvre           1            Multi-espèces          T Indirecte surtout _               Enzootique en Turquie où     Très                Le plus souvent sporadique;   S passive                    Des enjeux de santé
anthracis         charbonneuse*                 (domestiques ou        : ingestion de                      c'est un problème de         probablement        pas de spécificité îles                                    publique et de lutte pour
                  (Anthrax)                     sauvages) ; les        spores dans les sols                santé publique (environ      partout. Peu de                                                                éviter les résurgences,
                                                herbivores sont les    par les herbivores ;                50 cas humains en sept       notifications ces                                                              mais pas d'enjeu de S
                                                plus exposés et Se ;   diffusion passive                   2018, peut-être liés à des   dernières                                                                      pour les îles
                                                les suidés sont        possible par                        importations de viande       années, sauf
                                                moins Se               mouches                             ou de bovins infectés) ;     Sicile sept 2018,                                                                                            0
                                                                       hématophages                        Albanie ; sporadique dans    2016, 2014
                                                                                                           de nombreux pays dont
                                                                                                           France (2017, 2018),
                                                                                                           Italie (2016, 2017, mars
                                                                                                           2018), Grèce, Bulgarie
Francisella     Tularémie*         2            Tous les animaux à     T vectorielle           Lapins de   Sporadique ; ne concerne     ?                   Sporadique                    Pas de S                     Pas d'enjeu particulier de
tularensis type                                 sang chaud sont        (tiques, mouches        garenne,    que la rive nord de la                                                                                      S dans les îles
B (Europe)                                      Se, dont homme         piqueuses) et par       lièvres,    méditerranée et la
                                                                       contact direct ou       écureuils   Turquie                                                                                                                                   0
                                                                       indirect, inhalation,   et petits
                                                                       ingestion (eau)         rongeurs

            CGAAER n° 17125 – cahier 2                                                                                                          Page 10/30
Pays du bassin                                                       Commentaires

                                                                                                                                                                                                                                                                Importance**
                                      Cat. France
                                                                     Modalités de                                                                                 épidémio, impact,
                                                    Espèces                         Réservo méditerranéen où la Iles où la                                                                                                         Questions &
Agent            Maladie                                             transmission                                                                                 risque d'introduction
                                                    réceptives (Re)                 ir faune maladie est        maladie est                                                                        Surveillance (S)                Commentaires
pathogène        zoonose*                                            (T) / Vecteurs                                                                               dans les zones
                                                    / sensibles (Se)                sauvage présente (sans      présente                                                                                                           surveillance (S)
                                                                     compétents (V)          préjuger du statut                                                   indemnes du bassin
                                                                                                               officiel des pays)                                 méditerranéen
Réovirus -        Fièvre catarrhale    1            Ruminants              V = Culicoïdes ; T.    Ruminants    France (sérotypes 8,4) ;      Sur la base des      BTV3 est entré ouest Sicile      S passive et active             Importance d'une S
orbivirus - Blue ovine                              domestiques et         transplacentaire       sauvages     Espagne (1,4), Portugal       zones                en octobre 2017 ex-Tunisie,      (sentinelles) et                efficace (sentinelles et S
tongue virus,                                       sauvages. Les ovins    (seulement BTV8,       (cerf        (4), Italie (1,2,4,16, et 3   réglementées en      nov. 2016 (péninsule de Cap      entomologique. Epicore          passive) pour une
sérotypes BTV                                       sont plus Se que les   BTV2 ovins, BTV11      élaphe)      en mars 2019) ; Croatie       2018 : Iles          Bon à 150 km) puis               surveillance project. Voir      détection précoce.
1, 2, 3, 4, 8, 16                                   bovins et caprins      bovins), pas de T.                  (4) ; Montenegro (4) ;        grecques en mer      Sardaigne en octobre 2018.       chapitre FCO en annexe 9        L'incursion du BTV3 en
; souches                                           (souvent               verticale chez les V                Grèce (4) ; Turquie           Egée (4,16) ;        Probablement transporté          (D. Guériaux)                   Sicile puis Sardaigne
adaptées aux                                        subcliniques).                                             (1,4,16) ; Israël ; Tunisie   Crète (4 en 2014,    par culicoïdes infectés, à                                       souligne le besoin de S
petits                                                                                                         (1,3) ; Algérie ; Maroc       pas de foyers        partir de Tunisie ou de                                          conjointe entre pays
ruminants                                                                                                      (1,2,4); Libye                depuis 2014) ;       Sicile. Risque BTV3 pour                                         d'Afrique du Nord et
BTV-25, -27, -                                                                                                 (1,2,3,4,9,26) ; Israël ;     Chypre (4/2010,      Italie continentale et Corse ;                                   Europe du sud
30, de plus                                                                                                    Égypte (4) en 2019            8/2016,              risque des BTV Corses pour
faible                                                                                                                                       16/2010) ;           la France continentale                                                                         3
virulence                                                                                                                                    Sardaigne
                                                                                                                                             (1,3,4) ; Sicile
                                                                                                                                             (1,3,4,16) ; Malte
                                                                                                                                             (1,4) ; absente
                                                                                                                                             aux Baléares.
                                                                                                                                             Corse :
                                                                                                                                             réglementée
                                                                                                                                             pour(1,2,4,8,16)
                                                                                                                                             mais
                                                                                                                                             probablement
                                                                                                                                             seul (4) circule.
Flavivirus -    Infection à virus      1            De nombreux            V = Moustiques du      Oiseaux      Tous les pays du              Corse : des          Problème de santé publique       En France, seulement S          La France a une S passive
virus West Nile West Nile*                          vertébrés sont Re.     genre Culex,           principale   pourtour méditerranéen,       foyers équins en     en Europe depuis 2010. Seul      passive : homme, chevaux        seulement (et le réseau
: deux lignages                                     Les oiseaux ont des    principalement C.      ment         dont : France (1962-          2016 (un poney       un faible pourcentage des        par le réseau RESPE (S          SAGIR ne fonctionne pas
circulent en                                        virémies élevées       modestus et C.         passéridés   1970), puis réémergence       séropositif sans     cas humains est rapporté,        syndromique) + vigilance        bien), alors que d'autres
Europe :                                            mais sont peu Se       pipiens en Europe :    ; les        2000-2006, 2015 en            signes cliniques)    car souvent sans signes          des vétérinaires sanitaires ;   pays du bassin
Lignage 1 en                                        en Europe.             vecteurs               migrateur    PACA) ; Espagne (2017,        et 2018 :            cliniques.                       oiseaux morts par le réseau     méditerranéen ont une S
Europe de                                           L'homme et les         Ornithophiles ;        s infectés   2018) ; Portugal (2018) ;     2 équidés en         Introductions de virus par       SAGIR. En 2018, S renforcée     active et passive. Cette
l'Ouest,                                            chevaux sont Re et     genre Aedes (A.        peuvent      Italie (épidémies             Haute Corse ; 1      les oiseaux migrateurs ;         en PACA chez les équidés et     stratégie doit être
Afrique,                                            Se, mais sont des      Ochlerotatus) ;        entraîner    annuelles depuis 2008,        cas humain en        établissement si des             l'avifaune.                     éévaluée régulièrement
                                                                                                                                                                                                                                                                 3
Moyen Orient,                                       culs de sac            éventuellement         la maladie   surtout nord-est) ;           oct. 2018.           vecteurs sont présents ainsi     En Grèce : S humaine, S         en fonction de l’évolution
Amérique,                                           épidémiologiques       tiques ; saison de T   à distance   Croatie (depuis 2012) ;       Maladie              qu’une avifaune pour             animale : déclaration           de la situation
Lignage 2 en                                        (pas de                de juin à novembre                  Slovénie (1ère fois en        endémique en         amplifier le virus.              obligatoire, y compris les      épidémiologique. Intérêt
Europe de                                           retransmission aux     (en Europe). Le                     sept 2018 sur corvidé         Sardaigne ; îles     Les mécanismes de                suspicions ; S active           d'instaurer différents
l'Est, Grèce et                                     moustiques)            transport passif de                 mort) ; Serbie ; Croatie ;    ioniennes (mars      persistance chez les             sérologique sur des équidés     niveaux de suspicion ?
Italie du Nord                                                             moustiques                          Bulgarie ; Roumanie ;         2018) ; Crète (2     animaux sont mal connus.         sentinelles et S clinique       Intérêt d'une S concertée
depuis 2004                                                                infectés peut                       Grèce depuis 2010             cas équins           En 2018, la transmission a       autour des cas ; S passive      en Méditerranée ?

         CGAAER n° 17125 – cahier 2                                                                                                                  Page 11/30
Pays du bassin                                                     Commentaires

                                                                                                                                                                                                                                                              Importance**
                                       Cat. France
                                                                      Modalités de                                                                               épidémio, impact,
                                                     Espèces                         Réservo méditerranéen où la Iles où la                                                                                                       Questions &
Agent             Maladie                                             transmission                                                                               risque d'introduction
                                                     réceptives (Re)                 ir faune maladie est        maladie est                                                                     Surveillance (S)                 Commentaires
pathogène         zoonose*                                            (T) / Vecteurs                                                                             dans les zones
                                                     / sensibles (Se)                sauvage présente (sans      présente                                                                                                         surveillance (S)
                                                                      compétents (V)          préjuger du statut                                                 indemnes du bassin
                                                                                                              officiel des pays)                                 méditerranéen
(auparavant                                                                permettre la                       (réémergence de cas           notifiés en 2017     débuté plus précocement,        des équidés toute l'année ;      Poursuivre la recherche
Afrique sub-                                                               diffusion.                         humains en 2017) ;            et 1 en 2018);       le nombre de cas humains        sérologies sur des oiseaux       sur des modèles
saharienne).                                                                                                  Israël ; Turquie; Tunisie     Chypre (1er cas      notifiés a été plus             sauvages ; S des vecteurs de     prédictifs. Voir chapitre
                                                                                                              (cas humains et chevaux,      humain en 2017,      important, avec des cas         juin à octobre. En Italie : S    West Nile en annexe 9 (E.
                                                                                                              déc. 2018). Dans l’UE, en     mais importé de      groupés notamment en            active chez les vecteurs, les    Authié)
                                                                                                              2018 : 1 503 cas humains      Grèce). Non          France ; et de nouveaux         oiseaux (sentinelles), les
                                                                                                              rapportés, soit 5 fois plus   rapportée en         pays ont détecté le virus       équidés (sentinelles) et les
                                                                                                              qu'en 2017, et 285 foyers     Sicile.              (Slovénie, Allemagne) ou        humains. En Sardaigne et
                                                                                                              équins. En 2019 :environ                           déclaré des cas humains         Sicile : S active chez oiseaux
                                                                                                              un tiers des cas de 2018                           (Croatie, Bulgarie, Serbie).    sauvages et volailles en
                                                                                                              (430 cas humains, dont 2                           Risque sérieux d'émergence      élevage ; S passive des
                                                                                                              en France) et 90 foyers                            en Corse.                       mortalités d'oiseaux et S
                                                                                                              équins.                                                                            clinique des chevaux
Herpesvirus       Maladie               1            Nombreux              T directe par         Sangliers,   France (2010, 2018, 2019)     Enzootique en        Enzootique dans plusieurs       Sardaigne et Sicile font une     Difficultés de la mise en
                  d'Aujeszky                         mammifères, dont      contact avec porcs    porcs        : foyers dans des élevages    Corse (sangliers,    territoires du bassin           S active plus ou moins           place d'une S en Corse.
                                                     les suidés qui sont   ou sangliers          sauvages     de porcs plein air, dans      porcs sauvages),     méditerranéen, mais avec        organisée ;                      Voir chapitre Contexte de
                                                     les hôtes naturels    infectés (autres                   départements 64, 04, 84,      présente en          une épidémiologie               Crète fait une S passive.        l'élevage en Corse
                                                                           espèces sont des                   31 ; Portugal, Espagne,       Sardaigne, Sicile,   particulière dans le sud de     Corse : des actions              (annexe 8). Pourtant
                                                                           culs de sac) ;                     Italie, Croatie, Grèce,       Crète (pas de        l'Europe, où se situent la      géographiquement limitées        nécessaire en vue d’un
                                                                           reproduction ; voie                Bulgarie, Roumanie            foyers               majorité des pays non           de S (couplées à la              assainissement (le reste
                                                                           aérienne dans les                                                enregistrés)         indemnes. Les sangliers         vaccination)                     de la France reste           3
                                                                           zones de forte                                                                        sont sources d'infection                                         officiellement indemne)
                                                                           densité d'élevages                                                                    pour les porcs plein air et
                                                                           de porcs ; abats et                                                                   férals. Risque en élevage
                                                                           viscères de suidés                                                                    associé à l'introduction de
                                                                           infectés                                                                              porcelets ou de
                                                                                                                                                                 reproducteurs infectés, ou
                                                                                                                                                                 de semence infectée
Asfaviridae,      Peste porcine        1  Suidés                           T. directe            Sangliers    Dans les années 1950-60,      Sardaigne depuis     Virus très résistant dans les   France : S évènementielle1,      Difficultés d'une S
Asfivirus         africaine (PPA)    (PNI                                  oronasale +           (et porcs    incursions au Portugal et     1978 (porcs          produits animaux.               couplée avec PPC sur porcs       efficace en Corse. Repose
(4 génotypes,                        SU)                                   reproduction + T.     férals)      en Espagne (à partir de       d’élevage et         Épidémiologie en Sardaigne      domestiques et faune             sur S passive, mais
génotype I en                                                              indirecte (liée à des              l'Afrique) ; éradication      sangliers, avec      différente de celle en          sauvage. Le Plan d'action        sensibilisation
Sardaigne,                                                                 activités humaines                 dans les années 90            les porcs férals     Europe de l'Est. Risque pour    national 2018-2019 a un          insuffisante des acteurs.
                                                                                                                                                                                                                                                               3
génotype II en                                                             + T vectorielle par                partout en Europe, sauf       comme                les autres îles, surtout la     volet S (critères de             Nombreuses questions se
Europe de                                                                  tiques molles                      en Sardaigne.                 réservoirs de        Corse (pas d'introductions      suspicion clinique ;             posent : S des porcs
l’Est)                                                                     (Ornithodoros :                    Grèce (Macédoine)             virus). Absente      de porcs vivants ou produits    modalités et réseau de S en      férals ? Intérêt d'une

         1
             Les mesures de surveillance événementielle et de gestion des suspicions cliniques des pestes porcines en élevage sont définies dans l’instruction technique DGAL/SDSPA/2019-41 du 17/01/2019

         CGAAER n° 17125 – cahier 2                                                                                                                 Page 12/30
Pays du bassin                                              Commentaires

                                                                                                                                                                                                                                                     Importance**
                                       Cat. France
                                                                      Modalités de                                                                        épidémio, impact,
                                                     Espèces                         Réservo méditerranéen où la Iles où la                                                                                              Questions &
Agent              Maladie                                            transmission                                                                        risque d'introduction
                                                     réceptives (Re)                 ir faune maladie est        maladie est                                                              Surveillance (S)               Commentaires
pathogène          zoonose*                                           (T) / Vecteurs                                                                      dans les zones
                                                     / sensibles (Se)                sauvage présente (sans      présente                                                                                                surveillance (S)
                                                                      compétents (V)          préjuger du statut                                          indemnes du bassin
                                                                                                           officiel des pays)                             méditerranéen
                                                                         rôle avéré en                     février 2020                en 2018 de Sicile, d'origine porcine à partir de
                                                                                                                                                                                     faune sauvage selon les             sérosurveillance ciblée ?
                                                                         Afrique et dans la                                            Crète, Corse       Sardaigne, mais des        niveaux de risque ; réseau          Enregistrement des
                                                                         péninsule ibérique                                                               mouvements illicites ne    de labos agréés PCR et              suspicions par le LNR ?
                                                                         - inconnu pour les                                                               peuvent être exclus). En   ELISA). Crète : S passive + S       Voir chapitre Contexte de
                                                                         îles)                                                                            2014 : S programmée chez   active par les chasseurs            l'élevage en Corse
                                                                                                                                                          les porcs abattus en       (analyses sur tous les              (annexe 8)
                                                                                                                                                          abattoir en Corse : pas de sangliers tués ou trouvés
                                                                                                                                                          circulation virale.        morts) ; Sardaigne : S active
                                                                                                                                                          domestiques                (viro et séro sur sangliers
                                                                                                                                                                                     chassés) et passive
                                                                                                                                                                                     (sangliers trouvés morts,
                                                                                                                                                                                     porcs en élevages) ; plan de
                                                                                                                                                                                     lutte depuis 2015
Hepeviridae,       Hépatite E*          _            Suidés( génotypes   T directe ou         Sangliers,   France : Sud-est, Sud-      Corse et           Augmentation des cas       S passive (cas humains) ;           L’enjeu de S est lié aux
hepevirus, 4                                         3 et 4 chez porc,   indirecte chez le    rats         ouest, Corse (prévalence    Sardaigne,         humains depuis 15 ans. 90% enquêtes sérologiques en            traditions charcutières
génotypes ;                                          asymptomatique) ;   porc (orofécale).                 sérologique 40% chez les    situation mal      des élevages français sont élevage porcin                      dans certaines îles :
génotypes 3 et                                       homme (génotype     Zoonose                           donneurs de sang en         connue dans les    séropositifs                                                   besoin de S des porcs
4 en Europe                                          3) symptomatique    alimentaire en                    2016) ; autres pays du      autres îles                                                                       élevés localement mais      1-2
                                                     dans 50% des cas    Europe (source                    bassin méditerranéen                                                                                          aussi des porcs importés
                                                                         environnement ou
                                                                         produits d'origine
                                                                         porcine non cuits)
Flavivirus         Infection à virus    _            Homme (signes       V = Moustiques :     Oiseaux      Afrique du Sud, Europe :    Probablement       Forte circulation virale en     Aucune S spécifique            A surveiller en même
                   Usutu*                            cliniques idem WN, Culex pipiens                      large distribution en       présente dans      Europe en 2018, avec des        (seulement des                 temps que le virus West
                                                     chez personnes à                                      France continentale en      certaines îles     mortalités dans l'avifaune,     programmes de recherche        Nile. Importance de la S
                                                     risques), cheval,                                     2018 (surtout centre et     (idem WN)          notamment de corvidés ;         ponctuels) Difficulté du       des vecteurs et du
                                                     rongeurs, oiseaux                                     ouest ; cas humains                            risque potentiellement          diagnostic différentiel avec   réservoir animal pour
                                                     (mortalités surtout                                   depuis 2016), Belgique,                        partout en Europe               West Nile                      objectiver la circulation   1-2
                                                     chez les corvidés)                                    Autriche (27 cas humains                                                                                      du virus.
                                                                                                           en 2018), Allemagne,                                                                                          Voir chapitre West Nile
                                                                                                           Suisse, Hongrie, Italie                                                                                       (E. Authié) en annexe 9
                                                                                                           (Vénétie, 2018)
Paramyxovirid Maladie de                1            Oiseaux (poulets    T directe ou         Oiseaux      France (déc. 2017, Nord,    Chypre (Larnaca,   Souches vélogéniques           S passive ; S active de la      S nécessaire, sans enjeu
ae, APMV-1,   Newcastle*                             très S), homme      indirecte            sauvages     pigeons), Turquie (fév.     mars 2018)         (VND) produisent des           protection vaccinale            particulier dans les îles
souches                                              (rare et bénigne)                                     2018) ; Israël (récurrent                      mortalités importantes chez (sérologie)
(mésogéniques                                                                                              depuis 2010), Bulgarie,                        les volailles. Toutes les îles
                                                                                                                                                                                                                                                      1
et)                                                                                                        Portugal, Roumanie,                            sont potentiellement à
vélogéniques                                                                                               autres pays européens                          risque si volailles ou oiseaux

             CGAAER n° 17125 – cahier 2                                                                                                        Page 13/30
Pays du bassin                                                   Commentaires

                                                                                                                                                                                                                                                       Importance**
                                  Cat. France
                                                                 Modalités de                                                                             épidémio, impact,
                                                Espèces                         Réservo méditerranéen où la Iles où la                                                                                                    Questions &
Agent           Maladie                                          transmission                                                                             risque d'introduction
                                                réceptives (Re)                 ir faune maladie est        maladie est                                                                   Surveillance (S)                Commentaires
pathogène       zoonose*                                         (T) / Vecteurs                                                                           dans les zones
                                                / sensibles (Se)                sauvage présente (sans      présente                                                                                                      surveillance (S)
                                                                 compétents (V)          préjuger du statut                                               indemnes du bassin
                                                                                                          officiel des pays)                              méditerranéen
                                                                                                                                                          captifs en contact avec
                                                                                                                                                          oiseaux sauvages
Prion           Encéphalite       1             Bovins, homme                                             La plupart des pays                                                             Cf. S de l'ESB dans les États   Pas d'enjeu particulier
                spongiforme                                                                               européens. Ces dernières                                                        membres de l'UE. France :       dans les îles
                bovine (ESB)*,                                                                            années, seulement des                                                           programme d’épidémioS
                forme classique                                                                           formes atypiques, en                                                            passive (clinique) + S active                                 1
                et forme                                                                                  Espagne (2017); France                                                          des bovins à risque
                atypique                                                                                  (2016)
Echinococcus    Echinococcose      _            Chien et autres       Zoonose                ?            Présence de longue date    Corse ; Chypre       Manque de données               S à l’abattoir : Sicile et      Situation assez mal
granulosus      cystique -                      canidés (hôtes        alimentaire : œufs                  dans toutes les régions    (seul pays du        (prévalence) car non            Sardaigne réalisent une S       connue en Corse mais le
                Hydatidose*                     définitifs), ovins,   présents dans les                   pastorales du bassin       bassin               notifiée dans la majorité       active et passive organisée,    problème est réel
                                                caprins (hôtes        aliments ou l'eau                   méditerranéen, surtout     méditerranéen à      des pays. Liée aux              afin de suivre la prévalence.   (prévalence de 5% dans
                                                intermédiaires) ;     => migration des                    Afrique du Nord            avoir mis en         conditions particulières de     En Corse : S abattoir           enquêtes 2009) . Un plan
                                                homme                 larves dans les                     (problème de santé         place un             l'élevage extensif. Chiens      (saisies) et enquêtes           de S serait en cours de
                                                                      organes (kystes                     publique au Maroc),        programme            errants, abattages à la         ponctuelles => données          déploiement dans la
                                                                      hydatiques)                         Turquie, Grèce, Italie,    d'éradication).      ferme, failles de biosécurité   limitées                        faune sauvage
                                                                                                          Espagne                    Sardaigne            dans les abattoirs,                                                                          2-3
                                                                                                                                     fortement            favorisent le maintien.
                                                                                                                                     infestée (98 % de    Considéré comme un
                                                                                                                                     moutons              problème sérieux de santé
                                                                                                                                     séropositifs ; et    publique en Sicile et
                                                                                                                                     10 à 12              Sardaigne
                                                                                                                                     personnes
                                                                                                                                     infestées pour
                                                                                                                                     100 000) et Sicile
Taenia solium   Taeniasis et       _            Porc et autres        Zoonose                Sangliers,   Balkans dont Grèce,        Corse, Chypre,       Peu de données de               Inspection des porcs en         Classée "Neglected
                cysticercose*                   suidés (hôtes         alimentaire :          phacochèr    Albanie, Macédoine,        Crète, Sardaigne,    prévalence chez le porc et      abattoir (langueyage). Sicile   Tropical Disease" par
                                                intermédiaires) ;     taeniasis =            es           Turquie ? Des zones        Sicile ?             l'homme. Problème surtout       et Sardaigne réalisent une S    l'OMS en 2010 à cause de
                                                homme (hôte           consommation de                     d'endémie en Espagne                            lié au niveau d'hygiène et      active informelle.              la neurocysticercose,
                                                définitif)            viande de porc                      (Ouest) et au Portugal                          de biosécurité des élevages                                     mais considérée comme
                                                                      ladre ; cysticercose                (Nord)                                          de porcs                                                        éradicable. Plans de lutte   2-3
                                                                      = ingestion d'œufs                                                                                                                                  développés par
                                                                      de T. solium                                                                                                                                        Cysticercosis Working
                                                                      (contamination                                                                                                                                      Group in Europe
                                                                      fécale des
                                                                      aliments)

         CGAAER n° 17125 – cahier 2                                                                                                          Page 14/30
Pays du bassin                                                   Commentaires

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                                   Cat. France
                                                                  Modalités de                                                                             épidémio, impact,
                                                 Espèces                         Réservo méditerranéen où la Iles où la                                                                                                   Questions &
Agent             Maladie                                         transmission                                                                             risque d'introduction
                                                 réceptives (Re)                 ir faune maladie est        maladie est                                                                  Surveillance (S)                Commentaires
pathogène         zoonose*                                        (T) / Vecteurs                                                                           dans les zones
                                                 / sensibles (Se)                sauvage présente (sans      présente                                                                                                     surveillance (S)
                                                                  compétents (V)          préjuger du statut                                               indemnes du bassin
                                                                                                           officiel des pays)                              méditerranéen
Trichinella       Trichinellose*    2            Nombreuses             Consommation de       Sangliers,   ?                         Corse (T. britovi,    Liée au niveau d'hygiène et    Inspection des viandes          Problème corse de la
spiralis /                                       espèces                viande parasitée      renards ;                              cas humains en        de biosécurité des élevages    porcines en abattoir :          gestion des cadavres et
T. britovi                                       domestiques et         (porc, sanglier).     divers                                 2015),                de porcs. En France            chaque porc plein air doit      viscères par les chasseurs
                                                 sauvages (chien,       Zoonose               charognar                              Sardaigne : cas       continentale, seule la         être inspecté. Rôle             et les éleveurs.
                                                 renards, porc,         alimentaire (viande   ds                                     humains (les          viande de sangliers non        particulier des chiens (de      Importance de l'abattage
                                                 sangliers) ; homme     parasitée, peu ou                                            souches corses        contrôlée est à l'origine de   chasse) en Corse. Sicile et     contrôlé des porcs avec
                                                                        non cuite)                                                   et sardes sont        cas humains autochtones.       Sardaigne réalisent une S       recherche de trichine.         2-3
                                                                                                                                     différentes) ;        En 2015, cas humains liés à    active et passive organisées.   Intérêt du suivi des chiens
                                                                                                                                     Sicile ; les autres   la consommation de                                             de chasse.
                                                                                                                                     îles sont a priori    figatelles corses. D’après                                     Pour Sicile et Sardaigne,
                                                                                                                                     indemnes              une enquête de 2011, de                                        problème moins sérieux
                                                                                                                                                           nombreux chiens seraient                                       que l’échinococcose
                                                                                                                                                           séropositifs en Corse.
Theileria         Theilériose       _            Bovins                 V = tiques du genre ?              Présent dans de          Iles Baléares ;        L'aire de distribution des     Pas de S organisée. S des       Importance relevée par le
annulata          méditerranéenn                                        Hyalomma (surtout                  nombreux pays du bassin Sardaigne               tiques est en évolution ;      tiques au sein de projets de    REMESA.
                  e                                                     H. scupense)                       méditerranéen : Espagne,                        très peu de données de         recherche                       Importance de la S des
                                                                                                           Portugal ; Italie ;                             prévalence et d'impact.                                        tiques vectrices dans le
                                                                                                           Turquie ; Israël ;                              Introduction possible des                                      sud de l'Europe et les îles,   1-2
                                                                                                           enzootique dans toute                           tiques à l'occasion de                                         là où le parasite n'est pas
                                                                                                           l'Afrique du nord                               mouvements d'animaux.                                          encore endémique.
                                                                                                                                                           Émergence possible

Toxoplasma        Toxoplasmose*                  Multi-espèces, sans    Homme :               Sanglier     Présente sans doute       Corse,                                               S des avortements des           Parasitose présente en
gondii                                           signes cliniques       contamination par                  partout dans le bassin    prévalence                                           petits ruminants                élevage de petits
                                                 chez la plupart        ingestion                          méditerranéen, mais peu   sérologique 10-                                                                      ruminants en Corse, mais
                                                 (dont les chats),      d'oocystes (danger                 de données                20 % chez le                                                                         aussi sur le continent.
                                                 sauf petits            pour le fœtus si                                             sanglier; 20-70 %                                                                    Rien de spécifique aux
                                                 ruminants, porcs       infection pendant                                            chez les ovins                                                                       îles
                                                 (avortements) ;        le 1er tiers de la                                           (prévalence                                                                                                         1-2
                                                 homme                  gestation)                                                   parasitaire
                                                 (prévalence 30 %                                                                    25 %) ; 1 % chez
                                                 de la population Fr)                                                                porcs industriels
                                                                                                                                     français

            CGAAER n° 17125 – cahier 2                                                                                                        Page 15/30
Pays du bassin                                              Commentaires

                                                                                                                                                                                                                                                   Importance**
                                    Cat. France
                                                                   Modalités de                                                                        épidémio, impact,
                                                  Espèces                         Réservo méditerranéen où la Iles où la                                                                                            Questions &
Agent            Maladie                                           transmission                                                                        risque d'introduction
                                                  réceptives (Re)                 ir faune maladie est        maladie est                                                              Surveillance (S)             Commentaires
pathogène        zoonose*                                          (T) / Vecteurs                                                                      dans les zones
                                                  / sensibles (Se)                sauvage présente (sans      présente                                                                                              surveillance (S)
                                                                   compétents (V)          préjuger du statut                                          indemnes du bassin
                                                                                                      officiel des pays)                               méditerranéen
Babesia          Babésiose bovine       _         Bovins, buffles    V = tiques            Ruminants Sans doute présente dans ?                                                        Pas de S organisée           => Enjeu de S des
bigemina                                                             Rhipicephalus         sauvages  de nombreux pays du                                                                                            maladies à tiques dans le
Babesia                                                              microplus pour B.               bassin méditerranéen.                                                                                          bassin méditerranéen :
divergens                                                            bigemina                        Cas déclarés en Roumanie                                                                                       suivi de la distribution des
Babesia bovis                                                        Ixodes ricinus pour             à l’été 2018 (espèce non                                                                                       tiques et suivis de
                                                                     B. divergens.                   précisée)                                                                                                      prévalences (idem
                                                                                                                                                                                                                                                    1
                                                                     Rhipicephalus spp               Croatie en sept 2018 (B.                                                                                       anaplasmoses et
                                                                     et autres espèces               bovis)                                                                                                         theilériose)
                                                                     de tiques pour B.
                                                                     bovis
Hypoderma        Hypodermose            2         Bovinés            Myase cutanée         _          Présente dans plusieurs   Corse                  La prévalence serait en        Plan de S aléatoire annuel    Important de maintenir la
lineatum, H.     bovine (varron)                                                                      pays d’Europe du Nord ou                         augmentation en Corse. La      (sérologie) géré par GDS.     S en France (risque de
bovis (mouche                                                                                         du Sud, en Turquie.                              situation dans les autres îles                               réémergence) et enjeu de
                                                                                                                                                                                                                                                    1
famille                                                                                               Eradiquée en France, sauf                        est mal connue                                               Besoin de S en Corse
Oestridés)                                                                                            Corse

Vespa velutina   Pas une maladie,   2             Apis mellifera     _                                France (dans le Sud-Ouest Baléares, peut-        Grave menace pour les           S évènementielle dans        Importance de
Frelon           mais un                          autres insectes                                     depuis 2004), Espagne,    être d’autres îles     pollinisateurs. V. velutina     certains pays, mais manque   l’épidémiovigilance sur
asiatique        prédateur des                                                                        Portugal, Italie                                 devrait continuer dans les      global de données dans le    toutes les espèces de
                                                                                                                                                                                                                                                    1
                 abeilles                                                                                                                              années à venir, à envahir les   bassin méditerranéen         frelons susceptibles de
                                                                                                                                                       régions les plus chaudes                                     devenir envahissantes.
                                                                                                                                                       d’Europe.
Leishmania     Leishmaniose                       Chien (plus         V= Phlébotomes       Lagomorp   Tout le bassin                Malte (un cas       Nombreux cas en Europe                                      N'affecte pas les animaux
infantum (dans cutanée*(pour                      rarement chats),                         hes,       méditerranéen.                humain Autriche    continentale chez des                                        de rente (donc hors
le bassin      mémoire)                           homme                                    rongeurs   Espagne : prévalence          ex-Malte en        chiens ayant voyagé dans                                     mission) mais reste une
méditerranéen                                     Infection chronique                                 moyenne de 7-8% chez          2016) ; présente   des zones d’endémie ;                                        priorité sanitaire et de S.
, L. major, L.                                    chez le chien,                                      les chiens. Libye, Tunisie,   très               retransmission locale                                        Prolifération des
tropica                                           parfois                                             Algérie sont zones            probablement       possible ensuite si présence                                 phlébotomes liée au            non
ailleurs)                                         asymptomatique                                      d'endémie ; en 2018 -         les autres îles    de phlébotomes.                                              changement climatique          not
                                                  (=> persistance du                                  2019 il y aurait eu plus de   aussi              Le nombre de régions                                         => Importance de la S           ée
                                                  parasite)                                           5 000 cas humains en                             d’endémicité augmente,                                       vectorielle
                                                                                                      Libye ; l'Algérie aurait eu                      ainsi que le nombre de cas
                                                                                                      environ 400 cas en 2018.                         humains et animaux
                                                                                                      Cas humains également
                                                                                                      en Israël 2018.
         *maladies zoonotiques
         **note de 0 (minimum) à 3 (maximum) selon les critères de notation définis dans la démarche de priorisation (page 3)
         Code couleurs : en jaune : maladies bactériennes ; en bleu : maladies virales ; en vert : maladies parasitaires.

         CGAAER n° 17125 – cahier 2                                                                                                        Page 16/30
Maladies animales « exotiques » aux îles de la Méditerranée
                                                                               [non détectées entre le 1/1/2018 et le 31/12/2018, dans aucune île]

                                                                                                                                                            Risques

                                 Catégorie France
                                                                                                                                Pays (et îles) du      d'introduction et

                                                                                                                                                                                                                                                    Importance****
                                                       Espèces
                                                                     Modalités de                           Aire de                 bassin             d'émergence***            Commentaires Modalités de
                                                     réceptives                   Réservoir
  Agent            Maladie                                           transmission                      distribution des         méditerranéen          dans les régions            épidémio   Surveillance                 Commentaires
                                                        (Re) /                      faune
pathogène         zoonose*                                               (T) /                         vecteurs / de la         dans lesquels la         indemnes du              (dont place (S) dans les                 Surveillance (S)
                                                      sensibles                    sauvage
                                                                     Vecteurs (V)                         maladie**              maladie a été               bassin                 des îles)      îles
                                                         (Se)
                                                                                                                                  rapportée             méditerranéen
                                                                                                                                                           (dont îles)
Mycoplasma      Péripneumonie    1                  Bovinés          T directe (voie      _           Afrique sub-saharienne    Derniers foyers au    L'importation de bovins    Possible              France : réseau   Pas de suspicions            2
mycoïdes        contagieuse                         domestiques      respiratoire)                    (Mauritanie 2015),        Portugal en 1999 ;    vivants dans l'UE est      circulation à bas     VIGIMYC (S        déclarées, peu de
subsp.          bovine (PPCB)                       (bovins,                                          Moyen-Orient              en France foyers en   réglementée et             bruit de souches      passive) depuis   sensibilisation. Intérêt
mycoïdes                                            buffles) et                                                                 1980-84               contrôlée ; produits       peu pathogènes        2003 ; UE : S à   des données d’abattoir,
biotype SC                                          ruminants                                                                   (réémergences et      germinaux provenant        dans le bassin        l'abattoir        mais S peut passer à
                                                    sauvages (Se).                                                              non introductions)    de pays infectés sont à    méditerranéen.        seulement.        côté de souches peu
                                                    Les ovins sont                                                                                    risque, mais non           Difficulté du                           pathogènes (lésions
                                                    peu Se mais                                                                                       autorisés dans l'UE.       contrôle des                            mineures). Importance
                                                    peuvent être                                                                                      Danger des                 mouvements ;                            d'isoler des
                                                    sources                                                                                           introductions non          risques associés à                      mycoplasmes afin de
                                                    d'infection                                                                                       contrôlées de petits       la transhumance.                        repérer les souches de
                                                                                                                                                      ruminants en               Risques faibles                         faible pathogénicité en
                                                                                                                                                      provenance de zones        pour les îles, et à                     circulation.
                                                                                                                                                      d'enzootie                 partir des îles
Mycoplasma      Pleuropneumoni   _                  Caprins          T directe surtout    Ruminants   Afrique sahélienne,       Turquie (Thrace       Risques pour les îles si   Peut-être plus        idem              Importance de S en           2
capricolum      e contagieuse                                        (aérosols            sauvages    Afrique de l'Est, Moyen   2004), Tunisie,       mouvements de petits       répandue que                            Turquie et en Afrique
subsp.          caprine                                              infectieux) ; rôle               Orient, péninsule         Égypte                ruminants à partir de      rapportée, car                          sub-saharienne
capripneumoni                                                        des porteurs                     arabique, Turquie, Asie                         zones d'enzootie           facilement
ae                                                                   chroniques                       (Chine)                                         (Turquie)                  confondue avec
                                                                                                                                                                                 d'autres
                                                                                                                                                                                 pathologies
                                                                                                                                                                                 respiratoires

        CGAAER n° 17125 – cahier 2                                                                                                            Page 17/30
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