Colloque EcoAntibio 24 juin 2021 - DRAAF Normandie
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Colloque EcoAntibio
24 juin 2021
ECOANTIBIO
Les réponses du laboratoire
à 14 de vos questions
Dr. Albertine LEON & Fabienne BENOIT
24 juin 2021
Les plans Ecoantibio…
Présentation d’Ecoantibio² (20
actions) 2017-2021
Axe 1: développer les mesures en prévention des
maladies infectieuses et faciliter le
recours aux traitements alternatifs (4 actions)
Axe 2: Communiquer et former sur les enjeux de lutte
contre l’antibiorésistance, sur la
prescription raisonnée des antibiotiques, et sur les
autres moyens de maîtrise des maladies
infectieuses (4 actions)
Axe 3: Outils partagés : mettre à disposition des
outils d’évaluation et de suivi du recours
aux antibiotiques, ainsi que des outils pour leur
prescription et administration responsables (9
actions)
Axe 4: Des efforts partagés: s’assurer de la bonne
application des règles de bon usage au
niveau national et favoriser leur adoption aux niveaux
européen et international (3 actions)
Nouvelle catégorisation des antibiotiques
(Agence Européenne du médicament EMA-2020)
28/01/22 : application du nouveau règlement 2019/6 « médicament vétérinaire »
Catégorisation de A à D :
- A : à éviter voire proscrits en production animale
- B : « critiques » usage restreint
- C : 2nde intention, à utiliser avec précaution
- D : 1ère intention, usage prudent
Catégories et mesures associées Classes d’antibiotiques (+ exemples)
Fluoroquinolones (toutes les « oxacines »)
Catégorie B : « sur recours,
Autres quinolones (fluméquine et ac. oxolinique)
après antibiogramme » C3G/C4G (céphalosporines de 3ème et 4ème générations)
Antibiotiques « critiques » (ceftiofur, céfovécine, cefquinome, céfopérazone).
« Usage restreint » (avec
antibiogramme et en l’absence
d’alternative en cat. C ou D) Colistine et polymyxine B.
4
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1 – Comment mesure-t-on la résistance
aux ATB?
BACTERIE ANTIBIOTIQUES
2 METHODES AUTORISÉES &
• Méthode de dilution, en milieu liquide
ou gélosé (U47-106)
• Méthode de diffusion en milieu gélosé
(NF U47-107)
ANTIBIOGRAMME
méthode des disques
ANTIBIOGRAMME :
Permet la détermination de la sensibilité d’une bactérie vis-à-vis d’un
antibiotique donné
Evaluation de la CMI = concentration minimale inhibitrice
2 – Comment réalise-t-on un antibiogramme
comme un pro ?
ANTIBIOGRAMME selon la NF U47-107 :
Méthode de diffusion en milieu gélosé =
méthode des disques
- Souche pure identifiée : détermine les antibiotiques à tester
- Inoculum standardisé : 0,5 McFarland dilué au 1/10ème
- Milieu spécifique (Mueller Hinton +/- sang ou sérum)
- Ensemencement par écouvillonnage
- Positionnement des disques (choix/bactérie)
- Incubation : atmosphère contrôlée, température dirigée
3 – La LECTURE INTERPRETATIVE, c’est quoi ? Lecture interprétative = en fonction de la nature du germe et selon les référentiels (CA-SFM) Exemple : SARM, Staphylococcus aureus résistants à la méticilline : utilisation d’un disque de céfoxitine résistance pour toutes les β-lactamines Staphylococcus pseudintermedius : tester céfoxitine + oxacilline + céfovécine BLSE : β-Lactamase à Spectre Etendu : observation d’une synergie entre AMC et C3G résistance pour toutes les β-lactamines sauf AMC
4 –L’antibiogramme : la panacée ?
L’antibiogramme : exprime une probabilité de réussite
thérapeutique en fonction du résultat R-I-S obtenu
/!\ Conditions adéquates : prélèvement réalisé avant
traitement sur bactérie isolée, identifiée et …
A effectuer sur le germe réellement responsable de l’infection
Les résultats RIS sont corrélés aux concentrations
sériques en antibiotique, évaluées in vitro et non
aux concentrations tissulaires : prendre en compte
les critères de pharmacocinétique, de
pharmacodynamie et de toxicologie.
5-Quelles sont les erreurs à éviter
Si > 3 germes -> pas d’antibiogramme
car contamination du prélèvement
-> risque de cibler le mauvais germe
Antibiotique Diamètre Résultats interprétés
Identification précise du(des) germe(s) testé lus
Streptococcus uberis Enterococcus faecalis
en cause nécessaire à l’interprétation Pénicilline G 29 Sensible Sensible
résistance naturelle, acquise etc. Oxacilline 21 Sensible Résistant
Céfoxitine 24 Sensible Résistant
Amoxicilline 23 Sensible Sensible
Amox-clav 24 Sensible Sensible
Céfalexine 23 Sensible Résistant
Streptomycine 21 Résistance de bas Résistance de bas
HC niveau niveau
Gentamicine HC 17 Résistance de bas Résistance de bas
niveau niveau
Tétracyclines 14 Résistant Résistant
Erythromycine 15 Résistant Résistant
Lincomycine 25 Sensible Résistant
Spiramycine 25 Sensible Sensible
Tylosine 19 Sensible Sensible
Trim + sulfa 29 Sensible Sensible
Steptococcus uberis Enterococcus faecalis Enrofloxacine 19 Intermédiaire Intermédiaire
Marbofloxacine 17 Intermédiaire Intermédiaire
Contrôle par le vétérinaire officiel
inspecteur en pharmacie
Contrôle des conditions de réalisation des antibiogrammes effectués dans le cadre de la
prescription d’antibiotique critique
(Note de service DGAL/SDSPA/2020-426 du 06-07-2020)
1. Laboratoires vétérinaires adhérents au RESAPATH (U47-107)
2. Sinon vérification des spécifications :
- Méthode standardisée :
- Charge des disques utilisés
- Inoculum (culture pure)
- Conditions d’incubation
- Critères de catégorisation
- Des contrôles réguliers avec des souches de référence (1 fois par mois)
- Des contrôles des pieds à coulisse
- Sur le rapport d’essai : faire référence à la U47-107
et la version des recommandations CA-SFM
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Copyright © 2017 Tous droits réservés – Document interne LABÉO6- Suis-je acteur de la surveillance des résistances bactériennes ? Transmission des données au RESAPATH : Réseau d'épidémiosurveillance de l'antibiorésistance des bactéries pathogènes animales enquêtes épidémiologiques de la résistance par espèce comparaison des données animal / homme Impact environnemental
7 – Est-ce qu’il y a péril en la demeure ?
Étude RÉSAVEL : étude de la résistance
aux ATB chez les veaux laitiers7 – Est-ce qu’il y a péril en la demeure ?
● Evolution de la résistance des E. coli isolées des prélèvements équins
E % of resistant Escherichia coli
Year 2006 2007 2008 2009 2010 2011 2012 2013 2014 2015 2016
Antibiotic category
Number of strains (n) 350 419 479 521 467 528 577 490 491 493 344
AMP/AMX 40.6 33.9 54.1* 56.6 31.3* 52.5* 62.7* 55.7* 39.7* 40.0 39.5
Penicillins
AMC 28.9 23.6 48.6* 53.0 25.1* 43.6* 45.4 46.1 32.8* 34.9 31.4
3rd CEF 3.4 6.7* 8.6 8.6 8.8 10.8 10.2 9.8 11.2 6.7* 6.1
Cephalosporins
4th CEQ** 1.4 6.0* 8.4 8.3 7.9 10.6 9.9 9.2 11.0 6.9* 5.8
STR** 77.1 81.9 88.3 94.8* 90.4* 63.6* 76.1* 65.1* 59.3 36.1 33.1
KAN NT NT NT NT NT NT 25.3 24.9 21.4 8.9 9.0
Aminoglycosides
GEN 5.7 8.1* 9.4 11.5 10.5 15.9* 11.8 11.6 10.4 6.9 6.1
AMK** 3.4 3.8 2.7 3.8 3.4 0.6* 0.5 1.6 1.0 0.4 0.0 Désordres gastro-intestinaux
Tetracyclines TET/OT 21.4 20.8 22.8 26.3 24.0 23.9 24.1 20.4 21.4 24.5 20.6 Infections du tractus génital
Sulphonamides SUL/SXT** 24.6 26.7 27.1 28.4 26.1 29.2 62.7* 25.1* 30.1 28.2 31.4
NAL NT NT NT NT NT NT 7.1 10.0 8.1 6.7 4.9 Septicémie
FLU** 7.7 17.2* 6.1 7.7 8.1 7.8 6.1 6.3 6.5 6.1 4.9
Quinolones/Fluoroquinolones
ENO 4.0 5.0 5.0 4.6 6.0 6.3 5.9 5.5 6.1 5.3 3.2
MAR 3.4 3.8 3.5 3.8 4.3 4.9 4.7 3.5 5.1 3.7 2.9
Origine génitale majeure (51%)
Près de 40% de résistance à l’Amoxicilline
Haut niveau de résistance à la Streptomycine,
avec diminution entre 2015 et 2016
Moins de 12% de résistance aux Céphalosporines
et Quinolones
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Copyright © 2017 Tous droits réservés – Document interne LABÉO7 – Est-ce qu’il y a péril en la demeure ?
● Evolution de la résistance des E. coli isolées des prélèvements équins
Désordres gastro-intestinaux
Infections du tractus génital
Septicémie
Origine génitale majeure (51%)
Poursuite de la diminution jusqu’en 2018 pour
Amoxicilline, Streptomycine, avec nouvelles
augmentation en 2019
Moins de 6,5% de résistance aux Céphalosporines 14
et Quinolones
Copyright © 2017 Tous droits réservés – Document interne LABÉO8- Quid des bénéfices pour l’Homme ?
Projet de recherche : médecine comparée homme/animal
● Staphylococcus aureus
Caractérisation moléculaire de
85 souches SARM équines
Utilisation d’outils disponibles
en santé humaine : champ
pulsé, MLST, profil toxinogène
Emergence du clone ST 398
Cheval : réservoir de gène de
résistance ?9 – Vous laboratoire, avez-vous d’autres
choses à nous proposer ?
PCR génotypes de résistance
Détection par PCR des gènes mecA et mecC,
porteurs de la résistance à la méticilline
Exemple : Staphylococcus aureus
mecA
nuc
mecC10 – Quels sont les outils de diagnostic de la
résistance de demain ?
Séquençage complet du génome bactérien
Gènes de virulence, résistance, persistance, stratégie
d’évitement du système immunitaire ?
Epidémiologie génomique/diversité génétique dans le
temps
iSEQ 100 (illumina)11-Quelles sont les autres actions du laboratoire
dans la lutte contre l’antibiorésistance?
● Isolement de souche pour autovaccin
Ex : Rhodococcus equi
Traitement recommandé : combinaison Erythromycine +
rifampicine (molécule critique à préserver pour les cas de
tuberculose chez l’homme)
Autovaccin = alternative
Prévention
L'élaboration d'une solution vaccinale : 6 à 10 semaines de la détection à la délivrance.
https://www.biovac.ceva.com11-Quelles sont les autres actions du laboratoire
dans la lutte contre l’antibiorésistance?
● Nouvelles molécules antimicrobiennes
Expertise en
bactériologie
Synthèse de nouveaux
dérivés du m-Gaïacol
Criblage sur :
Micrococcus luteus
Souches sauvages (Gram +, Gram -) : Streptococcus
equi subsp zooepidemicus, Staphylococcus aureus, Escherichia
coli, Klebsiella pneumoniae, Stenotrophomonas maltophila
Souches multi-résistantes
1er Brevet LABÉO
LABÉO – Université de Caen Niveau d’effet
0 : aucun effet
1 : faible effet => observé au pur seulement
2 : effet moyen => fort au pur, diminue avec les dilutions
3 : fort effet => observé à plusieurs concentrations12- Qu’en est-il des désinfectants ? Surfanios premium
NPC (Anios®)
● Projet PyoCARBA sur Pseudomonas aeruginosa
Comparaison profil de résistance aux antibiotiques vs agents désinfectants
(Ammoniums quaternaires)
Pas de correspondance entre profil de résistance aux ATB et CDMA
Résistance cumulée pour certaines souches procédures de désinfections
Etude des biofilms formés en élevage et en clinique13- Le biofilm : qu’est ce que c’est ?
Communauté de microorganismes s’agrégeant grâce à la production d’une
matrice polymérique et adhérant à une surface inerte ou biologique très diverse =
surfaces minérales, végétales, animales, industrielles ou médicales
Caractérisation par des technologies innovantes
En conditions statiques
Coloration au cristal violet
méthode de référence
Microscopie 3D à
xCELLigence®
fluorescence
En conditions dynamiques
BioFlux®
Léon et coll. PVE, 2020, 208(52):20-2514- Qu’en est-il dans vos cliniques ?
la biosécurité
Les 5B de SAEGERMANN Bio-exclusion
Bio-compartimentation
Bio-prévention
Bio-confinement Bio-préservation
• Maitriser l’hygiène à la clinique (et dans les véhicules) = moins de risque pour le
personnel, les clients, leurs animaux et à terme moins d’usage des antibiotiques
• Le choix et le bon usage des nettoyants (bien connaitre les conditions d’utilisation,
garder un nombre mini de produits avec un protocole
de mise en œuvre simple) = attention à formation de biofilm
• Inclure tout le personnel dans la démarche
• Possibilité de suivre les principaux germes à risque
(SARM, Pseudomonas, E. coli BLSE…) + contrôle matériel (endoscopes)Take home message Confiez la réalisation de vos antibiogrammes à un laboratoire expert (accrédité et/ou adhérant au RESAPATH)…c’est aussi éviter les erreurs d’interprétation Législation « Antibiotiques » : contraignante mais réel impact sur la réduction de l’antibiorésistance à la fois en médecine vétérinaire et humaine L’antibiorésistance peut aussi être présente au sein de votre clinique…
MERCI POUR VOTRE ÉCOUTE
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12, rue du docteur Michel Baudoux 1, route de Rosel – SAINT-CONTEST
27023 ÉVREUX 14053 CAEN CEDEX 4
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