COVID 19 INSERM U 1142 - LIMICS - JF Gehanno Service de médecine du travail & Centre de ressource de pathologie professionnelle, CHU de Rouen - SMSTN

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COVID 19

                    JF Gehanno
Service de médecine du travail & Centre de ressource
    de pathologie professionnelle, CHU de Rouen
              INSERM U 1142 - LIMICS

                                             JF Gehanno - 9 décembre 2020 - 1
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LE VIRUS

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LA MALADIE

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Incubation

• 2-14 j
• Médiane 5j, 97,5% < 11,5j (Wiersinga, JAMA 2020)

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Wiersinga, JAMA 2020   JF Gehanno - 9 décembre 2020 - 9
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Wiersinga, JAMA 2020   JF Gehanno - 9 décembre 2020 - 10
Effect of SARS-CoV-2 infection on organs in different parts of the body. (Clockwise) Virus enters through the olfactory bulb causing an
       inflammatory response leading to a cytokine storm. This may cause anosmia and encephalitis. Upon entry into the eyes, the virus can spread
       through tear and mediate spreading via nasolacrimal system to other organs of the body and may cause conjunctivitis in the eyes. Entry of
       virus into the heart through the blood, can cause the formation of a necrotic lipid. When the lipid ruptures it can cause blood clots leading to
       myocardial infraction. In the kidney, the virus enters the proximal tubules and podocytes via the ACE2 receptors. After entry, it causes
       deposition of extracellular matrix causing fibrosis, diuresis and proliferation of kidney cells leading to acute kidney injury. In the liver, the virus
       activates kupffer cells mediating an inflammatory response. This causes activation of the hepatic skellate cells and hepatocytes resulting in
       roptosis and fibrosis derived injury. In the lungs, the virus causes damage to the walls of the alveolar cells, this results in the formation of
       debris. The debris accumulated in the walls of the alveolar cells causing thickening and results in lung distress and damage. This causes
       shortness of breath the commonly displayed symptom in COVID-19

Balachandar, Science of the Total Environment 729 (2020) 139021                                                            JF Gehanno - 9 décembre 2020 - 11
Anosmie / Agueusie

   • Fréquente : 64-80% des patients (Wiersinga, JAMA 2020)
       • Nombreux récepteurs ACE2 dans la muqueuse nasale
   • Principalement olfactive (peu atteinte sens
     sucré/salé/acide/amer)
   • Durée : +/- 2 semaines mais parfois plus long
   • Pas d’imagerie sauf si atteinte sinusienne suspectée
   • Traitement : sentir rose, citron, eucalyptus 20s chacun
       • 2x/j pendant 3 mois
   • Attention :
       • Détecteurs de fumée
       • Dates de péremption aliments
       • Seuil de détection olfactif des polluants professionnels

Whitcroft, JAMA 2020
                                                               JF Gehanno - 9 décembre 2020 - 12
Asymptomatiques

• 20-50%
• 50% des transmissions seraient liées à des sujets
  asymptomatiques (ou non encore symptomatiques)
   • Début de l’excrétion virale 48-72h avant symptômes

                                                          JF Gehanno - 9 décembre 2020 - 13
Pronostic

•   formes bénignes : 81%
•   Formes sévères : 14%
•   Formes très sévères : 5%
•   Mortalité de 2,3% (grippe= 0,3%)
•   Mortalité liée à l‘age
•   Enfants : syndrome proche du Kawasaki
    • 2/100 000 chez les moins de 21 ans

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Séquelles – COVID long

• Complications (dans les premières semaines)

• Rechute ?
   • Intervalle libre parfois
   • à plusieurs mois

• Séquelles

• COVID long (plus de 3 mois ?)

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Fréquence

• Etude LIFEN (non publiée), France
    • 1841 patients non passés en réanimation
    • 44% avaient encore des symptômes à 5 mois
         • >= 2 symptômes pour 80% d’entre eux
    • Impact important dans 15% des cas

• Etude Italienne : 179 patients suivis à 2 mois (Carfi, JAMA 9 July 2020)
    • 87% ont encore au moins 1 symptôme

• Troubles de type dysautonomiques ?

• Facteurs prédictifs ?

                                                             JF Gehanno - 9 décembre 2020 - 16
Symptômes pendant / après

Italie (Carfi, JAMA 9 July 2020)      France (Salmon, J Inf dec 2020)

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Séquelles neurologique

•   Fréquence des symptômes à distance (Salmon, 2020)
•   Troubles sensitifs
•   Céphalées
•   Troubles de la concentration, neuro-cognitifs
    • Bradypsychies, trouble de l’attention
    • Troubles de la mémoire immédiate
    • Troubles de la concentration
• Variation thermique
• Examens complémentaires
    • IRM cérébrales parfois perturbées
        • Peu contributif
    • EMG normaux

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Séquelles cardiaque

• Atteinte aigüe (myocardites, troubles du rythme..)
     • 3 mois de repos si myocardite + holter ECG et FEVG
• Etude autopsique 39 cas (Linder, JAMA Cardiology 2020)
     • Décès par pneumonie (90%)
     • Virus présent dans le cœur : 62%
     • Atteinte inflammatoire
• Etude sur 100 patients guéris (Puntmann, JAMA Cardiology 2020)
     •   À 71j du diagnostique
     •   78% avec atteinte à l’IRM
     •   76% élévation de la troponine
     •   22% atteinte péricardique
• Sensations d’oppression thoracique
• Syndrome d’hyperventilation
• Myocardites

                                                                   JF Gehanno - 9 décembre 2020 - 19
Séquelles respiratoires

• Etude à Bichat sur 50 patients avec atteinte respiratoire sans SDRA
  (Frija-Masson, ERJ 2020)
     • 50% d’anomalies aux tests à 30j
           • syndrome restrictif et/ou diminution de la diffusion.
     • 26% baisse du TLCO
     • Aucune corrélation retrouvée avec l’atteinte initiale
• Lésions de fibrose persistante (Yu et al ; Korean Journal of Radiology 2020)
     • Rare dans la cohorte d’Amiens (Andréjack, personnal communication)
• Images en verre dépoli :
     • 50% des patients post réanimation à 3 mois dans cohorte d’Amiens
• Persistance des lésions à 3 mois mais amélioration à 6 mois
• Intérêt de la réhabilitation respiratoire précoce dans le post-covid
  (Liu et al, Complementary therapies in clinical practice 2020)
• Guide de la SPLF (Andréjak et al, Rev Mal Respir 2020)

                                                                            JF Gehanno - 9 décembre 2020 - 20
Physiopathologie

   • Persistance virale
        • On retrouve de l’ARN viral dans la muqueuse olfactive à distance (De
          Melo, 2020)

   • Réponse immune inadaptée sur terrain génétique particulier
        • Femmes > hommes, fréquence élevée des allergiques / autoimmunes
   • Syndrome de fatigue chronique
        • 27% des patients après le SARS (Lam, Arch Int Med 2015)
   • Troubles psychosomatiques ou somatoformes
        • Stress post traumatique
        • Apport du soutient psychologique
   • Réinfection ?

Source : D Salmon
                                                                    JF Gehanno - 9 décembre 2020 - 21
Séquelles psychiatriques

• Etudes discordantes chez les survivants
  (https://doi.org/10.1101/2020.05.19.20103788)
     •   anxiété (13,0-94,4%),
     •   dépression (11,0-50,5%),
     •   syndrome de stress post traumatique (1,2- 96,2%)
     •   morbidité psychiatrique (49,1-90,3%).
• Pas d’augmentation des suicides … pour l’instant
     • Impact du confinement
• Fatigue chronique ++ (https://doi.org/10.1101/2020.05.08.20031666)
• Impact chez les soignants
     • Pas forcément de première ligne
• Impact du télétravail

                                                                       JF Gehanno - 9 décembre 2020 - 22
JF Gehanno - 9 décembre 2020 - 23
Un enjeux fort

• Associations de patients

• Désinsertion professionnelle à craindre
   • Rechute induite par la reprise du travail

• Pas de recommandation harmonisée de prise en charge

• Saisine de la HAS (réponse rapide attendue)

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Personnes à risque

                     JF Gehanno - 9 décembre 2020 - 25
Mortalité : impact de l’âge

Clift, BMJ 2020
                                         JF Gehanno - 9 décembre 2020 - 26
Impact de l’âge

Verity et al. Lancet Infect Dis 2020

                                                         JF Gehanno - 9 décembre 2020 - 27
Facteurs de risque

• L’âge ++ (augmentation exponentielle après 50 ans)
• l’obésité (IMC >30 ), particulièrement chez les plus jeunes,
• la BPCO et l’insuffisance respiratoire,
• l’hypertension artérielle compliquée,
• l’insuffisance cardiaque,
• le diabète (de type 1 et de type 2),
• l’insuffisance rénale chronique,
• les cancers et maladies hématologiques malignes actifs et de moins
  de 3 ans,
• le fait d’avoir une transplantation d’organe solide ou de cellules
  souches hématopoïétiques,
• la trisomie 21
• Les immunodépressions (maladie, corticoïdes,
  immunosuppresseurs)

                                                     JF Gehanno - 9 décembre 2020 - 28
Fréquence des facteurs de risques

HAS 27/11/20
                                        JF Gehanno - 9 décembre 2020 - 29
Reco SFMT 6/4/20 : immunodépression

                         JF Gehanno - 9 décembre 2020 - 30
Immunomodulateurs : tableau 1
                        classe                            DCI et noms commerciaux                              Exemples
                                                                                                            d’indications
            interferon Beta                AVONEX®, PLEGRIDY®, REBIF®, BETAFERON®, EXTAVIA®               SEP
            acetate de glatiramer          COPAXONE®, GLATIRAMER MYLAN®                                   SEP
            anti-TNF                       infliximab (RÉMICADE® et biosimilaires), étanercept            RI ; MICI ; Pso ;
                                           (ENBREL® et biosimilaires), adalimumab (HUMIRA® et             uvéites
                                           biosimilaires), golimumab (SIMPONI®), certolizumab
                                           (CIMZIA®), ...
            anti-IL1                       anakinra (KINERET ®), canakinumab (ILARIS®)                    RI ; maladie
                                                                                                          périodique
            anti-R.IL6                     tocilizumab (ROACTEMRA®), sarilumab (KEVZARA®)                 RI
            anti-IL17                      secukinumab (COSENTYX®), ixékizumab (TALTZ®),                  RI ; Pso
                                           BRODALUMAB (KYNTHEUM®)
            anti-IL23                      ustékinumab (STELARA®), guselkumab (TREMFYA®),                 MICI ; RI ; PSO
                                           rizankizumab (SKYRIZI®)
            CTLA4 -IG                      abatacept (ORENCIA®)                                           RI
            anti-JAK kinases               tofacitinib (XELJANZ®), baricitinib (OLUMIANT®)                RI ; MICI
            Anti-PDE4                      apremilast (OTEZLA®)                                           RI ; PSO
            Leflunomide                    léflunomide (ARAVA®)                                           RI
            Méthotrexate                   Par exemple : I-MET®, METOJECT®, NORDIMET®                     RI, Pso, MICI
            (dose ≤25mg/sem)

RI : Rhumatismes Inflammatoires (polyarthrite rhumatoïde, spondylarthrite ankylosante, rhumatisme psoriasique) ; Pso : psoriasis ;
SEP : sclérose en plaques (et autres pathologies demyélinisantes) ; autres MAI (lupus, granulomatoses avec polyangéite et polyangéite
microscopique, ...) ; MICI (maladies inflammatoires chroniques de l’intestin : maladie de Crohn et rectocolite hémorragique)

                                                                                                       JF Gehanno - 9 décembre 2020 - 31
Immunosupresseurs : tableau 2
A. Biothérapies à effet immuno-suppresseur (exemples)
                 classe                       DCI et noms commerciaux               Exemples d’indications
Anti-CD20 (Lc B)                       rituximab (MABTHERA®, RITUXAN® et        RI ; autres MAI (et
                                       biosimilaires)                           hémopathies lymphoïdes)
                                       Ocrelizumab (OCREVUS®)                   SEP
Agents immunosuppresseurs sélectifs natalizumab (TYSABRI®)                      SEP
                                       fingolimod (GILENYA®)                    SEP
                                       alemtuzumab (LEMTRADA®),                 SEP
B. Autre thérapeutique potentiellement immunosuppressive
                                       teriflunomide (AUBAGIO®)                 SEP
C. Pour mémoire, autres thérapeutiques immunosuppressives (dont certaines susceptibles d’être prescrites
au décours de ces mêmes pathologies). DCI et exemples de noms commerciaux

Azathioprine et 6 mercaptopurine (IMUREL®, PURINETHOL®), mycophénolate mofétil (CELLCEPT®),
cyclophosphamide (ENDOXAN®), mitoxantrone (ELSEP®), dimethylfumarate (TECFIDERA®)*, tacrolimus
(TACROLIMUS®), ciclosporine (Néoral®)

La corticothérapie générale prescrite à 10 mg/jour ou plus de façon prolongée (> 2 semaines) est considérée
comme ayant un effet immunodépresseur ; il en est de même des bolus de corticoïdes dans les 10 jours
suivants.

* molécule ayant été associée à des lymphopénies et infections opportunistes

                                                                                      JF Gehanno - 9 décembre 2020 - 32
Asthme (Asthma Control Test)
Au cours des 4 dernières semaines,         Tout le temps    La plupart     Quelques         Rarement          Jamais
votre asthme vous a-t-il empêché(e) de                      du temps         fois
pratiquer vos activités au travail, à
l’école/université ou chez vous?                 1              2
                                                                                 3               4              5
Au cours des 4 dernières semaines,         Plus d’1 fois    1 fois par    3 à 6 fois par    1 ou 2 fois       Jamais
avez-vous été essoufflé(e) ?                 par jour          jour         semaine        par semaine

                                                1                2             3                4               5
Au cours des 4 dernières semaines, les      4 nuits ou      2 à 3 nuits    1 nuit par      Juste 1 ou 2       Jamais
symptômes de l’asthme (sifflements           plus par           par         semaine            fois
dans la poitrine, toux, essoufflement,       semaine         semaine
oppression ou douleur dans la poitrine)
vous ont-ils réveillé(e) la nuit ou plus         1              2               3               4                5
tôt que d’habitude le matin?
Au cours des 4 dernières semaines,         3 fois ou plus   1 ou 2 fois    2 ou 3 fois      1 fois ou         Jamais
combien de fois avez-vous utilisé votre       par jour       par jour     par semaine       moins par
inhalateur/aérosol-doseur de secours ?                                                      semaine
                                                1                2             3                4                5
Comment évalueriez-vous votre              Pas maîtrisé      Très peu       Un peu            Bien          Totalement
maîtrise de l’asthme au cours des 4          du tout         maîtrisé       maîtrisé        Maîtrisé         maîtrisé
dernières semaines ?
                                                 1              2               3               4                5

                 Score ACT < 20 à critère conduisant à éviter l’exposition

                                                                                           JF Gehanno - 9 décembre 2020 - 33
Reco SFMT                                                              Professionnels exerçant en milieu de soins et
                                                                       travailleurs assimilés, présentant un asthme

                                                                                        Score ACT < 20
               NON à tous les items                                                                                        Respect possible des
                Mais pas de respect                                                                     OU                      mesures de
              possible des mesures de                                                                                      protection adéquates
               protection adéquates                                                     Asthme justifiant
                                                                                         une association
                                                                                            CSI/ LABA
                                                                                        dépassant la dose
                                                                                       quotidienne de CSI
                                                                                       (tableau n°1) ou au
                                                                                           moins trois
                                                                                          médicaments

                                                                                                        OU

                                                                                         Traitement
                                                OUI                                     corticoïde oral                NON
                                                                                             et/ou
                                                                                         biothérapie

                                                                                                        OU

                                                                                         Antécédent
                                                                                       d’intubation ou
                                                                                         de séjour en
                                                                                        soins intensifs
                  Eviter affectation dans les                                            pour asthme                        Activités de soins possibles,
                   secteurs à haute densité                                                (< 5 ans)
                virale, services dédiés aux cas                                                                             avec les mêmes précautions
                 graves de COVID, ou aux cas                                                                                 que les autres travailleurs
                                                                                                        OU                  (mesures barrières, port de
                     non graves mais avec
                  réalisation de procédures                                                                                 masque adapté selon secteur
                                                                                       Exacerbation de                              d’affectation)
                          exposantes                                                     l’asthme de
ACT: asthma control test www.asthmacontroltest.com;                                    moins de 6 mois
CSI: cortico-stéroïde inhalé; LABA: Beta2mimétique de longue durée d’action
                                                                                                                       JF Gehanno - 9 décembre 2020 - 34
Grossesse

  •   Femmes enceinte plus souvent hospitalisées en réanimation
  •   Impact des comorbidité (diabète, obésité)
  •   Accouchement prématuré : OR=3,03, (IC95% 1,16-7,85)
  •   Risque de foetopathie : non décrit
  •   Transmission verticale : risque très faible
       • Contact peau à peau & allaitement possibles
  • Donc
       • Risque au 3eme trimestre
       • Au 1er et 2eme trimestre si comorbidités

Avis HCSP 6 oct 2020
                                                       JF Gehanno - 9 décembre 2020 - 35
LES TESTS

            JF Gehanno - 9 décembre 2020 - 36
Approche clinique

• Aucun élément pathognomonique
• Anosmie + agueusie sans ATCD ORL (Tattevin, Lancer Inf Dis 2020):
    • Sensibilité 42%
    • Spécificité 95%
• Scanner :
    • 86% des patients avec anomalies (Guan, NEJM 2020;382;18)
         • Mais 15% sans !

                                                                 JF Gehanno - 9 décembre 2020 - 37
Cinétique des marqueurs virologiques au cours de l’infection à SARS-CoV-2

Sethuraman N, Jeremiah SS, Ryo A. Interpreting Diagnostic Tests for SARS-CoV-2. JAMA. 9 juin 2020;323(22):2249-51.

                                                                                                      JF Gehanno - 9 décembre 2020 - 38
Avis HAS 18 juin 2020

                   JF Gehanno - 9 décembre 2020 - 39
Apport sérologie

Avis HAS 1er mai 2020
                                           JF Gehanno - 9 décembre 2020 - 40
Tests rapides

• Tests sur prélèvement nasopharyngé
   •   Performances disparates (étude APHP sur 6 tests antigénique)
   •   Bonne spécificité
   •   NG biotech : Se 38,9% pour RT-PCR avec Ct < 33
   •   Abbott, Biosynex : Se proche de 60%
        • 87-96% pour RT-PCR avec Ct< 25
        • Bonne détection des plus contagieux

• Tests salivaires intégrés (EasyCov) (HAS 28/11/20)
   •   Technique RT-LAMP
   •   Peu de données chez asymptomatiques
   •   Symptomatiques : Se 84%, Sp 92% (8% de faux positifs)
   •   Confirmer un test + par RT-PCR sur prélèvement salivaire

                                                           JF Gehanno - 9 décembre 2020 - 41
Immunité

  • Réponse humorale : pic IgG et IgA à J14 (plus tard si peu
    symptomatique)
       • 6% des patients ne développent pas d’Ac neutralisant
       • Décroit rapidement
       • Vaccin MERS-CoV : diminution de 90% des Ac neutralisants à 1 an
  • Réponse immune cellulaire
       • Retrouvée même en l’absence de réponse humorale
       • Réactivité croisée avec d’autres coronavirus décrite
       • Réponse Th17 délétère
  • Rôle parfois délétère : ADE (antibody dependant
    enhancement)
       • Augmentation de l’infection des macrophages
  • Mutation D614G : plus transmissible mais plus sensible aux Ac
    neutralisants in vivo ?

HAS, 25 nov 2020
                                                                JF Gehanno - 9 décembre 2020 - 42
Réinfections

   • Décrites avec d’autres coronavirus
   • < 10 réinfections clairement documentées avec SARS-CoV-2
   • Virus différents lors des deux épisodes infectieux
       • Un portage prolongé n’est pas une réinfection
       • PCR négatives par intermittence
   • Sujets plutôt jeunes non immunodéprimés.
   • Raisons ?
       • absence de réponse adaptative initiale ?
       • perte de la protection immunitaire comme c’est le cas avec les
         coronavirus banals ?
       • sélection de variants viraux résistants à cette réponse ?

HAS, 25 nov 2020; ECDC 21/9/20
                                                              JF Gehanno - 9 décembre 2020 - 43
LA TRANSMISSION

                  JF Gehanno - 9 décembre 2020 - 44
Durée de contagiosité

• Charge virale asymptomatiques parfois élevée (Lee, JAMA aout 2020)
• Détection du virus par RT-PCR : J-3 à J+6
    • Jusqu’à 6 semaines après symptômes
• Virus viable ?
    • Etude sur 379 patients (Jaafar, Clin. Infect. Dis. Off. Publ. Infect. Dis. Soc. Am., sept. 2020)
          • 87,6% la première semaine
          • 9,6% la 2eme semaine
          • 2,8% la 3eme semaine
    • -> 10j si forme modérée et 20j si forme grave (avis HCSP)
          • Impact de la Ct

                                                                                       JF Gehanno - 9 décembre 2020 - 45
Probabilité d’isoler le virus en culture cellulaire par modélisation à partir de 3
études (N= 1 048 échantillons). Les zones colorées représentent les valeurs de
IC95 (Walsh et al. J Infect, oct. 2020)

                                                                   JF Gehanno - 9 décembre 2020 - 46
JF Gehanno - 9 décembre 2020 - 47
Caractérisation des émissions

• Mesures expérimentales peu nombreuses & anciennes
   • Duguid, 1946; Loudon & Roberts, 1967
• Génération possible d’aérosols viraux par des personnes
  infectées
   • Eternuement : 106 particules de 0,5 à 16 µm (Gerone, 1966 ; Tang,
      2006)

   • Toux : 103 à 104 particules (0,5 ->30 µm)
   • Parler pendant 5 mn : 3000 particules
   • Respiration simple 10 à 104 particules /l d’air expiré (Fabian et
      al., 2008)

      • forte disparité selon les individus (Edwards et al., 2004)
      • diamètre < 1 µm (Fabian et al., 2008 ; Morawska et al., 2008)

                                                      JF Gehanno - 9 décembre 2020 - 48
Travaux de Wells, 1934

• Calcul du taux d’évaporation d’une gouttelette en fonction de
   • la taille
   • la distance

• Gouttelette > 100 µm sédimente
   • Droplet

• Gouttelette < 100 µm s’évapore complètement avant 1 m
   • reste en suspension
   • « Droplet nuclei »

                                                 JF Gehanno - 9 décembre 2020 - 49
Transmission gouttelettes ?

               1m

                              JF Gehanno - 9 décembre 2020 - 50
Travaux de Xie

  • Définition d’une « grosse » gouttelette selon l’hygrométrie
       •   0%          : 125 µm
       •   50%         : 100 µm
       •   70%         : 85 µm
       •   90%         : 60 µm
  • Distance parcourue par une « droplet »
       • Eternuement (vélocité 50 m/s) :      6m
       • Toux (vélocité 10 m/s) :             2m
       • Parole (vélocité 1 m/s) :            1m

  • Plus de notion de 1 ou 2 m.
       • Entrée dans la chambre en milieu hospitalier

Xie, Indoor Air 2007

                                                        JF Gehanno - 9 décembre 2020 - 51
Comportement des particules liquidiennes

                               JF Gehanno - 9 décembre 2020 - 52
• https://www.youtube.com/watch?v=9Mkb4TMT_Cc

• https://www.tu.berlin/en/research/themenportal-
  forschen/2020/mai/the-risk-of-infection-is-in-the-air/

• https://www.nejm.org/doi/full/10.1056/nejmc2007800

                                                  JF Gehanno - 9 décembre 2020 - 53
Figure: Size Distribution of Exhaled Microdroplets and Resulting Viral Emissions During Regular Breathing. Left
          panel: The typical exhaled microdroplet concentration used as input for the simulation. Right panel: The
       modeled viral emission per breath for typical (orange), high, and low (whiskers) emitters. dN/dlogDp/cm3 is the
                               number concentration normalized by the aerosol size-bin width.

https://scoeh.ch/en/only-few-emit-sufficient-virus-to-be-infectious-via-aerosols-but-this-is-still-bad-news/

                                                                                                           JF Gehanno - 9 décembre 2020 - 54
Transmission aérosol du SARS-CoV-2 ?

• Très débattue dans la littérature
• Eléments :
   •   Respirer émet de fines particules
   •   Les particules contiennent du virus
   •   Les fines particules restent en suspension dans l’air
   •   Elles disséminent à distance
   •   Mais importance de cette voie de transmission pour le SARS-CoV-2 ?
• Conséquences
   • La distanciation physique n’est pas un palliatif au masque en intérieur
   • Proposer un masque FFP2 systématique au contact d’un patient
        • Pas uniquement si gestes générant des aérosols
        • Position de la SFMT : principe de précaution
        • Refusé par les hyginénistes : rapport bénéfice / risque

                                                                    JF Gehanno - 9 décembre 2020 - 55
Liu Y et al., Stability of SARS-CoV-2 on environmental surfaces and in human excreta, Journal of Hospital Infection, https://doi.org/10.1016/j.jhin.2020.10.021

                                                                                                                                  JF Gehanno - 9 décembre 2020 - 56
Professionnels à risque

                      JF Gehanno - 9 décembre 2020 - 57
Risques extra-professionnels

• Contact familial : méta-analyse (Lei, J Infect. 2020 Aug 25)
   • Taux d’attaque dans les foyers de 60 ans : 62%
   • Adultes 4 fois plus susceptibles d’être atteint de la Covid-19 que les
     enfant (OR = 3,67, IC 95% : 2,76-4,87, p < 0,001 )

• Restaurant : étude cas-témoins (Fisher, MMWR 2020)
   • Risque en cas de fréquentation dans les 2 sem précédentes
   • Restaurant : OR = 2,8 (IC à 95% = 1,9–4,3)
   • Bar/café : OR = 3,9 (IC à 95% = 1,5 à 10,1)

                                                            JF Gehanno - 9 décembre 2020 - 58
Risques chez les soignants

• Contact
   • Familial (extérieure)
   • Collègues
• Prise en charge de patients
   • Secteurs non-Covid (diagnostic)
• Facteurs de risque
   • Gestes à risque d’aérosolisation
   • Masques inappropriés ou mal-portés
   • Temps de contact / soins rapprochés ?
• Facteurs protecteurs
   • Mesures barrières
   • Formation /information et suivi

                                             JF Gehanno - 9 décembre 2020 - 59
Facteurs de risque chez les soignants
    • Etude cas témoins 1130 soignants (244+, 886 -)
    • Prise en charge de patients sans AGP : OR 1,4 (1,04-1,9)

Lentz, ICHE 2020
                                                     JF Gehanno - 9 décembre 2020 - 60
Professions à risque

• Abattoirs (Allemagne, Portugal, US, France)
   • USA Mai 2020, COVID-19 chez 9.1% des 112 616 travailleurs de
     l’industrie de la viande/volaille (Waltenburg, MMWR 2020)
       • 0,4 – 3% dans la population
   • Température, humidité, hébergement

                                                       JF Gehanno - 9 décembre 2020 - 61
Zhang, AJIM 2020
                   JF Gehanno - 9 décembre 2020 - 62
Marinaccio, OEM 2020   JF Gehanno - 9 décembre 2020 - 63
Prévention

             JF Gehanno - 9 décembre 2020 - 64
Mesures de prévention

• Collectives
   • Limiter les rassemblements
   • Distance
   • Ventilation
• Individuelles
   • Hygiène des mains
   • Masques
       • Pour soi
       • Pour les autres

                                              JF Gehanno - 9 décembre 2020 - 65
Effet des masques pour protéger les autres

         Leung, Nature medicine may 2020

                                           JF Gehanno - 9 décembre 2020 - 66
Mais différences entre masques

Visualization of droplet spread when a regular N95-rated mask is used to
impede the jet. (a) Prior to emulating a cough/sneeze, (b) 0.13 s after the
initiation of the emulated cough, (c) after 0.33 s, and (d) after 0.83 s.
Multimedia view: https://doi.org/10.1063/5.0022968.4

Verma et al., Phys. Fluids (2020); doi: 10.1063/5.0022968
                                                                       JF Gehanno - 9 décembre 2020 - 67
Brand B

                                                                      Brand A
                                              Visualization of droplet spread when a surgical
                                              mask is used to block the jet. (a) Prior to
                                              emulating a cough/sneeze, (b) 0.5 s after the
                                              initiation of the emulated cough, (c) after 0.83
                                              s, and (d) after 3.13 s. Multimedia view:
                                              https://doi.org/10.1063/5.0022968.6

Verma et al., Phys. Fluids (2020); doi: 10.1063/5.0022968
                                                                      JF Gehanno - 9 décembre 2020 - 68
Il y a pire

Near-field view of the droplet spread when a face shield is used to impede the emerging
jet. (a) Prior to emulating a cough/sneeze, (b) 0.57 s after the initiation of the emulated
cough, (c) after 3.83 s, and (d) after 16.57 s. The ejected plume is illuminated by both a
vertical and a horizontal laser sheet. Droplets illuminated by the horizontal laser sheet can
be observed in (c) and (d). Multimedia view: https://doi.org/10.1063/5.0022968.1

                                                                      JF Gehanno - 9 décembre 2020 - 69
Impact du confinement

                The Effective Reproduction Number (Rt) Estimates Based on Laboratory-
                Confirmed Coronavirus Disease 2019 (COVID-19) Cases in Wuhan, China
Inglesby, Jama May 2020

                                                                              JF Gehanno - 9 décembre 2020 - 70
Contact tracing

                  JF Gehanno - 9 décembre 2020 - 71
Pour qui (SPF, 16/11/20)?

• Contact à risque : toute personne
   • Ayant partagé le même lieu de vie que le cas confirmé ou probable ;
   • Ayant eu un contact direct avec un cas, en face à face, à moins d’1
     mètre, quelle que soit la durée (ex. conversation, repas, flirt,
     accolades, embrassades). En revanche, des personnes croisées dans
     l’espace public de manière fugace, même en l’absence de port de
     masque, ne sont pas considérées comme des personnes-contacts à
     risque ;
   • Ayant prodigué ou reçu des actes d’hygiène ou de soins ;
   • Ayant partagé un espace confiné (bureau ou salle de réunion, véhicule
     personnel …) pendant au moins 15 minutes consécutives ou cumulées
     sur 24h avec un cas ou étant resté en face à face avec un cas durant
     plusieurs épisodes de toux ou d’éternuement ;

                                                         JF Gehanno - 9 décembre 2020 - 72
Pour qui (SPF, 16/11/20)?

• En l’absence de mesures de protection efficaces pendant toute la
  durée du contact :
   • séparation physique isolant la personne-contact du cas confirmé en créant
     deux espaces indépendants (vitre, Hygiaphone®);
   • masque chirurgical ou FFP2 ou grand public en tissu fabriqué selon la
     norme AFNOR SPEC S76-001 de catégorie 1 ou masque grand public en
     tissu réutilisable possédant une fenêtre transparente homologué par la
     Direction générale de l’armement, porté par le cas ou le contact ;
   • masque grand public en tissu fabriqué selon la norme AFNOR SPEC S76-
     001 de catégorie 2, ou pour lequel la catégorie AFNOR n’est pas connue,
     porté par le cas et le contact;
• Ne sont pas considérés comme mesures de protection efficaces :
   • une plaque de plexiglas posée sur un comptoir ;
   • les masques en tissu « maison » ne répondant pas aux normes AFNOR
     SPEC S76-001
   • les visières en plastique transparent portées seules

                                                            JF Gehanno - 9 décembre 2020 - 73
Comment ?

• Eviction 7j
   • Sauf personnels ES / ESMS ou opérateur d’importance vitale
• Contact familial :
   • réaliser le test le plus tôt possible,
   • puis à 7 jours (J7) si le premier résultat est négatif ;
• Contact ponctuel :
   • réaliser le test à J7 après la date d'exposition
• Quel test ?
   • RT-PCR sur prélèvement naso-pharyngé
   • Test antigénique sur prélèvement nasopharyngé (HAS 27/11/20)

                                                                JF Gehanno - 9 décembre 2020 - 74
LES VACCINS

              JF Gehanno - 9 décembre 2020 - 75
Callaway
https://www.nature.com/articles/d41586-020-01221-y
                               JF Gehanno - 9 décembre 2020 - 76
Approche classique

                 JF Gehanno - 9 décembre 2020 - 77
Vaccins à vecteur viral

                     JF Gehanno - 9 décembre 2020 - 78
Vaccins à ADN / ARN

           JF Gehanno - 9 décembre 2020 - 79
Vaccins protéiques

                     JF Gehanno - 9 décembre 2020 - 80
Stratégie vaccinale (HAS 27/11/20)

                          JF Gehanno - 9 décembre 2020 - 81
JF Gehanno - 9 décembre 2020 - 82
PLACE DES SST

                JF Gehanno - 9 décembre 2020 - 83
Place des SST

• Prévention primaire
   •   Ventilation, organisation du travail
   •   EPI
   •   Vaccination
   •   Certificats d’isolement ?
• Prévention secondaire
   • Dépistage précoce ?
        • TROD à inscription dans SIDEP
   • Contact tracing
• Prévention tertiaire
   • Retour au travail des COVID +
        • Place de la Ct ?
        • Contagiosité faible si Ct > 33 (Avis SFM)

                                                      JF Gehanno - 9 décembre 2020 - 84
Personnes vulnérables

• Decret du 10 novembre 2020 :

• Les personnes âgées de 65 ans et plus,
• Les personnes ayant des antécédents cardiovasculaires, celles
  ayant un diabète non équilibré, celles en obésité (IMC>30),
  celles étant atteintes d’une immunodépression congénitale ou
  acquise, celles atteintes d’une maladie complexe
  (motoneurone, myasthénie, sclérose en plaque, maladie de
  Parkinson etc.) ou d’une maladie rare
• Les femmes au troisième trimestre de leur grossesse.

                                                JF Gehanno - 9 décembre 2020 - 85
Personnes vulnérables

    • Lorsque l’employeur a connaissance de ces situations, il doit :
         • Organiser quand c’est possible leur télétravail ;
         • En cas d’impossibilité, mettre en place les mesures de protection
           renforcées du travail présentiel :
             • bureau individuel ou limitation du risque (ex : écran de protection,
               aménagement des horaires)
             • vigilance particulière quant au respect des gestes barrière et port d’un masque
               de type chirurgical ;
             • absence, ou à défaut limitation du partage du poste de travail et nettoyage et
               désinfection de ce dernier au moins en début et en fin de poste ;
             • mode de déplacement domicile travail favorisant le respect des gestes
               barrières, pouvant notamment s’appuyer sur une adaptation des horaires
               d’arrivée et de départ.
             • mise à disposition de masques de type chirurgical y compris pour les
               transports.
    • Si impossible : activité partielle sur la base d’un certificat médical
    • Si désaccord sur le niveau de protection : avis du médecin du travail

Protocole national, 13 novembre
                                                                         JF Gehanno - 9 décembre 2020 - 86
HAS 9 oct 2020 : tests antigéniques

• Pour les personnes sans symptôme qui ne sont pas des
  personnes-contacts,
• la HAS reconnait l’intérêt de l’utilisation des tests
  antigéniques dans le cadre d’opérations de dépistage à large
  échelle ciblant des populations au sein desquelles le risque
  d'infection est plus important qu’en population générale.
• Cela peut recouvrir des populations qui vivent, étudient ou
  travaillent dans des lieux confinés qui favorisent la
  transmission du virus à un grand nombre de personnes
  (universités, abattoirs, ...), avec un objectif de débusquer des
  clusters ;

                                                    JF Gehanno - 9 décembre 2020 - 87
Tests rapide ?

    • « Au-delà des campagnes de dépistage organisées par les
      autorités sanitaires et auxquelles les entreprises peuvent
      participer, les employeurs peuvent, dans le respect des
      conditions réglementaires, proposer à ceux de leurs salariés
      qui sont volontaires, des actions de dépistage. A cette fin, la
      liste des tests rapides autorisés et leurs conditions
      d’utilisation ont été rendus disponibles par les autorités de
      santé.
    • Ces actions de dépistage doivent être intégralement financées
      par l’employeur et réalisées dans des conditions garantissant
      la bonne exécution de ces tests et la stricte préservation du
      secret médical. En particulier, aucun résultat ne peut être
      communiqué à l’employeur ou à ses préposés »
Protocole national, 13 novembre
                                                      JF Gehanno - 9 décembre 2020 - 88
Source : Presance nov 2020. https://www.presanse.fr/wp-content/uploads/2020/11/qr_depistage_sarcov2_ssti.pdf
                                                                                     JF Gehanno - 9 décembre 2020 - 89
Ordonnance du 2 décembre 2020

• Participation des SST à la lutte contre le COVID
    • Diffusion, à l'attention des employeurs et des salariés, de messages de
      prévention contre le risque de contagion ;
    • Appui aux entreprises dans la définition et la mise en œuvre des mesures
      de prévention adéquates contre ce risque et dans l'adaptation de leur
      organisation de travail aux effets de la crise sanitaire ;
    • Participation aux actions de dépistage et de vaccination définies par l'Etat.
• le médecin du travail peut prescrire et, le cas échéant, renouveler
  un arrêt de travail en cas d'infection ou de suspicion d'infection à la
  covid-19
• Le médecin du travail peut établir un certificat médical pour les
  salariés vulnérables en vue de leur placement en activité partielle
• Le médecin du travail et, sous sa supervision, d'autres
  professionnels de santé des services de santé au travail peuvent
  prescrire et réaliser, dans des conditions et selon des modalités
  précisées par décret, des tests de détection du SARS-CoV-2
• Applicable jusqu'au 16 avril 2021

                                                                JF Gehanno - 9 décembre 2020 - 90
Ordonnance du 2 décembre 2020

• Report des visites (L. 4624-1, L. 4624-2, L. 4624-2-1 et L. 4625-
  1-1 )
   • VIP, SIR, salariés temporaires, CDD
   • sauf lorsque le médecin du travail estime indispensable de maintenir
     la visite
   • Le report de la visite ne fait pas obstacle, le cas échéant, à l'embauche
     ou à la reprise du travail
   • Applicable aux visites médicales dont l'échéance intervient avant le 17
     avril 2021

                                                            JF Gehanno - 9 décembre 2020 - 91
FAQ

• Concernant les personnes vulnérables : pourraient elles
  reprendre à temps partiel ? et quid du temps ou elles restent
  à domicile ? est-ce envisageable ? en jours ? en heures ( si la
  personne travaille par ex de 10 à 15 h pour éviter les
  transports aux heures de pointe ?)
   • Si le salarié doit reprendre en temps partiel, il faut un avis de la
     médecine de santé au travail. L’activité partielle peut s’exprimer en
     jour et également en heure.
• Activité partielle ou chômage partiel
   • Le chômage partiel est l’ancienne dénomination maintenant c’est
     l’activité partielle.

                                                            JF Gehanno - 9 décembre 2020 - 92
MERCI DE VOTRE ATTENTION

Labor omnia vincit improbus

                              JF Gehanno - 9 décembre 2020 - 93
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