CATALOGUE DES COLLECTIONS BIOLOGIQUES - (CERBIM) - V5 CATALOGUE RB JANVIER 2021
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Centre de Ressources Biologiques de la Martinique
(CeRBiM)
Catalogue des collections biologiques
DOC-CERBIM-004/V5– Mise à jour: Janvier 2021
Pour toute demande de renseignements complémentaires : Vous pouvez consulter notre site web à l’adresse suivante :
cerbim@chu-martinique.fr http://www.chu-martinique.fr/recherche.html
0596 55 35 64Sommaire
Collections à promotion interne 3
Pathologies infectieuses et émergentes 4
Arboviroses (Dengue, Zika, Chikungunya…) 5
Infection à HTLV-1(Adult T-cell Leukemia (ATL) 7
Infection aux Papillomavirus et au VIH 9
Infection aux Leptospires 10
Pathologies auto-immunes et inflammatoires 11
Polyarthrite rhumatoïde 12
Sclérose en plaques 13
Neuromyélite optique 13/14
Incidences environnementales 15
Pathologies cardio-métaboliques 18
Maladies génétiques 20
Axes transversaux 22
Périnatalité 23
Cancer de l’endomètre 24
Collections à promotion externe 25
Covid-19 26
Drépanocytose 27
Lupus 28
Myélomes / Lymphomes 29
Sclérose en plaques 30
Infections urinaires à entérobactéries productrices de bêta-
lactamase 31
2
Tumorothèque sanitaire 32
Collaborer avec le CeRBiM 34Collections à
promotion interne
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3
0596 55 35 64Pathologies infectieuses
et
émergentes
Arboviroses
Infection à HTLV-1
Infection aux papillomavirus et à VIH
Leptospirose
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4
0596 55 35 64ARBOVIROSES (1/2)
Infections aux virus Dengue, Zika, Chikungunya
Acronyme de
Objectifs Nature des échantillons
la collection
Etude descriptive et pronostique des ARN
arboviroses endémiques, émergentes dans les Cellules cryoconservées
départements et régions d’Outre-Mer et en Larmes
France métropolitaine menée dans une cohorte Plasma
hospitalière d’enfants et d’adultes suspects Salive
ARBHITA
d’arbovirose aiguë. Sang capillaire
Sang total
Sécrétion pharyngées
Selles
Sérum
Urine
Étude descriptive et pronostique de la fièvre Cellules cryoconservées
dengue aux Antilles françaises et en Guyane Culots secs
CARBO menée dans une cohorte hospitalière d’enfants Plasma
et d’adultes suspects de fièvre dengue. Sérum
Urine
5ARBOVIROSES (2/2)
Infections aux virus Dengue, Zika, Chikungunya
Acronyme de la
Objectifs Nature des échantillons
collection
DENGUE-SEA Préparation à l’utilisation d’un vaccin
Sérum
à venir contre la dengue aux Antilles françaises
6Infections à HTLV-1 (1/2)
Nom de la
Objectifs Nature des échantillons
collection
Estimer l’efficacité et la toxicité d’une
stratégie de traitement en observant la survie
à 3 ans des patients atteints d’ATLL-HR
traités selon une stratégie thérapeutique
reconnue. Cette stratégie est adaptée à l’âge,
Cellules cryoconservées
Collection aux comorbidités et aux sous-groupes
Culots lymphocytaires
ATL cliniques, et comprend Zidovudine-PegINF
Sérum
+/- Chimiothérapie introduisant l’allogreffe
pour les patients éligibles et en réponse
suffisante après les traitements
conventionnels, chez les patients atteints
d’ATLL-HR associé à HTLV1
7Infections à HTLV-1 (2/2)
Nom de la
Objectifs Nature des échantillons
collection
Suivi prospectif de l’introduction de l’allogreffe
Cellules cryoconservées
dans la leucémie/lymphome de l’adulte liée à
ATLFAM Culots lymphocytaires
HTLV-1 (ATLL) de haut risque (HR) Antilles-
Sérum
Guyane.
Suivi prospectif de l’introduction de l’allogreffe ARN lymphocytaire
dans la leucémie/lymphome de l’adulte liée à Cellules cryoconservées
ATL-HR01 HTLV-1 (ATLL) de haut risque (HR) Antilles- Culots lymphocytaires
Guyane. Sérum
Etudier l’association entre les génotypes
CT/TT de rs12979860 combinés à une
ADN
variation de deux des nucléotides de
HAMIL28B Plasma
ss469415590 (TT ou ∆G), et une forme de
Culots lymphocytaires
progression rapide du handicap de la
TSP/HAM.
8Infection aux Papillomavirus et au VIH
Nom de la
Objectifs Nature des échantillons
collection
Epidémiologie des infections à
Acides nucléiques
papillomavirus HPV chez des femmes
HP2V-AG Culots lymphocytaires
infectées par le VIH aux Antilles et en
Prélèvements cervico-vaginaux
Guyane
9Infection aux Leptospires
Acronyme de
Objectifs Nature des échantillons
la collection
Etude de la valeur pronostique de la
leptospirémie quantitative déterminée par
LEPTO Sang total
PCR en temps réel au cours de la
leptospirose aux Antilles.
10Pathologies
auto-immunes
et
inflammatoires
Polyarthrite rhumatoide
Sclérose en plaques
Neuromyélite optique
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11
0596 55 35 64Polyarthrite rhumatoide
Nom de la
Objectifs Nature des échantillons
collection
Etude de l’association entre des sous-types ADN
d’anticorps anti peptide citrullinés (ACPA) et Plasmas
ACPPPA
des atteintes pulmonaires dans la polyarthrite Sang
rhumatoïde aux Antilles. Urine
12Sclérose en plaques, Neuromyélite optique
Nom de la
Objectifs Nature des échantillons
collection
Cohorte caribéenne de patients atteints de Culots lymphocytaires
Sclérose en plaques, de Neuro-optico myélite Culots LCR
OFSEP aiguë de Devic et des syndromes neurologiques Plasma (plasmaphérèse)
apparentés. Sérum
Surnageant LCR
13Neuromyélite optique aïgue de Devic (NOMAD)
Nom de la Nature des
Objectifs
collection échantillons
Constituer une cohorte Caribéenne de patients ADN
atteints de NOMAD, de ses formes débutantes Culots lymphocytaires
ou de syndromes neurologiques apparentés, Culots LCR
névrites optiques atypiques et myélites Plasma
transverses aiguës extensives isolées uniques (plasmaphérèse)
CARNOMAD
ou récidivantes. Cette cohorte permettra d’en Sérum
décrire les caractéristiques cliniques, Surnageant LCR
biologiques et d’imagerie de la maladie dans
son ensemble sur une grande échelle et de
manière prospective.
Cohorte caribéenne de patients atteints de ADN
Sclérose en plaques, de Neuro-optico myélite ARN
TYSABRI
aiguë de Devic et des syndromes neurologiques Culots lymphocytaires
apparentés. Sérum
14Incidences
environnementales
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15
0596 55 35 64Collection populationnelle
Nom de la
Objectifs Nature des échantillons
collection
Santé, nutrition et exposition au chlordécone aux Cheveux
Antilles. Etude populationnelle de consommation Sang total
alimentaire aux Antilles et d’imprégnation par le Sérum
KANNARI
chlordécone. Sérum Vitamine D
Collection promue par l’ARS Sérum Vitamine D témoin
Urine
16Etudes ancillaires à venir
Acronyme
Nature des
de la Objectifs
échantillons
collection
Etudes ancillaires sur le dosage ultérieur des polluants
HELICO Plasma
environnementaux
M-Q ADN
Etudes promues par le Registre des Cancers
17Pathologies
cardio-métaboliques
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18
0596 55 35 64Amylose Cardiaque
Nom de la Nature des
Objectifs
collection échantillons
Dépistage échographique précoce des
Plasma
TEAM Red cardiopathies amyloïdes : intérêts de la prise en
Sang total
Flags compte des signaux d’alerte cliniques et para-
ADN
cliniques.
19Maladies génétiques
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20
0596 55 35 64Anomalies de l’hémostase
Nom de la
Objectifs
collection
Hémophilies et Développer des thématiques de recherches avec l’appui
autres déficits des centres de référence: thérapies ciblées…..
Maladie de Von Développer des thématiques de recherches avec l’appui
Willebrand des centres de référence: thérapies ciblées…..
Collections réservées
21Axes transversaux
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22
0596 55 35 64Périnatalité
Nom de la Nature des
Objectifs
collection échantillons
Identifier les anomalies provenant d’interruptions
spontanées ou médicales de grossesse, ainsi que des
grossesses pathologiques.
Périnatalité Ce diagnostic prénatal dans ce domaine répond aux Tissu
besoins du Centre Pluridisciplinaire de Diagnostic
Prénatal - Maison de la Femme de la Mère et de
l'Enfant - CHU MARTINIQUE
23Cancer de l’endomètre
Acronyme
Nature des
de la Objectifs
échantillons
collection
Identifier les mutations actionnables grâce à la Couche leuco-
cartographie par séquençage des nouvelles plaquettaire
générations des carcinomes de l’endomètre de type Culot cellulaire
ENDO-NGS
2 des patientes martiniquaises. Plasma
Tissu
ADN
24Collections à
promotion externe
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25
0596 55 35 64COVID-19 (1/2) Covid-19 fait référence à « Coronavirus Disease 2019 », la maladie provoquée par un virus de la famille des Coronaviridae, le SARS-CoV-2. Cette maladie infectieuse est une zoonose, dont l'origine est encore débattue, qui a émergé en décembre 2019 dans la ville de Wuhan, dans la province du Hubei en Chine. Elle s'est rapidement propagée, d'abord dans toute la Chine, puis à l'étranger provoquant une épidémie mondiale. Le Covid-19 est une maladie respiratoire pouvant être mortelle chez les patients fragilisés par l'âge ou une autre maladie chronique. Elle se transmet par contact rapproché avec des personnes infectées. Source Internet Collection DISCOVERY promue par l’INSERM : Etude multicentrique, randomisée, adaptative, de l’efficacité et de la sécurité des traitements des patients adultes hospitalisés pour une infection COVID-19. Collection FRENCH COVID-19 promue par l’INSERM : collecte de données cliniques standardisées de patients hospitalisés en raison d'une infection par le SARS-CoV-2 afin d’améliorer les connaissances scientifiques et médicales et ainsi les soins aux patients Collection EPICOV promue par l’INSERM : projet CERSECO, qui constitue une réponse à visée de recherche et de surveillance de l’infection par SARS-CoV2, de sa dynamique de diffusion en population générale, des facteurs de risque et des effets sociaux des mesures de confinement et des mesures de prévention 26 prises pour limiter sa diffusion : dimensions spatiales, temporelles, sociodémographiques et familiales de l’épidémie
Drépanocytose
SIKAMIC
Etude multicentrique randomisée contrôlée en double aveugle versus
placebo, visant à évaluer l’effet sur l’albumine de 12 mois de traitement
par hydroxycarbamide (Siklos®) ou placebo chez des patients adultes
atteints de drépanocytose.
Objectif : améliorer les connaissances sur les marqueurs de la
pathologie rénale dans la drépanocytose en constituant une biobanque
pour le dosage de tout nouveau bio marqueur potentiel.
Les analyses précises (non-génétiques) qui seront effectuées sur les
échantillons collectés dépendront des progrès réalisés dans
l'identification des mécanismes et des bio marqueurs de la pathologie
rénale dans la drépanocytose.
Collection promue par ADDMEDICA SA
27Lupus
REGENCY
Cette étude de phase III multicentrique, randomisée, en double aveugle
évaluera l’efficacité, la tolérance et la pharmacocinétique de l’obinutuzumab
par rapport à un placebo chez des patients atteints de néphropathie lupique
de classe III ou IV de la Société Internationale de Néphrologie/ Société de
Pathologie Rénale lorsqu’il est ajouté à une thérapie standard à base de
mycophénolate mofétil (MMF) et de corticostéroïdes.
Collection promue par le laboratoire Roche
28Myélomes / Lymphomes
MYELODOM
Evaluer le rôle de l’exposition environnementale et professionnelle aux
pesticides. Etude pilote cas-témoins en Guadeloupe et Martinique.
Patients témoins (sains) et patients atteints de myélome ou lymphome
Collection promue par le CHU de la Guadeloupe
29Sclérose en plaques
OFSEP-HD
Aucune étude n’a encore évalué l’impact de la sclérose en plaques (SEP) sur
les dimensions multimodales du handicap ou élaboré des modèles pronostiques
capables de classer les patients en fonction de leur risque de progression à
chaque événement clinique d’intérêt (landmarks) au début ou au cours de la
maladie.
Ainsi, tirant parti de l’effort effectif de standardisation et de structuration réalisé
dans le cadre de la cohorte mère de l’OFSEP depuis 2011, il est proposé de
définir une nouvelle cohorte ancillaire haute définition (HD) de patients atteints
de SEP pour répondre à cette question difficile. Cette cohorte peut être décrite
comme une cohorte permettant de collecter de façon plus complète, les
déterminants potentiels des caractéristiques observées et interventionnelles de
la maladie, afin de déterminer les facteurs pronostiques de l’évolution de la
maladie dans la vie réelle. Cette cohorte portera sur un sous-groupe de patients
bien définis au sein du réseau OFSEP, issus de centres sélectionnés.
Collection promue par l’OFSEP (Observatoire Français de la Sclérose En Plaques)
30Infections urinaires à Entérobactéries
productrices de bêta-lactamase
TEMO-CARB:
Evaluer l’efficacité de la Témocilline versus les carbapenèmes dans le
traitement des infections urinaires à entérobactéries productrices de bêta-
lactamase à spectre étendu, étude de non-infériorité
Collection promue par l’AP-HP (Assiastance Publique – Hôpitaux de Paris)
31Tumorothèque
sanitaire
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32
0596 55 35 64Tumorothèque Sanitaire
La mission dite sanitaire des tumorothèques est inscrite au sein du dispositif d’autorisation des
établissements de santé pour le traitement du cancer. A ce titre, la cryopréservation doit être garantie
dans le cas où elle s’avère être un pré-requis à la réalisation des examens moléculaires permettant
d’améliorer la prise en charge diagnostique et thérapeutique des patients. En parallèle, la mission
scientifique relève d’une démarche stratégique visant à préserver des échantillons biologiques
destinés à des programmes de recherche en cancérologie.
InCa
Nom de la
Objectifs nature
collection
Prélèvements qui doivent être conservés en raison d’un intérêt tissu
Sanitaire
diagnostique et/ou pronostique, voire de choix thérapeutiques
ANAPATH
selon les recommandations de l’Institut National du Cancer
Leucémie
Lymphoïde
Prélèvements qui doivent être conservés en raison d’un intérêt tissu
chronique, diagnostique et/ou pronostique, voire de choix thérapeutiques
Lymphome B,
Lymphome du selon les recommandations de l’Institut National du Cancer
Manteau,
Lymphome de
Hodgkin,
Lymphome T,….
33Collaborer avec le
CeRBiM
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34
0596 55 35 64Prestations
Réception
Tous prélèvements et fluides biologiques humains
Préparation
Préparation de Cellules, Plasma, Sérum….
Traitement des Tissus (sains et tumoraux)
Extraction ADN, ARN
A la demande, des prestations peuvent être mises en place
Conservation à
Température ambiante
+ 4°C
- 20°C
- 80°C
- 150°C
35Formulaires en ligne
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0596 55 35 64
Demande de faisabilité d’un projet
Formulaire de demande de constitution ou
de prise en charge d’une collection
Formulaire de mise à disposition d’une
collection
36Collaborateurs du CeRBiM CHU de Martinique ARS de la Martinique (France) Karubiotec (CRB de la Guadeloupe, France) CNRS de Montpellier (France) INSERM (France) Université des Antilles (France) Mayo clinic (Etats-Unis) AMREC Réseaux Club 3 CR GIRCI SOHO Biobanques Groupe CRB de la CRI 37
Publications
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0596 55 35 64
2007-2013 Maladies infectieuses et tropicales dans la Caraïbe
2012 Thèse : Epidémiologie, phénotype et traitement des affections inflammatoires
démyelinisantes primitives du système nerveux central aux Antilles francaises, CABRE,
CHUM
2014 Maladies infectieuses et tropicales dans la caraïbe
2014 CABIE, Journées Nationales Infectiologie
2016 Epidemiology of aquaporin-4 autoimmunity and neuromyelitis optica spectrum,
Flanagan et al, Annals of Neurology
2018 Préambule du mémoire Etude Génétique de l'Hémophilie A en Martinique, DUBOIS
Marie-Daniéla CRC MHC
2020 Etude KANNARI sur la santé
2020 CHUM Bulletin d'information coronavirus n26
2020 Prevalence of chronic chikungunya and associated risks factors in the French West
Indies (La Martinique): A prospective cohort, Bertolotti et al, PLoS Neglected Tropical
Diseases
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