Plateformes Régionales de Lipidomique - Assises Nutrition - 11 septembre 2019 - Lyonbiopole
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Assises Nutrition – 11 septembre 2019
Plateformes Régionales
de
Lipidomique
Plateformes Régionales de Lipidomique
Localisations
Plateforme de Lipidomique Fonctionnelle:
Bât IMBL, INSA de Lyon, Villeurbanne
Plateforme de Sphingolipidomique:
Groupement Hospitalier Est – Hospices Civils de
Lyon, Bron
LYON
GRENOBLE
Plateforme de Glycérolipidomique LIPANG:
Laboratoire de Physiologie Cellulaire et Végétale,
CEA Grenoble, Grenoble
Qu’est-ce qu’un lipide?
Groupe chimiquement diversifié de composés organiques dont la caractéristique
principale est l'insolubilité dans l'eau (mais solubilité dans les solvants organiques)
Les fonctions biologiques des lipides sont aussi diverses que leur chimie
Rôle des lipides
Stockage d’énergie (graisses, huiles)
Rôle structural (phospholipides, stérols: composants principaux des membranes biologiques)
Signalisation (hormones…)
Lipides = nutriments essentiels au fonctionnement de l'organisme
Classification des lipides
Pas de classification unique:
- Lipides simples (constitués de C, H, O. Ex: acide gras, glycérides, ...)
- lipides complexes (en plus de C, H et O peuvent contenir du phosphore, de l'azote, du soufre...
Ex: sphingolipides, glycérophospholipides…)
Plateformes Régionales de Lipidomique
• Elles proposent une expertise dans le domaine de l'analyse lipidique.
• Elles s’adressent à l'ensemble de la communauté scientifique publique et privée.
• Elles sont ouvertes à tout type de projets en collaboration ou contractualisés.
Certification ISO 9001:2015 Accréditation NF EN ISO 15189
Plateforme de
Lipidomique
Fonctionnelle Plateforme de
Sphingolipidomique
Plateformes Régionales de Lipidomique
Services
• Conseils et accompagnements dans la mise en place de projets en lipidomique.
• Formation théorique et pratique en lipidomique.
• Réalisation d’analyses lipidiques ciblées.
• Assurer une performance technologique par une veille technologique active.
Plateformes Régionales de Lipidomique
Types d’analyses proposées
PLATEFORME DE LIPIDOMIQUE FONCTIONNELLE PLATEFORME DE SPHINGOLIPIDOMIQUE PLATEFORME DE
ANALYSE ET CARACTÉRISATION MOLÉCULAIRE DES LIPIDES ANALYSE DES BASES SPHINGOIDES ET GLYCÉROLIPIDOMIQUE LIPANG
o LIPIDES STRUCTURAUX LYSOSPHINGOLIPIDES
- Composition en acides gras des esters de cholestérol, triacylglycérols, o Sphingosine, Sphinganine, Sphingosine-1-P EXTRACTION DE LIPIDES
phospholipides (classes, sous-classes et espèces moléculaires de phospholipides) o Lysosphingolipides (LysoHexCer, LysoSM, LysoSm509, o Extraction à chaud pour échantillon contenant des
- Stérols et oxystérols LysoGb3, LysoGM1) lipases
o LIPIDES DE SIGNALISATION ANALYSE DES CERAMIDES ET SPHINGOMYÉLINES ANALYSE DES ACIDES GRAS
- Métabolites oxygénés : octadécanoïdes (HODEs...), eicosanoïdes (prostanoïdes, o Céramides et Dihydrocéramides o quantification et identification des acides gras libres ou
leucotriènes...), docosanoïdes (protectines, marésines, résolvines...) o Sphingomyélines estérifiés
- Autres : diacylglycérols, phosphatidate, sphingosine, sphingosine-1-phosphate
ANALYSE DES CÉRÉBROSIDES ANALYSE STRUCTURALE DES GLYCEROLIPIDES
o MARQUEURS DE LA PEROXYDATION LIPIDIQUE o Hexosylcéramides o Positionnement des acides gras sur le squelette glycérol
o Lactosylcéramides des différentes familles de lipides
- Hydroxy-alkénals (4-HNE, 4-HHE...)
- Isoprostanes o Globotriaosylcéramides
- Vitamines liposolubles et caroténoïdes o Sulfatides QUANTIFICATION DES GLYCÉROLIPIDES
o phospholipides, galactolipides, betaine lipides et
BIOSYNTHÈSE ET SYNTHÈSE DE LIPIDES MARQUÉS OU NON AUX ISOTOPES ANALYSE DES GANGLIOSIDES triacylglycérols
o GM3 - Gangliosides
STABLES
o GM2 - Gangliosides
o GM1 - Gangliosides
ANALYSE ET CARACTÉRISATION DE STRUCTURES SUPRAMOLÉCULAIRES
- Profils lipoprotéiques plasmatiques par FPLC
- Distribution de tailles de particules (émulsions, lipoprotéines plasmatiques,…) par
granulométrie laser
- Etudes de membranes biomimétiques : microscopie à angle de Brewster
(BAM), (PM-IRRAS)
Plateformes Régionales de Lipidomique
Différents organismes Différentes matrices
Bactéries
Fluides
biologiques
Fruits Humains Cellules
Mammi-
fères
Insectes
Pollen Tissus
Souris
Légumes
…
Matrices
diverses
Virus
Plateformes Régionales de Lipidomique
Différents contextes
physiologiques et
physiopathologiques
…
Plateformes Régionales de Lipidomique
Equipements disponibles
PLATEFORMEDE LIPIDOMIQUE FONCTIONNELLE
- Chromatographies gazeuses (GC)
- Chromatographies liquides (HPLC, UHPLC, FPLC)
PLATEFORME DE SPHINGOLIPIDOMIQUE
- Chromatographie gazeuse couplée à la spectrométrie
de masse en tandem (GC-MS/MS)
- Chromatographie liquide couplée à la spectrométrie
de masse en tandem (UHPLC-MS/MS)
LC-MS/MS
- Spectroscopie PM-IRRAS LC-MS/MS AB SCIEX 3200
- Microscope à Angle de Brewster (« BAM ») AB SCIEX 4500 et 4500 QTrap
GC-MS Agilent
Extracteur de lipide
CEM
Robot de méthanolyse
RIC
PLATEFORME
LIPANG
LC-MS/MS GC-FID et GC-FID-MS
6460 Agilent Perkin Elmer
MS trappe ionique
AmazonXL BrukerCollaborations (antérieures avec des acteurs de la nutrition santé; projets collaboratifs / prestations / exemples concrets,…). - Polaris - CarMeN - « Phospholipides structurés à DHA: Production et Biodisponibilité Cérébrale ». - UMR 870, Villeurbanne - CRNH Rhône-Alpes, Lyon - UMR 1019, Clermont-Ferrand - UMR 5220, Lyon - UMR 1286, Bordeaux - UMR 7104, Strasbourg – Iterg, Pessac – Phosphotech, St Herblain – Nestlé, Suisse) ANR Neuroprotect - « Métabolisme chez l’Homme d’un phospholipide d’origine marine structuré et action neuronale ». - Projet BPI France pour la production d’algues riches en huiles contenant des ω3 - Projet ANR – VALOBAB : VALOrisation durable du BABeurre : bénéfices nutritionnels, intérêt fonctionnel dans les aliments et perception par le consommateur – U1060 Carmen INSERM, INRA, CNIEL, ITERG, ENILIA, Université de Lyon Capacité de travailler avec des académiques et des industriels, nationaux et internationaux: Exemple d’académiques: Station marine de Roscoff, Norwegian University of Science and Technology, Chinese Academy of Agricultural Sciences, Université du Luxembourg, ... Exemple d’industriels: Fermentalg, Total, Polaris, Nestlé, Neptune...
Plateformes Régionales de Lipidomique
Exemples d’applications
Typical GC-MS/MS profile of derivatized sterols
FIA-MS/MS Plasmatic profile of Sphingomyelins
LC-MS/MS chromotagram of LysosphingolipidsPlateformes Régionales de Lipidomique
Modalités d’accès
PLATEFORMEDE LIPIDOMIQUE FONCTIONNELLE PLATEFORMEDE SPHINGOLIPIDOMIQUE
Contact : Contact :
Nathalie Bernoud-Hubac David Cheillan
Tel. 04 72 43 85 74 Tel. 04 72 12 96 88
Courriel : plateforme.lipidomique@insa-lyon.fr Courriel : david.cheillan@chu-lyon.fr
http://imbl.insa-lyon.fr/plateforme-de-lipidomique/la-plateforme-de-lipidomique
PLATEFORMEDE GLYCEROLIPIDOMIQUE LIPANG
Contacts :
Juliette Jouhet
Tel. 04 38 78 38 55
Courriel : juliette.jouhet@cea.fr
Fabrice Rébeillé
Tel. 04 38 78 44 99
Courriel : fabrice.rebeille@cea.frVous pouvez aussi lire
