Caractérisation moléculaire par microsatellites de trois races chevaline en Tunisie

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Caractérisation moléculaire par microsatellites de trois races chevaline en Tunisie
DIVERSITÉ GÉNÉTIQUES DES RACES CHEVALINES TUNISIENNE                                                                                                              103

Caractérisation moléculaire par microsatellites de
trois races chevaline en Tunisie
H. OULED AHMED1, M.FATNASSI2*, H. FERCHICHI2, R. BACCOUCHE4, F. LASFAR3, M. ZAOUIA3,
A BEN YOUNES3, M.HADDAD3, A. TRIMECHE2

1
 Laboratoire d’Analyses Génétiques Animales, Institut de la Recherche Vétérinaire de Tunisie 1006, Tunisie
2
 Gestion de la santé et de la qualité des productions animales, Service de zootechnie, Ecole de médecine vétérinaire, Sidi-Thabet 2020, Tunisie.
3
 Fondation Nationale d’Amélioration de la Race Chevaline, Sidi-Thabet 2020, Tunisie
4
 Institut National Agronomique de Tunisie, 43, Avenue Charles Nicolle 1082 -Tunis- Mahrajène Tunisie.

*Auteur chargé de la correspondance : fatnassi_meriem@yahoo.com

RÉSUMÉ                                                                                  ABSTRACT

L’objectif de cette étude est l’évaluation de la diversité génétique de 3 races         Molecular characterization of three horse breeds in Tunisia using
chevalines en Tunisie. Dix-sept marqueurs microsatellites ont été utilisés              microsatellites markers
pour le génotypage de 300 chevaux appartenant aux 3 races (100 Barbe,
100 Arabe Barbe et 100 Pur-Sang Arabe). Les 17 microsatellites utilisés                 This study aimed to evaluate the genetic diversity of 3 horse breeds in Tunisia.
étaient fortement polymorphes avec un nombre d’allèles par locus variant                A total of 17 microsatellite markers was used for the genotyping of 300 horses
entre 8 et 25. Le nombre moyen d’allèle est de 17,8 ; 18,5 et 13,8 pour la              belonging to the 3 breeds (100Barb, 100 Arab-Barb and 100 Arabian Pur-
population barbe, Arabe-Barbe et Pur-Sang Arabe, respectivement. Le taux                Sang). The number of alleles per locus varying from 8 to 25, with an average
de l’hétérozygotie observée est de 0,675 ; 0,657 et 0,666 pour la race Barbe,           number of alleles of 17.8; 18.5 and 13.8 for Barb, Arab-Barb and Arabian
Arabe-Barbe et Pur-sang Arabe, respectivement. Ces valeurs sont inférieures             Pur-Sang, respectively. The observed heterozygosity (Ho) were 0.675; 0.657
à celles de l’hétérozygotie attendue : 0,786 ; 0,870 et 0,872, respectivement.          and 0.666for Barb, Arab-Barb, andArabian Pur-Sang, respectively. These
Nos résultats ont montré que 91,2% de la variabilité génétique totale est               values were lower than those of the expected heterozygosity (He). Our results
expliquée par la variation intra-population et que 8,8 % de cette variabilité           showed that 91.2% of the total genetic variation were within the population
est attribuée aux différences entre les 3 populations. Le calcul de la distance         and the remaining (8.8%) originates from difference among populations.
génétique a permis de constater que l’Arabe-Barbe était génétiquement plus              Arab-Barb breeds was more closely related to Barb than Arabian-Pur-Sang.
proche des Barbes que des Pur- sang Arabes. Cette constatation est confirmée            This finding was confirmed by the factorial correspondence analysis (AFC).
par l’analyse factorielle des correspondances (AFC). En conclusion, cette               In conclusion, this study contributes to the programs of conservation and
étude contribue aux programmes de conservation et de valorisation des                   upgrading of local horse breeds, and reinforce the need to improve the
races chevalines locales, et insiste aussi à l’amélioration des méthodes de             methods of management of equine breeding in Tunisia.
gestion de l’élevage équin en Tunisie.
                                                                                        Keywords: Horses, microsatellites, genetic diversity,
Mots-clés : Chevaux, microsatellites, diversité génétique,                              Tunisia
Tunisie

Introduction                                                                            être phénotypiques (caractères morpho-biométriques),
                                                                                        biochimiques ou immunogénétiques (polymorphisme des
     Les chevaux occupent une place de choix dans l’histoire, la                        protéines), cytogénétiques (nombre, formes et anomalies
culture et l’économie des pays d’Afrique du nord. En Tunisie,                           chromosomiques) ou moléculaires (analyse des marqueurs
il existe cinq différentes races telles que la Barbe (BA), l’Arabe-                     dans l’ADN). Durant les dernières décennies et avec le
Barbe (AB), le Pur-Sang Arabe (AR), le Pur-Sang Anglais (PS)                            développement de nouvelles technologies de la biologie
et le Poney de Mogods (PM) [19]. La race BA est spécifique                              moléculaire, les polymorphismes de l’ADN sont devenus les
de l’Afrique du Nord, alors que la race AR est d’origine                                marqueurs de choix dans l’étude de la structure génétique
orientale ; elle est introduite en Tunisie avec la conquête                             et l’histoire évolutive des organismes. Un certain nombre
arabo-musulmane. Le croisement de ses deux races a donné la                             de marqueurs sont à présent utilisés, mais les marqueurs
race AB [14]. Selon la Fondation Nationale d’Amélioration de                            les plus couramment employés dans l’étude de la diversité
la Race Chevaline (FNARFC), l’effectif total des chevaux est                            génétique sont les microsatellites [31]. Par définition, les
estimé à 37 000 têtes, dont la grande majorité de ces chevaux                           microsatellites sont des séquences d’ADN constituées de
sont communément identifiés comme BA et AB (presque                                     répétition en tandem d’un motif de 1 à 6 pb [9, 35]. Ils sont
80% de l’effectif total) [15]. En raison de l’importance des                            largement utilisés dans l’analyse de la diversité génétique
races chevalines Tunisienne, une information complète                                   entre différentes races animales : chevaline [5, 19,32],
sur la diversité génétique et la structure de la population                             bovine [2, 26], ovine [10, 16, 20], cameline [29, 30]. Dans
présente une grande importance puisqu’elle constitue la basse                           ce contexte, cette étude vise (i) étudier la diversité génétique
de tous programmes de conservation et de gestion durable                                de trois races chevaline élevées en Tunisie (BA, AB, AR) par
[28]. D’une manière générale, la caractérisation des races                              l’étude des marqueurs microsatellites et (ii) déterminer leur
animales fait recours aux plusieurs méthodes qui peuvent                                relation génétique.

Revue Méd. Vét., 2018, 169, 4-6, 103-109
104                                                                                            OULED AHMED (H.) AND COLLABORATORS

Matériel et méthodes                                                               de dénaturation initiale à 95°C pendant 10 minutes, suivie
                                                                                   de 30 cycles comprenant chacun une dénaturation à 95°C
ECHANTILLONNAGE ET EXTRACTION D’ADN                                                pendant 30 secondes, une étape d’hybridation à 60°C durant
                                                                                   30 secondes et une étape d’élongation de 1 minutes à 72°C.
   Au total, 300 animaux de l’espèce chevaline composés de                         Après les 30 cycles d’amplification, une étape d’élongation
100 BA, 100 AB et 100 AR ont été utilisés dans ce travail.                         finale a été effectuée à 72°C pendant 1 heure.
Les échantillons du sang ont été prélevés dans des tubes
EDTA (5 ml) à partir de la veine jugulaire. Ils ont été choisis                        L’amplifiât a subi une dénaturation à 95°C pendant 3
au hasard parmi ceux présents dans la banque de sang du                            minutes en présence du formamide, le produit PCR est
Laboratoire d’Analyses Génétiques Animales (LAGA)                                  détecté par électrophorèse capillaire en utilisant le séquenceur
de l’Institut de la Recherche Vétérinaire de Tunisie                               ABI PRISM 3130 (Applied Biosystem, USA). La visualisation
(IRVT). L’extraction d’ADN génomique à partir du sang                              de résultat a été effectuée à l’aide du logiciel Gene Mapper
total a été réalisée à l’aide du Kit d’extraction (PurelinkTM                      V.4, 0 (Applied Biosystems, Foster City, Californie, USA). Le
Genomic DNA Mini Kit, Invitrogen, Carlsbad, CA, USA).                              standard de taille (GENESCAN-LIZ 500 Applied Biosystems)
                                                                                   a été utilisé pour déterminer la taille des allèles.
AMPLIFICATION DE L’ADN PAR PCR
                                                                                   CHOIX DES MARQUEURS MICROSATELLITES
  L’amplification de l’ADN a été réalisée par une PCR
multiplexe en utilisant le Kit (Stocks Marks for Horses, Equine                        Un jeu de 17 marqueurs microsatellites a été choisi pour
Genotyping kit Applied Biosystems, Foster City, Californie,                        le génotypage des races chevaline tunisienne (Tableau I).
USA). Les conditions d’amplifications comportent une étape                         Ces marqueurs font partie de la liste recommandée par le

 Locus                   Les séquences des amorces (avant et arrière)                               Taille (pb)                  Références
 AHT4                    5’: AACCGCCTGAGCAAGGAAGT                                                   144-164                      [7]
                         3’: CCCAGAGAGTTTACCCT
 AHT5                    5’: ACGGACACATCCCTGCCTGC                                                   126-144                      [7]
                         3’: GCAGGCTAAGGAGGCTCAGC
 ASB2                    5’: CCACTAAGTGTCGTTTCAGAAGG                                                216-250                      [8]
                         3’: CACAACTGAGTTCTCTGATAGG
 ASB17                   5’: ACCATTCAGGATCTCCACCG                                                   87-129                       [8]
                         3’: GAGGGCGGTACCTTTGTACC
 ASB23                   5’: GAGGGCAGCAGGTTGGGAAGG                                                  175-211                      [21
                         3’: ACATCCTGGTCAAATCACAGTCC
 CA425                   5’: AGCTGCCTCGTTAATTCA                                                     226-246                      [12]
                         3’: CTCATGTCCGCTTGTCTC
 HMS1                    5’: CATCACTCTTCATGTCTGCTTGG                                                170-186                      [17]
                         3’:TTGACATAAATGCTTATCCTATGGC
 HMS2                    5’:CTTGCAGTCGAATGTGTATTAAATG                                               222-248                      [17]
                         3’: ACGGTGGCAACTGCCAAGGAAG
 HMS3                    5: CCATCCTCACTTTTTCACTTTGTT                                                148-170                      [17]
                         3’: CCAACTCTTTGTCACATAACAAGA
 HMS6                    5’: GAAGCTGCCAGTATTCAACCATTG                                               151-169                      [17]
                         3’: CTCCATCTTGTGAAGTGTAACTCA
 HMS7                    5’:TGTTGTTGAAACATACCTTGACTGT                                               165-185                      [17]
                         3’: CAGGAAACTCATGTTGATACCATC
 HTG4                    5’: CTATCTCAGTCTTGATTGCAGGAC                                               127-139                      [13]
                         3’: CTCCCTCCCTCCCTCTGTTCTC
 HTG6                    5’: GTTCACTGAATGTCAAATTCTGCT                                               84-102                       [13]
                         3’: CCTGCTTGGAGGCTGTGATAAGAT
 HTG7                    5’: CCTGAAGCAGAACATCCCTCCTTG                                               118-128                      [25]
                         3’: ATAAAGTGTCTGGGCAGAGCTGCT
 HTG10                   5’:TTTTTATTCTGATCTGTCACATTT                                                95-115                       [25]
                         3’: CAATTCCCGCCCCACCCCCGGCA
 LEX3                    5’: ACATCTAACCAGTGCTGAGACT                                                 142-164                      [11]
                         3’: GAAGGAAAAAAAGGAGGAAGAC
 VHL20                   5’: CAAGTCCTCTTACTTGAAGACTAG                                               87-105                       [34]
                         3’: AACTCAGGGAGAATCTTCCTCAG
    Tableau I : Caractéristiques de 17 marqueurs microsatellites utilisés dans la caractérisation moléculaire de 3 races (Barbe (BA), Arabe-Barbe (AB) et Pur-
Sang Arabe (AR)) chevalines en Tunisie

                                                                                                                     Revue Méd. Vét., 2018, 169, 4-6, 103-109
DIVERSITÉ GÉNÉTIQUES DES RACES CHEVALINES TUNISIENNE                                                                                            105

Groupe Consultatif ISAG-FAO pour l’analyse de la diversité                    Résultats
génétique, l’identification et le contrôle de filiation des races
équines à l’échelle mondiale.                                                 VARIABILITÉ GÉNÉTIQUE INTRA-POPULATION

MÉTHODES D’ANALYSES STATISTIQUES                                                   Nombre total d’allèles et la richesse allélique

                                                                                  Le nombre total d’allèle (Na) calculé pour chaque race
    Le nombre d’allèle par locus, la fréquence allélique,
                                                                              est présenté dans le tableau II. Les 17 microsatellites utilisés
taux d’hétérozygotie observé (Ho) et attendu (He) sous
                                                                              ont montré un polymorphisme génétique important avec
l’hypothèse de Hardy-Weinberg ont été calculés en utilisant
                                                                              un nombre allélique variant entre 8 et 25. Dans notre étude,
le logiciel GENETIX version 4.05.2 [4] afin de déterminer la
                                                                              le nombre total d’allèles est de l’ordre de 303, 315 et 234
diversité génétique intra-population.
                                                                              respectivement pour les races BA, AB et AR.
    La diversité génétique inter-population a été évaluée                          Fréquences alléliques et allèles privés
par le calcul des distances génétiques [27] et le coefficient
de différentiation génétique Gst de Nei (les indices de                           L’analyse de résultats montre une différence portant sur la
différenciation de Wright (ou Nei)) déterminés à l’aide du                    distribution allélique au niveau de chaque locus ainsi que sur
logiciel GENETIX 4.05.2 [4]. La représentation de la relation                 les fréquences des allèles dans chaque population. Au total,
génétique entre les populations testées a été réalisée par                    115 allèles privés ont été identifiés dans le présent travail
l’approche AFC [22] en utilisant le même logiciel.                            pour les 3 races. Ces allèles sont répartis comme suit : 29
                                                                              pour la race BA, 40 allèles privés pour la race AB et 46 allèles
                                                                              privés pour la race AR, et (Tableau III). La plupart des allèles

                                                        BA                                AB                                     AR
                Locus
                                                         Na                                Na                                    Na
 VHL20                                                 20,000                            19,000                                11,000
 HTG4                                                  15,000                            15,000                                 9,000
 AHT4                                                  18,000                            16,000                                11,000
 HMS7                                                  20,000                            19,000                                15,000
 HTG6                                                  18,000                            21,000                                 9,000
 AHT5                                                  11,000                            17,000                                12,000
 HMS6                                                  15,000                            19,000                                15,000
 ASB23                                                 20,000                            17,000                                19,000
 ASB2                                                  21,000                            22,000                                22,000
 HTG10                                                 21,000                            23,000                                14,000
 HTG7                                                  12,000                            14,000                                16,000
 HMS3                                                  19,000                            19,000                                16,000
 HMS2                                                  24,000                            23,000                                16,000
 ASB17                                                 25,000                            25,000                                12,000
 LEX3                                                  20,000                            21,000                                16,000
 HMS1                                                  11,000                            13,000                                 8,000
 CA425                                                 13,000                            12,000                                13,000
 Na                                                     303                               315                                    234
 Nam                                                   17,824                            18,529                               13,765
             Na : Nombre total d’allèles, Nam : Nombre moyen d’allèles

    Tableau II : Nombre total d’allèles et nombre d’allèles moyen par locus pour les trois races (Barbe (BA), Arabe-Barbe (AB) et Pur-Sang Arabe (AR))
chevalines en Tunisie

 Race                                        Nombre total d’allèles            Nombre d’allèles privés                  % d’allèles privés
 BA                                                      303                                29                                  9,57
 AB                                                      315                                40                                 12,70
 AR                                                      234                                46                                 19,66

    Tableau III : Nombre et pourcentage d’allèles privés identifiés pour les 3 races (Barbe (BA), Arabe-Barbe (AB) et Pur-Sang Arabe (AR)) chevalines
Tunisienne étudiées.

Revue Méd. Vét., 2018, 169, 4-6, 103-109
106                                                                                                OULED AHMED (H.) AND COLLABORATORS

privés (104/115) ont caractérisés par une fréquence allélique                            génétique entre les populations. L’estimation de ces
inférieure à 2%. Par contre, 11 allèles spécifiques ont montré                           paramètres est représentée dans le tableau V.
une fréquence variant entre 2 à 12%, ce sont les allèles :
HTG4-138, ASB23-184, HMS-169 pour la race BA, ASB23-                                        F statistiques
183, HTG7-130 pour la race AB et ASB23-200, ASB2-223,
                                                                                             Le tableau VI présente les valeurs de FST, FIS et FIT calculées
224 et 236, HTG10-118 et HTG7-122 pour la race AR.
                                                                                         entre les différentes races chevalines étudiées. La valeur
    Taux d’hétérozygotie                                                                 minimale de FST(0,029) est enregistrée pour la race AR. La
                                                                                         race BA présente la plus forte valeur de FST(0,041). Les trois
    Les valeurs des taux d’hétérozygoties attendue He et                                 populations présentent des indices de fixation (FIS) positifs
observée Ho sont présentées dans le tableau IV. D’après ce                               plus ou moins élevés compris entre 0, 1527 pour la race AR
tableau, aucune différence significative n’a été trouvée entre                           et 0,2465 pour la race AB, alors que la race Barbe prend une
les taux d’hétérozygoties (He et Ho).                                                    valeur intermédiaire de 0,2241.

VARIABILITÉ GÉNÉTIQUE INTER-POPULATIONS                                                     Distances génétiques

    Paramètres de la diversité génétique de Nei (HT,HS, GST)                                Les distances génétiques calculées entre les 3 races
                                                                                         chevalines sont présentées dans le tableau VII. On constate
   Les paramètres de la diversité génétique [27] ont été                                 que les valeurs de la distance génétique entre les populations
déterminés afin d’étudier la structuration de la diversité                               BA et AB sont très faibles. Ceci indique que ces dernières

         Population                                                              He                                                 Ho
         BA                                                                     0,870                                              0,675
         AB                                                                     0,872                                              0,657
         AR                                                                     0,786                                              0,666
He : hétérozygotie attendue, Ho : hétérozygotie observée

    Tableau IV : Taux d’hétérozygotie pour les 3 races (Barbe (BA), Arabe-Barbe (AB) et Pur-Sang Arabe (AR)) chevalines en Tunisie

                                                                                    Toutes les populations
         Locus                                  HS                               HT                            DST                               GST
         AHT4                                0,7945                             0,8697                       0,0751                             0,0864
         AHT5                                0,8642                             0,8994                       0,0353                             0,0392
         ASB17                               0,8568                             0,8938                       0,0371                             0,0415
         ASB2                                0,8787                             0,9223                       0,0436                             0,0473
         ASB23                               0,8545                             0,9038                       0,0493                             0,0545
         CA425                                0,788                             0,8323                       0,0442                             0,0531
         HMS1                                0,7735                             0,8393                       0,0658                             0,0784
         HMS2                                0,8894                             0,9266                       0,0372                             0,0401
         HMS3                                0,8877                             0,9152                       0,0275                             0,0301
         HMS6                                0,8539                             0,8955                       0,0416                             0,0464
         HMS7                                0,8936                             0,9075                       0,0140                             0,0154
         HTG10                               0,3125                             0,6563                       0,3438                             0,5238
         HTG4                                0,8071                             0,8219                       0,0148                             0,018
         HTG6                                 0,779                             0,8545                       0,0751                             0,0879
         HTG7                                0,7191                             0,7876                       0,0685                             0,087
         LEX3                                0,8787                             0,9081                       0,0294                             0,0324
         VHL20                               0,4292                             0,7127                       0,2835                             0,3978
         Multilocus                          0,7801                             0,8557                       0,0756                             0,0884
HT : diversité totale ; HS : diversité intra-sous-population ;
     DST : diversité entre sous-population ;
     GST : coefficient de différenciation génétique entre les sous population

    Tableau V : Indices de diversité génétiques de Nei M., 1978 [27] estimés pour les 17 microsatellites de trois races chevalines en Tunisie

                                                                                                                        Revue Méd. Vét., 2018, 169, 4-6, 103-109
DIVERSITÉ GÉNÉTIQUES DES RACES CHEVALINES TUNISIENNE                                                                                                     107

sont très proches génétiquement, mais, elles sont éloignées                              AB se distingue par un nombre moyen d’allèles plus élevée.
à la population AR. Cette constatation est confirmée ensuite                             Ces différences de valeurs trouvées entres les races peuvent
par l’analyse factorielle des correspondances.                                           être expliquées soit par le nombre des microsatellites utilisé,
                                                                                         le nombre d’individus analysé dans chaque étude, ou bien
    Analyse factorielle des correspondances (AFC)                                        par des particularités liées à la structuration des populations
                                                                                         équines étudiées.
   Les relations génétiques entre les 3 populations étudiées
à partir d’AFC sont présentées dans la figure 1. On observe                                   L’allèle privé est un indice d’originalité génétique est le
que le nuage de points représentant la population BA est plus                            nombre d’allèles présents dans une population à l’exclusion
proche des nuages de points de la population AB.                                         de toute autre populations, ce qu’on appelle les allèles
                                                                                         « privés ». En utilisant ce paramètre on peut confirmer
                                                                                         l’appartenance ou non d’un individu d’origine inconnue à
                                                                                         une population [19]. Toute les races présentent des allèles
                                                                                         privés avec de pourcentages plus au moins variables. Les
                                                                                         taux d’hétérozygotie observés chez les races BA et AB sont
                                                                                         inférieurs aux taux rapportés par [19]. En utilisant ces mêmes
                                                                                         marqueurs microsatellites, ces derniers auteurs ont trouvé des
                                                                                         taux égales à 0,8 ± 0,03 et 0,8 ± 0,03 allèles, respectivement,
                                                                                         pour la race BA et la race AB. En comparaison avec cette
                                                                                         même étude, les taux d’hétérozygotie attendue obtenus chez
                                                                                         la population BA et AB sont comparables. Toutefois, des
                                                                                         taux relativement inferieurs ont été rapportés précédemment
                                                                                         dans une étude concernant la caractérisation moléculaire de
                                                                                         la race BA (0,046) et AB (0,039) moyennant 13 marqueurs
Figure 1 : Analyse Factorielle des Correspondances (AFC) des données                     microsatellites [18]. Malgré la richesse de la variabilité
    moléculaires pour les 3 populations (Barbe (BA), Arabe-Barbe (AB) et
                                                                                         allélique, l’hétérozygotie attendue est supérieure à celle
    Pur-Sang Arabe (AR)) chevalines en Tunisie
                                                                                         observée. Ceci montre un manque significatif d’hétérozygotes
                                                                                         qui pourrait être une conséquence du type de la gestion de
Discussion                                                                               l’élevage.

    Dans cet article nous avons réalisé une étude de                                         La diversité génétique totale est la somme de la diversité
caractérisation génétique de 3 races de cheveux élevées en                               génétique intra-population et de la diversité génétique inter-
Tunisie par l’utilisation des microsatellites. Tous les loci sont                        population, la valeur Ht obtenue montre que 91,2% de la
polymorphes ce qui prouve l’efficience des microsatellites                               variabilité génétique totale est expliquée par la variation
utilisés dans l’analyse de la diversité génétique des populations                        intra-population et que 8,8 % de cette variabilité est attribuée
étudiées. Pour la race BA, le nombre moyen d’allèles de la race                          aux différences entre les 3 populations.
BA est proche à celui rapporté par [19], mais il est nettement
supérieur à celui observé sur une population de 26 chevaux de                                Les valeurs de Fst trouvées dans notre étude sont
la race Barbe tunisienne [18], de la race Barbe marocaine [1]                            inférieures à ceux rapporté dans une étude portant sur cinq
et également pour la race portugaise Sorraia [24]. Dans notre                            races de cheveux Indiens [3]. Cependant, elles sont très
étude et en comparaison avec les deux autres races, la race                              inferieur par rapport à ceux précédemment trouvées dans les

        Population                                          FST (3)                                   FIS (1)                                  FIT (2)
        BA                                                  0,041                                    0,2241                                   0,2559
        AB                                                  0,037                                    0,2465                                   0,2744
        AR                                                  0,029                                    0,1527                                   0,1773
FIS : différenciation des individus à l’intérieur des populations ;
      FIT : différenciation des individus par rapport au total des populations ; FST : différenciation des populations par rapport au total

    Tableau VI : Les indices de fixation des 3 races (Barbe (BA), Arabe-Barbe (AB) et Pur-Sang Arabe (AR)) chevalines tunisienne étudiées

                                                             BA                                         AB                                     AR
        BA                                                 0,000                                      0,090                                   0,775
        AB                                                                                            0,000                                   0,643
        AR                                                                                                                                    0,000

    Tableau VII : Distances génétiques de Nei (1978) entre les 3 populations (Barbe (BA), Arabe-Barbe (AB) et Pur-Sang Arabe (AR)) chevalines

Revue Méd. Vét., 2018, 169, 4-6, 103-109
108                                                                            OULED AHMED (H.) AND COLLABORATORS

races polonaises ((FST = 10%, [37]), et les races brésiliennes       6. - 	 BJORNSTAD G., GUNBY E., ROED K.H.: Genetic
(FST = 11,7%, [23]), ainsi que les races norvégiennes (FST                   structure of Norwegian horse breeds. J. Anim. Breed.
= 12%, [6]). Nos résultats indiquent, selon [36], une faible                 Genet., 2000, 117, 307–317.
différenciation génétique entre les 3 races chevalines étudiées      7. - 	 BINNS M.M., HOLMES N.G., HOLLIMAN A., SCOTT
qui pourrait être dû à un régime de reproduction fermé ou à                  A.M.: The identification of polymorphic microsatellite
une sous structuration lors de l’échantillonnage. Les résultats              loci in the horse and their use in thoroughbred parentage
d’analyse factorielle des correspondances trouvés dans                       testing. Br. Vet. J., 1995, 151, 9-15.
cette étude sont similaires à ceux rapporté dans des études          8. - 	 BREEN M., LINDGREN G., BINNS M.M., NORMAN
précédentes [1, 18, 33].                                                     J., IRVIN Z., BELL K., SANDBERG K., ELLEGREN
                                                                             H.: Genetical and physical assignments of equine
     En conclusion, il s’avère que l’utilisation d’un ensemble               microsatellites-first integration of anchored markers in
de 17 marqueurs microsatellites est indispensable dans                       horse genome mapping. Mamm. Genome., 1997, 8 , 267-
l’étude de la diversité génétique. Les résultats de la variabilité           273.
génétique de 3 races chevalines tunisienne et les relations          9. - 	 CHAMBERS G.K., MAC AVORY E.S.: Micro satellites,
entre eux fournissent des informations importantes sur leur                  consensus and controversy. Comparative Biochemistry
structuration génétique. Toutefois, l’évaluation de la relation              and Physiology. Anim. Genet., 2000, 126, 455-476.
phylogénétique de ces 3 races révèle un taux d’homozygotie           10. - 	 CIANI E., CIAMPOLINI R., D’ANDREA M.,
et une consanguinité élevée entre la race BA et AB. Donc,                    CASTELLANA E., CECCHI F., INCORONATO C.,
cette étude constitue une alerte pour établir des stratégies                 D’ANGELO F., ALBENZIO M., PILLA F., MATASSINO
de conservation et de gestion durable de races chevalines                    D., CIANCI D.: Analysis of genetic variability
tunisienne afin d’éviter la perte d’hétérozygotie.                           within and among Italian sheep breeds reveals
                                                                             population stratification and suggests the presence of
Remerciements                                                                a phylogeographic gradient. Small. Rumin. Res., 2013,
                                                                             112, 21-27.
    Les auteurs remercient tous l’équipe du laboratoire              11. - 	 COOGLE L., BAILEY E.: Equine dinucleotide repeat
«Gestion de la santé et de la qualité des productions animales,              loci LEX064 through LEX070. Anim. Genet., 1998, 30,
référence LR14 Agr03» de l’Ecole National de Médecine                        66-80
Vétérinaire Sidi Thabet, Tunisie et le Laboratoire d’Analyses        12. - 	 EGGLESSTON-STOTT M.L., VALLE ADBAUTISTA
Génétiques Animales, Institut de la Recherche Vétérinaire de                 M., DILEANIS S., WICTUM E., BOWLING A.T.:
Tunisie qui ont financé la présente recherche, ainsi que tous                Nine equine dinucleotide repeats at microsatellite loci
les personnels de Haras Sidi Thabet.                                         UCDEQ136, UCDEQ405, UCDEQ412, UCDEQ425,
                                                                             UCDEQ437, UCDEQ467, UCDEQ487, UCDEQ502
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DIVERSITÉ GÉNÉTIQUES DES RACES CHEVALINES TUNISIENNE                                                                               109

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Revue Méd. Vét., 2018, 169, 4-6, 103-109
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