Identification des maladies prioritaires : méthodologie et tableaux des maladies
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Rapport n° 17125 Analyse du rôle des îles de la Méditerranée dans l’introduction, l’émergence et la diffusion de maladies animales et végétales dans le bassin méditerranéen - conséquences en matière d’épidémiosurveillance Cahier n° 2 Volet animal Identification des maladies prioritaires : méthodologie et tableaux des maladies établi par Édith AUTHIÉ Inspectrice générale de santé publique vétérinaire février 2020
Démarche d’identification des maladies prioritaires ........................................................................................ 3 Tableau des maladies animales présentes dans au moins une île de la Méditerranée, en 2018 ..................... 7 Maladies animales « exotiques » aux îles de la Méditerranée [non détectées entre le 1/1/2018 et le 31/12/2018, dans aucune île] ......................................................................................................................... 17 CGAAER n° 17125 – cahier 2 Page 2/30
Démarche d’identification des maladies prioritaires Les maladies des espèces bovines, ovines, caprines, porcines, équines, ainsi que les maladies des volailles et des abeilles, sont concernées par cette démarche. Des agents pathogènes animaux qui n’affectent pas les espèces citées ne sont pas retenues pour la priorisation (par exemple des agents pathogènes zoonotiques dont le réservoir est une espèce animale sauvage). On définit les « maladies présentes » comme étant des maladies détectées au moins une fois, dans au moins une île de la Méditerranée, au cours de l’année 2018. Les « maladies exotiques » sont des maladies qui n’ont été détectées dans aucune île de la Méditerranée en 2018. Deux listes de départ, pour les maladies présentes, d’une part, et pour les maladies exotiques, d’autre part, ont été constituées de la façon la plus large possible en utilisant les ressources bibliographiques (listes de maladies notifiables à l’OIE et à l’UE ; rapports et avis de l’Anses et de l’EFSA ; site de la plateforme ESA etc.). Des critères d’exclusion et d’inclusion ont été appliqués aux listes de départ, permettant d’établir deux listes de maladies retenues (présentes/exotiques). CRITERES D’EXCLUSION ET D’INCLUSION DES MALADIES 1. Maladies présentes dans certaines îles en 2018 Sont exclues (= ne sont pas retenues pour être notées) des maladies qui sévissent sur un mode enzootique ou sporadique dans plusieurs états membres de l’UE incluant des territoires riverains de la Méditerranée. (NB. Il peut néanmoins être important de surveiller ces maladies - certaines d’entre elles font d’ailleurs l’objet de mesures communautaires ou nationales de surveillance et de lutte). - Sauf si elles sont zoonotiques ; - Sauf si les (/des) îles offrent des conditions favorables à l’introduction et/ou la diffusion de ces maladies, qui présentent alors des enjeux de surveillance particuliers. Compte tenu de ces critères, ne sont pas retenues : - Besnoitiose, diarrhée virale bovine / maladie des muqueuses (BVD), campylobactériose génitale, rhinotrachéite infectieuse bovine (IBR), leucose bovine enzootique, paratuberculose, trichomonose, maladie de Schmallenberg - Arthrite encéphalite caprine à virus (CAEV), infection par Chlamydia abortus, Salmonellose à S. abortusovis, tremblante du mouton et de la chèvre, Visna Maedi - Métrite contagieuse équine, influenza équin, piroplasmose équine, infection par l’herpèsvirus équin (EHV-1) ; artérite virale équine ; anémie infectieuse des équidés - SDRP, GET, influenza porcin, diarrhée épidémique porcine (souches Indel) - Chlamydiose aviaire, bronchite infectieuse, laryngotrachéite infectieuse, mycoplasmoses aviaires, hépatite virale du canard, virus influenza aviaires autres que HP, maladie de Gumboro, pullorose typhose et autres salmonelloses aviaires non zoonotiques, rhinotrachéite de la dinde - Loques, varroase et nosémose des abeilles
Sont retenues en tant que maladies zoonotiques (par ordre alphabétique) : - Botulisme - Brucelloses - Cysticercose - Encéphalite spongiforme bovine (ESB) - Fièvre charbonneuse - Fièvre Q - Hépatite E - Hydatidose (échinococcose cystique) - Infection à virus West Nile (et infection par le virus Usutu) - Leptospiroses - Maladie de Newcastle - Maladie de Lyme - Salmonelloses aviaires à S. enterica subsp enterica, divers sérotypes dont S. Enteritidis - Toxoplasmose - Trichinose - Tuberculose bovine - Tularémie Sont retenues en raison d’enjeux de surveillance particuliers dans les îles : - Agalactie contagieuse (et autres mycoplasmoses) des petits ruminants - Epididymite contagieuse - FCO à sérotypes non exotiques (basé sur zones réglementées au 1/1/2018 : sérotypes 1, 2, 4, 6, 8, 9, 11 et 16) - Hémoparasitoses transmises par des tiques (anaplasmoses, babésioses, theilériose méditerranéenne à T. annulata) - Maladie d’Aujeszky - Peste porcine africaine (PPA) - Les autres maladies listées dans le tableau des maladies présentes. 2. Maladies « exotiques » aux îles de la Méditerranée Sont exclues les maladies vectorielles pour lesquelles il n’y a actuellement pas (en 2018) de vecteur compétent identifié dans le bassin méditerranéen (par ex. East Coast Fever, trypanosomoses transmises par les mouches tsétsé). Ces maladies peuvent être introduites accidentellement, mais les risques actuels d’installation et de diffusion de la maladie sont quasi nuls. CGAAER n° 17125 – cahier 2 Page 4/30
Les autres maladies exotiques sont incluses, notamment (par ordre alphabétique) : - Aethina tumida* (petit coléoptère de la ruche) - Clavelée et variole caprine - Cowdriose - Dermatose nodulaire contagieuse - Diarrhée épidémique porcine (souches non Indel) - Dourine - Encéphalite spongiforme bovine - Encéphalites virales (Nipah, japonaise, vénézuélienne) - Fièvre aphteuse - Fièvre catarrhale ovine (FCO) due à des sérotypes exotiques - Fièvre de la Vallée du Rift - Fièvre hémorragique Crimée Congo - Influenza aviaire - Maladie hémorragique épizootique des cervidés (EHD) - Maladie vésiculeuse des suidés - Morve - Péripneumonie contagieuse bovine - Peste des petits ruminants - Peste équine - Peste porcine classique - Pleuropneumonie contagieuse caprine - Rage - Stomatite vésiculeuse - Surra - Trypanosomose à T. vivax - Tropilaelaps spp - Les autres maladies listées dans le tableau des maladies exotiques. *NB. En 2018 le petit coléoptère de la ruche n’était présent dans aucune île de la Méditerranée ; en juin 2019 des foyers ont été déclarés en Sicile (suite à une introduction depuis la Calabre) CGAAER n° 17125 – cahier 2 Page 5/30
NOTATION DES MALADIES RETENUES Chaque maladie retenue a reçu une note de 0, 1, 2, 3 selon son intérêt pour la mission : - 0/1 : intérêt très faible à faible - 2 : intérêt modéré - 3 : intérêt élevé pour la mission. La maladie est considérée comme prioritaire dans le contexte des îles de la Méditerranéen, et doit faire l’objet de mesures de surveillance ; la mission pourra être amenée à faire des recommandations pour cette surveillance. Deux critères sont pris en compte pour l’attribution d’une note par maladie : 1. Le risque global représenté par cette maladie pour les îles de la Méditerranée, à savoir la combinaison de son occurrence et de son impact avéré ou potentiel. Pour définir ce risque, sont considérés : - L’épidémiologie de la maladie o Pour les maladies présentes dans une ou plusieurs îles : le mode (sporadique / enzootique / épizootique), la prévalence et la distribution géographique actuelles ; o Pour les maladies absentes de toutes les îles : le risque d’introduction et le risque potentiel de diffusion si la maladie est introduite dans une ou plusieurs îles. - L’impact de la maladie, sur l’homme, l’animal et l’environnement dans le bassin méditerranéen. NB. En théorie, le risque lié à une maladie ne devrait pas être estimé de façon globale, mais pour chaque île (pour les maladies exotiques, il s'agirait du risque de diffusion inter-îles ou d'une île à un territoire du pourtour méditerranéen). Il n'a pas été possible de faire cet exercice de façon systématique, notamment en raison des données limitées disponibles pour chaque île. Néanmoins l'analyse combinée de l'épidémiologie d'une maladie dans le bassin méditerranéen et des caractéristiques de certaines îles (telles que la proximité géographique avec des territoires non indemnes, l'intensité de certains mouvements d'animaux ou de personnes) doit permettre d'identifier des risques particuliers à certaines îles (ex. risque particulier BTV16 / BTV4 pour les îles proches de la Turquie et de la Grèce respectivement). 2. L'importance et la faisabilité de la surveillance de la maladie en question dans tout ou partie des îles de la Méditerranée - et donc l’intérêt spécifique pour cette mission - qui dépend notamment des éléments suivants : - Le rôle éventuel d'une ou plusieurs îles dans l’épidémiologie de la maladie (par ex. relais de diffusion) ; - L’existence de spécificités insulaires qui renforcent l’importance de la surveillance de cette maladie ; - L’existence et la disponibilité de données chiffrées pour les îles (NB. Les données concernant les îles sont difficilement disponibles car elles sont agrégées dans les statistiques européennes avec données des États membres dont elles font partie) Les notes des maladies ont été attribuées « à dires d’expert » et d’après les éléments bibliographiques. CGAAER n° 17125 – cahier 2 Page 6/30
Tableau des maladies animales présentes dans au moins une île de la Méditerranée, en 2018 Pays du bassin Commentaires Importance** Cat. France Espèces Modalités de Réservo méditerranéen où la Iles où la épidémio, impact, Questions & Agent Maladie transmission risque d'introduction réceptives (Re) ir faune maladie est maladie est Surveillance (S) Commentaires pathogène zoonose* (T) / Vecteurs dans les zones / sensibles (Se) sauvage présente (sans présente surveillance (S) compétents (V) préjuger du statut indemnes du bassin officiel des pays) méditerranéen B. melitensis, Brucellose ovine 1 Surtout ovins, id Ruminants Espagne, Portugal, Italie Sicile Grande importance dans le France (dont Corse) : France :la déclaration des 3 principalement et caprine* caprins ; autres sauvages (2017, 2018), Balkans ( (prévalence 5- bassin méditerranéen. réseau intégré à la lutte avortements des petits Biovar 3 dans espèces, dont Grèce, Bosnie, incursions 10 % et des cas Risque d'introduction dans collective obligatoire : S ruminants reste le bassin camélidés ; homme en Croatie), Turquie, humains) et les régions indemnes : idem passive (avortements) et insuffisante. La brucellose méditerranéen (zoonose majeure) Afrique du Nord (Algérie : Crète ; les autres B. abortus. Introductions active (dépistage n'est pas echerchée si nombreux cas humains îles (dont la illégales de petits ruminants sérologique en élevage) ; avortements isolés. en 2018), Égypte, Proche Sardaigne) sont à partir de la Turquie ou du importance de la S des Problème des faux- et Moyen Orient (Syrie, indemnes (sauf Maghreb avortements en ovins positifs en sérologie. Israël, Iran) la partie turque caprins lait cru (dispositif Iles : manque de Chypre, et OSCAR) ; Crète : S active ; d’informations sur la S incertitude sur Sardaigne et Sicile : S (avortements ?) et la certaines îles passive et active situation sanitaire. grecques Possible insuffisance de S dans certaines îles. La Crète a mis en place un programme d'éradication et interdiction des mouvements de petits ruminants depuis le continent. Mycobacteriu Tuberculose 1 Multi-espèces, T directe / Sangliers, France, Italie (surtout Des foyers en Réservoir sauvage en France : Plan national de Prévalence sous-estimée 3 m bovis bovine* dont homme indirecte autres sud), Espagne Corse, Malte, Sardaigne et en Corse : lutte contre la tuberculose en Corse; difficultés de la M. caprae, M. espèces (Andalousie, prévalence Baléares, Crète, circulation de l'infection bovine 2017-2022 ; Corse : prophylaxie. Voir tuberculosis troupeaux 15%), Sardaigne, et entre bovins, sangliers / plan de lutte 2016 ; Crète, chapitre Tuberculose Portugal, Grèce, Bulgarie, surtout Sicile. porcs en liberté. Sardaigne, Sicile : S active bovine en annexe 9 Arménie Sardaigne a 5 La souche bactérienne (dispositif de type réseau) (D. Guériaux) provinces sur 8 sarde est différente des indemnes souches corses CGAAER n° 17125 – cahier 2 Page 7/30
Pays du bassin Commentaires Importance** Cat. France Modalités de épidémio, impact, Espèces Réservo méditerranéen où la Iles où la Questions & Agent Maladie transmission risque d'introduction réceptives (Re) ir faune maladie est maladie est Surveillance (S) Commentaires pathogène zoonose* (T) / Vecteurs dans les zones / sensibles (Se) sauvage présente (sans présente surveillance (S) compétents (V) préjuger du statut indemnes du bassin officiel des pays) méditerranéen Brucella Brucellose 1 Surtout bovins, T directe (dont Ruminants Espagne, Portugal, sud de Crète, Malte, Risque d'introduction par France (dont Corse) : Voir chapitre Brucelloses 2-3 abortus bovine* buffles ; vénérienne) et sauvages l'Italie (2017), Croatie Chypre, Sicile les échanges (surtout si réseau intégré à la lutte en annexe 9 (plus rarement nombreuses autres indirecte ; (bouqueti (2017, 2018), Grèce, mouvements illicites collective obligatoire : S (D. Guériaux). B. melitensis) espèces, dont Homme : surtout ns) Turquie, Syrie, Égypte, d'animaux vivants) ; cas passive (avortements) et France : besoin d’analyse homme par voie orale (lait Algérie (bovins, cas humains liés à la active (dépistage des données de S ; et produits laitiers humains en 2018), Israël consommation de lait cru sérologique en élevage, problème des faux- contaminés, non (2017). France indemne contrôle aux introductions). positifs en sérologie. pasteurisés) (cas sporadiques) Crète : S active Coxiella Fièvre Q* _ Ruminants (surtout T directe par ? France (638 cas humains Corse (Rapport Germe hautement résistant France : S intégrée dans la S Manque de données sur 2 burnetii moutons, chèvres), inhalation confirmés en 2018), FRGDSB20 à la dessication et à la des avortements des petits l’infection animale dans homme d'aérosols Espagne cas humains en 2017) ; Crète chaleur => grande ruminants. Sardaigne, Sicile le bassin méditerranéen ; infectieux (spores) 2018, 2019 (Madrid, Pays persistance dans et Crète : S passive maladie qu'il importe de issus des secrétions Basque, Andalousie) l'environnement. Risque surveiller à cause de la / excrétions liées à Autres pays d’Europe d'introduction en Sicile densité élevée de petits parturition et selon CVO italien ruminants et des modes lactation ; T d’élevage indirecte par tiques Mycoplasma Agalactie 2 Petits ruminants T directe et _ Probablement dans tout Sardaigne ; Rôle des mouvements de France : réseau national de Situation mal connue agalactiae (et contagieuse (AC) (AC) indirecte (très le bassin méditerranéen. probablement caprins entre Sardaigne et S des mycoplasmes des dans les îles - des autres et autres contagieuse) En France : enzootique en Corse chez les Corse dans la diffusion ruminants : VIGIMYC enquêtes de prévalence mycoplasmes) mycoplasmoses Pays Basque (brebis). chèvres (rapport seraient utiles (+mise en 1-2 FRGDS20, 2017) place d’une S si nécessaire) Anaplasma Anaplasmose _ Caprins, ovins V = tiques ? ? Prévalence Impact clinique si associé à Enquêtes ponctuelles Idem ovis ovine élevée en Corse d'autres infections / 1-2 (FRGDS 20) infestations Brucella ovis Epididymite _ Ovins, caprins T. vénérienne _ Distribution et prévalence ? Résurgence depuis l'arrêt France : S réglementaire Recommandation de S et contagieuse (surtout mâles, mal connue ; rapportée de la vaccination Rev1 dans des reproducteurs ovins de lutte dans les pays du mais les brebis notamment en France, les pays ayant éradiqué bassin méditerranéen à peuvent jouer un Italie, Croatie, Espagne Brucella melitensis forte population ovine 1-2 rôle dans la Roumanie, Serbie. diffusion) Probablement enzootique dans plusieurs pays CGAAER n° 17125 – cahier 2 Page 8/30
Pays du bassin Commentaires Importance** Cat. France Modalités de épidémio, impact, Espèces Réservo méditerranéen où la Iles où la Questions & Agent Maladie transmission risque d'introduction réceptives (Re) ir faune maladie est maladie est Surveillance (S) Commentaires pathogène zoonose* (T) / Vecteurs dans les zones / sensibles (Se) sauvage présente (sans présente surveillance (S) compétents (V) préjuger du statut indemnes du bassin officiel des pays) méditerranéen Leptospira spp. Leptospirose* _ Multi-espèces, T directe et Rongeurs Mondiale ; incidence en Corse Sporadique Pas de S hormis cas Intérêt d’enquêtes dans surtout L. nombreux animaux indirecte, voie sauvages augmentation en France, (décharges, humains les zones offrant des interrogans, 24 domestiques transmuqueuse, (rats) et notamment en Corse zones humides) ; écosystèmes favorables sérogroupes, (chiens, bovins, transcutanée lagomorph probablement 300 sérotypes porcins) et es, mais aussi dans 1-2 l’homme aussi d’autres îles avec autres zones humides espèces Borrelia spp Maladie de Multi-espèces, V = tiques du genre Petits France et probablement Corse (cas équins Incidence croissante en S des cas humains La S des tiques vectrices Lyme* dont chevaux, Ixodes, surtout I. vertébrés la majorité des pays du et humains) Europe en 2019 ; situation est importante y compris homme ricinus en Europe (rongeurs, bassin méditerranéen dans les îles mal connue, dans les îles 1-2 reptiles, sauf par des enquêtes oiseaux) ponctuelles Anaplasma Anaplasmose _ Bovins, autres V = 17 espèces de ? Portugal, France Probablement Difficile à maîtriser une fois pas de S Serait à surveiller dans marginale bovine ruminants tiques, (sporadique), Croatie présente dans installée dans les élevages toute la zone Rhipicephalus et (août 2018, 1er cas) plusieurs îles (antibiotiques) méditerranéenne, en Boophilus en raison du changement Afrique, ainsi que climatique et de 1 des V mécaniques l'extension des zones de (stomoxes) distribution des tiques vectrices B. suis biovar 2 Brucellose 2 Suidés ; autres Contact direct et Sangliers Biovar 2 en Europe : ? Élevages plein air : France : contrôle La situation des îles est 1 porcine* espèces, dont indirect sporadique en France transmission aux porcs par sérologique annuel pour le mal connue. l’homme (biovars 1 (foyer en 2019 dans les les sangliers, puis diffusion maintien de la qualification Des enquêtes de et 3 sont les plus Hautes Pyrénées), possible d’élevage à élevage indemne de brucellose prévalence seraient à pathogènes, mais Espagne, Portugal Les sangliers corses seraient porcine ; contrôle effectuer ou à renouveler absents en Europe) NB. Biovars 1,3, 5 peu infectés : prévalence sérologique des (Corse) présents hors Europe, sérologique < 3% lors du reproducteurs. notamment Egypte programme de S 2000- 2004. Ehrlichia "Anaplasmose" _ Multi-espèces, Tiques (surtout Cervidés, Surtout présente dans ? Pas de particularité île Pas de S S des tiques dans le (Anaplasma) ou erhrlichiose dont bovins, ovins, Ixodes spp) sangliers, des pays nordiques, mais bassin méditerranéen phagocytophil granulocytaire équins, homme) renards, rapportée en Israël um (plusieurs (EG)* micromam 0-1 biovars) mifères CGAAER n° 17125 – cahier 2 Page 9/30
Pays du bassin Commentaires Importance** Cat. France Modalités de épidémio, impact, Espèces Réservo méditerranéen où la Iles où la Questions & Agent Maladie transmission risque d'introduction réceptives (Re) ir faune maladie est maladie est Surveillance (S) Commentaires pathogène zoonose* (T) / Vecteurs dans les zones / sensibles (Se) sauvage présente (sans présente surveillance (S) compétents (V) préjuger du statut indemnes du bassin officiel des pays) méditerranéen Salmonella Salmonellose 2 Oiseaux (poulets, T directe ou _ TIAC dans de nombreux Chypre, Malte Pas de particularité île Programme de S et de lutte Intérêt du partage des enterica, aviaire* dindes), homme : indirecte (par pays européens (près de concernées par dans les pays de l’UE données entre pays pour divers TIAC ingestion de 1700 cas dus au st. des cas de TIAC tracer l’origine des TIAC. sérotypes (st.) produits Enteritidis entre 2012 et dus au st. Pas d'enjeu particulier de dont contaminés) 2020 dus à des œufs Enteritidis en S dans les îles 0-1 Enteritidis contaminés provenant 2018 principalement de Pologne) Clostridium Botulisme* 1 Multi-espèces, T indirecte _ Probablement partout ? Sporadique ; pas de S des cas humains Pas d'enjeu de S dans les botulinum dont homme (ingestion de spécificité îles îles 0 spores) Bacillus Fièvre 1 Multi-espèces T Indirecte surtout _ Enzootique en Turquie où Très Le plus souvent sporadique; S passive Des enjeux de santé anthracis charbonneuse* (domestiques ou : ingestion de c'est un problème de probablement pas de spécificité îles publique et de lutte pour (Anthrax) sauvages) ; les spores dans les sols santé publique (environ partout. Peu de éviter les résurgences, herbivores sont les par les herbivores ; 50 cas humains en sept notifications ces mais pas d'enjeu de S plus exposés et Se ; diffusion passive 2018, peut-être liés à des dernières pour les îles les suidés sont possible par importations de viande années, sauf moins Se mouches ou de bovins infectés) ; Sicile sept 2018, 0 hématophages Albanie ; sporadique dans 2016, 2014 de nombreux pays dont France (2017, 2018), Italie (2016, 2017, mars 2018), Grèce, Bulgarie Francisella Tularémie* 2 Tous les animaux à T vectorielle Lapins de Sporadique ; ne concerne ? Sporadique Pas de S Pas d'enjeu particulier de tularensis type sang chaud sont (tiques, mouches garenne, que la rive nord de la S dans les îles B (Europe) Se, dont homme piqueuses) et par lièvres, méditerranée et la contact direct ou écureuils Turquie 0 indirect, inhalation, et petits ingestion (eau) rongeurs CGAAER n° 17125 – cahier 2 Page 10/30
Pays du bassin Commentaires Importance** Cat. France Modalités de épidémio, impact, Espèces Réservo méditerranéen où la Iles où la Questions & Agent Maladie transmission risque d'introduction réceptives (Re) ir faune maladie est maladie est Surveillance (S) Commentaires pathogène zoonose* (T) / Vecteurs dans les zones / sensibles (Se) sauvage présente (sans présente surveillance (S) compétents (V) préjuger du statut indemnes du bassin officiel des pays) méditerranéen Réovirus - Fièvre catarrhale 1 Ruminants V = Culicoïdes ; T. Ruminants France (sérotypes 8,4) ; Sur la base des BTV3 est entré ouest Sicile S passive et active Importance d'une S orbivirus - Blue ovine domestiques et transplacentaire sauvages Espagne (1,4), Portugal zones en octobre 2017 ex-Tunisie, (sentinelles) et efficace (sentinelles et S tongue virus, sauvages. Les ovins (seulement BTV8, (cerf (4), Italie (1,2,4,16, et 3 réglementées en nov. 2016 (péninsule de Cap entomologique. Epicore passive) pour une sérotypes BTV sont plus Se que les BTV2 ovins, BTV11 élaphe) en mars 2019) ; Croatie 2018 : Iles Bon à 150 km) puis surveillance project. Voir détection précoce. 1, 2, 3, 4, 8, 16 bovins et caprins bovins), pas de T. (4) ; Montenegro (4) ; grecques en mer Sardaigne en octobre 2018. chapitre FCO en annexe 9 L'incursion du BTV3 en ; souches (souvent verticale chez les V Grèce (4) ; Turquie Egée (4,16) ; Probablement transporté (D. Guériaux) Sicile puis Sardaigne adaptées aux subcliniques). (1,4,16) ; Israël ; Tunisie Crète (4 en 2014, par culicoïdes infectés, à souligne le besoin de S petits (1,3) ; Algérie ; Maroc pas de foyers partir de Tunisie ou de conjointe entre pays ruminants (1,2,4); Libye depuis 2014) ; Sicile. Risque BTV3 pour d'Afrique du Nord et BTV-25, -27, - (1,2,3,4,9,26) ; Israël ; Chypre (4/2010, Italie continentale et Corse ; Europe du sud 30, de plus Égypte (4) en 2019 8/2016, risque des BTV Corses pour faible 16/2010) ; la France continentale 3 virulence Sardaigne (1,3,4) ; Sicile (1,3,4,16) ; Malte (1,4) ; absente aux Baléares. Corse : réglementée pour(1,2,4,8,16) mais probablement seul (4) circule. Flavivirus - Infection à virus 1 De nombreux V = Moustiques du Oiseaux Tous les pays du Corse : des Problème de santé publique En France, seulement S La France a une S passive virus West Nile West Nile* vertébrés sont Re. genre Culex, principale pourtour méditerranéen, foyers équins en en Europe depuis 2010. Seul passive : homme, chevaux seulement (et le réseau : deux lignages Les oiseaux ont des principalement C. ment dont : France (1962- 2016 (un poney un faible pourcentage des par le réseau RESPE (S SAGIR ne fonctionne pas circulent en virémies élevées modestus et C. passéridés 1970), puis réémergence séropositif sans cas humains est rapporté, syndromique) + vigilance bien), alors que d'autres Europe : mais sont peu Se pipiens en Europe : ; les 2000-2006, 2015 en signes cliniques) car souvent sans signes des vétérinaires sanitaires ; pays du bassin Lignage 1 en en Europe. vecteurs migrateur PACA) ; Espagne (2017, et 2018 : cliniques. oiseaux morts par le réseau méditerranéen ont une S Europe de L'homme et les Ornithophiles ; s infectés 2018) ; Portugal (2018) ; 2 équidés en Introductions de virus par SAGIR. En 2018, S renforcée active et passive. Cette l'Ouest, chevaux sont Re et genre Aedes (A. peuvent Italie (épidémies Haute Corse ; 1 les oiseaux migrateurs ; en PACA chez les équidés et stratégie doit être Afrique, Se, mais sont des Ochlerotatus) ; entraîner annuelles depuis 2008, cas humain en établissement si des l'avifaune. éévaluée régulièrement 3 Moyen Orient, culs de sac éventuellement la maladie surtout nord-est) ; oct. 2018. vecteurs sont présents ainsi En Grèce : S humaine, S en fonction de l’évolution Amérique, épidémiologiques tiques ; saison de T à distance Croatie (depuis 2012) ; Maladie qu’une avifaune pour animale : déclaration de la situation Lignage 2 en (pas de de juin à novembre Slovénie (1ère fois en endémique en amplifier le virus. obligatoire, y compris les épidémiologique. Intérêt Europe de retransmission aux (en Europe). Le sept 2018 sur corvidé Sardaigne ; îles Les mécanismes de suspicions ; S active d'instaurer différents l'Est, Grèce et moustiques) transport passif de mort) ; Serbie ; Croatie ; ioniennes (mars persistance chez les sérologique sur des équidés niveaux de suspicion ? Italie du Nord moustiques Bulgarie ; Roumanie ; 2018) ; Crète (2 animaux sont mal connus. sentinelles et S clinique Intérêt d'une S concertée depuis 2004 infectés peut Grèce depuis 2010 cas équins En 2018, la transmission a autour des cas ; S passive en Méditerranée ? CGAAER n° 17125 – cahier 2 Page 11/30
Pays du bassin Commentaires Importance** Cat. France Modalités de épidémio, impact, Espèces Réservo méditerranéen où la Iles où la Questions & Agent Maladie transmission risque d'introduction réceptives (Re) ir faune maladie est maladie est Surveillance (S) Commentaires pathogène zoonose* (T) / Vecteurs dans les zones / sensibles (Se) sauvage présente (sans présente surveillance (S) compétents (V) préjuger du statut indemnes du bassin officiel des pays) méditerranéen (auparavant permettre la (réémergence de cas notifiés en 2017 débuté plus précocement, des équidés toute l'année ; Poursuivre la recherche Afrique sub- diffusion. humains en 2017) ; et 1 en 2018); le nombre de cas humains sérologies sur des oiseaux sur des modèles saharienne). Israël ; Turquie; Tunisie Chypre (1er cas notifiés a été plus sauvages ; S des vecteurs de prédictifs. Voir chapitre (cas humains et chevaux, humain en 2017, important, avec des cas juin à octobre. En Italie : S West Nile en annexe 9 (E. déc. 2018). Dans l’UE, en mais importé de groupés notamment en active chez les vecteurs, les Authié) 2018 : 1 503 cas humains Grèce). Non France ; et de nouveaux oiseaux (sentinelles), les rapportés, soit 5 fois plus rapportée en pays ont détecté le virus équidés (sentinelles) et les qu'en 2017, et 285 foyers Sicile. (Slovénie, Allemagne) ou humains. En Sardaigne et équins. En 2019 :environ déclaré des cas humains Sicile : S active chez oiseaux un tiers des cas de 2018 (Croatie, Bulgarie, Serbie). sauvages et volailles en (430 cas humains, dont 2 Risque sérieux d'émergence élevage ; S passive des en France) et 90 foyers en Corse. mortalités d'oiseaux et S équins. clinique des chevaux Herpesvirus Maladie 1 Nombreux T directe par Sangliers, France (2010, 2018, 2019) Enzootique en Enzootique dans plusieurs Sardaigne et Sicile font une Difficultés de la mise en d'Aujeszky mammifères, dont contact avec porcs porcs : foyers dans des élevages Corse (sangliers, territoires du bassin S active plus ou moins place d'une S en Corse. les suidés qui sont ou sangliers sauvages de porcs plein air, dans porcs sauvages), méditerranéen, mais avec organisée ; Voir chapitre Contexte de les hôtes naturels infectés (autres départements 64, 04, 84, présente en une épidémiologie Crète fait une S passive. l'élevage en Corse espèces sont des 31 ; Portugal, Espagne, Sardaigne, Sicile, particulière dans le sud de Corse : des actions (annexe 8). Pourtant culs de sac) ; Italie, Croatie, Grèce, Crète (pas de l'Europe, où se situent la géographiquement limitées nécessaire en vue d’un reproduction ; voie Bulgarie, Roumanie foyers majorité des pays non de S (couplées à la assainissement (le reste aérienne dans les enregistrés) indemnes. Les sangliers vaccination) de la France reste 3 zones de forte sont sources d'infection officiellement indemne) densité d'élevages pour les porcs plein air et de porcs ; abats et férals. Risque en élevage viscères de suidés associé à l'introduction de infectés porcelets ou de reproducteurs infectés, ou de semence infectée Asfaviridae, Peste porcine 1 Suidés T. directe Sangliers Dans les années 1950-60, Sardaigne depuis Virus très résistant dans les France : S évènementielle1, Difficultés d'une S Asfivirus africaine (PPA) (PNI oronasale + (et porcs incursions au Portugal et 1978 (porcs produits animaux. couplée avec PPC sur porcs efficace en Corse. Repose (4 génotypes, SU) reproduction + T. férals) en Espagne (à partir de d’élevage et Épidémiologie en Sardaigne domestiques et faune sur S passive, mais génotype I en indirecte (liée à des l'Afrique) ; éradication sangliers, avec différente de celle en sauvage. Le Plan d'action sensibilisation Sardaigne, activités humaines dans les années 90 les porcs férals Europe de l'Est. Risque pour national 2018-2019 a un insuffisante des acteurs. 3 génotype II en + T vectorielle par partout en Europe, sauf comme les autres îles, surtout la volet S (critères de Nombreuses questions se Europe de tiques molles en Sardaigne. réservoirs de Corse (pas d'introductions suspicion clinique ; posent : S des porcs l’Est) (Ornithodoros : Grèce (Macédoine) virus). Absente de porcs vivants ou produits modalités et réseau de S en férals ? Intérêt d'une 1 Les mesures de surveillance événementielle et de gestion des suspicions cliniques des pestes porcines en élevage sont définies dans l’instruction technique DGAL/SDSPA/2019-41 du 17/01/2019 CGAAER n° 17125 – cahier 2 Page 12/30
Pays du bassin Commentaires Importance** Cat. France Modalités de épidémio, impact, Espèces Réservo méditerranéen où la Iles où la Questions & Agent Maladie transmission risque d'introduction réceptives (Re) ir faune maladie est maladie est Surveillance (S) Commentaires pathogène zoonose* (T) / Vecteurs dans les zones / sensibles (Se) sauvage présente (sans présente surveillance (S) compétents (V) préjuger du statut indemnes du bassin officiel des pays) méditerranéen rôle avéré en février 2020 en 2018 de Sicile, d'origine porcine à partir de faune sauvage selon les sérosurveillance ciblée ? Afrique et dans la Crète, Corse Sardaigne, mais des niveaux de risque ; réseau Enregistrement des péninsule ibérique mouvements illicites ne de labos agréés PCR et suspicions par le LNR ? - inconnu pour les peuvent être exclus). En ELISA). Crète : S passive + S Voir chapitre Contexte de îles) 2014 : S programmée chez active par les chasseurs l'élevage en Corse les porcs abattus en (analyses sur tous les (annexe 8) abattoir en Corse : pas de sangliers tués ou trouvés circulation virale. morts) ; Sardaigne : S active domestiques (viro et séro sur sangliers chassés) et passive (sangliers trouvés morts, porcs en élevages) ; plan de lutte depuis 2015 Hepeviridae, Hépatite E* _ Suidés( génotypes T directe ou Sangliers, France : Sud-est, Sud- Corse et Augmentation des cas S passive (cas humains) ; L’enjeu de S est lié aux hepevirus, 4 3 et 4 chez porc, indirecte chez le rats ouest, Corse (prévalence Sardaigne, humains depuis 15 ans. 90% enquêtes sérologiques en traditions charcutières génotypes ; asymptomatique) ; porc (orofécale). sérologique 40% chez les situation mal des élevages français sont élevage porcin dans certaines îles : génotypes 3 et homme (génotype Zoonose donneurs de sang en connue dans les séropositifs besoin de S des porcs 4 en Europe 3) symptomatique alimentaire en 2016) ; autres pays du autres îles élevés localement mais 1-2 dans 50% des cas Europe (source bassin méditerranéen aussi des porcs importés environnement ou produits d'origine porcine non cuits) Flavivirus Infection à virus _ Homme (signes V = Moustiques : Oiseaux Afrique du Sud, Europe : Probablement Forte circulation virale en Aucune S spécifique A surveiller en même Usutu* cliniques idem WN, Culex pipiens large distribution en présente dans Europe en 2018, avec des (seulement des temps que le virus West chez personnes à France continentale en certaines îles mortalités dans l'avifaune, programmes de recherche Nile. Importance de la S risques), cheval, 2018 (surtout centre et (idem WN) notamment de corvidés ; ponctuels) Difficulté du des vecteurs et du rongeurs, oiseaux ouest ; cas humains risque potentiellement diagnostic différentiel avec réservoir animal pour (mortalités surtout depuis 2016), Belgique, partout en Europe West Nile objectiver la circulation 1-2 chez les corvidés) Autriche (27 cas humains du virus. en 2018), Allemagne, Voir chapitre West Nile Suisse, Hongrie, Italie (E. Authié) en annexe 9 (Vénétie, 2018) Paramyxovirid Maladie de 1 Oiseaux (poulets T directe ou Oiseaux France (déc. 2017, Nord, Chypre (Larnaca, Souches vélogéniques S passive ; S active de la S nécessaire, sans enjeu ae, APMV-1, Newcastle* très S), homme indirecte sauvages pigeons), Turquie (fév. mars 2018) (VND) produisent des protection vaccinale particulier dans les îles souches (rare et bénigne) 2018) ; Israël (récurrent mortalités importantes chez (sérologie) (mésogéniques depuis 2010), Bulgarie, les volailles. Toutes les îles 1 et) Portugal, Roumanie, sont potentiellement à vélogéniques autres pays européens risque si volailles ou oiseaux CGAAER n° 17125 – cahier 2 Page 13/30
Pays du bassin Commentaires Importance** Cat. France Modalités de épidémio, impact, Espèces Réservo méditerranéen où la Iles où la Questions & Agent Maladie transmission risque d'introduction réceptives (Re) ir faune maladie est maladie est Surveillance (S) Commentaires pathogène zoonose* (T) / Vecteurs dans les zones / sensibles (Se) sauvage présente (sans présente surveillance (S) compétents (V) préjuger du statut indemnes du bassin officiel des pays) méditerranéen captifs en contact avec oiseaux sauvages Prion Encéphalite 1 Bovins, homme La plupart des pays Cf. S de l'ESB dans les États Pas d'enjeu particulier spongiforme européens. Ces dernières membres de l'UE. France : dans les îles bovine (ESB)*, années, seulement des programme d’épidémioS forme classique formes atypiques, en passive (clinique) + S active 1 et forme Espagne (2017); France des bovins à risque atypique (2016) Echinococcus Echinococcose _ Chien et autres Zoonose ? Présence de longue date Corse ; Chypre Manque de données S à l’abattoir : Sicile et Situation assez mal granulosus cystique - canidés (hôtes alimentaire : œufs dans toutes les régions (seul pays du (prévalence) car non Sardaigne réalisent une S connue en Corse mais le Hydatidose* définitifs), ovins, présents dans les pastorales du bassin bassin notifiée dans la majorité active et passive organisée, problème est réel caprins (hôtes aliments ou l'eau méditerranéen, surtout méditerranéen à des pays. Liée aux afin de suivre la prévalence. (prévalence de 5% dans intermédiaires) ; => migration des Afrique du Nord avoir mis en conditions particulières de En Corse : S abattoir enquêtes 2009) . Un plan homme larves dans les (problème de santé place un l'élevage extensif. Chiens (saisies) et enquêtes de S serait en cours de organes (kystes publique au Maroc), programme errants, abattages à la ponctuelles => données déploiement dans la hydatiques) Turquie, Grèce, Italie, d'éradication). ferme, failles de biosécurité limitées faune sauvage Espagne Sardaigne dans les abattoirs, 2-3 fortement favorisent le maintien. infestée (98 % de Considéré comme un moutons problème sérieux de santé séropositifs ; et publique en Sicile et 10 à 12 Sardaigne personnes infestées pour 100 000) et Sicile Taenia solium Taeniasis et _ Porc et autres Zoonose Sangliers, Balkans dont Grèce, Corse, Chypre, Peu de données de Inspection des porcs en Classée "Neglected cysticercose* suidés (hôtes alimentaire : phacochèr Albanie, Macédoine, Crète, Sardaigne, prévalence chez le porc et abattoir (langueyage). Sicile Tropical Disease" par intermédiaires) ; taeniasis = es Turquie ? Des zones Sicile ? l'homme. Problème surtout et Sardaigne réalisent une S l'OMS en 2010 à cause de homme (hôte consommation de d'endémie en Espagne lié au niveau d'hygiène et active informelle. la neurocysticercose, définitif) viande de porc (Ouest) et au Portugal de biosécurité des élevages mais considérée comme ladre ; cysticercose (Nord) de porcs éradicable. Plans de lutte 2-3 = ingestion d'œufs développés par de T. solium Cysticercosis Working (contamination Group in Europe fécale des aliments) CGAAER n° 17125 – cahier 2 Page 14/30
Pays du bassin Commentaires Importance** Cat. France Modalités de épidémio, impact, Espèces Réservo méditerranéen où la Iles où la Questions & Agent Maladie transmission risque d'introduction réceptives (Re) ir faune maladie est maladie est Surveillance (S) Commentaires pathogène zoonose* (T) / Vecteurs dans les zones / sensibles (Se) sauvage présente (sans présente surveillance (S) compétents (V) préjuger du statut indemnes du bassin officiel des pays) méditerranéen Trichinella Trichinellose* 2 Nombreuses Consommation de Sangliers, ? Corse (T. britovi, Liée au niveau d'hygiène et Inspection des viandes Problème corse de la spiralis / espèces viande parasitée renards ; cas humains en de biosécurité des élevages porcines en abattoir : gestion des cadavres et T. britovi domestiques et (porc, sanglier). divers 2015), de porcs. En France chaque porc plein air doit viscères par les chasseurs sauvages (chien, Zoonose charognar Sardaigne : cas continentale, seule la être inspecté. Rôle et les éleveurs. renards, porc, alimentaire (viande ds humains (les viande de sangliers non particulier des chiens (de Importance de l'abattage sangliers) ; homme parasitée, peu ou souches corses contrôlée est à l'origine de chasse) en Corse. Sicile et contrôlé des porcs avec non cuite) et sardes sont cas humains autochtones. Sardaigne réalisent une S recherche de trichine. 2-3 différentes) ; En 2015, cas humains liés à active et passive organisées. Intérêt du suivi des chiens Sicile ; les autres la consommation de de chasse. îles sont a priori figatelles corses. D’après Pour Sicile et Sardaigne, indemnes une enquête de 2011, de problème moins sérieux nombreux chiens seraient que l’échinococcose séropositifs en Corse. Theileria Theilériose _ Bovins V = tiques du genre ? Présent dans de Iles Baléares ; L'aire de distribution des Pas de S organisée. S des Importance relevée par le annulata méditerranéenn Hyalomma (surtout nombreux pays du bassin Sardaigne tiques est en évolution ; tiques au sein de projets de REMESA. e H. scupense) méditerranéen : Espagne, très peu de données de recherche Importance de la S des Portugal ; Italie ; prévalence et d'impact. tiques vectrices dans le Turquie ; Israël ; Introduction possible des sud de l'Europe et les îles, 1-2 enzootique dans toute tiques à l'occasion de là où le parasite n'est pas l'Afrique du nord mouvements d'animaux. encore endémique. Émergence possible Toxoplasma Toxoplasmose* Multi-espèces, sans Homme : Sanglier Présente sans doute Corse, S des avortements des Parasitose présente en gondii signes cliniques contamination par partout dans le bassin prévalence petits ruminants élevage de petits chez la plupart ingestion méditerranéen, mais peu sérologique 10- ruminants en Corse, mais (dont les chats), d'oocystes (danger de données 20 % chez le aussi sur le continent. sauf petits pour le fœtus si sanglier; 20-70 % Rien de spécifique aux ruminants, porcs infection pendant chez les ovins îles (avortements) ; le 1er tiers de la (prévalence 1-2 homme gestation) parasitaire (prévalence 30 % 25 %) ; 1 % chez de la population Fr) porcs industriels français CGAAER n° 17125 – cahier 2 Page 15/30
Pays du bassin Commentaires Importance** Cat. France Modalités de épidémio, impact, Espèces Réservo méditerranéen où la Iles où la Questions & Agent Maladie transmission risque d'introduction réceptives (Re) ir faune maladie est maladie est Surveillance (S) Commentaires pathogène zoonose* (T) / Vecteurs dans les zones / sensibles (Se) sauvage présente (sans présente surveillance (S) compétents (V) préjuger du statut indemnes du bassin officiel des pays) méditerranéen Babesia Babésiose bovine _ Bovins, buffles V = tiques Ruminants Sans doute présente dans ? Pas de S organisée => Enjeu de S des bigemina Rhipicephalus sauvages de nombreux pays du maladies à tiques dans le Babesia microplus pour B. bassin méditerranéen. bassin méditerranéen : divergens bigemina Cas déclarés en Roumanie suivi de la distribution des Babesia bovis Ixodes ricinus pour à l’été 2018 (espèce non tiques et suivis de B. divergens. précisée) prévalences (idem 1 Rhipicephalus spp Croatie en sept 2018 (B. anaplasmoses et et autres espèces bovis) theilériose) de tiques pour B. bovis Hypoderma Hypodermose 2 Bovinés Myase cutanée _ Présente dans plusieurs Corse La prévalence serait en Plan de S aléatoire annuel Important de maintenir la lineatum, H. bovine (varron) pays d’Europe du Nord ou augmentation en Corse. La (sérologie) géré par GDS. S en France (risque de bovis (mouche du Sud, en Turquie. situation dans les autres îles réémergence) et enjeu de 1 famille Eradiquée en France, sauf est mal connue Besoin de S en Corse Oestridés) Corse Vespa velutina Pas une maladie, 2 Apis mellifera _ France (dans le Sud-Ouest Baléares, peut- Grave menace pour les S évènementielle dans Importance de Frelon mais un autres insectes depuis 2004), Espagne, être d’autres îles pollinisateurs. V. velutina certains pays, mais manque l’épidémiovigilance sur asiatique prédateur des Portugal, Italie devrait continuer dans les global de données dans le toutes les espèces de 1 abeilles années à venir, à envahir les bassin méditerranéen frelons susceptibles de régions les plus chaudes devenir envahissantes. d’Europe. Leishmania Leishmaniose Chien (plus V= Phlébotomes Lagomorp Tout le bassin Malte (un cas Nombreux cas en Europe N'affecte pas les animaux infantum (dans cutanée*(pour rarement chats), hes, méditerranéen. humain Autriche continentale chez des de rente (donc hors le bassin mémoire) homme rongeurs Espagne : prévalence ex-Malte en chiens ayant voyagé dans mission) mais reste une méditerranéen Infection chronique moyenne de 7-8% chez 2016) ; présente des zones d’endémie ; priorité sanitaire et de S. , L. major, L. chez le chien, les chiens. Libye, Tunisie, très retransmission locale Prolifération des tropica parfois Algérie sont zones probablement possible ensuite si présence phlébotomes liée au non ailleurs) asymptomatique d'endémie ; en 2018 - les autres îles de phlébotomes. changement climatique not (=> persistance du 2019 il y aurait eu plus de aussi Le nombre de régions => Importance de la S ée parasite) 5 000 cas humains en d’endémicité augmente, vectorielle Libye ; l'Algérie aurait eu ainsi que le nombre de cas environ 400 cas en 2018. humains et animaux Cas humains également en Israël 2018. *maladies zoonotiques **note de 0 (minimum) à 3 (maximum) selon les critères de notation définis dans la démarche de priorisation (page 3) Code couleurs : en jaune : maladies bactériennes ; en bleu : maladies virales ; en vert : maladies parasitaires. CGAAER n° 17125 – cahier 2 Page 16/30
Maladies animales « exotiques » aux îles de la Méditerranée [non détectées entre le 1/1/2018 et le 31/12/2018, dans aucune île] Risques Catégorie France Pays (et îles) du d'introduction et Importance**** Espèces Modalités de Aire de bassin d'émergence*** Commentaires Modalités de réceptives Réservoir Agent Maladie transmission distribution des méditerranéen dans les régions épidémio Surveillance Commentaires (Re) / faune pathogène zoonose* (T) / vecteurs / de la dans lesquels la indemnes du (dont place (S) dans les Surveillance (S) sensibles sauvage Vecteurs (V) maladie** maladie a été bassin des îles) îles (Se) rapportée méditerranéen (dont îles) Mycoplasma Péripneumonie 1 Bovinés T directe (voie _ Afrique sub-saharienne Derniers foyers au L'importation de bovins Possible France : réseau Pas de suspicions 2 mycoïdes contagieuse domestiques respiratoire) (Mauritanie 2015), Portugal en 1999 ; vivants dans l'UE est circulation à bas VIGIMYC (S déclarées, peu de subsp. bovine (PPCB) (bovins, Moyen-Orient en France foyers en réglementée et bruit de souches passive) depuis sensibilisation. Intérêt mycoïdes buffles) et 1980-84 contrôlée ; produits peu pathogènes 2003 ; UE : S à des données d’abattoir, biotype SC ruminants (réémergences et germinaux provenant dans le bassin l'abattoir mais S peut passer à sauvages (Se). non introductions) de pays infectés sont à méditerranéen. seulement. côté de souches peu Les ovins sont risque, mais non Difficulté du pathogènes (lésions peu Se mais autorisés dans l'UE. contrôle des mineures). Importance peuvent être Danger des mouvements ; d'isoler des sources introductions non risques associés à mycoplasmes afin de d'infection contrôlées de petits la transhumance. repérer les souches de ruminants en Risques faibles faible pathogénicité en provenance de zones pour les îles, et à circulation. d'enzootie partir des îles Mycoplasma Pleuropneumoni _ Caprins T directe surtout Ruminants Afrique sahélienne, Turquie (Thrace Risques pour les îles si Peut-être plus idem Importance de S en 2 capricolum e contagieuse (aérosols sauvages Afrique de l'Est, Moyen 2004), Tunisie, mouvements de petits répandue que Turquie et en Afrique subsp. caprine infectieux) ; rôle Orient, péninsule Égypte ruminants à partir de rapportée, car sub-saharienne capripneumoni des porteurs arabique, Turquie, Asie zones d'enzootie facilement ae chroniques (Chine) (Turquie) confondue avec d'autres pathologies respiratoires CGAAER n° 17125 – cahier 2 Page 17/30
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