MASTER 1 2019 - 2020 Sciences, Technologies, Santé - TOXICOLOGIE ET éCOTOXICOLOGIE

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MASTER 1 2019 - 2020 Sciences, Technologies, Santé - TOXICOLOGIE ET éCOTOXICOLOGIE
MASTER 1
Sciences, Technologies, Santé

2019 - 2020

 TOXICOLOGIE ET
 éCOTOXICOLOGIE

Toxicologie Environnementale et Humaine
MASTER 1 2019 - 2020 Sciences, Technologies, Santé - TOXICOLOGIE ET éCOTOXICOLOGIE
SOMMAIRE__________________________________________

     2   CONTACTS DE LA FORMATION

     3   CALENDRIER 2019–2020

     4   PRÉSENTATION DE LA FORMATION

     5   VOLUMES HORAIRES et CONTRÔLE DES CONNAISSANCES

     7   CONTENU DES ENSEIGNEMENTS

1
CONTACTS DE LA FORMATION___________________________

                  @
Sandrine TRAVIER
Assesseure à la Pédagogie
T. 02.41.73.50.01
sandrine.travier@univ-angers.fr

Hélène TRICOIRE-LEIGNEL
Responsable pédagogique et Présidente de Jury
T. 02.44.68.82.84
helene.leignel@univ-angers.fr

Olivier GUITTON
Gestion de la scolarité et des examens
T. 02.41.73.53.51
olivier.guitton@univ-angers.fr

             SCOLARITÉ – EXAMENS

             Horaire d’ouverture
              9h00 – 12h30                      Bâtiment A
             13h30 – 17h00                      Rez-de-chaussée
             Du lundi au vendredi               Bureau A006

  2
CALENDRIER 2019-2020________________________________

                                    Rentrée et début des cours    Vendredi 6 septembre 2019
     PREMIER SEMESTRE

                                                  Campus Day      Jeudi 19 septembre 2019
                                        Vacances de Toussaint     Du samedi 26 octobre au dimanche 3 novembre 2019
                                    Fin des cours 1 er semestre   Vendredi 20 décembre 2019
                                             Vacances de Noël     Du samedi 21 décembre 2019 au dimanche 5 janvier 2020
                                   Jury 1 er semestre session 1   Entre le 27 et le 31 janvier 2020

                               Début des cours 2 ème semestre     Lundi 6 janvier 2020
     DEUXIEME SEMESTRE

                                             Vacances d’hiver     Du samedi 22 février au dimanche 1er mars 2020
                                   Fin des cours 2 ème semestre   Vendredi 3 avril 2020
                                                         Stage    Du lundi 6 avril au vendredi 5 juin 2020
                                        Soutenances de stage      Mercredi 17 et jeudi 18 juin 2020
                                Jury 2ème semestre session 1      Entre le 26 et le 30 juin 2020
                         Examens 1 er & 2e semestres-Session 2    Du mardi 1er au vendredi 4 septembre 2020
                          Jury 1er & 2ème semestres session 2     Entre le lundi 7 et le vendredi 11 septembre 2020

            *CALENDRIER SUSCEPTIBLE DE MODIFICATIONS

 3
PRÉSENTATION DE LA FORMATION_______________________

Le master Toxicologie Environnementale & humaine (TE) forme des toxicologues et écotoxicologues,
capables d’appréhender des problématiques liées aux contaminants de l’environnement et leurs
effets délétères sur les organismes vivants et/ou la santé humaine. Au cours de leur formation,
les étudiants acquièrent une vision pluridisciplinaire des effets des toxiques à différentes échelles
(écosystème, organisme, cellule, cible moléculaire).

L’enseignement s’appuie sur la participation d’une trentaine de laboratoires académiques (Universités,
INRA, CNRS…) et de structures privées. La formation est complétée par des enseignements transversaux
(droit, anglais, management de projet, techniques de communication, analyse du risque, analyse
spatiale, expérimentation animale).

Objectif

Le master privilégie l’acquisition de compétences complémentaires en toxicologie générale et
écotoxicologie.
A l’issue, les diplômés pourront gérer des projets impliquant un pronostic (modélisation et définition de
biomarqueurs relatifs à une intoxication), un diagnostic (état des lieux d’une contamination unique ou
multiple) et/ou une aide à la décision (solutions mises en oeuvre pour parvenir à un
assainissement/détoxification).
En recherche fondamentale, les étudiants évolueront sur des questionnements scientifiques portant
sur l’interaction entre un toxique et son environnement ou sur la santé humaine.

Public visé

Peuvent postuler au Master TE :
— Etudiant.e.s titulaires d’une licence dans les domaines des Sciences de la Vie, de la chimie de
l’environnement
— Etudiant.e.s issu.e.s d’un cursus en médecine/pharmacie
— Professionnels en formation continue ou par alternance

  4
VOLUMES HORAIRES ET CC_____________________________

                                        SEMESTRE 1                                                          30 ECTS
                                                         Volumes horaires              Contrôle des Connaissances

                                             Coeff.
                                      ECTS
 U.E.               Matières                                                          1re session        2e      Durée
                                                      tot.   CM    TD       TP
                                                                                  Assidus       D.A.   session   exam.
S1-Ue1-   Toxicologie I                                                             CC          CT        CT ou oral
                                             1.5      30     15     5       10                                         2h00
  TEH                                 3                                           (100%)      (100%)       (100%)
S1-Ue2                                                                              CC          CT        CT ou oral
                                      3      1.5      26.6   16    5.3      5.3                                        2h00
 - TEH                                                                            (100%)      (100%)       (100%)
          Technique de
S1-Ue3    communication-                                                            CC          CT        CT ou oral
                                      2       1       20      6     6       8                                          2h00
 - TEH    conduite de projet                                                      (100%)      (100%)       (100%)

          Management
S1-Ue4-   environnemental et                                                        CC                    CT (80%)
                                      6       3       58     30    28        -                    -                    2h30
  TEH     normes                                                                  (100%)                  CC (20%)

          Analyses de données                                                       CC           CC       CT ou oral
                                      2       1       27      8     -       19                                         1h00
S1-Ue5-                                                                           (60%)        (60%)        (60%)
  TEH     SIG                                                                       CC           CC       CT ou oral
                                      2       1       21      3     -       18                                         1h00
                                                                                  (40%)        (40%)        (40%)
S1-Ue6-   Anglais                                                                   CC                    CT ou oral
                                      2       1               -     -    17.3                     -                    1h00
  TEH                                                                             (100%)                   (100%)
          Projet Personnel
S1-Ue7-
          Professionnel Etudiant      2       1       20      -    20        -           Validation présentiel
  TEH
S1-Ue8-   Groupe d’Options au
                                      8       4
  TEH     choix
          Pharmacologie                                                             CC           CC       CT ou oral
                                      3      1.5      28     18     7       3                                          2h00
                                                                                  (100%)       (100%)      (100%)
          Prolifération cellulaire,
                                                                                    CC           CC       CT ou oral
Toxico-   apoptose, oncogènes I       3      1.5      27     20     7        -                                         2h00
                                                                                  (100%)       (100%)      (100%)
 logie
          Altération génomique
                                                                                    CC           CC       CT ou oral
          et pharmacogénomique        2       1       27     16    11        -                                         2h00
                                                                                  (100%)       (100%)      (100%)
          Biologie et génétique
                                                                                    CC           CC       CT ou oral
          des Populations             6       3       54     26    12       16                                         2h00
                                                                                  (100%)       (100%)      (100%)
Ecotoxi
cologie   Géochimie des milieux
                                                                                    CC           CC       CT ou oral
          aquatiques                  2       1       20     11     9                                                  2h00
                                                                                  (100%)       (100%)      (100%)

  5
SEMESTRE 2                                                          30 ECTS
                                                             Volumes horaires               Contrôle des Connaissances

                                                 Coeff.
                                          ECTS
  U.E.               Matières                                                              1re session       2e      Durée
                                                          tot.    CM     TD     TP
                                                                                       Assidus      D.A.   session   exam.
 S2-Ue1-     Toxicologie II                                                              CC         CC      CT ou oral
                                          3      1.5       27     18     5      4                                          2h00
   TEH                                                                                 (100%)    (100%)      (100%)
 S2-Ue2-     Ecotoxicologie II                                                           CC         CC      CT ou oral
                                          3      1.5       25     16      5     4                                          2h00
   TEH                                                                                 (100%)    (100%)      (100%)
             Analyse des                                                                 CC                 CT (0.6)
 S2-Ue3-     micropolluants                                                             (80%)
                                          7      3.5       68     30     22     16                   -      CC (0.2)       3h00
   TEH       organiques et                                                                TP
                                                                                        (20%)               TP (0.2)
             minéraux
 S2-Ue4-     Anglais                                                                     CC                 CT ou oral
                                          2       1                            14.7                  -                     1h00
   TEH                                                                                 (100%)                (100%)
                                                                                       Rapport   Rapport
                                                                                        (0.5)     (0.5)      Rapport
 S2-Ue5-     STAGE                                                                      Suivi     Suivi       (0.5)
                                          6       3       209.3    -     3      -                                          0h30
   TEH                                                                                  (0.1)     (0.1)     Suivi (0.1)
                                                                                         Oral      Oral     Oral (0.4)
                                                                                        (0.4)     (0.4)
 S2-Ue6-
             Options                      9      4.5
   TEH
             Prolifération cellulaire,                                                   CC         CC      CT ou oral
                                          3      1,5       25     22     3      -                                          2h00
             apoptose, oncogènes II                                                    (100%)    (100%)       (100%)
             Toxicologie des
                                                                                         CC         CC      CT ou oral
             addictions, toxicologie      3      1.5       27     17.6   9.3    -                                          2h00
                                                                                       (100%)    (100%)      (100%)
             alimentaire
             Adaptations
             physiologiques aux                                                          CC         CC      CT ou oral
                                          3      1.5       26     15     3      8                                          2h00
             contraintes                                                               (100%)    (100%)      (100%)
             environnementales
             Ecologie des                                                                CC         CC      CT ou oral
                                          3      1.5      27.2    14.6   2.6    10                                         2h00
             communautés                                                               (100%)    (100%)      (100%)
             Bioindicateurs des                                                          CC         CC      CT ou oral
                                          3      1.5      27.5    13.5   8      6                                          2h00
             milieux aquatiques                                                        (100%)    (100%)      (100%)
             Technique d’inventaire,
                                                                                         CC         CC      CT ou oral
             indices qualité              6       3        54     16     8      30                                         1h30
                                                                                       (100%)    (100%)      (100%)
             environnementale

Choix conseillé selon orientation

                          Toxicologie                                                     Ecotoxicologie
                                  Adaptations physiologiques aux contraintes environnementales

      Toxicologie des addictions, toxicologie alimentaire                       Bioindicateurs des milieux aquatiques
         Prolifération cellulaire, apoptose, oncogènes II                             Ecologie des communautés
                                                                         Tech d’inventaire, indices qualité environnementale

  6
CONTENU DES ENSEIGNEMENTS_________________________

SEMESTRE 1

UE obligatoires

Ue1 TOXICOLOGIE I
      Toxicology I
Responsable : Hélène Tricoire-Leignel
Intervenants : Mathilde Munier, César Mattei, H. Tricoire-Leignel

Compétences visées
Maîtriser les concepts généraux de toxicologie (exposition, dose, analyse de risque, toxicité générale
(aiguë, chronique)) ainsi que les notions de toxicité spécifique (génotoxicité, reprotoxicité, neurotoxicité,
immunotoxicité, cancérogénicité).
Évaluer la toxicité spécifique par l’altération d’une fonction particulière, identifier les organes-cibles
Connaître les paramètres caractéristiques de la toxicité d’une molécule (dose létale 50, dose sans effet
nocif, dose minimale avec effet nocif, effet-dose, effet à seuil, valeur toxicologique de référence, limite
maximale en résidus)
Savoir identifier les xénobiotiques et leur capacité intrinsèque à entrainer un effet nocif sur l’organisme

Contenu de l’enseignement
Définition et concepts de toxicologie : exposition externe, dose interne - Captation tissulaire, absorption,
distribution - Organes cibles, effet critique - Effets intrinsèques modifiant les réponses aux toxiques -
Réponses cellulaires : lésions, mort cellulaire - Altérations du fonctionnement des organes et des
systèmes - Analyse de risque

Ue2 ÉCOTOXICOLOGIE I
      Ecotoxicology I
Responsable : Vincent Leignel
Intervenants : Justine Marchand, Aurore Zalouk-Vergnoux, Vincent Leignel

Contenu de l’enseignement et compétences visées
Maîtriser les définitions et les approches différentielles et communes de l’Eco-toxicologie et de Toxicologie
générale. Connaître la diversité des polluants, contaminants et toxiques
Identifier les compartiments cibles d’accumulation des contaminants (air, eau, sol).
Connaître la notion de transfert de contamination et les voies de pénétration (absorption), de
métabolisation (biotransformations primaires et secondaires) et l’excrétion dans les organismes animaux
et végétaux. Maitriser la bioaccumulation et la biomagnification des contaminants dans les réseaux
trophiques au sein d’un écosystème
Comprendre les méthodes d’évaluation des impacts de ces contaminants sur le développement et les
grands systèmes physiologiques (digestif, respiratoire, circulatoire, reproductif, urinaire...) à partir de
biomarqueurs d’effet et d’exposition (seuil, effet-dose...). Savoir apprécier les effets des contaminants à
diverses échelles d’analyse (individu, population, microcosme, parcelle)

  7
Ue3 TECHNIQUE DE COMMUNICATION-CONDUITE DE PROJET
      Communicating techniques-project management
Responsable : Geoffrey Ratouis

Compétences visées
Appréhender les enjeux, les théories et les méthodes de la communication dans le cadre de
l'enseignement, dans la perspective de la recherche et pour leur insertion professionnelle.

Contenu de l’enseignement
Introduction aux concepts et aux théories de la communication. La communication de groupe. La conduite
de réunion. La préparation d'un débat, d'une présentation, d'une conférence. La prise de parole.
Entraînement et improvisation. Le verbal et le non-verbal. La parole et le corps. L'attitude, la voix, le
regard, les gestes.
Environnement et communication (problématique, notions, débats). Approche de la communication
institutionnelle des organisations (entreprises, collectivités territoriales, associations). La communication
de crise (histoire, concepts, stratégies). Études de cas. Jeux de rôles (pour mettre les étudiants en
situation de choisir une stratégie de communication).

Ue4 MANAGEMENT ENVIRONNEMENTAL ET NORMES
      Environmental management & Standards
Responsable : Sophie Kints

Compétences visées :
Il s’agit de donner aux étudiants la capacité d’assurer la promotion et la mise en oeuvre des systèmes
de management, de l’environnement et de la santé au travail.

Contenu de l’enseignement :
Les systèmes de management de l’environnement : L’architecture des normes ISO (Présentation des
référentiels environnementaux et sécurité/santé au travail, ECO AUDIT, ISO 14.000, OHSAS 18.001, Le
Développement Durable : guide de référence SD 21.000). Organisation du Système de Management de
l’Environnement. Organisation et présentation d’un Système de Management Intégré. Les incidences et
parallèles des Systèmes de Management de l’Environnement, de la Qualité, de la Santé et de la Sécurité
au Travail. Les organismes de certification. La gestion de la communication environnementale. Concept
et contexte de la communication. Différentes formes de communication. Les différents modes de
communication. Les différents supports de la communication. Architecture des normes/ qualité.
Installations Classées pour l’Environnement. Le cadre des ICPE. L’organisation administrative. Le dossier
ICPE. La directive SEVESO II. Applications, plan d’organisation interne (POI). Plan particulier
d’intervention (PPI).

Ue5 ANALYSES DE DONNÉES - SIG
      Data analysis-GIS

ANALYSES DE DONNÉES
      Data analysis
Responsable : Olivier Pays-Volard
Intervenants : Olivier Pays-Volard, Jean-Marc Labatte

Compétences visées
Connaître la démarche d’un test d’hypothèses statistiques, Connaître les quelques lois fondamentales
(Loi Normale…), Savoir manipuler un jeu de données et extraire des descripteurs clefs d’un jeu de
données (moyenne, médiane, variance, écart-type…), Renforcer les acquis sur les bases nécessaires pour
réaliser des analyses statistiques appliquées aux sciences environnementales, S’initier à la modélisation
statistique.

  8
Contenu de l’enseignement
Description des tests statistiques classiques (paramétriques, non-paramétriques, analyses
multivariées…). Initiation à la modélisation statistique
    ― Construire un modèle linéaire à effets fixes (Régression linéaire, régression multiple, analyse de
        variance à un facteur et deux facteurs, analyse de covariance)
    ― Transformation des variables pour respecter les conditions d’application des procédures
    ― Tester les interactions entre variables
    ― Estimateur d’ajustement de modèle et de robustesse
Validation du modèle et Examen des résidus

SIG (Système d’Information Géographique)
      GIS
Responsable : Pierre-Cyril Renaud

Compétences visées
Connaitre les différentes sources d’information géographique. Être capable de définir les données
géographiques et leurs formats nécessaires à la résolution d’une problématique particulière. Comprendre
les structures, concepts et théories de base des SIG. Développer des compétences pour résoudre des
problèmes et utiliser un raisonnement analytique à l’aide de données géographiques. Apprendre à utiliser
les outils informatiques et l’analyse spatiale pour modéliser le monde réel. Apprendre à penser
spatialement.

Contenu de l’enseignement
Aspects théoriques de l’utilisation des systèmes d’information géographique et mise en pratique sur des
problématiques de contamination environnementale.

Ue6 ANGLAIS
      Applied english
Responsable : Philippe Torres

Compétences visées
En fin de Master, on vise le niveau de compétence B2 du Cadre Européen Commun de Référence pour
les Langues (CECRL) qui est résumé comme suit : « Peut comprendre le contenu essentiel de sujets
concrets ou abstraits dans un texte complexe, y compris une discussion technique dans sa spécialité.
Peut communiquer avec un degré de spontanéité et d'aisance tel qu'une conversation avec un locuteur
natif ne comporte de tension ni pour l'un ni pour l'autre. Peut s'exprimer de façon claire et détaillée sur
une grande gamme de sujets, émettre un avis sur un sujet d’actualité et exposer les avantages et les
inconvénients de différentes possibilités. »

Contenu de l’enseignement
Permettre aux étudiants de continuer à travailler les cinq compétences en langue - compréhension écrite
et orale, expression écrite et orale, et interaction orale - à travers des supports authentiques (articles,
documentaires, documents audio et vidéo d’internet, graphiques…) et des activités variées (exercices de
compréhension, d’expression écrite, jeux de rôle, débats, présentations orales…) ; étoffer les
connaissances lexicales dans le domaine de l’environnement ; améliorer la prononciation et revoir
certains points de langue le cas échéant.

Ue7 PROJET PERSONNEL PROFESSIONNEL DE L’ÉTUDIANT
      Student professional project
Intervenants : Virginie Grimault, Alexandra Nadifi

Contenu de l’enseignement et Compétences visées
Ateliers du SUIO-IP : « Trouve ton stage », « Talents, compétences, soft skills »
Construire son CV et sa lettre de motivation en français et en anglais. Prendre contact téléphoniquement
pour obtenir un rendez-vous. Simuler un entretien en langue anglophone.

  9
UE optionnelles

Ue8 Groupe d’Options au choix (8 ects)

                                              TOXICOLOGIE

PHARMACOLOGIE        (Tronc commun M1 Bio-santé)
       Pharmacology
Responsable : Hélène Tricoire-Leignel
Intervenants : César Mattei, Hélène Tricoire-Leignel, Sébastien Faure, Olivier Duval

Compétences visées
Maîtriser les concepts généraux de pharmacologie : les cibles de médicaments, le développement d’un
médicament, les différents-types de récepteurs, les cibles thérapeutiques, la signalisation intracellulaire,
les agonistes et antagonistes
Comprendre l’activité d’une biomolécule et son interaction avec son récepteur. Être en mesure de
caractériser la relation ligand-récepteur : affinité, sélectivité, Ka, Kd, kon, koff, effet maximal, Ki.
Maîtriser les principales techniques et démarches expérimentales permettant de mettre en évidence les
relations ligand-récepteur.
Connaître la structure et la pharmacologie des RCPG, canaux ioniques, récepteurs-enzymes, récepteurs
nucléaires.
Introduire les lois de la pharmacodynamie
Se familiariser avec la pharmacochimie et la pharmacocinétique
Acquérir des connaissances de base sur les méthodes d’études précliniques d’un médicament
Se familiariser avec des exemples physiopathologiques par la description de l’activité d’un médicament

Contenu de l’enseignement
Médicament, interaction ligand-récepteur, marge thérapeutique, concentration efficace 50, efficacité,
pharmacocinétique, pharmacodynamie, agonistes, antagonistes, santé publique, AMM, cible
thérapeutique, toxicité, criblage, essai et phases cliniques, loi d’action de masse, affinité, tests de liaison
(saturation, inhibition, …) distribution, métabolisme, absorption, relation dose-effet, effets indésirables.

PROLIFÉRATION CELLULAIRE, APOPTOSE, ONCOGÈNES I
       Cell proliferation, apoptosis, oncogenes I
Responsable : Olivier Coqueret
Intervenants : Olivier Coqueret, Benjamin Barré

Compétences visées
Maitriser les mécanismes moléculaires qui régulent la prolifération cellulaire.
Identifier les principales altérations de la prolifération cellulaire qui peuvent être à l’origine du phénomène
de cancérisation
Connaitre les principaux oncogènes et les gènes suppresseurs de tumeurs ainsi que leur rôle dans le
maintien de l’intégrité du génome.
Être capable d’expliquer les mécanismes de protection cellulaire tels que l’apoptose et la sénescence.

Contenu de l’enseignement
Mécanismes moléculaires régulant la prolifération cellulaire et ses dérégulations.
Principaux oncogènes, gènes suppresseurs de tumeurs et mécanismes de protection apoptotique.

ALTÉRATION GÉNOMIQUE ET PHARMACOGÉNOMIQUE
       Genomic alteration & pharmacogenomics
Responsable : Alain Morel
Intervenants : Alain Morel, Benjamin Barré

  10
Objectif et contenu de l’enseignement
Comprendre l’impact de la structure du génome sur la physiopathologie humaine. Appréhender
l’ensemble des approches permettant de caractériser les altérations génétiques et de leur expression.
Identifier les avantages et limites de chacune d’entre elles. Comprendre l’impact des altérations sur
l’expression de gènes et les altérations phénotypique associées. Être capable de comprendre et de
maitriser les moyens d’altérer ou de corriger les génomes.

                                        ÉCOTOXICOLOGIE

BIOLOGIE ET GÉNÉTIQUE DES POPULATIONS
       Population biology & genetics
Responsable : Olivier Pays-Volard
Intervenants : Christophe Lemaire, Olivier Pays-Volard

Compétences visées
Appréhender les outils permettant de caractériser la structure d'une population c.a.d. des éléments
structurants jusqu'au fonctionnement. Comprendre les variations d'abondance et les facteurs impliqués
dans la régulation des populations et métapopulations. Comprendre les forces évolutives dans la variation
génétique des populations (dérive, mutation, migration, sélection) et leur rôle. Résoudre des problèmes
simples de génétique des populations et aborder une question écologique sous l’angle de la génétique
des populations.

Contenu de l’enseignement
   ― Structure et fonctionnement démographique d'une population
Age des individus dans une population, Tables et Courbes de survie, Lois de croissance, Matrices de
Leslie, Stratégie de reproduction (r,k), Fluctuations d’abondance (régulières, irrégulières…), Facteurs
indépendants et dépendants (compétitions, prédation…) de la densité, Régulation bottom-up et top down,
Métapopulations (concept, modèles simples, structures et fonctionnements).
   ― Génétique des populations et les quatre forces évolutives
Dérive génétique (effet des tailles de populations, mécanisme probabiliste). Effet de la consanguinité
(autofécondation, effet Walhund), diversité génétique, structure génétique des populations.
Migration : flux de gènes. Modèles ile-continent, modèle en iles de Wright, modèle en pas japonais.
Généralisation aux matrices de migrations
Mutations réversibles et irréversibles (fréquences d’équilibre)
Sélection : modes de sélection (additivité, dominance, récessivité, super- et sous-dominance)
Équilibres entre les différentes forces (migration-dérive, sélection-dérive, mutation-sélection)

GÉOCHIMIE DES MILIEUX AQUATIQUES
       Geochemistry of marine & aquatic environment
Responsables : Édouard Metzger, Aurélia Mouret

Fonctionnement biogéochimique des milieux aquatiques et marins

Objectifs pédagogiques
Présenter les cycles géochimiques des éléments majeurs (N, P, Ca, C, Si...) et traces (Cd, Pb...) dans
l’environnement et leurs interactions dans le cycle de la matière organique. Analyser les processus
géochimiques à l’interface eau/sédiment et continent/océan. Caractériser les habitats aquatiques et la
variabilité temporelle et spatiale des paramètres physico-chimiques qui les définissent.

Connaissances et compétences visées
Comprendre les flux d’éléments nutritifs et contaminants qui contrôlent les écosystèmes. Appréhender
les évolutions géochimiques des habitats benthiques et planctoniques en domaine océanique franc,
côtier (plage, estuaire, lagune) et lacustre, en réponse aux variations hydro-météorologiques (par ex.
courants marins, vents, vagues, marée) et climatologiques (par ex. saisons, sècheresse).

  11
SEMESTRE 2

UE obligatoires

Ue1 TOXICOLOGIE II
       Toxicology II
Responsable : César Mattei
Intervenants : César Mattei, Claire Campion

Compétences visées
Savoir analyser des données scientifiques relatives aux toxines, du producteur à la molécule. Maîtriser
les principales toxines et leurs producteurs et les cibles associées.
Caractériser le rôle d’une toxine animale dans une stratégie de défense/envenimation. Mettre en
perspective l’effet de cette toxine sur son récepteur, les organes affectés et le tableau
symptomatologique.
Maîtriser la notion de toxine dans sa globalité [producteur, fonction, structure chimique, cible, effets,
DL50]. Comparer les effets de toxines ciblant le même récepteur (exemple du canal sodium). Savoir
caractériser les effets d’une toxine en analysant des données de la littérature.
Être à même d’associer une toxine avec la maladie humaine dont elle est responsable, en sachant
identifier les modes de contamination, les effets cellulaires et tissulaires d’une toxine et ses conséquences
sur la santé.
Appréhender les usages traditionnels, présents et en développement des toxines, connaître celles qui ont
obtenu une autorisation de mise sur le marché et les aires thérapeutiques concernées.

Contenu de l’enseignement
Définition d’une toxine, caractéristiques en termes de producteur, structure chimique, mode de
transmission, interaction toxine/récepteur, effets sur l’homme. Toxines fongiques : classification, types
de toxines, phytotoxines, mycotoxines (muscarine), syndrome phalloïdien. Toxines bactériennes :
germes impliqués dans des pathologies, inoculum, cibles physiologiques, toxines protéiques (structure,
récepteur), maladies humaines (tétanos, coqueluche, diphtérie), traitement. Toxines animales :
producteurs venimeux et vénéneux, toxines peptidiques et non-peptidiques, spécificité de l’interaction
toxine/récepteur, vectorisation des toxines animales en médicament. Toxines végétales : des micro-
algues aux plantes toxiques, alcaloïdes végétaux, principaux effets des intoxications, usage
thérapeutique des toxines végétales.

Ue2 ÉCOTOXICOLOGIE II
       Ecotoxicology II
Responsable : Amélie Châtel
Intervenants : Amélie Châtel, Françoise Montrichard, Jean Secondi

Contenu de l’enseignement
Méthodes d’évaluation de la génotoxicité, Impacts des polluants sur les amphibiens. Pollution lumineuse.
Signalisation et régulation des espèces réactives de l’oxygène

  12
Ue3 ANALYSE DES MICROPOLLUANTS ORGANIQUES ET MINÉRAUX
       Organic & inorganic micropollutant analysis
Responsable : Tony Breton

Compétences visées :
Connaitre les principales méthodes instrumentales dédiées spécifiquement à l’analyse quantitative et de
détection présentes dans les laboratoires d’analyse des secteurs de l’industrie chimique et
pharmaceutique ainsi que dans les sciences de l’environnement.

Contenu de l’enseignement
Absorption atomique et ICP ; méthodes chromatographiques et électrophorétiques ; Quantification par
étalonnages interne/externe ; Spectrométrie de Masse : notions d'isotopie, de résolution..., présentation
des types de sources et analyseurs ; principe de la spectrométrie de masse en tandem ; principales
réactions de fragmentation ; interprétation de spectres.

Ue4 ANGLAIS
    Applied english
Responsable : Philippe Torres

Compétences visées
En fin de Master, on vise le niveau de compétence B2 du Cadre Européen Commun de Référence pour
les Langues (CECRL) qui est résumé comme suit : « Peut comprendre le contenu essentiel de sujets
concrets ou abstraits dans un texte complexe, y compris une discussion technique dans sa spécialité.
Peut communiquer avec un degré de spontanéité et d'aisance tel qu'une conversation avec un locuteur
natif ne comporte de tension ni pour l'un ni pour l'autre. Peut s'exprimer de façon claire et détaillée sur
une grande gamme de sujets, émettre un avis sur un sujet d’actualité et exposer les avantages et les
inconvénients de différentes possibilités. »

Contenu de l’enseignement
Permettre aux étudiants de continuer à travailler les cinq compétences en langue - compréhension écrite
et orale, expression écrite et orale, et interaction orale - à travers des supports authentiques (articles,
documentaires, documents audio et vidéo d’internet, graphiques…) et des activités variées (exercices de
compréhension, d’expression écrite, jeux de rôle, débats, présentations orales…) ; étoffer les
connaissances lexicales dans le domaine de l’environnement ; améliorer la prononciation et revoir
certains points de langue le cas échéant.

Ue5 STAGE
    Internship
Responsable : Hélène Tricoire-Leignel

Compétences visées
Mener à bien un projet d’insertion pré-professionnelle cohérent avec la formation et les objectifs de
l’étudiant. Faire preuve de savoir-être dans la structure d’accueil (comportement et motivation, tenue,
ponctualité et assiduité, relation avec les usagers, rapports avec la hiérarchie et capacité d’interaction,
rapports avec ses collègues, capacité à solliciter les informations). Mobiliser les compétences et les
savoirs au profit de la mission qui sera confiée (efficacité, méthode et organisation, adaptation du niveau
de connaissance à la mission, faculté d’adaptation et compétences mises en œuvre, autonomie, rigueur
et fiabilité, progression au cours du stage, qualité des documents produits dans la rédaction, le contenu
technique et la clarté).

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UE optionnelles

Ue8 Options au choix (9 ects)

PROLIFÉRATION CELLULAIRE, APOPTOSE, ONCOGÈNES II
     Cell proliferation, apoptosis, oncogenes II
Responsable : Olivier Coqueret
Intervenants : Olivier Coqueret, Benjamin Barré

Compétences visées
Maitriser les mécanismes moléculaires qui régulent la prolifération cellulaire.
Identifier les principales altérations de la prolifération cellulaire qui peuvent être à l’origine du phénomène
de cancérisation
Connaitre les principaux oncogènes et les gènes suppresseurs de tumeurs ainsi que leur rôle dans le
maintien de l’intégrité du génome.
Être capable d’expliquer les mécanismes de protection cellulaire tels que l’apoptose et la sénescence.

Contenu de l’enseignement
Mécanismes moléculaires régulant la prolifération cellulaire et ses dérégulations.
Principaux oncogènes, gènes suppresseurs de tumeurs et mécanismes de protection apoptotique.

TOXICOLOGIE DES ADDICTIONS, TOXICOLOGIE ALIMENTAIRE
    Addiction & food toxicology
Responsable : César Mattei

Objectifs pédagogiques
Comprendre les mécanismes inhérents au phénomène d’addictions chimiques.
Identifier les différents agents responsables de l’absence d’innocuité des aliments.

Contenu de l’enseignement
Addiction à l’alcool, à la nicotine et aux opiacés.
Principes généraux de toxicologie alimentaire. Rappel de la physiologie gastro-intestinale et mécanismes
d’absorption. Grands groupes de toxiques alimentaires. Les additifs alimentaires et les conservateurs :
législation, DJA, controverses.

ADAPTATION PHYSIOLOGIQUES AUX CONTRAINTES ENVIRONNEMENTALES
     Physiological adaptations regarding environmental constraints
Responsable : Hélène Tricoire-Leignel
Intervenants : Vincent Leignel, Hélène Tricoire-Leignel

Compétences visées
Maîtriser les concepts de régulations physiologiques des organismes en conditions extrêmes. Connaître
les différents niveaux d’identification d’une adaptation d’un organisme dans un milieu extrême donné.

Contenu de l’enseignement
Réponses des organismes aux conditions extrêmes : concepts généraux et approches méthodologiques,
études de cas :
   ― Températures extrêmes : stratégies et adaptations physiologiques et moléculaires permettant
       d’éviter ou de tolérer le gel, les températures polaires et désertiques
   ― Dessiccation : adaptations physiologiques et moléculaires permettant d’éviter ou de tolérer les
       pertes d’eau corporelle (modifications des téguments, anhydrobiose, cryptobiose, régulations
       physiologiques et comportementales...)
   ― Conditions abyssales et hydrothermales profondes : adaptations moléculaires à l’hypoxie, à la
       pression hydrostatique, aux contaminations métalliques, à l’émission de soufre, au gradient de
       température, à l’absence de lumière.

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ÉCOLOGIE DES COMMUNAUTÉS
     Communauty ecology
Responsable : Olivier Pays-Volard
Intervenants : Aurélie Davranche, Sébastien Maugenest, Alain Pagano, Olivier Pays-Volard

Compétences visées
Appréhender les outils permettant de caractériser la structure d'une communauté qu’elle soit animale ou
végétale. Savoir identifier la nature des principales relations entre groupes d’organismes (et populations)
pluri-spécifiques et comprendre le fonctionnement des communautés.

Contenu de l’enseignement
    ― Structure et fonctionnement des communautés animales
Caractéristiques des communautés (Richesse et diversité spécifique, indice de dominance, comparaison
de niches…), Compétition interspécifique (Modèles mathématiques d’exclusion réciproque et de
coexistence, Ségrégation et partage des ressources, Conséquences évolutives…), Les interactions
prédateurs proies (Modèles d’optimal foraging et variation du régime alimentaire, Les réponses
fonctionnelles, numériques et écologiques, Rôle limitant de la prédation, Conséquences écologiques et
évolutives), Les interactions hôte-parasite (Modèles mathématiques et rôle limitant du parasitisme).
    ― Structure et fonctionnement des communautés végétales
Les successions écologiques (Dynamique, Structuration, Zonation écologique, Communauté fermée et
ouverte), Théorie de la niche intermédiaire, Fondements de la synsystématique et la syntaxinomie,
Détermination des communautés végétales, Dynamique des groupements végétaux, Valeurs indicatrices
d’Ellenberg, Exemples concrets sur la végétation des prairies humides angevines.

BIOINDICATEURS DES MILIEUX AQUATIQUES
    Bio-indicators for marine & aquatic environments
Responsable : Emmanuelle Geslin

Objectifs pédagogiques
Présenter les principes des différents moyens de suivi de la qualité des milieux en mettant l’accent sur
les avantages et les inconvénients de chacun. Présenter globalement les différentes méthodes de bio-
indication en milieu aquatique (indices biotiques, bio-essais, bio-accumulateurs…).

Connaissances et compétences visées
Développer l’esprit critique des étudiants par rapport aux différents outils utilisés pour évaluer la qualité
des environnements aquatiques afin qu’ils puissent être prêts à définir un plan de surveillance d’un milieu.
Savoir manier quelques indices biotiques employés dans le suivi de la qualité du milieu (eaux douces,
eaux intermédiaires, eaux marines).

TECHNIQUE D’INVENTAIRE, INDICES QUALITÉS ENVIRONNEMENTALES
      Biodiversity survey techniques, environment quality index
Responsable : Jean Secondi
Intervenants : Séverine Chauvet, Hervé Daniel, Philippe Frin, Stéphanie Hudin, Jean Secondi, Jessica
Vizinet, Intervenants extérieurs

Compétences visées
Connaître les principes généraux des inventaires en écologie et des études de suivi des populations et
des peuplements ; Connaître les différentes approches de caractérisation de l’environnement des zones
humides et les principales méthodes normalisées d’inventaire en rivière ;
Connaître les différentes approches de quantification de la qualité des milieux et leurs intérêts respectifs
pour être en mesure de sélectionner la combinaison de techniques nécessaires à la mise en place d’un
programme d’étude ou de suivi.

Contenu de l’enseignement
    ― Techniques d’inventaire (27h)
L’objectif est d’acquérir les principes d’échantillonnage de la biodiversité et les méthodes d’estimation.
Seront traitées les questions suivantes Quelles sont les différentes approches pour estimer la biodiversité

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à différentes échelles ? Comment estimer la taille d’une population et sa tendance démographique.
Comment appliquer les principes d’échantillonnage pour les inventaires botaniques dans les zones
humides.
    ― Indices de qualité environnementale (27h)
L’objectif est de comprendre comment les principes d’échantillonnage et les méthodes d’inventaire ont
été utilisés pour développer des méthodes de caractérisation de la qualité de l’environnement. Seront
développées les différentes approches d’évaluation (physiques, physico-chimiques, biotiques) ainsi que
les méthodes normalisées sur des groupes spécifiques ainsi que les méthodes multi-critères en cours de
développement pour l’évaluation environnementale des milieux aquatiques et des zones humides. Une
part importante de cet enseignement sera donnée par des professionnels du domaine concerné.

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Impression Service Reprographie UA
A    Administration ı Scolarité ı Enseignement (Amphi A à E)
B    Biologie végétale ı Physiologie végétale ı Travaux pratiques biologie
B’   Travaux pratiques biologie
C    Travaux pratiques chimie
C’   Département de Géologie ı Recherche environnement (LETG -LEESA) ı Recherche géologie (LPGN-BIAF)
D    Travaux pratiques physique
Da   Enseignement ı Travaux pratiques physique
Db   Département de Physique ı Recherche physique (LPHIA)
E    Travaux pratiques biologie
F    Département de Biologie ı Recherche neurophysiologie (SIFCIR) ı Travaux pratiques biologie, géologie
GH   Département Informatique ı Recherche Informatique (LERIA) ı Travaux pratiques géologie
I    Département Mathématiques ı Recherche Mathématiques (LAREMA)
J    Chimie enseignement ı Travaux pratiques
K    Département de Chimie ı Recherche Chimie (MOLTECH Anjou)
L    Espace multimédia ı Enseignement (Amphi L001 à L006) ı Salle d’examen rez-de-jardin

                             2, Boulevard Lavoisier
                             49045 ANGERS CEDEX 01
                             T.0241735353
                             www.univ-angers.fr
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