Rongeurs et santé publique en zone urbaine : des défis propres aux villes africaines ? - Gauthier DOBIGNY (IRD) Jean-Marc DUPLANTIER (IRD) Eric ...

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Rongeurs et santé publique en zone urbaine : des défis propres aux villes africaines ? - Gauthier DOBIGNY (IRD) Jean-Marc DUPLANTIER (IRD) Eric ...
Rongeurs et santé publique en zone urbaine :
   des défis propres aux villes africaines ?

                                Gauthier DOBIGNY (IRD)

                                Jean-Marc DUPLANTIER (IRD)

                                Eric BERTHERAT (WHO)
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World Cities Report, 2016
                       ONU-Habitat, 2014

                                            Taux d’urbanisation actuel faible en Afrique
                                            mais taux de croissance urbaine devenu
                                            très élevé

                                            38 millions de citadins dans le corridor
                                            « Abidjan-Lagos » en 2030

                                            500 millions d’africains dans des bidonvilles
                                            en 2020

Afrique : une urbanisation tardive, très rapide et mal contrôlée
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Abondance de rongeurs anthropophiles

Risque zoonotique
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Arenavirus
 Rongeurs et santé             (Lassa, LCMV, …)

                                 Hantavirus
                                 (Seoul, Hantaan, Puumala)
 Réservoirs zoonotiques
Relais environnementaux                            leptospirose
                                    borréliose

                                                                 rickettsioses
                                   peste                         (i.e. typhus)
                                           bartonellose

     Mortalité / morbidité ?                                             leishmaniose cutanée

                                                             taeniasis
                                                                                 asthme
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12.7% des micro-mammifères des villes du Sud Bénin portent des leptospires,
(et jusque 50% dans certains quartiers à certaines saisons).

                    34.7% des micro-mammifères de Cotonou portent des bartonelles,
                    et plus de 40% d’entre eux portent des trypanosomes atypiques.

    Plus de 25% des rats noirs (Rattus rattus) d’Antananarivo étaient
    séropositifs à Yersinia pestis en 1998.

                      18% des surmulots (Rattus norvegicus) d’un bidonville de Salvador au
                      Brésil portaient des hantavirus Seoul en 1998 et 2010.
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Les micromammifères urbains
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Crocidura spp.
                                         Rattus rattus
                                         (R. tanezumi)
Cricetomys gambianus

                          Mus musculus

 Mastomys natalensis                       Rattus norvegicus
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Les villes africaines sont … des villes !
Et les rongeurs aiment les villes …
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Le milieu urbain                       Paysage complexe
Nairobi, Kenya
                                              Prédation réduite

                                   Ressources abondantes et permanentes
                                            (stocks, déchets, etc)

                  Cotonou, Bénin

                                   Les rongeurs y trouvent le gîte et couvert.

                                     Les ressources sont permanentes …
                                                 … leur reproduction aussi !
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Modification de la dynamique de reproduction
Mastomys natalensis

                                                                               pluies

                            pluies

               Adultes sexuellement actifs
                                                                 Femelles sexuellement actives

         En ville (Niamey, Niger, Garba et al., 2014)   Dans les cultures (Tanzanie, Leirs et al., 1996)
Les rongeurs dans les villes africaines

     % de maisons
       infestées

                               Cotonou, Bénin
                       Taux global d’infestation = 91.8%
Omniprésence de grandes populations de rongeurs dans les villes
Les villes africaines sont … des villes,
   donc des carrefours d’échange
Les villes, carrefours d’échange … donc points d’entrée des rongeurs invasifs

Quelles conséquences de l’Histoire sur les transports,
      donc les communautés de rongeurs urbains en Afrique ?
Mus musculus

Rattus rattus
(R. tanezumi)

                  Rattus norvegicus
1870s                              1914

Pénétration puis installation occidentale à l’intérieur du continent
     africain à partir de la seconde moitié du XIXème siècle
Transports et expansion du rat noir (Rattus rattus) au Sénégal

                                                                            Transport fluvial

                                                                            Transport routier

Konecny et al. 2013
Evolution des communautés de rongeurs dans les ville d’Afrique

Dakar

                        1929                             2016
                N=249 845 ; Cazenove, 1932   N=567 ; Stragier et al., non publié
Communautés de micromammifères urbains en Afrique : espèces invasives vs. natives

          Espèces natives
          Espèces invasives

                                            Durban – 98.9%              Douala – 100%
                                        N=262, Taylor et al., 2008   N=2512, Voeckel, 1958

               Niamey – 24.1%                  Cotonou – 69.7%                  Dakar – 90.1%
           N=1056, Garba et al., 2014         N=2647, non publié       N=592, Stragier et al., non publié
Communautés de micromammifères urbains en Afrique : différentes espèces invasives

                    89.2%           10,6%                0,2%
Dakar

                                    14.7%                85.3%
Douala

                     3.3%            2.3%                91.9%
Durban                                                                   + Rattus tanezumi
                                                                         depuis 2000s – 0.8%

                     3.4%           79.6%                 17%
Cotonou

                    28.3%            71.7%
Niamey
Rongeurs et santé publique : importance de l’assemblage spécifique

                         VF Lassa   Hantavirus   LCMV   Leptospira   Rickettsia   Yersinia
NATIFS

                           ++           -         -        +           (+)         +

                           -           +          -        ++           +          ++
INVASIFS

                           -            -         +       (+)           -           -

                           -          (+)         -        +            +          +
Rongeurs et santé publique : importance de l’assemblage spécifique

      Sauts d’espèce et processus de spill-over et de spill-back
            (ex. LFV, Mastomys et Rattus spp.)

      Co-infections et émergence
            (ex. Trypanosoma lewisi et Toxoplasma gondii)

      Recombinaison de souches, émergence et virulence
            (ex. MERS-coV, Leptospira)
A quels défis spécifiques les villes africaines
   font elles face en termes de risques
   zoonotiques associés aux rongeurs ?
Urbanisation galopante et zones informelles en Afrique

Cotonou, Bénin     1960                                   2018
                   1960                                   2009

Niamey, Niger
Villes riches du Nord                            Freetown, Sierra Leone
      Une règle d’urbanisme généralisée
on aménage  on construit  on habite

                                   Villes pauvres du Sud
                        Des quartiers de bidonvilles en expansion
                 on habite  on construit  on aménage
Urbanisme informel et rongeurs

  Gestion des déchets défaillante, dépotoirs sauvages
   ressources alimentaires pléthoriques

  Habitat en matériaux précaires, encombrement des
  intérieurs, absence de voirie
   nombreux abris et déplacements facilités

  Forte densité humaine
   promiscuité accrue hommes / rongeurs
Urbanisme informel et rongeurs

   Réseaux d’assainissement moins développés
   Collecteurs à ciel ouvert
Habitat informel, absence de voirie, pas de gestion des déchets
donc omniprésence des ressources

 Prolifération permanente de rongeurs,
     donc risque de circulation zoonotique accru

    Abondance des rongeurs
    Forte promiscuité rongeurs-hommes (et hommes-hommes)

     Risque de transmission (et d’épidémie) accru
Quelles stratégies de contrôle des
  rongeurs urbains en Afrique ?
Règlementations et services d’hygiène
Utilisation des prédateurs naturels des rongeurs
La dératisation de masse : quelle utilité ?

         1.Très haut taux d’infestation

         2.Fortes abondances

                        Dératisation ????
La dératisation de masse : quelle utilité ?

                                  75% de réduction de la survie
                            600
                Abondance
                 simulée

                            400

                                                                  Sans dératisation
                            200
                                                                  Avec dératisation
                             0

                                             Temps

Stenseth et al., 2001
La dératisation de masse : quelle utilité ?

           Nécessite d’atteindre puis informer tous
            les habitants, d’obtenir leur confiance

          Assemblage d’entités socio-culturelles différentes

Erosion et/ou compartimentation des mécanismes de solidarité sociale

      Identification plus complexe des personne(s) ressource(s)
La dératisation de masse : quelle utilité ?

                                                        Recolonisation immédiate
Infestation massive des    Dératisation dans certains
                                                         à partir des foyers non
 foyers par les rongeurs       foyers seulement
                                                                 dératisés

    Présence de rongeurs           Adhésion et lutte           Recolonisation rapide
La dératisation de masse : quelle utilité ?

- Besoins énormes en ressources humaines et financières

- Succès mitigé à court terme, probablement nul à moyen et long termes

- Difficulté de l’utilisation de poisons aigus (dangerosité, confinement, etc)

- Problèmes de résistance aux anti-coagulants

     La dératisation massive n’apparaît pas comme une solution durable,
     du moins pas sans un accompagnement par d’autres mesures !!!
Pas de dératisation sans désinsectisation !!!
Mutualisation des compétences / ressources humaines et des fonds
« Hotspots » spatialement délimités

Plateformes d’échanges
      ports, ports secs, gares routières, etc …

Zones d’entreposage
      entrepôts, marchés, etc …

Centres de santé
Les rats ne véhiculent pas
                                le virus de la fièvre de Lassa

Informer, éduquer, sensibiliser pour convaincre et agir
Merci
de votre attention

gauthier.dobigny@ird.fr
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