Sur la production de logiciels libres au Laboratoire d'Informatique Gaspard-Monge (LIGM) : ce que nous avons appris

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Sur la production de logiciels libres au Laboratoire d'Informatique Gaspard-Monge (LIGM) : ce que nous avons appris
Sur la production de logiciels libres au
     Laboratoire d’Informatique Gaspard-Monge (LIGM) :
                               ce que nous avons appris

                                       Teresa Gomez-Diaz

                      CNRS - Laboratoire d’informatique Gaspard-Monge
                         Cette œuvre est mise à disposition selon les termes de la licence
              Creative Commons Attribution-NonCommercial-NoDerivatives 4.0 International License
                            http://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/4.0/

         Séminaire du Laboratoire d’informatique Gaspard-Monge
                       LIGM, Marne-la-Vallée, 15 février 2022

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Sur la production de logiciels libres au Laboratoire d'Informatique Gaspard-Monge (LIGM) : ce que nous avons appris
Préambule : évolution du cadre politique en 2020 (1/2)

  27/04/2020 Circulaire Castex sur la “politique publique de la donnée, des algorithmes et
             des codes sources” https://circulaire.legifrance.gouv.fr/circulaire/id/45162
  22/06/2020 Lettre de mission du Premier Ministre adressée au député Eric Bothorel
        https://www.mission-open-data.fr/uploads/decidim/attachment/file/1/Lettre_Mission_BOTHOREL.pdf

                 Mission Politique publique de la donnée (2020) + Consultations
  23/12/2020 Rapport “Pour une politique publique de la donnée”, et ses annexes
                 https://www.mission-open-data.fr/

  29/01/2021 Étude Etalab et Inno3 :
             “Étude relative à l’ouverture des codes sources au sein de l’Enseignement
             Supérieur et de la Recherche (ESR)”
                 https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-03125456/document

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Préambule : quelques conférences en 2021-22 (2/2)
Voici autres conférences en 2021-22 :
Open Source Experience 2021 (9-10/11/2021)
    - Journée BlueHats OSX https://github.com/blue-hats/journee-bluehats-osx-2021
    - Allocution ministérielle : Amélie de Montchalin, Ministre de la Transformation & Fonction publiques
      https://www.youtube.com/watch?v=eLwuRdf3F6M

Bastien Guerry (Etalab/La direction interministérielle du numérique (DINUM))
         7/12/2021 Séminaire LIGM : Logiciels libres et missions de service public : où en est-on ?
         3/02/2022 # FLOSS ESR - Rencontres sur les enjeux du logiciel libre dans la recherche (Etalab, COSO)
                   Journée de Convergence - Ouverture et valorisation : pistes d’action au sein de la recherche
                 - Restitution des deux Ateliers (14/01, 21/01)
         4/02/2022 OpenForum Europe, The EU Open Source Policy Summit
                   Building Public Sector Capacity : Open Source and Digital Sovereignty
         5/02/2022 FOSDEM 2022, Open Research Tools and Technologies devroom
               - What is special about open source research software and why does it matters ?
                  Reporting about progresses and challenges from the French ecosystem
                  https://fosdem.org/2022/schedule/event/open_research_french_ecosystem/
               - Policies panel : Bastien Guerry (Etalab), Mathieu Jacomy (Fosdem), TGD (LIGM)
         6/02/2022 FOSDEM 2022, Public Code
                 - We listed +9000 public code repositories. Now what ?
                   How to build valuable services on top of fragile assets

OSEC 2022 - Les journées européennes de la science ouverte (4-5/02/2022)
    - Séance d’ouverture, Frédérique Vidal, Ministre de l’Enseignement supérieur, de la Recherche et de l’Innovation
    - Deux séances sur l’Évaluation de la recherche et une table ronde
    - Séance sur Le pilier logiciel de la science ouverte

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– Un cas d’étude : le LIGM
    LIGM : Laboratoire d’informatique Gaspard-Monge
    Tutelles : CNRS, ENPC, Université Gustave Eiffel, à l’est de Paris
    http://ligm.u-pem.fr/
    environ 150 membres, dont 80 chercheurs permanents
    thèmes de recherche : l’analyse et le traitement des images, la géométrie
    en informatique, l’apprentissage, les réseaux, l’algorithmique temps-réel,
    la combinatoire, l’algorithmique, la bio-informatique, la logique informatique et
    les automates, le traitement automatique des langues, le traitement du signal.
    Production importante de logiciels, dont ∼ 80% FLOSS :
       I   finalité : principalement de la recherche
       I   2008-13 : 61 logiciels de la recherche, dont 53 FLOSS
       I   2013-18 : 66 logiciels de la recherche, dont 50 FLOSS
       I   certains très connus :
           Unitex (linguistique), OpenMVG (images),
           contributions à JAVA (JSR 335, JSR 292), MesoNet (Deepfake)...

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La mission logiciels de la recherche au LIGM
      2002 : Ingénieure de recherche CNRS
      2006 : Mission logiciels (de la recherche) LIGM
              étudier la mise en place de services (suivi de versions, publication, etc.)
                   associés au développement logiciel au sein du laboratoire, avec
                                pour objectif de favoriser leur visibilité.

      2008-13 :               – Projet PLUME, projet national CNRS
      (*)(2019) TGD : Le Projet PLUME et le paysage actuel des logiciels de la recherche dans la science ouverte
          I   publication des fiches descriptives de logiciels
          I   études sur FLOSS, questions légales : licences et droits d’auteur,
              procédure de diffusion, politiques de diffusion et FLOSS...
              Patrimoine logiciel d’un laboratoire : https://projet-plume.org/patrimoine-logiciel-laboratoire

      2017-18 : Projet PRESOFT, Plans de gestion de logiciels
      (2018) TGD, G. Romier : Research Software management Plan Template V3.2, Projet PRESOFT

      depuis 2018 : des travaux sur les logiciels de la recherche, leur évaluation,
      la Science Ouverte, les infrastructures pour la Science Ouverte, voir :
      (2019) TGD, T. Recio : On the evaluation of research software: the CDUR procedure
      (2020-21) TGD, T. Recio : Towards an Open Science definition as a political and legal framework: on the sharing...
      (2021) TGD, T. Recio : Open comments on the Task Force SIRS report: Scholarly Infrastructures for Research Soft.

(*) Les références complètes sont à la fin de la présentation.
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Les problèmes détectés en 2006-07 : vision 2021
Sésame, ouvre-toi ! Quels sont les logiciels du LIGM ?
                : produire la liste des logiciels
Définition     Ce que je fais est un logiciel LIGM ?
                : besoin de définir “logiciel du laboratoire” ou “log. de la recherche”
Référence     Pas de nom, pas d’auteurs, pas de date, pas de version...
                : besoin d’établir une référence (identification)
Diffusion       Quelques uns sur pages web perso, sur des forges, avec page web...
                : besoin d’établir une procédure de diffusion
FLOSS           Un réel intérêt pour les logiciels libres, mais souvent pas de licence
                : besoin de mieux comprendre : FLOSS, licences
Questions légales Qui décide de la licence ?
                : besoin de mieux comprendre : questions légales, droit d’auteur
Questions de politique Définition, licences, diffusion, décisions...
                : besoin d’établir les politiques du laboratoire sur cette production
Valeur          Quelle est la valeur de cette production scientifique ?
                : besoin d’établir des protocoles d’évaluation de la recherche

Questions de nature diverse : juridique, politique, publication, scientifique, bonnes pratiques...
    nécessitant des approches différentes, mais similaires pour tout domaine scientifique.

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Définition d’un logiciel de la recherche
(2007) TGD : Autour de la valorisation de logiciels développés dans un laboratoire de recherche
(2009) TGD : Guide laboratoire pour recenser ses développements logiciels
(2011, 2015) TGD : Article vs. Logiciel : questions juridiques et de politique scientifique dans la production de logiciels

          Un logiciel du laboratoire est un programme utile pour faire avancer la recherche
                 qui a été produit avec la participation d’un membre du laboratoire.
                 Il arrive souvent que des publications de recherche soient associées.

        finalité : recherche
        un membre du laboratoire participe à l’écriture du logiciel (idem aux publications)
        la production importante sont les articles, les logiciels sont des objets associés

(2019) TGD, T. Recio : On the evaluation of research software: the CDUR procedure
(2021) TGD, T. Recio : Open comments on the Task Force SIRS report: Scholarly Infrastructures for Research Software

          Research software (RS) is a well identified set of code that has been written by
       a well identified research team. It is software that has been built and used to produce
             a result published or disseminated in some article or scientific contribution.
         Each RS encloses a set of files containing the source code and the compiled code.
        It can also include other elements as the documentation, specifications, use cases...

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Références, Publications, Liste des logiciels LIGM
– LIGM 2008-2013 (PLUME) : 61 logiciels, dont 53 FLOSS

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                                                                                       rd - M o
                                                                                  pa              n
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                                                                                                                 « Mission logiciels LIGM » (juin 2006) : étudier la mise en place de services (suivi de versions, publication, etc.)
                                                                                                                 associés au développement logiciel au sein du laboratoire, avec pour objectif de favoriser leur visibilité.
                                                                                                                                                                                                           1.- Publication de fiches descriptives des logiciels LIGM sur le serveur PLUME :
                                                                                                                                                                                                                  https://www.projet-plume.org/LIGM
                                                                         Nom                                                         Licence                   Algorithmes,                                        https://www.projet-plume.org/en/taxonomie/1936/en
                                                                                                                                                               Architectures,                              2.- Études sur la diffusion des logiciels publiés sous l'intitulé « Patrimoine logiciel d'un laboratoire » :
                                                                         OpenMEEG                                                    CeCILL-B
                                                                                                                                                               Analyse et                                      - https://www.projet-plume.org/patrimoine-logiciel-laboratoire
                                                                         Topological smoothing                                       CeCILL
                                                                                                                                                               Synthèse d'Images
                                                                                             22 logiciels actifs à partir de janvier 2008                      (A3SI)
                                                                                                                                                                                           Logiciels actifs depuis janvier 2008
                                                                         CAPCC                                                       en cours                                                                                                                            Nom                            Licence
                                                                         Critical kernels                                            CeCILL                             Équipe                Nb.      Diffusés        Libres     Fiches PLUME
                                                                                                                                                                                                                                                                         JMMF                           GPL               Logiciels,
                                                                         Cross-Section topology                                      CeCILL                             A3SI                  22           22               18    22 fr, 20 en                                                                            Réseaux,
                                                                         DCTV                                                        GPL v3                                                                                                                              MEDL                           non diffusé
                                                                                                                                                                        Combinatoire          7            7                7     2 Val., 7 fr, 7 en                     Sprintabout                    LGPL              Temps réél
                                                                         Euclidean skeletons                                         CeCILL
                                                                                                                                                                        Modèles-Algo.         11           11               11    1 Val., 11 fr, 8 en                                                                     (LRT)
                                                                         gpu-openings                                                GPL                                                                                                                                   12 logiciels actifs à partir de janvier 2008
                                                                         Ibex                                                        GPL v3                             LRT                   12           11               9     12 fr, 7 en
                                                                         Imagine++                                                   propriétaire                       Signal-Com.           9            8                8     9 fr, 9 en
                                                                                                                                                                                                                                                                         BeC3                           en cours
                                                                         ImagineMVS                                                  propriétaire                       Total                 61           59            53       3 Val., 61 fr, 51 en
                                                                         Imview                                                      GPL                                                                                                                                 D-LITe                         GPL
                                                                         K-VLD                                                       BSD                                                                                                                                 LejosRT                        GPL
                                                                         Norm Est                                                    GPL v3                                                                                                                              MIMO-802.11e                   en cours
                                                                                                                                                                         Nom                                      Licence
                                                                         Olena                                                       GPL + clause                                                                                                                        Plade                          Affero GPL v3
                                                                         OpenKN                                                      GPL                                 Algorithmique du texte                 propriétaire              Modèles et                     Qolyester                      GPL
                                                                         OpenMVG                                                     MPL v2                                                                                               Algorithmes                    REALTIMEZ                      BSD
                                                                                                                                                                         Ed'Nimbus                              non diffusé
                                                                         OrsaHomography                                              LGPL
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                                                                         PowerWatershed                                              CeCILL                              Hoop                                   LGPL                                                     RTSS                           GPL
                                                                         Saliency maps                                               CeCILL                              Lothaire package                  utilisation, reproduction                                     Saburo                         LGPL
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                                                                         SynDEx-Ic                                                 utilisation, reproduction             Outilex                                LGPL                                                     YARTISS                        GPL
                                                                         Topological watershed                                       CeCILL
                                                                                                                                                                                   11 logiciels actifs à partir de janvier 2008
                                                                                                                                                                                                                                                         Nom                                     Licence
                                                                                                                                                                         ASTL                                     GPL v2
                                                                                                           Nom                                     Licence               Distagger                                LGPL                                                                                                    Signal et
                                                                                                                                                                                                                                                         Décompositions 1D ondelettes           CeCILL-B
                                                                          Combinatoire                       7 logiciels actifs à partir de janvier 2008                 Gramlab                                  Apache v2                              Séparation aveugle de sources          propriétaire              communications
                                                                           algébrique et                                                                                 GraMoFoNe                                GPL
                                                                      calcul symbolique                InvariantRingPermutationGroup               GPL                                                                                                            9 logiciels actifs à partir de janvier 2008
                                                                                                                                                                         LGExtract                                LGPL
                                                                                                       MLV                                         GPL                   LGTagger                                 LGPL                                   GC-PPXA-QUANTIZER                      LGPL
                                                                                                       MuPAD-Combinat                              LGPL                  Regal                                    GPL                                    LSMM                                   CeCILL-B
                                                                                                       Polynômes multivariés en Sage               GPL                   RoadColoringImpl                         GPL                                    pMRILab                                CeCILL v2
                                                                                                       PST-Cox                                     LGPL                  TreeCloud                                GPL                                    RestoMMMG_Lab                          CeCILL-B
                                                                                                       Sage-Combinat                               GPL                   Unitex                                   LGPL                                   RestoPPXA_Lab                          CeCILL-B
                                                                                                       Schur                                       GPL                   Vaucanson                                GPL                                    RestoVMFB_Lab                          CeCILL-B

   Fiche RELIER. Metadata, mots clés, classification,                                                     Contact : Teresa.Gomez-Diaz@univ-mlv.fr
                                                                                                                                                                                                                                                         Séparation de signaux
                                                                                                                                                                                                                                                         SURELET-DECONV
                                                                                                                                                                                                                                                         TexGeoPPXA_Lab
                                                                                                                                                                                                                                                                                              contrat partenaire ind.
                                                                                                                                                                                                                                                                                                CeCILL-B
                                                                                                                                                                                                                                                                                                CeCILL-B                   LIGM, nov. 2013

         interfaces de recherche... et liens aux articles.
– LIGM 2013-2018 (document interne) : 66 logiciels, dont 50 FLOSS
– Évolutions
      Groupe Science Ouverte de l’Université Gustave Eiffel, voir
       (2020-21) TGD, T. Recio : Towards an Open Science definition as a political and legal framework: on the sharing...

       (depuis 2011) Image Processing On Line (IPOL) Journal : article + logiciel
       P. Monasse, Extraction of the Level Lines of a Bilinear Image, IPOL 2019,
       https://www.ipol.im/pub/art/2019/269/

       (depuis 2015) SoftwareX Journal, avec le logiciel sur GitHub
       B. Perret, et al., Higra : Hierarchical Graph Analysis, SoftwareX, Vol. 10, 2019,
       https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S235271101930247X
  T. Gomez-Diaz (CNRS/LIGM)                           Logiciels libres au LIGM                                                                                                                       Marne-la-Vallée, janvier 2022                                                                                                          8 / 18
Donnez-moi votre interface de recherche...
      Quel service à quelle communauté ?
      Difficile de trouver un logiciel si nous ignorons : nom, équipe de développement...
      Outil essentiel pour accéder aux compétences, et aux développements ESR.
      L’information scientifique doit être scientifiquement classifiée.

Types d’interfaces de recherche sur                        – PLUME :
      Recherche textuelle simple :
      Classification thématique (expert thématique)
      Recherche à facettes, par exemple (voir Wikipédia : Recherche à facettes) :
         I   selon la date de publication (ou modification) des résultats,
         I   au type des résultats (en général, type des documents),
         I   la langue,
         I   présence de mots ou d’expressions clés liés à la recherche,
         I   présence d’entité nommée : personne, un lieu, une organisation...

      Mots clés de la plateforme : classification en sous-thématiques
      Mots clés Laboratoires et Institutions : Logiciels du LIGM, du CNRS...
      Mots clés libres (choisis par les déposants de l’information)

Désormais : informations accessibles sur un cloud, exploitables avec des outils IA.
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Procédure de diffusion des logiciels
(2009) TGD : Guide laboratoire pour recenser ses développements logiciels
(2010) TGD : Diffuser un logiciel de laboratoire : recommandations juridiques et administratives
(2014) TGD : Free software, Open source software, licenses. A short presentation including a procedure for research soft ...

S’adapte à chaque situation, valable pour les données (de la recherche).
        Choisir un nom, éviter les noms déjà utilisés, les marques.
        (*) Établir la liste des auteurs (avec % de participation), leurs affiliations.
        (*) Établir la liste des fonctionnalités principales.
        (*) Établir la liste des briques logicielles ou les données utilisées, avec licences.
        Choisir une licence, avec l’accord des auteurs et propriétaires des droits.
        Si possible : un accord signé. Attention à la compatibilité et héritage des licences.
        Choisir un site web, forge, dépôt pour la distribution. Indiquer les licences
        et les conditions d’utilisation, copie..., comment citer l’œuvre. PIDs...
        Créer et indiquer une adresse courriel de contact.
        (*) La traçabilité est importante, archiver en .tar.gz régulièrement.
        Informer la direction des laboratoires et les tutelles (si pas fait au point licence).
        Diffuser le logiciel et/ou les données.
        Informer la communauté cible, considérer les data ou les software papers.

(*) À revoir à chaque nouvelle version du logiciel.
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Plans de gestion de logiciels : modèle PRESOFT
(2018) TGD, G. Romier : Research Software management Plan Template V3.2, Projet PRESOFT

Le modèle est précédé d’une présentation qui indique comment l’utiliser.
      0. Titre avec le nom du logiciel, avec :
          dates, auteur(s), affiliation(s)
                                                           2.1 Historique
      1. Métadonnées
                                                           2.2 Projet(s) liés au logiciel
      2. Contexte du logiciel :
                                                           2.3 Questions légales et politique de diffusion
      3. Caractéristiques du logiciel :
      4. Organisation de l’équipe
                                                           3.1 Objectifs scientifiques
      5. Organisation du développement
                                                           3.2 Objectifs d’utilisation et de diffusion
      6. Organisation de la diffusion
                                                           3.3 Caractéristiques techniques
      7. Gestion du plan de gestion
      Références
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Études : questions juridiques et de politique scientifique
(2009) TGD : Licence & copyright pour les développements de logiciels libres de laboratoires
(2009) TGD : Guide laboratoire pour recenser ses développements logiciels
(2011, 2015) TGD : Article vs. Logiciel : questions juridiques et de politique scientifique dans la production de logiciels

Pour comprendre et expliquer les questions juridiques et de politique scientifique sur les logiciels
de la recherche par comparaison avec la production principale des articles de la recherche.

                                  (2011) https ://projet-plume.org/ressource/article-vs-logiciel

   (2015) https://www.societe-informatique-de-france.fr/wp-content/uploads/2015/04/1024-5-gomez-diaz.pdf

Toutes les références données à la fin traitent des questions liées aux aspects
juridiques et de politique scientifique.
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Sur la Science Ouverte (1/3)
(2020-21) TGD, T. Recio : Towards an Open Science definition as a political and legal framework: on the sharing...

Trois piliers pour une définition de “Science Ouverte” :
      Le libre accès aux publications : déclaration de Budapest (BOAI, 2002)
        https://www.budapestopenaccessinitiative.org/
         Par “accès libre” à cette littérature, nous entendons sa mise à disposition gratuite sur
         l’Internet public, permettant à tout un chacun de lire, télécharger, copier, transmettre,
         imprimer, chercher ou faire un lien vers le texte intégral de ces articles...

        Selon la Free Software Fondation (FSF, 1985), fondée par R. M. Stallman,
        un logiciel est libre http://www.gnu.org/philosophy/free-sw.fr.html
                si ces quatre libertés sont garanties : d’exécuter, d’étudier et de modifier...
        Important : accès au code source, rôle de la licence (conditions du partage).
        Mouvement de Open Data : CODATA (Committee on Data for Sciences and
        Technology) constitué en 1966 par l’International Council of Scientific Unions
        (ICSU) : http://www.codata.info/resources/newsletters/Newsletter_7.pdf
         CODATA est un Comité au niveau scientifique international le plus élevé [...] à cause
         de l’importance qui s’attache à l’évaluation des données...
        Vision + récente : Research Data Alliance (RDA)                        https://www.rd-alliance.org/about-rda

Adopted November 2021 : Recommandation UNESCO sur une Science Ouverte
https://en.unesco.org/science-sustainable-future/open-science/recommendation
Projet de recommandation :           https://unesdoc.unesco.org/ark:/48223/pf0000378381_fre
  T. Gomez-Diaz (CNRS/LIGM)                        Logiciels libres au LIGM            Marne-la-Vallée, janvier 2022   13 / 18
Sur la Science Ouverte (2/3)
(2020-21) TGD, T. Recio : Towards an Open Science definition as a political and legal framework: on the sharing...

Définition proposée de “Science Ouverte” :
      [EN] the political and legal framework where research outputs are shared and
      disseminated in order to be rendered visible, accessible and reusable.
        [FR] le cadre politique et juridique dans lequel les productions scientifiques sont
        partagées et diffusées afin d’être rendues visibles, accessibles et réutilisables.

L’article étudie quelques contextes politiques et légales, ainsi que les outils pour
faciliter l’adoption de ces nouvelles pratiques :
       Europe : Programme de financement H2020 (2012) “Towards better access to
        scientific information : Boosting the benefits of public investments in research”                          PDF
           ...so that the ‘fifth freedom’ of the EU – the free circulation of knowledge – can become a reality.

        France : Loi pour une République numérique (7 octobre 2016), et
        Le Plan national pour la science ouverte (4 juillet 2018)
        Et trois pierres angulaires, les vecteurs du changement :
           I évolutions des politiques des Universités et des Établissements de recherche,
           I le développement des services et infrastructures pour la Science Ouverte,

           I l’évolution des pratiques d’évaluation de la recherche.

Le protocole CDUR pour l’évaluation des logiciels de la recherche fait partie de la 3ième pierre.
  T. Gomez-Diaz (CNRS/LIGM)                        Logiciels libres au LIGM              Marne-la-Vallée, janvier 2022   14 / 18
Sur la Science Ouverte (3/3)
The future of Open Science                                                                     The future of Open Science                                                                                                                                                                              as
                                                                                                                                                                                                                                                                                                            pa
                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 rd - M o
                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            n

                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            ge
                                                                                                                                                                                                                                                                                                  G
asks for a common understanding                                                             asks for a common understanding

                                                                                                                                                                                                                                                                                                 -

                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 -
                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                ue
                                                                                                                                                                                                                                                                                                 Lab

                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                iq
                                                                                                                                                                                                                                                                                                     at

                                                                                                                                                                                                                                                                                                  or

                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        at
                                                                                                                                                                                                                                                                                                          oir               m
                                                                                                                                                                                                                                                                                                                e d'infor

                                                                                                                    Teresa Gomez-Diaz, CNRS/LIGM, Est of Paris
                                                                                                                    Tomas Recio, University Nebrija, Madrid

                                                                                                                A definition is missing                                                                                                    Our contribution
                   Open Science is                                                         Definition [of Open Science] remains vague, probably
                                                                                           because objectives are vague... (Aspesi, COASP 2014)
                                                                                                 ... there is no single, accepted, unified definition                                                       Goal
                                                                                                     or vision of ‘open science’... (Tennant, 2018)

         the political and legal framework                                            ... there is a lack of awareness about what Open Science is,
                                                                                         mainly due to the fact that there is no formal definition
                                                                                      of Open Science ... (Vicente-Saez & Martinez-Fuentes, 2018)
                                                                                                                                                                                                            To contribute to the adoption of a common, unified vision.

                                                                                                                                                                                                            Definition proposal
        where research outputs are shared                                                     Recent, inclusive & complete visions
                                                                                                                                                                                                            Open Science is the political and legal framework where
                                                                                                                                                                                                            research outputs are shared and disseminated in order
     and disseminated in order to be rendered                                                                                                                                                               to be rendered visible, accessible and reusable
                                                                                                                                                                                                            (Gomez-Diaz & Recio, 2020-21).

          visible, accessible and reusable.                                                         (Méndez 2021, Image: Méndez 2017, CC-BY)
                                                                                                                                                                                                            Three steps supporting this proposal
                                                                                                                                                                                                            I - Three selected pillars for a common understanding
                                                                                For the purpose of this Recommendation, Open Science is defined
                                                                                                                                                                                                            II - Towards a political and legal framework
                (Gomez-Diaz & Recio, 2020-21)                                   as an inclusive construct [...] aiming to make scientific knowledge
                                                                                   openly available, accessible and reusable for everyone, [...]
                                                                           It includes all scientific disciplines and aspects of scholarly practices, [...]
                                                                                                                                                                                                            III - Enablers: three cornerstones to get to a working framework
                                                                          it builds on the following key pillars: open access to scientific knowledge,
                                                                                         open science infrastructures, ... (UNESCO, 2021)

                                                                          I - Three selected pillars for                                                                                                 Budapest Open Access Initiative, 2002
                                                                          a common understanding                                                                                                         By “open access” to [peer-reviewed research literature], we mean its free availability

 I Three selected pillars                                                                        Free Software Foundation, 1985
                                                                                                                                                                                                         on the public internet, permitting any users to read, download, copy, distribute, print, search, or link...

                                                                                                                                                                                                                                     Committee on Data for Sciences and Technology, 1966
                                                                                                 The free software definition presents the criteria for whether a particular
                                                                                                                                                                                                                                     CODATA est un Comité au niveau scientique international le plus élevé [...]

        BOAI (2002)                                                                              software program qualifies as free software: the freedom to run the program
                                                                                                 as you wish, the freedom to study how the program works, and change it...
                                                                                                 + importance of licenses        l
                                                                                                                                                 Lega
                                                                                                                                                                                                                                     à cause de l'importance qui s'attache à l'évaluation des données...

        Free Software Foundation (1985)                                   II - Towards a political and
                                                                          legal framework
                                                                                                                                                                                                                         “Towards better access to scientific information:
                                                                                                                                                                                                                      Boosting the benefits of public investments in research”
                                                                                                                                                                                                                                  (European Commission, 2012)

        CODATA (1966)                                                          Polic
                                                                                        y         ...sets out the action that intends to improve access to scientific information and to boost the benefits of public investment in research. [...]
                                                                                            To improve access to scientific information, Member States, research funding bodies, researchers, scientific publishers, Universities and their libraries,
                                                                                      innovative industries, and society at large need to work together [...] so that the ‘fifth freedom’ of the EU – the free circulation of knowledge – can become a reality.

                                                                                                                                                                                                                                       LOI du 7 octobre 2016 pour une République numérique, Article 30
                                                                                           BOE N. 131 de 2 de junio de 2011, Artículo 37

II Towards a political and legal framework                                1. Los agentes públicos impulsarán el desarrollo de repositorios de acceso abierto a las publicaciones...
                                                                          2. Los investigadores cuya actividad haya sido financiada mayoritariamente con los Presupuestos
                                                                            Generales del Estado están obligados a publicar en acceso abierto una versión electrónica de         Law
                                                                                                                                                                                                                            I. Lorsqu'un écrit scientifique issu d'une activité de recherche financée au moins pour moitié
                                                                                                                                                                                                                               par des dotations publiques est publié, son auteur dispose, même après avoir accordé des
                                                                                                                                                                                                                               droits exclusifs à un éditeur, du droit de mettre à disposition gratuitement....
                                                                                                                                                                                                                            II. Dès lors que les données issues d'une activité de recherche financée au moins pour moitié
                                                                            los contenidos aceptados para publicación...
                                                                                                                                                                                                                               par des dotations publiques [...] ont été rendues publiques, leur réutilisation est libre.
                                                                          4. La versión electrónica pública podrá ser empleada en los procesos de evaluación.
                                                                                                                                                                                                                            Plan national pour la Science Ouverte, Juillet 2018 & 2ième Plan, juillet 2021

III Enablers :                                                            Estrategia Española de Ciencia, Tecnología e Innovación (EECTI) 2021-2027
                                                                          La ciencia excelente y abierta constituye uno de los pilares del Objetivo 4 (Generación de
                                                                          conocimiento y liderazgo científico). El impulso a un modelo de Ciencia Abierta favorecerá
                                                                          la generación de conocimiento de alta calidad e impacto, así como su transmisión a la sociedad...
                                                                                                                                                                                                                Polic
                                                                                                                                                                                                                        y   1. Rendre obligatoire la publication en accès ouvert des articles et livres issus de recherches
                                                                                                                                                                                                                              financées par appel d’offres sur fonds publics.
                                                                                                                                                                                                                            4. Rendre obligatoire la diffusion ouverte des données de recherche issues de programmes
                                                                                                                                                                                                                              financés par appels à projets sur fonds publics.

      I Institutional policies                                                                                                                    Other Member States, see: Open Science overview in Europe, OpenAIRE, https://www.openaire.eu/os-eu-countries
                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        y
                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                Polic
                                                                          III - Enablers: three cornerstones                                                                                - Institutional policies: the required evolution of policies of Universities and RPOs.

                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            http://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/4.0/
      I Infrastructures                                                   to get to a working framework                                                                                     - Infrastructures: the development of Open Science-oriented infrastructures and services.
                                                                                                                                                                                            - Research evaluation: the transformation of evaluation policies and practices.

                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            Conception et réalisation : T. Gomez-Diaz - october 2021
                                                                    Some references
                                                                    - Aspesi C. (2014). A financial analyst's perspective on open access, COASP 2014.

      I Research evaluation                                         - European Commission (2012). Towards better access to scientific information: Boosting the benefits of public investments in research,
                                                                      COM(2012) 401 final, European Commission, Brussels.
                                                                    - Expert Group to the European Commission (2019). Future of Scholarly Publishing and Scholarly Communication.
                                                                    - Gomez-Diaz T. & Recio T. (2020-21). Towards an Open Science definition as a political and legal framework: on the sharing and
                                                                      dissemination of research outputs. Version 2, POLIS N. 19, pp. 5-25, 2020. Version 3, 28/02/2021, Zenodo.
                                                                    - Margoni T., Caso R., Ducato R., Guarda P. & Moscon V. (2016). Open Access, Open Science, Open Society, University of Trento.
                                                                    - Méndez E. (2021). Open Science por defecto. La nueva normalidad para la investigación. ARBOR Ciencia, Pensamiento y Cultura.
                                                                                                                                                                                                                                                                      EGI Virtual Conference 2021
                                                                    - Tennant J. P. (2018). The state of the art in peer review. FEMS Microbiology Letters, Volume 365, Issue 19, fny204.                                                                                  19-21 october 2021
                                                                    - UNESCO (2021). Final report on the draft text of the UNESCO Recommendation on Open Science, CL/4349.
                                                                    - Vicente-Saez R., & Martinez-Fuentes C. (2018). Open Science now: A systematic literature review for an integrated definition, J. Business Research, V. 88.
                                                                    - More information and references at: Gomez-Diaz & Recio (2020-21).
                                                                    This work is partially funded by the CNRS-IEA PREOSI project (2021-22).
                                                                    With many thanks to Wikimedia Commons for the «green pillar» https://commons.wikimedia.org/wiki/File:GreenPillar.svg.

EGI Virtual Conference 2021, Lisbon, 19-21 october 2021
https://padlet.com/gwenfranck/EGI2021Posters

  T. Gomez-Diaz (CNRS/LIGM)                      Logiciels libres au LIGM                                                                                                           Marne-la-Vallée, janvier 2022                                                                                                                          15 / 18
Comment donner de la valeur à cette production ?
En augmentant la réputation scientifique des producteurs des RS, voir :
(2019) TGD, T. Recio : On the evaluation of research software: the CDUR procedure

(C) Citation      mesure si RS bien identifié : référence, metadata, bien citer autres...
                  point légal : auteurs, affiliations, participation
(D) Dissemination bonnes pratiques de diffusion selon contexte de l’évaluation,
                  [29] (2014) TGD : Free software, Open source software, licenses...
                  point Science Ouverte, légal : licences
(U) Use           aspects “logiciel” du RS : résultats corrects, facilite la réutilisation ; et
                  aussi bonnes pratiques logiciel : exemples, docs., test, facilite install.,
                  voir le code, lancer le RS, qualité, dépôt APP...
                  point reproductibilité, validation des résultats obtenus
(R) Research aspects “recherche” : qualité du travail scientifique, algorithmes et
             structures de données, publications, collaborations et projets...
             point impact de la recherche

Flexibilité d’application : chaque décideur ou comité d’évaluation établit son propre
protocole CDUR adapté au contexte et aux objectifs de l’évaluation.
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Conclusions
Sésame, ouvre-toi ! Infrastructures et services pour les logiciels
                : travail en cours au groupe de travail de l’Univ. Gustave Eiffel
Définition     Ce que je fais est un logiciel LIGM ?
                : définitions proposées : logiciels d’un laboratoire, de la recherche
Référence     Pas de nom, pas d’auteurs, pas de date, pas de version...
                : référence, procédures de diffusion, plans de gestion des logiciels
Diffusion       Quelques uns sur pages web perso, sur des forges, avec page web...
                : procédures de diffusion, plans de gestion des logiciels
FLOSS           Un réel intérêt pour les logiciels libres, mais souvent pas de licence
                : besoin de continuer la formation, le support : nouveaux membres...
Questions légales Qui décide de la licence ?
                : besoin de continuer la formation, le support : nouveaux membres...
Questions de politique Définition, licences, diffusion, décisions...
                  (2009) TGD : Guide laboratoire pour recenser ses développements logiciels
                  : travail en cours au groupe de travail de l’Univ. Gustave Eiffel
Valeur            Quelle est la valeur de cette production scientifique ?
                  : proposition des protocoles d’évaluation CDUR
      Questions de nature diverse, similaires pour tout domaine scientifique                                       :
                        : solutions adaptables proposées.
  T. Gomez-Diaz (CNRS/LIGM)                   Logiciels libres au LIGM            Marne-la-Vallée, janvier 2022       17 / 18
Références

 2007 TGD : Autour de la valorisation de logiciels développés dans un laboratoire de recherche.
 2009 TGD : Licence & copyright pour les développements de logiciels libres de laboratoires
      de recherche, PLUME, https://projet-plume.org/fr/ressource/faq-licence-copyright
 2009 TGD : Guide laboratoire pour recenser ses développements logiciels, PLUME,
      https://projet-plume.org/ressource/guide-laboratoire-recensement-developpements-logiciels
 2010 TGD : Diffuser un logiciel de laboratoire : recommandations juridiques et administratives, PLUME,
      http://www.projet-plume.org/fr/ressource/diffuser-logiciel-recomm-juridiques-admin
 2011 TGD : Article vs. Logiciel : questions juridiques et de politique scientifique dans la production de logiciels, PLUME,
      http://www.projet-plume.org/fr/ressource/article-vs-logiciel
 2014 TGD : Free software, Open source software, licenses. A short presentation including a procedure
      for research software and data dissemination, Zenodo, https://zenodo.org/record/11709
 2015 TGD : Article vs. Logiciel : questions juridiques et de politique scientifique dans la production de logiciels,
      Société Informatique de France, https ://zenodo.org/record/18993
 2018 TGD, G. Romier : Research Software management Plan Template V3.2,
      Projet PRESOFT, Zenodo, https://zenodo.org/record/1405614. Voir aussi sur DMP OPIDoR.
 2019 TGD : Le Projet PLUME et le paysage actuel des logiciels de la recherche dans la science ouverte, Zenodo,
      https://zenodo.org/record/2591474
 2019 TGD, T. Recio : On the evaluation of research software: the CDUR procedure, F1000Research,
      https://doi.org/10.12688/f1000research.19994.2
2020-1 TGD, T. Recio : Towards an Open Science definition as a political and legal framework: on the sharing and dissemination
       of research outputs, POLIS N. 19, 2020, https://uet.edu.al/polis/wp-content/uploads/2022/01/polis-19.pdf,
       Version 3 du 28/02/2021 : https://zenodo.org/record/4577066
 2021 TGD, T. Recio : Open comments on the Task Force SIRS report: Scholarly Infrastructures for Research Software
      (EOSC Executive Board, EOSCArchitecture), RIO 7: e63872, https://doi.org/10.3897/rio.7.e63872

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