2020 RAPPORT 2019 - Unis pour la santé mondiale - Institut Pasteur
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SOMMAIRE PASTEUR NETWORK CHIFFRES CLÉS 2019-2020 01 Chiffres clés 2019-2020 02 Dernières évolutions du Pasteur Network 04 Carte des 33 membres 06 Expertises techniques nationales et internationales 08 Missions et valeurs 33 membres, 09 Entretien avec Stewart Cole et Pierre-Marie Girard dans 25 pays, 10 Une stratégie scientifique commune 11 Un réseau de santé publique 12 Le Réseau International des Instituts localisés sur les 5 continents Pasteur devient Pasteur Network 13 Gouvernance 17 4 14 Quelques faits marquants 2019-2020 18 Quelques rendez-vous pour préparer l’avenir — centres collaborateurs membres nommés « Laboratoire de l’OMS de référence pour la Covid-19 » par l’OMS 9 nouveaux projets collaboratifs 34 projets ACIP & PTR dont 12 ACIP et 22 PTR* 33 16 projets en cours en 2019 et 21 en 2020 impliquant plusieurs membres du Pasteur Network projets avec la Task Force Covid-19* 19 39 49 110 bénéficiaires d’une bourse internationale* 18 MOBILISER PARTAGER INNOVER cours internationaux financés** 20 Chiffres clés 40 Projets de renforcement 50 D es outils technologiques 21 SARS-CoV-2, récit d’une mobilisation solidaire 24 Une réponse internationale de capacités 42 Formation et mobilité 43 Chiffres clés innovants 52 ACIP & PTR, des appels à projets incitatifs 5 groupes de recherche 3 soutenue par l’Institut Pasteur 44 Les cours internationaux 54 Les PIU, une recherche unités de recherche à quatre ans en cours* 26 Amériques 45 Le label PIC collaborative à l’international internationales créées* 28 Euro-Méditerranée 46 Les groupes de recherche 5 377 30 Afrique à quatre ans ou G4 1 193 32 Asie-Pacifique 48 Prix « Pasteur Network Talent Awards » 34 Quelques faits marquants 48 Cérémonie des doctorants 56 P artenaires et remerciements Covid-19 en 2020 — publications scientifiques signées — chaque année en moyenne par 38 Zoom sur les projets articles scientifiques déposés et DOPAHYPOCOV les membres du Pasteur Network, en ligne sur la plateforme HAL-RIIP indépendamment ou en collaboration. autorisant le dépôt et la consultation et AFROSCREEN 2019: 5 054 *** – 2020: 5 700 **** de travaux scientifiques gratuits — * Actions concertées inter-pasteuriennes (ACIP) – projets transversaux de recherche (PTR) – programmes coordonnés et/ou financés par l’Institut Pasteur. ** Par l’association Pasteur Network. *** Publications issues de la base Scopus, dont 1 651 impliquant la Fiocruz et 1 218 l’Institut Pasteur (Paris). **** Dont 2 024 impliquant la Fiocruz et 1 260 l’Institut Pasteur (Paris). Pasteur Network – Rapport 2019-2020 01
DERNIÈRES ÉVOLUTIONS DU PASTEUR NETWORK Depuis plus de 130 ans, le Réseau International des Instituts Pasteur, nouvellement renommé en faisant de l’éducation une priorité. « Pasteur Network », œuvre au bénéfice de la santé des populations. Né de la volonté Un comité de coordination a par la suite de Louis Pasteur de mettre le fruit de ses découvertes vaccinales et microbiologiques été créé afin de proposer un plan d’action et une stratégie scientifique, à la libre disposition de la communauté médicale internationale, le réseau est implanté tous deux approuvés fin août 2016. aujourd’hui dans 25 pays et sur les cinq continents. C’est le 4 juillet 2019 qu’est inaugurée la Plateforme scientifique en tant que membre associé à Pasteur Network, faisant d’elle le trente-troisième membre. C’est le 14 novembre 1888, grâce au succès principalement, mais pas uniquement, Depuis 2019, Pasteur Network Située au sein de l’Université de d’une souscription internationale, que dans les pays de l’ancien Empire colonial regroupe 33 membres avec l’intégration, São Paulo, cette Plateforme scientifique l’Institut Pasteur est inauguré, 17 mois français. Il s’y établit au plus proche en qualité de membre associé au sein de 1 700 m2 est dédiée aux 17 laboratoires après sa fondation par décret. Dès 1889, des foyers infectieux endémiques ou de l’association, de la Plateforme et sept équipes qui la composent. forte de la renommée de son fondateur, épidémiques et directement au contact scientifique Pasteur – Université l’institution voit affluer des élèves venant des populations. Plusieurs Prix Nobel de São Paulo (USP) au Brésil. L’histoire de la construction du Pasteur de divers pays d’Europe, et d’au-delà, afin viendront alors récompenser les travaux Aujourd’hui, Pasteur Network s’inscrit Network continue de s’écrire avec d’y suivre le premier cours de microbiologie de scientifiques du réseau. Par exemple, davantage dans une logique l’ouverture d’un nouvel institut à Conakry, jamais dispensé dans le monde. Alphonse Laveran le reçoit en 1907 d’approfondissement des relations et l’Institut Pasteur de Guinée. Localisé pour son travail sur le paludisme depuis collaborations entre ses membres plutôt à côté de l’université Gamal Abdel Par la suite, l’Institut Pasteur concrétise très l’Institut Pasteur d’Algérie. Jules Bordet est que dans une logique d’élargissement. Nasser, le bâtiment abritera trois unités vite sa volonté de diffuser hors de récompensé en 1919 et Charles Nicolle de recherche, un insectarium, une ses murs les progrès de la microbiologie. en 1928, respectivement pour ses travaux Pasteur Network a célébré, en 2019, biobanque ainsi qu’une plateforme CÉLÉBRATIONS Le premier institut hors métropole est fondé sur l’immunité au sein de l’ancien Institut l’entrée de la Plateforme scientifique de diagnostic et plusieurs laboratoires. • 15 ans de l’Institut Pasteur de Corée (2019) par Albert Calmette à Saïgon, en 1891, avec Pasteur du Brabant (Belgique) et pour Pasteur – USP en tant que membre Lancé en construction en août 2019, pour objectif d’étendre la vaccination contre ses découvertes sur le typhus à l’Institut associé. Fidèle à sa volonté de se le site a accueilli sa première équipe • 100 ans de l’Institut Pasteur Hellénique (2019) la rage et la variole en Indochine. C’est le Pasteur de Tunis. rapprocher des populations pour dès septembre 2020, dans l’attente • 60 ans du Centre Pasteur du Cameroun (2019) même Albert Calmette qui créera quelques mieux faire face aux épidémies, de conditions sanitaires meilleures années plus tard, en 1899, l’Institut Pasteur Dans les années 60, Pasteur Network il se prépare également à inaugurer pour son inauguration officielle. • 20 ans du Pôle de Recherche Université de Lille, afin de lutter contre les épidémies regroupait déjà une vingtaine de l’Institut Pasteur de Guinée. de Hong Kong – Pasteur (2020) de diphtérie. C’est également là qu’il mit au membres, mais c’est dans les années 70 • 100 ans de l’Institut Pasteur d’Iran (2020) point le bacille de Calmette et Guérin (BCG), que celui-ci franchit un cap décisif sous Juin 2015 a vu la signature d’un accord premier vaccin contre la tuberculose. l’impulsion de Jacques Monod avec tripartite liant l’Université de São Paulo, Plus d’informations sur la la création du Conseil des directeurs. la Fondation Oswaldo Cruz et l’Institut Plateforme scientifique Pasteur Pasteur Network s’étend ensuite D’autres événements jalonnent Pasteur (Paris) avec la volonté ferme – Université de São Paulo (USP) : progressivement et de façon régulière ensuite le développement du réseau de partager connaissances scientifiques sppu.com.br/en/ (voir frise) hors métropole et (voir encadré page 12). et ressources technologiques tout Chronologie de l’établissement des membres du Pasteur Network avec leurs noms actuels. 1938 2004 1900 1925 1947 1964 Institut Pasteur 1893 1895 1919 1924 INRS- 1953 1959 2004 de Shanghai – 1888 Fondation Institut Pasteur Institut National Centre Institut de Institut Pasteur 1978 Académie 2015 Institut Pasteur Institut Pasteur Oswaldo Cruz Institut Pasteur d’Hygiène et Armand-Frappier Microbiologie Institut Pasteur Centre Pasteur d’Italie – Fondation CERMES Institut Pasteur chinoise des Institut Pasteur Institut Pasteur de Dakar Santé Biotechnologie du Cambodge de Tunis de Nha Trang (Fiocruz, Brésil) Hellénique d’Épidémiologie Stephan Angeloff du Cameroun Cenci Bolognetti (Niger) de Corée Sciences de Guinée (France) (Sénégal) (Canada) (Vietnam) (Vietnam) (Bulgarie) (Chine) 1891 1894 1898 1900 1920 1929 1940 1948 1955 1961 1972 2000 2004 2007 2019 Institut Pasteur Institut Pasteur Institut Pasteur Sciensano 1908 Institut Pasteur Institut Pasteur Institut Pasteur Institut Pasteur Institut Pasteur Institut Pasteur Institut Pasteur Pôle Institut Pasteur Institut Pasteur Plateforme d’Hô Chi Minh-Ville d’Algérie de Madagascar (Belgique) d’Iran du Maroc de la Guyane de la Guadeloupe de Nouvelle- de Bangui de Côte d’Ivoire de Recherche de Montevideo du Laos scientifique (Vietnam) Institut Pasteur (France) (France) Calédonie (République Université (Uruguay) Pasteur – Institut Pasteur de Saint- (France) centrafricaine) de Hong Kong – USP de Lille Pétersbourg Pasteur (France) (Russie) (Chine) Afrique Amériques Asie-Pacifique Euro-Méditerranée 02 Pasteur Network – Rapport 2019-2020 Pasteur Network – Rapport 2019-2020 03
PASTEUR NETWORK SAINT-PÉTERSBOURG Pasteur Network est un réseau mondial de 33 membres, unis LILLE par des missions et des valeurs BRUXELLES pasteuriennes communes, PARIS ROME SOFIA LAVAL qui contribuent à l’amélioration de la santé humaine. TÉHÉRAN SÉOUL ALGER TUNIS ATHÈNES SHANGHAI CASABLANCA HANOÏ HONG KONG VIENTIANE POINTE-À-PITRE DAKAR NHA TRANG NIAMEY PHNOM PENH CONAKRY HÔ CHI MINH-VILLE CAYENNE BANGUI ABIDJAN YAOUNDÉ RIO DE JANEIRO ANTANANARIVO SÃO PAULO NOUMÉA MONTEVIDEO Amériques Euro-Méditerranée Afrique Asie-Pacifique BRÉSIL ALGÉRIE ITALIE CAMEROUN NIGER CAMBODGE IRAN iocruz F Institut Pasteur d’Algérie Institut Pasteur d’Italie – Centre Pasteur CERMES Institut Pasteur du Cambodge Institut Pasteur d’Iran portal.fiocruz.br/en pasteur.dz Fondation Cenci Bolognetti du Cameroun cermes.net pasteur-kh.org en.pasteur.ac.ir Plateforme scientifique Pasteur – istitutopasteuritalia.it pasteur-yaounde.org Université de São Paulo (USP) * BELGIQUE RÉPUBLIQUE CHINE LAOS sppu.com.br/en/ MAROC CÔTE D’IVOIRE CENTRAFRICAINE Institut Pasteur de Shanghai – Institut Pasteur du Laos Sciensano sciensano.be Institut Pasteur du Maroc Institut Pasteur Institut Pasteur Académie chinoise des Sciences pasteur.la CANADA pasteur.ma de Côte d’Ivoire de Bangui english.shanghaipasteur.cas.cn/ INRS-Centre Armand Frappier BULGARIE pasteur.ci pasteur-bangui.org Pôle de Recherche Université VIETNAM Santé Biotechnologie RUSSIE de Hong Kong – Pasteur Institut National Institut de Microbiologie GUINÉE SÉNÉGAL inrs.ca/centreAFSB Institut Pasteur www.hkupasteur.hku.hk/ d’Hygiène et Stephan Angeloff microbio.bas.bg/wordpress/ de Saint-Pétersbourg Institut Pasteur Institut Pasteur d’Épidémiologie FRANCE pasteurorg.ru de Guinée de Dakar CORÉE DU SUD (Hanoï) index.php/en/ Institut Pasteur de la Guadeloupe www.pasteur-guinee.org pasteur.sn Institut Pasteur de Corée nihe.org.vn/en web.pasteur-guadeloupe.fr FRANCE TUNISIE ip-korea.org Institut Pasteur Institut Pasteur de la Guyane Institut Pasteur de Tunis MADAGASCAR de Nha Trang Institut Pasteur (Paris) pasteur-nhatrang.org.vn/en pasteur-cayenne.fr pasteur.tn Institut Pasteur FRANCE pasteur.fr Institut Pasteur Institut Pasteur de Lille de Madagascar Institut Pasteur URUGUAY pasteur.mg de Nouvelle-Calédonie d’Hô Chi Minh-Ville pasteur-lille.fr pasteurhcm.gov.vn Institut Pasteur de Montevideo institutpasteur.nc pasteur.uy/en GRÈCE Institut Pasteur Hellénique pasteur.gr/en * Membre associé. 04 Pasteur Network – Rapport 2019-2020 Pasteur Network – Rapport 2019-2020 05
EXPERTISES TECHNIQUES NATIONALES ET INTERNATIONALES Pasteur Network abrite un grand nombre de laboratoires nationaux, régionaux et internationaux de référence pour la santé humaine. Les laboratoires de référence nationaux Les « centres collaborateurs et régionaux sont reconnus par les de l’OMS, ou CCOMS » sont, ministères nationaux de la Santé pour d’après l’OMS, des organismes leur compétence en matière de diagnostic. de recherche locaux (instituts, De plus, les laboratoires nationaux de départements d’université…) désignés référence agissent en tant qu’observatoires par l’Organisation pour mener des des maladies transmissibles dans actions nationales et internationales les pays où ils sont situés. de soutien à la santé mondiale*. Ce tableau rassemble les laboratoires indiqués par les membres dans la base de données du Pasteur Network** et sur le site internet de l’OMS*. MEMBRES DU PASTEUR LABORATOIRES RÉGIONAUX LABORATOIRES NATIONAUX NETWORK CCOMS DE RÉFÉRENCE DE RÉFÉRENCE Fiocruz (Fondation Oswaldo Cruz) Santé mondiale et coopération Sud-Sud; Leishmaniose tégumentaire, schistosomiase, paludisme, dengue, maladie Leishmanioses cutanées, schistosomiase, paludisme, dengue, maladie de Chagas, filariose, hépatites virales, hantavirus, rickettsioses, sida, santé publique et environnementale; politiques de Chagas, filarioses, hépatites virales, hantavirus, rickettsioses, sida, anthrax, diagnostic histopathologique des maladies infectieuses, infections intestinales bactériennes, fièvre jaune, grippe, lèpre, pharmacologiques; formation des techniciens carbuncle, diagnostic histopathologique des maladies infectieuses, maladie hydatique, leptospirose, mycoses systémiques, fièvre, poliomyélite et autres entérovirus, rotavirus, tuberculose de santé; leptospiroses; renforcement entéro-infections bactériennes, fièvre jaune, grippe, lèpre, hydatidose, des banques de lait humain leptospirose, mycoses systémiques, peste Institut Pasteur Biobanque de la trypanosomiase humaine Bactéries anaérobies et botulisme, coqueluche et autres bordetelloses, corynébactéries du complexe Diphtheriae, Escherichia coli, africaine, entérovaccins et vaccins viraux, Shigella, Salmonella, fièvres hémorragiques virales, hantavirus, leptospirose, listeria, mycoses invasives et antifongiques, méningocoques méningites bactériennes, rage, listériose et Haemophilus influenzae, peste et autres yersinioses, rage, vibrions et choléra, virus des infections respiratoires (dont la grippe)*** d’origine alimentaire, salmonelles, peste Institut Pasteur d’Algérie Member of WHO EDPLN**** Toxoplasmose, HIV Institut Pasteur d’Iran Rage, arbovirus, fièvres hémorragiques Institut Pasteur de Dakar Arbovirus et les virus des fièvres hémorragiques Institut Pasteur de la Guadeloupe Laboratoire supranational de référence de l’OMS pour la tuberculose (région AMRO)***** Surveillance de la résistance aux médicaments Institut Pasteur de la Guyane antipaludiques Institut Pasteur de Madagascar Contrôle de la peste et recherche Poliovirus, rougeole, rubéole, grippe Poliovirus, rougeole, rubéole, grippe Institut Pasteur de Nha Trang Rougeole, rubéole, sécurité alimentaire, Covid-19 Institut Pasteur de Réseau océanien de surveillance de santé publique (ROSSP) Programme mondial sur les moustiques « World Mosquito Program » Nouvelle-Calédonie Institut Pasteur de Poliomyélite, entérovirus, rougeole, rubéole, hépatites virales, salmonelles, Saint-Pétersbourg rickettsies Laboratoire supranational de l’OMS pour la poliomyélite, la rougeole et la rubéole Institut Pasteur de Tunis Laboratoire de Virologie clinique, laboratoire d’Anatomopathologie Salmonellose, shigelles, rougeole, rubéole (poliovirus, rougeole) Institut Pasteur du Maroc Tuberculose, rage, grippe, hépatites virales NIHE (Vietnam) Grippe (National Influenza Center – NIC), Laboratoire arbovirus, Laboratoire virus respiratoires, Laboratoire entérovirus Pôle de Recherche Université Épidémiologie et contrôle des maladies de Hong Kong – Pasteur infectieuses Sciensano (Belgique) Laboratoire de référence de l’Union européenne pour la fièvre aphteuse, Rougeole, rubéole, rage la dermatose nodulaire et les varioles ovine et caprine * https://www.who.int/fr/about/partnerships/collaborating-centres ** Août 2021. *** www.pasteur.fr/fr/sante-publique/CNR/les-cnr **** Regional Emerging and Dangerous Pathogens Laboratory Network (EDPLN). ***** ASEAN + 3 Macroeconomic Research Office. 06 Pasteur Network – Rapport 2019-2020 Pasteur Network – Rapport 2019-2020 07
MISSIONS ET VALEURS Le contexte pandémique a renforcé les synergies au sein de la communauté scientifique pour mettre en place DU PASTEUR NETWORK des projets communs dans le réseau. Il a accéléré la transformation identitaire de celui-ci vers le Pasteur Network. L’évolution de sa gouvernance a contribué à son développement en donnant plus de poids à chacun des membres du Pasteur Network dans 25 pays sur Présent aujourd’hui dans 25 pays sur tous les continents au cœur de nombreuses zones tous les continents. L’intégration de la Plateforme scientifique Pasteur – Université de São Paulo (USP), au Brésil, en tant que d’endémie, le réseau a démontré à de multiples reprises son rôle d’acteur majeur au bénéfice trente-troisième membre a témoigné de ce dynamisme dès 2019. des populations à travers l’approche One Health. Ce modèle unique de coopération en santé L’expertise scientifique dont font continuellement preuve rassemble, au-delà des structures indépendantes publiques ou privées qui le composent, les membres du réseau positionne le Pasteur Network parmi les acteurs mondiaux leaders en santé globale. une communauté humaine et scientifique mobilisée sur des priorités de santé tant locales Les collaborations se sont démultipliées et l’offre qu’internationales dans une logique de solidarité. populationnelle s’est élargie. Résolument tourné vers l’avenir, Pasteur Network favorise l’installation de jeunes scientifiques Stewart Cole, et de nouvelles équipes, via les groupes de recherche à Particulièrement implanté dans des Les membres du Pasteur Network la diffusion du savoir et le libre accès Directeur général de l’Institut Pasteur quatre ans, par exemple. Le réseau encourage la formation à zones d’endémies ou d’épidémies, travaillent dans une approche dite à la connaissance. Président de la fondation Pasteur Network travers le nouveau label Pasteur International Courses, qui certifie Pasteur Network contribue activement « One Health » ou « Une seule santé » l’excellence des cours labellisés dispensés dans le réseau. à la lutte contre les agents infectieux. Ainsi, ils soutiennent une vision globale Enfin, la solidarité scientifique, Les 33 membres du Pasteur Network sont attachés Pour œuvrer à l’amélioration de la santé des enjeux sanitaires en tenant compte la réponse aux besoins nationaux à leurs valeurs pasteuriennes, telles que la diffusion du savoir humaine, il y déploie continuellement aussi bien de la santé humaine et régionaux ou encore la contribution et le libre accès à la connaissance, comme en témoignent son expertise à travers quatre missions: qu’animale et des écosystèmes dans à l’éducation et l’implication dans les les exemples évoqués dans ce rapport. Tirant aujourd’hui lesquels les maladies surviennent. enjeux de santé publique constituent les leçons de la pandémie, ils avancent ensemble • la recherche biomédicale; • les activités de santé publique; La diversité du Pasteur Network constitue un atout majeur pour conduire les piliers sur lesquels repose la vie du réseau. En témoigne la mobilisation Pasteur Network pour répondre aux défis de la santé mondiale de demain. • la formation; • l’innovation et le transfert des programmes selon cette approche. du Pasteur Network dans la crise sanitaire mondiale de la Covid-19. a joué un rôle majeur technologique. Mais plus que par leurs missions, les 33 membres sont avant tout unis dans la réponse Les 33 membres Ces activités, conduites avec la volonté de promouvoir un développement par les valeurs pasteuriennes qu’ils ont communément adoptées en Plus d’informations : pasteur-network.org à la crise Covid-19. du Pasteur Network durable, sont fondées sur le renforcement des capacités locales signant la charte des valeurs pasteuriennes. Parmi elles figurent Dans le cadre du plan stratégique 2019-2023, sont attachés dans le respect des droits de l’homme et de l’environnement. l’humanisme, la rigueur, l’universalisme et le dévouement, la liberté d’initiative, nous avons pour ambition de rendre le Réseau International des Instituts Pasteur, devenu aujourd’hui plus que jamais Pasteur Network, plus structuré, plus participatif à leurs valeurs pasteuriennes. et plus efficace. Pasteur Network a joué un rôle majeur dans la réponse Les activités L’innovation et le transfert à la crise Covid-19 à travers la mise en place de projets La recherche biomédicale de santé publique technologique internationaux et le partage de ressources scientifiques, humaines et matérielles. Je salue ici l’esprit collégial des membres du Pasteur Network qui s’est illustré Pierre-Marie Girard, dans sa mobilisation rapide et solidaire face à ce virus Directeur international La formation qui a ébranlé le monde comme aucun autre depuis de l’Institut Pasteur la grippe espagnole de 1918. L’Institut Pasteur a soutenu un grand nombre de projets avec les autres membres du Pasteur Network (voir le détail pages 24-25), cela en partie grâce à la générosité du public. Dès janvier 2020, le coronavirus SARS-CoV-2 nous a également rappelé l’importance des valeurs pasteuriennes d’humanisme et de dévouement. Pôle de Recherche Université Chercheur dans un laboratoire de Hong Kong – Pasteur. de l’Institut Pasteur de Dakar. Être pasteurien, c’est réaffirmer aujourd’hui nos convictions fondées sur la raison et sur les faits et montrer l’exemple. À l’aube du bicentenaire de la naissance de Louis Pasteur, Pasteur Network s’oriente davantage vers une logique Atelier international sur la rage Centre de vaccination de structuration à travers l’évolution de son modèle de organisé par l’Institut Pasteur d’Iran. international, Institut Pasteur gouvernance. En 2021, les nouveaux statuts de l’association du Maroc, Casablanca. Pasteur Network et la création de la fondation Pasteur Network constituent une avancée majeure en faveur d’un réseau plus moderne et plus efficace. J’ai pleinement confiance dans les résultats positifs de cette évolution. Fidèle à ses valeurs, Pasteur Network est plus que jamais prêt à relever les défis de la santé mondiale. 08 Pasteur Network – Rapport 2019-2020 Pasteur Network – Rapport 2019-2020 09
PASTEUR NETWORK, UN RÉSEAU DE UNE STRATÉGIE SCIENTIFIQUE 1. SANTÉ PUBLIQUE AU SERVICE COMMUNE FIXE Explorer les principales zoonoses endémiques DES POPULATIONS LES PRIORITÉS ou émergentes selon une approche One Health D’ACTION ou « Une seule santé » en tirant profit de son implantation Au contact direct des populations, Pasteur Network propose une vaste offre de services en santé COORDONNÉES globale, qui lui procure un accès privilégié à une très large diversité. publique: vaccinations, analyses biomédicales et DU PASTEUR pratique des tests de dépistage sont réalisées par des structures dédiées au sein des membres du réseau, NETWORK 2. ce qui est propice à une veille continue des émergences infectieuses et des risques épidémiques. Le comité d’orientation Étudier les maladies Institutions de recherche mais aussi structures d’accueil, les membres du scientifique du Pasteur Network infectieuses à transmission Pasteur Network se mobilisent pour offrir aux populations une panoplie de (anciennement COS-RIIP) vectorielle en mettant l’accent services de proximité. Pas moins d’une quinzaine de membres du réseau a été créé en août 2019. sur la biologie des insectes vecteurs ouvrent leurs portes pour vacciner des patients de façon préventive et des interactions vecteurs-pathogènes ou en post-exposition, comme pour la rage, et aussi afin de réaliser Sa première réunion, en février 2020, tout en portant une attention particulière des actions de sensibilisation et prévention. Tests diagnostiques des a réaffirmé les quatre axes stratégiques à l’étude de stratégies innovantes pathologies infectieuses qui contribuent également à la surveillance de de contrôle vectoriel. ces maladies (voir pages 6 et 7 consacrées aux laboratoires de référence), définis en 2017 pour le Pasteur Network, analyses de biologie médicale et analyses microbiologiques des actant ainsi une stratégie scientifique eaux et des denrées alimentaires font également partie des activités 3. ambitieuse du réseau en tant qu’acteur exercées au sein du réseau pour veiller à l’amélioration de la santé humaine, en parallèle des activités de recherche. reconnu de la santé globale. Les analyses réalisées en laboratoire couvrent un champ très large. Composé de dix membres dont huit sont choisis Par exemple, des analyses en biochimie générale et spécialisée au sein de la communauté des chercheurs du Explorer les risques infectieux faites sur des prélèvements sanguins dosent les marqueurs tumoraux ou Pasteur Network et deux au sein de la communauté au cours des premiers âges cardiaques, les hormones, etc. En microbiologie, l’étude des échantillons scientifique internationale, le comité d’orientation de la vie, en particulier dans les révèle la présence de bactéries, parasites, champignons ou virus et scientifique du Pasteur Network définit la stratégie populations marginalisées et migrantes permet d’identifier une infection. L’anatomocytopathologie, autre scientifique du réseau. Il analyse les opportunités pour lesquelles l’enfance, l’adolescence exemple d’analyse, porte sur les tissus ou les cellules afin de détecter de partenariat entre ses membres, identifie et la maternité sont des étapes de la vie des anomalies associées à une maladie cancéreuse ou inflammatoire. les priorités d’action et recommande les modalités qui sont particulièrement fragiles Quant aux études génétiques, elles identifient des maladies rares de leur mise en œuvre. et dont nombre de pathologies du et de caractériser les mutations génétiques qui les provoquent. développement et d’agents infectieux Réuni pour la première fois les 17 et 18 février 2020, le sont propres à ces stades de vie. Par ailleurs, les laboratoires et leur centre de prélèvement accueillent comité d’orientation scientifique fait de la formation et de quotidiennement des patients. Nombreux sont ceux qui sont ouverts l’éducation dans les sciences du vivant une priorité du de manière continue 7j/7. Cette permanence offre la possibilité 4. réseau avec la création du label Pasteur International de réaliser des analyses en urgence et ainsi pour les patients de disposer Courses (voir page 45). Il réaffirme également les quatre de leurs résultats très rapidement. Ce service concourt largement axes de la stratégie scientifique du réseau formulés en 2017. à l’amélioration de la prise en charge des patients et à la mission de santé publique du Pasteur Network. Étudier l’impact du L’Institut Pasteur du Cambodge accueille, par exemple, près vieillissement et de la longévité de 26 000 personnes par an après une morsure par un animal La communauté scientifique sur la santé dans le contexte potentiellement enragé pour l’administration de la vaccination antirabique du Pasteur Network de la transition épidémiologique post-exposition, seule thérapie évitant une issue toujours fatale s’est particulièrement qui caractérise la plupart des pays. en cas de rage avérée. Cet institut consolide son engagement mobilisée en 2019 et 2020 L’étude des maladies chroniques telles dans la lutte contre la rage avec l’ouverture de son troisième centre de sur les thématiques que les syndromes métaboliques, vaccination à Kampong Cham en 2019. Le protocole vaccinal « IPC » de l’antibiorésistance le cancer ou encore les affections (conçu par l’institut), premier protocole post-exposition « court » et de la rage. neurodégénératives s’inscrit dans administré sur une semaine, est aujourd’hui recommandé par l’OMS. cet axe. Plus d’informations : pasteur.fr/fr/journal-recherche/actualites/ rage-nouvelles-pistes-prophylactiques-therapeutiques 10 Pasteur Network – Rapport 2019-2020 Pasteur Network – Rapport 2019-2020 11
LE RÉSEAU INTERNATIONAL DES INSTITUTS GOUVERNANCE PASTEUR DEVIENT PASTEUR NETWORK ➜ ASSOCIATION Une nouvelle gouvernance se met en place pour l’anciennement nommé « Réseau International des Directeur exécutif Président Vice-président Instituts Pasteur » et ses 33 membres, réunis au sein d’une association depuis 2011 présidée par Stewart Cole, directeur général de l’Institut Pasteur. Dix ans plus tard, l’organisation du réseau évolue Nommé par le président Élu parmi les 8 représentants Directeur général et le vice-président régionaux du CA de l’Institut Pasteur (Paris) vers une gouvernance plus participative et équilibrée ainsi qu’un modèle économique plus structuré. Elle intègre l’évolution des statuts de l’association représentant le réseau qui devient Pasteur Network et la création d’une fondation abritée à l’Institut Pasteur, nouvel organe financier. À travers son organisation et sa nouvelle identité, Pasteur Network marque sa volonté de poursuivre son Conseil Assemblée d’administration générale engagement dans la lutte contre les maladies en priorité́ infectieuses et émergentes par une approche One Health, dans une logique de solidarité internationale et d’une seule voix. ➜8 représentants Directeurs ou représentants régionaux dont le président des membres du – 2 Amériques Pasteur Network Pasteur Network: une et encourageant la collaboration au communauté scientifique – 2 Afrique sein du Pasteur Network (Pasteur mondiale aux valeurs International joint research unit). LES DATES CLÉS DU – 2 Asie-Pacifique pasteuriennes communes PASTEUR NETWORK – 2 Euro-Méditerranée tournée vers l’avenir Plus d’informations sur Pasteur ➜ Vice-président 1888 Pasteur Network s’inscrit dans Network : pasteur-network.org ➜2 /3 administrateurs une nouvelle dynamique et dans Inauguration externes cooptés une logique d’approfondissement de l’Institut Pasteur du réseau pour la santé mondiale. L’association Pasteur International 1891 Une nouvelle organisation a été Network évolue pour prendre Ouverture du premier adoptée le mardi 8 juin 2021, le nom du Pasteur Network, institut hors métropole après sa présentation le 4 juin qu’elle représente juridiquement, à Saïgon au conseil d’administration tout en faisant évoluer ses ➜ FONDATION ABRITÉE À L’INSTITUT PASTEUR de l’Institut Pasteur. statuts pour construire une 1972 Elle est conçue pour représenter gouvernance plus équilibrée Création du Conseil tous les membres du Pasteur Network et participative. L’association des directeurs du réseau Directeur exécutif Président Vice-président et faire face avec eux aux défis est une structure de représentation majeurs du XXIe siècle, tels que du Pasteur Network et d’aide 1988 Nommé par le président Directeur général Président de l’association la lutte contre la pandémie au montage de projets de Le réseau devient après consultation du de l’Institut Pasteur (Paris) Pasteur Network, de la Covid-19. recherche impliquant plusieurs le Réseau International bureau exécutif issu d’une région de ses membres ainsi que des Instituts Pasteur Une gouvernance mieux leur coordination. et Instituts associés partagée et un modèle Elle assure également l’animation 1989 économique renforcé de ce collectif au niveau régional et interrégional. Afin de donner Signature de la Déclaration générale de coopération Bureau Comité Dans ce contexte, une fondation davantage de poids aux régions, exécutif de gestion scientifique abritée à l’Institut Pasteur a été deux représentants par région créée pour définir un modèle sont élus dans chacune ce qui 2004 économique plus efficace et porte leur nombre à huit incluant ➜8 représentants Signature de la Déclaration ➜D irecteurs ou représentants structuré. Celle-ci contribuera le président (contre cinq auparavant, des valeurs pasteuriennes régionaux dont le vice-président à développer le Pasteur Network cf. graphique ci-contre). des fondateurs: membres partagées et de la Charte des – 2 Amériques en renforçant ses capacités valeurs pasteuriennes du Pasteur Network et son infrastructure, ainsi que Grâce à ces évolutions, l’association – 2 Afrique celles de ses fondateurs et pourra agir en complémentarité 2011 – 2 Asie-Pacifique partenaires, à travers le soutien et en parfaite synergie avec Création de l’association Pasteur International Network – 2 Euro-Méditerranée de programmes internationaux. la fondation abritée au bénéfice En plus d’œuvrer à consolider des membres du Pasteur Network. représentant le réseau ➜ Président et à augmenter les financements Tous ces changements se pour le Pasteur Network, qui traduisent dans la nouvelle 2021 ➜1 représentant de l’Institut dispose d’un fonds d’amorçage, identité visuelle du réseau et Création de la fondation Pasteur (Paris) la fondation gère également les fonds son nouveau nom. Réseau, membres, Pasteur Network et évolution des statuts de l’association soutenant la mobilité (programme association et fondation utiliseront qui porte désormais le nom Calmette & Yersin, groupes de désormais la même marque, du réseau qu’elle représente: recherche à quatre ans – G4) « Pasteur Network ». Pasteur Network Conseil d’orientation ➜ Grands mécènes et contributeurs 12 Pasteur Network – Rapport 2019-2020 Pasteur Network – Rapport 2019-2020 13
QUELQUES FAITS MARQUANTS EN 2019 Ci-dessous, une sélection réalisée à partir des faits marquants transmis par les membres JUIN 2019 JUILLET 2019 du Pasteur Network. Cette liste est non exhaustive et pour plus d’informations, consultez Chine France (Nouvelle-Calédonie) le site internet ou les rapports d’activité des membres. PRÉVENIR LES MUTATIONS LANCEMENT DU WORLD DU VACCIN CONTRE MOSQUITO PROGRAM LA GRIPPE AVRIL 2019 MAI 2019 L’efficacité des vaccins contre la grippe Côte d’Ivoire Madagascar saisonnière H3N2 peut être fortement diminuée lorsqu’apparaissent des INAUGURATION D’UNE CARACTÉRISATION modifications dites « antigéniques ». Des chercheurs du Pôle de Recherche BIOBANQUE RÉGIONALE DE L’ÉPIDÉMIE DE PESTE Université de Hong Kong – Pasteur OCTOBRE 2019 EN CÔTE D’IVOIRE À MADAGASCAR ont découvert qu’effectuer une mutation Guinée spécifique dans le vaccin contre JANVIER 2019 Des chercheurs de l’Institut Pasteur la grippe saisonnière pouvait empêcher DES TRACES D’EBOLAVIRUS de Madagascar et de l’Institut Pasteur l’apparition d’une mutation antigénique. France (Guadeloupe) (Paris), en collaboration avec le ministère Une étude importante pour l’élaboration CHEZ LE PORC de la Santé publique malgache, de futurs vaccins. CRÉATION DU RÉSEAU l’OMS et des experts internationaux Cell Host & Microbe, juin 2019, KARUBIONET ont décrit l’ampleur de l’épidémie DOI:10.1016/j. chom.2019.04.013 de peste pulmonaire survenue en 2017 En plus de s’équiper d’un séquenceur à Madagascar ainsi que la dynamique MinION, l’Institut Pasteur de la Guadeloupe de sa transmission. L’analyse révèle Premier lâcher de moustiques a constitué le réseau KaruBioNet. notamment une dominance de la forme à Nouméa (Nouvelle-Calédonie). L’ambassadeur de France en Côte d’Ivoire, C’est une plateforme de discussion, le ministre de l’Enseignement supérieur pulmonaire qui représente 78 % des de partage, de formation et d’entraide et de la Recherche scientifique, et le 2 414 cas suspects cliniques notifiés. Les premiers moustiques porteurs de entre chercheurs dans le domaine représentant de la CEDEAO. Wolbachia, une bactérie qui les empêche de la bioinformatique. Il regroupe de transmettre les arbovirus (dengue, entre autres des scientifiques de Le 25 avril 2019 a eu lieu l’inauguration Zika…), ont été lâchés le mercredi l’Institut Pasteur de la Guadeloupe, de la Biobanque régionale des pays 10 juillet 2019 à Nouméa, dans le cadre de l’Université des Antilles, de l’INRA, de la Communauté économique des du World Mosquito Program impliquant Étude des souches du virus Ebola circulant en Guinée. du CIRAD, de l’IRD, etc. États de l’Afrique de l’Ouest (CEDEAO). l’Institut Pasteur de Nouvelle-Calédonie. Située sur le site d’Adiopodoumé (axe L’objectif est d’obtenir, par des Une publication du Friedrich-Loeffler- Virus de la grippe (influenza) Abidjan-Dabou) de l’Institut Pasteur de A/TeXAS/1/77 (H3N2). accouplements de moustiques infectés Institut, en collaboration avec l’Institut Côte d’Ivoire, elle est hébergée dans le par Wolbachia et des moustiques Pasteur de Guinée, révèle que les porcs Centre de ressources biologiques de sauvages, une population de moustiques peuvent être des hôtes pour les virus l’institut et permet de conserver, en toute Aedes aegypti incapables de transmettre du genre Ebolavirus. Les anticorps sécurité, les micro-organismes à hauts The Lancet Infectious Diseases, mai 2019, DOI:10.1016/ S1473-3099 (18) 30730-8 JUILLET 2019 les virus de la dengue, Zika... retrouvés dans leur sang suggèrent risques pour les besoins de la recherche. Plus d’informations : https://www.pasteur.fr/fr/ institut-pasteur/institut-pasteur-monde/actualites/ Belgique https://www.pasteur.fr/fr/institut-pasteur/ institut-pasteur-monde/actualites/wolbachia-bacterie- que ceux-ci pourraient jouer un rôle Plus d’informations : http://pasteur.ci/index.php/homepage/ epidemie-peste-pulmonaire-2017-madagascar- lutter-contre-dengue dans la transmission du virus. actualitees/item/494-ceremonie-dinoguration-du-cereb-bio- banque-regionale-des-pays-de-la-cedeao caracterisee-chercheurs ÉTUDE DE LA RÉSISTANCE Une étude importante pour la compréhension du cycle viral AUX ANTIMICROBIENS SEPTEMBRE 2019 des Ebolavirus. MAI 2019 PAR NGS Cambodge Transboundary and Emerging Diseases, octobre 2019, Canada DOI:10.1111/tbed.13391 Grâce à l’accréditation BELAC obtenue RESIST-2, UN NOUVEAU DE NOUVELLES ESPÈCES en juillet 2019, les centres nationaux PROTOCOLE CONTRE LA RAGE de référence en microbiologie clinique DE LEPTOSPIRA humaine de Sciensano effectuent des Une étude de cohorte observationnelle Une équipe de l’INRS-Centre activités de typage de routine sur des menée par des équipes de l’Institut Armand-Frappier Santé Biotechnologie et isolats bactériens grâce au séquençage Pasteur du Cambodge et de l’Institut ses collaborateurs ont publié une étude nouvelle génération NGS ou séquençage Pasteur (Paris) entérine l’efficacité sur la découverte de 30 espèces de haut débit permettant la détection du nouveau protocole vaccinal Leptospira, une bactérie dont les souches de clusters de maladies microbiennes postexposition contre la rage développé infectieuses sont responsables de la mais également d’analyser les gènes au sein du Pasteur Network. Désormais, leptospirose. L’analyse de ces souches de résistance aux antimicrobiens. la vaccination postexposition se fera environnementales a permis d’affiner la sur une semaine au lieu de quatre. classification du genre tout en identifiant Un protocole améliorant la prise des spécificités génomiques propres en charge qui a déjà été adopté aux espèces infectieuses. par l’OMS. Plos Neglected Tropical Diseases, mai 2019, The Lancet Infectious Diseases, septembre 2019, Bactéries leptospires. DOI: 10.1371/journal. pntd.0007270 DOI:10.1016/S1473-3099 (19) 30311-1 14 Pasteur Network – Rapport 2019-2020 Pasteur Network – Rapport 2019-2020 15
QUELQUES FAITS MARQUANTS EN 2019-2020 MAI 2020 JUIN 2020 JUILLET 2020 NOVEMBRE 2020 France (Guyane) République centrafricaine Cameroun France LA RÉSISTANCE UN NOUVEAU « PAYS LIBRE DE NOUVELLES MOLÉCULES DÉCOUVERTE MOLÉCULAIRE AUX ANTIPALUDIQUES DU POLIOVIRUS SAUVAGE » CONTRE LE PALUDISME DANS LA MALADIE EN AMAZONIE D’ALZHEIMER Comme annoncé le 17 juin 2020 par le Le laboratoire de recherche sur le Suite à l’apparition en Asie d’une mutation bureau pays de l’OMS, la République paludisme du Centre Pasteur du Des chercheurs de l’Institut Pasteur du parasite à l’origine du paludisme centrafricaine a été déclarée Cameroun, en collaboration avec de Lille ont découvert qu’aux premiers le rendant résistant à l’artémisinine, « pays libre du poliovirus sauvage » par l’Université de Buea, a découvert, stades de la maladie d’Alzheimer, un antipaludique, des chercheurs la Commission régionale de certification grâce à des techniques d’hybridation principale cause de démence chez de l’Institut Pasteur de la Guyane ont pour l’éradication de la polio en région moléculaire, une nouvelle classe d’agents les personnes âgées, certaines régions étudié la résistance aux antipaludiques africaine. Les données du laboratoire de antipaludiques aux modes d’action du cerveau, comme l’hippocampe, en Amazonie. La même mutation référence régional OMS de la poliomyélite multiples. Cette découverte est d’autant avaient une expression génique altérée. a été retrouvée mais avec une origine abrité à l’Institut Pasteur de Bangui le plus importante que le composé est Ces résultats aident à mieux indépendante. Elle conduit alors, en plus, certifient: aucun cas d’infection par un efficace sur les souches multirésistantes comprendre le processus moléculaire à un ralentissement de la croissance poliovirus sauvage n’a été détecté depuis et sur tous les stades asexués du parasite. des étapes précoces de la maladie du parasite supposant une future le 8 décembre 2011. Scientific Reports, octobre 2020, et pourraient conduire à l’identification résistance aux autres antipaludiques. DOI:10.1038/s41598-020-74824-0 de cibles thérapeutiques. eLife, mai 2020, DOI:10.7554/eLife.51015 npj/Aging and Mechanims of Disease, novembre 2020, DOI:10.1038/s41514-020-00052-5 DÉCEMBRE 2019 Bulgarie JUIN 2020 NOVEMBRE 2020 NOVEMBRE 2020 NOVEMBRE 2019 DES MIMOTOPES POUR Canada Cambodge – France – Sénégal Grèce – France Cameroun ÉTUDIER LA RÉACTIVITÉ ÉLUCIDATION AEDES AEGYPTI PLUS NOUVEAU MODÈLE 51E CONSEIL DES IGM DU MÉCANISME D’ACTION SENSIBLE AU VIRUS ZIKA D’INFECTION DU CERVEAU DES DIRECTEURS Des chercheurs du département DE L. DONOVANI À YAOUNDÉ d’Immunologie de l’Institut de microbiologie Des équipes de l’INRS-Centre Entérovirus de la famille des Picornaviridae, trois sérotypes L’Institut Pasteur et l’Institut Pasteur Stephan Angeloff ont décrit une Hellénique signent une publication Armand-Frappier Santé Biotechnologie connus. Agent de la poliomyélite, Le 51e Conseil des directeurs du bibliothèque quasi complète de mimotopes l’homme est le seul hôte naturel. mettant en avant le rôle des lipoprotéines réseau international s’est déroulé au d’IgM, des molécules mimant la partie ont démontré que le parasite Leishmania dans le franchissement de la barrière Centre Pasteur du Cameroun et pour de l’antigène qui se lie aux anticorps. donovani, responsable de la leishmaniose hématoencéphalique par les la première fois dans le pays du 12 au Cette bibliothèque permet d’analyser le viscérale, provoquait une reprogrammation JUIN 2020 streptocoques B, des bactéries 15 novembre 2019. Le 12 novembre, dynamisme et la réactivité du répertoire vaste mais sélective de l’activité de le ministre de la Santé, le Dr Malachie public humain des immunoglobulines traduction de la cellule hôte en début France (Guyane) notamment à l’origine de méningites. Le travail réalisé sur des drosophiles d’infection. Certains de ces changements Manaouda, a inauguré un nouveau bâtiment au Centre Pasteur du Cameroun, de classe M ou IgM en étudiant structurellement les interactions établies. seraient impliqués dans les mécanismes de LE VIRUS MAYARO et des modèles murins identifie ainsi un nouveau mécanisme utilisé par les financé par l’État du Cameroun. Frontiers in Immunology, décembre 2019, défense de l’hôte et d’autres dans la survie EN GUYANE FRANÇAISE Femelle d’Aedes aegypti élevée au Vectopôle de l’Institut Pasteur de la Guyane. pathogènes pour infecter le cerveau. Le 13 novembre 2019, il a présidé DOI:10.3389/fimmu.2019.02796 du parasite, sa résistance. Nature Communications, novembre 2020, le gala des 60 ans du Centre Pasteur PLoS Pathogens, juin 2020, L’Institut Pasteur de la Guyane, en La collaboration de plusieurs laboratoires DOI:10.1038/s41467-020-19826-2 DOI:10.1371/journal. ppat.1008291 du Cameroun. Un symposium scientifique collaboration avec la CIBU de l’Institut dont cinq issus des membres autour du thème « Les avancées Pasteur (Paris), a caractérisé la du Pasteur Network – l’Institut scientifiques au service du contrôle circulation du virus Mayaro, un arbovirus Pasteur (Paris), l’Institut Pasteur des maladies infectieuses » a été émergent, et évalué son risque de de la Guadeloupe, l’Institut Pasteur organisé à cette occasion. Des journées transmission à l’homme, tâche difficile de la Guyane, l’Institut Pasteur portes ouvertes à destination du public de par sa réactivité croisée avec le virus du Cambodge et l’Institut Pasteur et une campagne de dépistage du chikungunya. Les chercheurs ont de Dakar – a mis en évidence une et prévention des cancers ont eu lieu trouvé des preuves solides de l’existence augmentation de la sensibilité du du 18 au 22 novembre. d’un important cycle selvatique, moustique Aedes aegypti au virus Zika, notamment avec une séroprévalence d’où sa capacité à acquérir et plus élevée en forêt. transmettre le virus suite à l’évolution Nature Communications, juin 2020, de sa forme « domestique ». Cette DOI:10.1038/s41467-020-16516-x découverte, combinée à l’expansion mondiale d’Aedes aegypti, explique Streptococcus agalactiae (aussi l’émergence d’arbovirus. appelé streptocoque du groupe B) Science, novembre 2020, en microscopie électronique DOI:10.1126/science. abd3663 à balayage. Leishmania donovani, agent de la leishmaniose viscérale, au stade intracellulaire amastigote révélé en rouge en microscopie confocale. 16 Pasteur Network – Rapport 2019-2020 Pasteur Network – Rapport 2019-2020 17
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