Groupe ornithologique et naturaliste du Nord - Pas-de-Calais Bilan de l'étude bioacoustique sur l'Engoulevent d'Europe menée dans la Réserve ...
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Groupe ornithologique et naturaliste du Nord – Pas-de-Calais Bilan de l’étude bioacoustique sur l’Engoulevent d’Europe menée dans la Réserve Naturelle Nationale de la Baie de Canche Année 2019 Année 2019 Cédric Beaudoin, Nathan Legroux Année 2019
REFERENCE : BEAUDOIN, C & LEGROUX, N., 2019. Bilan de l’étude bioacoustique sur l‘Engoulevent d’Europe dans la réserve naturelle nationale de la Baie de Canche. Année 2019. 15p. Photo de couverture : Engoulevent d’Europe Caprimulgus europaeus, Thierry Tancrez Relecture : Olivier Fontaine, Lucien Gues
Table des matières Objectifs de l’étude .................................................................................................................... 1 Contexte ..................................................................................................................................... 1 Zone d’étude .............................................................................................................................. 1 Matériels et méthodes ............................................................................................................... 2 Analyses ...................................................................................................................................... 3 Résultats ..................................................................................................................................... 5 Discussion ................................................................................................................................. 11 Méthodologie ........................................................................................................................... 11 Analyses du déplacement des mâles chanteurs ...................................................................... 11 Conclusion et Perspectives ....................................................................................................... 11 Bibliographie ............................................................................................................................ 13 Figure 1. Localisation et délimitation de la Réserve Naturelle Nationale de la Baie de Canche. .................................................................................................................................................... 1 Figure 2. Localisation des points d'enregistrement ................................................................... 2 Figure 3. Sonagramme du chant de l’Engoulevent d’Europe. ................................................... 3 Figure 4. Pics de fréquence d’une pulse des phrases majeures et mineures. ........................... 3 Figure 5. Localisation des numéros d'enregistrements par dates ............................................. 5 Figure 6. Plan factoriel de l’analyse en composante principale représentant les différents engoulevents enregistrés en fonction des passages.................................................................. 6 Figure 7. Localisation d’un individu portant les enregistrements 2,3,17 au cours de la saison.7 Figure 8. Localisation d’un individu portant les enregistrements 11 et 19a au cours de la saison. ......................................................................................................................................... 7 Figure 9. Localisation d’un individu portant les enregistrements 10 et 23 au cours de la saison. ......................................................................................................................................... 8 Figure 10. Localisation d’un individu portant les enregistrements 4,5 et 19b au cours de la saison. ......................................................................................................................................... 8 Figure 11. Localisation des individus portant les enregistrements 4,5,12 et13 au cours de la saison. ......................................................................................................................................... 9 Figure 12. Localisation des individus portant les enregistrements 1 et 13 au cours de la saison. ....................................................................................................................................... 10 Tableau 1. Dates de sessions d’enregistrement ........................................................................ 2
Objectifs de l’étude L’objectif de l’étude est d’améliorer les connaissances sur la population d’Engoulevent d’Europe Caprimulgus europaeus dans la Réserve naturelle nationale de la Baie de Canche. La bioacoustique est une méthode non-invasive qui permet d’individualiser des mâles chanteurs grâce à leur signature vocale. Le but est de préciser les effectifs relevés sur le terrain pas des méthodes classiques de dénombrement. Les analyses par la bioacoustique permettront d’écarter d’éventuels doublons ou de détecter de nouveaux individus chanteurs sur des placettes identiques. L’individualisation de chaque mâle chanteur permet d’identifier la répartition des individus aux cours d’une saison. Si l’étude est réalisée sur plusieurs années, il est possible d’identifier la fidélité des chanteurs au site de reproduction. Contexte D’après le plan de gestion de la Réserve naturelle nationale de la Baie de Canche, l’Engoulevent d’Europe est jugé comme espèce prioritaire. En effet, la population dans la réserve est la plus importante dans le Nord et le Pas-de-Calais et concentre près de 40 % de la population du territoire (Cohez, 1996 ; Stien, 2019). L’objectif II.B.1 inscrit dans le plan de gestion prévoit une opération de suivi ainsi que l’amélioration des connaissances sur l’Engoulevent d’Europe. Le syndicat mixte EDEN 62, gestionnaire de la Réserve naturelle nationale de la Baie de Canche a missionné le Groupe ornithologique et naturaliste du Nord – Pas-de-Calais (GON) afin de mener une étude bioacoustique dans une partie de la réserve. Zone d’étude La Réserve naturelle nationale de la Baie de Canche d’une superficie de 512 hectares se situe sur les communes d’Etaples, Camiers et Lefaux (Figure 1). Figure 1. Localisation et délimitation de la Réserve Naturelle Nationale de la Baie de Canche. 1
Matériels et méthodes Afin d’enregistrer le maximum de mâles chanteurs, les chargés d’études du GON guidés par les agents d’Eden 62 ont réalisé cinq sessions du 13/05/19 au 25/06/19 (Tableau 1) sur les points 1 à 3 et quatre sessions sur les points 4 à 6 (figure 2). Ces points d’écoute ont été localisés dans des secteurs de la réserve connus pour avoir des densités importantes d’engoulevents. Figure 2. Localisation des points d'enregistrement Tableau 1. Dates des sessions d’enregistrement Dates des sessions Points d'enregistrement 13/05 1à6 23/05 1à6 06/06 1à6 19/06 1à3 25/06 1à6 Le matériel utilisé est un enregistreur Tascam DR-100 MKIII et un micro directionnel Sennheiser avec une bonnette permettant d’atténuer le bruit du vent ©C. Beaudoin (Photo ci-contre). 2
Analyses Le chant de l’Engoulevent d’Europe est divisé en deux phrases successivement répétées à plusieurs reprises lors d’un même chant (Figure 3). La phrase majeure, qui dure le plus longtemps, est entrecoupée par une phrase mineure dont la fréquence fondamentale d’émission est plus basse. Phrase mineure Phrase majeure Figure 3. Sonagramme du chant de l’Engoulevent d’Europe. D’après Winkler, D. (2008), les Engoulevents d’Europe sont identifiables par les caractéristiques de leur chant et par l’étude de la bioacoustique. Dans son étude, 4 facteurs sont pris en compte (Figure 4) : - La fréquence (Hz) de la phrase majeure - La fréquence (Hz) de la phrase mineure - La durée (s) de la phrase majeure - La durée (s) de la phrase mineure Figure 4. Pics de fréquence d’une pulse des phrases majeures et mineures. Rebbeck et al. (2001) utilisent la fin de la phrase majeure pour réaliser les analyses de la fréquence et de la durée. Les 20 dernières impulsions sont analysées à partir des trois dernières avant la phrase mineure. Cela permet d’éviter de réaliser des analyses sur des 3
impulsions qui s’atténuent avant le début de la phrase mineure. La phrase mineure est, quant à elle, analysée en supprimant la première et dernière impulsion pour les raisons inverses. L’analyse de ces quatre facteurs par l’utilisation des statistiques multivariées permet d’individualiser les différents chanteurs et ainsi de répondre aux différentes hypothèses émises dans les objectifs de l’étude. 4
RESULTATS Lors des cinq sorties, 25 engoulevents ont été localisés et enregistrés (Figure 5) sur les points d’écoute mais également lors des déplacements. Les analyses ont révélé la présence d’un minimum de 13 individus différents. Figure 5. Localisation des numéros d'enregistrement par dates Sur les 25 enregistrements individuels, 7 pistes n’ont pu être exploitées car la qualité était insuffisante (vents, individu trop lointain, …) ou alors il n’y avait pas assez de fragments de chant pour réaliser une analyse complète. L’analyse en composante principale montre bien la superposition de certains individus identiques en terme de composition de chant (Figure 6). 5
Figure 6. Plan factoriel de l’analyse en composante principale représentant les différents engoulevents enregistrés en fonction des passages (points bleus : 13/05 ; points verts : 23/05 ; points rouges : 06/06 ; points orange : 19/06 et points jaunes : 24/06). Dans un premier temps, l’analyse des axes de l’ACP montre que ceux-ci représentent 75 % de l’inertie totale. C’est un pourcentage très haut qui suggère que le plan représente convenablement la variabilité du jeu de données. L’ACP montre des individus très proches qui ont été enregistrés à des dates différentes. En prenant les cas individuellement, nous remarquons que des individus sont très fidèles à leur territoire et que d’autres mâles ont des déplacements importants lors d’une même nuit ou lors de passages à différentes dates. L’individu portant les enregistrements 2,3 et 17 est cantonné entre le 23 mai et 19 juin à la même placette de chant (Figure 7). Son absence lors du passage du 6 juin peut être expliquée par un passage plus tardif sur la placette. 6
Figure 7. Localisation d’un individu portant les enregistrements 2, 3, 17 au cours de la saison. L’individu 11 et 19a présente également une fidélité à son poste de chant entre le 6 et le 24 juin (Figure 8). Malheureusement, l’enregistrement n°25 ne comportait pas assez d’éléments du chant pour permettre une analyse mais on peut penser qu’il s’agit du même individu. Figure 8. Localisation d’un individu portant les enregistrements 11 et 19a au cours de la saison. 7
Lors de la soirée du 6 juin, l’individu 10 et 23 a parcouru 700 m entre 22h29 et 23h (Figure 9). C’est un déplacement très important pour un même individu lors d’une même soirée qui pourrait être expliqué par un oiseau immature, non apparié avec une femelle ou encore en recherche d’un territoire. Figure 9. Localisation d’un individu portant les enregistrements 10 et 23 au cours de la saison. Les individus 4, 5 et 19b sont très proches lorsqu’on analyse l’ACP (Figure 6). Il est intéressant de remarquer que cet individu a chanté à deux placettes différentes distantes de 500m environ lors de la même soirée du 23 mai (Figure 10). Cet individu sera contrôlé de nouveau le 24 juin à 4 km de son premier poste de chant. 8 Figure 10. Localisation d’un individu portant les enregistrements 4,5 et 19b au cours de la saison.
Notons que le 24 juin, deux mâles (12 et 13) ont été contactés sur des placettes de chant identiques à l’individu 4 et 5 contacté le 26 mai mais ce sont réellement deux individus différents (Figure 6). Malheureusement, lors du passage du 6 juin aucun contact n’a pu être enregistré sur ce secteur car nous sommes arrivés tardivement sur le site. Entre les deux dates, il s’est écoulé 32 jours, soit la durée d’un cycle classique de nidification pour l’espèce (32-34 jours entre la ponte et l’envol des jeunes ; MNHN, 2010). Plusieurs hypothèses peuvent être avancées pour comprendre ce changement de mâles : - La nidification de l’individu aux numéros d’enregistrements 4 et 5 a échoué sur ce secteur causé par l’arrivée des individus 12 et 13 « plus dominants » ; - Le territoire laissé vacant a été réoccupé par deux autres mâles ; - La nidification a été menée à terme, il n’y a pas eu de seconde ponte et le territoire a été réoccupé. Figure 11. Localisation des individus portant les enregistrements 4,5,12 et13 au cours de la saison. 9
Enfin, l’individu 1 a été enregistré lors de la première session. Le fort vent lors de cette session n’a pas permis des longs enregistrements. Toutefois, la proximité de l’individu a permis d’avoir des séquences propres permettant une analyse. Ce même individu a été enregistré (numéro 13) à environ 2 km, le 24 juin (Figure 12). Figure 12. Localisation des individus portant les enregistrements 1 et 13 au cours de la saison. 10
Discussion Méthodologie Lors de cette première étude, nous avons pu remarquer que les mâles ne chantent pas toute la soirée. Le pic de chant apparaît quelques dizaines de minutes après le coucher du soleil et dure environ 1h-1h30. La distance entre les différents points d’écoute était importante (déplacement en voiture ou à pied entre les points) et à notre arrivée sur les derniers points, malheureusement les mâles ne chantaient plus ou étaient absents, probablement partis chasser. Cette problématique a été décrite par Zwarts & al en 2014, ils ont montré par une méthode de bioacoustique passive (enregistreur de type SM2) que les engoulevents chantent de préférence au crépuscule et au lever du jour. Durant la nuit, les mâles se font beaucoup plus discrets. Analyses du déplacement des mâles chanteurs D’après les premiers résultats de cette étude, il a été constaté des mâles très fidèles à leur territoire et des autres capables de déplacements très importants lors d’une même nuit ou durant la saison de nidification. Plusieurs études montrent que les mâles qui ont tendance à se déplacer sur de longues distances sont en réalité des mâles non appariés (Sharps, 2013 ; Sharps & al, 2015). En 2019, lors d’une même nuit, un mâle a parcouru 700 m entre deux placettes de chant pendant les 30 minutes d’écart entre les enregistrements. Dans la bibliographie, la moyenne des distances parcourues entre deux postes de chant est d’environ 500 m (Sharps, 2013) et 750 m (Zwarts, 2014 ; Sharps & al, 2015) selon les études et les habitats exploités par l’espèce. Celles-ci corroborent bien les déplacements de certains mâles dans la Réserve Naturelle Nationale de la Baie de Canche. Un second mâle, réellement cantonné, a réalisé un déplacement d’environ 380 m. Ce chiffre correspond à une distance moyenne qui peut être observée dans diverses études (Zwarts, 2014 ; Sharps, 2015). Toutefois, toutes ces distances sont approximatives car aucun pointage n’a été réalisé directement sur le terrain par des points GPS. De plus, il est difficile de localiser précisément un engoulevent qui chante de nuit et distant de plusieurs mètres. Conclusion et Perspectives L’étude réalisée en 2019 par la bioacoustique a démontré plusieurs facettes du comportement des engoulevents lors de la période de nidification. En effet, la bioacoustique a permis de caractériser la signature vocale des différents mâles chanteurs, d’étudier la fidélité à la placette de chant ainsi que d’identifier des éventuels déplacements durant la période de nidification. Quelques biais ont été mis en avant lors de cette première étude notamment l’espacement trop important entre les points d’écoute qui a nécessité des temps de déplacement trop 11
importants et un manque d’enregistrement sur certains points. En effet, la bibliographie montre que les mâles chantent préférentiellement au crépuscule et au lever du jour. Ainsi, les derniers points d’écoutes étaient réalisés entre minuit et 1h du matin, période moins optimale pour la détection des mâles partis chassés (Zwarts, 2015). Nous avons ainsi des périodes importantes d’absences de données (1 mois), ce qui s’avère moins précis dans le détail des évènements. Pour pallier à ce manque de données, il serait intéressant de coupler le suivi actif par la pose d’un dispositif passif dans certains secteurs. Il est possible d’utiliser des SM4 positionnés dans les secteurs intéressants et déjà effectués en 2019 afin d’avoir des comparaisons pour les années à venir. L’absence de données et l’explication pour comprendre de tels déplacements des mâles peuvent provenir de notre méthode d’approche. Dans la nuit, il est difficile de se repérer et les lampes peuvent être des sources de dérangement important. Plusieurs mâles ont été surpris à notre arrivée et se sont déplacés ou ont arrêté de chanter. L’immobilité sur les secteurs d’étude semble importante à prendre en compte. Pour démontrer la fidélité interannuelle des mâles, les mêmes secteurs devront être parcourus en 2020 selon les améliorations de méthodes décrites. Une seconde méthode pourrait être utilisée pour comprendre les déplacements des mâles et/ou des femelles durant la période de nidification, la pose de balise sur les individus. Cette technique serait beaucoup plus précise pour répondre à cet objectif, malgré tout elle est beaucoup plus invasive et peut engendrer des échecs et des comportements non innés chez l’espèce. Enfin pour conclure, l’étude a montré que des déplacements importants de mâles chanteurs pouvaient être effectués lors d’une même soirée, ce qui suggère que des doubles comptages sont possibles lorsque les suivis sont réalisés par les méthodes classiques de dénombrement de la population. Il est alors possible que la population de la RNN Baie de Canche soit légèrement surestimée. Toutefois, malgré l’étude par la nouvelle technique qu’est la bioacoustique, cela confirme que cette population d’Engoulevent d’Europe est la plus importante du territoire du Nord – Pas-de-Calais et qu’il est donc important de la protéger. 12
Bibliographie Cohez, D., 1996. L’Engoulevent d’Europe Caprimulgus europaeus dans les dunes de la réserve naturelle de Baie de Canche. Université d’Artois, faculté des sciences de Lens. Espace Naturel Régional. 34 p. MNHN, 2010. L’Engoulevent d’Europe Caprimulgus europaeus. Cahiers d’Habitat « oiseaux » - MEEDDAT-MNHN. 4 p. Rebbeck, M., Corrick, R., Eaglestone, B. & Stainton, C., 2001. Recognition of individual European Nightjars Caprimulgus europaeus from their song. Ibis 143 : 468-475. Sharps, K., 2013. The conservation ecology of the European Nightjar (Caprimulgus europeaus) in a complex heathland-plantation landscape. A thesis submitted for the degree of doctor of Philosophy at the School of Environmental Sciences, University of East Anglia, Norwich, UK. 168 p. Sharps, K., Henderson, I., Conway, G., Armour-Chelu, N., & Dolman, P., 2015. Home-range size and habitat use of European nighjtar Caprimulgus europeaus nesting in a complex plantation-forest landscape. Ibis (2015) 0 : 1- 13. Stien, B., 2019. L’Engoulevent d’Europe (Caprimulgus europaeus), in Beaudoin, C., Boutrouille, C., Camberlein, P., Godin, J., Luczak, C., Pischiutta R., & Sueur, F. [coord.], 2019. Les oiseaux nicheurs du Nord et du Pas-de-Calais. Biotope, Mèze : 240-241. Winckler, D., 2008. Habitat selection and territory change of European Nightjar (Caprimulgus europaeus L.) in the Sopron Mountains. Szélkáltó 13 : 1-14. Zwart, M.C., Baker, A., McGowan, PJK., & Whittingham, MJ., 2014. The use of Automated Bioacoustic Recorders to replace human wildlife surveys : An example using nightjars. PLoS ONE 9 (7) : 1-8. 13
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