Aide décisionnelle de Swissnoso pour les méthodes diagnostiques de COVID-19 dans le cadre des soins aigus (v.2, mai 2021)
←
→
Transcription du contenu de la page
Si votre navigateur ne rend pas la page correctement, lisez s'il vous plaît le contenu de la page ci-dessous
Aide décisionnelle de Swissnoso pour les méthodes diagnostiques de COVID-19 dans le cadre des soins aigus (v.2, mai 2021) Introduction Après plus d'un an de pandémie, plusieurs méthodes diagnostiques de détection du SARS-CoV-2 sont disponibles pour les personnes asymptomatiques et symptomatiques1. L'acide ribonucléique viral (ARN) peut être détecté par amplification en chaîne par polymérase (PCR), l'antigène viral par un test antigénique rapide (RADT) ou les anticorps (sérologie) peuvent être utilisés pour confirmer l'infection et la tomographie thoracique (CT-scan) pour identifier les manifestations pulmonaires du COVID-19. Cependant, l'interprétation des résultats de ces tests et la détermination de l'infectiosité restent un défi. Plusieurs facteurs jouent un rôle, notamment le type, la qualité, le moment du prélèvement, et aussi la méthode diagnostique choisie par rapport au cours de l’infection. La combinaison de différentes méthodes diagnostiques peut contribuer à améliorer le rendement diagnostique et à orienter la prise en charge ultérieure. PCR Le test d'amplification de l’acide nucléique par PCR (test moléculaire) reste la méthode de référence pour confirmer ou exclure une infection par SARS-CoV-2 dans les prélèvements adéquats des voies respiratoires ou de la salive. Les tests PCR quantitatifs sont de plus en plus disponibles et très utiles pour déterminer la valeur Ct (mesure indirecte de la charge virale par le nombre de cycles nécessaires pour détecter l’ARN: des valeurs Ct plus faibles correspondent à une charge virale plus élevée). Des valeurs Ct >35 (charge virale très faible) indiquent un risque d'infectiosité extrêmement faible2. Pour les prélèvements confirmés positifs, d'autres tests moléculaires peuvent être indiqués (par exemple, la PCR ciblée sur des mutations pour la détection de nouveaux variants de SARS-CoV-2, s'ils sont suspectés, ou le séquençage génomique3). Le diagramme 1 fournit un exemple4 , qui peut être adapté au contexte local, d’aide décisionnelle pour l'interprétation des résultats PCR positifs pour SARS-CoV-2 chez les personnes symptomatiques ou asymptomatiques . Test de détection antigénique rapide (RADT) Lorsque l'accès rapide au test PCR est limité, les RADT peuvent aider à prendre des décisions rapidement sur la gestion et l'isolement des patients et des professionnels de la santé (PS). Le rendement des RADT est le meilleur chez les personnes symptomatiques pendant la phase précoce de l'infection. Globalement, la sensibilité et la spécificité des RADT sont plus faibles que celles de la PCR, mais les RADT sont plus spécifiques par rapport à l’infectiosité 5(c.-à-d. un RADT positif détecte est normalement des personnes infectieuses)1,6. Les cliniciens doivent être conscients de l’influence de la probabilité pré-test sur l’interprétation des résultats. Ainsi, le risque d'un résultat RADT faussement négatif est plus élevé lorsque la prévalence de la maladie dans la population est élevée (en raison d’une valeur prédictive négative plus basse). Vice-versa, le risque de résultats RADT faussement positifs est plus élevé lorsque la prévalence de la maladie est faible (valeur prédictive positive 1 Peeling RW, et al. Scaling up COVID-19 rapid antigen tests: promises and challenges. The Lancet Infectious Diseases. 2021 Feb 23. https://doi.org/10.1016/S1473-3099(21)00048-7 2 Singanayagam et al. Duration of infectiousness and correlation with RT-PCR cycle threshold values in cases of COVID-19, England, January to May 2020. https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC7427302/ 3 Sur décision du médecin cantonal (au cas par cas), voir https://www.bag.admin.ch/bag/fr/home/krankheiten/ausbrueche-epidemien-pandemien/aktuelle-ausbrueche-epidemien/novel-cov/information-fuer-die-aerzteschaft/covid-testung.html 4 Adapté de HUG, Interprétation d’une RT-PCR SARS-CoV-2 positive, v1 26.2.21 https://www.hug.ch/sites/interhug/files/structures/coronavirus/documents/interpretation-rt-pcr-plus-35-milieu-hospitalier.pdf 5 Probabilité estimée de la maladie avant la réalisation du test, sur la base d'une prévalence locale, probabilité clinique, voir également https://asm.org/Articles/2020/June/Why-Pretest-and-Posttest-Probability-Matter-in-the
plus faible) 6. Un test PCR de confirmation est recommandé en cas de résultats douteux (un deuxième prélèvement peut être effectué de routine au moment du prélèvement pour le RADT et envoyé pour une PCR (confirmation de SARS-CoV-2) ou pour d’autres analyses si nécessaire, par exemple panel respiratoire ou recherche de nouveaux variants3). Diagramme 2 Aide décisionnelle pour l'utilisation des RADT dans les établissements de soins aigus où l'accès rapide aux tests PCR est limité. Recherche d'anticorps (sérologie) La sérologie n’est pas sûre pour diagnostiquer une infection aiguë et son interprétation fait l’objet de recherches7. Cependant, si elle est disponible, la recherche d’anticorps anti-SARS-CoV-2 peut être utile en cas de PCR douteuse pour détecter un infection récente ou ancienne. Diagramme 1 Nouvelle approche pour le prélèvement et le dépistage de groupes Récemment, quelques autres méthodes de prélèvement ont été validées pour la PCR et les RADT (par exemple, écouvillons nasaux, salive). Elles sont plus faciles que le frottis naso-pharyngé8) et visent à permettre un dépistage élargi dans la communauté9 et les institutions sanitaires. Les tests individuels sont réalisés le plus souvent chez les patients suspects d'être infectés par COVID-19 lors de leur admission à l’hôpital ou pour un dépistage de routine à l'admission. Cependant, de façon similaire au dépistage de masse en communauté, le dépistage de masse, pour des groupes de patients ou de personnel de santé est de plus en plus utilisé dans le cadre d’investigations de flambée ou de dépistages ciblés et répétitifs (par exemple pour des patients en séjour prolongé ou pour le personnel d’un service lorsque le nombre de cas dans la population est élevé). Le pooling des prélèvements est une méthode de test de masse : les prélèvements de plusieurs personnes sont réunis en un seul échantillon (pool) qui est testé par PCR (à condition que cette méthode soit validée par le laboratoire local). Le pool est utile pour le dépistage de groupes importants de personnes, mais uniquement dans un contexte de faible prévalence, car si un pool s’avère positif, les membres du pool doivent être à nouveau testés individuellement, afin d'identifier et de gérer la ou les personnes positives. Patients, personnel de santé, visiteurs Un dépistage peut être effectué chez les patients ambulatoires ou hospitalisés en milieu de soins aigus (symptomatiques ou asymptomatiques) et chez les professionnels de la santé après une exposition à COVID-19 ou dans le cadre d'un dépistage ciblé et répétitif. Il peut même être envisagé pour les visiteurs - bien que ses avantages et sa faisabilité puissent être limités. Le tableau 1 (personnes symptomatiques) et le tableau 2 (personnes asymptomatiques) donnent un aperçu du dépistage COVID-19 dans les établissements de soins aigus pour différents groupes et établissements. Personnes entièrement vaccinées (ou transitoirement immunes après une infection) Les définitions10 pour entièrement vacciné/transitoirement immun changent avec le recul permettant l’acquisition de données sur la durée de l'immunité chez les personnes vaccinées et guéries. Les personnes symptomatiques entièrement vaccinées et/ou guéries d'une infection COVID-19 confirmée doivent toujours être 6 Les lignes directrices de l'ECDC suggèrent des taux de maladie élevés >10% par rapport à des taux faibles
évaluées cliniquement et testées. Dans la plupart des cas, la protection après vaccination ou maladie semble durer au moins six mois11, mais elle pourrait être compromise par de nouveaux variants susceptibles d'échapper à la réponse immunitaire (mutants du SARS-CoV-2 classés comme variants préoccupants, VOCs). Les collaborateurs asymptomatiques et entièrement vaccinés peuvent continuer à travailler en respectant strictement les mesures d'hygiène après avoir été exposés à un cas confirmé de Covid-19 (Voir recommandations Swissnoso12). En l’attente de données plus solides, il peut être prudent d'envisager la mise en quarantaine et le dépistage des patients asymptomatiques et entièrement vaccinés après une exposition, ainsi que, selon les directives locales, le dépistage de routine (par exemple à l'admission ou de façon répétitive). Toutes les personnes, y compris celles testées négatives, doivent respecter strictement les mesures générales d'hygiène et de distanciation. 11 See ECDC statement from 29 Mar 2021 https://www.ecdc.europa.eu/en/news-events/ecdc-report-examines-sars-cov-2-transmission-risk-vaccinated-previously-infected-individuals 12 Swissnoso Recommendations for healthcare workers, having had unprotected close contact with COVID-19 cases, under https://www.swissnoso.ch/forschung-entwicklung/aktuelle-ereignisse
Tableau 1 Aperçu du dépistage COVID-19 dans les établissements de soins aigus - personnes symptomatiques (voir ci-dessus pour les personnes entièrement
vaccinées)
Objectif du dépistage
triage rapide (unités COVID-19, unités non-COVID-19)
décision rapide sur le maintien ou l'abandon des mesures de précaution et d'isolement
Groupe à tester Secteur Individus symptomatiques = forte probabilité
Le dépistage est impératif
Ambulatoire
Méthode diagnostique préférée :
Lors de l'admission Test PCR (prélèvement nasopharyngé, oropharyngé ou salivaire)
Méthode diagnostique alternative
Patients Test antigénique rapide (RADT) si la PCR n'est pas disponible ou si es résultats sont nettement retardés, et si les symptômes sont apparus au
cours des 5 derniers jours. (Remarque: afin d'exclure tout résultat RADT faussement négatif, confirmer tous les résultats négatifs par une PCR
Durant de routine) Diagramme 2
l’hospitalisation
Méthode diagnostique supplémentaire
Cas plus graves et résultats de laboratoire indéterminés : tomodensitométrie thoracique pour détecter les signes de maladie COVID-19
Unité COVID-19/ Le dépistage est impératif
"exposition à haut
risque" (contact Méthode diagnostique préférée :
connu avec COVID- Test PCR (prélèvement nasopharyngé ou oropharyngé ou salive)
Professionnel 19)
de la santé
Méthode diagnostique alternative
Unité non-COVID-19
Test antigénique sur écouvillon nasopharyngé (ou écouvillon nasal) si la PCR n'est pas disponible ou si les résultats sont très tardifs, et si les
ou "exposition à
symptômes sont apparus au cours des 5 derniers jours. (Note : afin d'exclure tout résultat faussement négatif du RADT, confirmer tous les
faible risque".
résultats négatifs par PCR de routine) Diagramme 2
Visiteurs Tout secteur Il est conseillé de ne pas se rendre à l'hôpital en cas de symptômes (suivre les règles de l'OFSP en matière de quarantaine et d'isolement).
Tableau 2 Aperçu du dépistage COVID-19 dans les établissements de soins aigus - personnes asymptomatiques (voir ci-dessus pour les personnes entièrement
vaccinées)
Objectifs du dépistage
En complément d'une excellente adhésion aux mesures de précaution standard, pour réduire le risque de transmission à l'hôpital
Détection/prévention potentielle de la transmission silencieuse parmi les patients et les professionnels de la santé dans les unités de soins.
Groupe à tester Secteur Asymptomatique = probabilité faible à modérée
Ambulatoire Non recommandé
Épidémiologie locale : Non recommandé dans les milieux à faible prévalence ; à envisager dans les milieux à prévalence moyenne ou élevée.
Lors de l'admission Recommandé en cas d'exposition non protégée à un cas positif https://www.bag.admin.ch/bag/de/home/medizin-und-forschung/heilmittel/covid-testung.html#-1047800939
Épidémiologie locale : à envisager dans les milieux de prévalence moyenne ou élevée.
A considérer dans des populations spécifiques (sans exposition significative ; hospitalisés pour d'autres raisons)
Investigation d'une flambée COVID-19 associée aux soins
A envisager pour les situations suivantes :
Patients o Long séjour prévu
Durant o Pour les volontaires (au moins 1x/semaine) par PCR groupée ou RADT selon la stratégie fédérale
https://www.bag.admin.ch/bag/fr/home/krankheiten/ausbrueche-epidemien-pandemien/aktuelle-ausbrueche-epidemien/novel-cov/testen.html#1637978903
l’hospitalisation
Peut éviter des quarantaines aux collaborateurs si ≥ 80% de participation https://www.bag.admin.ch/dam/bag/fr/dokumente/mt/k-und-i/aktuelle-
ausbrueche-pandemien/2019-nCoV/faktenblatt-kostenuebernahme-dez-2020.pdf.download.pdf/faktenblatt-kostenuebernahme-dez-2020.pdf
Méthode diagnostique préférée :
PCR rapide (prélèvement nasopharyngé, oropharyngé ou salivaire)
Méthode diagnostique alternative
RADT si la PCR n'est pas disponible (Diagramme 2)
Unité COVID-19/ Épidémiologie locale : à envisager dans les milieux de prévalence moyenne ou élevée.
"exposition à haut Envisager des tests répétitifs (au moins une fois par semaine) pour :
risque" (contact o Volontaires par PCR (groupée) idéalement à partir de la salive ou RADT(idéalement écouvillon nasal), selon la stratégie fédérale.
connu avec Covid- Remarque : Peut éviter des quarantaines aux collaborateurs si ≥ 80% de participation (voir ci-dessus).
Professionnel 19) Méthode diagnostique préférée :
de la santé La PCR sur échantillon nasal ou salivaire est préférable en raison de la gêne due aux prélèvements nasopharyngés répétitifs.Possibilité de pooling
Unité non-COVID- (salive).
19 ou "exposition à Attention aux PCR positives dues à des résidus viraux.en l’absence d’infectiosité.
faible risque". Méthode diagnostique alternative
RADT si la PCR n'est pas disponible (Diagramme 2)
A envisager dans des milieux de prévalence moyenne ou élevée (prévalence > 2 %)6
Dans les 24 heures précédant la visite, test par PCR ou RADT.
Visiteurs
Ecouvillon nasopharyngé pour RADT, salive ou écouvillon nasop-haryngé pour PCR.
Voir Diagramme 2 pour l'interprétation du RADT selon la probabilité pré-test.
Diagramme 1 : Aide décisionnelle pour l'interprétation des résultats PCR positifs pour SARS-CoV-2 avec CT ≥ 35 (faible charge virale) dans les soins aigus [adapté des HUG4].
Diagramme 2 : Aide décisionnelle pour l’indication, l'utilisation et l’interprétation des tests antigéniques rapides (RADTs) dans les établissements de soins aigus où l'accès rapide aux tests PCR est limité.
Liste de symptômes OFSP: https://bag-coronavirus.ch/check/ ; Recommandations RADTs : https://www.bag.admin.ch/bag/de/home/medizin-und-forschung/heilmittel/covid-testung.html#- 1047800939 ; voir aussi https://www.bag.admin.ch/dam/bag/de/dokumente/mt/msys/covid-19-verdachts-meldekriterien.pdf.download.pdf/Verdachts_Beprobungs_und_Meldekriterien.pdf La sensibilité du RADT est plus élevée si l'apparition des symptômes date de ≤ 5 jours, selon l'ECDC, 17 Nov 2020 https://www.ecdc.europa.eu/sites/default/files/documents/Options-use-of-rapid-antigen- tests-for-COVID-19_0.pdf Lors du prélèvement pour RADT : envisager de routine un deuxième prélèvement pour une PCR (SARS-CoV-2 ± panel de pathogènes respiratoires ± séquençage) pour confirmation ou, si une autre cause ou un nouvau variant sont suspectés. * Pour les estimations des taux de prévalence Covid-19 dans la population locale, voir le site de l’OFSP proportion de tests positifs (%), par canton, https://www.covid19.admin.ch/fr/epidemiologic/test ** Selon la décision du médecin (au cas par cas): https://www.bag.admin.ch/bag/de/home/krankheiten/ausbrueche-epidemien-pandemien/aktuelle-ausbrueche-epidemien/novel-cov/information-fuer-die-aerzteschaft/covid-testung.html
Vous pouvez aussi lire
