Nouveau coronavirus 2019 - Ce que nous savons jusqu'à présent sur la transmission fécale-orale
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SYNOPSIS
Le 6 février 2020
Nouveau coronavirus 2019 – Ce que nous
savons jusqu’à présent sur… la transmission
fécale-orale
Introduction
La série de documents « Ce que nous savons jusqu’à présent sur… » vise à donner un aperçu des
rapports publiés et non publiés au sujet de nouveaux enjeux liés à la maladie à coronavirus 2019
(COVID-19). Ces rapports sont trouvés grâce à des recherches régulières dans la documentation
publiée et la littérature grise scientifique (p. ex., ProMED, CIDRAP, Johns Hopkins Situation Reports),
ainsi que dans les reportages des médias. Il est possible que d’autres renseignements ne soient pas
inclus dans le présent document. Comme l’épidémie de COVID-19 évolue rapidement, cette
information est à jour à la date de la rédaction des documents. Si vous souhaitez fournir des
renseignements supplémentaires ou si vous avez des questions, veuillez communiquer à
cd@oahpp.ca.
Éléments clés
La diarrhée était courante avec le virus du syndrome respiratoire aigu sévère (SRAS-CoV) et la
transmission par les selles aurait eu lieu.
La diarrhée a été signalée avec le nouveau coronavirus 2019, mais moins fréquemment qu’avec
le SRAS-CoV.
L’ARN du nouveau coronavirus 2019 a été détecté par réaction en chaîne de la polymérase (RCP)
dans les selles de certains patients infectés.
Le tube digestif contient des récepteurs qui seraient utilisés par le nouveau coronavirus 2019
pour pénétrer dans les cellules.
Les gouttelettes respiratoires sont sans doute le mode de transmission prédominant du nouveau
coronavirus 2019. On ne sait pas encore dans quelle mesure la transmission fécale-orale
contribue à la propagation du nouveau coronavirus 2019.
Contexte
Chez l’humain, les coronavirus se transmettent plus facilement par les gouttelettes respiratoires qui sont
produites lorsqu’une personne infectée tousse ou éternue et éventuellement par des fomites (objets
inanimés, y compris les surfaces ou les objets contaminés par des gouttelettes infectieuses).
Il a été établi que le SRAS-CoV était excrété dans les matières fécales et qu’il était potentiellement
transmissible par les matières fécales, comme l’indiquent les données probantes ci-dessous.
COVID-19 – Ce que nous savons jusqu’à présent sur… la transmission fécale-orale 1 Lors de l’épidémie du SRAS, en 2002-2003, on a signalé que de 20 à 25 % des patients avaient la
diarrhée. Au total, la diarrhée était présente chez de 40 à 70 % des patients, et celle-ci avait
tendance à survenir environ une semaine après l’apparition des symptômes. (Hui et coll.)
Une étude prospective de 75 patients atteints du SRAS à Hong Kong a permis de constater que
55 patients (73 %) avaient la diarrhée environ une semaine après l’apparition des symptômes.
Selon les prélèvements de selles effectués plus tard dans le cours de la maladie (en moyenne
14,2 jours après le début de la maladie), l’ARN du SRAS était détecté par RCP chez 65 (97 %) des
67 patients. (Peiris et coll.)
Que savons-nous jusqu’à présent sur la transmission
fécale-orale du nouveau coronavirus 2019?
Symptômes gastro-intestinaux du nouveau coronavirus 2019
Nous avons recensé quatre études qui décrivent la présence de la diarrhée chez les patients qui
ont reçu un diagnostic d’infection au nouveau coronavirus 2019. (Chen et coll., Huang et coll.,
Chan et coll. et Holshue et coll.)
Dans les deux plus grandes études, la diarrhée était une constatation peu courante (2,0 % et
2,6 % des patients). (Chen et coll. and Huang et coll.)
Dans un foyer d’infection au sein d’une famille, deux des six membres infectés ont souffert de
diarrhée. (Chan et coll.)
Analyse de selles aux fins du dépistage du nouveau coronavirus 2019
Dans un foyer d’infection au sein d’une famille comptant six cas, des échantillons de selles ont
été prélevés auprès de quatre personnes, dont deux avaient la diarrhée (celle-ci était présente
au début chez les deux). Tous les échantillons ont obtenu un résultat négatif pour la présence
du nouveau coronavirus 2019 à la suite d’une analyse par RCP. (Chan et coll.)
Un rapport de cas aux États-Unis décrit un patient qui a eu une maladie diarrhéique les sixième
et septième jours après l’apparition des symptômes. Un échantillon de selles prélevé le
septième jour a obtenu un résultat positif pour la présence du nouveau coronavirus 2019 à la
suite d’une analyse par RCP. (Holshue et coll.)
Cinq patients admis dans une unité de soins intensifs à Wuhan se sont révélés négatifs à la suite
d’une analyse de prélèvements anaux par RCP pour la présence du nouveau coronavirus 2019.
Toutefois, ces prélèvements ont été effectués longtemps après l’apparition des symptômes (de
18 à 29 jours). (Zhou et coll.)
Des articles dans des médias chinois indiquent que le nouveau coronavirus 2019 a été décelé
dans les selles de patients infectés à la suite d’une analyse par RCP.
Récepteurs du nouveau coronavirus 2019 dans le tube digestif
Tout comme ce fut le cas avec le SRAS-CoV, on pense que le nouveau coronavirus 2019 pénètre
dans les cellules à l’aide des récepteurs de l’enzyme de conversion de l’angiotensine 2 (ECA2)
(Hoffmann M. et coll). On trouve les récepteurs ECA2 dans le tube digestif, ainsi que dans les
poumons, les reins et le cœur.
COVID-19 – Ce que nous savons jusqu’à présent sur… la transmission fécale-orale 2Rapports
Preuve de la transmission fécale-orale du SRAS-CoV
1. Hui DSC, Zumla A. Severe acute respiratory syndrome: historical, epidemiologic, and clinical
features. Infect Dis Clin North Am. 2019;33(4):869-89. Disponible à :
https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S0891552019300571?via%3Dihub.
2. Peiris JS, Chu CM, Cheng VC, Chan KS, Hung IFN Poon LL, et coll. Clinical progression and viral
load in a community outbreak of coronavirus-associated SARS pneumonia: a prospective
study. Lancet. 2003;361(9371):1767-72.
Symptômes gastro-intestinaux du nouveau coronavirus 2019
et absence d’analyse de selles
3. Chen N, Zhou M, Dong X, Qu J, Gong F, Han Y, et coll. Epidemiological and clinical
characteristics of 99 cases of 2019 novel coronavirus pneumonia in Wuhan, China: a descriptive
study. Lancet. 2020 Jan 29 [Diffusion en ligne avant la version imprimée.] Disponible à :
https://www.thelancet.com/journals/lancet/article/PIIS0140-6736(20)30211-7/fulltext.
Cette étude décrit les caractéristiques épidémiologiques et cliniques de 99 cas confirmés
d’infection au nouveau coronavirus 2019 qui ont été hospitalisés dans un seul établissement à
Wuhan, en Chine. Deux des 99 patients avaient une diarrhée.
4. Huang C, Wang Y, Li X, Ren L, Zhao J, Hu Y, et coll. Clinical features of patients infected with
2019 novel coronavirus in Wuhan, China. Lancet. 2020 Jan 24 [Diffusion en ligne avant la
version imprimée.] Disponible à : https://www.thelancet.com/journals/lancet/article/PIIS0140-
6736(20)30183-5/fulltext .
Il s’agit d’une série de cas de 41 patients admis à l’hôpital de Wuhan. Un des 38 patients
évalués avait des symptômes de diarrhée.
Symptômes gastro-intestinaux du nouveau coronavirus 2019
et analyses de selles
5. Chan JF, Yuan S, Kok KH, To KK, Chu H, Yang J, et coll. A familial cluster of pneumonia associated
with the 2019 novel coronavirus indicating person-to-person transmission: a study of a family
cluster. Lancet. 2020 Jan 24 [Diffusion en ligne avant la version imprimée.] Disponible à :
https://www.thelancet.com/journals/lancet/article/PIIS0140-6736(20)30154-9/fulltext .
Un foyer d’infection au sein d’une famille comptant six personnes symptomatiques, dont deux
ont développé une diarrhée au début de leur maladie. Des échantillons de selles ont été
prélevés auprès de quatre personnes et le nouveau coronavirus 2019 n’a pas été détecté.
6. Holshue ML, DeBolt C, Lindquist S, Lofy KH, Wiesman J, Bruce H, et coll. First case of 2019 novel
coronavirus in the United States. N Engl J Med. 2020 Jan 31 [Diffusion en ligne avant la version
imprimée.] Disponible à : https://www.nejm.org/doi/full/10.1056/NEJMoa2001191.
COVID-19 – Ce que nous savons jusqu’à présent sur… la transmission fécale-orale 3Il s’agit d’un rapport clinique détaillé du premier cas d’infection au nouveau coronavirus 2019
confirmé aux États-Unis. Le patient a eu la diarrhée les sixième et septième jours de la maladie.
Le seul échantillon de selles, qui a été prélevé le septième jour, était positif pour le nouveau
coronavirus 2019 à la suite d’une analyse par RCP. Les auteurs soulignent que l’ARN
extrapulmonaire ne signifie pas nécessairement la présence d’un virus infectieux.
Analyses de selles seulement
7. Zhou P, Yang XL, Wang XG, Hu B, Zhang L, Zhang W, et coll. A pneumonia outbreak associated
with a new coronavirus of probable bat origin. Nature. 2020 February 3. Disponible à :
https://www.nature.com/articles/s41586-020-2012-7_reference.pdf.
Il s’agit du rapport d’une analyse génomique de sept patients admis à l’unité de soins intensifs
de Wuhan avec apparition des symptômes entre le 12 et le 23 décembre 2019. Un lavage
broncho-alvéolaire et des prélèvements buccaux ont été effectués sur tous les patients le 30
décembre 2019 et un ou deux ont obtenu un résultat positif pour la présence du nouveau
coronavirus 2019 à la suite d’une analyse par RCP. Des tests supplémentaires, y compris des
prélèvements d’écouvillons anaux, ont été effectués sur cinq patients le 10 janvier 2020 (18 à
29 jours après l’apparition des symptômes), et tous se sont révélés négatifs pour la présence
du nouveau coronavirus 2019.
Articles dans les médias
8. En Chine, des médias rapportent que des acides nucléiques viraux ont été trouvés dans les
selles et les prélèvements anaux de patients infectés par le nouveau coronavirus 2019, ce qui
suggère que la transmission fécale-orale du nouveau coronavirus 2019 est possible. Il a
également été rapporté que la diarrhée est parfois le premier symptôme, par opposition à la
fièvre.
Récepteurs dans le tube digestif
9. Hoffmann M, Kleine-Weber H, Krueger N, Mueller MA, Drosten C, Poehlmann S. The novel
coronavirus 2019 (2019-nCoV) uses the SARS-coronavirus receptor ACE2 and the cellular
protease TMPRSS2 for entry into target cells. bioRxiv. 2020 Jan 31 [Diffusion en ligne avant la
version imprimée.] Disponible à :
https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2020.01.31.929042v1.
Cette étude décrit l’utilisation de virus pseudotypés afin d’examiner la manière dont le
nouveau coronavirus 2019 pénètre dans les cellules. Les virus pseudotypés sont des virus
artificiels exprimant la protéine de pointe (S) du nouveau coronavirus 2019. L’analyse des
acides aminés et les expériences de culture cellulaire montrent que, comme le SRAS-CoV, la
protéine S du nouveau coronavirus 2019 se lie aux récepteurs ECA2 des cellules.
COVID-19 – Ce que nous savons jusqu’à présent sur… la transmission fécale-orale 4Modèle proposé pour citer le document Agence ontarienne de protection et de promotion de la santé (Santé publique Ontario). « Ce que nous savons jusqu’à présent sur… la transmission fécale-orale ». Toronto, ON. Imprimeur de la Reine pour l’Ontario, 2020. Avis de non-responsabilité Santé publique Ontario (SPO) a conçu le présent document. SPO offre des conseils scientifiques et techniques au gouvernement, aux agences de santé publique et aux fournisseurs de soins de santé de l’Ontario. Les travaux de SPO s’appuient sur les meilleures données probantes disponibles au moment de leur publication. L’application et l’utilisation du présent document relèvent de la responsabilité des utilisateurs. SPO n’assume aucune responsabilité relativement aux conséquences de l’application ou de l’utilisation du document par quiconque. Le présent document peut être reproduit sans permission à des fins non commerciales seulement, sous réserve d’une mention appropriée de Santé publique Ontario. Aucun changement ni aucune modification ne peuvent être apportés à ce document sans la permission écrite explicite de Santé publique Ontario. Santé publique Ontario Santé publique Ontario est une société d’État vouée à la protection et à la promotion de la santé de l’ensemble de la population ontarienne, ainsi qu’à la réduction des iniquités en matière de santé. Santé publique Ontario met les connaissances et les renseignements scientifiques les plus pointus du monde entier à la portée des professionnels de la santé publique, des travailleurs de la santé de première ligne et des chercheurs. Pour obtenir plus de renseignements au sujet de SPO, veuillez consulter santepubliqueontario.ca. COVID-19 – Ce que nous savons jusqu’à présent sur… la transmission fécale-orale 5
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