Avec Quantum ActiveScale, Genomics England stocke, protège et donne accès à plusieurs pétaoctets de données génomiques - Allbound
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ÉTU DE DE CAS
Avec Quantum ActiveScale, Genomics England
stocke, protège et donne accès à plusieurs
pétaoctets de données génomiques
Genomics England a été créé en 2013 par le ministère britannique de la Santé et des Affaires
sociales pour gérer le projet « 100 000 génomes », une initiative révolutionnaire visant
à séquencer les génomes entiers d’un grand nombre de patients atteints de maladies rares
et de formes courantes de cancers. En 2018, le projet a été considérablement élargi, ce qui
a contraint Genomics England à étendre son infrastructure de stockage de données.
L’utilisation de la solution de stockage objets ActiveScale™ de Quantum au sein d’un
environnement unifié et intégré permet à la société de stocker, de protéger et de donner
«
accès à des centaines de pétaoctets de données génomiques.
Stockage objets ActiveScale
PRODUITS PRÉSENTÉS
Ce que nous aimons dans le système
ActiveScale, c’est que son architecture
»
inhérente s’appuie sur BitSpread,
une technologie de placement intelligent et
dynamique des données avec erasure coding.
David Ardley
Responsable de la prestation de services techniques, Genomics England
« Il nous fallait une infrastructure beaucoup plus évolutive que les solutions NAS
existantes, extensible à plusieurs centaines de pétaoctets.
»
David Ardley - Responsable de la prestation de services techniques, Genomics England
Genomics England poursuit des objectifs incident efficace pour restaurer rapidement
ambitieux. La société a été créée pour les données en cas de catastrophe ou autre
séquencer les génomes d’un très grand perturbation majeure.
nombre de personnes, le but étant d’acquérir
La société avait besoin d’une solution capable
de nouvelles connaissances afin d’améliorer
de stocker et de protéger des volumes de
les traitements et d’accélérer le développement
données en rapide expansion. « Il nous fallait
de l’industrie génomique britannique.
PRÉSENTATION DE LA SOLUTION une infrastructure beaucoup plus évolutive
Quelques années après son inauguration, que les solutions NAS existantes, extensible à
∙ Stockage objets ActiveScale de Quantum
la société a atteint son objectif initial, à savoir plusieurs centaines de pétaoctets », explique
∙ Système de fichiers distribué WekaIO
le séquençage de 100 000 génomes. Forte David Ardley, responsable de la prestation de
∙ Mise en réseau Mellanox haut débit
de ce succès, la société s’est vue confier un services techniques chez Genomics England.
nouvel objectif en 2018 : séquencer jusqu’à La nouvelle solution devait en outre assurer
PRINCIPAUX AVANTAGES
cinq millions de génomes sur cinq ans. un accès simple et flexible aux données à plus
∙ Dépassement des limites de capacité de 3 000 chercheurs dans le monde entier.
de la solution de stockage précédente La solution NAS (Network-Attached Storage)
et évolutivité nécessaire à la prise utilisée pour le stockage des données
en charge de volumes de données UTILISATION DU STOCKAGE OBJETS
génomiques en rapide expansion. génomiques montrait malheureusement des
ACTIVESCALE DE QUANTUM
∙ Gain d’agilité permettant de relever de signes de fatigue. Le NAS, qui stockait 21 Po
Genomics England s’est adressé à
nouveaux défis urgents, notamment le de données, avait atteint son nombre maximal
séquençage des génomes des malades Nephos Technologies, un prestataire
du Covid‑19.
de nœuds. Impossible donc de l’étendre.
indépendant de services de données
∙ Protection et résilience accrues Le NAS approchait de ses limites de capacité, basé au Royaume-Uni, pour concevoir et
des données critiques via un
environnement géodistribué réparti sur et les performances s’en ressentaient. implémenter la nouvelle solution de stockage.
trois datacenters. Dans ces conditions, la société était Ensemble, les équipes de Nephos et de
∙ Réduction des coûts et de la incapable d’assurer la résilience de toutes Genomics England ont passé en revue les
complexité associés au stockage des
ces informations génomiques. Malgré des exigences actuelles et les besoins futurs
données grâce à un environnement
efficace et simple à utiliser. sauvegardes sur bande, Genomics England prévus, puis ont élaboré et mis en œuvre
n’avait pas de stratégie de reprise après une nouvelle solution aux multiples facettes.
http://www.quantum.com/customerstories
La solution de stockage intègre un système en soins intensifs, et de 15 000 malades du
« Nous apprécions
de fichiers WekaIO hautes performances, une virus ne présentant que des symptômes légers.
mise en réseau Mellanox haut débit et un Elle a par ailleurs lancé une plate-forme de
la simplicité, la
système de stockage objets ActiveScale de recherche génomique de nouvelle génération facilité d’utilisation
Quantum. Elle crée une architecture à deux pour permettre aux chercheurs et aux et l’architecture des
niveaux, combinant un stockage flash et le fabricants de médicaments d’accéder aux systèmes ActiveScale.
système de stockage objets ActiveScale qui données génomiques et de les utiliser dans
Ces systèmes sont
sert de référentiel Data Lake à long terme. leurs travaux sur le Covid‑19.
Le déploiement initial comprenait 1,4 Po de
véritablement conçus
À peu près au même moment où Genomics pour évoluer en toute
capacité flash et 40 Po de stockage objets.
England s’est engagé dans la recherche sur
transparence vers des
Extensibles indépendamment l’un de l’autre, le Covid‑19, Quantum a racheté ActiveScale.
les deux niveaux de stockage forment un Grâce à l’équipe Quantum, la transition s’est solutions de stockage
environnement de stockage hybride unifié. faite en douceur pour Genomics England. de données sur site et
Les chercheurs peuvent ainsi rapidement
Pleinement confiante dans Quantum et le hybrides de plusieurs
interroger les données de manière exaoctets. »
système ActiveScale, Genomics England
extrêmement randomisée.
a poursuivi l’expansion de son environnement
de stockage objets pour héberger ses travaux David Ardley
NOUVEAUX DÉFIS LIÉS À LA PANDÉMIE Responsable de
sur le Covid‑19. La société a pu porter
DE COVID‑19 la prestation de
sa capacité à plus de 100 Po.
Quelques années seulement après le services techniques,
déploiement du nouvel environnement de Cette extension s’est déroulée de manière Genomics England
stockage, Genomics England a dû à nouveau transparente, en partie grâce à la technologie
s’étendre. Avec l’émergence de la pandémie BitSpread®. « Ce que nous aimons dans À PROPOS DE
de Covid‑19 début 2020, la communauté le système ActiveScale, c’est que son GENOMICS ENGLAND
médico-scientifique mondiale a été confrontée architecture inhérente s’appuie sur BitSpread,
une technologie de placement intelligent et Genomics England a été créé
à de nouveaux défis urgents et la société
dynamique des données avec erasure coding », en 2013 pour gérer le projet
Genomics England était particulièrement
« 100 000 génomes », une
bien placée pour contribuer à une meilleure indique David Ardley. Ce placement
initiative visant à séquencer
compréhension des profils les plus exposés au des données évite tout rééquilibrage
100 000 génomes entiers de
virus. Elle a ainsi entrepris de séquencer les du système, une opération qui peut entraver
patients touchés par des maladies
génomes d’environ 20 000 patients Covid‑19 les performances et la disponibilité.
rares, des membres de leur
famille, ainsi que de patients
atteints de formes courantes de
cancers. Le projet, qui a par la
suite été étendu à cinq millions de
génomes, est financé par l’Institut
national de recherche en santé
du Royaume-Uni, le NHS England
(qui fait partie du service de santé
public national britannique) et
d’autres organismes. Détenu par
le ministère de la Santé et des
Affaires sociales britannique,
Genomics England a pour ambition
d’accélérer et d’approfondir la
recherche génomique, et de mettre
les thérapies géniques à la portée
de tous ceux qui en ont besoin.
En 2020, Genomics England a
entamé une collaboration avec
un consortium de médecins et de
scientifiques pour séquencer des
génomes entiers de personnes
ayant contracté le Covid‑19.
L’objectif est de mieux comprendre
la prédisposition génétique au virus.
http://www.quantum.com/customerstories
ÉTUDE DE CAS
PROTECTION DES DONNÉES ÉVOLUTIVITÉ, MAÎTRISE DES COÛTS Tout aussi important, l’équipe
GÉNOMIQUES VITALES ET RÉDUCTION DE LA COMPLEXITÉ de Genomics England a pu profiter
Le stockage objets ActiveScale protège Avec ActiveScale, Genomics England de ces avantages sans complexité
le contenu et offre les capacités ne souffre plus des limites de capacité supplémentaire. « Nous apprécions
de résilience des données dont de sa précédente solution NAS. La société la simplicité, la facilité d’utilisation
Genomics England a besoin pour a pu étendre son stockage objets pour et l’architecture des systèmes
ses précieux travaux. La société tire prendre en charge un plus grand volume ActiveScale », déclare David Ardley.
parti des fonctions de géodistribution d’analyses génomiques, et même des « Ces systèmes sont véritablement
d’ActiveScale, un autre atout de la travaux supplémentaires sur le Covid‑19, conçus pour évoluer en toute
technologie BitSpread. Avec ActiveScale, sans refonte drastique du stockage. transparence vers des solutions
les données sont réparties sur trois À l’avenir, Genomics England pourra de stockage de données sur site
datacenters pour une protection facilement intégrer le stockage objets et hybrides de plusieurs exaoctets. »
complète en cas de catastrophe majeure ActiveScale avec les environnements
telle que la perte d’un site. Elles restent de Cloud public compatibles Amazon S3
accessibles en lecture et en écriture afin de bénéficier d’une protection
sur les sites restants, et résistent à des supplémentaire et d’une plus grande
pannes matérielles supplémentaires. souplesse d’évolution.
La durabilité des données est de l’ordre
Cet environnement de stockage évolutif
de 99,99999999999999999 %.
réduit également les coûts. Selon Nephos,
La technologie BitDynamics™ assure l’équipe de Genomics England a réduit ses
quant à elle un haut niveau d’intégrité coûts de stockage de 75 % par génome
des données. BitDynamics protège les comparé à l’environnement précédent.
données critiques à grande échelle Ils devraient diminuer de 96 % d’ici 2023.
grâce à un processus d’autoréparation
reposant sur le nettoyage, la vérification,
la réparation et l’optimisation
automatiques du contenu.
La technologie et les services de Quantum permettent aux clients de capturer, créer et partager du contenu numérique, tout en le stockant
et en le protégeant pendant des décennies au coût le plus bas. Les plates-formes de Quantum offrent des performances ultrarapides
pour la vidéo haute résolution, les images et l’IoT industriel grâce à des solutions adaptées à chaque étape du cycle de vie des données,
de l’ingestion hautes performances à la collaboration et l’analyse en temps réel en passant par l’archivage économique. Chaque jour,
les solutions de Quantum aident des sociétés de l’industrie audiovisuelle, des franchises sportives, des chercheurs, des organismes publics,
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des entreprises et des fournisseurs de services Cloud comptant parmi les plus influents de la planète à rendre le monde plus heureux, +33 (0)1 41 43 49 00
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