Formation des Ingénieurs AgroParisTech Dominante d'approfondissement Gestion des Milieux Naturels (GMN)

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Formation des Ingénieurs AgroParisTech Dominante d'approfondissement Gestion des Milieux Naturels (GMN)
3 ème année - cursus ingénieu r AgroPar isTech 2017/20 18

                                                            Formation des Ingénieurs AgroParisTech

                                                               Dominante d'approfondissement
                                                              Gestion des Milieux Naturels (GMN)

                                                                                      2017 - 2018

                                                                            Présentation et résumés
                                                                          des mémoires de fin d'études

                                                              INSTITUT DES SCIENCES ET INDUSTRIES DU VIVANT ET DE L'ENVIRONNEMENT
Formation des Ingénieurs AgroParisTech Dominante d'approfondissement Gestion des Milieux Naturels (GMN)
Sommaire

Présentation d'AgroParisTech                                                                         3

Présentation du centre de Nancy                                                                      4

Le domaine d'approfondissement Gestion des Milieux Naturels                                          5

Les projets                                                                                         6-8

Résumés                                                                                              9

Cartographie des habitats naturels du Mas Neuf du Vaccarès BAILLIN Margot                           11

Gestion post-incendie d'une forêt méditerranéenne : vers une forêt plus résiliente et moins         12
sensible au feu BASTIANELLI Melina

Génération et utilisation d'une base de données de phytoplancton marin de la série temporelle       13
océanographique RADIALES (RADCAN) du Cantabrique Sud CHABRIER Pauline

Plan de gestion des terres littorales de la Communauté de communes du Haut Pays Bigouden            14
DEBUE Marianne

Les voies d’introduction et de propagation des espèces exotiques envahissantes préoccupantes        15
pour l’UE en France hexagonale : analyse et plans d’action DUNCOMBE Joseph

Élaboration d’un plan technique de réhabilitation et de protection de l’espace littoral ESSARTIER   16
Aurélie

Études d’impact : la biodiversité victime des espèces protégées ? Analyse critique des biais        17
induits par l’utilisation des listes d’espèces protégées dans l’évaluation environnementale et
propositions d’amélioration GOURDOL Angélique

Évaluation de l'état de conservation de 13 milieux humides sur le site Natura 2000 Petite           18
Montagne du Jura : mise au point d'une méthode adaptée au territoire GRANDADAM Laura

Quels déterminants des patrons de végétation prairial en zone de marais ? Analyse de données        19
in situ par un panel de variables environnementales GRANGE Marie

                                                                                                1
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Analyse de l’évolution des mesures ERC Biodiversité et des coûts associés pour une LGV entre la      20
    phase de déclaration d’utilité publique et la mise en service GUIBERT Quentin

    Mise en relation de la cartographie de l’occupation du sol et des services écosystémiques liés à     21
    l’eau : cas du nitrate au sein du bassin versant de l’Orne GUTHMANN Léo

    Station en environnement changeant. Test de transfert des nouvelles connaissances sur                22
    l’adéquation sol-plante en climat changeant JOUSSEMET François

    Les Chiroptères de la forêt domaniale de Raismes-Saint Amand-Wallers (59) : amélioration des         23
    connaissances en vue d’une gestion adaptée à leur conservation LESOT Céline

    Diagnostic environnemental du fleuve La Foa et de son principal influent la Poquereux (La Foa,       24
    Nouvelle-Calédonie) LETONNELIER Stéphanie

    Identification des facteurs de sélection des sites de nidification chez la cigogne noire, Ciconia    25
    nigra MAGOT Charline

    Étude des flux d’eau et de sédiments vers les étangs du PNR de la Brenne grâce à la mise en          26
    place de parcelles d’érosion in situ MARION Baptiste

    Réalisation d’un catalogue de mesures compensatoires et d’accompagnement à destination de            27
    projets éoliens situés dans un contexte agricole QUÉNÉE Louis

    Étude des corrélations entre la fonctionnalité du couvert forestier et la qualité et disponibilité   28
    en eau en Nouvelle-Calédonie SCHAAN Mélanie

    Élaboration d’une méthode d’identification des sites et orientations de gestion pour favoriser       29
    la biodiversité sur le foncier des sites hydroélectriques. Cas du foncier de l’Unité de Production
    hydraulique Sud-Ouest d’EDF THOMAS Claire

    La rédaction du document stratégique de façade Manche Est – mer du Nord. La priorisation des         30
    orientations stratégiques ZAK Marie-Ange

    Rappel soutenances 2017                                                                              32

    Rappel soutenances 2016                                                                              34

    Rappel soutenance 2015                                                                               36

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Présentation d'AgroParisTech
Institut sous tutelle du ministère chargé de l’agriculture, AgroParisTech est la grande école européenne
d’ingénieurs et de managers dans le domaine du vivant et de l’environnement. Il répond aux grands
enjeux du 21è siècle : nourrir les hommes en gérant durablement les territoires, préserver les ressources
naturelles, favoriser les innovations.
AgroParisTech s’est donné deux missions fondamentales :
- la formation d’ingénieurs au coeur d’un dispositif étendu à d’autres cursus académiques et
"professionnalisant" articulé en réseaux régionaux ou thématiques bâtis avec de nombreux partenaires
- la production et la diffusion de connaissances (recherche et développement) en partenariat avec
les grands organismes de recherche et les principaux centres techniques professionnels pertinents.
AgroParisTech déploie son offre de formation au niveau national dans une école multisites permettant
une pédagogie ancrée sur le terrain et l’opérationnel.

AgroParisTech s’est assigné six grands domaines de compétences pour ses enseignants-chercheurs et
d’activités pour ses diplômés :

•   les ressources agricoles et forestières,
•   l’environnement,
•   la transformation agro-industrielle,
•   les biotechnologies,
•   la distribution,
•   l’ensemble des services accompagnant l’acte de production et de commercialisation.

                                                    Paris &
                                                    Ile-de-         Nancy
                                                    france

                         Kourou
                         Guyane
                                                 Clermont-Ferrand

                                                  Montpellier

                                                                                                    3
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Présentation du centre de Nancy
                                                       Issu de l’école forestière fondée en 1825 et
                                                       rattachée à l’ENGREF en 1966, le centre est
                                                       devenu campus d’AgroParisTech en 2007. Avec
                                                       ses partenaires lorrains, ses réseaux nationaux
                                                       et internationaux, il offre une formation de
                                                       cadres et une recherche pluridisciplinaire
                                                       uniques en France et reconnues dans le monde
                                                       entier, centrées sur la connaissance et la gestion
                                                       durable des forêts multifonctionnelles, ouvertes
                                                       aux secteurs de la protection de la nature, du
                                                       bois matériau et énergie, de l’arbre urbain et
                                                       rural. Le campus AgroParisTech de Nancy est
                                                       situé au cœur du centre historique de Nancy,
                                                       pôle important d’enseignement supérieur (50
                                                       000 étudiants) et de recherche (CNRS, INRIA,
                                                      INRA). Il accueille les étudiants et visiteurs dans
un beau cadre de vie, et offre l’accès aux terrains et savoirs forestiers, essence de notre recherche et
notre pédagogie.
Les formations
En lien avec les autres campus d’AgroParisTech, notamment Kourou, Montpellier et Paris, le campus de
Nancy a la responsabilité des formations supérieures forestières d’AgroParisTech :
• Il pilote les parcours forestiers du cursus ingénieur AgroParisTech (bac+5) avec les dominantes
    d’approfondissement (DA) suivantes :

-          Gestion Forestière durable et multifonctionnelle (GF)
-          Ressources Forestières et Filière bois (RFF)
-          Gestion des Milieux Naturels (GMN)
-          Foresterie Urbaine (IEVU-FU)

•       Il pilote le Mastère Spécialisé Forêt, Nature et
        Société (bac+6) ;

•       Il est co-accrédité dans le master FAGE
        (Biologie et Écologie pour la Forêt,
        l’Agronomie, et l’Environnement, bac+5),
        aux côtés de l’Université de Lorraine. Il
        est particulièrement impliqué dans les
        spécialités « Bois Forêt Développement
        durable » (BFD) et « Forests and their
        environment » (FEN) en anglais.

Le campus de Nancy héberge plusieurs équipes de recherche : le
laboratoire des travaux de recherche pluridisciplinaires sur le bois, les arbres et les
écosystèmes forestiers (Silva), le Bureau d'Économie Théorique et Appliquée (BETA) et le Laboratoire
des Inventaires Forestiers de l’Institut national de l’information géographique et forestière (LIF-IGN).

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Le domaine d’approfondissement Gestion des Milieux
             Naturels (GMN)
Chaque année, une vingtaine d’étudiants de diverses écoles d’ingénieurs terminent leur cursus dans
ce domaine d’approfondissement. La moitié de l’effectif, environ, est issue d’AgroParisTech et les autres
étudiants, pour la majorité, d’écoles d’ingénieurs traitant des thématiques touchant l’agronomie, l’eau,
le paysage….

Le domaine d’approfondissement « Gestion des Milieux Naturels » a pour objectif de former des
spécialistes de la gestion des espèces et des milieux naturels dans un contexte social où les exigences
de conservation et de production augmentent simultanément et dans un contexte environnemental
changeant. Dans ce contexte, le domaine d’approfondissement vise à former des ingénieurs capables
d’évaluer la ressource et l’intérêt patrimonial des milieux, d’identifier les mesures de conservation
nécessaires et d’effectuer des choix de
gestion multifonctionnelle à différentes
échelles spatiales et dans des milieux
naturels variés en lien avec les acteurs
politiques administratifs, et associatifs
concernés. La formation utilise à la fois les
outils traditionnels utilisés dans l’évaluation
patrimoniale des milieux ou la planification
de leur gestion et des approches
quantitatives récentes peu ou pas encore
utilisées par les professionnels : traitement
quantitatif et spatialisé des données
(SIG, GPS, cartographie numérique, …),
modélisation des relations espèces/
communautés – environnement ...
Le domaine d’approfondissement est
divisé en quatre thématiques principales
abordant des objectifs de gestion, des
échelles spatiales et temporelles, des
outils et des niveaux de perturbations des milieux variés. Ces thématiques, abordées dans quatre
modules d'environ cinq semaines chacun, concernent : l'inventaire et la gestion des espaces naturels,
l'évaluation environnementale et la restauration, la gestion des espèces et des milieux naturels en
contexte environnemental changeant et enfin les ressources en eau.

               Compétences coeur de métier de la spécialité
•   Capacité de mise en place d’un inventaire pour l’acquisition et le suivi à long terme de la biodiversité.
    Réalisation de diagnostics environnementaux. Maîtrise des outils d’analyse spatiale et de la
    géomatique. Maîtrise de la réalisation de modèles environnementaux de distribution actuelle ou
    future d’espèces ou d’habitats naturels.
•   Capacité d’analyse quantitative des informations naturelles pour leur typologie, la prévision de leur
    réponse à la gestion courante, à des perturbations anthropiques directes, ou aux changements
    environnementaux à long terme.
•   Réalisation et analyse d’études d’impacts liées aux milieux naturels.
•   Capacité d’intégration d’échelles spatiales et temporelles dans la définition des enjeux, l’identification
    des acteurs et la mise en oeuvre de plans de gestion conservatoire ou multifonctionnelle des
    milieux naturels
•   Capacité de gestion de projet.

                                                                                                         5
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Changement Climatique et Régénération Naturelle (CCRN)

                                      Les 20 élèves de la promotion 2017-2018 ont réalisé le projet
                                      CCRN sur la thématique de l’adaptation des milieux naturels
                                      au changement de climat dans le Parc Naturel régional du
                                      Haut Languedoc. Cette étude s’est inscrite dans le cadre du
                                      projet LIFE Foreccast, qui s’intéresse au renouvellement des
                                      peuplements forestiers dans un contexte de climat changeant.
                                      Ce projet vise à créer un outil cartographique basé sur la
                                      méthode BIOCLIMSOL du CNPF, permettant d’intégrer le
                                      changement climatique dans les stratégies de gestion forestière.

                                     Après une semaine de formation en salle les élèves sont allés
sur le terrain en Occitanie, autour de Saint Pons de Thommières, afin de rencontrer les porteurs de
projet (PNR Haut Languedoc, CNPF), les acteurs locaux, et découvrir les enjeux, les conditions
de milieu et les espèces présentes au sein du site d’étude. Ils ont ensuite travaillé par petits
groupe sur quatre sujets concernant des thématiques liées au sol, au climat ou à la végétation.

Le premier sujet concernait l’estimation et la cartographie de la capacité du sol à stocker l’eau, une
composante essentielle en contexte de sécheresse. Ce travail a été réalisé en étroite collaboration avec
le chargé de mission « sol » du PNR et les scientifiques de l’INRA de Montpellier, qui ont ouvert une
centaine de fosses profondes de 3 à 5 m sur l’emprise du PNR. L’objectif des étudiants était principalement
d’étudier la distribution spatiale de la profondeur du sol, du régolithe et de l’enracinement de comparer
les données issues des fosses profondes avec celles relevées par la méthode traditionnelle (fosse –
tarière). Ce travail a permis de mieux définir les limites des sondages traditionnels qui se sont révélés peu
représentatifs du fait de leur faible profondeur de prospection.

Le deuxième sujet avait pour objectif d’identifier les variables
climatiques importantes à intégrer dans l’outil Bioclimsol,
et de cartographier leur évolution au cours des 50 dernières
années à l’échelle du PNR. Ces travaux ont permis de mettre
en évidence des augmentations allant de 1, 5 °C pour les
températures moyennes à 2,5°C pour les températures
maximales et peu d’évolution globale des pluies en
moyenne. Il a également permis de montrer que les valeurs
moyennes recouvraient des variations spatiales fortes et
variables selon les saisons. Des simulations d’évolution de ces
variables ont également été réalisées à l’aide des modèles et scénarios IPCC, pour le 21ème siècle.

Les deux derniers sujets concernaient la vulnérabilité de la hêtraie acidiphile à houx et la détermination
de la place occupée par diverses essences par rapport à leur niche climatique. Ces deux sujets menés à
l’échelle de l’habitat ou de l’espèce visaient à essayer de déterminer le niveau de risque en fonction du
contexte écologique présent, en utilisant des modèles de niche et de mortalité, et en privilégiant au
maximum les comparaisons entre les outils existants. L’étude de la distribution de 7 essences menée
à l’échelle de leur aire de distribution montre que certaines d’entre elles sont proches de leurs limites
climatiques dans certaines zones du PNR du Haut Languedoc, tandis que d’autres semblent avoir une
certaine marge dans un contexte de climat changeant. Pour ce qui concerne la hêtraie acidiphile à
houx, une relative bonne concordance des différentes approches étudiées a été mise en évidence,
avec un impact potentiel du réchauffement sur la hêtraie dans les zones de plus basse altitude.

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Il résulte de ces travaux que le PNR du Haut Languedoc, qui est une zone présentant de forts gradients
écologiques, est déjà impactée par le changement de climat mais de façon très différenciée selon les
variables étudiées, la saison, et la zone géographique, ce qui rend la prédiction des conséquences du
changement climatique sur la végétation très compliquée. Cela est d’autant plus vrai que l’estimation
de la capacité du sol à stocker l’eau disponible pour les arbres est très complexe… Les travaux menés ont
permis d’améliorer la connaissance au sein du PNR des caractéristiques climatiques, de leur évolution
passée et à venir, ainsi que de l’impact que ces changements peuvent avoir sur la végétation en place. Un
certain nombre de ces résultats seront intégrés pour améliorer le fonctionnement de l’outil Bioclimsol.

         Inventaire et Gestion des Espaces Naturels (IGEN)
Les enjeux actuels de conservation, de préservation et de restauration des milieux naturels et semi-
naturels ont pour objectif principal le maintien de la valeur intrinsèque et des services écosystémiques
                                         qu’ils apportent (ressources naturelles, fonctionnalités des
                                         écosystèmes). Dans un contexte de changement global,
                                         pour des milieux variés (forêts, zones humides, prairies et
                                         espaces à fort enjeu patrimonial) et avec des contraintes
                                         politiques, institutionnelles et socio-économique, il s’agit
                                         pour les acteurs de la conservation de mettre en place et de
                                         pérenniser des mesures de gestion innovantes et cohérentes
                                         localement (populations, écosystèmes, paysages, territoires).
                                         Dans ce cadre, le diagnostic écologique est une des étapes
                                         clés qui permet d’identifier, d’orienter et de prioriser les zones
                                         à plus forts enjeux. Le projet d’application présenté ici se veut
        ©Photographie Quentin GUIBERT

                                                                                                      7
Formation des Ingénieurs AgroParisTech Dominante d'approfondissement Gestion des Milieux Naturels (GMN)
une mise en œuvre concrète d’une gestion intégrée prenant en compte tous les enjeux du territoire.

Le module « Inventaire et Gestion des Espaces Naturels » s’inscrit dans la formation de 3ème année
ingénieur « gestion des milieux naturels » d’AgroParisTech. Ce module a pour but d’apprendre aux
étudiants à réaliser un diagnostic écologique et un bilan de la biodiversité et des services écosystémiques
sur une zone d’étude (milieux semi-naturels) en prenant en compte les statuts de protection (Natura
2000) et les besoins des acteurs du territoire (institutionnel, académique et commercial). Le projet est
articulé de la manière suivante : chaque partie correspond à un document technique, excepté le guide
des stations forestières qui se veut plus pédagogique, correspondant aux attentes des parties prenantes.

Les étudiants ont passé deux semaines sur le domaine de la forêt-école des Agreaux. Ils ont pu à cette
occasion mettre en œuvre les protocoles de terrains élaborés en amont (mesures dendrométriques,
inventaire floristique, évaluation de l’état de conservation) pour l’établissement des bases de
données nécessaires aux analyses. Les rencontres avec les différents acteurs du territoire ont été
déterminantes pour la compréhension des enjeux du site et des cadres institutionnel et juridique.

         Bassin Versant et Ressources en Eau (BVRE)

                                     Les communes de la Palud sur Verdon et de Castellane se situent au
                                     cœur des Gorges du Verdon. Ces deux municipalités bénéficient
                                     de l’expertise du parc naturel régional pour concilier au mieux
                                     la préservation du patrimoine face à la pression touristique
                                     particulièrement importante pendant la période estivale.

                                     Dans le cadre du module « bassin versant et ressource en eau »
                                     les étudiants ont, dans un premier temps, mis en place un atlas
                                     répertoriant et décrivant les zones humides de ces territoires
                                     communaux.

Pour les deux zones humides les plus sensibles (marais de la Palud
sur Verdon et Marais de Castellane) une description fine de ces
milieux a été réalisée en adaptant des outils reconnus au niveau
national (boite à outil Rhoméo, protocole Carhyce, méthode
nationale d’évaluation des zones humides). Ces résultats, croisés
avec une étude sociologique ont permis aux étudiants de
proposer des mesures de gestion pour préserver ces milieux,
supports de nombreux services écosystémiques.

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Formation des Ingénieurs AgroParisTech Dominante d'approfondissement Gestion des Milieux Naturels (GMN)
Résumés

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Cartographie des habitats naturels du Mas Neuf du Vaccarès

                                                            BAILLIN Margot

     Maître de stage : Madame POULET Laetitia, Parc Naturel Régional de Camargue
                Tutrice AgroParisTech : Madame PINTO Paulina, UMR Silva

Mots-clefs : état de conservation, habitats, indicateurs, phytosociologie

Le site du Mas neuf du Vaccarès est un terrain appartenant au Conservatoire du Littoral et dont la
gestion a été confiée au Parc Naturel Régional de Camargue. Le plan de gestion de cet espace naturel
situé au Nord de l’étang du Vaccarès est actuellement en cours de renouvellement.

Cette étude s’intègre donc dans la phase de diagnostic du nouveau plan de gestion et a pour
                                          objectif de cartographier les habitats naturels du site
                                          de 224 ha et d’évaluer leur état de conservation. La
                                          cartographie et l’évaluation s’appuient sur les relevés
                                          phytosociologiques et la mesure des indicateurs de l’état
                                          de conservation des habitats. La méthode employée
                                          est reproductible pour les années à venir afin d’avoir un
                                          suivi temporel des habitats suite à la mise en place des
                                          mesures de gestion.

 Photographie de : ©BAILLIN Margot
 Plan d’eau envahi par la Jussie (Ludwigia peploïdes) et bordé
 de Séneçon en arbre (Baccharis halimifolia), deux espèces
 exotiques envahissantes à forts enjeux en Camargue

                                                                                              11
Gestion post-incendie d'une forêt méditerranéenne : vers une forêt plus résiliente
                            et moins sensible au feu

                                                            BASTIANELLI Melina

                       Maître de stage : SERANTONI Eric, Parc national de Port-Cros
                        Tutrice AgroParisTech : Madame PINTO Paulina,UMR Silva

Mots clefs : forêt méditerranéenne, gestion, post-incendie, régénération, résilience

La zone du Cap Lardier, espace naturel de la côte varoise, a été touchée en juillet 2017 par un incendie
sur plus de 500 ha. Les forêts méditerranéennes sont des espaces sensibles aux feux, et avec les
changements climatiques la fréquence de ces événements risque d’augmenter.

Dans ce contexte, le Parc national de Port-Cros, gestionnaire d’une partie de cette zone, a souhaité
                                             mettre à profit cet événement pour développer une
                                             gestion post-incendie qui permettrait d’obtenir de
                                             meilleures connaissances de la régénération forestière
                                             et des différentes actions à entreprendre.

                                                                     Cette étude, qui a commencé près de 9 mois après
                                                                     l’incendie, a pour but de donner des pistes de gestion
                                                                     pour aller vers une forêt moins sensible au départ
                                                                     d’incendie, et plus résiliente face aux perturbations,
                                                                     qui pourront ensuite servir de référence sur les actions
                                                                     post-incendie. C’est aussi l’occasion de mettre en place
                                                                     des protocoles de suivis réguliers afin de compléter les
                                                                     connaissances sur le milieu.

 Photographie de : ©BASTIANELLI Melina
 Un an après l’incendie, la strate herbacée s’est bien développée.
 On peut voir les pins morts sur pieds, et les chênes lièges qui,
 eux, rejettent depuis les branches

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Génération et utilisation d'une base de données de phytoplancton marin de la
  série temporelle océanographique RADIALES (RADCAN) du Cantabrique Sud

                                                          CHABRIER Pauline

        Maître de stage : Monsieur SCHAREK Renate, Centro Oceanografico de Gijón
                 Tutrice AgroParisTech : Madame PINTO Paulina, UMR Silva

Mots clefs : abondance, base de données, bloom, campagne océanographique, colonne d'eau,
phytoplancton marin, saisonnalité, taxonomie

La Radial de Gijón s'inscrit dans le projet RADIALES (études de séries historiques de données
océanographiques). Il s'agit d'une campagne océanographique commencée à l'Instituto Español de
Oceanografía (IEO) à la fin des années 80 comme programme d'observation systémique et continue
de l'océan.
                                             La série temporelle de phytoplancton marin de Gijón
                                             est en marche depuis 12 ans (2004-2015), soit une durée
                                             devenant intéressante pour commencer un travail; à
                                             savoir construire une base de données et amorcer une
                                             analyse.

                                                                 Les analyses réalisées décrivent la communauté en
                                                                 terme de richesse et de fréquence des taxons en
                                                                 abondance et en présence, abordant la variabilité
                                                                 saisonnière et la variabilité vertical.

                                                                 La variabilité saisonnière étudiée met bien en évidence
                                                                 les blooms printaniers et automnaux caractéristiques
                                                                 des espèces du Cantabrique. Les blooms printaniers de
                                                                 certaines Diatomées ainsi que certains Dinoflagellés
 Photographie de : ©CHABRIER Pauline
 En haut navire océanographique Ramon Margalef, en bas           dirigent les variations saisonnières d'abondance de la
 rosette avec les bouteilles NISKIN® pour les échantillonnages   communauté.
 dans la colonne d'eau

                                                                                                                  13
Plan de gestion des terres littorales de la Communauté de communes du Haut Pays
                                      Bigouden

                                                        DEBUE Marianne

Maîtres de stage : Madame GOASCOZ Gaëlle, Communauté de communes du Haut Pays
                                  Bigouden (CCHPB)
          Tuteur AgroParisTech : Monsieur LEBOURGEOIS François, UMR Silva

Mots clefs : biodiversité, conservatoire du littoral, enjeux et problématiques d’un territoire,
érosion, littoral, plan de gestion

La CCHPB est une des trois communautés de communes qui se partagent la baie d’Audierne. Cette baie
constitue un site à forte valeur patrimoniale, par la diversité de ses paysages, de ses espèces animales et
végétales et par son Histoire. Cependant, plusieurs menaces pèsent sur ce territoire : érosion, espèces
envahissantes, fermeture des milieux, modification anthropique du fonctionnement hydraulique…

                                                           La CCHPB, étant gestionnaire d’une partie des
                                                           terres littorales de la baie, a un rôle à jouer dans la
                                                           préservation de ce patrimoine. Afin de remplir cette
                                                           mission, un plan de gestion a été réalisé, constitué de
                                                           trois parties : un diagnostic du territoire en matière
                                                           d’environnement (habitats, faune, flore, eau, géologie)
                                                           et d’anthropisation, une mise en évidence des enjeux
                                                           du site, et une proposition d’un ensemble de mesures
                                                           de gestion pour répondre à ces enjeux.

 Photographie de : ©DEBUE Marianne
 Plage du Gored, interface entre l'Homme et la Nature

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Les voies d’introduction et de propagation des espèces exotiques envahissantes
    préoccupantes pour l’UE en France hexagonale : analyse et plans d’action

                                                       DUNCOMBE Joseph

Maître de stage : Monsieur ALBERT Arnaud, Agence Française pour la Biodiversité (AFB)
           Tutrice AgroParisTech : Madame FLEISCH Marie-Reine, UMR Silva

Mots clefs : administration publique, invasions biologiques, plans d’action, voies
d’introductions

Considérées comme l’une des principales menaces qui pèsent sur l’équilibre des écosystèmes à
l’échelle mondiale, les espèces exotiques envahissantes (EEE) sont depuis 2014 l’objet d’un règlement
européen qui oblige les États membres de l’UE à agir contre leur introduction et leur propagation.

                                                                A ce titre, l’AFB a été chargée d’identifier les voies
                                                                d’introduction prioritaires et d’élaborer des plans d’action
                                                                pour lutter contre leur propagation. Dans l’hexagone,
                                                                l’étude de l’utilisation des voies et des impacts ont
                                                                permis de cibler : les utilisations ornementales et
                                                                horticoles d’EEE végétales, les détentions domestiques
                                                                et les élevages d’EEE animales, le transport non
                                                                intentionnel d’espèces et l’utilisation par ces dernières
                                                                de corridors de déplacements en milieux terrestres et
                                                                aquatiques. La sensibilisation et/ou la formation des
                                                                acteurs concernés, le renforcement des moyens pour le
                                                                contrôle et la surveillance ainsi que l’amélioration des
                                                                connaissances relatives aux mécanismes de dispersion
                                                                des EEE sont les mesures que la puissance publique doit
                                                                soutenir en priorité.
 Couverture de la stratégie nationale relative aux espèces
 exotiques envahissantes. (de gauche à droite et de haut en
 bas) : Reynoutria japonica, Ambrosia artemisiifolia, Pterois
 volitans, Carpobrotus edulis,Vespa velutina, Myocastor
 coypus, Furcraea foetida, Procambarus clarkii, Harmonia
 axyridis et Ludwigia peploides

                                                                                                                     15
Élaboration d’un plan technique de réhabilitation et de protection de l’espace
                                  littoral

                                                             ESSARTIER Aurélie

           Maître de stage : Monsieur MURACCIOLE Michel, Conservatoire du littoral
                Tuteur AgroParisTech : Monsieur DURAND Philippe, UMR Silva

Mots clefs : changement climatique, cordon dunaire, dunes littorales, érosion côtière, gestion
souple, littoral, réhabilitation écologique, trait de côte

A l’interface terre/mer, le littoral est un espace fortement convoité et soumis aux phénomènes littoraux,
tels que l’érosion côtière. Devenue un enjeu majeur de gestion pour les politiques publiques, des
aménagements en dur (épis, digues …) ont été entrepris sur les littoraux afin de fixer le trait de côte
et de protéger les populations. N’apportant que des solutions à court terme difficilement soutenables
                                                    dans le temps, des techniques de gestion souples des
                                                    dunes, bien moins coûteuses, ont vu le jour durant la
                                                    seconde moitié du XXe siècle, dans le cadre de la gestion
                                                    intégrée des zones côtières.

                                                                     C’est dans un objectif de gestion souple du littoral et
                                                                     d’adaptation au changement climatique, que le projet
                                                                     national Adapto est créé en 2015, par le Conservatoire
                                                                     du littoral. Ce stage consiste à réhabiliter et protéger
                                                                     l’espace littoral et, notamment, le cordon dunaire de
                                                                     deux communes d’un des dix sites pilotes Adapto, situé
                                                                     en Corse.

 Photographie de : ©ESSARTIER Aurélie 27/04/2018.
 Mise en place de brise-vents de type ganivelles sur un site
 protégé par le Conservatoire du littoral, en vu de réhabiliter le
 cordon dunaire et de canaliser les accès à la plage

 16
Études d’impact : la biodiversité victime des espèces protégées ?
Analyse critique des biais induits par l’utilisation des listes d’espèces protégées
      dans l’évaluation environnementale et propositions d’amélioration

                                                GOURDOL Angélique

                         Maître de stage : Madame RENARD Emma, ECOTER
                    Tuteur AgroParisTech : Monsieur DURAND Philippe, UMR Silva

Mots clefs : biodiversité, espèces protégées, étude d’impact, évaluation environnementale,
méthode, nature ordinaire, protection

L’étude d’impact a pour objectif l’intégration des enjeux écologiques dans la conception des projets
d’aménagement. Elle vise à proposer des mesures permettant d’adapter le projet au site d’implantation
en intégrant les contraintes réglementaires.

                                                     Les espèces protégées, de par leur statut, semblent
                                                     constituer le fil rouge de ces études et les méthodes
                                                     employées par les bureaux d’études permettent
                                                     une prise en compte optimale de ces espèces. Mais
                                                     permettent-elles de considérer l’ensemble de la
                                                     biodiversité, comme le demande la réglementation ? Il
                                                     semblerait que l’utilisation actuelle des listes d’espèces
                                                     protégées induise des biais dans la détermination
                                                     des enjeux écologiques d’un site. Quels sont ces biais,
                                                     quelle est leur importance ? Comment les minimiser
                                                     ? Comment mieux prendre en compte la part de
                                                     biodiversité jusqu’alors négligée dans les études
                                                     d’impact ?

 Photographie de : ©ECOTER
 Infrastructures routières au sein du paysage

                                                                                                         17
Évaluation de l'état de conservation de 13 milieux humides sur le site Natura 2000
  Petite Montagne du Jura : mise au point d'une méthode adaptée au territoire

                                                       GRANDADAM Laura

      Maître de stage : Monsieur NOYERE Tristan, Natura 2000 Petite Montagne du Jura
               Tuteur AgroParisTech : Monsieur DURAND Philippe, UMR Silva

Mots clefs : amélioration des connaissances, état de conservation, gestion, indicateurs,
inventaires, milieu humide, Natura 2000, RhoMéO

Les 38 300 ha du site Natura 2000 Petite Montagne du Jura sont constitués d'une diversité remarquable
de milieux. Parmi eux, de nombreux habitats humides de petite taille (moins d'un hectare en moyenne)
sont dispersés sur tout le territoire. Méconnus, ils sont pourtant très importants, autant pour le
fonctionnement hydrologique de la région que pour les espèces patrimoniales qu'ils peuvent abriter.

                                                                L'évaluation de l'état de conservation de 13 de ces
                                                                secteurs est une façon de mieux les connaître tout
                                                                en préparant de potentielles actions de préservation
                                                                (contrats Natura 2000) afin de l'améliorer ou de le
                                                                conserver.

                                                                Les méthodes d'évaluation d'état de conservation
                                                                existantes sont chronophages et peu adaptées à de
                                                                petites surfaces. La création d'une méthode ajustée au
                                                                territoire était donc indispensable et se base sur le calcul
                                                                d'indicateurs. Son application a permis la réalisation de
                                                                fiches pratiques présentant les sites, leurs enjeux et des
                                                                préconisations de gestion précises.
 Photographie de : ©GRANDADAM Laura
 Epipactis palustris, espèce patrimoniale typique des milieux
 humides de la Petite Montagne

 18
Quels déterminants des patrons de végétation prairial en zone de marais ?
     Analyse de données in situ par un panel de variables environnementales

                                                        GRANGE Marie

Maître de stage : Madame BONIS Anne, GeoLab et Monsieur PAILLISSON Jean-Marc,
                                      EcoBio
           Tuteur AgroParisTech : Monsieur PIEDALLU Christian, UMR Silva

Mots-clefs : analyse de données, biodiversité, communautés végétales, Marais poitevin, prairie,
régime hydrique, sélection de variables, zone humide

Le Marais poitevin est la deuxième zone humide de France. Elle constitue une zone critique
pour la biodiversité et est également un territoire à forts enjeux agricoles de par la fertilité de ces
sols. La gestion de l’eau dans le marais constitue un thème primordial pour ces deux enjeux.

                                                            L’objectif de ce travail est d’identifier les effets
                                                            respectifs de la gestion du régime hydrique et des
                                                            autres conditions environnementales sur les patrons
                                                            de la végétation de marais de façon quantitative afin
                                                            de trouver des compromis entre activité agricole et
                                                            conservation de la biodiversité. Des données ont
                                                            été récoltées à cet effet par l'Établissement Public
                                                            du Marais Poitevin et l’UMR EcoBio depuis 2014.

                                                            La première partie du travail d’analyse porte sur les liens
                                                            entre variables environnementales mesurées et leur
                                                            stabilité. Plusieurs analyses ont ensuite été conduites
                                                            et combinées afin d’identifier les facteurs déterminants
                                                            la richesse et la composition des prairies humides.
 Photographie de : ©GRANGE Marie
 Prairie humide délimitée par des canaux bordés de frênes
 caractéristiques de la partie est du Marais poitevin

                                                                                                                 19
Analyse de l’évolution des mesures ERC Biodiversité et des coûts associés pour une
    LGV entre la phase de déclaration d’utilité publique et la mise en service

                                                           GUIBERT Quentin

                   Maître de stage : Monsieur LE GALLIC Yann, Setec International
                   Tuteur AgroParisTech : Monsieur DURAND Philippe, UMR Silva

                                            Rapport et soutenance confidentiels

Mots-clefs : biodiversité, ERC, ligne à grande vitesse, mesures compensatoires, monétisation

Dans le contexte actuel d’érosion de la biodiversité, la réglementation française impose des mesures
aux activités impactant les espèces protégées. La séquence « Éviter, Réduire, Compenser » est un pilier
de cette réglementation.
La construction d’une nouvelle ligne à grande vitesse induit la destruction d’espèces protégées, le
maître d’ouvrage a donc l’obligation d’appliquer ce triptyque « ERC ».
                                              Le stage a porté sur l’étude des mesures d’une ligne à
                                              grande vitesse, entre la phase de conception et la mise
                                              en service :
                                              •     Dans un premier temps, l’évolution des mesures
                                              ERC a été caractérisée. Une reconstitution des coûts de
                                              ces mesures a également été réalisée.
                                              •     Puis, les causes de ces évolutions ont été analysées
                                              avec l’étude de la réglementation et des méthodologies
                                              utilisées dans chaque dossier.
                                              •     Enfin, une comparaison avec des projets similaires
                                              a été effectuée pour exposer les points de vigilance et
                                              proposer des pistes d’amélioration.

 Photographie de : ©Setec
 Passage supérieur spécifique à la grande faune franchissant
 une ligne à grande vitesse. Ouvrage de réduction des impacts
 d’une infrastructure linéaire de transport sur la biodiversité

 20
Mise en relation de la cartographie de l’occupation du sol et des services
  écosystémiques liés à l’eau : cas du nitrate au sein du bassin versant de l’Orne

                                                          GUTHMANN Léo

Maître de stage : Monsieur DURAND Philippe, UMR Silva, Université de Lorraine, INRA,
                                    AgroParisTech
           Tuteur AgroParisTech : Monsieur GEGOUT Jean-Claude, UMR Silva

Mots clefs : bassin versant, modélisation, nitrate, occupation du sol, puits, services
écosystémiques, sources

Dans le cadre des activités de la Zone Atelier Moselle, le bassin de l’Orne (Grand Est) est sujet à de
nombreuses études scientifiques liées à l’eau. Avec l’UMR SILVA, nous cherchons à mettre en relation
les quantités de nitrate mesurées dans les cours d’eau avec les types d’occupation du sol.

                                                                Le projet a pour objectif de créer un modèle qui a deux
                                                                caractéristiques :
                                                                •     Il n’inclue que des paramètres facilement
                                                                accessibles permettant d’établir un premier diagnostic
                                                                de l’état chimique des cours d’eau à l’échelle d’un bassin
                                                                versant. Pour cette étude, la topographie, le tracé des
                                                                cours d’eau et l’occupation du sol sont pris en compte.
                                                                •    Il est capable d’identifier les types d’occupation
                                                                du sol qui correspondent à un puits ou une source de
                                                                pollution.

                                                                L’étude s’est appuyée sur les outils de SIG et de
                                                                statistiques pour tenter d’établir un modèle à
                                                                la fois pertinent écologiquement et significatif
                                                                mathématiquement.
 Photographie de : ©Léo Guthmann, 2018. Données : SANDRE,
 UMR SILVA
 Carte de l’occupation du sol sur le bassin versant de l’Orne
 avec les stations colorées en fonction des concentrations
 mesurées en nitrate

                                                                                                                    21
Station en environnement changeant
Test de transfert des nouvelles connaissances sur l’adéquation sol-plante en climat
                                    changeant

                                                     JOUSSEMET François

Maître de stage : Mesdames DELEUZE Christine et POUSSE Noémie, Office National des
                                       Forêts
            Tuteur AgroParisTech : Monsieur PIEDALLU Christian, UMR Silva

Mots clefs : aménagement forestier, catalogue de stations, changement climatique, déficit
hydrique, directives, gestion, sols

L’aménagement forestier est actuellement réalisé après une analyse des facteurs physique et
biologique du milieu et pose l’hypothèse d’un climat constant. Ce postulat est désormais remis en
cause et il semble nécessaire d’intégrer les effets du changement climatique dans l’aménagement afin
de garantir une gestion plus adaptée dans le temps. Dans ce contexte, le département RDI de l’ONF
                                                 cherche à étudier l’influence du déficit hydrique et de la
                                                 température sur la répartition des essences.

                                                               Un premier test de transfert des informations
                                                               scientifiques sur le changement climatique vers les
                                                               gestionnaires a été apprécié mais nécessite d’être
                                                               adapté à une échelle plus vaste qui correspond aux
                                                               catalogues de stations dans un objectif de révision
                                                               des préconisations en termes d’essences des directives
                                                               régionales et schémas régionaux d’aménagement.

                                                               Ce stage plutôt méthodique vise à tester différentes
                                                               hypothèses d’hétérogénéité spatiale des sols et de
                                                               répartition des stations forestières sur le développement
                                                               des outils de caractérisation des stations en climat
 Photographie de : ©POUSSE Noémie
 Fosse pédologique réalisée dans la forêt du Grand Jailly en   changeant.
 Bourgogne. L’étude du déficit hydrique commence par une
 prospection fine des sols

 22
Les Chiroptères de la forêt domaniale de Raismes-Saint Amand-Wallers (59) :
amélioration des connaissances en vue d’une gestion adaptée à leur conservation

                                                           LESOT Céline

Maître de stage : Monsieur DUTILLEUL Simon, Coordination Mammalogique du Nord de
                                      la France
          Tuteur AgroParisTech : Monsieur LEBOURGEOIS François, UMR Silva

Mots clefs : acoustique, activité, Chiroptères, gestion forestière, habitats, Natura 2000,
télémétrie

Durant ces vingt dernières années, la forêt de Raismes-Saint Amand-Wallers (dans le département du
Nord) n’a fait l’objet d’aucune étude chiroptérologique. La révision du Document d’Objectifs de la zone
Natura 2000 FR3100507, dont certains périmètres se trouvent au sein de la forêt en question, a permis
de réaliser un inventaire des Chiroptères sur le massif.

                                                             L’activité des chauves-souris a été analysée en fonction
                                                             de plusieurs variables du milieu, ce qui a mis en
                                                             évidence une utilisation variée et complexe des habitats
                                                             forestiers par ces dernières. En parallèle, trois espèces
                                                             appartenant à l’Annexe II de la Directive « Habitats-
                                                             Faune-Flore » (1992) ont été plus précisément étudiées
                                                             afin de connaître leurs gîtes et leur utilisation de la forêt.
                                                             Il s’agit de Myotis bechsteinii, Myotis emarginatus et
                                                             Myotis myotis. Des préconisations de gestion ont ensuite
                                                             été proposées afin de concilier production forestière et
                                                             conservation des populations de Chiroptères sur le site
                                                             étudié.

 Photographie de : ©DUTILLEUL Simon
 Murin à oreilles échancrées (Myotis emarginatus) en vol

                                                                                                                    23
Diagnostic environnemental du fleuve La Foa et de son principal influent la
                   Poquereux (La Foa, Nouvelle-Calédonie)

                                            LETONNELIER Stéphanie

                 Maître de stage : Monsieur WANEISI Etienne, DDR, Province Sud
                 Tuteur AgroParisTech : Monsieur DURAND Philippe, UMR Silva

Mots clefs : aménagement, diagnostic, fleuve, génie végétal, rivière

Le gouvernement de la Nouvelle-Calédonie montre, depuis quelques années déjà, une volonté de
mettre en place une politique de l’eau sur son territoire. Dans ce cadre, plusieurs fleuves et rivières
ont fait l’objet d’études ces dernières années, et des seuils ont été rénovés. Le village de La Foa a été
l’un des précurseurs en matière de politique de l’eau, ayant été la première commune à se doter d’un
conseil de l’eau.
                                                Ici, les objectifs sont à la fois de faire un état des
                                                lieux des deux cours d’eau actuels, afin de pouvoir le
                                                comparer avec un diagnostic futur pour pouvoir suivre
                                                leur évolution. De plus, aux vues des dégradations
                                                actuelles, des aménagements seront proposés, tels que
                                                des protections de berge, en essayant de promouvoir le
                                                génie végétal.

 Photographie de : ©LETONNELIER Stéphanie
 Zone amont de la Foa

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Identification des facteurs de sélection des sites de nidification chez la cigogne
                               noire, Ciconia nigra

                                                          MAGOT Charline

                  Maître de stage : Monsieur CHEVALLIER Damien, CNRS-IPHC
               Tuteur AgroParisTech : Monsieur LEBOURGEOIS François, UMR Silva

Mots-clefs : caractérisation, cigogne noire, conservation, gestion, macro-habitat, micro-habitat,
peuplement forestier, site de nidification

La cigogne noire est un échassier du paléarctique en danger d’extinction en France. La première
nidification sur le territoire en 1973 marque l’arrivée progressive d’une espèce essentiellement
forestière durant la reproduction. Dans ce contexte, l’oiseau fut sélectionné par l’Office National des
Forêts comme espèce indicatrice pour le bilan patrimonial des forêts domaniales. La cigogne noire
                                             bénéficie alors, dans le cadre de ce bilan, de mesures
                                             de conservation. En particulier, le site de nidification,
                                             comportant l’arbre porteur de nid, est pris en compte
                                             dans l’itinéraire forestier. Néanmoins, les sites de
                                             nidification de l’espèce sont encore peu étudiés.

                                                                Après avoir établi un protocole visant à caractériser
                                                                les sites de nidification en décrivant plusieurs échelles
                                                                d’habitat, l’identification de facteurs de sélection des
                                                                sites de nidification permettra de préciser l’échelle à
                                                                laquelle la sélection opère. Les résultats conduiront à
                                                                des propositions en termes de gestion forestière, et à
                                                                de meilleures prospections.

 Photographie de : ©MAGOT Charline
 Site de nidification de cigognes noires en milieu forestier.
 L'arbre porteur de nid est généralement imposant au sein du
 peuplement environnant. Juin 2018

                                                                                                                   25
Étude des flux d’eau et de sédiments vers les étangs du PNR de la Brenne grâce à la
                    mise en place de parcelles d’érosion in situ

                                                          MARION Baptiste

                       Maître de stage : Madame GRELLIER Séraphine, Citeres
                   Tuteur AgroParisTech : Monsieur PIEDALLU Christian, UMR Silva

Mots clefs : détachement, sol, ruissellement, micro parcelles, fonctionnement hydro
sédimentaire, pâturage

Durant ce stage de fin de Dominante d’Approfondissement : Gestion des Milieux Naturels, le
détachement du sol au niveau d’un pâturage a été étudié.

Pour cela, trois micro parcelles ont été mises en place, en amont d’une petite mare : en haut, en
                                             milieu et en bas de pente. Ces micro parcelles sont
                                             des cadres en acier enfoncés de 10 cm environ dans le
                                             sol et recouvrant 1 m² de surface. Elles permettent de
                                             recueillir les éventuelles eaux de ruissellement et les
                                             sédiments que ces eaux contiennent. Les volumes d’eau
                                             et les masses de sédiments sont ensuite quantifiés
                                             afin de mieux comprendre le fonctionnement hydro-
                                             sédimentaire du pâturage.

 Photographie de : ©MARION Baptiste
 Une des trois micro parcelles d’érosion mises en place

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Réalisation d’un catalogue de mesures compensatoires et d’accompagnement à
          destination de projets éoliens situés dans un contexte agricole

                                           QUÉNÉE Louis

             Maître de stage : Madame JOUNEAU Agathe, EDF Energies Nouvelles
               Tuteur AgroParisTech : Monsieur PIEDALLU Christian, UMR Silva

Mots clefs : agriculture, catalogue, éolien, photovoltaïque, séquence ERC

En 2023, la France devra produire 23% de son électricité de manière renouvelable pour répondre aux
exigences de l’Union européenne. La filière hydroélectrique ne pouvant pas produire beaucoup plus
qu’actuellement, c’est par le développement de l’éolien et du photovoltaïque qu’elle pourra y arriver.
Mais cela ne pourra se faire que dans le respect de la biodiversité, la réglementation étant très stricte
à cet égard.

                                               C’est dans ce cadre général qu’EDF EN m’a mandaté
                                               pour réaliser un catalogue de mesures compensatoires
                                               et d’accompagnement à destination des différentes
                                               équipes de développement éolien et photovoltaïque
                                               du nord de la France. En plus de ce travail, de nombreux
                                               travaux de sensibilisation environnementale ont été
                                               réalisés.

                                               A terme, l’objectif est d’avoir des projets ayant une
                                               balance environnementale positive, comme le souhaite
                                               le code de l’environnement.

 Photographie de : ©BOIRON Alexandra
 Éolienne dans un champs Picard

                                                                                                   27
Étude des corrélations entre la fonctionnalité du couvert forestier et la qualité et
                   disponibilité en eau en Nouvelle-Calédonie

                                          SCHAAN Mélanie

                         Maître de stage : Madame DOKHAC Emma , WWF
                      Tuteur AgroParisTech : Monsieur DURAND Philippe, Silva

Mots clefs : forêt, périmètres de protection des captages d’eau, protection de la ressource en
eau, services écosystémiques

En Nouvelle-Calédonie, les forêts de captages d’eau potable sont aujourd’hui menacées par
l’exploitation minière, les feux et les espèces exotiques envahissantes. Le WWF, en partenariat avec le
bureau d’études BLUECHAM, a développé un outil d’évaluation de la fonctionnalité du couvert forestier
par télédétection, notamment dans les périmètres de protection des captages, permettant une aide
                                                 à la décision pour les collectivités, dans un contexte de
                                                 construction d’une nouvelle politique de l’eau sur le
                                                 territoire.

                                                L’objectif du stage était d’étudier les corrélations entre
                                                le diagnostic et la réalité de terrain en termes de qualité
                                                de l’eau, par la sélection d’indicateurs pertinents de
                                                dysfonctionnement des captages, et proposer un
                                                chiffrage du service écosystémique rendu par les forêts
                                                pour la ressource en eau. Enfin, une réflexion sur un
                                                protocole plus adapté à cette étude, et sur la mise en
                                                place d’un observatoire de la ressource en eau a été
                                                menée.

 Photographie de : ©SCHAAN Mélanie
 Rivière de la Coulée

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