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Domaine 4 :
                              « Ingénierie et santé :
                        Homme, bioproduits, environnement »
www.agroparistech.fr

                                  Présentation pédagogique du domaine 4 – 2017/2018   1

                       Le périmètre du D4, les compétences à
                       acquérir, et les métiers visés
www.agroparistech.fr

                                  Présentation pédagogique du domaine 4 – 2017/2018   2
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Domaine 4 – le périmètre du domaine

                                                                SANTE                                      Soins
                             Facteurs                                                                   traitements
                                                                                                      prise en charge
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                             influents                                                                        …

                       Spécificité des ingénieurs
                             AgroParisTech :               Mécanismes impliqués
                       vision intégrée de l’amont            dans l’organisme

                                               Former les étudiants à l’étude des effets des produits
                                               (alimentaires, cosmétiques, pharmaceutiques) et autres
                                               caractéristiques du milieu (environnement) sur la santé de
                                               l’Homme, et aux voies d’action permettant de maîtriser leur
                                               impact sur la santé.
                                                  Présentation pédagogique du domaine 4 – 2017/2018                      3

                                                 Domaine 4 – compétences à acquérir

                                     EVALUER
                       • l’incidence de composés ou micro-
                                                                                         MAITRISER
                       organismes sur la santé humaine                    • la bioingénierie cellulaire et moléculaire
                       • l’exposition (doses externes et internes)        pour la santé et la chimie blanche
                       aux molécules positives ou négatives               • les méthodes de caractérisation et
                       • les bénéfices / risques en alimentation          d’évaluation des dangers / bénéfices
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                                                                          • les méthodes de prévention d’apparition
                                                                          de contaminants / pathogènes

                                      CONCEVOIR
                       • des approches multimodales de sécurité                             INNOVER
                       sanitaire centrées sur leur répercussion              • sur les méthodes d’évaluation
                       chez l’Homme                                          de la toxicité pour l’Homme ou les
                       • des indicateurs de dangers / bénéfices              écosystèmes
                       • et produire des molécules actives et                • sur les méthodes d’analyse
                         des aliments à bénéfice santé                       chimique et microbiologique

                                                  Présentation pédagogique du domaine 4 – 2017/2018                      4
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Domaine 4 – secteurs d’activité, métiers

                         Secteur industriel                                                Métiers
                       • Pharmaceutique (nouveaux                         Ingénieur nutritionniste
                       médicaments et traitements,
                                                                          Ingénieur formulation
                       diagnostic, politiques de
                       santé)                                             Ingénieur qualité filière
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                       • Cosmétique                                       Responsable Qualité Produit
                       • Agro-alimentaire (maîtrise                       Responsable Qualité Environnement
                       de l’hygiène de l’aliment et
                       outils de production, aliments/
                                                            D4            « Food safety manager »
                                                                          Ingénieur recherche et développement
                       ingrédients santé, additifs,
                       conception de procédés                             Responsable projet
                       biotechnologiques innovants)                       Responsable propriété industrielle
                       • Chimique, phytosanitaire                         Responsable R&D en cosmétologie
                       (caractérisation, adaptation                       Ingénieur conseil en entreprise
                       aux normes, bioprocédés
                                                                          Responsable de production
                       pour la chimie blanche...)
                                                                          Chef de produit

                                                  Présentation pédagogique du domaine 4 – 2017/2018          5

                                                 Domaine 4 – secteurs d’activité, métiers

                         Secteur public
                        • Agences sanitaires (ANSES, ANSM, EFSA, EChA)
                        • Epidémiosurveillance (InVS, ORS, INERIS)
                        • Gestionnaires de santé (DGCCRF, DGAL, DGS,
                        collectivités territoriales, services déconcentrés)
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                        • Education à la santé (INPES, CRES)
                        • Organismes publics internationaux
                        • Enseignement supérieur / recherche                                    Métiers
                                                      Ingénieur nutritionniste de santé publique
                                        D4            Responsable de projet en analyse de risque sanitaire
                                                      Chargé de mission en santé publique
                                                      Ingénieur biostatisticien
                                                      Biomathématicien
                                                      Chercheur
                                                      Enseignant-chercheur

                                                  Présentation pédagogique du domaine 4 – 2017/2018          6
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Domaine 4 – secteurs d’activité, métiers

                         Autres secteurs
                       • Restauration collective                                               Métiers
                       (maîtriser l’hygiène des
                       procédés et des aliments)                  Ingénieur nutritionniste
                       • Matériel médical /                       Responsable qualité produit
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                       hospitalier (matériaux,
                       nettoyage / désinfection
                                                    D4            Ingénieur hygiéniste
                                                                  Ingénieur concepteur de matériel
                       des locaux)
                                                                  Ingénieur conseil
                       • Cabinets de conseil
                                                                  Analyste économique de projets de
                       • Banques, organismes
                                                                  « start-up »
                       financiers
                                                                  Gestion de portefeuille d’activités de
                       • ONG
                                                                  recherche en pharmacie
                       • Police scientifique
                                                                  Responsable projets en ONG
                                                                  Ingénieur de la police scientifique

                                           Présentation pédagogique du domaine 4 – 2017/2018               7

                       Les enseignements du D4 en 2ème année
www.agroparistech.fr

                                                                                                           8
                                                                                                           8
                                           Présentation pédagogique du domaine 4 – 2017/2018
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Domaine 4 – l’enseignement de 2A

                       UE Socle commun                  UE optionnelles                         Projet   Stage

                       5 UC obligatoires            Parcours « personnalisé »
                                                          par l’étudiant
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                                                      Parcours pré-établi
                                                      « Santé, aliments et
                                                      bioproduits » (SAB)

                                                       Parcours pré-établi

                           ?                       « Bioingénierie moléculaire
                                                      et cellulaire » (BMC)

                                            Présentation pédagogique du domaine 4 – 2017/2018                     9

                                                 Les UC du socle commun du D4

                                Des UC : - disciplinaires / thématiques
                                               - pluri- / inter- disciplinaires
                                               - complémentaires
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                       Apprendre à : - dialoguer avec plusieurs disciplines
                                           - décontextualiser les connaissances
                                           - transposer à d’autres objets
                                           - extrapoler à d’autres niveaux d’échelle

                                            Présentation pédagogique 10
                                                                     du domaine 4 – 2017/2018                    10
Domaine 4 – le socle commun
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                                                                                   UC Biologie
                                                                               structurale et santé

                                               Présentation pédagogique du domaine 4 – 2017/2018      11

                                                  Domaine 4 – le socle commun

                         UC Biologie structurale et santé                          24 h
                          Responsables : Anita BAUDEVIN, Pierre BRIOZZO

                             Objectif : montrer l’importance des données structurales
                          (de l’échelle atomique à l’échelle cellulaire) pour comprendre et
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                                   modifier les fonctions biologiques de l’homme

                       Apports de connaissances : CM + conférences + TD

                             Complexes d’intégration viraux
                             Méthodes d’étude des interactions protéine partenaire
                             Assemblages membranaires
                             Le ribosome bactérien comme cible d’antibiotiques
                             Bases structurales des allergies et intolérances alimentaires
                             Prions
                             Cibles thérapeutiques pour le HIV
                             Interactions de molécules actives avec des cibles de structure connue
                             Interactions moléculaires étudiées par double hybride

                                               Présentation pédagogique du domaine 4 – 2017/2018      12
Domaine 4 – le socle commun
www.agroparistech.fr

                                                                                   UC Biologie
                       UC Bioingénierie                                        structurale et santé
                        pour la santé

                                               Présentation pédagogique du domaine 4 – 2017/2018                  13

                                                  Domaine 4 – le socle commun

                        UC Bioingénierie pour la santé                                                 34 h
                          Responsables : Annaig LAN, Dalila AZZOUT-MARNICHE

                       Objectif : montrer l’application des acquis récents de la biologie au
                            développement de nouveaux traitements thérapeutiques
www.agroparistech.fr

                       Apports de connaissances : CM + TD
                            Génétique : du génome à l'identification des gènes d'intérêt et à leur expression
                            [Génétique / Epigénétique]
                            Biologie cellulaire et développement : contrôle de la prolifération cellulaire,
                            apoptose, neurobiologie, immunologie
                            Modélisation de la réponse : biologie systémique et synthétique
                            Ingénierie cellulaire : modèles cellulaires, contrôle de la différenciation cellulaire,
                            méthode de transgénèse, production de protéines thérapeutiques
                            Stratégies thérapeutiques : considérations éthiques, gestion publique des systèmes
                            de santé, gestion de portefeuille d’activités de recherche en pharmacie, thérapies
                            génique et cellulaire

                                               Présentation pédagogique du domaine 4 – 2017/2018                  14
Domaine 4 – le socle commun

                                                                                               UC Alimentation,
                                                                                               aliment et santé
                                                                                                 de l’Homme
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                                                                                    UC Biologie
                       UC Bioingénierie                                         structurale et santé
                        pour la santé

                                                Présentation pédagogique du domaine 4 – 2017/2018             15

                                                   Domaine 4 – le socle commun

                         UC Alimentation, aliment et santé de l’homme                                39 h
                           Responsables : Jean-François HUNEAU

                         Objectif : Introduire les différentes composantes de l’alimentation
                         de l’homme (culturelle, hédonique, technologique et nutritionnelle)
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                            (1) Comment se construit et s’analyse la qualité nutritionnelle d’un aliment ?
                            (2) Quels sont les déterminants des choix alimentaires ?
                            (3) Comment s’analyse l’impact de la qualité nutritionnelle et des choix
                            alimentaires sur la santé du consommateur et des populations ?
                       Apports de connaissances : CM + TD + projets en groupes
                          Alimentation (systèmes alimentaires)
                          Alimentation (composition/techno alimentaire)
                          Physiologie/Nutrition
                          Sciences de l’aliment : perceptions sensorielles
                          Sociologie de l’alimentation
                          Droit de l'alimentation
                          Microbiologie
                          Analyse chimique appliquée aux aliments
                          Epidémiologie analytique appliquée aux relations alimentations santé
                                                Présentation pédagogique du domaine 4 – 2017/2018             16
Domaine 4 – le socle commun

                                                                                                    UC Aliment,
                                                                                                  alimentation et
                                                                                                 santé de l’Homme
UC Risques sanitaires
environnementaux et
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  alimentaires pour
      l’Homme
                                                                                       UC Biologie
                       UC Bioingénierie                                            structurale et santé
                        pour la santé

                                                   Présentation pédagogique du domaine 4 – 2017/2018                   17

                                                      Domaine 4 – le socle commun
                                UC Risques sanitaires environnementaux et
                                       alimentaires pour l’Homme                                          32 h
                              Responsables : Valérie CAMEL, Florence DUBOIS-BRISSONNET
                            Objectif : Acquérir des connaissances / compétences relatives
                            à l’évaluation des risques sanitaires et la maîtrise des dangers
                            (caractérisation des dangers, évaluation de l’exposition, contrôle et maîtrise,
www.agroparistech.fr

                            gestion des risques)
                       Apports de connaissances : CM + conférences + TD + travail thématique
                       1)     Problématique générale : introduction des concepts, présentation des différents
                              types de risques sanitaires, évolution du cadre réglementaire, présentation des enjeux
                              et des principaux acteurs impliqués
                       2)     Maîtrise des dangers : dangers microbiologiques, dangers chimiques, avec 2 TD
                              (démarche HACCP + évaluation de l'exposition alimentaire à des contaminants
                              chimiques)
                       3)     Méthodologie d’évaluation quantitative des risques sanitaires
                       4)     Gestion des risques sanitaires
                       5)     Travail par projet sur dossiers permettant d’approfondir les connaissances sur des
                              dangers sélectionnés avérés, suspectés, émergents : dangers microbiologiques
                              (bactéries, virus, parasites..) + dangers chimiques

                                                   Présentation pédagogique du domaine 4 – 2017/2018                   18
Domaine 4 – le socle commun

                                                                                                   UC Aliment,
                                                                                                 alimentation et
                                                                                                santé de l’Homme
UC Risques sanitaires
environnementaux et
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  alimentaires pour
      l’Homme
                                                                                      UC Biologie
                       UC Génétique et                                            structurale et santé
                       biologie cellulaire
                         pour la santé

                                                               UC Mathématiques
                                                              et statistiques pour
                                                                        la santé
                                                  Présentation pédagogique du domaine 4 – 2017/2018             19

                                                     Domaine 4 – le socle commun

                         UC Mathématiques et statistiques pour la santé                                  27 h
                          Responsable : Emilie LEBARBIER

                            Objectif : compléter l’enseignement de TC dans 2 domaines :
                       (i) en analyse des systèmes dynamiques, en étudiant le modèle de
www.agroparistech.fr

                       diffusion d’épidémies SIR ;
                       (ii) en statistiques, en étudiant le modèle linéaire généralisé, la
                       régression logistique (essentielle en épidémiologie statistique) et la
                       classification)
                       et initier à l’épidémiologie
                       Apports de connaissances : CM + TD info
                              Analyse des systèmes dynamiques ; le modèle SIR
                              Le modèle linéaire généralisé
                              La classification
                              L’approche épidemiologique quantitative, la régression logistique

                                                  Présentation pédagogique du domaine 4 – 2017/2018             20
Domaine 4 – les UE optionnelles 2A

                       UE Socle commun                  UE optionnelles                         Projet   Stage

                        5 UC obligatoires
www.agroparistech.fr

                                                               ?

                                            Présentation pédagogique du domaine 4 – 2017/2018                    21

                                            Domaine 4 – les UE optionnelles 2A
                                   Exemples d’UE optionnelles de 48h
                       Aspects moléculaires et cellulaires du vieillissement
                       Ce que nous apprennent les génomes
                       Mécanismes et évolution de la pathogénie : interactions cellulaires
www.agroparistech.fr

                       Stratégie multi-canal & Modèles d'affaires innovant dans la santé, l'alim […]
                       Microbiologie alimentaire
                       Communication Nutrition-Santé sur les produits alimentaires
                       Physiologie de la perception et du comportement humain
                       Food safety through the food chain
                       Apport de l’épidémiologie à la maîtrise des risques sanitaires
                       Gestion de la qualité
                       Pollutions atmosphériques

                                            Présentation pédagogique du domaine 4 – 2017/2018                    22
Domaine 4 – les UE optionnelles 2A

                                Exemples d’UE optionnelles de 24h
                       Bio-informatique et bio-analyse des génômes
                       Quels défis à relever pour l’utilisation des probiotiques en santé ?
                       Prévision du risque microbiologique dans les aliments
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                       Nutrition Publique
                       Qualité microbiologique des matériaux
                       Outils sensoriels pour la formulation et l’optimisation de produits
                       Polymorphisme des populations humaines et facteurs de
                       prédisposition
                       Analyse statistique de données environnementales
                       Introduction à l'immunologie sur le thème de la vaccination
                       Nanotechnologies : principes, usages, attentes et inquiétudes

                                        Présentation pédagogique du domaine 4 – 2017/2018     23

                                        Domaine 4 – les UE optionnelles 2A

                                Exemples d’UE optionnelles Athens

                          Bioingénierie métabolique

                          Neurones: des modèles à la conscience
www.agroparistech.fr

                          Nouvelles applications des outils de détection moléculaires

                          Nutrition en Conditions Extrêmes

                          Modèles animaux de pathologies humaines

                          Gestion des microorganismes dans différents écosystèmes

                                        Présentation pédagogique du domaine 4 – 2017/2018     24
Domaine 4 – les parcours pré-établis

                        UE Socle commun                     UE optionnelles                         Projet    Stage

                         5 UC obligatoires                      Parcours libre
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                                                            Parcours pré-établi
                                                            « Santé, aliments et
                                                            bioproduits » (SAB)

                                                           Parcours pré-établi
                                                       « Bioingénierie moléculaire
                                                          et cellullaire » (BMC)
                       Parcours : à raisonner
                       sur 2A + 3A
                                                    Tout parcours est personnalisé
                                                             par l’étudiant

                                                Présentation pédagogique du domaine 4 – 2017/2018                     25

                                                Domaine 4 – détail des parcours - 2A

                       Parcours « Bioingénierie moléculaire et cellulaire »
                                                                                Responsable
www.agroparistech.fr

                                                                                                          Anita
                                                                                                        BAUDEVIN

                        Structuration d’une offre d‘UE optionnelles ciblée sur les
                       niveaux moléculaires et cellulaires

                        Préparer à des débouchés diversifiés allant de la conception
                       de procédés innovants à la gestion de projets dans les domaines
                       de la pharmacologie, la cosmétologie et des biotechnologies
                       pour la santé humaine en général

                                                Présentation pédagogique du domaine 4 – 2017/2018                     26
Domaine 4 – détail des parcours - 2A
                       Parcours « Bioingénierie moléculaire et cellulaire »

                                                                                        Fonctionnement cellulaire
                       Offre structurée en           Bioingénierie
                                                                                             6 UE au choix
                       3 volets incluant
                       les aspects socio-                6 UE au choix
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                       économiques
                                                                   De la cellule à l’organisme

                                                                         5 UE au choix

                             Le parcours BMC comprend:
                                       - 1 UE de chaque volet (dont 2 de 48h)
                                       - 1 UE au choix dans l’un des 3 volets
                                       - 2 UE au choix dans l’offre 2A d’APT
                             Pas de contrainte sur l’UE projet ni le stage

                                                Présentation pédagogique du domaine 4 – 2017/2018                   27

                                                Domaine 4 – détail des parcours - 2A
                       Parcours « Bioingénierie moléculaire et cellulaire »
                                                                                                    Bioingénierie
                        Bioingénierie des protéines et applications industrielles
                        Economie et gestion de la santé
                        Bioéthique et biovigilance
                        Ingénierie cellulaire expérimentale
                        Apport de l’épidémiologie à la maîtrise des risques sanitaires
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                                                                                     Fonctionnement cellulaire
                        Ce que nous apprennent les génomes
                        Mécanismes et évolution de la pathogénie
                        Initiation à la biologie de synthèse
                        Introduction à l’immunologie sur le thème de la vaccination
                        Construire la complexité en biologie
                        Aspects moléculaires et cellulaires du vieillissement

                                                                                     De la cellule à l’organisme
                        Biologie intégrative, introduction à la complexité du vivant
                        Biotechnologies animales
                        Polymorphisme des populations humaines et facteurs de prédisposition
                        Neurosciences cognitives et computationnelles

                                                Présentation pédagogique du domaine 4 – 2017/2018                   28
                                                                          28
Domaine 4 – détail des parcours - 2A
                              Parcours « Santé, aliments et bioproduits»

                                                                                    Responsable
www.agroparistech.fr

                                                                                                             François
                                                                                                            MARIOTTI
                          Objectifs
                         Proposer une offre de formation multidisciplinaire large, relative à la santé,
                        centrée sur l’objet « aliments et bioproduits », articulée entre la 2A et la 3A
                         Préparer à des débouchés relatifs aux questions de santé dans le secteur de
                        l’alimentation et des bioproduits

                          Méthode
                         Utiliser 10 semaines d’U.E. à choix (hors Athens) pour renforcer
                        l’approche multidisciplinaire, entre le SCD4 et la 3A ; proposer un équilibre
                        entre les différentes disciplines
                                                  Présentation pédagogique du domaine 4 – 2017/2018                       29

                                                  Domaine 4 – détail des parcours - 2A

                              Parcours « Santé, aliments et bioproduits»
                                                        44 UE sur ce thème

                                 Ingénierie de         Sciences            Biologie         Outils d’aide
                                  l’aliment et         sociales          (sens large)       à la décision
                                                                                                                  UE Athens
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                                       des           dont gestion,           dont               et à la
                                  bioproduits         sociologie,       physiologie,           gestion             (1 sem)
                                 dont sciences,       marketing,         génétique              (sci. de              +
                                  procédés,             droit, et        hum., bio.         l’ingénieur +         UE Projet
                                 microbiologie         polit. pub       cell/mol, etc.        approches           (6-8 sem)
                       SCD4
                                                                                            intégratives)             +
                                                                                                                    stage
                                                                                                                  (>10 sem)
                                 3 au moins          3 au moins         1 au moins         1 au moins
                                                                                                                  au choix
                                                              2 au choix

                                                        10 crédits-semaines
                                             + tolérance de 2 crédits s’ils sont répartis sur plusieurs thèmes

                                                  Présentation pédagogique du domaine 4 – 2017/2018                       30
Domaine 4 – détail des parcours - 2A
                          Parcours « Santé, aliments et bioproduits»
                                                                                                      Ingénierie de
                       Biomatériaux, biopolymères, matériaux biosourcés                                l’aliment et
                       Outils sensoriels pour la formulation et l’optimisation de produits                  des
                       Bioingénierie des protéines et applications industrielles                       bioproduits
                       Microbiologie alimentaire
                       Produits alimentaires et cosmétiques: structure et caractérisation physique
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                       Gestion de l'Innovation […] dans les secteurs Aliment et Santé                    Sciences
                       Les enjeux de la qualité des produits transformés : de l'approche qualité […]      sociales
                       Economie et gestion de la santé
                       Nutrition publique
                       Stratégie multi-canal & Modèles d'affaires innovant dans la santé, l'alimentation […]

                       Polymorphisme des populations humaines et facteurs de prédisposition                Biologie
                       Introduction à l’immunologie sur le thème de vaccination
                       Physiologie de la perception sensorielle et du comportement humain

                                                                                          Outils d’aide à la décision
                       Food safety and risk analysis through the food chain
                       Prévision du risque microbiologique dans les aliments
                                                                                                et à la gestion

                                               Présentation pédagogique du domaine 4 – 2017/2018                      31

                       Un aperçu des formations de 3ème année au
                       coeur du D4
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                                                                                                                      32
                                                                                                                      32
                                               Présentation pédagogique du domaine 4 – 2017/2018
Domaine 4 – les dominantes de 3A

                                 Ingénierie et Santé :                                      SSMAQ
                                 Homme, bioproduits,                                 Management de la Qualité,
                                                                                       Sécurité sanitaire et
                                      environnement
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                                                                                      prévention des risques

                                                                                           BIOTECH
                                                                                Biologie et biotechnologies pour la
                                                                              santé et les productions microbiennes
                                                                                           ou végétales
                               NUTRI                               METATOX
                       Sciences et technologies de       De l'évaluation à la gestion des risques
                        la biologie, la nutrition et        toxicologiques pour la santé des
                         l’alimentation humaine                écosystèmes et de l'Homme

                                                Présentation pédagogique du domaine 4 – 2017/2018                33

                                                   Domaine 4 – les spécialités de M2

                                                                                                    ARSA
                                 Ingénierie et Santé :                                     Analyse des risques
                                                                                             sanitaires liés à
                                 Homme, bioproduits,                                          l’alimentation
                                      environnement
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                                                                                                RDSA
                                                                                           R&D en stratégies
                                                                                             analytiques

                                 TES                                               NS
                              Toxicologie,
                                                                                 Nutrition,
                         environnement, santé
                                                                                  santé

                                                          SSB
                                                      Systemic and
                                                    synthetic biology

                                                Présentation pédagogique du domaine 4 – 2017/2018                34
Toute l’information, et des interviews “métiers”
                       sur TICE
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                                   Présentation pédagogique du domaine 4 – 2017/2018

                                    Cours « Présentation du domaine 4 »
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Cours « Présentation du domaine 4 »
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                                      Domaine 4 – the end !
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                       Présentation pédagogique du domaine 4 – 2017/2018   38
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