MISE AU POINT D'UN TEST DE DIAGNOSTIC RAPIDE DU VIRUS EBOLA - Ebola eZYSCREENTM

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MISE AU POINT D'UN TEST DE DIAGNOSTIC RAPIDE DU VIRUS EBOLA - Ebola eZYSCREENTM
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                                    Ebola eZYSCREEN

MISE AU POINT D’UN TEST DE DIAGNOSTIC RAPIDE DU
                  VIRUS EBOLA
                                              Fabrice GALLAIS

      Source: Massachusetts Medical Society

                                Direction des sciences du vivant
           Laboratoire d’Innovations technologiques pour la Détection et le Diagnostic
MISE AU POINT D'UN TEST DE DIAGNOSTIC RAPIDE DU VIRUS EBOLA - Ebola eZYSCREENTM
Plan

 Rappel sur le virus Ebola

 Point sur l’épidémie actuelle

 Notion d’anticorps monoclonaux

 Développement des anticorps dirigés contre Ebola

 Développement du test rapide bandelette

 Evaluation du test sur le terrain

 Le laboratoire P4

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Aire de répartition

 Agent étiologique de fièvres hémorragiques
 Fatales chez l’homme et les primates
 Pas de vaccin ni de traitement
 Agent pathogène de classe 4

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Réservoir animal

                          Ebolavirus
Hypsignathus monstrosus    Epomops franqueti   Myonycteris torquata

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Cycle de transmission

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Tableau clinique

                                                      Infection
                          Patient non symptomatique
                              Virémie indétectable
                            Patient non infectieux         3 à 21 jours

                                          Première phase clinique
                         Syndrome pseudo-grippal
Patient symptomatique    Douleurs abdominales, nausées, diahrées,
    Virémie élevée      vomissements, malaises
                          Asthénie et amaigrissement
                         Eruptions cutanées

                                         Signes hémorragiques

                                        Défaillance de nombreux
                                                 organes

                                                          10 jours
                                                  Décès
                                                                          | PAGE 6
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Phylogénie

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                                                                  EBOV-S Bon
                                                                                        Soudan
                                                                  EBOV-S Mal

 Classification:                                                     EBOV-Z Ecr         Reston
               Ordre: Mononegavirales
                                                                      EBOV-Z May Bundibugyo
               Famille: Filoviridae
               Genre: Ebolavirus
                                                                                    Taï Forest
                                                                      EBOV-Z Kik

 5 sous types
                                                                      EBOV-IC IC1       Zaïre

                                                                           Reston
                                              (Hensley L. 2010)
                                                                                    | PAGE 7
MISE AU POINT D'UN TEST DE DIAGNOSTIC RAPIDE DU VIRUS EBOLA - Ebola eZYSCREENTM
Virus Ebola

                                          Virus enveloppé
                                          ARN linéaire non segmenté simple brin
                                          7 protéines

                                                                                       18,9 kb
       NP     VP35 VP40   GP / sGP VP30 VP24                      L
                                                                                                     5’
3’
                                             VP30

                                        GP

                                                                                        sGP
     VIRION                                               NP
                                             VP30

                                               ARN
                                                                      VP35     Source: education.expasy.org

                          VP24   VP40                            L                                     | PAGE 8
MISE AU POINT D'UN TEST DE DIAGNOSTIC RAPIDE DU VIRUS EBOLA - Ebola eZYSCREENTM
Historique des épidémies
                           24 701 cas
                           10 194 morts

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MISE AU POINT D'UN TEST DE DIAGNOSTIC RAPIDE DU VIRUS EBOLA - Ebola eZYSCREENTM
Point sur l’épidémie actuelle

Source: OMS au 22/10/14
                                                  Source: OMS au 18/03/15

        Sous type Zaïre variant Guinée
        40% de mortalité
                                                                            | PAGE 10
Point sur l’épidémie actuelle

Liberia

Sierra Leone

  Guinée

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                                 Source: OMS
Crise sanitaire, quel apport?

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                                                                             d’un test bandelette

                                                          JS Towner et al J. Virol. 2004, 78(8):4330

Complémentaire des tests pratiqués
       Utilisable sur le terrain
       Simple
       Rapide
       Stable (faible empreinte logistique)
       Peu onéreux
       Gamme de sensibilité cohérente
       Objectif : Isoler rapidement un patient positif

Types d’échantillons
       Sang total
       Sérum/Plasma

                                                                                                       | PAGE 12
Les anticorps

Un anticorps est une protéine complexe utilisée par le système immunitaire pour détecter et neutraliser les
agents pathogènes de manière spécifique. Les anticorps sont sécrétés par des cellules dérivées des
lymphocytes B : les plasmocytes.

                                                                                                      13   | PAGE 13
Les anticorps monoclonaux

          Anticorps polyclonal ?
      Mélange d’une multitude d’anticorps sécrétés par toute une population de lymphocytes B.

          Anticorps monoclonal ?
      Un seul anticorps issue d'un seul lymphocyte (clone)

                              G. KÖHLER (1946-1995) ET C. MILSTEIN (1927-2002)

                         Publication en 1975

                 Les hybridomes

                         Prix Nobel de médecine en 1984 avec N.K. Jernes

                 "for theories concerning the specificity in development and control of the immune system and the discovery
PAGE 14
                 of the principle for production of monoclonal antibodies"
Les anticorps monoclonaux

Immunogène   Lymphocytes                                            Myélome

                              FUSION

             Croissance -    Sélection      Croissance +
             Anticorps +                    Anticorps -

                                                     Hybridomes
                                                     Croissance +
                                                     Anticorps +

                             Criblage                Identification des anticorps
                                                     spécifiques

                             Clonage

                                                     Population monoclonale

                  Congélation, Banques cellulaires
                                                                                | PAGE 15
Immunogène?

                            Protéines recombinantes
                            pseudovirus GP Ebola Zaïre

Transcriptase inverse

      GP Ebola Zaïre

              Intégrase

                  GAG

             Enveloppe

                              • Manipulable en laboratoire classique
                                   • non pathogène, non-réplicatif
                            • Utilisable pour le criblage des d’anticorps
                          • Utilisable pour estimer le potentiel neutralisant

 | PAGE 16                                                                      AFM, (CEA/SBTN, M Odorico)
Développement des anticorps monoclonaux

             Immunisation de souris

             Obtention de 20 anticorps monoclonaux spécifiques de la GP du virus Ebola

             Validation sur virus Ebola Zaïre au laboratoire P4

             Obtention d’anticorps neutralisants fortement l’infection

                                             1.4

                                             1.2

                                                  1
                       DO à 450 nm blanc déduit

                                             0.8

                                             0.6

                                             0.4

                                             0.2

                                                  0

| PAGE 17
Test « sandwich » bandelette

Production assurée par

Laboratoire Français, situé en Normandie, spécialisé dans le domaine des tests rapides.
Capacité de production annuelle de plus de 15 millions de tests.

                                                                               | PAGE 18
Développement du test

Du 18 août au 25 novembre

                  CEA            VEDALAB           CEA               P4

                Anticorps          Mise au       Evaluation       Evaluation
                                     point          Types             Types
                Production       Fabrication     d’échantillon    d’échantillon
                Purification        Coating          Prise        Prise d’essai
                                  Conjugués         d’essai        Sensibilité
                 Contrôle
                                   Tampons        Sensibilité      Spécificité
                                 Membranes        Spécificité
                                     Types         Stabilité       Echantillons
                                 d’échantillon                      sanguins
                                                                    normaux
                                  Echantillons   Utilisation de    surchargés
                                   sanguins      pseudotypes         Ebola
                                   normaux

                                                                                  | PAGE 19
Principaux résultats issus du développement

Spécificité Espèce Zaïre et variant Guinée                    Stabilité, 85 jours à 30°C

Sensibilité, limite de détection analytique
Plasma (150µl)                                Sérum (150µl)        Sang (50µl + 3 gouttes diluant)

                                                                                                     | PAGE 20
Evaluation des performances sur le terrain

           Commande de 3000 tests

           Test unitaires, en coffret de 20 unités

           Evaluation des performances cliniques (plan d’étude établi en liaison avec l’ANSM)

             320 normaux (répartis sur 3 matrices)

             50 pathologiques non Ebola

             300 positifs Ebola (répartis sur 3 matrices)

                                                                                                 21
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Evaluation des performances sur le terrain

                                                            Centre de traitement Ebola de Forécariah (Guinea)
                                                                        sous le control de la Croix Rouge française

                                                                          1000 tests
                                                                          En attente d’autorisation du commité d’Ethique
                                                                           Guinéen

 Hopital de Coyah, Coyah (Guinée)

               800 tests
               L’étude a débutée le 07/03/15

 Centre de traitement Ebola de Macenta (Guinea)                                                     Geographical
             sous le control de la Croix Rouge française                                             distribution of new
                                                                                                     and total
                                                                                                     confirmed cases
               1000 tests                                                                           (WHO, 2015, March 11)

                                                                                                                    | PAGE 22
Conclusion et perspectives

Dans un rapport du 18 November 2014, l’OMS demandait à la communauté scientifique la mise au point d’un test de
diagnostic “IDEAL”

        Rapide
        Sensible
        Sans danger
        Simple, adapté pour une utilisation dans les centres de santé périphériques sans infrastructure de laboratoire
        en place.
        Devrait impliquer moins de trois étapes, produire des résultats en moins de 30 minutes,
        Necéssitant aucune exigence en matière de biosécurité au-delà du port des équipements de protection
        individuelle.

Conclusions

 Le test Ebola eZYSCREEN® remplit tous les critères du test idéal OMS

 L’évaluation des performances sur le terrain est un point critique.

 Selon les résulats, diffusion “institutionnelle” dès que possible.

Intérêt dans un contexte post-epidemique

Le test Ebola eZYSCREEN® permettra également la surveillance des populations a risque en dehors de la phase
épidémique actuelle. Il permettra d’identifier des cas sporadiques isolés, d’identifier les malades et ainsi éviter une
épidémie locale ou une plus large épidémie.

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Le laboratoire P4

Un laboratoire P4 s’impose pour la manipulation des agents pathogènes
                             du groupe 4
                     • essentiellement des virus,
                      • taux de mortalité élevé,
                     • pas de traitement vaccinal,
                     • pas de traitement curatif,
         • dangereux pour la population (transmission aisée).

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Le laboratoire P4

    PATHOGÈNES DE CLASSE 4 :
    SONT TOUS DES VIRUS

   POXVIRIDAE
     Smallpox

   ARENAVIRIDAE
    Guanarito, Junin, Lassa, Machupo, Sabia

   BUNYAVIRIDAE
    CCHF

   FILOVIRIDAE
    Ebola, Marburg

   PARAMYXOVIRIDAE
    Nipah, Hendra

   Pathogènes émergents (SARS, H5N1, TB…)

                                              | PAGE 25
La construction du Laboratoire P4 est la
                                   réalisation d’un projet du Dr. Charles MERIEUX

                                       Il est localisé au sud de Lyon au sein du
                                                 technopôle de Gerland

                                         Il est actuellement l’un des meilleurs
                                     équipements pour la manipulation des agents
                                                pathogènes du groupe 4

1998: Début de la construction du laboratoire
1999: Inauguration par M. le Président Jacques CHIRAC
2000: Entrée en activité du Laboratoire.
2004: Le Laboratoire P4 passe sous le contrôle de l’Etat Français
                                                                           26
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Le confinement

Les locaux sont maintenus en permanence en dépression par un système d’air neuf, avec filtration absolue de l’air entrant
et de l’air extrait.
L’entrée ou la sortie de matériel s’effectue par un sas de décontamination au formol ou par un autoclave à double entrée.
Les déchets décontaminés sont ensuite pris en charge par une entreprise spécialisée dans l’incinération des déchets.
Les effluents liquides sont après décontamination chimique, stérilisés à la vapeur (128°C) dans des cuves spécialement
adaptées à ce type de traitement.
Les agents biologiques sont stockés à l’intérieur des zones protégées et dans des contenants appropriés
(réfrigérateur, congélateurs, cuves d’azote liquide fermées à clé.
                                                                                                                   | PAGE 27
Protection des chercheurs

            Les scaphandres sont réalisés sur mesure.
            Communication radio permanente avec le PCS (possibilité de
            réception d’appels téléphoniques).
            Arrivée d’air entre 500 et 1200L/min.
            Filtre absolu HEPA (efficacité 99,99994%) au niveau de la
            connexion avec l’air respirable.
            Systèmes de sécurité redondants pour l’air respirable.

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Ebola eZYSCREEN

                                               Fabrice GALLAIS
                                             Charles MARCHETTI
                                               Yasmina TAYEB
                                                Yves BRIGNON
                                                Karen DUMAS
                                              Karine AVERSENG
                                             Laurent BELLANGER

Source: Reuters / Jean Paul Pelissier

                                                 Hervé RAOUL
                                           Caroline CARBONNELLE
                                             Delphine PANNETIER
                                                Stéphane MELY
                                                Anne BOCQUIN
                                           Stéphanie MUNDWEILLER
                                              Frédéric JACQUOT

                                               Raphaël DONATI
                                               Personnel R&D

                                          CNR Fièvres hémorragiques

                                                Sylvain BAIZE
                                                                      | PAGE 29
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