Le programme de surveillance des mammifères marins - Benjamin GUICHARD Chargé de mission " Mammifères marins - tortues marines " - UBO

Le programme de surveillance des
       mammifères marins

                 Benjamin GUICHARD
 Chargé de mission « Mammifères marins - tortues marines »
        Agence française pour la biodiversité, Brest

                  UE Mammifères marins
                  UBO, 24 octobre 2017

Introduction
France = 2ème plus grande surface d’eaux marines sous juridiction
(10 millions de km²), dans tous les océans, de 51°N à 51°S.

71 des 120 espèces de mammifères marins fréquentent les eaux
françaises : 42 odontocètes, 11 mysticètes, 16 pinnipèdes et 2 siréniens.

Introduction
Convention sur la Diversité Biologique  Objectifs d’Aïchi (2010) = 10%
d’Aires Marines Protégées (AMP) d’ici 2020.

                           2016… 5,1 %

Agence française pour la biodiversité chargée de la stratégie de
création d’AMP + du programme de surveillance des mammifères marins
de la Directive-cadre « Stratégie pour le milieu marin » (DCSMM).

Plan de la présentation

       1- L’Agence française pour la biodiversité
             & les aires marines protégées

  2- La Directive-cadre Stratégie pour le milieu marin

3- Le programme de surveillance des mammifères marins
           SP1 - Populations côtières de cétacés
          SP2 - Populations côtières de phoques
             SP3 - Mammifères marins au large
         SP4 - Échouages de mammifères marins
       SP5 - Interactions avec les activités humaines

1. L’Agence française pour la biodiversité
Créée par la loi du 8 août 2016 pour la reconquête de la biodiversité, de la
nature et des paysages, l'Agence française pour la biodiversité regroupe
depuis le 1er janvier 2017 les compétences de :
   • l'Agence des aires marines protégées
   • l'Atelier technique des espaces naturels
   • l'Office national de l'eau et des milieux aquatiques
   • Parcs nationaux de France
   • + 75 agents du Muséum national d’histoire
     naturelle et 6 agents de la Fédération des
     conservatoires botaniques nationaux
   • les 10 parcs nationaux sont rattachés
     par décret à l’Agence
Soit environ 1300 agents et un champ d'intervention
couvrant les milieux marins, aquatiques et terrestres.

Organisation des services centraux

Organisation territoriale

       (hors parcs nationaux)

Feuille de route 2017

• Apporter un appui à la mise
en œuvre des programmes du
1er cycle de la Directive-
cadre Stratégie pour le
milieu marin, à la révision de
l’évaluation des eaux marines
et des objectifs environ-
nementaux ;
(…)
• Intensifier l’effort de surveillance du milieu marin, notamment dans le
cadre de la DCSMM (en bonne articulation avec la surveillance des aires
marines protégées) et au titre des autres actions de recueil de données
(ex. : programme de recensement des mammifères marins et autre
mégafaune pélagique par observation aérienne) sur la base d’une stratégie
d’acquisition élaborée conjointement avec le Ministère de la Transition
Écologique et Solidaire.

Les aires marines protégées (AMP)
AMP = espace délimité en mer au sein duquel un objectif de protection de
la nature à long terme a été défini.
Loi du 14 avril 2006  6 catégories d’AMP :
• Parc naturel marin
• Parc national ayant une partie maritime
• Réserve naturelle ayant une partie maritime
• Site Natura 2000 en mer :
   - Directive Oiseaux (DO)
   - Directive Habitats-Faune-Flore (DHFF)
• Partie maritime du domaine relevant du
  Conservatoire du Littoral
• Arrêté de protection de biotope ayant une
  partie maritime

Grenelle de la mer (2009) : objectif de 10 parcs naturels marins et 20 %
d’AMP dans les eaux françaises d’ici 2020.

Les aires marines protégées
Parcs Naturels Marins (PNM) :
= outil de protection du milieu
marin créé par la loi de 2006,
visant des secteurs riches en
biodiversité où les activités
humaines sont nombreuses.
Décisions concertées à travers
un conseil de gestion.

9 PNM créés par l’AAMP/AFB entre 2007 (Iroise) et 2017 (Martinique),
avec des enjeux sur les mammifères marins dans chacun d’entre eux.

Les AMP
Natura 2000 :
4 espèces de mammifères marins à
l’annexe 2 de la DHFF : grand dauphin,
marsouin, phoques gris et veau-marin.
 78 sites Natura 2000 désignés en
2008-2009, mais pas tous pertinents…
+ déficit de sites au large pour protéger
les populations pélagiques.

Les aires marines protégées
Natura 2000 au large : 1 site proposé en Manche ouest (marsouin),
1 dans le golfe de Gascogne (GD/marsouin), 2 en Méditerranée (GD).

 B. Guichard/AFB

 B. Guichard/AFB

Ces 4 sites devraient être désignés prochainement et leur gestion confiée
à l’AFB.

Les aires marines protégées
Les sanctuaires pour mammifères marins :
PELAGOS en Méditerranée (AMP convention de Barcelone), France-Italie-
Monaco, partie française animée par le Parc National de Port-Cros.

AGOA aux Antilles (AMP convention de Carthagène), géré par l’AFB.

Les aires marines protégées
Objectif de 20 % atteint en 2016 avec l’extension des réserves des TAAF
et après la création du parc naturel de la Mer de Corail.

                                                                     Cap Corse

                                                                     Kerguelen

Mammifères marins aussi en dehors des AMP
 approche écosystémique de la DCSMM.                        Nouvelle-Calédonie

B. Guichard/AFB

2. La Directive-cadre Stratégie pour le milieu marin
La Directive 2008/56/CE (DCSMM) vise à rétablir le bon état écologique
des eaux marines de l’UE, à travers la mise en place de Plans d’Action
pour le Milieu Marin (PAMM).
11 descripteurs :
 D1- Biodiversité
 D2- Espèces invasives
 D3- Espèces exploitées
 D4- Réseaux trophiques
 D5- Eutrophisation
 D6- Intégrité des fonds marins
 D7- Conditions hydrographiques
 D8- Contaminants
 D9- Questions sanitaires
 D10- Déchets marins
 D11- Bruit sous-marin
4 sous-régions marines : Manche-Mer du Nord, Mers Celtiques, Golfe de
Gascogne et Méditerranée Occidentale

2. La Directive-cadre Stratégie pour le milieu marin
Pilotage national par le MTES et les préfets
coordonnateurs de chaque sous-région marine,
coordination nationale par l’AFB et l’Ifremer.
Fonctionnement par cycles de 6 ans, constitué de plusieurs étapes :

        Évaluation
        initiale            Adoption du                                Lancement
                                                  Adoption du
        BEE                 programme                           2016       du
2012                 2014       de         2015   programme
                                                                       programme    2020
        Objectifs                                 de mesures
        environne-          surveillance                               de mesures
        mentaux

2018 : fin du 1er cycle  nouvelle évaluation du
BEE, nouveaux objectifs environnementaux.
Nouveau cycle 2018-2024, puis 2024-2030…
jusqu’à atteinte du BEE pour tous les
descripteurs.

2. La Directive-cadre Stratégie pour le milieu marin
 Rôles du programme de surveillance :

                                                                             Évaluer l’état du milieu
                                                                          (biodiversité/qualité de l’eau)
       Évaluer                           Programme de                       au regard des pressions
     l’efficacité                         surveillance                          d’origine humaine
    des mesures                            du milieu
                                             marin                           le BEE est-il atteint ?
                                                                                (11 descripteurs)
   Les mesures sont-elles
    efficaces, suffisantes?
Ex.: inciter les ports à assurer
                                                                               La diversité biologique est-elle conservée
  des services adéquats de
                                                                                          (espèces, habitats) ?
      gestion des déchets
                                                                                Les pressions anthropiques ne nuisent-
                                                                                 elles pas au bon fonctionnement des
                                                                                écosystèmes (ex. quel est l’impact des
                                                                                     déchets sur la faune marine)?
                                     Évaluer l’atteinte des                       Quelles lacunes de connaissances
                                          objectifs                                 (développement d’indicateurs) ?
                                     environnementaux

                                   Ex: Les objectifs de réduction des
                                   déchets en mer ont-il été atteints ?

2. La Directive-cadre Stratégie pour le milieu marin
Élaboration du programme de surveillance :
Un par sous-région marine, co-construit avec
services de l’Etat, socio-pro, ONGs… et en
cohérence avec autres Directives (DCE, DHFF,
DO, PCP…) et CMR (OSPAR, Barcelone).
Forte assise scientifique : CNRS, Ifremer,
Universités, MNHN, BRGM, SHOM, etc.
Large couverture géographique : ZEE
métropolitaine/4 sous-régions marines.
Large champ thématique pluri-disciplinaire : 13
programmes thématiques

2015-2021 : mise en œuvre opérationnelle de la surveillance
Création ou adaptation de dispositifs de suivi avec les experts
scientifiques, maîtres d’ouvrages, opérateurs et financeurs.

2. La Directive-cadre Stratégie pour le milieu marin
Chaque programme de surveillance est animé par un binôme pilote
scientifique/coordonnateur thématique.
         Programmes de surveillance    Coordination / Animation    Pilotage scientifique
                thématiques                   nationale
                   Oiseaux                      AFB                    MNHN-AFB
        Mammifères marins et tortues            AFB               UMS Pelagis/MNHN-AFB
             Habitats benthiques
                                             AFB/BRGM               RESOMAR/BRGM
            et intégrité des fonds
                   Déchets                      AFB                  Ifremer/CEDRE
           Espèces non indigènes               MNHN                    MNHN-AFB
          Poissons / céphalopodes              Ifremer              Ifremer/MNHN-AFB
            Espèces commerciales               Ifremer                    Ifremer
         Changements hydrographiques           SHOM                       SHOM
             Habitats pélagiques                AFB                  CNRS/IFREMER
               Eutrophisation                   AFB                      Ifremer
                Contaminants                   Ifremer                    Ifremer
             Questions sanitaires              ANSES                     ANSES
             Perturbations sonores             SHOM                       SHOM

B. Guichard/AFB

3. Le programme de surveillance des mammifères marins
Adopté en 2015 par les préfets coordonnateurs des quatre sous-régions
marines, mise en œuvre jusqu’en 2021.
Pilote scientifique : Observatoire PELAGIS (J. Spitz)
Coordonnateur thématique : AFB (B. Guichard).

Programme de surveillance divisé en 5 sous-programmes :
   SP1 = populations côtières de cétacés
   SP2 = populations côtières de phoques
   SP3 = mammifères marins au large
   SP4 = échouages de mammifères marins
   SP5 = interactions avec les activités humaines

SP1: populations côtières de cétacés
Cible principalement les
groupes côtiers de grands
dauphins et les marsouins.

Pour le 1er cycle de
surveillance, le principal
objectif est de pérenniser le
suivi des groupes de grands
dauphins en Atlantique, et
de définir une stratégie de
suivi des grands dauphins
en Méditerranée.

Marsouins : connaissances insuffisantes pour définir une stratégie de
surveillance au 1er cycle
 continuer à expérimenter l’utilisation de l’acoustique passive
(hydrophones) et définir une stratégie pour le 2ème cycle.

SP1: populations côtières de cétacés
En Atlantique :
Golfe normand-breton = 400-500 grands dauphins se déplaçant du nord du
Cotentin au cap Fréhel, répartis en trois sous-groupes.
Suivis par des associations : GECC (Cherbourg) et Al Lark (Saint-Malo).
                                                          Golfe normand-
                                                          breton

Molène

                     Île de Sein

Louis et al., 2017

2 groupes en mer d’Iroise : dans l’archipel de Molène (environ 70 individus)
et sur la chaussée de Sein (30 individus), suivis par le PNMI.
Aucun échange entre les deux groupes !

SP1: populations côtières de cétacés
En Méditerranée :
Projet en cours avec le GIS3M pour déterminer les différents groupes
côtiers et définir une stratégie de suivi.
Plateau continental étroit  difficile de distinguer les dauphins côtiers des
dauphins pélagiques + pas de séparation génétique.

                                                   M.Dumontier/PNM Golfe du Lion

Probablement trois groupes côtiers : Golfe du Lion, Provence et Corse.
Pourraient être suivis par les grandes AMP (PNM Golfe du Lion, parc marin
de la Côte Bleue, PN des Calanques et de Port Cros, PNM Cap Corse-
Agriate et RNN des bouches de Bonifaccio) + par des associations.

SP1: populations côtières de cétacés
                                                     L. Schweyer/PNMI
Méthodes de suivi :
Transects en bateau et photo-identification des
individus au moyen de la nageoire dorsale.
+ éventuellement biopsies pour analyses
génétiques,     isotopes    stables    (réseaux
trophiques) et contaminants.

 Y. Turpin/PNMI

                           GIS3M                                        B. Guichard/AFB

Acoustique passive : hydrophones posés au fond ou fixés à des bouées
pour enregistrer les clics. Permet de mieux connaître l’utilisation d’un site
mais pas de quantifier sa fréquentation.

B. Guichard/AFB

SP2: populations côtières de phoques
En limite d’aire de répartition et chassés systématiquement jusqu’à leur
protection totale en 1980, les phoques sont longtemps restés rares sur les
côtes françaises, à part un petit groupe de phoques gris à Molène.
                                                        Phoque veau marin (Phoca vitulina)

                                                                 Phoques gris (Halichoerus grypus)

Vincent et al., 2017

2017 : 6 colonies majeures de phoques gris et 4 de veaux marins
+ nombreux petits groupes.
Augmentation des colonies jusqu’à 30%/an !

SP2: populations côtières de phoques
Phoques gris :
Principales colonies en Baie de Somme
et à Molène, puis au phare de Walde, en
Baie d’Authie et aux Sept-Îles.
Échanges constants avec les popula-
tions des îles britanniques (90 000 !)
                                                         Vincent et al., 2017
       B. Guichard/AFB

Suivi de ces colonies par de nombreux
acteurs différents : associations, ges-
tionnaires d’AMP…

SP2: populations côtières de phoques
Phoques veaux marins :
Plus grande colonie en baie de Somme
+ baies des Veys, d’Authie, du Mont
Saint-Michel…
Se déplacent moins que les phoques
gris mais échanges avec les populations
de Mer du Nord.                                    Vincent et al., 2017

                       K. Dedieu/AFB

Nombreux acteurs également impliqués
dans le suivi des veaux marins.

SP2: populations côtières de phoques
Méthodes de suivi :
Comptages, photo-identification, prélèvement de poils et crottes.
                           Y. Turpin/PNMI                      Vincent et al., 2017

Télémétrie au moyen de balises GPS/GSM, collées au pelage quelques
semaines à quelques mois jusqu’à la mue annuelle
 déplacements, utilisation des sites, zones de chasse…

B. Guichard/AFB

SP3: mammifères marins au large
Deux possibilités pour étudier les populations du large :
  - Survols aériens au moyen de petits avions dédiés
  - Transects en bateau sur des grands navires, dédiés ou non

Méthode par distance-sampling en relevant la distance et l’angle de
chaque observation  évaluation des densités et des abondances.
Ces campagnes permettent également de renseigner les programmes de
surveillance des tortues marines, des oiseaux marins et des déchets en
mer.

SP3: mammifères marins au large
Survols aérien :
Campagne SAMM (Survol
Aérien de la Mégafaune
Marine) en hiver 2011-
2012 et été 2012.

A. Chevallier/Observatoire PELAGIS

Campagnes coordonnées par PELAGIS, financées par l’AFB.
Programme de surveillance : campagne de survol été/hiver tous les 6 ans
 nouveau SAMM en 2017-2018 mais…

SP3: mammifères marins au large
Campagnes régionales (avion + bateau) :
Atlantique : campagnes SCANS (Small
Cetaceans in European Atlantic waters and
the North Sea) organisées par l’Université de
Saint-Andrews en 1994, 2005 et 2016 (été).

          B. Guichard/AFB

Méditerranée : ACCOBAMS Survey
Initiative en juillet 2018
 SAMM hiver 2018-2019 dans les eaux
françaises

SP3: mammifères marins au large
Observateurs embarqués sur des navires :
Principalement sur les campagnes halieutiques annuelles de l’Ifremer :
   - IBTS/Thalassa      : mer du Nord, janvier
   - PELGAS/Thalassa : golfe de Gascogne, mai
   - PELMED/Europe : golfe du Lion, juin
   - CGFS/Thalassa : Manche est, octobre
   - EVHOE/Thalassa : GdG-mer Celtique, novembre

                         B. Guichard/AFB

+ observateurs embarqués sur des ferry (EcoOcéan, ORCA), des navires
des douanes (Musée de la Mer de Biarritz)…

SP3: mammifères marins au large
                                           Hiver     Été
Modélisation d’habitat :
Données d’observation +
traits de vie + paramètres
environnementaux
 modélisation de la
distribution et estimation de
l’abondance des différentes
                                 Grand
espèces.                        dauphin

                                Marsouin
 B. Guichard/AFB                commun

V. Brétille/Observatoire PELAGIS

SP4: échouages de mammifères marins
Un seul dispositif : le Réseau National
Échouages des mammifères marins (RNE).

Environ 400 correspondants de 45 structures
(associations, collectivités, établissements
publics, gestionnaires d’AMP, aquariums…)
                                               Échouages des cétacés et pinnipèdes
                                                en France métropolitaine 1996-2016

en métropole et outre-mer.
Coordination nationale par l’Observatoire
PELAGIS, qui délivre les “carte vertes”.
Augmentation des échouages depuis les
années 1990  record probable en 2017 !

SP4: échouages de mammifères marins
Répartition géographique 1996-2016 :
67 % des échouages en Atlantique, 24 % en Manche-Mer du Nord, 9 % en
Méditerranée. Rôle des vents dominants.
Très peu d’échouages en outre-mer (quelques individus/an/DOM-COM)
Composition spécifique 1996-2016 :

SP4: échouages de mammifères marins
Échouages des marsouins :
3173 échouages en Atlantique et Manche-Mer
du Nord entre 1996 et 2016, pic d’échouage
au printemps.                                                     S. Dromzée/AFB

                                             Échouages de marsouins
                                             2006-2016

Forte augmentation depuis 1999, surtout en
Manche orientale et au sud du GdG.
Causes : inconnues > captures > autres.
Captures : GdG > Manche-Mer du Nord.

SP4: échouages de mammifères marins
Échouages des grands dauphins :
745 échouages en Atlantique et Méditerranée
entre 1996 et 2016, pas de tendance
saisonnière.
                                                          Échouages de
                                                        grands dauphins
                                                             2006-2016

Causes : inconnues > captures > collisions.
Recherche de contaminants dans le GNB (121 échantillons)  PCBs +++
(♂, âge), Hg ++ (âge), phtalates + (âge).

SP4: échouages de mammifères marins
Estimation des mortalités en mer :
40%     des    animaux     échoués
présentent des marques de capture
accidentelle par des engins de
pêche.
Calcul de dérive inverse  estima-
tion des zones de capture et du
nombre d’animaux capturés.

SP5: interactions avec les activités humaines
Dauphin commun : Peltier et al. (2016)
 3650-4700 captures/an dans le GdG
Peut-être pas soutenable pour les populations
de dauphins communs de l’Atlantique NE.
Février-mars 2017 : 800 dauphins communs
échoués dans le GdG (surtout 17 et 85), avec
90 % de marques de capture accidentelles.

Dérive inverse  deux zones de captures différentes suivant l’état de
conservation au moment de l’échouage.

B. Guichard/AFB

SP5: interactions avec les activités humaines
Captures accidentelles : dispositif ObsMer (Ifremer) = observateurs
embarqués sur des navires de pêche volontaires, mais peu d’observations.
 nécessité de renforcer les obser-
vations sur des secteurs ciblés
+ déclaration des captures et
enquêtes auprès des pêcheurs

Développement des énergies
marines renouvelables :
Système d’information en cours
d’élaboration pour collecter les
données d’études d’impact et de
suivi des chantiers d’EMR.
Suivant les sites : survols, bateaux,
acoustique passive, télémétrie,
suivi des échouages…

SP5: interactions avec les activités humaines
Collisions :
Système REPCET pour éviter les
collision en Méditerranée (Pélagos),
mais encore peu utilisé
 extension prochaine à AGOA
À terme : obligation pour tous les
grands navires ?

                                         Dérangement :
                                         Activité de whale watching insuffi-
                                         samment encadrée, dérangement
                                         intentionnel mal caractérisé
                                              nécessité    d’une     évolution
                                         réglementaire pour mieux contrôler
B. Guichard/AFB                          le développement de ces activités.

B. Guichard/AFB

Conclusion
Programme de surveillance des mammifères marins en cours de
démarrage seulement, rythme de croisière d’ici la fin du 1er cycle de
surveillance (2021).
Nombreux opérateurs pour certains suivis (suivi des phoques, RNE…),
importance de l’Observatoire PELAGIS pour d’autres (survols,
observateurs embarqués).
Déficit de campagnes en mer  importance des survols aériens.

2ème cycle : montée en
puissance des AMP (PN, PNM,
Natura     2000),    nouvelles
technologies    (Photo    HD,
drones, acoustique, balises),
prise en compte de la
génétique, des changements
globaux ?                                                   B. Guichard/AFB

www.agence-française-biodiversite.fr

benjamin.guichard@afbiodiversite.fr

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