UN NOUVEAU CORONAVIRUS HUMAIN SARS-COV-2 EST LÀ POUR RESTER. COMMENT ALLONS-NOUS Y FAIRE FACE? - GUIDO VANHAM, MD, PHD - ICPCOVID
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Un nouveau coronavirus humain SARS-CoV-2 est là pour rester.
Comment allons-nous y faire face?
Guido Vanham, MD, PhD
Université d’ Anvers
Institut De Médecine Tropicale
4 Mars 2021
gvanham@ext.itg.be
6/03/2021 1
Mars 2020 Hôpitaux Italiens boulversés de patients COVID 6/03/2021 2
Mortalité élevée en avril 2020
Bergamo New York City
Italie
Manaus Japan
Brézil
6/03/2021 3
6/03/2021 4
6/03/2021 5
DEFINITIONS VIRUS = SARS-CoV-2 = Severe Acute Respiratory Syndrome - Corona Virus- type 2 (Corona Virus type 2 du Syndrome d’Insuffisance Respiratoire Aigue) MALADIE = COVID-19 = Corona Virus Disease - 2019 → Ces termes sont utilisés de manière interchangeable 6/03/2021 6
SARS-CoV-2 et COVID-19
1) Virologie
2) Présentation clinique
3) Diagnostique
4) Transmission et prévention
5) Vaccination
6/03/2021 7
Les Coronavirus ont été decouverts par une scientifique féminine En 1960 Dr. June Almeida (1930-2007) observe un coronavirus par microscopie électronique 6/03/2021 8
Infections émergentes à coronavirus humain depuis les années 60
Les 4 premiers coronavirus causent des infections bénignes des voies respiratoires supérieures (nez-gorge), mais
rarement aussi des pneumonies, surtout chez les veillards
Les 3 virus derniers causent SARS = syndrome de détresse respiratoire aiguë sévère
6/03/2021 9
Ref 2 Loeffelholz and Tang Emerging Microbes and Infections March 2020
L'origine des coronavirus humains de type SARS
Bat = chouve souris
Civet = civette
Raccoon = raton laveur
Camel = chameau
6/03/2021 10La transmission zoonotique (inverse) du SARS-CoV-2
Bat = chouve souris
Ferret = furet
Monkey = singe
Mink = vison
Dog = chien
Chicken = poulet
Duck = canard
Pig = Cochon
6/03/2021 116/03/2021 12
La protéine “Spike” de SARS-CoV-2 se lie au récepteur cellulaire “ACE2” et peut être bloquée par des anticorps
Anticorps “neutralisants”
AA
Clé et serrure
Des anticorps neutralisants “faibles” sont induits par l’infection
Des anticorps neutralisants plus forts sont induits par la vaccination
6/03/2021 13Le virus se multiplie dans les cellules des poumons
L’inflammation pulmonaire (pneumonie) provoque des troubles de respiration
→ l’oxygène n’est pas suffisamment absorbé dans le sang
→ la personne est « essoufflée »
6/03/2021 146/03/2021 15
SARS-CoV-2 et COVID-19
1) Virologie
2) Présentation clinique
3) Diagnostique
4) Transmission et prévention
5) Vaccination
6/03/2021 16Évolution de la maladie du SRAS-CoV-2 / COVID-19
• Trois étapes: symptômes légers, pneumonie grave, soins intensifs
• Beaucoup de cas asymptomatiques, qui peuvent quand-même transmettre l'infection.
• La récupération peut être lente, même après une maladie bénigne
6/03/2021 17
https://www.researchgate.net/figure/Clinical-course-of-SARS-CoV-2-infection_fig3_341918470Symptoms of COVID-19 6/03/2021 18
Symptômes du COVID-19
POUMONS
Le patient tousse, la fièvre augmente et la respiration devient difficile
→ l'oxygène du sang peut diminuer.
CARDIOVASCULAIRE
- Thrombose
- Attaque cardiaque .
- Hypotension et choc
Le CERVEAU:
Certains patients ont des accidents vasculaires cérébraux,
des convulsions, de la confusion et une inflammation du
cerveau:
6/03/2021 19Symptômes du COVID-19
Le NEZ: COVID peut se présenter come un rhume « banal »
Perte du sens du goût et de l'odorat = plutôt typique
et peut persister, même chez des jeunes
Les YEUX
Conjunctivite = chez les patients très malades
Gastro-intestinal
La diarrhée peut être associée au troubles respiratoire
Ou être le seul symptôme
Insuffisance rénale et/ou hépatique = chez les patients très malades
6/03/2021 20Facteurs de risque préexistants pour développer un COVID grave
« Co-morbidités »
1. Âge (> 60) et sexe (homme> femme)
2. Métabolisme: diabète, obésité, troubles graisseux
3. Hypertension artérielle, maladie cardiovasculaire
4. Maladie pulmonaire chronique, tabagisme
5. Insuffisance rénale et / ou hépatite chronique
6. Cancer
7. Grossesse
8. Autres formes d'immunité supprimée: - VIH non traité ou mal traité;
- traitement avec des médicaments immunosuppresseurs
Pourtant, un (petit) nombre de «jeunes en bonne santé» sont morts du COVID-19!
→ ils ont des problèmes génétiques avec l’ «interféron de type 1» = protéine antivirale
6/03/2021 21Distribution selon l’âge et le sexe des patients hospitalisés Co-morbidités chez les pts hospitalisés belges
En comparaison avec la population générale belge
Hypertension
Maladie cardiovasculaires
Diabète
Maladie pulmonaires
Maladie rénale
Troubles cognitifs
Obésité
Cancer solide
Trouble neurologique
Maladie hépatique
Leucémie
Immunodépression
6/03/2021 22
SciensanoSARS-CoV-2 et COVID-19
1) Virologie
2) Présentation clinique
3) Diagnostique
4) Transmission et prévention
5) Vaccination
6/03/2021 23Revue des méthodes diagnostiques
Diagnostique moléculaire Test rapide Test “sérologique”
Détection de SARS-CoV-2 RNA SARS-CoV-2 protéine SARS-CoV-2 anticorps
= génome du virus (produit par notre système immunitaire)
Technique Reverse-transcriptase PCR ELISA ELISA, neutralisation
Substrat 1) Echantillon respiratoire: par le nez ou la bouche Sang
2) Echantillon de matières fécales
Virus présent: (preuve de viabilité par culture) Ac seulement présent à la fin et
6/03/2021
après la présence du virus 24Echantillonage
Naso-pharyngéal Oro-pharyngéal
6/03/2021 25RNA viral dans les matières fécales peut rester positive après négativité de l’ RNA viral respiratoire
Il n’y a pas de preuve de transmission féco-orale !
(mais il vaut mieux d’être prudent et de veiller sur votre hygiène de toilette)
6/03/2021 26
Ref 19 Yongjian Wu Lancet Gastroenterol Hepatol March 19, 2020Revue des méthodes diagnostiques
Diagnostique moléculaire Test rapide Test “sérologique”
Détection de SARS-CoV-2 RNA SARS-CoV-2 protéine SARS-CoV-2 anticorps
= génome du virus (produit par notre système immunitaire)
Technique Reverse-transcriptase PCR ELISA ELISA, neutralisation
Substrat 1) Echantillon respiratoire: par le nez ou la bouche Sang
2) Echantillon de matières fécales
Virus présent: (preuve de viabilité par culture) Ac seulement présent à la fin et
6/03/2021
après la présence du virus 27Test de l’antigène (protéine virale) rapide
Lecteur
automatique
Avantage: très rapide (< 30 minutes) et spécifique (peu de faux positives)
Désavantage: moins sensible que PCR: on rate les échantillons à faible charge virale (= faux négatif)
→ faible charge virale = moins de chance de transmission et de maladie grave
6/03/2021 28Revue des méthodes diagnostiques
Diagnostique moléculaire Test rapide Test “sérologique”
Détection de SARS-CoV-2 RNA SARS-CoV-2 protéine SARS-CoV-2 anticorps
= génome du virus (produit par notre système immunitaire)
Technique Reverse-transcriptase PCR ELISA ELISA, neutralisation
Substrat 1) Echantillon respiratoire: par le nez ou la bouche Sang
2) Echantillon de matières fécales
Virus présent: (preuve de viabilité par culture) Ac seulement présent à la fin et
6/03/2021
après la présence du virus 29Test rapide des anticorps
Signification:
- Preuve que la personne a été en contact avec le virus
- Le virus peut toujours être là ou avoir été éliminé
- La personne sera moins sensible a être réinfectée, mais
ces anticorps ne garantissent pas une immunité absolue
6/03/2021 30
Ref 22 Zhengtu Li J Med Virol Feb 2020 DOI: 10.1002/jmv.25727Résumé sur les tests diagnostiques
1) Test PCR (RNA) sur échantillon naso-pharyngéale = standard d’or pour le diagnostic individuel
2) Test rapide (antigène) aussi sur échantillon naso-pharyngéale
- Très utile pour screening des écoles et autres collectivités
- Peut être faussement négatif
- Evolution vers un test sur salive
3) Test sérologique (anticorps) sur le sang :
- Surtout utile pour des études « épidémiologiques »: savoir combien de personnes dans une population
ont été en contact avec le virus
- Ne prouve pas l’immunité protectrice sur le plan individuel
6/03/2021 31SARS-CoV-2 and COVID-19
1) Virologie
2) Présentation clinique
3) Diagnostique
4) Transmission et prévention
5) Vaccination
6/03/2021 326/03/2021 33
Importance primordiale de la transmission par (micro)-gouttelettess Transmission par gouttelettes plus grosses : - Dépôt proche de la personne « source » - Restent dans le nez + la gorge de la personne nouvellement infectée Transmission par aérosol = les microgouttelettes - Se diffusent plusieurs mètres à l'intérieur. - Pénètrent profondément dans les poumons chez la personne nouvellement infectée 6/03/2021 34
Prévenir ou bloquer la transmission par gouttelettes Ventilation avec de l’air fraîche Masquage universel 6/03/2021 35
Fifty ways to srew up your mask wearing = Cinquante façons de bousiller votre masque
Le masque doit s'ajuster complètement contre votre visage !Fifty ways
to screw up
masks wearing
6/03/2021 37Règles de base pour éviter le COVID:
Principe: limitez les contacts avec personne ou surface potentiellement infectés
1) Portez un masque facial correctement
ET Tenez-vous à 1,5 mètre des autres.
en présence de toute personne qui n’appartient pas à votre ménage,
y compris vos amis, collègues et membres de la famille étendue .
2) Lavez-vous les mains régulièrement.
Attention à l’hygiène de toilette
3) Limitez-vous à 1 contact câlin
Travaillez à la maison si possible
4) Faites vos activités de préférence à l'extérieur
Aérez les espaces intérieurs avec de l'air frais
5) Quarantaine obligatoire après voyage à l’étranger ou contact avec une personne « PCR positive »
Isolation obligatoire si vous êtes infectée vous-même
6/03/2021 6) Pensez aux personnes vulnérables: supportez et aidez-les 38Il faut combiner les différent mesures pour bloquer la transmission à 100%
SARS-CoV-2 and COVID-19
1) Virologie
2) Présentation clinique
3) Diagnostique
4) Transmission et prévention
5) Vaccination
6/03/2021 40Plates-formes pour le développement d'un vaccin contre le SARS-CoV-2
Virus inactivé = vaccin classique
2 compagnies chinoises (Sinovac et Sinopharm):
- Efficacité non prouvée dans des études publiées.
- Selon des communiqués de presse entre 50-80 %
Protéine “spike” isolée
Novavax
Selon un communiqué de presse: efficacité de
60 % en Afrique du Sud et 90 % au Royaume-Uni
6/03/2021 41
Ref 50 Florian Krammer Nature 23 Sept 2020Plates-formes pour le développement d'un vaccin contre le SARS-CoV-2
Vaccins RNA (ou ARN messager) Spike
Pfizer-BioNtech et Moderna
Efficacité dans études cliniques de > 90 %
Vaccins vecteurs viral Adenovirus + Spike
Astra-Zeneca, Sputnik V et Janssen
Efficacité dans études cliniques:
- En Europe, USA, Russie 80 – 90 %
- En Afrique du Sud 50-60 %
6/03/2021 42
Ref 50 Florian Krammer Nature 23 Sept 2020Remarques concernant les vaccins COVID
- Les vaccins actuels ont été jugés surtout pour leur efficacité contre la maladie COVID, hospitalisations et décès.
- Ils diminuent aussi le risque d’infection SARS-CoV-2, mais certainement pas à 100 %.
- La charge virale d’une personne vaccinée et quand même infectée est moindre, et par conséquent le risque de
maladie et de transmission.
- Des études pour déterminer leurs efficacité anti-infectieux précises sont en cours.
- Tous les vaccins actuels sont basés sur la souche « Wuhan ».
- Ils sont également actifs contre la variante Britannique
- Ils sont moins actifs contre les variantes sud-africaine et brésilienne
→ La distribution géographique explique la différente efficacité de certains vaccins Adeno selon le pays
→ Néanmoins les vaccins actuels sont toujours utiles pour prévenir la mortalité par ces variantes (Anzegem)
- Pour relâcher les mesures de prévention, il faut protéger la population très sensible (âgée et/ou avec co-morbidité)
= 25 % de la population belge
6/03/2021 43Vous pouvez aussi lire
