PROCEDURE MERS-COV (MIDDLE EAST RESPIRATORY SYNDROME CORONAVIRUS)
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PROCEDURE MERS-CoV (Middle East Respiratory Syndrome Coronavirus) Document de synthèse sur la conduite à tenir vis-à-vis des infections liées au nouveau Coronavirus (Mers-CoV) InVS – Cire Auvergne ARS Auvergne – CRVGS ARlin Auvergne Version 2 - 10/09/2013 Spaccaferri Guillaume - InVS Deleau Stéphane - ARS Olivier Baud - ARlin
Table des matières 1. Objectif de la surveillance ................................................................................................................ 3 2. Références ....................................................................................................................................... 3 3. Définition de cas (mise à jour le 19 juin 2013) ................................................................................. 3 3.1 Cas possible ............................................................................................................................ 3 3.2 Cas confirmé............................................................................................................................ 3 3.3 Liste des pays considérés comme à risque ............................................................................ 4 4. Prise en charge des cas suspects, possibles et confirmés .............................................................. 4 4.1 Prise en charge des « cas suspects » ..................................................................................... 4 a) Cas suspect pris en charge en médecine ambulatoire : ......................................................... 4 b) Cas suspect pris en charge en établissement de santé .......................................................... 4 4.2 Validation du « cas suspect » en « cas possible » .................................................................. 4 a) En heures et jours ouvrés ........................................................................................................ 4 b) En dehors des heures et jours ouvrés ..................................................................................... 5 4.3 Prise en charge des « cas possibles » .................................................................................... 5 4.4 Prise en charge des « cas confirmés » ................................................................................... 5 5. Suivi .................................................................................................................................................. 5 5.1 Suivi des cas possibles ou confirmés jusqu’à guérison, décès ou exclusion ......................... 5 5.2 Suivi des personnes « contacts étroits » d’un cas confirmé ................................................... 5 6. La réalisation des prélèvements ...................................................................................................... 6 6.1 Prélèvements respiratoires ...................................................................................................... 6 a) Moment des prélèvements dans l’évaluation de la maladie .................................................... 6 b) Nature des prélèvements ........................................................................................................ 6 c) Modalités de réalisation des prélèvements des voies respiratoires bases ............................. 7 6.2 Autres prélèvements ................................................................................................................ 7 6.3 Acheminements des prélèvements aux laboratoires du CNR ................................................. 7 7. Conduite à tenir devant un cas possible d’infection à Mers-CoV .................................................... 8 8. Conduite à tenir devant un cas confirmé d’infection à Mers-CoV .................................................. 10 9. Annexe ........................................................................................................................................... 12 9.1 Annexe 1 : Liste des CH ciblés comme pouvant accueillir des cas possibles ...................... 12 9.2 Annexe 2 : Courriel d’exclusion d’un cas .............................................................................. 12 9.3 Annexe 3 : Logigramme de prise en charge d’une suspicion d’infection à Mers-CoV .......... 13 PROCEDURE MERS-CoV (Middle East Respiratory Syndrome Coronavirus) p2
1. Objectif de la surveillance L’objectif de la surveillance en France est d’assurer la détection précoce des cas dues au nouveau coronavirus MERS-CoV (Middle East Respiratory Syndrome Coronavirus) pour : - une prise en charge thérapeutique rapide et adaptée du malade, - une confirmation virologique, avec caractérisation précise, permettant le suivi de l'évolution du virus, - l'alerte précoce des autorités sanitaires, - la recherche active des personnes ayant partagé la même exposition, - la recherche active de transmission interhumaine, - la prévention de la transmission autour d’un cas. L’Institut de veille sanitaire (InVS) est en charge de la surveillance épidémiologique et de la validation du classement des cas possibles d’une infection à des agents infectieux émergents en France. Dans ce cadre, il est en charge des liens avec les autorités nationales et internationales et s’appuie sur un réseau territorial constitué par les Cellules de l’InVS en région (Cire). Les Agences régionales de santé (ARS) sont chargées de la mise en œuvre des mesures de contrôle autour des cas. Cette mission est effectuée par la CRVGS (Cellule régionale de veille et de gestion sanitaire). Elles disposent pour cela de l’expertise de l’InVS au travers des Cires qui relayent au niveau régional les missions de l’InVS. 2. Références - Avis du Haut Conseil de la Santé Publique du 28 juin 2013 - Dossier Infection à nouveau coronavirus (MERS-CoV) - Site de l’Institut de Veille Sanitaire - Questionnaire MERS-CoV cas suspect/possible/confirmé et Questionnaire MERS-CoV sujet contact ou co-exposé (mise à jour le 5 août 2013) - Rappel des mesures pour la prévention d’une transmission interhumaine du coronavirus (MERS-CoV). Réseau national de prévention des infections associées aux soins. 3. Définition de cas (mise à jour le 19 juin 2013) 3.1 Cas possible Tout cas suspect répondant à la définition des cas ci-dessous : a) Toute personne ayant voyagé ou séjourné dans les pays listés ci-dessous, qui, au cours des 14 jours après son retour, a présenté : - des signes cliniques et/ou radiologiques de détresse respiratoire aiguë (SDRA) ou d’infection du parenchyme pulmonaire, avec une fièvre ≥38°C et de la toux, sans autre étiologie identifiée pouvant expliquer la pathologie - Pour les personnes immunodéprimées ou présentant une pathologie chronique, considérer également la survenue d’un syndrome fébrile avec diarrhée et/ou tableau clinique sévère. b) Tout contact (ex : famille, soignants) d’un cas possible ou confirmé, ayant présenté une infection respiratoire aiguë quelle que soit sa gravité, dans les 14 jours suivant le dernier contact avec le cas possible/confirmé pendant que ce dernier était malade (i.e. symptomatique). Pour les contacts immunodéprimés ou présentant une pathologie chronique, considérer également la survenue d’un syndrome fébrile avec diarrhée et/ou tableau clinique sévère. 3.2 Cas confirmé Cas possible avec prélèvements indiquant la présence du nouveau coronavirus Mers-CoV. PROCEDURE MERS-CoV (Middle East Respiratory Syndrome Coronavirus) p3
3.3 Liste des pays considérés comme à risque Conformément à la recommandation de l’ECDC, la définition de cas possibles devant être investigués inclut la liste des pays concernés par les cas confirmés, et pays limitrophes : Arabie Saoudite, Bahreïn, Emirats Arabes Unis, Irak, Iran, Israël, Jordanie, Koweït, Liban, Oman, Qatar, Syrie, Territoires palestiniens occupés, Yémen. Cette liste est susceptible d’évoluer : la liste des pays considérés comme à risque est disponible sur le site de l’InVS. 4. Prise en charge des cas suspects, possibles et confirmés 4.1 Prise en charge des « cas suspects » La conduite à tenir vis-à-vis d’un signalement de cas suspect d’infection à Mers-CoV différera selon le mode de prise en charge initiale du cas (ambulatoire ou établissement de santé) : a) Cas suspect pris en charge en médecine ambulatoire : Le médecin consulté par le patient considéré comme « cas suspect » contactera le Samu Centre 15 qui l’aidera pour le classement en « cas possible » en lien avec l’ARS et l’InVS. Le patient restera isolé et portera un masque chirurgical. Le patient, sauf en cas d’exclusion initiale, sera ensuite transporté dans un établissement de santé en capacité de recevoir des cas d’infections à Mers-CoV (Cf. liste régionale des CH ciblés en annexe 1). b) Cas suspect pris en charge en établissement de santé Si le patient est pris en charge dans un établissement de santé, il restera dans un box fermé jusqu’au classement en cas « possible » par l’ARS et l’InVS. Le signalement d’un cas suspect se fait au point focal de l’Agence Régionale de Santé (ARS) Tél : 04-73-74-48-80 Tout au long de cette prise en charge, le patient portera un masque chirurgical et les soignants un appareil de protection respiratoire (masque) de type FFP2 ou à défaut un masque chirurgical. Le patient et les soignants doivent se désinfecter les mains avec un SHA. 4.2 Validation du « cas suspect » en « cas possible » a) En heures et jours ouvrés - Les cas répondant à la définition de cas possible sont signalés par les cliniciens au point focal de l’ARS - La CRVGS réceptionne le signal et crée une fiche Orages - Le signalement (coordonnées du clinicien) est transmis à l’épidémiologiste de permanence à la Cire - La Cire recueille auprès du clinicien les informations nécessaires à la validation à partir du questionnaire « Cas suspect/possible/confirmé (Fiche 1) (Cf. §2)» - La Cire, en lien avec l’InVS St-Maurice, classe le cas et informe la CRVGS de la validation ou non en cas possible - La Cire informe le médecin signalant de la classification du cas : o si le cas est exclu, Cf. Courriel d’exclusion d’un cas (Cf. Annexe 2) - La Cire informe le niveau national de l’InVS - L’InVS informe la DGS et le CNR d’un cas possible - Les informations recueillies lors du signalement sont saisies par la Cire sur l’application informatique développée par l’InVS - L’ARS informe le CORRUSS via Sisac PROCEDURE MERS-CoV (Middle East Respiratory Syndrome Coronavirus) p4
b) En dehors des heures et jours ouvrés - Les cas répondant à la définition de cas possible sont signalés par les cliniciens à l’astreinte de l’ARS - La personne d’astreinte recueille les coordonnées du clinicien - Elle transmet à l’astreinte de l’InVS les coordonnées du clinicien par mail à alerte@invs.sante.fr et par téléphone au 0820 42 67 15 - L’astreinte InVS St-Maurice classe le cas, informe l’astreinte de l’ARS de la validation ou non en cas possible - Les informations recueillies lors du signalement sont saisies par la l’InVS sur l’application informatique développée par l’InVS 4.3 Prise en charge des « cas possibles » Sont présentées ici les principales étapes de la prise en charge des cas possibles. Celles-ci sont détaillées au §7. - Transfert, le cas échéant, vers un CH ciblé comme étant en capacité d’accueillir un cas d’infection à Mers-CoV (ARS/SAMU/Infectiologues référents) (Cf. annexe1) - Mise en place des mesures d’isolement et d’hygiène (Arlin/EOH). La CRVGS s’assure de la mise en place de ces mesures de précaution. - Organisation et acheminement des prélèvements (laboratoire de Virologie du CHU de Clermont-Ferrand (§6). La CRVGS s’assure que cet acheminement a bien été réalisé. - Evaluation de la pertinence d’initier la recherche des contacts hospitaliers et extrahospitaliers (ARS/InVS/ARLIN/EOH) 4.4 Prise en charge des « cas confirmés » Sont présentées ici les principales étapes de la prise en charge d’un cas confirmé. Celles-ci sont détaillées au §8. - La confirmation d’un cas possible est donnée par le laboratoire de Virologie du CHU au point focal de l’ARS. - Information de la Cire, - La Cire informe l’InVS qui transmet l’information à la DGS, ECDC, OMS. - Transfert du patient au CHU de Clermont-Ferrand (au vu des tableaux cliniques sévères rapportés dans la littérature, seul le CHU sera en mesure de prendre en charge un cas confirmé) - La Cire complète le questionnaire « Cas suspect/possible/confirmé (Fiche 1) » (Cf. §2). - Investigation des contacts hospitaliers et extrahospitaliers (InVS/Arlin/EOH/ARS) questionnaire « sujet contact ou d’un co-expose - fiche 2 » (Cf. §2). - Suivi du cas confirmés et des contacts étroits (Cf. §5) 5. Suivi 5.1 Suivi des cas possibles ou confirmés jusqu’à guérison, décès ou exclusion - Le suivi des cas possibles ou confirmés sera assuré par l’ARS (CRVGS) en lien avec la Cire jusqu’à guérison, décès ou exclusion. Appeler le clinicien deux fois par semaine. 5.2 Suivi des personnes « contacts étroits » d’un cas confirmé Les contacts étroits (particulièrement exposés aux contaminations par gouttelettes) sont définis comme : o personnes partageant ou ayant partagé le même lieu de vie que le cas index, par exemple : famille, même chambre d’hôpital ou d’internat ; PROCEDURE MERS-CoV (Middle East Respiratory Syndrome Coronavirus) p5
o contact direct, en face à face, à moins d’1 mètre du cas index au moment d’une toux, d’un éternuement ou lors d’une discussion ; flirt ; amis intimes ; voisins de classe ou de bureau ; voisins du cas index dans un avion ou un train - Le suivi s’étend 14 jours après le dernier contact non protégé avec le cas confirmé. La recherche de ces sujets est assurée par la CRVGS en lien avec la Cire. - Conseiller d’éviter de fréquenter des personnes de façon rapprochée ou prolongée (face à face) et éviter de rejoindre des rassemblements de personnes sur la période d’incubation. - Informer ces personnes que l’apparition de symptômes respiratoires ou de fièvre (prise de température 2 fois par jour) doit faire l’objet o d’une prise en charge médicale et d’un signalement à l’ARS o du port d’un masque chirurgical (préalablement donné par le médecin traitant), le lavage fréquent des mains avec une solution hydro-alcoolique, l’utilisation de mouchoirs à usage unique, la limitation au maximum des contacts avec les proches. - Informer le médecin traitant de cette personne et assurer le suivi du cas en lien avec le médecin traitant 2 fois par semaine. 6. La réalisation des prélèvements La réalisation des prélèvements est conditionnée par le classement du patient en cas possible par l’InVS et l’ARS. Il est rappelé que l’ensemble des échantillons biologiques (et pas seulement ceux destinés à être envoyés pour diagnostic virologique) des patients classés cas possible ou confirmé doivent être décontaminés et techniqués dans de bonnes conditions afin de limiter le risque de contamination des 1 professionnels de santé au sein des laboratoires . 6.1 Prélèvements respiratoires a) Moment des prélèvements dans l’évaluation de la maladie - Ils doivent être réalisés le plus tôt possible, pour permettre d’identifier le plus rapidement les cas confirmés et donc de mettre en place au plus vite les mesures afin d’éviter l’installation d’une chaine de transmission. - J0 étant défini comme le premier jour de l’apparition de la fièvre, des prélèvements réalisés avant J4 qui s’avèreraient négatifs pour le Mers-CoV doivent être répétés à partir de J4, soit au bout de 4 jours d’évolution des signes cliniques. b) Nature des prélèvements - Les prélèvements respiratoires doivent comprendre à la fois des prélèvements des voies respiratoires basses (qui ont démontré une meilleure sensibilité pour la recherche de Mers- 1 Les échantillons biologiques (selles, sanguins, respiratoires) des patients classés cas possible et confirmé, doivent être acheminés au(x) laboratoire(s) sous triple emballage, le contenant doit être décontaminés à l’aide d’un produit virucide tel que le Dakin avant d’être techniqués. Les échantillons biologiques de ces mêmes patients doivent être analysés si possible sur automates fonctionnant sur tubes primaires fermés. Pour les automates fonctionnant sur tubes primaires ouverts, l’ouverture des tubes se fera : - sous PSM de type II à proximité de la zone analytique le personnel ayant revêtu une sur-blouse à usage unique, une protection respiratoire de type FFP2, des gants et des lunettes de protection ; - sinon, à proximité immédiate de la zone analytique avec les mêmes protections pour le personnel. PROCEDURE MERS-CoV (Middle East Respiratory Syndrome Coronavirus) p6
CoV) et des prélèvements des voies respiratoires hautes dits « naso-pharyngés » (plus adaptés à la recherche des autres virus respiratoires. c) Modalités de réalisation des prélèvements des voies respiratoires bases - Adultes non intubés/non ventilés : effort de toux, expectoration provoquée ou aspiration trachéale - Enfants non intubés/non ventilés : aspiration naso-pharyngée immédiatement après une séance de kinésithérapie respiratoire (expectoration provoquée) - Patients intubés : Lavage broncho-alvéolaire effectué sous fibroscopie ou à défaut un autre prélèvement (prélèvement distal protégé, aspiration trachéale, mini-lavage alvéolaire dirigé par fibroscopie ou aveugle) 6.2 Autres prélèvements - Les prélèvements de selles : ils seront réalisés en cas de diarrhée - Les prélèvements sanguins : un prélèvement de sang sur tube sec accompagné si possible d’un prélèvement sur EDTA 6.3 Acheminements des prélèvements au laboratoire Dès le classement d’un patient en « cas possible », un contact doit être pris entre l’hôpital de prise en charge et le laboratoire de Virologie du CHU de Clermont-Ferrand afin de discuter des modalités d’envoi. Tous les échantillons biologiques doivent être acheminés sous triple emballage. L’acheminement se fera obligatoirement par un transporteur utilisant un conditionnement de catégorie B (norme UN 3373). La présente note détaille la liste des établissements de santé disposant d’un container triple emballage en annexe 1. Centre de Biologie - service de Virologie CHU site Gabriel Montpied 58, rue de Montalembert 63 003 CLERMONT-FERRAND cedex Tel : 04 73 754 850 Fax : 04 73 754 851 PROCEDURE MERS-CoV (Middle East Respiratory Syndrome Coronavirus) p7
7. Conduite à tenir devant un cas possible d’infection à Mers-CoV Laboratoire de Virologie InVS - CIRE ARS ARLIN - EOH InVS - niveau national du CHU Informe le clinicien Informe la direction de l’ARS Informe la DGS du signalant du classement en ou l’astreinte de direction du classement en cas possible. Information partenaires cas possible. classement en cas possible. Si astreinte : informe Informe l’ARS (CRVGS en également le clinicien et heure ouvrable et astreinte vérifie la mise en place des en dehors) et l’ARLIN du précautions particulières de classement en cas type « air » et « contact », possible. autour du cas possible. Organise le cas échéant Prise en charge du cas l’hospitalisation dans un CH ciblé, en lien avec SAMU et les infectiologues référents. possible Prévient l’EOH du CH d’accueil pour assurer la mise en œuvre immédiate des précautions particulières de type « air » et « contact En lien avec DMI-InVS, En lien avec CIRE-InVS, juge En lien avec CIRE-InVS, juge sujets contacts Investigation juge de la pertinence de de la pertinence de la de la pertinence de mettre en mettre en œuvre la recherche des sujets œuvre la recherche des recherche des sujets contacts hospitaliers sujets contacts contacts extrahospitaliers (personnels et patients), extrahospitaliers à ce stade. à ce stade. avec l’aide de l’EOH, à ce stade. PROCEDURE MERS-CoV (Middle East Respiratory Syndrome Coronavirus) p8
7. Conduite à tenir devant un cas possible d’infection à Mers-CoV Laboratoire de Virologie InVS - CIRE ARS ARLIN - EOH InVS - niveau national du CHU Transmet les résultats à S’assure auprès du biologiste Transmet les résultats à la Se met en lien avec les l’InVS que les prélèvements sont DGS et informe l’ECDC et biologistes du CH pour la Confirmation virologique envoyés (heure, conditions) au l’OMS si le cas est confirmé. réalisation et l’acheminement laboratoire du CNR. des prélèvements Retransmet ces informations à la Cire et à l’InVS. Transmet les résultats au Transmet les résultats à la Cire point focal de l’ARS PROCEDURE MERS-CoV (Middle East Respiratory Syndrome Coronavirus) p9
8. Conduite à tenir devant un cas confirmé d’infection à Mers-CoV InVS - CIRE ARS ARLIN - EOH InVS - niveau national Prise en charge du cas confirmé Organise le transfert du patient au CHU, en lien avec le SAMU et les infectiologues référents Met en place une astreinte dédiée Met en place une astreinte dédiée en Met en place une astreinte dédiée Active l’équipe dédiée en tant que de Organisation en tant que de besoin. tant que de besoin. en tant que de besoin. besoin. (outils et équipe) Met en place une main courante Met en place un espace collaboratif partagée ARS/Cire dans le cadre dédié au suivi avec accès limité. de la plateforme Investigation de l’ensemble des Apporte un appui à l’investigation des Investigation de l’ensemble des et organisation logistique Appui aux investigations selon la recommandations aux contacts extrahospitaliers identifiés contacts extrahospitaliers (cf. contacts hospitaliers identifiés (cf. situation. (cf. questionnaire sujet contact ou questionnaire sujet contact ou d’un co- questionnaire sujet contact ou d’un Investigation et sujets contacts d’un co-expose - fiche 2). expose - fiche 2). co-expose - fiche 2). Investigations et suivi des co-exposés si retour d’un voyage organisé. Informe les partenaires des Organise l’information des médecins Le suivi des contacts est à faire par résultats de l’investigation des traitants des contacts les EOH et/ou médecin du travail et contacts et transmet à l’ARS la liste transmettre à la Cire. Investigation et suivi des contacts et les coordonnées des contacts « transports » si nécessaire. pour la livraison de masques. PROCEDURE MERS-CoV (Middle East Respiratory Syndrome Coronavirus) p 10
8. Conduite à tenir devant un cas confirmé d’infection à Mers-CoV InVS - CIRE ARS ARLIN - EOH InVS - niveau national Coordonne le suivi des contacts Appui au suivi des contacts extra Coordonne le suivi des contacts Appui au suivi des contacts extra extra hospitaliers. hospitaliers si nécessaire. hospitaliers et transmets les hospitaliers si nécessaire. Suivi des sujets résultats à la Cire. Transmet à l’InVS - National les contacts coordonnées des contacts pour Transmet à la DGS les coordonnées lesquels un arrêt de travail peut des contacts pour lesquels un arrêt de poser des problèmes avec travail peut poser des problèmes avec l’employeur. l’employeur et assure le suivi en lien Transmet les résultats du suivi aux avec la Cire. partenaires. A l’issue du suivi, diffusion d’un épidémiologique Issue du suivi point épidémiologique spécial permettant d’informer l’ensemble des partenaires régionaux. PROCEDURE MERS-CoV (Middle East Respiratory Syndrome Coronavirus) p 11
9. Annexe 9.1 Annexe 1 : Liste des CH ciblés comme pouvant accueillir des cas possibles Cette liste a été établie selon 2 critères : - La possibilité de mettre en place des mesures d’hygiène complémentaires permettant la prise en charge d’un cas possible - La disponibilité dans la structure, des emballages permettant le transport des échantillons biologiques (triple emballage) Cette liste est susceptible d’évoluer, notamment si un CH décide d’acquérir les emballages permettant le transport des prélèvements biologiques. Centres hospitaliers en capacité d’accueillir un cas possible de Mers-CoV Allier Cantal Haute-Loire Puy-de-Dôme - CH de Montluçon - CH de Mauriac - CH de Brioude - CH de Riom - CH de Vichy - CH de Saint-Flour - CH du Puy-en-Velay (à - CHU de Clermont- confirmer) Ferrand - CH de Moulins-Yzeure* - CH d’Aurillac * Commande de triples emballages en cours 9.2 Annexe 2 : Courriel d’exclusion d’un cas « Cher collègue, Suite à votre appel du XX/XX/XXXX concernant une suspicion d’infection à nouveau Coronavirus, je vous confirme que le cas a été exclu des cas possibles pour les raisons suivantes : Pas de retour des pays ou zones listés dans la définition de cas* Pas d’infection respiratoire sévère Début des signes au-delà des 14 jours après l’exposition Contact avec un cas humain confirmé ou fortement suspecté non retenu Lien épidémiologique avec d’autres cas sévères d’infections respiratoires aigues non retenu Autres éléments : Les critères de la définition d’un cas possible ne sont pas remplis. La demande d’une recherche de virus sur un prélèvement nasopharyngé ne se justifie pas. Les autorités sanitaires n’ont pas besoin d’être avisées. Veuillez agréer, cher collègue, l'expression de mes sentiments distingués. PS : La définition de cas possible est consultable sur le site internet de l’InVS » PROCEDURE MERS-CoV (Middle East Respiratory Syndrome Coronavirus) p 12
9.3 Annexe 3 : Logigramme de prise en charge d’une suspicion d’infection à Mers-CoV Médecine Etablissement de ambulatoire santé Signalement d'un cas suspect à l'ARS Transf ert dans un CH ciblé * Cas Non Cas exclu possible ? Oui Transf ert dans un CH ciblé ** Prélèvement biologiques Envoi au laboratoire du CHU Résultats Cas Non Cas exclu conf irmé ? Oui Transf ert du cas au CHU * Transfert vers un CH ciblé si le cas suspect est pris en charge en médecine ambulatoire ** Transfert vers un CH ciblé si le cas possible est pris en charge par un établissement de santé non listé dans les CH ciblés pour la prise encharge d'infection à Mers-CoV PROCEDURE MERS-CoV (Middle East Respiratory Syndrome Coronavirus) p 13
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