Licence Biologie-Biochimie - Première année Livret de l'étudiant 2013-2014 - Université d'Orléans

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Licence Biologie-Biochimie
       Première année
         Livret de l’étudiant

             2013-2014
Licence Biologie-Biochimie

Objectifs
    D ans le cadre de l'harmonisation européenne des cur-
                                                                        Directrice des études
sus universitaires (réforme LMD Licence-Master-Doctorat), les
                                                                        Valérie Altemayer
mentions de Licence sont constituées de 6 semestres.                    valerie.altemayer@univ-orleans.fr

                                                                            (Secrétariat)+33238417097

Parcours et objectifs

     L a licence mention  Biologie  Biochimie  a pour
objectifs de :
     - former un public étudiant à toutes les disciplines de la biologie : biologie générale animale et
végétale, biologie cellulaire et moléculaire, génétique formelle et des populations, physiologie animale
et physiologie végétale, biotechnologies, écologie, biologie des organismes et des populations.
     - lui permettre ainsi d'acquérir des connaissances fondamentales et pratiques de niveau Bac+3
dans tous les secteurs techniques et scientiques des Sciences de la Vie, ces connaissances étant
indispensables à une poursuite d'études vers les Masters Recherches et Professionnels ou à l'inté-
gration dans le monde professionnel dans ce domaine.
     - préparer au concours du CAPES Sciences de la Vie et de la Terre, via une insertion dans un
Master de préparation au concours du CAPES (exemple le Master MED-SVT d'Orléans)
     - préparer au concours pour le Professorat des écoles, via une insertion dans un Master
de préparation au concours (exemple le Master MEEFA ESPE d'Orléans) mettre à disposition
les savoirs et les connaissances existants à l'Université d'Orléans dans le domaine des Sciences
biologiques.

    L a première année de la licence mention  Biologie  Biochimie  est organisée en deux
semestres. Le premier est un semestre d'enseignement pluridisciplinaire, commun à tous les étudiants.
Au second semestre, deux options peuvent être choisies par les étudiants :
     L'option Biologie-Biochimie, qui permet d'acquérir les bases d'une formation généraliste en
      sciences biologiques. Ce parcours permet par la suite d'accéder aux diérents parcours de la
      licence Biologie-Biochimie :
             Le parcours  Biologie des Organismes, des Populations et des Ecosystèmes 
      (BOPE) s'intègre dans le contexte actuel de l'essor des disciplines de l'écologie de la bio-
      diversité et de l'étude de l'environnement. Ce parcours permet aux étudiants d'approfondir
      leurs connaissances sur les inter-relations des êtres vivants, animaux ou végétaux, ainsi que
      les liens avec leur environnement. Les mécanismes adaptatifs, évolutifs, physiologiques et
                                                   1
génétiques seront abordés au niveau des organismes et des populations. Pour ce faire, au-
      delà des connaissances théoriques, des études sur le terrain et en laboratoire, intégrant les
      outils modernes de la biologie moléculaire sont proposées.
             Le parcours  Biologie Moléculaire et Cellulaire  (BMC) est destiné aux étudiants
      voulant aborder le monde vivant, par ses aspects physiologiques, cellulaires et moléculaires.
      Ce parcours permettra aux étudiants d'acquérir des connaissances en biologie moléculaire, en
      biochimie structurale, en génétique, en biochimie, en biophysique en physiologie humaine et
      animale et en immunologie. Les aspects pratiques permettront aux étudiants d'acquérir une
      initiation au travail en laboratoire dans ces diérents domaines. Un choix d'option de chimie
      en semestre 6 peut aussi permettre à l'étudiant d'acquérir des connaissances spéciques à la
      chimie bioorganique.
             Le parcours  Biologie et Biochimie du Végétal  (BBV) est spécialement conçu
      pour les étudiants intéressés par le monde végétal et souhaitant se former de façon large
      aux disciplines de la physiologie végétale, de la biologie moléculaire et des biotechnologies
      végétales, ainsi qu'à l'écologie. Il recouvre ainsi partiellement les parcours BOPE et BMC.
      Ce parcours qui a été ouvert aux étudiants durant le contrat précédent a montré qu'il corre-
      spondait parfaitement aux attentes des étudiants  végétalistes . Il permet par le jeu de la
      mutualisation des unités de biologie végétale et de biochimie d'orir une formation originale
      dans ce domaine.
     L'option SVT, contenant des enseignements adaptés aux étudiants désireux de poursuivre
      une formation pour préparer les concours du CAPES Sciences de la vie et de la terre (Parcours
      BGST).

Conditions d'admission en première année de licence

    Baccalauréats scientiques ou équivalent.

Orientation et réorientation

    L e choix du parcours de licence s'eectue l'issue du premier semestre et sera réalisé en con-
certation avec l'enseignant référent et le directeur des études.
Glossaire

Unités d'enseignement :

    Ensemble d'enseignements comprenant des cours, TD, TP ou autres travaux personnels. Chaque
unité est aectée d'ECTS et fait l'objet d'un contrôle de connaissances.
    Unités d'ossature : unités d'enseignement obligatoires correspondant à la formation de l'étudi-

       ant dans la licence pour le parcours choisi.
    Unités de choix : unités à choisir dans une sélection d'unités proposées pour personnaliser son

       parcours.
    Unités libres : UE permettant à l'étudiant de compléter sa formation (culture générale,

       méthodologie universitaire, éléments de professionnalisation, stages, compléments de langue,
       utilisation des ressources documentaires. . . ). Unités à choisir dans le livret des UE libres de
       l'ensemble des composantes de l'Université.

Crédits ECTS (European Credits Transfer System = Système Européen de

Crédits de Transfert)

     A chaque unité d'enseignement (UE) est aectée une valeur en crédits qui correspond au
      volume du horaire de l'unité. Les crédits sont attribués quand l'unité est validée (note > ou
      = à 10/20).
     Chaque semestre validé correspond à 30 crédits. Une licence correspond donc à 180 crédits
      (6 semestres).
     Ces crédits représentent une monnaie d'échange et sont :
       Transférables dans toute autre université européenne ;
       Capitalisables c'est-à-dire dénitivement acquis quelle que soit la durée du parcours de
         l'étudiant.

Grade :

    Les grades universitaires sanctionnent les divers niveaux de l'enseignement supérieur. Depuis le
décret du 8 avril 2002 ce sont : le baccalauréat, la licence, le master et le doctorat.

Diplôme :

    A chaque grade correspond un titre ou un diplôme. Sont conservées les possibilités de délivrer
deux diplômes intermédiaires, ne correspondant pas à un des grades précédents :
 celui de maîtrise (correspondant aux 60 crédits ECTS des semestres 1 et 2 de master) 
      (article 9 de l'arrêté du 25 avril 2002 relatif au diplôme de master),
     celui de DEUG (correspondant aux 120 crédits ECTS des semestres 1, 2, 3 et 4 de licence)
       (article 2 de l'arrêté du 23 avril 2002 relatif aux études universitaires conduisant au grade
      de licence).
    Ces deux derniers diplômes sont délivrés dans la mention retenue sans indication de
parcours ou de spécialité, mais accompagnés d'un  supplément au diplôme .

Supplément au diplôme

    (décret du 8 avril 2002 portant application au système français d'enseignement supérieur de la
construction de l'Espace européen de l'enseignement supérieur. Art. 2). C'est une annexe descriptive
au diplôme, destinée à assurer la lisibilité des connaissances et aptitudes acquises dans le cadre de
la mobilité internationale.

Projet Personnel et Professionnel :

     Le Projet Personnel et Professionnel (SOL1PP01 ou SSL1PP01) est réalisé lors du semestre 1.
Il a pour but d'aider l'étudiant à dénir et/ou préciser un projet en termes de vie professionnelle.
Pour cela, il doit s'informer sur les formations proposées et confronter son projet aux réalités profes-
sionnelles. . . Cette démarche active de son orientation future permet à l'étudiant de faire des choix
pertinents tout au long de ses études.

Equipe de formation :

     Chaque mention de licence ou master est pilotée par une équipe de formation qui veille à
l'adéquation de l'organisation des études avec les objectifs xés, organise l'évaluation générale des
formations et élabore un bilan annuel de la formation.

Conseil de Perfectionnement :

      Equipe de formation élargie à des représentants étudiants élus et des personnalités du monde de
la recherche académique, du monde de l'entreprise et des enseignants en lycée (classes du secondaire
et de BTS). Réuni une fois par an, ce conseil, à la lecture des évaluations de la formation, fait évoluer
la licence pour l'adapter au monde socio-économique, de la recherche et aux formations antérieures.
Directeur des études :

    En contact direct avec les étudiants et la scolarité de l'UFR, il anime l'équipe pédagogique.

Jury :

    Constitué pour chaque semestre et présidé par le Directeur des études, il a en charge le recueil
des notes, l'établissement des moyennes et la validation du semestre. Un jury d'année réuni après
chaque session a en charge la délivrance de l'année et pour la L3 la délivrance nale du diplôme.

Compensations :

     Pour chaque semestre, si la note globale moyenne est supérieure ou égale à 10/20, le semestre
      est validé et lui sont associés 30 ECTS.
     La compensation annuelle s'organise dès la première session entre les deux semestres consé-
      cutifs d'une même année universitaire : soit le semestre 1 avec le semestre 2.

Notes éliminatoires :

    Pas de note éliminatoire en licence
Semestre 1

Maquette des enseignements

                       Intitulé                                ECTS CM   TD CTP    TP NP
                       Panorama du monde animal et              5        3         15
                                                                    30
                       végétal

                       Atomistique et thermodynamique           5   17   16        15
  Ossature - 30 ECTS

                       Molécules du vivant                      5   28   10        10

                       Anglais 1                                3        24

                       Analyse des données en biosciences       2   6    6

                       Introduction à la biologie cellulaire    4   18   4         12   2

                       Préparation au C2i                       3             20

                       Projet personnel et professionnel        3   2    12             2

Détail des enseignements
SOL1BO01               Panorama du monde animal et végétal
 SSL1BO01
Durée   1i’   48 h          Tronc commun

Cours    à       30 h    Responsable                 François Lieutier å                      francois.lieutier@univ-orleans.fr
TD       à        3h
TP       à       15 h   Contenu
   Semestre 1           Origine de la vie et grandes étapes de sa complexification .Eubactéries, archées, eu-
                        caryotes ; les diverses lignées unicellulaires et pluricellulaires ; les plans d’organisation du
Objectifs
                        monde animal (feuillets embryonnaires, cœlome, ..) et caractères généraux des grands
+ Sensibiliser          embranchements. Plans d’organisation du monde végétal, les étapes de l’acquisition des
 l’étudiant à la        différents organes des algues aux angiospermes ; particularités des mycètes.
 diversité du monde
 vivant et lui faire    Évaluation
 connaître son
 organisation.                                     Coefficient 5           ECTS 5
                         Méthode d’évaluation :
Langue(s)                  Ecrit
    Français             Modalités de contrôle des connaissances :
                          à              Première session : RNE : CCI(3) 4h - coefficients 1/1/2 ; RSE : CT 2h
                          à         Session de rattrapage : RNE et RSE : CT 2h
                         Calcul de la note finale :
                          à              Première session : Ecrit 100%
                          à         Session de rattrapage : Ecrit 100%

 SOL1CH02               Atomistique et thermodynamique
 SSL1CH02
Durée   1i’   48 h          Tronc commun

Cours    à       17 h    Responsable               Fabienne Méducin å                       fabienne.meducin@univ-orleans.fr
TD       à       16 h
TP       à       15 h   Contenu
   Semestre 1           – Structure de l’atome (le noyau, les électrons : introduction des orbitales atomiques),
Objectifs                 formation des liaisons (introduction des orbitales moléculaires)
                        – Radioactivité, quelques propriétés moléculaires (moment dipolaire, énergies de liaison,
+ Bases de chimie
 générale.                ...)
                        – Gaz parfaits, premier et deuxième principes de thermodynamique.
Langue(s)
    Français            Évaluation
                                                   Coefficient 5           ECTS 5
                         Méthode d’évaluation :
                           Ecrit
                         Modalités de contrôle des connaissances :
                          à             Première session : RNE : CCI (E(3) - coeffs 1/1/2 + TP(5+1E) coeffs 1/1) 6h ;
                                                                   RSE : CT (E+TP) 3h
                          à         Session de rattrapage : RNE et RSE : CT (E+TP) 3h
                         Calcul de la note finale :
                          à              Première session : Ecrit : 67 % ; TP : 33 %
                          à         Session de rattrapage : Ecrit : 67 % ; TP : 33 %

                                                             1
SOL1BH01                Molécules du vivant
 SSL1BH01
Durée   1i’   48 h           Tronc commun

Cours    à        28 h    Responsable                      Eric Hébert å                          eric.hebert@univ-orleans.fr
TD       à        10 h
TP       à        10 h   Contenu
     Semestre 1          - Protéines : acides aminés - propriétés physico-chimiques. Structure primaire des pro-
                         téines. Structure secondaire : hélice α , feuillets β. - Lipides : acides gras, triglycérides,
Objectifs
                         glycéro-phospholipides, stéroïdes. Membranes et surface cellulaire, structure, composi-
+ Bases moléculaires     tion des protéines membranaires. - Oses : nomenclature, mono et diholosides, polyosides
 de la biologie.         de réserve et de structure. - Acides nucléiques : structure primaire : bases puriques et
                         pyrimidiques. Nucléosides, nucléotides. Structure secondaire : liaisons faibles, double brin,
Langue(s)
                         double hélice, séquençage chimique de l’ADN. - Enzymologie : rappels de cinétique chim-
     Français            ique ; structure et mécanisme d’action des enzymes ; régulation de l’activité enzymatique ;
                         Introduction au métabolisme : glycolyse et cycle de Krebs ; oxydations phosphorylantes.
                         Évaluation
                                                   Coefficient 5            ECTS 5
                          Méthode d’évaluation :
                            Ecrit
                          Modalités de contrôle des connaissances :
                           à             Première session : RNE : CCI (E(3) - coefficients 1/1/2 + TP) 4h ; RSE : CT
                                                                   (E(2h)+TP(1h))
                           à         Session de rattrapage : RNE et RSE : CT (E(2h) + TP(30min))
                          Calcul de la note finale :
                           à              Première session : Ecrit : 75 % ; TP : 25 %
                           à         Session de rattrapage : Ecrit : 75 % ; TP : 25 %

 SOL1AG11                Anglais 1
 SSL1AG11
Durée   1i’   24 h           Tronc commun

TD       à        24 h    Responsable                Murielle Pasquet å                      murielle.pasquet@univ-orleans.fr
     Semestre 1           Pré-requis           Niveau baccalauréat anglais LV1 ou LV2 ou environ 400 heures de formation
Objectifs                Contenu
+ Etre à même de         Travail de compréhension et d’expression orale et écrite à partir de documents authen-
 préparer un projet      tiques simples et / ou courts centrés sur le monde universitaire anglo-saxon.
 de séjour d’études
 universitaires en       Évaluation
 pays anglophone
 dans une langue                                   Coefficient 3            ECTS 3
 écrite et orale
                          Méthode d’évaluation :
 simple et
 suffisamment claire.       Ecrit et/ou oral
                          Modalités de contrôle des connaissances :
Langue(s)                  à              Première session : RNE : CCI(5) 2h30 ; RSE : CT 1h30
     Français              à         Session de rattrapage : RNE et RSE : CT 1h30
     Anglais              Calcul de la note finale :
                           à              Première session : CCI ou CT 100%
                           à         Session de rattrapage : CT 100%

                                                             2
SOL1BO02                 Introduction à la biologie cellulaire
 SSL1BO02
Durée   1i’   36 h           Tronc commun

Cours    à       18   h    Responsables             Valérie Altemayer å                   valerie.altemayer@univ-orleans.fr
TD       à        4   h                                 Eric Duverger å                       eric.duverger@univ-orleans.fr
TP       à       12   h
NP       à        2   h   Contenu
   Semestre 1             – Acaryotes, Procaryotes et Eucaryotes : Définition, classification, multiplication.
                          – Description de la cellule : membrane plasmique, parois, système membranaire interne,
Objectifs
                            organites semi-autonome, cytosquelette.
+ Sensibiliser            – Différenciation cellulaire : types cellulaires et structure des cellules spécialisées.
 l’étudiant à la          – Particularité de la cellule végétale : plastes, paroi, vacuoles, pigments. . .
 diversité du monde
 vivant et lui faire      – TP : Apprentissage de quelques techniques d’observation de la cellule et illustration du
 connaître son              cours.
 organisation.

Langue(s)                 Évaluation
                                                   Coefficient 4          ECTS 4
    Français
                           Méthode d’évaluation :
                             Ecrit
                           Modalités de contrôle des connaissances :
                            à              Première session : RNE : CCI (E(2)+TP(4-5)) 3h ; RSE : CT (E+TP) 1h30
                            à         Session de rattrapage : RNE et RSE : CT 1h
                           Calcul de la note finale :
                            à              Première session : Ecrit : 75 % ; TP : 25 %
                            à         Session de rattrapage : Ecrit 100%

                                                            3
SOL1BO03                 Analyse des données en biosciences
 SSL1BO03
Durée   1i’   12 h           Tronc commun

Cours    à           6h    Responsable                   Aurélien Sallé å                      aurelien.salle@univ-orleans.fr
TD       à           6h
   Semestre 1             Contenu
                          Représentation des données dans le domaine biologique ; valeurs centrales et de disper-
Objectifs
                          sion. Distribution normale et épreuves de normalité. Test de comparaison des moyennes
+ Eléments                (Student). Applications en écologie : Régression linéaire simple, covariance, corrélation,
 statistiques de base     test de signification du coefficient de corrélation, loi de Poisson, Chi2 d’ajustement à la
 pour les
 applications
                          loi de Poisson. Applications en biochimie-physiologie et génétique : les principes énoncés
 écologiques et           en cours seront appliqués à des analyses de données issues de travaux dans le domaine
 physiologiques en        bio-santé. Il sera mis l’accent en particulier sur la pertinence d’emploi de tel ou tel test
 Travaux Dirigés.         statistique et la présentation graphique des résultats (moyenne, écart type, erreur standard
                          à la moyenne. . . )
Langue(s)
                          Évaluation
    Français
                                                    Coefficient 2           ECTS 2
                           Méthode d’évaluation :
                             Ecrit
                           Modalités de contrôle des connaissances :
                            à              Première session : RNE et RSE : CCI(3) 1h30
                            à         Session de rattrapage : RNE et RSE : CT 1h
                           Calcul de la note finale :
                            à              Première session : Ecrit 100%
                            à         Session de rattrapage : Ecrit 100%

  SOL1II01                Préparation au C2i (Certificat informatique et internet)
  SSL1II01
Durée   1i’   24 h           Tronc commun

CTP      à       20 h      Responsable                  Laure Kahlem å                         laure.kahlem@univ-orleans.fr
   Semestre 1
                          Contenu
Objectifs
                          Cette UE a pour objectif de développer les compétences de base nécessaires à l’usage
                          des Technologies de l’Information et de la Communication telles que définies dans le
Langue(s)                 référentiel national du C2i niveau 1 et de préparer les étudiants à la certification.

    Français              Évaluation
                                                    Coefficient 3           ECTS 3
                           Méthode d’évaluation :
                             Ecrit
                           Modalités de contrôle des connaissances :
                            à              Première session : RNE : CCI(3) 5h ; RSE : CT 2h
                            à         Session de rattrapage : RNE et RSE : CT 2h
                           Calcul de la note finale :
                            à              Première session : CCI ou CT 100%
                            à         Session de rattrapage : Ecrit 100%

                                                             4
SOL1PP01                Projet personnel et professionnel
 SSL1PP01
Durée   1i’   16 h           Tronc commun

Cours    à        2h      Responsable                  Olivier Richard å                         olivier.richard@univ-orleans.fr
TD       à       12 h
NP       à        2h     Contenu
   Semestre 1            Après une présentation générale des objectifs de l’UE et des modalités de recherche
                         documentaire au cours d’un premier cours magistral, l’élaboration d’une fiche de projet
Objectifs
                         individuel sera réalisée par l’étudiant. A l’issue du dépouillement de ces fiches, des groupes
+ Recherche              de travail (3-4 étudiants) seront organisés pour les séances de TD suivantes. Ces séances
 d’informations sur      seront destinées à préparer une présentation sous forme de poster et de diaporama in-
 les métiers (sites
 internet appropriés,
                         formatisés soutenu oralement lors de la dernière séance.Des séances spécifiques seront
 nécessité de mise à     consacrées à la prise de parole en public, la capacité à s’exprimer avec/sans notes, aux
 jour pour ce type       techniques d’interview, d’entretien et à la rédaction écrite. La réalisation du diaporama
 d’information).         informatique sera facilitée par le travail en deux séances de TP (initiation au logiciel,
+ Prise de parole lors   réalisation du document). La présentation finale sera construite autour d’une recherche
 d’interviews et face
                         de documents sur le métier ou l’activité choisie en début de semestre, et d’une rencontre
 à un public.
+ Réalisation d’une      avec un professionnel. Le travail personnel sera guidé par un enseignant lors des séances
 production écrite       de TD. Le SUIO sera présenté et l’étudiant devra l’utiliser dans sa démarche personnelle.
 sous forme de           Un rapport individuel issu du travail produit pendant le module sera remis pour évaluation
 poster.                 lors de la dernière séance de TD
Langue(s)                Évaluation
                                                   Coefficient 3             ECTS 3
    Français
                          Méthode d’évaluation :
                            Ecrit et oral
                          Modalités de contrôle des connaissances :
                           à             Première session : RNE et RSE : Ecrit : Rapport + Poster ; Oral : Présentation
                                                                   (15min)
                            à          Session de rattrapage : RNE et RSE : Ecrit : Rapport à remettre au plus tard le 4
                                                                   juin 2014 ; Oral : Présentation (15min) - voir ENT après la
                                                                   publication des résultats de la session 1
                          Calcul de la note finale :
                           à              Première session : Ecrit 50 % ; Oral 50 %
                           à         Session de rattrapage : Ecrit 50 % ; Oral 50 %

                                                             5
Semestre 2

Maquette des enseignements
Option Biologie-Biochimie

               Intitulé                                        ECTS   CM   TD   TP

               Organisation et fonctionnement de la cellule
                                                                3     20   4
               eucaryote

               Chimie en solution 1                             3     10   8    6
    21 ECTS
    Ossature

               Principe de la génétique formelle                4     12   16   8

               Bases de la génétique des populations            2     6    6

               Anglais 2                                        3          24

               Approches expérimentales en recherche            3     10   14

               Bases de la chimie organique                     3     12   12

               Ecologie    générale :     environnement   et
                                                                3     12   6    6
               fonctionnement de la biosphère
   Ossature
   9 ECTS
   à choix

               Parasitismes et grandes endémies                 3     18        6

               Algues et mycètes                                3     10   4    10

               Chimie en solution 2                             3     10   8    6
Option SVT

              Intitulé                                       ECTS   CM   TD   TP

              Organisation et fonctionnement de la cellule
                                                              3     20   4
              eucaryote

              Chimie en solution 1                            3     10   8    6

              Principe de la génétique formelle               4     12   16   8

              Bases de la génétique des populations           2     6    6
   30 ECTS
   Ossature

              Anglais 2                                       3          24

              Ecologie générale : environnement et
                                                              3     12   6    6
              fonctionnement de la biosphère

              Paléontologie                                   6     18   6    24

              Minéralogie                                     6     18   6    24

Détail des enseignements
SOL2BO01                Organisation et fonctionnement de la cellule eucaryote
 SSL2BO01
Durée   1i’   24 h          Option Biologie-Biochimie et SVT

Cours    à       20 h     Responsables                Jacques Pichon å                          jacques.pichon@univ-orleans.fr
TD       à        4h                                    Eric Duverger å                           Eric.duverger@univ-orleans.fr

   Semestre 2             Pré-requis          Modules Molécules du vivant et Introduction à la biologie cellulaire
Objectifs                Contenu
+ Initiation au          La membrane plasmique : structure et transport des molécules. Réticulum endoplasmique.
 fonctionnement de       Appareil de Golgi. Lysosome. . . . Le noyau : Introduction à l’expression des gènes et le
 la cellule eucaryote.   cycle cellulaire.
Langue(s)                Évaluation
    Français                                      Coefficient 3             ECTS 3
                          Méthode d’évaluation :
                            Ecrit
                          Modalités de contrôle des connaissances :
                           à              Première session : RNE : CCI(2) 2h ; RSE : CT 2h
                           à         Session de rattrapage : RNE et RSE : CT 2h
                          Calcul de la note finale :
                           à              Première session : Ecrit 100%
                           à         Session de rattrapage : Ecrit 100%

 SOL2CH04                Chimie en solution 1
 SSL2CH04
Durée   1i’   24 h          Option Biologie-Biochimie et SVT

Cours    à       10 h     Responsable               Valérie Bertagna å                         valerie.bertagna@univ-orleans.fr
TD       à        8h
TP       à        6h      Pré-requis          Atomistique et thermodynamique

   Semestre 2            Contenu
Objectifs                Equilibres, pH d’une solution aqueuse, Oxydo-réduction. Ces chapitres seront abordés
                         avec le minimum de notions nécessaires
+ Aborder les notions
 de base de la           Évaluation
 chimie en solution,                              Coefficient 3             ECTS 3
 avec applications à
 la biologie : les        Méthode d’évaluation :
 équilibres                 Ecrit
 chimiques, pH de
 solutions aqueuses,      Modalités de contrôle des connaissances :
 dosages                   à             Première session : RNE : CCI E(2) 3h - coeffs 1/1 ; TP(2 + Ecrit 1h) ; RSE : CT
 acides-bases,                                                     (E + TP) 2h
 précipitation,            à         Session de rattrapage : RNE et RSE : CT (E (2h) + TP (1h))
 complexation.
                          Calcul de la note finale :
Langue(s)                  à              Première session : Ecrit 67 % ; TP 33 %
                           à         Session de rattrapage : Ecrit 67 % ; TP 33 %
    Français

                                                               1
SOL2BO02                 Principe de la génétique formelle
 SSL2BO02
Durée   1i’   36 h           Option Biologie-Biochimie et SVT

Cours    à       12 h      Responsable                Catherine Mura å                     catherine.mura@univ-orleans.fr
TD       à       16 h
TP       à        8h      Contenu
   Semestre 2             Le modèle mendélien mono et dihybridisme. Notions fondamentales en génétique formelle :
                          Le gène, Génotype/Phénotype, dominance récessivité, mutation, allèles, allèles multiples,
Objectifs
                          allèles létaux, complémentation, pléiotropie, Interaction entre les gènes Théorie Chro-
+ Acquérir les bases      mosomique de l’hérédité. Distance génétique, cartographie des loci. Génétique humaine.
 de la génétique          L’analyse des pedigrees. Génétique formelle des phages et des bactéries. TP : Croisements
 formelle permettant
 d’interpréter la         Drosophiles, Polymorphisme de l’amylase
 ségrégation des          Évaluation
 caractères
 héréditaires.                                     Coefficient 4             ECTS 4

Langue(s)                  Méthode d’évaluation :
                             Ecrit
    Français               Modalités de contrôle des connaissances :
                            à              Première session : RNE : CT (E) 2h / CC (TP) ; RSE : CT (E+TP) 3h
                            à         Session de rattrapage : RNE et RSE : CT (E+TP) 1h
                           Calcul de la note finale :
                            à              Première session : Ecrit 75 % ; TP 25 %
                            à         Session de rattrapage : Ecrit 75 % ; TP 25 %

 SOL2BO03                 Bases de la génétique des populations
 SSL2BO03
Durée   1i’   12 h           Option Biologie-Biochimie et SVT

Cours    à           6h    Responsable                Catherine Mura å                     catherine.mura@univ-orleans.fr
TD       à           6h
                           Pré-requis          Principe de la génétique formelle
   Semestre 2
                          Contenu
Objectifs
                          Notions de génétique des populations. Le modèle de Hardy Weinberg. La sélection. Les
+ Acquérir les bases      mutations. La migration. Le hasard et la dérive.
 de la génétique des
 populations              Évaluation

Langue(s)                                          Coefficient 2             ECTS 2
                           Méthode d’évaluation :
    Français
                             Ecrit
                           Modalités de contrôle des connaissances :
                            à              Première session : RNE et RSE : CT 1h
                            à         Session de rattrapage : RNE et RSE : CT 1h
                           Calcul de la note finale :
                            à              Première session : Ecrit 100%
                            à         Session de rattrapage : Ecrit 100%

                                                                2
SOL2AG12                Anglais 2
 SSL2AG12
Durée   1i’   24 h          Option Biologie-Biochimie et SVT

Cours    à        0h      Responsable                Murielle Pasquet å                        murielle.pasquet@univ-orleans.fr
TD       à       24 h
                          Pré-requis           Avoir suivi Anglais 1 ou environ 400 heures de formation équivalente.
   Semestre 2
                         Contenu
Objectifs
                         Travail de compréhension et d’expression orale et écrite à partir de documents authen-
+ Comprendre et          tiques simples et / ou courts centrés sur le monde universitaire anglo-saxon.
 s’exprimer de
 manière plus            Évaluation
 autonome dans des
 situations de séjour                              Coefficient 3             ECTS 3
 d’études                 Méthode d’évaluation :
 universitaires en
 pays anglophone            Ecrit et/ou oral
 (niveau européen :       Modalités de contrôle des connaissances :
 B1).                      à              Première session : RNE : CCI(4-7) 2h30 ; RSE : CT 1h30
Langue(s)                  à         Session de rattrapage : RNE et RSE : CT 1h30
                          Calcul de la note finale :
    Français               à              Première session : CCI ou CT 100%
    Anglais                à         Session de rattrapage : CT 100%

 SOL2BO10                Approches expérimentales en recherche
 SSL2BO10
Durée   1i’   24 h          Option Biologie-Biochimie et SVT

Cours    à       10 h     Responsables             Jean-Pierre Gomez å                        jean-pierre.gomez@cnrs-orleans.fr
TD       à       14 h                                 Arnaud Menuet å                            arnaud.menuet@cnrs-orleans.fr

   Semestre 2
                         Contenu
Objectifs                Des cours-conférences sont destinés à présenter des approches biochimiques, physi-
+ Ce module se veut      ologiques et génétiques concernant divers sujets de recherche. Par une présentation dé-
 comme une               marrant des fondements les plus simples accessibles par tous, et suivis des découvertes
 première approche       les plus récentes, l’étudiant comprendra en quoi la recherche peut apporter des solutions
 du monde la
                         à plus ou moins brève échéance. Les thématiques de ces cours concernent, par exemple,
 recherche dans le
 domaine de la           les pathologies humaines et l’utilisation et la valorisation des plantes en pharmacologie et
 biologie de la santé.   santé humaine. Les thématiques proposées en cours-conférences seront ensuite reprises
 Il doit permettre à     en TD d’une part sous la forme d’une étude d’article, et, d’autre part, avec un travail sur
 l’étudiant              documents scientifiques afin d’analyser une démarche de recherche et son évolution.
 d’appréhender de
 façon concrète les      Évaluation
 découvertes les plus
                                                   Coefficient 3             ECTS 3
 récentes et
 d’acquérir la            Méthode d’évaluation :
 démarche et la             Ecrit et oral
 méthodologie
 nécessaire dans la       Modalités de contrôle des connaissances :
 recherche                 à              Première session : RNE : CC(2)/CT 1h ; RSE : CT 1h
 d’information             à         Session de rattrapage : RNE et RSE : CT 1h
 scientifique.
                          Calcul de la note finale :
Langue(s)                  à              Première session : CC 33% + CT 67 %
                           à         Session de rattrapage : CT 100%
    Français

                                                               3
SOL2CH06               Bases de la chimie organique
 SSL2CH06
Durée   1i’   24 h          Option Biologie-Biochimie

Cours    à       12 h    Responsable               Arnaud Tatibouet å                      arnaud.tatibouet@univ-orleans.fr
TD       à       12 h
                         Pré-requis
   Semestre 2                                 – Atomistique et Thermodynamique
                                              – Chimie en Solution 1
Objectifs
+ Connaissances
                        Contenu
 fondamentales de la
 chimie                 Initiation à la chimie organique : Liaisons - représentation de Lewis, hybridation - structure
 bio-organique          3D, conformations, configurations et stéréoisomérismes - Résonance - Acidité et Basicité
 réactionnelle.         - Nomenclature des Alcanes - Introduction à la réactivité.
Langue(s)               Évaluation

    Français                                       Coefficient 3              ECTS 3
                         Méthode d’évaluation :
                           Ecrit
                         Modalités de contrôle des connaissances :
                          à              Première session : RNE : CCI (2) 3h ; RSE : CT 2h
                          à         Session de rattrapage : RNE et RSE : CT 2h
                         Calcul de la note finale :
                          à              Première session : CCI ou CT 100%
                          à         Session de rattrapage : Ecrit 100%

 SOL2BO05               Ecologie générale : environnement et fonctionnement de la
 SSL2BO05               biosphère
Durée   1i’   24 h          Option Biologie-Biochimie et SVT

Cours    à       12 h    Responsable                    François Lieutier å                 francois.lieutier@univ-orleans.fr
TD       à        6h
TP       à        6h    Contenu
   Semestre 2           Quelques problèmes environnementaux et notions d’interdépendance ; organisation
                        générale de la biosphère ; organisation fonctionnelle ; circulation de la matière et cycles
Objectifs
                        biogéochimiques (eau, carbone, azote, oxygène), et relations avec les activités humaines ;
+ Montrer comment       flux d’énergie (bilans énergétiques, productivité, efficacité des écosystèmes naturels et
 la connaissance du     anthropisés) ; organisation des biocénoses, biogéographie et fonctionnement des grands
 fonctionnement de
 la biosphère, en       biomes terrestres ; notions de biodiversité.
 liaison avec les       Évaluation
 activités humaines,
 peut permettre de                                 Coefficient 3              ECTS 3
 comprendre les
 problèmes               Méthode d’évaluation :
 environnementaux          Ecrit
 actuels, d’envisager    Modalités de contrôle des connaissances :
 des solutions et
                          à              Première session : RNE et RSE : CT(CM+TD) 1h30 / CC(TP)
 d’appréhender les
 problèmes futurs.        à         Session de rattrapage : RNE et RSE : CT(CM+TD+TP) 2h
                         Calcul de la note finale :
Langue(s)                 à              Première session : CT 67 % ; CC 33 %
                          à         Session de rattrapage : CM 33 % ; TD 33 % ; TP 33 %
    Français

                                                               4
SOL2BO06               Parasitisme et grandes endémies
 SSL2BO06
Durée   1i’   24 h         Option Biologie-Biochimie

Cours    à       18 h    Responsable               Valérie Altemayer å                  valerie.altemayer@univ-orleans.fr
TP       à        6h
   Semestre 2           Contenu
                        Les grandes parasitoses mondiales. Les parasites animaux d’intérêts médicaux Morpholo-
Objectifs
                        gie et cycle parasitaire. Répartition géographiques et coûts des principales parasitoses
+ Connaissance des      humaines. Traitements. Notion d’épidémiologie.
 principaux parasites
 de l’Homme et des      Évaluation
 animaux
                                                  Coefficient 3          ECTS 3
 domestiques et
 notion d’écologie       Méthode d’évaluation :
 parasitaire.              Ecrit
Langue(s)                Modalités de contrôle des connaissances :
                          à              Première session : RNE et RSE : CT 1h
    Français              à         Session de rattrapage : RNE et RSE : CT 1h
                         Calcul de la note finale :
                          à              Première session : Ecrit 100%
                          à         Session de rattrapage : Ecrit 100%

 SOL2BO07               Algues et mycètes
 SSL2BO07
Durée   1i’   24 h         Option Biologie-Biochimie

Cours    à       10 h    Responsable          Christiane Depierreux å                christiane.depierreux@univ-orleans.fr
TD       à        4h
TP       à       10 h   Contenu
   Semestre 2           Biologie et reproduction des algues et des champignons, initiation à la reconnaissance des
                        champignons. Intérêts économiques, pharmaceutiques et biotechnologiques des algues et
Objectifs
                        des champignons
+ Intérêts
 économiques et         Évaluation
 biologie des algues                              Coefficient 3          ECTS 3
 et des
 champignons.            Méthode d’évaluation :
                           Ecrit
Langue(s)
                         Modalités de contrôle des connaissances :
    Français              à              Première session : RNE et RSE : CT 1h
                          à         Session de rattrapage : RNE et RSE : CT 1h
                         Calcul de la note finale :
                          à              Première session : Ecrit 100%
                          à         Session de rattrapage : Ecrit 100%

                                                           5
SOL2CH14                Chimie en solution 2
 SSL2CH14
Durée   1i’   24 h          Option Biologie-Biochimie

Cours    à       10 h     Responsable                   Valérie Bertagna å                 valerie.bertagna@univ-orleans.fr
TD       à        8h
TP       à        6h      Pré-requis           Chimie en Solution 1

   Semestre 2            Contenu
Objectifs                Approfondissement des notions de pH, et d’oxydo-réduction (notions non abordées en
                         chimie en solution 1)), conductivité solubilité et cinétique. Applications à la biologie.
+ Aborder les notions
 de base de la chimie    Évaluation
 en solution, avec
                                                   Coefficient 3             ECTS 3
 applications à la
 biologie : équilibres    Méthode d’évaluation :
 d’oxydo-réduction,         Ecrit
 cinétique chimique.
                          Modalités de contrôle des connaissances :
Langue(s)                  à             Première session : RNE : CCI (E(2) (3h - coeffs 1/1) et TP(2 + Ecrit 1h) ; RSE :
                                                                   CT (E (2h)+TP (1h))
    Français               à         Session de rattrapage : RNE et RSE : CT (E (2h)+TP (1h))
                          Calcul de la note finale :
                           à              Première session : Ecrit 67 % ; TP 33 %
                           à         Session de rattrapage : Ecrit 67 % ; TP 33 %

 SOL2GO02                Minéralogie
 SSL2GO02
Durée   1i’   48 h          Option SVT

Cours    à       18 h     Responsable                   Nicole Lebreton å                    nicole.lebreton@univ-orleans.fr
TD       à        6h
TP       à       24 h     Pré-requis           Connaissances de base en chimie.

   Semestre 2            Contenu
Objectifs                CM : Définition d’un minéral – Bases élémentaires de cristallographie et cristallochimie –
                         Notions de symétrie cristalline – Présentation des critères de détermination macroscopique
+ Connaissances du       des minéraux – Notions d’optique cristalline pour la détermination des minéraux à l’aide
 monde minéral dans
                         du microscope polarisant – La classification des minéraux et leur répartition dans le globe
 sa diversité et ses
 principes –             – Présentation des grandes familles de minéraux (cristallochimie, gisements, applications
 Apprentissage des       industrielles). TD : La symétrie des mailles élémentaires – Calcul de formules structurales.
 méthodes                TP : Méthodes de détermination macroscopiques et microscopiques des minéraux. Appli-
 d’identification des    cation de ces méthodes à la reconnaissance des minéraux courants.
 minéraux.
                         Évaluation
Langue(s)                                          Coefficient 5             ECTS 6
    Français              Méthode d’évaluation :
                            Ecrit
                          Modalités de contrôle des connaissances :
                           à              Première session : RNE et RSE : CCI (E(2)+TP(2)) 8h
                           à         Session de rattrapage : RNE et RSE : CT (E+TP) 4h
                          Calcul de la note finale :
                           à              Première session : Ecrit 67 % ; TP 33 %
                           à         Session de rattrapage : Ecrit 67 % ; TP 33 %

                                                              6
SOL2GO01               Cours Paléoenvironnement, stratigraphie et paléontologie
 SSL2GO01
Durée   1i’   48 h          Option SVT

Cours    à       18 h    Responsable           Christian Di Giovanni å                 christian.di-giovanni@univ-orleans.fr
TD       à        6h
TP       à       24 h   Contenu
   Semestre 2           La caractérisation du paysage (relief terrestre) - L’enregistrement du temps (grands
Objectifs               principes de stratigraphie, lithostratigraphie, biostratigraphie, chimiostratigraphie) - His-
                        toire des climats et environnements (paléoclimats, paléoenvironnements, marqueurs
+ Notion de             paléoclimatiques et paléoenvironnementaux) - Histoire de la vie (grandes étapes de la
 stratigraphie,
                        vie et crises biologiques)
 échelle
 biostratigraphique,    Évaluation
 variabilité
 climatique                                       Coefficient 5           ECTS 6
 naturelle, histoire
 de la vie.
                         Méthode d’évaluation :
                           Ecrit
Langue(s)                Modalités de contrôle des connaissances :
                          à              Première session : RNE : CCI (E(2)+TP(2)) 5h ; RSE : CT 3h
    Français
                          à         Session de rattrapage : RNE et RSE : CT (E+TP) 3h
                         Calcul de la note finale :
                          à              Première session : Ecrit 67 % ; TP 33 %
                          à         Session de rattrapage : Ecrit 67 % ; TP 33 %

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