Évaluer la charge de morbidité d'origine alimentaire : guide pratique à l'intention des pays - Un guide pour la planification, la mise en oeuvre ...

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Évaluer la charge de
morbidité d’origine
alimentaire : guide
pratique à l’intention des pays
Un guide pour la planification, la mise en oeuvre
et la notification de la charge des maladies
d'origine alimentaire au niveau des pays
Évaluer la charge de morbidité d'origine alimentaire : guide pratique à l'intention des pays - Un guide pour la planification, la mise en oeuvre ...
Évaluer la charge de
morbidité d’origine
alimentaire : guide
pratique à l’intention des pays
Un guide pour la planification, la mise en oeuvre
et la notification de la charge des maladies d’origine
alimentaire au niveau des pays
Évaluer la charge de morbidité d’origine alimentaire : guide pratique à l’intention des pays
                                     ISBN 978-92-4-001992-8 (version électronique)
                                       ISBN 978-92-4-001993-5 (version imprimée)

                                       © Organisation mondiale de la Santé 2021

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Citation suggérée. Évaluer la charge de morbidité d’origine alimentaire : guide pratique à l’intention des pays
[Estimating the burden of foodborne diseases: a practical handbook for countries]. Genève, Organisation mondiale de
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iii

TABLE DES MATIÈRES

  Préfacevii
  Remerciementsx
  Abréviations et acronymes utilisés dans le présent guide  xii
  Résumé d’orientation                                     xiii

  1. INTRODUCTION                                                              1
      Pourquoi évaluer la charge de morbidité d’origine alimentaire ?          2
      Finalité du présent guide                                                3
      Charge de morbidité                                                      4
      Champ d’application                                                      4
      Public cible                                                             4
      Comment utiliser le présent guide                                        4

  2. LES ÉTUDES SUR LA CHARGE DE MORBIDITÉ D’ORIGINE ALIMENTAIRE 7
      But et objectifs                                                        10
      Principaux éléments et étapes                                           10
      Conditions requises                                                     12
      Éléments facilitant les études                                          12

  3. LA PLANIFICATION DES ÉTUDES SUR LA CHARGE DE MORBIDITÉ
     D’ORIGINE ALIMENTAIRE                                                    15
      Établissement du plan de travail                                        16
      Analyse de la situation                                                 16
      Définition du cadre général                                             19
      Vérification des capacités                                              19
      Choix des dangers sur lesquels portera l’étude                          20

  4. PRÉPARATION DES DONNÉES                                                  21
      Identification des données nécessaires et des sources                   22
              Données démographiques                                          23
              Données concernant l’incidence                                  24
      Choix des événements de santé                                           30
              Données concernant les schémas de morbidité                     30
              Poids des incapacités                                           31
              Durée de la maladie                                             32
              Données concernant la mortalité                                 32
      Collecte des données                                                    32
      Pallier les lacunes et la distorsion des données                        32
iv TABLE DES MATIÈRES

            5. ESTIMATION DE L’INCIDENCE, DE LA MORTALITÉ ET DES DALY                                        37
                   Incidence et mortalité                                                                     39
                   Incidence d’autres événements de santé et séquelles                                        41
                   Calcul des DALY                                                                            41
                   Incertitude                                                                                42
                   Logiciels                                                                                  43

            6. ESTIMATION DES DALY RÉSULTANT DE MALADIES D’ORIGINE
               ALIMENTAIRE45

            7. INTERPRÉTATION DES RÉSULTATS CONCERNANT LA CHARGE
               NATIONALE DE MORBIDITÉ D’ORIGINE ALIMENTAIRE                                                  49

            8. L’APPLICATION DES CONNAISSANCES ET L’INFORMATION SUR
               LES RISQUES                                                                                   53
                   Utiliser les DALY pour évaluer la charge économique des maladies d’origine alimentaire     55

            9. CONSIDÉRATIONS FINALES                                                                        59

            Bibliographie61
            Annexe 1. Évaluer la charge de morbidité due à la présence de produits chimiques dans les aliments 65
            Annexe 2. Méthodes d’attribution des sources                                                       68
            Annexe 3. Liste des dangers alimentaires établie par le FERG                                       73
            Annexe 4. Liste récapitulative des données à collecter                                             78
            Annexe 5. Méthodes et hypothèses retenues par le FERG pour pallier les lacunes dans les données 81
v

LISTE DES TABLEAUX,
FIGURES ET BOXES

  Liste des tableaux

  TABLEAU 1.          Facteurs à prendre en considération dans le choix des dangers à inclure dans
                      l’étude nationale sur la charge de morbidité d’origine alimentaire                    20
  TABLEAU 2.          Données démographiques requises pour réaliser une étude sur la charge nationale
                      de morbidité d’origine alimentaire, sources et critères d’évaluation                  22
  TABLEAU 3.          Table de survie standard de l’OMS concernant les années vécues en incapacité utilisée
                      dans les estimations de la charge mondiale de morbidité pour la période 2000-2016 24
  TABLEAU 4.          Données syndromiques requises pour réaliser une étude sur la charge nationale de
                      morbidité/mortalité d’origine alimentaire, sources et critères d’évaluation           30
  TABLEAU 5.          Exemples de lacunes et de distorsions des données fréquemment rencontrées
                      dans les études sur la charge de morbidité d’origine alimentaire, éléments en cause
                      et solutions possibles                                                                33
  TABLEAU 6.          Résultats concernant la charge de morbidité d’origine alimentaire au Danemark en 2017 51
  TABLEAU 7.          Attentes des différents acteurs et communication des résultats concernant la charge
                      de morbidité d’origine alimentaire                                                    54
  TABLEAU A1.1        Aperçu général des données requises pour évaluer la charge de morbidité due
                      aux produits chimiques présents dans les aliments, des sources de données
                      possibles et des critères d’évaluation                                                67
  TABLEAU A2.1        Avantages et inconvénients des méthodes d’attribution DES SOURCES                     70
  TABLEAU A3.1.       Liste détaillée des principaux agents en cause dans les maladies d’origine
                      alimentaire initialement dressée par le FERG                                          73
  TABLEAU A3.2.       Liste des dangers alimentaires dont le FERG a estimé la charge de morbidité           74
  TABLEAU A3.1.       Dangers alimentaires, états de santé causés par ces dangers et poids des
                      incapacités correspondants                                                            74
  TABLEAU A4.1.       Une liste des sources de données démographiques, des informations attendues
                      et des évaluations de la qualité                                                      78
  TABLEAU A4.2.       Une liste des sources de données épidémiologiques, des informations attendues
                      et des évaluations de la qualité                                                      79

  Liste des figures

  FIGURE 1.           Termes d’années de vie ajustées sur l’incapacité - Disability-adjusted life years (DALYs) 9
  FIGURE 2.           Principaux éléments et étapes d’une étude sur la charge de morbidité
                      d’origine alimentaire                                                                    11
  FIGURE 3.           Pyramide de surveillance des maladies d’origine alimentaire                              25
vi LISTE DES TABLEAUX, FIGURES ET BOXES

            FIGURE 4.           Exemple d’un modèle de maladie pour une infection aux salmonelles non typhiques   30
            FIGURE 5.           Échantillon du poids des incapacités associé à différentes maladies               31
            FIGURE 6.           Principales étapes du calcul de la charge de morbidité d’origine alimentaire      38
            FIGURE 7.           Modèle de schéma de morbidité pour le calcul de la charge de morbidité
                                des dangers alimentaires                                                          39
            FIGURE 8.           Représentation graphique du déficit de santé quantifié à l’aide des DALY          42

            Liste des boxes

            BOX 2.1.            La méthode de calcul de la charge de morbidité basée sur la prévalence             9
            BOX 2.2.            Études de pays du FERG                                                            13
            BOX 4.1.            Le sousdiagnostic et de la sous-déclaration                                       25
            BOX 4.2.            Détermination du poids des incapacités (PIs)                                      31
            BOX 5.1.            Exemple de calcul des DALYs                                                       41
            BOX 5.2.            Variabilité et incertitude                                                        43
            BOX 7.1.            Exemple de présentation et d’interprétation des résultats concernant la charge
                                de morbidité d’origine alimentaire                                                51
            BOX 8.1.            Utiliser les DALY pour évaluer la charge économique des maladies
                                d’origine alimentaire                                                             55
            BOX A1.1.           Relation dose-réponse                                                             66

            Expériences pays

            •       Le cas de l’Albanie                                                                           17
            •       Le cas des Caraïbes                                                                           26
            •       Le cas de la Thaïlande                                                                        34
            •       Projet international mené en Éthiopie, au Mozambique, au Nigéria et en République-Unie
                    de Tanzanie                                                                                   35
            •       Le cas du Japon                                                                               47
            •       Le cas de la Nouvelle-Zélande                                                                 48
            •       Le cas des Pays-Bas                                                                           56
vii

PRÉFACE

  L’évaluation de la charge de morbidité                   Cette initiative visait également à
  des maladies d’origine alimentaire est                   aider les pays à évaluer leur charge de
  un élément essentiel pour classer les                    morbidité d’origine alimentaire et à faire
  risques correspondants, établir des                      en sorte qu’ils soient plus nombreux
  priorités en ce qui concerne la sécurité                 à entamer de telles recherches. Ces
  sanitaire des aliments et répartir                       évaluations permettent en effet de
  efficacement les ressources destinées                    répartir plus efficacement les moyens
  à prévenir les maladies d’origine                        de prévention, d’intervention et de
  alimentaire. Afin de se faire une idée                   lutte contre les maladies d’origine
  aussi précise que possible du poids                      alimentaire. Aussi tous les pays sont-ils
  des maladies d’origine alimentaire                       invités à se lancer dans la réalisation de
  à l’échelle régionale et mondiale, en                    leurs propres estimations, simplifiées ou
  2007, l’OMS a lancé une initiative                       non, selon les compétences techniques
  visant à évaluer la charge mondiale                      et les moyens dont ils disposent. Il
  de morbidité correspondante. Dans                        convient de préciser que, quels que
  le prolongement de cette initiative,                     soient le niveau de développement
  l’OMS a publié pour la première fois                     et les ressources disponibles, il est
  en 2015 des estimations sur la charge                    essentiel que les pays utilisent des
  mondiale de morbidité d’origine                          méthodes uniformes, de manière à
  alimentaire, qui ont été réalisées par le                pouvoir mettre en commun les résultats
  Groupe de référence sur l’épidémiologie                  obtenus, comparer les chiffres et, in
  des maladies d’origine alimentaire                       fine, améliorer les politiques relatives à
  (FERG). Le FERG a évalué la charge de                    la sécurité sanitaire des aliments.
  morbidité de 31 dangers répartis en
  11 agents responsables de maladies                       On trouvera dans le présent guide des
  diarrhéiques, 7 agents responsables                      explications détaillées sur l’évaluation
  de maladies invasives, 10 helminthes                     de la charge de morbidité due aux
  et 3 produits chimiques et toxines                       agents microbiologiques fréquemment
  en s’appuyant sur les trois critères                     transmis par les aliments. Destiné à
  suivants : incidence, mortalité et                       être utilisé en particulier au niveau
  années de vie ajustées sur l’incapacité                  national, celui-ci donne une image
  (DALY). Ces estimations ont permis                       complète des conditions requises, des
  de mettre en évidence les priorités                      éléments qui facilitent les évaluations,
  concernant la sécurité sanitaire des                     des difficultés à surmonter et des
  aliments dans différentes régions                        possibilités que présentent ces
  du monde et ont été utilisées pour                       évaluations, ainsi que des différentes
  réaliser des analyses complémentaires,                   étapes du processus. Il vise en outre à
  notamment sur la charge que les                          favoriser l’harmonisation des méthodes
  aliments impropres à la consommation                     d’évaluation de la charge de morbidité
  font peser sur l’économie 1.                             d’origine alimentaire entre les pays.

  1
   Jaffee S, Henson S, Unnevehr L, Grace D, Cassou E. The safe food imperative: accelerating progress in low-
  and middle-income countries. Agriculture and Food Series. Washington, DC: Banque mondiale; 2019.
viii PRÉFACE

               Cet ouvrage a été structuré dans toute la         différents égards et y remédier. Enfin,
               mesure possible autour des différentes            on y trouve des informations sur les
               étapes à suivre lorsqu’on réalise une             logiciels disponibles.
               étude nationale sur la charge de              •   Le Chapitre 6 propose une méthode
               morbidité d’origine alimentaire.                  pour évaluer la part de la charge
               • Le Chapitre 2 explique en quoi                  totale de morbidité qui relève de la
                   consistent les études sur la charge           transmission par les aliments.
                   de morbidité d’origine alimentaire        •   Le Chapitre 7 explique ce dont il est
                   et comment il convient de procéder            important de tenir compte dans la
                   dans ce domaine. Il y est question            présentation et l’interprétation des
                   des but et objectifs de ces études,           résultats d’une étude sur la charge
                   des principaux éléments à prendre             de morbidité d’origine alimentaire.
                   en considération et des étapes à              On y trouve des suggestions sur la
                   suivre, ainsi que des conditions              manière de présenter les résultats
                   requises et des facteurs qui facilitent       et d’expliquer les hypothèses et
                   leur réalisation.                             les limites de l’étude, ainsi que des
               • Le Chapitre 3 décrit les travaux de             exemples des éléments à inclure
                   planification et de lancement des             dans les résultats.
                   études sur la charge de morbidité         •   Enfin, le chapitre 8 donne des
                   d’origine alimentaire. Il explique le         indications sur les types de supports
                   pourquoi de l’analyse de la situation         qu’on peut utiliser pour présenter
                   nationale et les différentes étapes           et diffuser les résultats des études
                   à suivre, les variables à prendre en          sur la charge de morbidité auprès
                   considération pour définir le cadre de        des différents publics cibles et
                   l’étude, les ressources matérielles et        décrit dans les grandes lignes les
                   les effectifs nécessaires et comment          moyens existants pour informer sur
                   choisir les agents pathogènes sur             les risques et faire en sorte que les
                   lesquels portera l’étude.                     connaissances scientifiques soient
               • Le Chapitre 4 chapitre est consacré             transposées dans des politiques.
                   aux données nécessaires pour
                   réaliser une étude sur la charge          Ces différents aspects et activités
                   nationale de morbidité. Il dresse         auront probablement un caractère
                   une liste des sources d’information       dynamique et interactif et devront être
                   potentielles et propose des               adaptés au contexte national, compte
                   méthodes de collecte de données           tenu de la capacité de surveillance
                   et des solutions pour pallier les         de la santé publique du pays et des
                   lacunes.                                  données effectivement disponibles. Si
               • Le Chapitre 5 a trait aux différentes       les études nationales doivent tendre
                   étapes du calcul de la charge             vers l’estimation des DALY, les étapes
                   nationale de morbidité d’origine          intermédiaires telles que l’estimation
                   alimentaire. On y apprend comment         de l’incidence et de la mortalité des
                   calculer l’incidence, la mortalité        maladies d’origine alimentaire, sont, elles
                   et les DALY et comment évaluer            aussi, utiles pour évaluer l’impact de
                   les éventuelles incertitudes à ces        ces maladies sur la santé publique par
ix

rapport à celui d’autres maladies. Enfin,    permettent en outre de mettre en
une étude sur la charge de morbidité         évidence les besoins et les informations
d’origine alimentaire est aussi l’occasion   qui font défaut dans les systèmes
de repérer les lacunes dans les données,     de sécurité sanitaire des aliments et
de nouer un dialogue avec les acteurs de     de promouvoir la coopération et la
la sécurité sanitaire des aliments dans      communication entre les différentes
l’ensemble du pays et de faire converger     parties prenantes. Tous les pays, quels
les différentes actions en plaidant pour     que soient leur niveau de développement
la communication et la mise en commun        et l’étendue de leurs connaissances
des informations.                            techniques, sont invités à commencer
                                             à travailler à la réalisation de telles
On trouvera tout au long du présent guide    études dans toute la mesure possible.
des exemples tirés d’études nationales       Ils seront peut-être amenés pour ce
qui montrent comment celles-ci ont été       faire à réaliser dans un premier temps
menées dans les différentes régions du       des études élémentaires qu’ils pourront
monde. Les aspects techniques sont           progressivement affiner et enrichir
décrits en détail dans les cinq annexes.     à mesure que leurs moyens le leur
                                             permettront. Enfin, il importe que l’équipe
Les études nationales sur la charge          technique chargée de la réalisation de
de morbidité d’origine alimentaire sont      l’étude associe les différentes parties
essentielles pour combler les lacunes        prenantes, les décideurs et les experts
concernant les données observées             en sciences sociales au projet dès les
dans le cadre d’initiatives régionales       premières étapes, de manière à favoriser
et mondiales, concentrer l’action sur        la communication et la collaboration,
le contexte national et produire des         ainsi que l’application des connaissances
évaluations aussi exactes que possible       et l’élaboration de politiques fondées sur
à partir des données locales. Elles          des données scientifiques.
x REMERCIEMENTS

    REMERCIEMENTS

          L’Organisation mondiale de la Santé exprime ses remerciements sincères aux personnes
          ci-après qui ont participé à l’élaboration du présent guide.

          Rédaction initiale
          Le groupe de rédaction initial se composait des personnes suivantes :
          Frederick J. Angulo, United States Centers for Disease Control and Prevention, Atlanta,
          Géorgie (États-Unis d’Amérique); Peter Cressey, Institut de sciences et de recherche
          environnementales, Christchurch (Nouvelle-Zélande); Brecht Devleesschauwer,
          Sciensano, Bruxelles (Belgique); John Ehiri, Université d’Arizona, Tucson, Arizona
          (États-Unis d’Amérique); Juanita Haagsma, Centre médical de l’Université Erasmus,
          Rotterdam (Pays-Bas); Arie Havelaar, Université de Floride, Gainesville, Floride (États-
          Unis d’Amérique); Steve Jaffee, Université du Maryland, College Park, Maryland (États-
          Unis d’Amérique); Helen Jensen, Université d’État de l’Iowa, Ames, Iowa (États-Unis
          d’Amérique); Nasreen Jessani, École de santé publique Johns Hopkins Bloomberg,
          Baltimore, Maryland (États-Unis d’Amérique); Robin Lake, Institut de sciences et de
          recherche environnementales, Christchurch (Nouvelle-Zélande); Charline Maertens
          de Noordhout, Université catholique de Louvain, Bruxelles (Belgique); Sara M. Pires,
          Université technique du Danemark, Lyngby (Danemark); et Niko Speybroeck, Université
          catholique de Louvain, Bruxelles (Belgique).

          Le travail initial a été coordonné par le Centre collaborateur de l’OMS pour l’évaluation des
          risques liés à la présence d’agents pathogènes dans les aliments et dans l’eau installé
          dans les locaux de l’Institut national de la santé publique et de l’environnement des Pays-
          Bas, à Bilthoven (Pays-Bas).

          Finalisation
          La rédaction définitive a été réalisée par :
          Sara M. Pires, Université technique du Danemark, Lyngby (Danemark) (auteure principale);
          Brecht Devleesschauwer, Sciensano, Bruxelles (Belgique); Arie Havelaar, Université de
          Floride, Gainesville, Floride (États-Unis d’Amérique); Lea Jakobsen, Université technique
          du Danemark, Lyngby (Danemark); et Robin Lake, Institut de sciences et de recherche
          environnementales, Christchurch (Nouvelle-Zélande).

          Les informations concernant les exemples nationaux ont été fournies par :
          Suchunya Aungkulanon, Ministre de la santé publique, Amphur Muang (Thaïlande);
          Tine Hald, Université technique du Danemark, Lyngby (Danemark); Lisa Indar, Agence
          de santé publique des Caraïbes, Port d’Espagne (Trinité-et-Tobago); Kunihiro Kubota,
          Institut national des sciences de la santé, Kanagawa (Japon); Yuko Kumagai, Université
          féminine de Wayo, Ichikawa (Japon); Robin Lake, Institut de sciences et de recherche
          environnementales, Christchurch (Nouvelle-Zélande); Lindita Molla, Service albanais
          de réglementation de l’eau, Tirana (Albanie); Lapo Mughini Gras, Institut national de la
          santé publique et de l’environnement, Bilthoven (Pays-Bas); et Sara M. Pires, Université
          technique du Danemark, Lyngby (Danemark).
xi

Le projet final a été révisé par un groupe d’intervenants extérieurs, à savoir :
Mohammad Alwetaid, Bureau saoudien de la santé et de l’alimentation, Riyad (Arabie
saoudite); Eva Inam Al Zein, Autorité jordanienne de l’alimentation et du médicament,
Amman (Jordanie); Erica Billig Rose, US Centers for Disease Control and Prevention,
Atlanta, Géorgie (États-Unis d’Amérique); Beau B. Bruce, US Centers for Disease
Control and Prevention, Atlanta, Géorgie (États-Unis d’Amérique); Eleanor Click, US
Centers for Disease Control and Prevention, Atlanta, Géorgie (États-Unis d’Amérique);
Agaba Edson Friday, Autorité nationale du médicament, Ministère de la santé, Kampala
(Ouganda); Gbemenou Joselin Benoit Gnonlonfin, Communauté économique des États
de l’Afrique de l’Ouest, Abuja (Nigéria); Patricia M. Griffin, US Centers for Disease Control
and Prevention, Atlanta, Géorgie (États-Unis d’Amérique); Zainab Jallow, consultante
indépendante, Serrekunda (Gambie); Kunihiro Kubota, Institut national des sciences
de la santé, Kanagawa (Japon); Lindita Molla, Service albanais de réglementation de
l’eau, Tirana (Albanie); Lapo Mughini Gras, Institut national de la santé publique et de
l’environnement, Bilthoven (Pays-Bas); Elaine Scallan Walter, Université du Colorado,
Aurora, Colorado (États-Unis d’Amérique); Mashresha Tessema, Institut éthiopien de la
santé publique, Addis-Abeba (Éthiopie); Lucie C. Vermeulen, Centre collaborateur de l’OMS
pour l’évaluation des risques liés à la présence d’agents pathogènes dans les aliments
et dans l’eau, Bilthoven (Pays-Bas); et Jinjing Zhang, Office public de réglementation du
marché, Beijing (Chine).

L’OMS remercie en outre tout particulièrement ses collègues du Groupe de la sécurité
sanitaire et de la qualité des aliments de l’Organisation des Nations Unies pour
l’alimentation et l’agriculture (FAO), notamment Eleonora Dupouy, Alice Green, Christine
Kopko et Keya Mukherjee, de leur contribution. Ont également fourni une contribution non
négligeable et participé à la révision du présent guide les conseillers régionaux de l’OMS
en matière de sécurité alimentaire Margarita Corrales, Gyanendra Gongal, Peter Sousa
Hoejskov, Simone Moraes Raszl, Lusubilo Mwamakama et Philippe Verger, ainsi que
Bochan Cao de la Division Analyse de données, résultologie et impact de l’OMS.

Les travaux ont été coordonnés par Yuki Minato, Département de l’OMS Nutrition
et sécurité sanitaire des aliments de l’OMS, à Genève (Suisse), avec le concours de
Chrystelle Daffara, Cheng Liang, Naoko Obara, Ruwanthi Jayasuriya, Claire Scott, et Luz
de Regil comme chef d’unité.
La révision technique a été réalisée par Patricia Butler, Cascais (Portugal) et la maquette
et la mise en page ont été confiées à Blossom Srl, Meda (Italie).

Enfin, l’OMS tient à remercier le Gouvernement du Japon de son appui financier.
xii ABRÉVIATIONS ET ACRONYMES UTILISÉS DANS LE PRÉSENT GUIDE

    ABRÉVIATIONS ET ACRONYMES
    UTILISÉS DANS LE PRÉSENT GUIDE

            AVI            années vécues en incapacité

            AVP            années de vie perdues

            AVPES          années de vie perdues par rapport à l’espérance de vie standard

            DALY           années de vie ajustées sur l’incapacité

            EAEC           E. coli entéroaggrégatif

            EHEC           E. coli entérohémorragique

            EPEC           E. coli entéropathogène

            ETEC           E. coli entérotoxinogène

            EVR            espérance de vie résiduelle

            FAO            Organisation des Nations Unies pour l’alimentation et l’agriculture

            FERG           Groupe de référence sur l’épidémiologie des maladies d’origine alimentaire

            INDEPTH        réseau international des sites d’étude chargés de l’évaluation démographique
                           continue des populations et de leur santé dans les pays en développement

            OMS            Organisation mondiale de la Santé

            ONG            organisation non gouvernementale

            ONU            Organisation des Nations Unies

            OPS            Organisation panaméricaine de la Santé

            PI             poids des incapacités

            PIB            produit intérieur brut

            PNB            produit national brut

            s.o.           sans objet

            sp.            espèce

            spp.           espèces

            STEC           E. coli producteur de shigatoxine

            USAID          Agence des États-Unis pour le développement international
xiii

RÉSUMÉ D’ORIENTATION

  L’évaluation de la charge de morbidité          fonction de leur impact global sur la santé
  d’origine alimentaire est un élément            publique. Les objectifs à remplir pour ce
  essentiel pour classer les risques              faire consistent à :
  correspondants et établir des priorités en      • évaluer la charge de morbidité
  ce qui concerne la sécurité sanitaire des            d’un certain nombre de dangers
  aliments. Les études nationales sur la               alimentaires;
  charge de morbidité permettent aux pays         • établir un cadre pour actualiser
  d’affecter plus efficacement les moyens              régulièrement les estimations et
  de prévention, d’intervention et de lutte            apprécier les tendances; et
  contre les maladies d’origine alimentaire.      • produire des données de référence
  Aussi l’OMS invite-t-elle tous les pays, quel        qui permettent d’apprécier l’efficacité
  que soit leur niveau de développement,               des interventions destinées à garantir
  à se lancer dans la réalisation de leurs             la sécurité sanitaire des aliments.
  propres estimations, compte tenu des            La charge de morbidité peut être
  compétences techniques et des moyens            exprimée à l’aide de différents indicateurs
  dont ils disposent. Il convient de préciser     tels que l’incidence, la mortalité, le coût
  que l’harmonisation des méthodes entre          pour la société ou encore des mesures
  les différents pays permettra de mettre         sommaires de la santé de la population.
  en commun les résultats des uns et des          Dans le présent ouvrage, les auteurs
  autres, de comparer les chiffres et, in fine,   ont décidé de prendre les années de
  d’améliorer les politiques relatives à la       vie ajustées sur l’incapacité (DALY)
  sécurité sanitaire des aliments.                comme unité de mesure principale pour
                                                  quantifier l’impact des maladies d’origine
  On trouvera dans le présent guide des           alimentaire sur la santé publique. Cet
  explications détaillées sur l’évaluation de     indicateur rend compte du nombre
  la charge de morbidité due aux agents           d’années de vie en bonne santé qui
  microbiologiques fréquemment transmis           sont perdues du fait de maladies ou
  par les aliments. Destiné à être utilisé        de facteurs de risque. Il tient compte
  en particulier au niveau national, celui-ci     de la morbidité, de la mortalité et des
  donne une image complète des conditions         incapacités résultant des maladies en
  requises, des éléments qui facilitent les       cause. S’il se peut que certains pays ne
  évaluations, des difficultés à surmonter        disposent pas encore des moyens voulus
  et des possibilités que présentent ces          pour chiffrer les DALY, celles-ci doivent
  évaluations, ainsi que des différentes          constituer un but à terme et tout pas
  étapes du processus. Il vise en outre à         fait en ce sens, tel que l’estimation de
  favoriser l’harmonisation des méthodes          l’incidence ou de la mortalité, est utile.
  d’évaluation de la charge des maladies
  d’origine alimentaire entre les pays.           Une étude sur la charge de morbidité
                                                  d’origine alimentaire se déroule en
  Une étude nationale sur la charge               six étapes, comme suit : planification,
  de morbidité d’origine alimentaire a            préparation des données, calculs,
  vocation à permettre de classer les             attribution des sources, interprétation
  maladies d’origine alimentaire par ordre        et diffusion des résultats. Ces différents
  d’importance et d’établir des priorités en      aspects et activités auront probablement
xiv RÉSUMÉ D’ORIENTATION

           un caractère dynamique et interactif            en épidémiologie, en sciences de
           et devront être adaptés au contexte             l’alimentation, en sécurité sanitaire des
           national, compte tenu de la capacité de         aliments et des spécialistes d’autres
           surveillance de la santé publique du pays       domaines en rapport avec le sujet.
           et des données effectivement disponibles.
                                                           Pour faire en sorte que les résultats de
           Si certains aspects du travail, tels que        l’étude soient exploités au maximum,
           la collecte de données, les calculs et          il convient de les diffuser auprès d’une
           l’établissement des DALY, sont souvent          large gamme de publics (scientifiques,
           confiés à une agence spécialisée ou à           décideurs, entreprises du secteur
           un groupe qui dispose de compétences            agroalimentaire, médias et grand public).
           particulières, il est important d’associer      Les messages et les supports seront
           un groupe relativement important                choisis en fonction du groupe cible.
           d’acteurs au processus global. Il est en
           effet crucial de faire appel aux différents     Les études nationales sur la charge
           acteurs nationaux, non seulement parce          de morbidité d’origine alimentaire sont
           qu’ils peuvent apporter une contribution        essentielles pour combler les lacunes
           utile au projet, mais aussi parce que cela      relevées dans le cadre d’initiatives
           permet de les amener à s’y intéresser et        régionales et mondiales, concentrer
           de leur faire prendre conscience de l’utilité   l’action sur le contexte national et
           des estimations qui en résulteront. Ces         produire des estimations fondées sur
           acteurs comprennent toute une série             les données locales qui soient aussi
           d’organisations qui jouent un rôle dans         exactes que possible. Elles permettent
           la sécurité sanitaire des aliments ou s’y       en outre de mettre en évidence les
           intéressent, telles que les institutions        besoins et les informations qui font
           publiques, les milieux universitaires, les      défaut dans les systèmes de sécurité
           représentants des entreprises du secteur        sanitaire des aliments et de promouvoir
           agroalimentaire et les associations de          la coopération et la communication
           consommateurs.                                  entre les différentes parties prenantes.
                                                           Sur le long terme, les informations sur la
           Les études nationales sur la charge de          charge de morbidité d’origine alimentaire
           morbidité d’origine alimentaire peuvent         devraient être une composante
           donner lieu à la production d’un grand          essentielle d’une politique structurée
           nombre de chiffres et il est crucial de         concernant la sécurité sanitaire
           fournir des résultats détaillés. Il importe     des aliments, à l’image du cadre de
           également d’expliquer le caractère              gestion des risques que préconise la
           incertain de certaines estimations.             Commission du Codex Alimentarius.
           Enfin, les résultats seront autant que          Une telle politique serait bénéfique non
           possible interprétés par des experts en         seulement pour la santé publique, mais
           médecine clinique, en santé publique,           aussi pour le commerce.
1

1
INTRODUCTION

Pourquoi évaluer la charge de morbidité d’origine alimentaire ?
Finalité du présent guide
Charge de morbidité
Champ d’application
Public cible
Comment utiliser le présent guide
2   INTRODUCTION

     INTRODUCTION

            POURQUOI ÉVALUER LA CHARGE DE                  et de la capacité nationales. Enfin, ces
            MORBIDITÉ D’ORIGINE ALIMENTAIRE ?              estimations exigent de nouer un dialogue
                                                           avec de nombreux acteurs, ce qui
            Malgré l’attention croissante que les          peut contribuer à harmoniser et à faire
            milieux politiques portent à la sécurité       converger les différentes actions menées
            sanitaire des aliments depuis quelques         au niveau national pour améliorer la
            décennies, les maladies d’origine              sécurité sanitaire des aliments.
            alimentaire continuent de représenter
            une charge considérable pour la santé          L’évaluation de la charge de morbidité
            publique, l’économie et la société dans le     d’origine alimentaire est une mission
            monde entier, et plus encore dans les pays     difficile à plusieurs égards. Tout d’abord, on
            à faible revenu et à revenu intermédiaire.     dénombre plus de 250 maladies d’origine
            Pour faire diminuer cette charge, il est       alimentaire, qui sont causées par toute
            nécessaire de prendre des décisions            une gamme d’agents microbiologiques
            éclairées, de faire preuve de volonté          (bactéries, virus, parasites) et de polluants
            politique et de déployer des stratégies        chimiques qui sont présents naturellement
            efficaces axées sur les problèmes les          dans les aliments, ou qui résultent de
            plus graves en ce qui concerne la sécurité     la pollution environnementale, de la
            sanitaire des aliments. Cela suppose           fabrication, du conditionnement, du
            d’identifier les maladies et les sources       transport et du stockage des aliments.
            d’exposition les plus importantes et de les    Ensuite, seule une fraction des personnes
            classer en fonction de leur impact sur la      qui contractent une maladie après avoir
            santé publique.                                mangé des aliments contaminés vont
                                                           consulter, se font soigner et sont signalées
            Il est indispensable d’évaluer la charge       aux autorités de santé publique. De
            que représentent les maladies d’origine        plus, les effets sanitaires des dangers
            alimentaire au niveau national pour            alimentaires sont extrêmement complexes
            faire reculer ces maladies. Cela permet        et vont bien au-delà de la gastro-entérite
            en effet de disposer des informations          aiguë, certains pathogènes pouvant
            nécessaires pour affecter au mieux les         entraîner des séquelles telles qu’une
            ressources et structurer efficacement          insuffisance rénale, une maladie hépatique
            l’action de prévention. Ces estimations        ou neurologique, ou encore des cancers.
            contribuent en outre à la mise en place        Il convient également de noter que les
            de systèmes nationaux de sécurité              agents pathogènes généralement classés
            sanitaire des aliments fondés sur les          parmi les pathogènes alimentaires sont
            risques et favorisent la participation à des   également responsables de maladies
            activités normatives relatives aux denrées     qui trouvent leur origine dans d’autres
            alimentaires au niveau international et        modes de transmission, comme la
            l’implication dans des organisations           consommation d’eau contaminée ou le
            commerciales. Elles sont utiles pour           contact avec des animaux, ou du simple
            identifier les besoins concernant les          fait de leur présence dans l’environnement.
            systèmes de sécurité sanitaire des             Enfin, nombre de pays ne disposent pas
            aliments et les lacunes concernant les         de systèmes de surveillance solides,
            données et donc pour établir des priorités     ni des données requises pour réaliser
            quant au renforcement de l’infrastructure      de telles analyses. Dans la plupart
3

des pays à faible revenu ou à revenu           morbidité a été évaluée grâce à trois unités    INTRODUCTION
intermédiaire, les données sont détenues       de mesure : incidence, mortalité et années
par certains acteurs et ne sont pas            de vie ajustées sur l’incapacité (DALY).
forcément facilement accessibles aux
autres, sans compter que les systèmes          Si elles ont joué un rôle crucial dans la
d’enregistrement de l’information ne sont      mise en évidence des priorités en matière
pas standardisés, ce qui entrave la collecte   de sécurité alimentaire dans les différentes
des données et leur mise en commun.            régions du monde, ces estimations sont
                                               le fruit d’une initiative de grande envergure
Afin de se faire une idée aussi précise que    qui s’est heurtée à des obstacles non
possible de la charge régionale et mondiale    négligeables sur le plan méthodologique
de morbidité d’origine alimentaire, l’OMS      et sur le plan des données. Pour réaliser
a créé en 2007 le Groupe de référence          ces études régionales et mondiale, le
sur l’épidémiologie des maladies d’origine     FERG a dû s’appuyer sur un certain
alimentaire (FERG) (1) qui a vocation à :      nombre d’hypothèses et d’extrapolations
                                               de données, d’où l’incertitude de
•   évaluer la charge mondiale de              certaines estimations. Compte tenu du
    morbidité d’origine alimentaire en         nombre limité de données disponibles
    fonction de l’âge, du sexe et de la        à certains égards, le FERG a présenté
    région, pour une liste donnée d’agents     ses estimations à l’échelle régionale, ne
    pathogènes véhiculés par les aliments;     pouvant rendre compte de la diversité des
•   sensibiliser les États Membres et          risques entre les pays d’une même région
    les amener à se mobiliser pour faire       ou à l’intérieur des pays.
    respecter les normes relatives à la
    sécurité sanitaire des aliments;           Les pays sont par conséquent invités
•   renforcer les capacités des pays en ce     à réaliser leurs propres estimations,
    qui concerne l’évaluation de la charge     simplifiées ou non, selon l’étendue de
    de morbidité d’origine alimentaire et      leurs compétences techniques et de leurs
    faire en sorte qu’un nombre croissant      moyens. Ce processus nécessitera des
    de pays entreprennent des évaluations      mesures de différents ordres, suivant la
    de ce type;                                capacité actuelle du pays, les données
•   encourager les pays à mettre à             dont il dispose et ses ressources
    profit l’estimation de la charge de        globales. Quels que soient le niveau de
    morbidité d’origine alimentaire pour       développement et le travail nécessaire
    se doter de politiques réglementaires      pour évaluer la charge nationale de
    et de normes concernant la sécurité        morbidité d’origine alimentaire, il est
    sanitaire des aliments et faire une        essentiel que les pays utilisent des
    analyse à moindre coût des mesures         méthodes uniformes de manière à pouvoir
    de prévention, d’intervention et de        mettre en commun les résultats obtenus,
    lutte contre les maladies d’origine        comparer leurs chiffres respectifs et, in
    alimentaire.                               fine, améliorer les politiques relatives à la
                                               sécurité sanitaire des aliments.
Les travaux du FERG ont permis à
l’OMS de publier pour la première fois
en 2015 des estimations concernant la          FINALITÉ DU PRÉSENT GUIDE
charge mondiale de morbidité d’origine
alimentaire. Ces estimations portent           Le présent guide donne des indications
sur les maladies causées par 31 agents         à quiconque prévoit d’évaluer la charge
pathogènes parmi lesquels 11 agents            de morbidité d’origine alimentaire, en
responsables de maladies diarrhéiques,         particulier au niveau national. Il donne une
7 agents responsables de maladies              image complète des conditions requises,
invasives, 10 helminthes et 3 produits         des éléments qui facilitent ces évaluations,
chimiques ou toxines. Il en ressort que les    des difficultés et des possibilités qu’elles
aliments impropres à la consommation           comportent, ainsi que des différentes
sont responsables de 600 millions de           étapes du processus, en s’appuyant sur
cas de maladies d’origine alimentaire, de      la méthode utilisée par le FERG. Il vise
420 000 décès et d’un total de 33 millions     en outre à favoriser l’harmonisation des
d’années de vie en bonne santé perdues         méthodes d’évaluation de la charge de
à l’échelle planétaire (1). La charge de       morbidité entre les différents pays.
4   INTRODUCTION

            CHARGE DE MORBIDITÉ                               morbidité dont ils sont responsables, ainsi
                                                              que des exemples d’études nationales.
            La charge de morbidité peut être
            exprimée à l’aide de différents indicateurs,      La majorité des agents pathogènes
            tels que l’incidence, la mortalité, le            véhiculés par l’alimentation sont présents
            coût pour la société, ou encore des               dans toute une série d’aliments et peuvent
            mesures sommaires de la santé de la               être transmis à l’homme, pour plusieurs
            population. Dans le présent ouvrage, les          d’entre eux, par l’environnement, par les
            DALY constituent la principale mesure             contacts avec les animaux et d’individu
            sommaire de l’impact des maladies                 à individu. Aussi est-il essentiel de
            d’origine alimentaire sur la santé de la          déterminer dans quels cas les infections
            population. Si toutes les études sur la           ont une origine alimentaire et quels sont
            charge de morbidité doivent tendre vers           les aliments en cause. C’est là une tâche
            l’évaluation des DALY, toute mesure               difficile qui exige d’utiliser des méthodes
            intermédiaire est également valable. Il est       d’attribution des sources (2). Parce que
            aussi possible de s’appuyer sur les taux          ces études nécessitent des moyens
            d’incidence et de mortalité pour classer les      conséquents, ainsi que des compétences
            maladies d’origine alimentaire par ordre          et des capacités particulières, elles ne
            d’importance et en comparer l’impact sur          seront pas décrites en détail dans cet
            la santé publique.                                ouvrage. On trouvera cependant à l’annexe
                                                              2 un aperçu général des méthodes
                                                              d’attribution des sources, ainsi que des
            CHAMP D’APPLICATION                               explications sur l’utilité de ces méthodes
                                                              selon les pathogènes considérés et les
            Le présent guide décrit les différentes           questions de santé publique qui se posent,
            étapes de l’évaluation de la charge des           et sur leurs avantages et inconvénients.
            maladies d’origine alimentaire causées
            par des agents microbiologiques
            généralement véhiculés par les aliments.          PUBLIC CIBLE
            Il traite de la planification, de la définition
            du contexte, des estimations de la charge         Le présent guide s’adresse aux
            de morbidité, de la mise en parallèle de          gouvernements, aux établissements
            ces données et des estimations relatives          universitaires, ainsi qu’à toute personne
            à l’attribution des sources, de la diffusion      participant à la réalisation d’une étude sur
            de l’information et de l’application des          la charge de morbidité d’origine alimentaire
            connaissances. Cet ouvrage a été structuré        au niveau national ou à un autre niveau
            de manière à rendre compte au mieux               (régional ou infranational).
            de la séquence des étapes à respecter
            lorsqu’on réalise une étude nationale sur la
            charge de morbidité d’origine alimentaire.        COMMENT UTILISER LE PRÉSENT GUIDE
            Il conviendra d’adapter ces différentes
            étapes en fonction de la capacité de              Les travaux que suppose la réalisation
            surveillance de la santé publique du pays et      d’une étude sur la charge de morbidité
            des données disponibles.                          d’origine alimentaire sont expliqués aux
                                                              chapitres 3 et 7. Ils seront adaptés en
            Bien qu’ils soient connus pour être               fonction du contexte national et auront
            responsables d’une bonne partie des               potentiellement un caractère dynamique et
            cas de maladies d’origine alimentaire,            interactif. Il importe si possible d’accomplir
            les dangers chimiques, notamment les              les étapes décrites pour chaque activité
            allergènes alimentaires, ne seront pas            dans l’ordre indiqué.
            traités dans le présent guide. Les données
            nécessaires et les méthodes à suivre à            Les études sur la charge de morbidité
            ce sujet feront l’objet d’une prochaine           d’origine alimentaire sont souvent
            publication. On trouvera cependant                itératives, l’intégration de nouveaux
            à l’annexe 1 des informations sur les             éléments s’imposant à mesure que l’étude
            contaminants chimiques présents dans les          avance. Il est donc sage de procéder étape
            aliments, un rapide aperçu des méthodes           par étape, en commençant par une étude
            qui permettent d’évaluer la charge de             élémentaire et relativement restreinte
5

                                                                                              INTRODUCTION
qui sera progressivement étendue et            avec les acteurs de la sécurité sanitaire
approfondie. Le présent ouvrage guidera le     des aliments à l’échelle du pays et de faire
lecteur dans cette démarche.                   converger les efforts en plaidant pour la
                                               communication et la mise en commun des
La meilleure façon d’apprendre étant de        données.
pratiquer, le présent ouvrage a pour but
d’encourager chaque pays à étudier sa          L’évaluation de la charge nationale
charge de morbidité d’origine alimentaire.     de morbidité des maladies d’origine
Si les études nationales doivent tendre        alimentaire peut nécessiter des moyens
vers l’estimation des DALY, les étapes         techniques supplémentaires et des
intermédiaires telles que l’estimation         indications particulières. Cette question
de l’incidence des maladies d’origine          sera traitée dans des ouvrages à paraître et
alimentaire et de la mortalité qui en          dans le cadre d’autres activités de l’OMS.
résulte, sont, elles aussi, utiles. Enfin,     Les lecteurs sont invités à consulter le
une étude sur la charge de morbidité est       site web de l’OMS pour se tenir informés
aussi l’occasion d’identifier les lacunes en   (https://www.who.int/activities/estimating-
matière de données, de nouer un dialogue       the-burden-of-foodborne-diseases).
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