Évaluer la charge de morbidité d'origine alimentaire : guide pratique à l'intention des pays - Un guide pour la planification, la mise en oeuvre ...
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1 Évaluer la charge de morbidité d’origine alimentaire : guide pratique à l’intention des pays Un guide pour la planification, la mise en oeuvre et la notification de la charge des maladies d'origine alimentaire au niveau des pays
Évaluer la charge de morbidité d’origine alimentaire : guide pratique à l’intention des pays Un guide pour la planification, la mise en oeuvre et la notification de la charge des maladies d’origine alimentaire au niveau des pays
Évaluer la charge de morbidité d’origine alimentaire : guide pratique à l’intention des pays ISBN 978-92-4-001992-8 (version électronique) ISBN 978-92-4-001993-5 (version imprimée) © Organisation mondiale de la Santé 2021 Certains droits réservés. La présente œuvre est disponible sous la licence Creative Commons Attribution – Pas d’utilisation commerciale – Partage dans les mêmes conditions 3.0 IGO (CC BY-NC-SA 3.0 IGO ; https://creativecommons.org/licenses/by-nc-sa/3.0/igo/deed.fr). Aux termes de cette licence, vous pouvez copier, distribuer et adapter l’œuvre à des fins non commerciales, pour autant que l’œuvre soit citée de manière appropriée, comme il est indiqué cidessous. Dans l’utilisation qui sera faite de l’œuvre, quelle qu’elle soit, il ne devra pas être suggéré que l’OMS approuve une organisation, des produits ou des services particuliers. L’utilisation du logo de l’OMS est interdite. Si vous adaptez cette œuvre, vous êtes tenu de diffuser toute nouvelle œuvre sous la même licence Creative Commons ou sous une licence équivalente. Si vous traduisez cette œuvre, il vous est demandé d’ajouter la clause de non-responsabilité suivante à la citation suggérée : « La présente traduction n’a pas été établie par l’Organisation mondiale de la Santé (OMS). L’OMS ne saurait être tenue pour responsable du contenu ou de l’exactitude de la présente traduction. L’édition originale anglaise est l’édition authentique qui fait foi ». Toute médiation relative à un différend survenu dans le cadre de la licence sera menée conformément au Règlement de médiation de l’Organisation mondiale de la propriété intellectuelle (https://www.wipo.int/amc/fr/ mediation/rules/index.html). Citation suggérée. Évaluer la charge de morbidité d’origine alimentaire : guide pratique à l’intention des pays [Estimating the burden of foodborne diseases: a practical handbook for countries]. Genève, Organisation mondiale de la Santé, 2021. Licence : CC BY-NC-SA 3.0 IGO. Catalogage à la source. Disponible à l’adresse https://apps.who.int/iris/?locale-attribute=fr&. Ventes, droits et licences. Pour acheter les publications de l’OMS, voir http://apps.who.int/bookorders. Pour soumettre une demande en vue d’un usage commercial ou une demande concernant les droits et licences, voir https://www.who.int/fr/about/who-we-are/publishing-policies/copyright. Matériel attribué à des tiers. Si vous souhaitez réutiliser du matériel figurant dans la présente œuvre qui est attribué à un tiers, tel que des tableaux, figures ou images, il vous appartient de déterminer si une permission doit être obtenue pour un tel usage et d’obtenir cette permission du titulaire du droit d’auteur. L’utilisateur s’expose seul au risque de plaintes résultant d’une infraction au droit d’auteur dont est titulaire un tiers sur un élément de la présente œuvre. Clause générale de non-responsabilité. Les appellations employées dans la présente publication et la présentation des données qui y figurent n’impliquent de la part de l’OMS aucune prise de position quant au statut juridique des pays, territoires, villes ou zones, ou de leurs autorités, ni quant au tracé de leurs frontières ou limites. Les traits discontinus formés d’une succession de points ou de tirets sur les cartes représentent des frontières approximatives dont le tracé peut ne pas avoir fait l’objet d’un accord définitif. La mention de firmes et de produits commerciaux ne signifie pas que ces firmes et ces produits commerciaux sont agréés ou recommandés par l’OMS, de préférence à d’autres de nature analogue. Sauf erreur ou omission, une majuscule initiale indique qu’il s’agit d’un nom déposé. L’OMS a pris toutes les précautions raisonnables pour vérifier les informations contenues dans la présente publication. Toutefois, le matériel publié est diffusé sans aucune garantie, expresse ou implicite. La responsabilité de l’interprétation et de l’utilisation dudit matériel incombe au lecteur. En aucun cas, l’OMS ne saurait être tenue pour responsable des préjudices subis du fait de son utilisation.
iii TABLE DES MATIÈRES Préfacevii Remerciementsx Abréviations et acronymes utilisés dans le présent guide xii Résumé d’orientation xiii 1. INTRODUCTION 1 Pourquoi évaluer la charge de morbidité d’origine alimentaire ? 2 Finalité du présent guide 3 Charge de morbidité 4 Champ d’application 4 Public cible 4 Comment utiliser le présent guide 4 2. LES ÉTUDES SUR LA CHARGE DE MORBIDITÉ D’ORIGINE ALIMENTAIRE 7 But et objectifs 10 Principaux éléments et étapes 10 Conditions requises 12 Éléments facilitant les études 12 3. LA PLANIFICATION DES ÉTUDES SUR LA CHARGE DE MORBIDITÉ D’ORIGINE ALIMENTAIRE 15 Établissement du plan de travail 16 Analyse de la situation 16 Définition du cadre général 19 Vérification des capacités 19 Choix des dangers sur lesquels portera l’étude 20 4. PRÉPARATION DES DONNÉES 21 Identification des données nécessaires et des sources 22 Données démographiques 23 Données concernant l’incidence 24 Choix des événements de santé 30 Données concernant les schémas de morbidité 30 Poids des incapacités 31 Durée de la maladie 32 Données concernant la mortalité 32 Collecte des données 32 Pallier les lacunes et la distorsion des données 32
iv TABLE DES MATIÈRES 5. ESTIMATION DE L’INCIDENCE, DE LA MORTALITÉ ET DES DALY 37 Incidence et mortalité 39 Incidence d’autres événements de santé et séquelles 41 Calcul des DALY 41 Incertitude 42 Logiciels 43 6. ESTIMATION DES DALY RÉSULTANT DE MALADIES D’ORIGINE ALIMENTAIRE45 7. INTERPRÉTATION DES RÉSULTATS CONCERNANT LA CHARGE NATIONALE DE MORBIDITÉ D’ORIGINE ALIMENTAIRE 49 8. L’APPLICATION DES CONNAISSANCES ET L’INFORMATION SUR LES RISQUES 53 Utiliser les DALY pour évaluer la charge économique des maladies d’origine alimentaire 55 9. CONSIDÉRATIONS FINALES 59 Bibliographie61 Annexe 1. Évaluer la charge de morbidité due à la présence de produits chimiques dans les aliments 65 Annexe 2. Méthodes d’attribution des sources 68 Annexe 3. Liste des dangers alimentaires établie par le FERG 73 Annexe 4. Liste récapitulative des données à collecter 78 Annexe 5. Méthodes et hypothèses retenues par le FERG pour pallier les lacunes dans les données 81
v LISTE DES TABLEAUX, FIGURES ET BOXES Liste des tableaux TABLEAU 1. Facteurs à prendre en considération dans le choix des dangers à inclure dans l’étude nationale sur la charge de morbidité d’origine alimentaire 20 TABLEAU 2. Données démographiques requises pour réaliser une étude sur la charge nationale de morbidité d’origine alimentaire, sources et critères d’évaluation 22 TABLEAU 3. Table de survie standard de l’OMS concernant les années vécues en incapacité utilisée dans les estimations de la charge mondiale de morbidité pour la période 2000-2016 24 TABLEAU 4. Données syndromiques requises pour réaliser une étude sur la charge nationale de morbidité/mortalité d’origine alimentaire, sources et critères d’évaluation 30 TABLEAU 5. Exemples de lacunes et de distorsions des données fréquemment rencontrées dans les études sur la charge de morbidité d’origine alimentaire, éléments en cause et solutions possibles 33 TABLEAU 6. Résultats concernant la charge de morbidité d’origine alimentaire au Danemark en 2017 51 TABLEAU 7. Attentes des différents acteurs et communication des résultats concernant la charge de morbidité d’origine alimentaire 54 TABLEAU A1.1 Aperçu général des données requises pour évaluer la charge de morbidité due aux produits chimiques présents dans les aliments, des sources de données possibles et des critères d’évaluation 67 TABLEAU A2.1 Avantages et inconvénients des méthodes d’attribution DES SOURCES 70 TABLEAU A3.1. Liste détaillée des principaux agents en cause dans les maladies d’origine alimentaire initialement dressée par le FERG 73 TABLEAU A3.2. Liste des dangers alimentaires dont le FERG a estimé la charge de morbidité 74 TABLEAU A3.1. Dangers alimentaires, états de santé causés par ces dangers et poids des incapacités correspondants 74 TABLEAU A4.1. Une liste des sources de données démographiques, des informations attendues et des évaluations de la qualité 78 TABLEAU A4.2. Une liste des sources de données épidémiologiques, des informations attendues et des évaluations de la qualité 79 Liste des figures FIGURE 1. Termes d’années de vie ajustées sur l’incapacité - Disability-adjusted life years (DALYs) 9 FIGURE 2. Principaux éléments et étapes d’une étude sur la charge de morbidité d’origine alimentaire 11 FIGURE 3. Pyramide de surveillance des maladies d’origine alimentaire 25
vi LISTE DES TABLEAUX, FIGURES ET BOXES FIGURE 4. Exemple d’un modèle de maladie pour une infection aux salmonelles non typhiques 30 FIGURE 5. Échantillon du poids des incapacités associé à différentes maladies 31 FIGURE 6. Principales étapes du calcul de la charge de morbidité d’origine alimentaire 38 FIGURE 7. Modèle de schéma de morbidité pour le calcul de la charge de morbidité des dangers alimentaires 39 FIGURE 8. Représentation graphique du déficit de santé quantifié à l’aide des DALY 42 Liste des boxes BOX 2.1. La méthode de calcul de la charge de morbidité basée sur la prévalence 9 BOX 2.2. Études de pays du FERG 13 BOX 4.1. Le sousdiagnostic et de la sous-déclaration 25 BOX 4.2. Détermination du poids des incapacités (PIs) 31 BOX 5.1. Exemple de calcul des DALYs 41 BOX 5.2. Variabilité et incertitude 43 BOX 7.1. Exemple de présentation et d’interprétation des résultats concernant la charge de morbidité d’origine alimentaire 51 BOX 8.1. Utiliser les DALY pour évaluer la charge économique des maladies d’origine alimentaire 55 BOX A1.1. Relation dose-réponse 66 Expériences pays • Le cas de l’Albanie 17 • Le cas des Caraïbes 26 • Le cas de la Thaïlande 34 • Projet international mené en Éthiopie, au Mozambique, au Nigéria et en République-Unie de Tanzanie 35 • Le cas du Japon 47 • Le cas de la Nouvelle-Zélande 48 • Le cas des Pays-Bas 56
vii PRÉFACE L’évaluation de la charge de morbidité Cette initiative visait également à des maladies d’origine alimentaire est aider les pays à évaluer leur charge de un élément essentiel pour classer les morbidité d’origine alimentaire et à faire risques correspondants, établir des en sorte qu’ils soient plus nombreux priorités en ce qui concerne la sécurité à entamer de telles recherches. Ces sanitaire des aliments et répartir évaluations permettent en effet de efficacement les ressources destinées répartir plus efficacement les moyens à prévenir les maladies d’origine de prévention, d’intervention et de alimentaire. Afin de se faire une idée lutte contre les maladies d’origine aussi précise que possible du poids alimentaire. Aussi tous les pays sont-ils des maladies d’origine alimentaire invités à se lancer dans la réalisation de à l’échelle régionale et mondiale, en leurs propres estimations, simplifiées ou 2007, l’OMS a lancé une initiative non, selon les compétences techniques visant à évaluer la charge mondiale et les moyens dont ils disposent. Il de morbidité correspondante. Dans convient de préciser que, quels que le prolongement de cette initiative, soient le niveau de développement l’OMS a publié pour la première fois et les ressources disponibles, il est en 2015 des estimations sur la charge essentiel que les pays utilisent des mondiale de morbidité d’origine méthodes uniformes, de manière à alimentaire, qui ont été réalisées par le pouvoir mettre en commun les résultats Groupe de référence sur l’épidémiologie obtenus, comparer les chiffres et, in des maladies d’origine alimentaire fine, améliorer les politiques relatives à (FERG). Le FERG a évalué la charge de la sécurité sanitaire des aliments. morbidité de 31 dangers répartis en 11 agents responsables de maladies On trouvera dans le présent guide des diarrhéiques, 7 agents responsables explications détaillées sur l’évaluation de maladies invasives, 10 helminthes de la charge de morbidité due aux et 3 produits chimiques et toxines agents microbiologiques fréquemment en s’appuyant sur les trois critères transmis par les aliments. Destiné à suivants : incidence, mortalité et être utilisé en particulier au niveau années de vie ajustées sur l’incapacité national, celui-ci donne une image (DALY). Ces estimations ont permis complète des conditions requises, des de mettre en évidence les priorités éléments qui facilitent les évaluations, concernant la sécurité sanitaire des des difficultés à surmonter et des aliments dans différentes régions possibilités que présentent ces du monde et ont été utilisées pour évaluations, ainsi que des différentes réaliser des analyses complémentaires, étapes du processus. Il vise en outre à notamment sur la charge que les favoriser l’harmonisation des méthodes aliments impropres à la consommation d’évaluation de la charge de morbidité font peser sur l’économie 1. d’origine alimentaire entre les pays. 1 Jaffee S, Henson S, Unnevehr L, Grace D, Cassou E. The safe food imperative: accelerating progress in low- and middle-income countries. Agriculture and Food Series. Washington, DC: Banque mondiale; 2019.
viii PRÉFACE Cet ouvrage a été structuré dans toute la différents égards et y remédier. Enfin, mesure possible autour des différentes on y trouve des informations sur les étapes à suivre lorsqu’on réalise une logiciels disponibles. étude nationale sur la charge de • Le Chapitre 6 propose une méthode morbidité d’origine alimentaire. pour évaluer la part de la charge • Le Chapitre 2 explique en quoi totale de morbidité qui relève de la consistent les études sur la charge transmission par les aliments. de morbidité d’origine alimentaire • Le Chapitre 7 explique ce dont il est et comment il convient de procéder important de tenir compte dans la dans ce domaine. Il y est question présentation et l’interprétation des des but et objectifs de ces études, résultats d’une étude sur la charge des principaux éléments à prendre de morbidité d’origine alimentaire. en considération et des étapes à On y trouve des suggestions sur la suivre, ainsi que des conditions manière de présenter les résultats requises et des facteurs qui facilitent et d’expliquer les hypothèses et leur réalisation. les limites de l’étude, ainsi que des • Le Chapitre 3 décrit les travaux de exemples des éléments à inclure planification et de lancement des dans les résultats. études sur la charge de morbidité • Enfin, le chapitre 8 donne des d’origine alimentaire. Il explique le indications sur les types de supports pourquoi de l’analyse de la situation qu’on peut utiliser pour présenter nationale et les différentes étapes et diffuser les résultats des études à suivre, les variables à prendre en sur la charge de morbidité auprès considération pour définir le cadre de des différents publics cibles et l’étude, les ressources matérielles et décrit dans les grandes lignes les les effectifs nécessaires et comment moyens existants pour informer sur choisir les agents pathogènes sur les risques et faire en sorte que les lesquels portera l’étude. connaissances scientifiques soient • Le Chapitre 4 chapitre est consacré transposées dans des politiques. aux données nécessaires pour réaliser une étude sur la charge Ces différents aspects et activités nationale de morbidité. Il dresse auront probablement un caractère une liste des sources d’information dynamique et interactif et devront être potentielles et propose des adaptés au contexte national, compte méthodes de collecte de données tenu de la capacité de surveillance et des solutions pour pallier les de la santé publique du pays et des lacunes. données effectivement disponibles. Si • Le Chapitre 5 a trait aux différentes les études nationales doivent tendre étapes du calcul de la charge vers l’estimation des DALY, les étapes nationale de morbidité d’origine intermédiaires telles que l’estimation alimentaire. On y apprend comment de l’incidence et de la mortalité des calculer l’incidence, la mortalité maladies d’origine alimentaire, sont, elles et les DALY et comment évaluer aussi, utiles pour évaluer l’impact de les éventuelles incertitudes à ces ces maladies sur la santé publique par
ix rapport à celui d’autres maladies. Enfin, permettent en outre de mettre en une étude sur la charge de morbidité évidence les besoins et les informations d’origine alimentaire est aussi l’occasion qui font défaut dans les systèmes de repérer les lacunes dans les données, de sécurité sanitaire des aliments et de nouer un dialogue avec les acteurs de de promouvoir la coopération et la la sécurité sanitaire des aliments dans communication entre les différentes l’ensemble du pays et de faire converger parties prenantes. Tous les pays, quels les différentes actions en plaidant pour que soient leur niveau de développement la communication et la mise en commun et l’étendue de leurs connaissances des informations. techniques, sont invités à commencer à travailler à la réalisation de telles On trouvera tout au long du présent guide études dans toute la mesure possible. des exemples tirés d’études nationales Ils seront peut-être amenés pour ce qui montrent comment celles-ci ont été faire à réaliser dans un premier temps menées dans les différentes régions du des études élémentaires qu’ils pourront monde. Les aspects techniques sont progressivement affiner et enrichir décrits en détail dans les cinq annexes. à mesure que leurs moyens le leur permettront. Enfin, il importe que l’équipe Les études nationales sur la charge technique chargée de la réalisation de de morbidité d’origine alimentaire sont l’étude associe les différentes parties essentielles pour combler les lacunes prenantes, les décideurs et les experts concernant les données observées en sciences sociales au projet dès les dans le cadre d’initiatives régionales premières étapes, de manière à favoriser et mondiales, concentrer l’action sur la communication et la collaboration, le contexte national et produire des ainsi que l’application des connaissances évaluations aussi exactes que possible et l’élaboration de politiques fondées sur à partir des données locales. Elles des données scientifiques.
x REMERCIEMENTS REMERCIEMENTS L’Organisation mondiale de la Santé exprime ses remerciements sincères aux personnes ci-après qui ont participé à l’élaboration du présent guide. Rédaction initiale Le groupe de rédaction initial se composait des personnes suivantes : Frederick J. Angulo, United States Centers for Disease Control and Prevention, Atlanta, Géorgie (États-Unis d’Amérique); Peter Cressey, Institut de sciences et de recherche environnementales, Christchurch (Nouvelle-Zélande); Brecht Devleesschauwer, Sciensano, Bruxelles (Belgique); John Ehiri, Université d’Arizona, Tucson, Arizona (États-Unis d’Amérique); Juanita Haagsma, Centre médical de l’Université Erasmus, Rotterdam (Pays-Bas); Arie Havelaar, Université de Floride, Gainesville, Floride (États- Unis d’Amérique); Steve Jaffee, Université du Maryland, College Park, Maryland (États- Unis d’Amérique); Helen Jensen, Université d’État de l’Iowa, Ames, Iowa (États-Unis d’Amérique); Nasreen Jessani, École de santé publique Johns Hopkins Bloomberg, Baltimore, Maryland (États-Unis d’Amérique); Robin Lake, Institut de sciences et de recherche environnementales, Christchurch (Nouvelle-Zélande); Charline Maertens de Noordhout, Université catholique de Louvain, Bruxelles (Belgique); Sara M. Pires, Université technique du Danemark, Lyngby (Danemark); et Niko Speybroeck, Université catholique de Louvain, Bruxelles (Belgique). Le travail initial a été coordonné par le Centre collaborateur de l’OMS pour l’évaluation des risques liés à la présence d’agents pathogènes dans les aliments et dans l’eau installé dans les locaux de l’Institut national de la santé publique et de l’environnement des Pays- Bas, à Bilthoven (Pays-Bas). Finalisation La rédaction définitive a été réalisée par : Sara M. Pires, Université technique du Danemark, Lyngby (Danemark) (auteure principale); Brecht Devleesschauwer, Sciensano, Bruxelles (Belgique); Arie Havelaar, Université de Floride, Gainesville, Floride (États-Unis d’Amérique); Lea Jakobsen, Université technique du Danemark, Lyngby (Danemark); et Robin Lake, Institut de sciences et de recherche environnementales, Christchurch (Nouvelle-Zélande). Les informations concernant les exemples nationaux ont été fournies par : Suchunya Aungkulanon, Ministre de la santé publique, Amphur Muang (Thaïlande); Tine Hald, Université technique du Danemark, Lyngby (Danemark); Lisa Indar, Agence de santé publique des Caraïbes, Port d’Espagne (Trinité-et-Tobago); Kunihiro Kubota, Institut national des sciences de la santé, Kanagawa (Japon); Yuko Kumagai, Université féminine de Wayo, Ichikawa (Japon); Robin Lake, Institut de sciences et de recherche environnementales, Christchurch (Nouvelle-Zélande); Lindita Molla, Service albanais de réglementation de l’eau, Tirana (Albanie); Lapo Mughini Gras, Institut national de la santé publique et de l’environnement, Bilthoven (Pays-Bas); et Sara M. Pires, Université technique du Danemark, Lyngby (Danemark).
xi Le projet final a été révisé par un groupe d’intervenants extérieurs, à savoir : Mohammad Alwetaid, Bureau saoudien de la santé et de l’alimentation, Riyad (Arabie saoudite); Eva Inam Al Zein, Autorité jordanienne de l’alimentation et du médicament, Amman (Jordanie); Erica Billig Rose, US Centers for Disease Control and Prevention, Atlanta, Géorgie (États-Unis d’Amérique); Beau B. Bruce, US Centers for Disease Control and Prevention, Atlanta, Géorgie (États-Unis d’Amérique); Eleanor Click, US Centers for Disease Control and Prevention, Atlanta, Géorgie (États-Unis d’Amérique); Agaba Edson Friday, Autorité nationale du médicament, Ministère de la santé, Kampala (Ouganda); Gbemenou Joselin Benoit Gnonlonfin, Communauté économique des États de l’Afrique de l’Ouest, Abuja (Nigéria); Patricia M. Griffin, US Centers for Disease Control and Prevention, Atlanta, Géorgie (États-Unis d’Amérique); Zainab Jallow, consultante indépendante, Serrekunda (Gambie); Kunihiro Kubota, Institut national des sciences de la santé, Kanagawa (Japon); Lindita Molla, Service albanais de réglementation de l’eau, Tirana (Albanie); Lapo Mughini Gras, Institut national de la santé publique et de l’environnement, Bilthoven (Pays-Bas); Elaine Scallan Walter, Université du Colorado, Aurora, Colorado (États-Unis d’Amérique); Mashresha Tessema, Institut éthiopien de la santé publique, Addis-Abeba (Éthiopie); Lucie C. Vermeulen, Centre collaborateur de l’OMS pour l’évaluation des risques liés à la présence d’agents pathogènes dans les aliments et dans l’eau, Bilthoven (Pays-Bas); et Jinjing Zhang, Office public de réglementation du marché, Beijing (Chine). L’OMS remercie en outre tout particulièrement ses collègues du Groupe de la sécurité sanitaire et de la qualité des aliments de l’Organisation des Nations Unies pour l’alimentation et l’agriculture (FAO), notamment Eleonora Dupouy, Alice Green, Christine Kopko et Keya Mukherjee, de leur contribution. Ont également fourni une contribution non négligeable et participé à la révision du présent guide les conseillers régionaux de l’OMS en matière de sécurité alimentaire Margarita Corrales, Gyanendra Gongal, Peter Sousa Hoejskov, Simone Moraes Raszl, Lusubilo Mwamakama et Philippe Verger, ainsi que Bochan Cao de la Division Analyse de données, résultologie et impact de l’OMS. Les travaux ont été coordonnés par Yuki Minato, Département de l’OMS Nutrition et sécurité sanitaire des aliments de l’OMS, à Genève (Suisse), avec le concours de Chrystelle Daffara, Cheng Liang, Naoko Obara, Ruwanthi Jayasuriya, Claire Scott, et Luz de Regil comme chef d’unité. La révision technique a été réalisée par Patricia Butler, Cascais (Portugal) et la maquette et la mise en page ont été confiées à Blossom Srl, Meda (Italie). Enfin, l’OMS tient à remercier le Gouvernement du Japon de son appui financier.
xii ABRÉVIATIONS ET ACRONYMES UTILISÉS DANS LE PRÉSENT GUIDE ABRÉVIATIONS ET ACRONYMES UTILISÉS DANS LE PRÉSENT GUIDE AVI années vécues en incapacité AVP années de vie perdues AVPES années de vie perdues par rapport à l’espérance de vie standard DALY années de vie ajustées sur l’incapacité EAEC E. coli entéroaggrégatif EHEC E. coli entérohémorragique EPEC E. coli entéropathogène ETEC E. coli entérotoxinogène EVR espérance de vie résiduelle FAO Organisation des Nations Unies pour l’alimentation et l’agriculture FERG Groupe de référence sur l’épidémiologie des maladies d’origine alimentaire INDEPTH réseau international des sites d’étude chargés de l’évaluation démographique continue des populations et de leur santé dans les pays en développement OMS Organisation mondiale de la Santé ONG organisation non gouvernementale ONU Organisation des Nations Unies OPS Organisation panaméricaine de la Santé PI poids des incapacités PIB produit intérieur brut PNB produit national brut s.o. sans objet sp. espèce spp. espèces STEC E. coli producteur de shigatoxine USAID Agence des États-Unis pour le développement international
xiii RÉSUMÉ D’ORIENTATION L’évaluation de la charge de morbidité fonction de leur impact global sur la santé d’origine alimentaire est un élément publique. Les objectifs à remplir pour ce essentiel pour classer les risques faire consistent à : correspondants et établir des priorités en • évaluer la charge de morbidité ce qui concerne la sécurité sanitaire des d’un certain nombre de dangers aliments. Les études nationales sur la alimentaires; charge de morbidité permettent aux pays • établir un cadre pour actualiser d’affecter plus efficacement les moyens régulièrement les estimations et de prévention, d’intervention et de lutte apprécier les tendances; et contre les maladies d’origine alimentaire. • produire des données de référence Aussi l’OMS invite-t-elle tous les pays, quel qui permettent d’apprécier l’efficacité que soit leur niveau de développement, des interventions destinées à garantir à se lancer dans la réalisation de leurs la sécurité sanitaire des aliments. propres estimations, compte tenu des La charge de morbidité peut être compétences techniques et des moyens exprimée à l’aide de différents indicateurs dont ils disposent. Il convient de préciser tels que l’incidence, la mortalité, le coût que l’harmonisation des méthodes entre pour la société ou encore des mesures les différents pays permettra de mettre sommaires de la santé de la population. en commun les résultats des uns et des Dans le présent ouvrage, les auteurs autres, de comparer les chiffres et, in fine, ont décidé de prendre les années de d’améliorer les politiques relatives à la vie ajustées sur l’incapacité (DALY) sécurité sanitaire des aliments. comme unité de mesure principale pour quantifier l’impact des maladies d’origine On trouvera dans le présent guide des alimentaire sur la santé publique. Cet explications détaillées sur l’évaluation de indicateur rend compte du nombre la charge de morbidité due aux agents d’années de vie en bonne santé qui microbiologiques fréquemment transmis sont perdues du fait de maladies ou par les aliments. Destiné à être utilisé de facteurs de risque. Il tient compte en particulier au niveau national, celui-ci de la morbidité, de la mortalité et des donne une image complète des conditions incapacités résultant des maladies en requises, des éléments qui facilitent les cause. S’il se peut que certains pays ne évaluations, des difficultés à surmonter disposent pas encore des moyens voulus et des possibilités que présentent ces pour chiffrer les DALY, celles-ci doivent évaluations, ainsi que des différentes constituer un but à terme et tout pas étapes du processus. Il vise en outre à fait en ce sens, tel que l’estimation de favoriser l’harmonisation des méthodes l’incidence ou de la mortalité, est utile. d’évaluation de la charge des maladies d’origine alimentaire entre les pays. Une étude sur la charge de morbidité d’origine alimentaire se déroule en Une étude nationale sur la charge six étapes, comme suit : planification, de morbidité d’origine alimentaire a préparation des données, calculs, vocation à permettre de classer les attribution des sources, interprétation maladies d’origine alimentaire par ordre et diffusion des résultats. Ces différents d’importance et d’établir des priorités en aspects et activités auront probablement
xiv RÉSUMÉ D’ORIENTATION un caractère dynamique et interactif en épidémiologie, en sciences de et devront être adaptés au contexte l’alimentation, en sécurité sanitaire des national, compte tenu de la capacité de aliments et des spécialistes d’autres surveillance de la santé publique du pays domaines en rapport avec le sujet. et des données effectivement disponibles. Pour faire en sorte que les résultats de Si certains aspects du travail, tels que l’étude soient exploités au maximum, la collecte de données, les calculs et il convient de les diffuser auprès d’une l’établissement des DALY, sont souvent large gamme de publics (scientifiques, confiés à une agence spécialisée ou à décideurs, entreprises du secteur un groupe qui dispose de compétences agroalimentaire, médias et grand public). particulières, il est important d’associer Les messages et les supports seront un groupe relativement important choisis en fonction du groupe cible. d’acteurs au processus global. Il est en effet crucial de faire appel aux différents Les études nationales sur la charge acteurs nationaux, non seulement parce de morbidité d’origine alimentaire sont qu’ils peuvent apporter une contribution essentielles pour combler les lacunes utile au projet, mais aussi parce que cela relevées dans le cadre d’initiatives permet de les amener à s’y intéresser et régionales et mondiales, concentrer de leur faire prendre conscience de l’utilité l’action sur le contexte national et des estimations qui en résulteront. Ces produire des estimations fondées sur acteurs comprennent toute une série les données locales qui soient aussi d’organisations qui jouent un rôle dans exactes que possible. Elles permettent la sécurité sanitaire des aliments ou s’y en outre de mettre en évidence les intéressent, telles que les institutions besoins et les informations qui font publiques, les milieux universitaires, les défaut dans les systèmes de sécurité représentants des entreprises du secteur sanitaire des aliments et de promouvoir agroalimentaire et les associations de la coopération et la communication consommateurs. entre les différentes parties prenantes. Sur le long terme, les informations sur la Les études nationales sur la charge de charge de morbidité d’origine alimentaire morbidité d’origine alimentaire peuvent devraient être une composante donner lieu à la production d’un grand essentielle d’une politique structurée nombre de chiffres et il est crucial de concernant la sécurité sanitaire fournir des résultats détaillés. Il importe des aliments, à l’image du cadre de également d’expliquer le caractère gestion des risques que préconise la incertain de certaines estimations. Commission du Codex Alimentarius. Enfin, les résultats seront autant que Une telle politique serait bénéfique non possible interprétés par des experts en seulement pour la santé publique, mais médecine clinique, en santé publique, aussi pour le commerce.
1 1 INTRODUCTION Pourquoi évaluer la charge de morbidité d’origine alimentaire ? Finalité du présent guide Charge de morbidité Champ d’application Public cible Comment utiliser le présent guide
2 INTRODUCTION INTRODUCTION POURQUOI ÉVALUER LA CHARGE DE et de la capacité nationales. Enfin, ces MORBIDITÉ D’ORIGINE ALIMENTAIRE ? estimations exigent de nouer un dialogue avec de nombreux acteurs, ce qui Malgré l’attention croissante que les peut contribuer à harmoniser et à faire milieux politiques portent à la sécurité converger les différentes actions menées sanitaire des aliments depuis quelques au niveau national pour améliorer la décennies, les maladies d’origine sécurité sanitaire des aliments. alimentaire continuent de représenter une charge considérable pour la santé L’évaluation de la charge de morbidité publique, l’économie et la société dans le d’origine alimentaire est une mission monde entier, et plus encore dans les pays difficile à plusieurs égards. Tout d’abord, on à faible revenu et à revenu intermédiaire. dénombre plus de 250 maladies d’origine Pour faire diminuer cette charge, il est alimentaire, qui sont causées par toute nécessaire de prendre des décisions une gamme d’agents microbiologiques éclairées, de faire preuve de volonté (bactéries, virus, parasites) et de polluants politique et de déployer des stratégies chimiques qui sont présents naturellement efficaces axées sur les problèmes les dans les aliments, ou qui résultent de plus graves en ce qui concerne la sécurité la pollution environnementale, de la sanitaire des aliments. Cela suppose fabrication, du conditionnement, du d’identifier les maladies et les sources transport et du stockage des aliments. d’exposition les plus importantes et de les Ensuite, seule une fraction des personnes classer en fonction de leur impact sur la qui contractent une maladie après avoir santé publique. mangé des aliments contaminés vont consulter, se font soigner et sont signalées Il est indispensable d’évaluer la charge aux autorités de santé publique. De que représentent les maladies d’origine plus, les effets sanitaires des dangers alimentaire au niveau national pour alimentaires sont extrêmement complexes faire reculer ces maladies. Cela permet et vont bien au-delà de la gastro-entérite en effet de disposer des informations aiguë, certains pathogènes pouvant nécessaires pour affecter au mieux les entraîner des séquelles telles qu’une ressources et structurer efficacement insuffisance rénale, une maladie hépatique l’action de prévention. Ces estimations ou neurologique, ou encore des cancers. contribuent en outre à la mise en place Il convient également de noter que les de systèmes nationaux de sécurité agents pathogènes généralement classés sanitaire des aliments fondés sur les parmi les pathogènes alimentaires sont risques et favorisent la participation à des également responsables de maladies activités normatives relatives aux denrées qui trouvent leur origine dans d’autres alimentaires au niveau international et modes de transmission, comme la l’implication dans des organisations consommation d’eau contaminée ou le commerciales. Elles sont utiles pour contact avec des animaux, ou du simple identifier les besoins concernant les fait de leur présence dans l’environnement. systèmes de sécurité sanitaire des Enfin, nombre de pays ne disposent pas aliments et les lacunes concernant les de systèmes de surveillance solides, données et donc pour établir des priorités ni des données requises pour réaliser quant au renforcement de l’infrastructure de telles analyses. Dans la plupart
3 des pays à faible revenu ou à revenu morbidité a été évaluée grâce à trois unités INTRODUCTION intermédiaire, les données sont détenues de mesure : incidence, mortalité et années par certains acteurs et ne sont pas de vie ajustées sur l’incapacité (DALY). forcément facilement accessibles aux autres, sans compter que les systèmes Si elles ont joué un rôle crucial dans la d’enregistrement de l’information ne sont mise en évidence des priorités en matière pas standardisés, ce qui entrave la collecte de sécurité alimentaire dans les différentes des données et leur mise en commun. régions du monde, ces estimations sont le fruit d’une initiative de grande envergure Afin de se faire une idée aussi précise que qui s’est heurtée à des obstacles non possible de la charge régionale et mondiale négligeables sur le plan méthodologique de morbidité d’origine alimentaire, l’OMS et sur le plan des données. Pour réaliser a créé en 2007 le Groupe de référence ces études régionales et mondiale, le sur l’épidémiologie des maladies d’origine FERG a dû s’appuyer sur un certain alimentaire (FERG) (1) qui a vocation à : nombre d’hypothèses et d’extrapolations de données, d’où l’incertitude de • évaluer la charge mondiale de certaines estimations. Compte tenu du morbidité d’origine alimentaire en nombre limité de données disponibles fonction de l’âge, du sexe et de la à certains égards, le FERG a présenté région, pour une liste donnée d’agents ses estimations à l’échelle régionale, ne pathogènes véhiculés par les aliments; pouvant rendre compte de la diversité des • sensibiliser les États Membres et risques entre les pays d’une même région les amener à se mobiliser pour faire ou à l’intérieur des pays. respecter les normes relatives à la sécurité sanitaire des aliments; Les pays sont par conséquent invités • renforcer les capacités des pays en ce à réaliser leurs propres estimations, qui concerne l’évaluation de la charge simplifiées ou non, selon l’étendue de de morbidité d’origine alimentaire et leurs compétences techniques et de leurs faire en sorte qu’un nombre croissant moyens. Ce processus nécessitera des de pays entreprennent des évaluations mesures de différents ordres, suivant la de ce type; capacité actuelle du pays, les données • encourager les pays à mettre à dont il dispose et ses ressources profit l’estimation de la charge de globales. Quels que soient le niveau de morbidité d’origine alimentaire pour développement et le travail nécessaire se doter de politiques réglementaires pour évaluer la charge nationale de et de normes concernant la sécurité morbidité d’origine alimentaire, il est sanitaire des aliments et faire une essentiel que les pays utilisent des analyse à moindre coût des mesures méthodes uniformes de manière à pouvoir de prévention, d’intervention et de mettre en commun les résultats obtenus, lutte contre les maladies d’origine comparer leurs chiffres respectifs et, in alimentaire. fine, améliorer les politiques relatives à la sécurité sanitaire des aliments. Les travaux du FERG ont permis à l’OMS de publier pour la première fois en 2015 des estimations concernant la FINALITÉ DU PRÉSENT GUIDE charge mondiale de morbidité d’origine alimentaire. Ces estimations portent Le présent guide donne des indications sur les maladies causées par 31 agents à quiconque prévoit d’évaluer la charge pathogènes parmi lesquels 11 agents de morbidité d’origine alimentaire, en responsables de maladies diarrhéiques, particulier au niveau national. Il donne une 7 agents responsables de maladies image complète des conditions requises, invasives, 10 helminthes et 3 produits des éléments qui facilitent ces évaluations, chimiques ou toxines. Il en ressort que les des difficultés et des possibilités qu’elles aliments impropres à la consommation comportent, ainsi que des différentes sont responsables de 600 millions de étapes du processus, en s’appuyant sur cas de maladies d’origine alimentaire, de la méthode utilisée par le FERG. Il vise 420 000 décès et d’un total de 33 millions en outre à favoriser l’harmonisation des d’années de vie en bonne santé perdues méthodes d’évaluation de la charge de à l’échelle planétaire (1). La charge de morbidité entre les différents pays.
4 INTRODUCTION CHARGE DE MORBIDITÉ morbidité dont ils sont responsables, ainsi que des exemples d’études nationales. La charge de morbidité peut être exprimée à l’aide de différents indicateurs, La majorité des agents pathogènes tels que l’incidence, la mortalité, le véhiculés par l’alimentation sont présents coût pour la société, ou encore des dans toute une série d’aliments et peuvent mesures sommaires de la santé de la être transmis à l’homme, pour plusieurs population. Dans le présent ouvrage, les d’entre eux, par l’environnement, par les DALY constituent la principale mesure contacts avec les animaux et d’individu sommaire de l’impact des maladies à individu. Aussi est-il essentiel de d’origine alimentaire sur la santé de la déterminer dans quels cas les infections population. Si toutes les études sur la ont une origine alimentaire et quels sont charge de morbidité doivent tendre vers les aliments en cause. C’est là une tâche l’évaluation des DALY, toute mesure difficile qui exige d’utiliser des méthodes intermédiaire est également valable. Il est d’attribution des sources (2). Parce que aussi possible de s’appuyer sur les taux ces études nécessitent des moyens d’incidence et de mortalité pour classer les conséquents, ainsi que des compétences maladies d’origine alimentaire par ordre et des capacités particulières, elles ne d’importance et en comparer l’impact sur seront pas décrites en détail dans cet la santé publique. ouvrage. On trouvera cependant à l’annexe 2 un aperçu général des méthodes d’attribution des sources, ainsi que des CHAMP D’APPLICATION explications sur l’utilité de ces méthodes selon les pathogènes considérés et les Le présent guide décrit les différentes questions de santé publique qui se posent, étapes de l’évaluation de la charge des et sur leurs avantages et inconvénients. maladies d’origine alimentaire causées par des agents microbiologiques généralement véhiculés par les aliments. PUBLIC CIBLE Il traite de la planification, de la définition du contexte, des estimations de la charge Le présent guide s’adresse aux de morbidité, de la mise en parallèle de gouvernements, aux établissements ces données et des estimations relatives universitaires, ainsi qu’à toute personne à l’attribution des sources, de la diffusion participant à la réalisation d’une étude sur de l’information et de l’application des la charge de morbidité d’origine alimentaire connaissances. Cet ouvrage a été structuré au niveau national ou à un autre niveau de manière à rendre compte au mieux (régional ou infranational). de la séquence des étapes à respecter lorsqu’on réalise une étude nationale sur la charge de morbidité d’origine alimentaire. COMMENT UTILISER LE PRÉSENT GUIDE Il conviendra d’adapter ces différentes étapes en fonction de la capacité de Les travaux que suppose la réalisation surveillance de la santé publique du pays et d’une étude sur la charge de morbidité des données disponibles. d’origine alimentaire sont expliqués aux chapitres 3 et 7. Ils seront adaptés en Bien qu’ils soient connus pour être fonction du contexte national et auront responsables d’une bonne partie des potentiellement un caractère dynamique et cas de maladies d’origine alimentaire, interactif. Il importe si possible d’accomplir les dangers chimiques, notamment les les étapes décrites pour chaque activité allergènes alimentaires, ne seront pas dans l’ordre indiqué. traités dans le présent guide. Les données nécessaires et les méthodes à suivre à Les études sur la charge de morbidité ce sujet feront l’objet d’une prochaine d’origine alimentaire sont souvent publication. On trouvera cependant itératives, l’intégration de nouveaux à l’annexe 1 des informations sur les éléments s’imposant à mesure que l’étude contaminants chimiques présents dans les avance. Il est donc sage de procéder étape aliments, un rapide aperçu des méthodes par étape, en commençant par une étude qui permettent d’évaluer la charge de élémentaire et relativement restreinte
5 INTRODUCTION qui sera progressivement étendue et avec les acteurs de la sécurité sanitaire approfondie. Le présent ouvrage guidera le des aliments à l’échelle du pays et de faire lecteur dans cette démarche. converger les efforts en plaidant pour la communication et la mise en commun des La meilleure façon d’apprendre étant de données. pratiquer, le présent ouvrage a pour but d’encourager chaque pays à étudier sa L’évaluation de la charge nationale charge de morbidité d’origine alimentaire. de morbidité des maladies d’origine Si les études nationales doivent tendre alimentaire peut nécessiter des moyens vers l’estimation des DALY, les étapes techniques supplémentaires et des intermédiaires telles que l’estimation indications particulières. Cette question de l’incidence des maladies d’origine sera traitée dans des ouvrages à paraître et alimentaire et de la mortalité qui en dans le cadre d’autres activités de l’OMS. résulte, sont, elles aussi, utiles. Enfin, Les lecteurs sont invités à consulter le une étude sur la charge de morbidité est site web de l’OMS pour se tenir informés aussi l’occasion d’identifier les lacunes en (https://www.who.int/activities/estimating- matière de données, de nouer un dialogue the-burden-of-foodborne-diseases).
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