Santé des plantes - FORMATION RECHERCHE INNOVATION - Inra
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Enjeux de la santé Expertises et thèmes des plantes de recherche en région Pays de la Loire Pour répondre aux enjeux de la santé des plantes, des approches de biologie intégrative mobilisent des expertises en génétique, Améliorer la sécurité alimentaire phytopathologie, physiologie, biochimie, bioinformatique, sta- dans un contexte de population croissante. tistiques, modélisation… au service de l’étude des : MALADIES ÉMERGENTES INTERACTIONS HÔTE-PATHOGÈNE ANALYSES BIOAGRESSEURS PHÉNOTYPAGE HAUT-DÉBIT DIAGNOSTIC RÉSISTANCE INTERACTIONS HÔTE-ENVIRONNEMENT SANTÉ DES PLANTES BIOSTIMULATION QUALITÉ SANITAIRE DÉFENSE STRATÉGIES DE LUTTE AGROÉCOSYSTÈME BIOCONTRÔLE Protéger l’environnement et la SEMENCES MODE D’ACTION DES INSECTICIDES biodiversité : concevoir de nouvelles STRESS BIOTIQUES PLANTES PARASITES méthodes de protection des ITINÉRAIRES CULTURAUX AMÉLIORATION DES PLANTES plantes pour réduire les risques STRESS ABIOTIQUES environnementaux des produits PRODUITS DE PROTECTION DES PLANTES phytosanitaires. FOCUS SUR DES MODÈLES D’ÉTUDE POMMIER CAROTTE ROSIER TAVELURE FEU BACTÉRIEN BRÛLURE FOLIAIRE TACHE NOIRE PUCERON CENDRÉ Réduire l’impact sur la santé humaine : SEMENCES DE HARICOT TOURNESOL MULTI-ESPÈCES agriculteurs et consommateurs (zéro résidu). XYLELLA GRAISSE COMMUNE OROBANCHE POIS VIGNE SEMENCES DE LUZERNE PUCERON MILDIOU NÉMATODES LES ÉQUIPEMENTS OU RESSOURCES MUTUALISÉES S’adapter au changement climatique : prédire, gérer l’émergence et • CIRM-CFBP : la collection française de bactéries associées aux plantes la dissémination des maladies conserve des ressources stratégiques pour la santé des plantes. Sa particularité : et ravageurs des plantes, détenir des représentants de l’ensemble de la diversité des bactéries pathogènes s’adapter aux nouvelles conditions de plantes. Ses missions : préserver les ressources et les données associées, les environnementales qui rendent mettre à disposition de la communauté scientifique internationale. les cultures plus sensibles. • Plateforme PHENOTIC : outils de phénotypage basés essentiellement sur l’acquisition et le traitement d’images pour le phénotypage des semences, plantules et plantes entières. Sa particularité : proposer des outils d’analyse phénotypique des interactions hôtes-agents pathogènes. •M ATREF : un réseau de matériels de référence (bioagresseurs et semences) pour l’étude de la résistance des variétés légumières aux bioagresseurs, dans Prendre en compte les échanges le cadre de l’inscription au Catalogue par le Comité Technique Permanent de la internationaux qui favorisent Sélection (CTPS), de la protection des variétés par l’OCVV ou l’INOV et pour toutes l’introduction de nouveaux demandes externes. bioagresseurs des plantes.
Les formations spécifiques • Licence professionnelle productions végétales parcours gestion de la santé des plantes UNIVERSITÉ D’ANGERS – FACULTÉ DES SCIENCES / AGROCAMPUS OUEST > Formation ouverte à l’alternance. Former des spécialistes de la protection des plantes et des méthodes de lutte alternatives à l’utilisation de pesticides pour les filières du végétal spécialisé (horticulture ornementale, maraîchage, arboriculture, zones non agricoles, vigne, plantes aromatiques et à parfum, semences). Débouchés visés : responsable technique (diagnostic, expérimentation, conseil phytosanitaire, réglementation, contrôle phytosanitaire, homologation), technico-commercial, chef de culture. • Master Biologie Végétale – parcours Gestion de la Santé des Plantes (M2) UNIVERSITÉ D’ANGERS – FACULTÉ DES SCIENCES / UNIVERSITÉ DE NANTES / AGROCAMPUS OUEST > Formation ouverte à l’alternance. Former des cadres experts en protection des plantes, avec une spécialisation dans l’analyse des interactions plantes-bioagresseurs et de la réponse des plantes aux contraintes biotiques et abiotiques, dans l’expérimentation et l’innovation en protection des cultures. Module de formation par la recherche au sein des laboratoires de la SFR Quasav . Obtention du Certiphyto. Débouchés : chef de projet en pathologie végétale, ingénieur d’étude, de R&D, responsable expérimentation de produits phytosanitaires, responsable homologation, conseiller phytosanitaire, enseignant, doctorat (dont CIFRE). • Ingénieur en Horticulture, parcours Protection des Plantes Angers et Environnement appliquée à l’Horticulture AGROCAMPUS OUEST 1er pôle > Formation sur deux sites, Angers et Rennes, ouverte à l’alternance. Fournir aux étudiants des connaissances scientifiques et méthodologiques ainsi de formation que les outils de réflexion nécessaires à l’analyse des problèmes de protection du végétal en France des cultures au sein des agrosystèmes horticoles, à la conception de méthodes de avec 3000 étudiants protection innovantes, efficaces et durables, à la prévision de leurs conséquences aux de bac +2 à bac +8 plans économique, environnemental et sanitaire. Ce parcours est dédié aux cultures spécialisées : légumes, fruits, ornementales et semences. Débouchés : ingénieur R&D, qualité ou en expérimentation, technico-commercial, Pour en savoir plus chargé de clientèle, responsable homologation phytosanitaire ou biocontrôle, chargé sur les formations et d’étude ou conseiller technique en protection des plantes, ingénieur environnement les métiers du végétal : ou développement durable, responsable parcs et jardins, évaluateur scientifique, votreavenirvegetal.fr enseignant, doctorat (dont CIFRE). • Des modules sur la santé des plantes au sein d’autres formations initiales ou continues proposés par : LYCÉE ANGERS LE FRESNE / CAMPUS DE POUILLÉ / AGROCAMPUS OUEST / ESA (ÉCOLE SUPÉRIEURE D’AGRICULTURES) / ISTOM / UNIVERSITÉ D’ANGERS • Summer School Plant Health and Quality Université d’Angers / Agrocampus Ouest / Anses / Esa / Geves / Inrae / Université de Nantes Permettre à des étudiants de Master provenant du monde entier de découvrir les récentes avancées des recherches conduites au sein des unités de recherche rassemblées au sein de la Structure Fédérative de Recherche Qualité et Santé du Végétal (SFR Quasav) dans les domaines de la santé et de la qualité des plantes à travers des conférences avec des chercheurs internationaux, des travaux pratiques et des visites de laboratoires et d’entreprises. http://summerschools.univ-angers.fr/en/index/about-schools/schools/plant-science.html
La recherche en région Pays de la Loire CHAQUE RÉSULTAT EST ASSOCIÉ À UNE ÉCHELLE TRL QUI PERMET D’ÉVALUER LE NIVEAU DE MATURITÉ TECHNOLOGIQUE 1à3 Recherche fondamentale et appliquée : du principe à la preuve de concept Interactions d’application plantes - bioagresseurs 4à5 Recherche avancée • Un nouveau scénario d’émergence de daptation d’Alternaria brassicicola •A et démonstration : des composants au virulence dans les vergers à la phase de dessiccation des prototype, validation en laboratoire ou Risques épidémiologiques encourus semences en environnement représentatif par l’introduction d’une population de Identification de protéines de type V. Inaequalis (tavelure) hydrophilines pour protéger les B Le Cam, IRHS cellules contre le stress hydrique 7 à 9 Qualification et T Guillemette, IRHS opérationnalité technologique : • Contrôle génétique de la tavelure : de la démonstration du prototype en éphémère ou durable ? •D iaporthe angelicae et D. eres : environnement opérationnel au produit La combinaison de facteurs de agents responsables des grillures de série résistance dans une même plante d’ombelles de la carotte porte-graine apporte des efficacités contrastées Mise au point d’un outil d’aide à la selon les vergers décision des traitements fongicides UNITÉS DE RECHERCHE ET V Caffier, IRHS P Poupard, IRHS EXPÉRIMENTALE • IRHS : Institut de recherche en • Identification d’un promoteur de •C ombiner résistance variétale horticulture et semences pommier activé spécifiquement par à l’alternariose et qualité une attaque de feu bactérien organoleptique chez la carotte • SIFCIR : Signalisation fonctionnelle Vers la production de pommiers Des analyses biochimiques et des canaux ioniques et récepteurs intragéniques résistants à cette sensorielles pour identifier les • LBPV : Laboratoire de biologie et maladie métabolites liés à l’amertume pathologie végétales E Chevreau, IRHS V Le Clerc, IRHS • LEVA : Légumineuses, écophysiologie • Emergence de Xylella en France •L ’aldaulactone : une toxine fongique végétale, agroécologie La diversité de Xylella fastidiosa originale impliquée dans l’agressivité • GRAPPE : Groupe de recherche en suggère une présence ancienne d’Alternaria dauci sur la carotte agroalimentaire sur les produits et MA Jacques, IRHS Mais la carotte résiste… procédés R Berruyer, IRHS • LSV-BVO : Laboratoire santé des • Apparition de nouvelles bactéries végétaux - unité bactériologie, pathogènes sur plantes •D éveloppement d’outils d’étude de la virologie, OGM Mécanismes moléculaires impliqués résistance de la rose à la maladie de dans l’émergence de Xanthomonas la tache noire • EGI : équipe Écologie génétique des T Boureau, IRHS L Hibrand-Saint-Oyant, IRHS insectes de l’IGEPP • GEVES : Groupe d’étude et de contrôle • Voies de transmission de •S ensibilité des cibles aux insecticides des variétés et des semences Xanthomonas citri pv. fuscans (Xcf) Moduler la réponse en prenant en • HORTI : Unité expérimentale horticole aux semences compte l’ensemble des facteurs Co-localisation des bactéries cellulaires et moléculaires pathogènes et commensales dans les V Raymond, SIFCIR graines de haricot MA Jacques, IRHS • I mpact d’une exposition des insectes à des doses sublétales d’insecticides • Infection par des souches de Mise en place de modifications Xanthomonas responsables de la physiologiques et moléculaires graisse commune du haricot permettant à l’insecte de s’acclimater Rôle des effecteurs TAL en lien avec à son environnement l’adaptation à l’hôte pour l’élaboration V Raymond, SIFCIR de stratégies de résistance MA Jacques, IRHS
Diagnostics et analyses • Evaluation de la performance de tests • Dityluz : outils méthodologiques •T est de résistance des variétés de de détection et d’identification de pour la détection et la quantification piments aux nématodes Pseudomonas syringae pv. actinidiae du nématode des tiges, Ditylenchus Pour les études de Distinction Agent causal du chancre bactérien du dipsaci, sur semences de luzerne Homogénéité Stabilité (DHS) Kiwi Mise au point d’un test de viabilité et V Grimault, GEVES A Cunty, LSV-BVO adaptation de l’échantillonnage et de •T est Belarosa de résistance des l’échantillon analysé •M osa Hordeum : Mosaïques de l’orge : V Grimault, GEVES rosiers à la maladie de la tache noire identification des virus prédominants Pour l’évaluation du niveau de impactant le rendement et la qualité • Protocole d’évaluation de la résistance résistance des variétés de rosier technologique du chanvre à l’orobanche rameuse vis-à-vis de souches du champignon Des outils de diagnostic moléculaire Pour l’évaluation de nouvelles variétés Diplocarpon rosae L Hibrand Saint-Oyant, IRHS pour orienter la sélection vers une de chanvre résistance durable. P Simier, LBPV • Méthode de détection et d’identification V Cadot, GEVES de Xylella en une seule opération Une nouvelle qPCR multiplex pour la détection et l’identification simultanée des sous-espèces de Xylella fastidiosa MA Jacques, IRHS Lutte contre les bioagresseurs • Utilisation des Stimulateurs de • Méthode de lutte biologique contre les •P hénotypage par analyse d’image Défense des Plantes (SDP) en verger agents pathogènes au sein des graines Enregistrement du développement Une solution possible pour diminuer Une compétition entre les bactéries des plantes en continu et de façon les pesticides pour le partage des ressources automatique pour caractériser la MN Brisset, IRHS nutritives réceptivité aux SDP et la réponse aux M Barret, IRHS biostimulants • Impact des stimulateurs de défense D Rousseau, IRHS des plantes (SDP) sur un ravageur du • Un insecticide dopé par un agent pommier et sur ses ennemis naturels synergisant nanoencapsulé •L ogiciel MARCUS pour la simulation Le goût et l’odeur du pommier Optimiser l’effet du traitement tout en de la dispersion d’une maladie stimulé indisposent le puceron cendré réduisant les doses Pour la gestion des maladies par la Dysaphis plantaginea V Apaire-Marchais, SIFCIR diversification des cultures annuelles A Degrave, IRHS et pérennes • Méthode de traitement alternative en N Sapoukhina, IRHS • Mise en place d’une défense viticulture efficace de la plante en réponse aux C Maury, GRAPPE •q PFD® - Dispositif pour déterminer agressions des agents pathogènes ou étudier l’état de stimulation des Mise en évidence d’un peptide sécrété • Outils pour l’écoconception des défenses naturelles de plantes qui régule la réponse aux stress itinéraires techniques viticoles Un outil moléculaire disponible sur biotiques et l’élongation racinaire Vit’LCA outil de calcul Analyse des pommier, vigne, tomate, pomme de S Aubourg, IRHS Cycles de Vie (ACV) des pratiques terre et blé viticoles & Jeu sérieux Vitipoly pour MN Brisset, IRHS • Processus écologiques impliqués l’écoconception collective. dans l’assemblage du microbiote des C Renaud, GRAPPE •A daptation de l’outil qPFD au modèle semences carotte • Plantes biosenseurs Equipe QuarVeg, IRHS Vers une méthode alternative à l’enrobage des semences. Outil de laboratoire pour caractériser le •P uce qPFD abiotique M Barret, IRHS mode d’action des SDP et biostimulants Outil de laboratoire pour caractériser sur les mécanismes de défense et sur un état de stress de la plante le contrôle de la croissance MN Brisset, IRHS P Grappin, IRHS
Les projets public / privé INTERACTIONS PLANTES-BIOAGRESSEURS DIAGNOSTICS ET DÉTECTIONS PRÉCOCES • INVITE • VALITEST (H2020 2019-2024) (H2020 2018-2021) Amélioration de l’efficacité de Validation des tests de diagnostic l’évaluation variétale et des pour soutenir la santé des plantes informations dont disposent les - Améliorer les processus de utilisateurs sur les performances détection et d’identification des des variétés dans diverses organismes nuisibles (bactéries, conditions de production, dont virus, champignons, nématodes, la résistance aux maladies et arthropodes ou mauvaises parasites. herbes). • Thèse CIFRE IRHS-HM Clause (2018-2021) • XF-ACTORS (H2020 2016-2020) Origine des épidémies de nervation blanche de la courgette. Amélioration des outils de détection précoce de Xylella fastidiosa, la prévention des contaminations et leur contrôle. • Resilens (CASDAR 2019-2021) • RustWatch Évaluation de la résistance aux (H2020 2018-2022) bruches de la collection de Mise en place d’un système ressources génétiques de lentilles. d’alerte précoce pour les rouilles des blés tendres et durs afin de réduire l’usage des fongicides. STRATÉGIES INNOVANTES DE LUTTE CONTRE LES BIOAGRESSEURS • miPEPITO • OPTIMA (ANR PRCE 2017-2020) (H2020 2018-2022) Utilisation de micropeptides pour Développement d’une méthode de contrôler l’interaction tournesol gestion intégrée des bioagresseurs – orobanche et fournir une en vergers de pommiers (tavelure), nouvelle méthode de biocontrôle sur vigne (mildiou) et sur légumes du parasitisme des orobanches et de plein champ (carotte/alternariose) strigas. en mettant en œuvre l’utilisation de bio pesticides, des modèles de prédiction et de détection précoces • PEEL (PIA ADEME 2018-2023) des maladies, des techniques de pulvérisation de précision. Production d’Eliciteurs par Extraction Liquide. Mise au point des solutions de biocontrôle issues de la valorisation de • Actifol coproduits disponibles en masse (drèches de tomates et marc (CASDAR 2019-2022) de pommes). Mise au point des méthodes d’évaluation de l’efficacité des nouveaux produits de traitements • LABCOM MATCH de semences sur laitue (ANR 2019-2022) (biocontrôle, biostimulation). Mise au point de Méthodes Alternatives aux Traitements Chimiques sur Hortensia. • ADVANTAGE Maladies du bois de la vigne : nouveaux produits de protection et de service pour une stratégie • Friendly Fruit globale de production durable, de (EIT Climate-Kic 2018-2021) la pépinière au vignoble. Test, étude de l’impact et transfert de bonnes pratiques • PROTECT+ respectueuses de l’environnement (FUI 2019-2023) sur les cultures de pommier et Déploiement du biocontrôle sur grandes cultures en fraisier. développant une solution globale qui combine solution de biocontrôle innovante et méta-OAD prenant en compte les contraintes environnementales.
Les innovations • La Start-Up Green Impulse s’engage dans le développement de nouvelles stratégies de sensibilisation des champignons pathogènes des plantes permettant ainsi une meilleure performance et un déploiement rapide des alternatives aux fongicides. Green Impulse s’appuie notamment sur une technologie brevetée par l’Université d’Angers, les SENSITINES®. Cette Technologie vise à fragiliser le champignon afin de le rendre plus sensible aux moyens de défense naturelle de la plante. Ainsi, les SDP du marché, tel que le produit KITAE® commercialisé par Green Impulse, associés aux SENSITINES® sont plus efficaces. E Pajot, Green Impulse •A rexhor Pays de la Loire propose des prestations d’évaluation des biostimulants selon une méthode développée dans la cadre du LabCom ESTIM. Dispositif modulable qui permet d’évaluer l’efficacité en moins d’un mois sur jeunes plants de tomates, de biostimulants ou formulations, de doses et de modes d’application dans différentes conditions de stress abiotique. A Ferre, Arexhor Pays de la Loire • L e centre R&D de Vegepolys Valley, dans le cadre d’une collaboration avec De Sangosse et Arvalis et au sein du Consortium Biocontrôle, a adapté sa méthode de prélèvement avec carte FTA au champ sur la culture blé. Cette méthode permet de confirmer un effet éliciteur des défenses au champ. C Bonneau, Centre R&D, Vegepolys Valley Vegepolys Valley est partenaire du programme PEI santé du végétal, projet inter-filières, porté par la Chambre d’Agriculture des Pays de la Loire, qui a pour finalité d’aider les agriculteurs à améliorer la gestion sanitaire des cultures. Dans le cadre du projet, une journée d’échanges et six webinaires ont été proposés. Au travers de son axe d’innovation « Santé du Végétal », Vegepolys Valley accompagne les acteurs des filières, de la recherche ainsi que les entreprises en lien avec la protection des plantes et la nutrition pour mettre au point de nouveaux intrants et les outils associés pour les déployer au champ avec précision et fiabilité. Ainsi, Vegepolys Valley a par exemple accompagné les projets : • AGROPASS : étude de faisabilité d’une plateforme de test et de démonstration d’AGROéquipements pour les alternatives au désherbage chimique pour les filières PAM, Semences et autres cultures Spécialisées. Porteur : Iteipmai. • ASEEDS : optimisation de l’implantation des semis de blé et de maïs dans des conditions de stress biotiques et abiotiques par la recherche et le développement de solutions alternatives applicables aux semences. Porteur : Limagrain. • L e Contrat de Solutions, initiative de la FNSEA, rassemble aujourd’hui 41 organisations professionnelles agricoles et de la recherche, au sein d’une association, qui s’engagent en matière de réduction des utilisations, des risques et des impacts des produits phytosanitaires, en cohérence avec les attentes des consommateurs et des citoyens. 300 pistes de solutions durables, existantes ou d’avenir, techniquement accessibles, telles que des pratiques agronomiques, des outils de biocontrôle, ou encore des variétés tolérantes aux principales maladies ont été identifiées. Le Contrat de Solutions comporte à ce jour 69 fiches solutions prêtes à être déployées plus largement sur le terrain. Chaque semestre de nouvelles fiches solutions sont proposées. Un suivi est opéré avec un engagement de présentation des indicateurs de déploiement par solution et le cas échéant une actualisation des actions à conduire. Plus d’informations sur : www.contratsolutions.fr
Agenda des évènements en Pays de la Loire Appel à idées projets innovants 14 > 16 janvier 2020 Alternatives aux produits phytosanitaires SIVAL, Angers en productions végétales 17 février > 13 mars 2020 Made in Angers (visites des acteurs du campus du végétal, du lycée En tant que partenaire du Contrat de Solutions, Vegepolys Valley Le Fresne et campus de Pouillé) lance un appel à idées de projets innovants, du 15 janvier au 20 > 22 mars 2020 15 mars, pour booster les recherches dans le domaine. Expo Flo, Agrocampus Ouest, Angers Cet Appel à Idées a pour objectif d’accompagner l’émergence et le développement 28 & 29 mars 2020 de solutions qui répondront aux enjeux soulevés par la diminution de l’utilisation de Salon de plantes exotiques Edenia, Istom Angers produits phytopharmaceutiques en agriculture. 2 & 3 avril 2020 QUELLES IDÉES SOUMETTRE ? Formation continue : Maladies Des propositions mobilisant notamment des leviers agro-écologiques, le numérique physiologiques de conservation des fruits : et la robotique, le big data, le biocontrôle, la génétique et les biotechnologies, etc état des connaissances et moyens de lutte, Agrocampus Ouest, Angers L’éligibilité de l’idée ou du projet sera évaluée selon son caractère innovant, son approche marché, son caractère collaboratif. 8 mai 2020 Sortie du rosier de la libération, un nouveau QUI PEUT DÉPOSER ? rosier résistant, à l’occasion des 75 ans de la Tout acteur ayant la volonté de développer une innovation dans les filières agricoles et libération de l’Europe, Angers industries du bois (papeteries, bioraffineries) : une entreprise, acteur des filières de Conception graphique : Université d’Angers – Impression : service reprographique UA – Janvier 2020 27 juin > 17 juillet 2020 productions végétales mais aussi un agro-fournisseur, un équipementier, un institut Summer school Plant health & Quality, Angers technique, un laboratoire de recherche. 8 > 10 septembre 2020 Plus d’informations sur : www.aipi-vegetal.fr Salon du végétal, Angers Automne 2020 2e journée des acteurs de la conservation des Ressources Phytogénétiques 1 & 2 décembre 2020 Rencontres du végétal, Angers Agrocampus Ouest Anses Campus de Pouillé Edgard Pisani Journées portes ouvertes agrocampus-ouest.fr anses.fr campus-pouille.com eap49.educagri.fr Agrocampus Ouest • 18 janvier 2020 - 9h à 13h • 8 février 2020 - 13h à 17h Université d’Angers • 8 février 2020 - 9h à 17h Esa Le Fresne Esa Geves Gnis eap49.educagri.fr groupe-esa.com geves.fr gnis.fr • 18 janvier 2020 - 9h à 17h • 8 février 2020 - 9h à 17h • 7 mars 2020 - 9h à 12h Istom • 22 janvier 2020 - 17h à 20h • 8 février 2020 - 9h30 à 17h UNIVERSITÉ DE NANTES • 7 mars 2020 - 13h à 17h Campus de Pouillé Inrae Istom Université d’Angers Université de Nantes • 31 janvier 2020 - 16h à 19h inrae.fr/centres/pays-loire istom.fr univ-angers.fr univ-nantes.fr • 1er février 2020 - 9h à 13h • 7 mars 2020 - 9h à 13h • 13 mai 2020 - 16h à 19h Le Fresne • 8 février 2020 - 9h à 13h : post bac • 7 mars 2020 - 9h à 17h Edgard Pisani Vegepolys Valley Objectif Végétal Ce document a été réalisé dans le cadre du programme Objectif Végétal Recherche-Formation-Innovation en vegepolys-valley.eu objectifvegetal.univ-angers.fr Pays de la Loire financé par : ALM, FEDER, Région. • 1 février 2020 - 9h à 12h er • 14 mars 2020 - 9h à 12h
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