Pathogènes transmis par les tiques - Situation actuelle à l'intention des laboratoires de diagnostic Suisse - Association des responsables de ...

Pathogènes transmis
   par les tiques
Situation actuelle à l’intention des laboratoires de
                 diagnostic Suisse

      Reto Lienhard, CNRT - Laboratoire Borrelia,
      ADMed Microbiologie, La Chaux-de-Fonds

                          1

Le Matin - RTS 2014-2018

2

3

4

5

6

7

Tiques en Suisse
•   Estimation du nombre d ‘espèces (Source CSCF 2018)

    •   13 Ixodes spp (I.ricinus, I.canisuga, I.hexagonus)

    •   3 Hyalomma spp

    •   3 Rhipicephalus spp

    •   3 Argas spp

    •   2 Haemaphysalis spp (H.punctata VS)

    •   2 Dermacentor spp (D.marginatus VS)

    •   Total de 23 Ixodidae et 3 Argasidae

                                       8

Centre Suisse de
Cartographie de la
Faune, Neuchâtel

                     9

Où et quand les tiques
piquent-elles les humains
            ?

            10

11

12

Quelles tiques piquent les
         humains
            ?

            13

En Suisse

•   Ixodidae et très majoritairement I.ricinus

•   Autres tiques - incidence peu connue

•   Identification des tiques envoyées par l’Application
    « Tique » peut être une bonne approche.

•   !! Attention aux retours de Voyage !!

                            14

Quels micro-organismes
  peut-on attraper ?

          15

Liste sélectionnée = potentiel
Virus
                                                         Bactéries
•   Encéphalite à tique 3s-types (MEVE - FSME - TBE)
                                                         •   Borrelia spp
•   Louping ill
                                                         •   Anaplasma phagocytophilum (anc.
•   Sheep encephalitis - Goat encephalitis
                                                             Ehrlichia)
•   Powassan
                                                         •   Ehrlichia spp (E.chaffeensis , E.canis,)
•   Omsk hemorrhagic fever
                                                         •   Rickettsia spp (R.helvetica, R.slovaca
•   Kyasanur Forest disease
                                                         •   Coxiella spp
•   Fièvre hémorragique de Congo-Crimée
                                                         •   Francisella spp (F.tularensis)
•   Virus Eyach, virus Erve, Orbiviridae, etc…
                                                         •   Bartonella spp (B.henselae, B.birtlesii)
Parasites

•   Babesia spp (B.microti, B.canis, B.divergens,        •   Chlamydo- like
    B.venatorum)
                                                         •   Cand. Midichloria mitochondrii
•   Theileria spp

                                                    16

Critères = Liste raisonnée

Publications = détection des acides nucléiques !

•   Mise en culture de micro-organismes

•   Compétence vectorielle

•   Clinique

•   Pathogénicité

•   Symbionte ? Microbiome ?

                               17

Quels sont les risques d’attraper un pathogène ?

•   Tiques /humain     n=314          •   prises de sang N= 626 (piqures
                                          de tiques 335 - EM=291
•   positives pour pathogène (53%)
    B.burgdorferi s.l.  (29.3%)       •   B.burgdorferi s.l. n=1 (0.2%)
    N.mikurensis          (5.4%)          N.mikurensis           (1.1%)
    A.phagocytophilum (1.%)               A.phagocytophilum      (0.8%)
    Rickettsia spp      (22%)             Rickettsia spp         (0%)
    Babesia spp           (3.5%)
                                          Babesia spp            (0.5%)
    B.miyamotoi          (2.3%)
                                          B.miyamotoi           (0.2%)
•   co-infections 34/314 (11%)
                                     18            Plos Neglected Tropical Disease 2016

Quels sont les risques de tomber malade ?

 Sur les 16 personnes présentant de l ADN dans le sang

 •   9 EM, qui ont toutes eu un traitement Doxycycline (ou Amoxy)

 •   Aucun symptôme typique du pathogène détecté observé

 •   Besoin d’études prospectives plus larges

                                   19

MTT en Suisse

•   Maladie de Lyme (Borrelia burgdorferi sensu lato)

•   Méningo-encéphalite verno-estivale (FSME- TBE)

•   Tularémie (Francisella tularensis ssp holarctica)

•   Ehrlichiose (Cand. Neoehrlichia mikurensis)

                            20

Vigilance

•   Anaplasmose (A.phagocytophilum)

•   Babésiose (B.venatorum)

•   Borréliose des fièvres récurrentes (B.miyamotoi)

•   Rickettsiose (R.slovaca, R.helvetica, R.monacensis)

                            21

Médecine des voyages
•   Borrélioses des fièvres récurrentes

•   Babésiose

•   Ehrlichiose ou Anaplasmose

•   Rickettsioses (f. pourprées, f. boutonneuses)

•   Arboviroses

                            22

Importance vétérinaire

•   Anaplasmose ( A.ovis, A.platys)

•   Babesiose (B.canis, B.divergens, B.microti-like)

•   Ehrlichiose (E.canis)

•   Virus Eyach, virus Erve, Orbiviridae (I.ricinus /
    Europe centrale)

                             23

et les autres ?
Symbiotes - commensaux - pathogènes

•   Chlamydo-like

•   Francisella spp

•   Coxiella spp

•   Midichoria mitochondrii

•   etc.

                              Pilloux L, Aeby S, Gaümann R, Burri C, Beuret C, Greub G. Appl Environ Microbiol.
                              2015 Dec;81(23):8177-82

                                  24

Effets sur la population
•   Les tiques porteuses de pathogènes multiples

•   Vecteurs majeurs dans l’hémisphère Nord

•   Moult exemples et témoignages sur le web

•   Beaucoup de questions sur le diagnostic

•   Réponses scientifiques et médicales insuffisantes ou peu adéquates

•   Communication peu efficace et peu constructive par voies indirectes

•   En attente de projets nationaux sur les MTT et les pathogènes

•   Nécessité d’un dialogue

                                      25

Demandes d’analyses
•   >80% ne sont probablement pas motivées

•   données épidémiologiques absentes

•   recherches à large (ou « vague ») spectre

•   et demandes dirigées par convictions

•   Valeur pré-test très faible car souvent très peu
    probable.

                             26

Diagnostic microbiologie
•   Techniques directes versus indirectes

•   De l’observation directe par la Culture vers le
    Diagnostic moléculaire pour aboutir à la Sérologie

•   Généralement le plus facile (et souvent moins
    cher)

•   Rôle du CNRT = aide au diagnostic des MTT

                            27

Essentiel =

      contexte clinique
              +
  contexte épidémiologique
(en Suisse et dans le Monde)

            28

MEVE - FSME -TBE
•   Méningo-encéphalite
    morbidité élevée et risque de
    mortalité

•   Zones à risques

•   Est de l’Europe plus virulent

•   Vaccin efficace
                                         OFSP, mars 2018
•   Suisse cartographie OFSP

                                    29

Diagnostic microbiologie

•   Sérologie dans le sérum IgM et IgG -

•   Production intrathécale pas utile et

•   Ne jamais tester LCR seul !

•   PCR sans valeur diagnostic ! au moment des symptômes
    neurologiques le LCR est négatif

•   CNRT - Labo Spiez Référent FSME

Spécificité des IgG - test de neutralisation - Echec de vaccination? -
quantification IgG, test d’avidité (2018 ?) - Matériel d’autopsies: PCR

                                       30

F.tularensis
•   Agent de la tularémie sous forme moins
    virulente en Europe F.tularensis holarctica

•   Transmission par contact animaux,
    aérosol, eaux contaminées, arthropodes
    (CH 57% dont),….

•   2009: 6 cas / 2012: 41 /2015: 50 et en
    2017: 120 !!

•   Détection rare dans les tiques (

Diagnostic microbiologie

•   Culture de prélèvements des sites infectés -Hémocultures , ponction,
    plaies cutanées, ganglions, frottis oeil, frottis ORL, LBA,…

•   Identification ! MALDI-TOF ok si base de données adéquates.
    Croissance sur gélose au sang, Gram nég. faible, cat faible pos,
    oxidase nég. API NH mais

•   CNRT - PCR spécifique directement sur ces prélèvements,
    hémocultures à BGN fin mal coloré ou pour identification plus sûre et
    rapide des colonies.

•   Sérologie - Ig totaux ICT, mais attention faux positifs ! (EIA IgG et IgM
    ?)

•   Labos de référence OFSP (Spiez) et aussi vétérinaire (Berne)

                                      32

Cand. N.mikurensis

•   Tiques infectée (.6% à 23%)
    en Suisse 6.4%

•   Encore peu de cas en Europe

•   Patients immuno-compromis

•   Fièvre, nausée, arthralgie,
    thrombocytopénie, forme
    aiguë ou chronique

                                  33

Diagnostic microbiologie

•   PCR large spectre (arn 16S) puis séquence sur
    prélèvements stérile

•   CNRT - PCR spécifique

•   Culture ? (pas disponible actuellement, essais sur
    cultures de cellules)

•   Pas de sérologie disponible

                            34

A.phagocytophilum
•   Répartition aux US liée à
    I.scapularis - zone endémique

•   Europe présent dans I.ricinus
    et pathogène modéré chez
    humains documenté en
    France , Slovénie, .… Pas de
    cas publié en Suisse.

•   « Ehrlichiose » granulocytaire

•   Etat « grippal » - syndrome GI

                                     35

Diagnostic microbiologie
•   Giemsa sur frottis sanguin et observation de
    moral dans les granulocytes.

•   CRNT - CHUV et ADMed - PCR
    A.phagocytophilum

•   CNRT - ADMed - Sérologie IFI avec limite au
    titre de 128. Selon littérature les cas cliniques
    présentent titres >256.

•   Séroprévalence en CH au titre de 256: CH
    romande 1.4% - BEFR 5.7% -CHorientale 5.1%
    (Aliyiev et al Poster), - NE 1.4% (R.Lienhard et al Poster
    ICLB2010)

•   Limite positivité fixée au titre de 128
    séroprévalence 3,1%

•   Probabilité pré-test faible = VPP faible !!

                                                 36

E.chaffeensis
•   Amblyoma americanum, ….

•   E.canis chez les chiens

•   E.ewingii
                                       joan_b@eosinc.com
•   E.muris-like

•   Ehrlichiose monocytaire

•   syndrome « grippal » - rash
    (enfants) - syndrome GI -
    Atteinte SNC -

                                  37           CDC- US

Diagnostic microbiologie

•   Giemsa sur frottis sanguin - observer les monocytes
    et la formation de morula dans le cytoplasme

•   PCR Ehrlichia spp (pas disponible en CH, cf CNRT)

•   PCR arn16S et séquençage permet identifier autre
    espèce opportuniste ou pas connue

•   CNRT - ADMed - rétrospectivement si probabilité
    pré-test élevée - Sérologie IFI - titre limite pas défini -
    attention séro-épidémiologie.

                               38

B.miyamotoi
•   Borrelia de fièvres récurrentes ne présentant
    généralement pas de rash

•   découverte au Japon (1995)

•   Pas lié à B.burgdorferi sensu lato ni au symptôme
    de la borreliose de Lyme

•   Cas graves en Sibérie - I.persulcatus - Cas décrit
    aux USA I.scapularis

•   « Case report » en Europe mais actuellement sans
    incidence (immuno-compromis?)

•   seules des valeurs de prévalence et co-infection
    dans toutes les régions possibles mais basées sur
    l’ADN

•   Etat grippal pouvant mener à des atteintes
    neurologiques

                                                 39

Diagnostic microbiologie

•   Comme pour les Borrélies des fièvres récurrentes

•   Giemsa sur un frottis - observation de spirochètes

•   CNRT - PCR large spectre ou B.miyamotoi spécifique - mais
    attention les amorces 16S pour Borrelia burgdorferi s.l. détecte
    aussi B.miyamotoi (CQE et panels du CNR de Munich, groupe de
    V.Fingerle)

•   Typage (MLSA) fait en collaboration avec Dr. G.Margos (Munich)

•   Sérologie à l’essais sur une protéines rec. GlpQ ou lysat mais
    réactions croisées très marquées avec d ‘autres Borrélies
    (B.hermsi ou B.burgdroferi) P.J.Krause et al. PLoS ONE 2018

                                   40

Rickettsia
•   Spotted Fever Group: R.conori
    - R.sanguineus

•   SENLAT - TIBOLA / escarre:
    R.slovaca, R.raoulti -
    Dermacentor reticulatus et
    D.marginatus

•   LAR (lymphangite)

•   Rickettsiose africaine
                                         Fournier, Villars2013
•   Europe - SFR à suivre:
    R.monacensis - R.helvetica -
    R.aeschlimani - R.massiliae

                                    41

Diagnostic microbiologie

•   Ponction, biopsie, écouvillonnage d’escarre, LCR,
    etc.

•   PCR - pan rickettsia ou plus spécifique au CNRT -
    CHUV, ADMed + coll. ICHV

•   Sérologie IgG et IgM CNRT - CHUV et coll. ICHV

•   Réactions croisées importantes analyses
    spécialisées envoyées CNR, Unité rickettsies à
    Marseille.
                           42

Babesia microti
•   Ixodes scapularis (USA)

•   Retraitée avec 3 semaines de fièvre,
    sueur, anémie, thrombocytopénie,
    hépatopathie et forme annulaire sur
    le frottis de sang (parasitémie 1%).
    Retour de Long Island.

•   Ixodes ricinus (CH)

•   Pas de cas cliniques publiés -
    présente dans la tique. Connu
    B.divergens bovins (très rares chez
    humains!). B.venatorum - rôle?

•   Autres tiques - Babésioses canines.

                                           43

Diagnostic microbiologie

•   Frottis de sang et goutte épaisse (= Plasmodium)

•   ICT rapide Malaria négatif

•   PCR Plasmodium spp négative - (PCR Babesia plus sûre pour éviter
    les faux négatifs)

Si la probabilité pré-test est élevée - documenter rétrospectivement par

•   Sérologie IFI IgG-B.microti (CNRT - ADMed) - titre 64 = positif limite -
    cas clinique titre >512 !

Erreur = demandes non documentées à faible probabilité car l’analyse
relève alors plus de la séro-épidémiologie que du diagnostic . Contact -
Réaction croisée - voyage

                                      44

Et la maladie de Lyme
        alors ?

          45

Borreliose: A+B=0
•   Borréliose tardive + patient séronégatif = 0

•   Toute clinique + patient séropositif = 0

•   Borréliose précoce + sérologie = 0

•   IgM spécifique + activité de l’infection = 0

•   Anticorps + datation de l’infection = 0

                             46

A + B = Borréliose

•   Pléiocytose + SIA + bandes oligoclonales

•   Pléiocytose + CXCL13 + IgG-VlsE (LCR)

•   Monarthrite + IgG Blots + PCR positive

•   Clinique typique + traitements

                           47

THM
•   Borréliose de Lyme et MEVE en routine dans laboratoire de
    microbiologie - CNRT support pour cas difficiles
    (neuroborréliose, échec de vaccination ou expertise de cas)

•   Cas publiés rares - suspicions peuvent être diagnostiqué
    dans labo spécialisés.

•   Retour de voyage - zones endémiques - Diagnostic au CNRT
    possible

•   Cas CH non publié - documenter avec des méthodes directes
    disponibles au CNRT pour confirmation et description du
    pathogène (culture ou NGS)

                                48

Collaborations - Information -

•   CNRT - NRZK (Spiez - La Chaux-de-Fonds - Lausanne)

•   ADMed Microbiologie

•   CHUV Microbiologie

•   ICHV Sérologie

•   CNR Borrelia Munich et Strasbourg

•   CNR UR, Marseilles

•   ESGBOR

•   ESCCAR

                                  49

Merci pour votre attention

            50