Présentation et utilisation du Web of Science (TP)
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Module ED : « Outils bibliographiques et affiliés : bases de données, logiciels, indices d’évaluation. » http://apps.isiknowledge.com/ Présentation et utilisation du Web of Science (TP) Catherine MORGE Elise TANCOIGNE Julie MARIN Direction des Bibliothèques et de la Documentation - Département Systématique et Evolution morge@mnhn.fr - tancoigne@mnhn.fr - jumarin@mnhn.fr 1 24 – 25 – 26 janvier 2011
Module ED : « Outils bibliographiques et affiliés : bases de données, logiciels, indices d’évaluation. » Interroger une base de données Utilisateur Document Traduction Indexation de la question en Mots-clés langage documentaire Index Classification Thesaurus Liste d’autorités 2
Module ED : « Outils bibliographiques et affiliés : bases de données, logiciels, indices d’évaluation. » Présentation du Web of Science Science Citation Index Expanded™ Producteur : le WoS - Web of Science fait partie des produits du Web of Knowledge développé par la société ISI – Information Scientific Institute de Thomson Reuters Scientific. WoS permet la recherche de références bibliographiques scientifiques dans quatre bases de données, ensemble ou séparément : • Science Citation Index Expanded (SCIE) • Social Sciences Citation Index • Arts & Humanities Citation Index • Index Chemicus/ Contenu du WOS SCIE : sciences (en particulier biologie et sciences de la Vie et de la santé), technologie et sciences appliquées. Type de données : pour la totalité du WOS, environ 40 millions de références bibliographiques référencées en 2010 et plus de 700 millions de références citées. Résumés disponibles, lien vers le texte intégral, espace personnel, export vers les logiciels de références bibliographiques. Un outil puissant au service des citations : Cited Reference Search (Recherche par Référence Citée). WOS SCIE : les références, réparties principalement en revues et articles de revues (50%) et communications de congrès (30%), plus de 100 Book Series suivies. Actuellement environ 7000 titres de revues sont dépouillées dans le WOS SCIE. Langue : majoritairement en anglais (plus de 92%). Couverture géographique : internationale, majoritairement américaine (environ 35 % des références). Couverture chronologique : depuis 1900 (depuis 1956 au Muséum). Mise à jour : hebdomadaire. Consultation : accès sur abonnement. 3
Module ED : « Outils bibliographiques et affiliés : bases de données, logiciels, indices d’évaluation. » 1ère partie. Interroger le WOS Un peu de vocabulaire Notice = fiche d'identité de l'article Toutes les informations sur le document, appelées métadonnées, sont réparties en différents champs : auteur, titre sujet, etc. Notice abrégée ou courte = correspond le plus souvent à des références bibliographiques normalisées. Notice détaillée ou complète (ou longue) = permet de voir tous les champs, y compris les résumés. Champ = zone informatique permettant de stocker une information spécifique Les principaux champs de la notice détaillée sont interrogeables : auteurs, titres, année de publication… Dans le Web of science Topic lance la recherche dans plusieurs champs simultanément : titres, résumés, mots clés de l’auteur (Author Keywords) et Keywords Plus. - Le résumé ou abstract = 15-20 lignes qui permettent de connaître le contenu de l'article. - Author Keywords = mots clés libres ajoutés par les auteurs. - Keywords Plus : mots clés en vocabulaire contrôlé ajouté par le producteur de la base de données (Thomson Reuters), ces mots clés permettent d’optimiser l’interrogation de la base en enrichissant son indexation. L’ensemble des Keywords Plus du Web of Science constitue une liste d’autorités qui joue un rôle voisin de celui d’un thesaurus. Topic équivaut à une recherche sujet. Titres abrégés de revues Limités à 20 caractères, les titres abrégés sont uniques et leur liste est soumise à une normalisation internationale. Lors de la rédaction d’une bibliographie, on cite soit le titre complet soit le titre abrégé d’une revue en fonction du style appliqué. Il n’est en aucun cas permis d’extrapoler un titre abrégé à partir du titre complet lorsqu’on ne le trouve pas dans une liste de référence. Identifiants numériques ISSN = International Serial Standard Number, c’est l’identifiant d’une revue, propre à un titre et un seul. DOI = Digital Object Number, identifie un document numérisé. 4
Module ED : « Outils bibliographiques et affiliés : bases de données, logiciels, indices d’évaluation. » 1ère partie. Interroger le WOS La recherche 1/2 Onglets : Accès aux bases de données disponibles sur la plate forme, variables en fonction des abonnements de l’établissement. Champs : Par défaut c’est "Topic" qui est sélectionné en premier. "Topic" correspond à une recherche dans : les mots des titres, ceux des résumés, dans les mots clés des auteurs ainsi que dans les Keywords Plus. Limites par date: Variables en fonction Combiner les termes avec les opérateurs booléens : des abonnements de AND OR NOT l’établissement. 5
Module ED : « Outils bibliographiques et affiliés : bases de données, logiciels, indices d’évaluation. » 1ère partie. Interroger le WOS La recherche 2/2 Onglet "Search" Recherche simple : Commencer la recherche avec quelques mots clés préalablement sélectionnés et vérifiés dans TermSciences par exemple http://www.termsciences.fr/ ou avec d’autres outils pertinents de votre choix. La recherche d’expressions exactes se fait en utilisant des guillemets. On peut combiner les mots clés grâce aux opérateurs booléens, soit en utilisant ceux proposés dans les menus déroulants à gauche des formulaires, soit en les tapant en clair dans le formulaire de recherche. Nota bene : on peut ajouter des formulaires et donc des champs (jusqu’à 25) en cliquant sur "Add Another Field" sur la page d’accueil de la recherche. L’opérateur de proximité SAME est analogue au booléen AND mais introduit en plus une notion de proximité. SAME peut être utilisé pour rechercher deux termes situés dans la même phrase quel que soit leur ordre. Exemple : tree SAME life. Penser à utiliser la troncature * : phylogen* va retrouver phylogeny, phylogenetic, phylogenesis. La troncature * ne s’emploie qu’en fin de mot et remplace de zéro à x caractères. A titre indicatif deux autres caractères de troncature sont utilisables : - $ remplace 0 ou 1 caractère pour rechercher en une fois color et colour : colo$r - ? pour remplacer 1 caractère et 1 seul Ces jokers ne peuvent s’utiliser qu’à l’intérieur des mots. Mieux vaut, dans les débuts, utiliser le booléen OR. 6
Module ED : « Outils bibliographiques et affiliés : bases de données, logiciels, indices d’évaluation. » 1ère partie. Interroger le WOS Les pages de résultats Ci-contre la page de résultats : En haut : - Rappel de la requête - Nombre de références - Fonctionnalités (tris, feuilletage A gauche dans la frame : Limites applicables Les enregistrements contiennent tous la phrase ET le mot clé recherchés Ci-dessous une notice détaillée : Les termes recherchés sont surlignés. 7
Module ED : « Outils bibliographiques et affiliés : bases de données, logiciels, indices d’évaluation. » 1ère partie. Interroger le WOS Les champs et les index Champs le plus couramment utilisés : Title : titre de l’article Author : nom de personne Group author : collectivité auteur Publication Name : titre de la revue, ne pas confondre avec " Title " Year Published : année de publication, ne pas confondre avec la date de mise en ligne Trois des options : Author, Group Author et Publication name offrent un lien vers les index signalé par une loupe En cliquant sur cette loupe on accède aux listes des auteurs et des revues indexés dans le Web of Science. Ici nous recherchons Philippot L. 8
Module ED : « Outils bibliographiques et affiliés : bases de données, logiciels, indices d’évaluation. » 1ère partie. Interroger le WOS Historique Onglet Search history Historique de recherche : L’historique se remplit automatiquement au fur et à mesure des recherches, on peut l’utiliser pour rappeler des requêtes, ou combiner de nouvelles requêtes avec AND et OR. On peut également le modifier (Delete) et/ou le sauvegarder dans son espace personnel, ce qui nécessite de créer un compte. Astuces : Utiliser l’historique pour combiner les termes de recherche Exploiter les mots clés trouvés dans les résumés et les mots clés des notices détaillées pour enrichir le vocabulaire d’interrogation de la base. La recherche de références bibliographiques est une démarche itérative aboutissant à des listes de mots clés propres à une base de données 9
Module ED : « Outils bibliographiques et affiliés : bases de données, logiciels, indices d’évaluation. » 1ère partie. Interroger le WOS Exercices Exercice 1 : recherche des publications d’un établissement Rechercher dans le Web of science les références publiées par le MNHN. museum SAME Paris ; MNHN SAME Paris lister les institutions On voit les erreurs de frappe ; les traductions non désirées du nom ou encore les acronymes Exercice 2 : recherche des publications d’un chercheur Rechercher dans le Web of science les publications de Philippe Bouchet et de Brigitte Crouau. bouchet p* subject areas astronomy On voit les problèmes d’homonymie crouau* b* analyze results treshold = 1 On voit les problèmes de changement de nom après mariage et le problème des noms avec tiret Exercice 3 : choix de synonymes de recherche Rechercher dans le Web of science les publications de phylogénie, systématique et taxonomie des Anoures anura* AND phylogen* ; anura* AND systematic* ; anura* AND taxonom* search history combine deux par deux avec l’opérateur AND On voit que des articles qui comportent le mot taxonomie ne comportent pas forcément le mot systématique ; etc. Exercice 4 : recherche des publications d’un journal Rechercher dans le Web of science les publications du Proceedings of the Linnean Society of London et Molecular and Cellular Biology proc* lin* soc* lond* ; mol* cell* bio* On voit qu’il n’y a pas les problèmes cités plus haut (auteurs, établissements) car les noms sont standardisés 10
Module ED : « Outils bibliographiques et affiliés : bases de données, logiciels, indices d’évaluation. » 2e partie. Exploiter les résultats Cibler la recherche : limites et analyse 1/2 Reprendre dans l’historique la requête Topic=("escherichia coli" and phylogeny) et réafficher la liste des résultats Dans la frame de gauche "Subject Areas" propose le top 5 des domaines les plus fréquemment utilisés dans le lot de références, en cliquant sur le lien "More options / values" on fait apparaître la liste des 100 domaines les plus fréquents. Cette liste de domaines donne lors d’une recherche un aperçu synthétique des grandes thématiques concernées. Limites les plus couramment utilisées : - Subject Areas - Authors : qui sont les spécialistes ? - Source titles : quels sont les titres de revues les plus Exercices : pertinents par rapport à mon Cocher les cases sujet ? GENETICS AND HEREDITY - Institutions : attention les EVOLUTIONARY BIOLOGY auteurs ne remplissent pas Puis appuyer sur le bouton Refine toujours leurs affiliations de Que constate-ton au niveau du nombre de réponses et qu’en conclure ? façon normée. A quel opérateur booléen correspond le bouton Refine ? - Document Types En utilisant Refine results sélectionner les articles de revues, les reviews et - Publication years éliminer les éventuels articles rédigés dans des langues non pratiquées. 11
Module ED : « Outils bibliographiques et affiliés : bases de données, logiciels, indices d’évaluation. » 2e partie. Exploiter les résultats Cibler la recherche : limites et analyse 2/2 Il est tout à fait possible d’utiliser l’option "Refine results" plusieurs fois mais on peut aussi appliquer des limites en cliquant sur le lien "Analyze results" soit en haut à droite de la page de résultats, soit en bas de la frame de gauche. Toutefois l’interface est moins intuitive et propose moins de fonctionnalités et élimine toutes les références ayant moins de deux occurrences. 12
Module ED : « Outils bibliographiques et affiliés : bases de données, logiciels, indices d’évaluation. » 2e partie. Exploiter les résultats Le panier documentaire (Marked List) 1/2 Onglet "Marked List" Le Panier documentaire : On peut sélectionner des références une à une et les ajouter au panier soit depuis les pages de résultats, soit depuis les notices complètes afin de les imprimer, de les envoyer par email ou de les sauvegarder dans un logiciel de gestion de références bibliographiques. Il est également possible d’envoyer tout un lot de références dans le panier documentaire (voir page suivante). Le panier peut contenir jusqu'à 500 références. Ajouter une référence au panier documentaire : - Depuis la liste abrégée - Et depuis la référence complète 13
Module ED : « Outils bibliographiques et affiliés : bases de données, logiciels, indices d’évaluation. » 2e partie. Exploiter les résultats Le panier documentaire (Marked List) 2/2 Exporter les références du panier documentaire. Les fonctions d’export sont en haut de la page au- dessus de la liste des références. Display Marked List : Contient les paniers documentaires de chaque base de données. Si on interroge plusieurs bases de données plusieurs paniers documentaires. Step 1 : Personnaliser les champs exportés. Attention ! "Abstract" n’est pas coché par défaut. Step 2 : Choisir les options d’exports : impressions, email, ou exportation vers un logiciel de références bibliographiques (plusieurs formats sont disponibles, choisir celui qui correspond au logiciel utilisé). 14
Module ED : « Outils bibliographiques et affiliés : bases de données, logiciels, indices d’évaluation. » 2e partie. Exploiter les résultats Exporter les résultats Les fonctionnalités d’exportation sont directement disponibles depuis les pages de résultats en haut de chacune des pages. Cliquer sur "More Options" pour basculer en bas de page En bas de chaque page de résultats se trouvent détaillées toutes les options d’export. Step 1 : Sélectionner les enregistrements : ceux cochés dans la liste, tous les enregistrements de la page, ou bien un ensemble d’enregistrements dans une fourchette donnée (moins de 500 enregistrements qui est la capacité maximum du panier documentaire). Step 2 : Choisir les champs à exporter. Par défaut sont sélectionnés la liste des auteurs, le titre et la source. On peut ajouter l’abstract, ou bien choisir l’enregistrement complet (mots clefs, adresses et références citées). Step 3 : Choisir les exports impression, email, Marked List, et exportation vers un logiciel de gestion de références bibliographiques. 15
Module ED : « Outils bibliographiques et affiliés : bases de données, logiciels, indices d’évaluation. » 2e partie. Exploiter les résultats Créer un compte personnel. Sauvegarder les recherches et créer des alertes Depuis l’historique (onglet "Search History") Après avoir éventuellement modifié l’historique, cliquer sur le bouton "Save History / Create Alert". Puis créer un compte personnel ou rentrer ses login et password. On peut alors enregistrer l’historique, le nommer et cocher la case " Send Me E-Mail Alerts " si l’on souhaite créer une veille automatisée sur la dernière requête. Terminer en cliquant sur "Done« (cf. page suivante). L’historique sera sauvegardé dans sa totalité mais l’alerte ne sera installée que sur la dernière requête. Astuces : créer une alerte permet d’automatiser une veille documentaire, chaque fois qu’une nouvelle référence correspondant à la requête sera publiée dans la base elle générera un envoi automatique de mail. 16
Module ED : « Outils bibliographiques et affiliés : bases de données, logiciels, indices d’évaluation. » 2e partie. Exploiter les résultats Créer un compte personnel. Sauvegarder les recherches et créer des alertes Il est également possible de sauvegarder un historique en local. Pour cela utiliser le bouton "Save on your workstation" en bas de la page de l’historique. Création d’un fichier history.wos que l’on enregistre en local et que l’on peut réimporter par la suite dans le WOS. 17
Module ED : « Outils bibliographiques et affiliés : bases de données, logiciels, indices d’évaluation. » 2e partie. Exploiter les résultats Créer un compte personnel. Sauvegarder les recherches et créer des alertes Pour rappeler les requêtes sauvegardées sur le serveur, cliquer sur My Saved Search Open Run Continue. La requête est alors relancée et mise à jour. D’autres fonctionnalités sont proposées sur le 1ère page. Dans "Alerting" on peut renouveler les alertes qui arrivent à expiration. Dans "Modify Settings" on peut modifier la requête sauvegardée. Dans " Open from your workstation " on peut télécharger le fichier sauvegardé history.wos. 18
Module ED : « Outils bibliographiques et affiliés : bases de données, logiciels, indices d’évaluation. » 3e partie. Exploiter les références citées L’exploitation des références bibliographiques et des notes de bas de pages permet de savoir de quels travaux l’auteur s’est inspiré. Elle est donc toujours rétrospective. La recherche des références citées a pour point de départ une référence bibliographique donnée et retrouve les travaux qui la citent et donc s’en inspirent. Une telle recherche ne peut se faire que sur des articles qui datent de quelques mois voire années, les articles récents même excellents n’ont pas encore de postérité. La recherche de références citées dans le Web of science se fait à partir du nom du premier auteur, du titre de la revue et de la date. Il n’y a pas de possibilité de recherche de référence citée à partir du titre de l’article. On peut également créer une alerte à partir de la référence repérée qui générera un envoi automatique de mail chaque fois qu’une référence ajoutée dans la base citera cette référence. (Voir les copies d’écran sur les pages suivantes) 19
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Module ED : « Outils bibliographiques et affiliés : bases de données, logiciels, indices d’évaluation. » 3e partie. Exploiter les références citées Title: THE PHYLOGENY OF PROKARYOTES Author(s): FOX GE, STACKEBRANDT E, HESPELL RB, et al. Source: SCIENCE Volume: 209 Issue: 4455 Pages: 457-463 Published: 1980 Times Cited: 1,088 Ma recherche a produit une liste de références aux travaux de Fox GE dans la revue Science. Les références citées sur lesquelles apparaît un lien "view record" correspondent à des articles retrouvés sur la base de données. Les références sans lien "view record" ne sont pas automatiquement reliées à un article de la base de donnée. Certaines de ces références peuvent être des films, des livres, ou d’autres documents non indexés dans le Web of science. Dans d’autres cas, des erreurs ont été commises par les auteurs en référençant l’article qui n’est donc pas reconnu automatiquement. 21
Module ED : « Outils bibliographiques et affiliés : bases de données, logiciels, indices d’évaluation. » 3e partie. Exploiter les références citées 22
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