Comment savoir si les OGM sont toxiques ? Réflexions autour des résultats scientifiques du projet GMO90+

La page est créée André Nguyen
 
CONTINUER À LIRE
Comment savoir si les OGM sont toxiques ? Réflexions autour des résultats scientifiques du projet GMO90+
Comment savoir si les OGM sont
            toxiques ?
 Réflexions autour des résultats
scientifiques du projet GMO90+

                              Bernard Salles
                         bernard.salles@inra.fr

et X Coumoul, P Rogowsky, R Servien, F Richard-Forget,
      JP Cravedi, B Broux-Laporte, R Barouki et al.

  GMO90+ projet financé par le MTES à hauteur de 2.5 M€

  Restitution 18 avril 2019                               1
Comment savoir si les OGM sont toxiques ? Réflexions autour des résultats scientifiques du projet GMO90+
TOXICOLOGIE DES ALIMENTS
                      ÉVALUATION DU DANGER
TOXI-INFECTIONS ALIMENTAIRES COLLECTIVES (TIAC)

TOXICITÉ DUE À LA PRÉSENCE D’UN AGENT(phalloïdine…)
OU D’UN CONTAMINANT (Aflatoxines B1/2…)

CONTAMINANTS DES ALIMENTS PENDANT LE STOCKAGE,
LE TRANSPORT, LE PROCESS INDUSTRIEL, LE STOCKAGE
CHEZ LE CONSOMMATEUR ET LA PRÉPARATION CULINAIRE

QUELLES SONT LES SOURCES D’UNE TOXICITÉ POTENTIELLE DE CERTAINS OGM?
• Expression d’une nouvelle protéine par la plante (maïs Bt…)
• Modification de composition chimique et production de dérivés toxiques (direct, empilement de
  modifications génétiques)
• Résidus de pesticides (glyphosate…)

                                        Restitution 18 avril 2019                                 2
Comment savoir si les OGM sont toxiques ? Réflexions autour des résultats scientifiques du projet GMO90+
QUEL MODÈLE EXPÉRIMENTAL POUR QUELS OBJECTIFS?
Comment évaluer la toxicité?   Épidémiologie (lien… très difficilement testable)
                               Modèle in vitro ou in silico (non adapté)
                               Modèle in vivo : réglementaire/non réglementaire         Rat (Wistar)

Quels aliments?                Deux maïs (MON 810 et NK 603) et des analyses des grains et des
                               granulés (composés chimiques ciblés et non ciblés par NMR et MS)

Quelles questions?             La question effet « CMR » (cancérogène-mutagène-reprotoxique)? NON
                               Toxicologie réglementaire (LD 408, protocole dérivé de l’évaluation d’un
                               toxique chimique) avec expérimentation en CRO + exposition 6 mois au
                               lieu de 3 mois
                               Analyse complémentaire d’organotoxicité (foie, rein, reproduction,
                               intestin) (biomarqueurs?)
                               Combinaison avec une approche « omique » (biomarqueurs?)
                                   Restitution 18 avril 2019                                           3
Comment savoir si les OGM sont toxiques ? Réflexions autour des résultats scientifiques du projet GMO90+
QUEL MODÈLE EXPÉRIMENTAL POUR QUELS OBJECTIFS?
Comment évaluer la toxicité?       Participants                   Organisation name              COI
                               1     academic      Toxalim INRA, Toulouse (coordination)          -
Quels aliments?
                               2     academic      IMT CNRS, Toulouse                             -
Quelles questions?
                               3     company       Methodomics, Toulouse                          -
Quel consortium?               4     company       Profilomic, Paris                              -
                               5     academic      RDP ENS- INRA-CNRS, Lyon                      +/-
                               6     academic      MycSA INRA, Bordeaux                          +/-
                               7     academic      Fruit biology and pathology INRA, Bordeaux    +/-
   Accord de consortium:       8     academic      INSERM UMR-S 1124, Paris                       -
   INRA, INSERM, Anses
                               9     academic      CRI INSERM, Paris                              -
                               10 academic         Irset INSERM, Rennes                           -
                               11 academic         Laberca, Nantes                                -
                               12 company          CitoxLAB- CRO, Evreux                          -

                               DPI publiées sur le site RiskOGM (ou site d’un autre ministère)
                               http://rechercheriskogm.fr/en/page/partners-pdis

                                     Restitution 18 avril 2019                                         4
Comment savoir si les OGM sont toxiques ? Réflexions autour des résultats scientifiques du projet GMO90+
QUEL MODÈLE EXPÉRIMENTAL POUR QUELS OBJECTIFS?
Comment évaluer la toxicité?   Collaboration avec projets          GRACE                                            G-TwYST                          GMO90+

                                GRACE et G-TwYST (MoU,                            Toxicity studies with whole
Quels aliments?                Memorendum of Understanding)                       food/feed following OECD Test
                                                                                                                                 Toxicity studies with whole
                                                                                                                                 food/feed partly following
                                                                                  Guidelines and EFSA
Quelles questions?                   Comparability                                recommendations:
                                                                                                                                 OECD Test Guidelines and EFSA
                                                                                                                                 recommendations:
                                                                                  • Same Laboratory
                               Comité : R Barouki, X Coumoul,                     • Same rat strain
                                                                                                                                 • Same rat strain
                                                                                                                                 • Same corn harvest
Quel consortium?               F Fourès, P Rogowsky, B Salles
                                                                                  • Same diet manufacturer

Quelles interactions?          • Culture du maïs en
                                                                                                   NK603:
                                                                                                   • 2 Sub-chronic studies
                                                                                                                                       NK603, MON810

                                                                                                     (TG408) 33% and 50%               • 90-day & 180-day
                               commun Complementarity                                                 maize
                                                                                                   • Combined                          • Additional variables
                               • Echange échantillons                  MON810:                        chronic/carcinogenic (TG
                                                                       • Sub-chronic (TG408)
                               • Membre de l’advisory                  • Chronic (TG 452)
                                                                                                      453)

                               board G-TwYST :
                               F Fourès puis B Salles
                                                                                                                                               Gen. public
                                                                                                                                  Scientists
                                       Data dissemination                                              CADIMA                              Risk assessors

Quelle transparence?           Instance de Dialogue : Anses (F Fourès) participation D Demortain
                               Publication des données brutes sur le site CADIMA (https://www.cadima.info/)

                                           Restitution 18 avril 2019                                                                                             5
Comment savoir si les OGM sont toxiques ? Réflexions autour des résultats scientifiques du projet GMO90+
DÉROULEMENT DE L’EXPÉRIMENTATION
                                                                                                        Analyses OMICs (foie et urine)
                                                                                                                 G-TwYST
                                              Analyses statistiques et intégration                           10/2017 > 06/2018

                                             Analyses des échantillons                                                Microbiote intestin
                                08/2015
                                                                                              Colloque de clôture
                                  Expérimentation 6 mois                                                                                 Barrière intestin
  G-TwYST                                                                                         03/2017
                                                                                                                    06/2018                  04/2019
                      04/2015                                             11/2016
                          Fabrication et analyse croquettes
  04/2014
                                                                                                                        Rapport
    Production maïs          Analyses maïs                                                                              Publication

Kick off         Cellule communication (INRA-MTES-INSERM-Anses)
02/2014

                                                                                    COMMUNICATION « 3G »
 Instance de
  Dialogue                   Leçons des 3 projets scientifiques
    05/2014

                                                                  Restitution 18 avril 2019                                                              6
Comment savoir si les OGM sont toxiques ? Réflexions autour des résultats scientifiques du projet GMO90+
PRODUCTION DES DEUX VARIÉTÉS DE MAÏS

                                                                                        Cultures en
                                                                                       collaboration
                                                                                       avec G-TwYST                       Spain, Catalonia
                   USA, Minnesota
R É S U LTAT S

                 Prairie Brand 882RR and 882                                                                     Site 1: Fonolleres
                                                                                                                    Site 2: Bellcaire
                                                                                                       DKC6667YG and near-isogenic DKC6666
                                                 Canada, Ontario
                                               Pioneer 8906R and 8906

                 Paramètres guidant le choix de la culture:
                 génétique, biochimique, contaminants (métaux, POP, mycotoxines) et composition nutritionnelle

                 Analyse des maïs:
                 Pesticides dont glyphosate et AMPA, mycotoxines, génétique, transcriptomique, métabolomique
                 (1H-NMR et LC-QTOF-MS)

                                                                        Restitution 18 avril 2019                                            7
Comment savoir si les OGM sont toxiques ? Réflexions autour des résultats scientifiques du projet GMO90+
CARACTÉRISATION DES GRANULÉS

                                    Pesticides (575 molecules) :
                                    Traces de glyphosate and 4 insecticides dans tous les régimes                                         Les
                                                                                                                                      croquettes
                                    Heavy metals (5 metals):
R É S U LTAT S

                                    Faible concentration As, Cd, Pb and Al dans tous les régimes                                       produites
                                                                                                                                     peuvent être
                                    Persistent Organic Pollutants (15 molecules)
                                    Absence dans tous les régimes
                                                                                                                                    utilisées pour
                                                                                                                                    l’alimentation
                                    Mycotoxins (10 toxins):                                                                             des rats
                                    Traces d’AFB1, faible concentration de DON dans tous les régimes,
                                    faible concentration de Fumonisins dans régime MON810

                 •   Bernillon S et al. (2018) Characterization of GMO or glyphosate effects on the composition of maize grain and maize-based diet for rat feeding,
                     Metabolomics, 14: 36
                 •   Chereau S et al. (2018) Rat feeding trials: Contaminants should be assessed in both grains and resulting pellets, Food Chem Tox, 121: 573-582

                                                                             Restitution 18 avril 2019                                                            8
Comment savoir si les OGM sont toxiques ? Réflexions autour des résultats scientifiques du projet GMO90+
SCHÉMA EXPÉRIMENTAL
                      MON810
                NK603 ± glyphosate                   Experimentation
           Contrôles (proches isogéniques)           animale conduite
                                                        par le CRO
                                                         CitoxLAB
                       Incorporation dans
                           les granulés
                                                       Traitement en
                          11% and 33%
                                                     aveugle ainsi que
                                                       les premières
    3 et 6 mois                                      étapes d’analyse
   alimentation                                          statistique

sang

                                   urine      Échantillons           Observations anatomo-, histo-pathologiques
   foie
                                             tissus/fluides                                                           SANTÉ ?
           rein        gonades                                          Analyses hématologique et biochimique
                  intestin                                                                                        BIOMARQUEURS ?
                                                                                Analyses « omiques »

                                                    Restitution 18 avril 2019                                                9
ECHEC DE CONSTITUTION D’UNE INSTANCE DE DIALOGUE
  Appel à participation (mars 2014) et sélection des demandes: Anses

  Composition de l’instance de dialogue : Confédération paysanne; ONG (CRIIGEN, Grennpeace, Inf’OGM,
  CLCV); Industrie (Europabio/Monsanto, Bayer, Limagrain, ANIA); Anses (F Fourès, R Boutrais, E Pic); INSERM
  (X Coumoul); INRA (B Salles, P Rogowsky, D Demortain); Risk’OGM (J Guillemain, D Thierry)

  1ere et unique réunion: 28 mai 2014 (verbatim consultable sur le site web Risk’OGM)
                                  Boycott par les représentants des ONG

  Pourquoi?
  • ONG « Monsanto invité à s’auto évaluer avec 3 millions d’euros d’argent public» (N Defarge)
  « Insuffisances du protocole et la composition partiale et sans légitimité scientifique de l’instance de dialogue
  créée pour ce projet » (N Defarge)
  Durée de l’expérimentation (N Defarge)

  • Autres explications:
  Implication de CRIIGEN dans un processus de dialogue, d’analyse de protocole et de résultats qui rappellerait
  les défauts intrinsèques du protocole publié par G E Séralini avec une interprétation FAUSSE des résultats
  Evolution d’une société mettant en cause les résultats expérimentaux et l’intégrité des scientifiques…
                                              Restitution 18 avril 2019                                           10
Comment savoir si les OGM sont toxiques ?
R É S U LTAT S

                  RÉSULTATS D’UNE ALIMENTATION DE RATS
                 WISTAR PENDANT 6 MOIS CONTANT DU MAÏS
                      MON 810 OU NK 603 (11 OU 33%)

                                 Restitution 18 avril 2019    11
SIGNES CLINIQUES ET POIDS DES ANIMAUX
Effets sur la croissance et la santé

                                                    Poids corporel des mâles (group A, B and C)                               Poids corporel des femelles (group A, B and C)

                                                    450       a                                                               260
                                                                                                                                        b
                                                    400                                                                       240
                                       Weight (g)

                                                                                                                 Weight (g)
                                                    350                                                                       220

                                                    300                                                                       200

                                                    250                                                                       180

                                                    200                                                                       160

                                                                                                                              140
                                                          0        50        100        150                                         0        50         100        150
                                                                          Days                                                                        Days
  •

                                        Quelques signes cliniques de faible intensité (croissance dents…) sans lien avec les régimes
                                        Aucune différence statistiquement significative entre les régimes sur la croissance des rats

                                                                                           Restitution 18 avril 2019                                                           12
DONNÉES ISSUES DE L’AUTOPSIE
Anatomo- et histo-pathologie

                               Quelques différences mineures sur le poids des organes.
                               Effets non confirmés par les observations en histo-pathologie.
                               Tous les changements macroscopiques sont typiques des cette souche de rat et de leur âge

                               Absence d’augmentation du nombre d’observations macroscopiques à 6 mois en
                               comparaison de 3 mois

                               Absence d’augmentation du nombre d’observations histo-pathologiques à 6 mois en
                               comparaison de 3 mois
 •

                               Aucune tumeur observée

                                                              Restitution 18 avril 2019                                   13
DONNÉES D’HÉMATOLOGIE
                   ANALYSE STATISTIQUE EN AVEUGLE: E (%) (                                    ) et WBC, PWBC (             ) à T180
                   COMPARAISON PAR PAIRES (LEVÉE DE L’AVEUGLE)
analyse sanguine

                                                 Hematology                   males                        females

                                                                                                                                 HÉMATOLOGIE
                                                            TIME
                                                                         90     135     180   90     135             180
                                         PARAMETER
                                         Red blood cells (106/µl)
                                         Haemoglobin (g/dl)

                                                                                                                                 Différences significatives:
                                         Red differential weighin (%)
                                         Mean.corp.haem.conc. (g/dl)

                                                                                                                                 Absence de corrélation en
                                         Mean cell haemoglobin (pg)
                                         Reticulocytes (%)

                                                                                                                                 prenant en compte la
                                         Mean cell volume (fl)
                                         Perox white blood cells (g/l)

                                                                                                                                 durée d’expérimentation,
                                         Packed cell volume (l/l)
                                         Differential (g/dl)

                                                                                                                                 le taux d’inclusion d’OGM
                                                      3
                                         Platelets (10 /µl)
 •

                                         Mean thrombocyte volume (fl)
                                         White blood cells (103/µl)
                                                          3
                                         Lymphocytes (10 /µl)                                                                    dans le régime ainsi
                                         Lymphocytes (%)
                                         Neutrophils (%)                                                                         qu’intra et inter-genres.
                                         Monocytes (%)
                                         Eosinophils (%)
                                         Basophils (%)
                     GM effect           Large unstained cells (%)

                     Glyphosate effect
                     Variety and environment effect

                                                                                      Restitution 18 avril 2019                                                14
DONNÉES DE BIOCHIMIE CLINIQUE
                    ANALYSE STATISTIQUE EN AVEUGLE : A/G ( ), Ca, P, ALB ( ) à T90.
                                                     Na, CREA and ALAT ( ) et absence de différence (                               ) à T180
                   COMPARAISON PAR PAIRES (LEVÉE DE L’AVEUGLE)
analyse sanguine

                   Blood Biochemistry             males                      females
                                                                                                  BIOCHIMIE CLINIQUE
                                      TIME
                                             90    135    180   T90   T135             T180
                   PARAMETER
                   Na+ (mmol/L)
                                                                                                  Différences significatives:
                   K+ (mmol/L)
                   Cl- (mmol/L)
                                                                                                  la plupart ne sont pas reliées au
                   Ca++ (mmol/L)                                                                  temps d’expérimentation, ni au
                                                                                                  taux de maïs OGM inclus dans le
                   PHOS (mmol/L)
                   GLUC (mmol/L)
                   UREA (mmol/L)
                   CREAT (µmol/L)                                                                 régime mais très souvent
                   TOT.BIL (µmol/L)
                                                                                                  rattachées à la variété de maïs
 •

                   PROT (g/L)
                   ALB (g/L)
                   A/G ratio
                                                                                                  (MON 810 versus NK 603)
                   CHOL (mmol/L)
                   TRIG (mmol/L)
                   ALP (U/L)
                   ASAT (U/L)
                   ALAT (U/L)                                                                      GM effect
                   GGT (U/L)
                                                                                                   Glyphosate effect
                   BIL.AC (µmol/L)
                                                                                                   Variety and environment effect

                                                                      Restitution 18 avril 2019                                                15
CIBLAGE D’ORGANES
                  Histologie et immuno-histologie du rein : quelques anomalies mineures à T90 sans relation
                  avec les régimes

                  Absence de différence significative entre les régimes pour les valeurs de
fonction rénale

                         paramètres urinaires simples : volume, densité, pH
                         protéinurie, albuminurie, numération des hématies
                         biomarqueurs de dysfonctionnement rénal précoce (KIM1 et NGAL)
 •

                        Quelque soit le paramètre testé, aucune différence significative n’est
                                        observée entre les différents régimes

                         La fonction rénale n’est pas altéré après 3 mois et 6 mois
                                   d’alimentation quelque soit le régime
                                                  Restitution 18 avril 2019                                   16
CIBLAGE D’ORGANES
                                                                                          0                                                                                      0                                                                                                                 0
                                                                                              IsoNK NK11 NK33     NK-    NK- IsoMON MON       MON                                    IsoNK NK11 NK33     NK-    NK- IsoMON MON                         MON                                             IsoNK NK11 NK33      NK-    NK- IsoMON MON      MON
                                                                                                                  G11    G33         11        33                                                        G11    G33         11                          33                                                                  G11    G33         11       33
                                                                                              n=9    n=4   n=4    n=6     n=4   n=12   n=12   n=12                                   n=9    n=4   n=4    n=6     n=4   n=12   n=11                     n=12                                             n=9    n=4   n=4    n=6     n=4    n=12   n=11 n=12

                       Aucune difference d’expression                                     4
                                                                                                      Jejunum T180 - Subgroup B - Males
                                                                                                        (Kruskal-Wallis test - P=0.0034)
                                                                                                                                                                                 3
                                                                                                                                                                                             Jejunum T180 - Subgroup B - Males
                                                                                                                                                                                               (Kruskal-Wallis test - P=0.0847)
                                                                                                                                                                                                                                                                                                   5
                                                                                                                                                                                                                                                                                                                Jejunum T180 - Subgroup B - Males
                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  (Kruskal-Wallis test - P=0.0148)

                       de proteins de junction                                                               *

                                                                                                                                                                                                                                                                   Claudin-2 relative expression
                                                           Occludin relative expression

                                                                                                                                                     JAM-A relative expression
                                                                                                                                                                                                                                                                                                   4
                                                                                          3
                                                                                                                                                                                 2

                       Expression différentielle
                                                                                                                                                                                                                                                                                                   3
barrière intestinale

                                                                                          2
                                                                                                                                                                                                                                                                                                   2

                       d’occludine dans le jejunum entre                                  1
                                                                                                                                                                                 1

                                                                                                                                                                                                                                                                                                   1

                       les régimes NK11 et NKG11 mais                                     0                                                                                      0                                                                                                                 0

                       absence d’effet en comparaison
                                                                                              IsoNK NK11 NK33     NK-    NK- IsoMON MON       MON                                    IsoNK NK11 NK33     NK-    NK- IsoMON MON                         MON                                             IsoNK NK11 NK33      NK-    NK- IsoMON MON      MON
                                                                                                                  G11    G33         11        33                                                        G11    G33         11                          33                                                                  G11    G33         11       33
                                                                                              n=11   n=7   n=11   n=11   n=12    n=8   n=11 n=12                                     n=11   n=7   n=11   n=12   n=12    n=7   n=11                     n=11                                             n=11   n=8   n=10   n=11   n=12    n=8    n=12 n=12

                       du régime contrôle NK et limite
                                                                                                                                                                                                                                                                                                        Jejunum T90 vs T180

                       de puissance statistique.                                                                                                                                                                                                             800
                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       p
CIBLAGE D’ORGANES
                           EFFET MARGINAL/NÉGLIGEABLE CHEZ LES MALES
                                v Aucune différence de poids des organes (testicules, épididymes, prostate ventrale, vésicules séminales)
                                v Aucune différence dans la réserve de sperme de l’épididyme
Fonction de reproduction

                                v Aucune différence dans le taux circulant de LH
                                v Effet marginal sur la concentration de testostérone intra-testiculaire (ISOMON > MON11)
                                v Aucune différence dans le rapport LH/Testosterone
                                v Difference de concentration d’inhibine B (ISONK vs NK11, NK33, NKG33) à T90

                           AUCUN EFFET CHEZ LES FEMELLES
                                v Aucune différence de poids des organes (uterus, ovaires, vagin)
                                v Aucune différence de concentration circulante d’estradiol
                                v Aucune différence de concentration circulante de LH et FSH
 •

                           AUCUNE MODIFICATION DES TAUX D’HORMONES STÉROÏDES DANS LES URINES
                                v Effet significative à T90 entre les régimes MON et NK chez les
                                v Quelques differences dans le profil des stéroïdes urinaires sans valeur biologique au regard du métabolisme
                                  general de stéroïdogenèse chez les
                                v Aucune différence entre les régimes OGM en comparaison des contrôles non-OGM
                                                                     Restitution 18 avril 2019                                                  18
CONCLUSION 1
                                                 Effect
                                                            Variety and
                  Parameter               GM   Glyphosate
                                                            environment
                                                                                                                    Results

       Feed consumption and body weight   -        -            -
       Clinical observations              -        -            -         Minor clinical signs both gender, no diet effect

       Haematology and clinical
       biochemistry                       -        -            ±
                                                                          Difference in the relative weight of organs in males at T180 in the specific case of kidney,
       Relative organ weights, gross                                      liver, seminal vesicles and thyroid/ Minor macroscopic differences, typical of animals of this
       necropsy and histopathology        -        -            -         age/ Minor microscopic observations with the exception of the reproduction female tractus
                                                                          with cysts in the ovaries more frequent at T180 than T90/ No diet effect

       Urinalysis and kidney physiology   -        -            -
                                                                          The mean number of mast cells in all groups is elevated; a significant increase of mast cell
       Gut barrier integrity              -        -            -         number in the jejunum between T90 and T180- No diet effect
                                                                          At T180, males fed with MON11 show a low but significant reduction of intra-testicular
       Male reproduction                  -        -            -         testosterone concentrations compared to ISOMON. This reduction is not found with MON33
                                                                          diet

       Female reproduction                -        -            -
       Reproductive system                ±       ±             ±         Diets-group difference of urinary endogenous steroid profile appears very low.

•   Coumoul X et al. (2019)The GMO90+ project: absence of biologically relevant difference between rats fed with MON810 or NK603 maize
    diets in comparison with their non-genetically modified near-isogenic controls, Tox Sci. 168: 315–338

                                                                     Restitution 18 avril 2019                                                                             19
CONCLUSIONS DES PROJETS EUROPÉENS
  ABSENCE D’EFFET TOXIQUE D’UN RÉGIME MAÏS OGM CHEZ LE RAT WISTAR

3 MOIS ET 1 AN D’UN RÉGIME AVEC 11 ET 33% DE MAÏS MON 810 (GRACE)
Zeljenkov. D et al (2014) Ninety-day oral toxicity studies on two genetically modified maize MON810 varieties
in Wistar Han RCC rats (EU 7th Framework Programme project GRACE). Arch Toxicol 88:2289–2314

Zeljenkov. D, et al. (2016) One-year oral toxicity study on a genetically modified maize MON810 variety in
Wistar Han RCC rats (EU 7th Framework Programme project GRACE). Arch Toxicol 90:2531–2562

3 MOIS, 1 AN ET 2 ANS D’UN RÉGIME AVEC 11 ET 33% (50%) DE MAÏS NK 603 (G-TwYST)
Steinberg P et al. (2019) Lack of adverse effects in subchronic and chronic toxicity/ carcinogenicity studies on
the glyphosate-resistant genetically modified maize NK603 in Wistar Han RCC rats. Arch Toxicol
https://doi.org/10.1007/s00204-019-02400-1

                                               Restitution 18 avril 2019                                           20
QUE NOUS APPREND L’APPROCHE MULTI-OMIQUES ?

                                             DNA                                                                                             Genomics – 25,000 Genes

Analyse du transcriptome global              RNA                                                                                      Transcriptomics – 100,000 Transcripts
(mRNA) et mirnome (miRNA)
hépatique et rénal
                                            Protein                                                                                         Proteomics – 1,000,000 Proteins

                                                                                                                                  NH2
                                                                                               H OH
                                                             OH

                                         Biochemicals                                                      H O             N
                                                                                                                                        N

                                                                                                                                            Metabolomics – 2,400 Compounds
                                                                        H2
                                                                                         HO

Analyse du métabolome plasmatique
                                                             C          C          CH3
                                                         O        CH         CH               HO                       H

                                         (Metabolites)
                                                                                                       H     OH            N      N
                                                                                                                           H
                                                                  NH2        CH3                   H              OH

(MS) et urinaire (NMR)
                                                                                                                           Confidential

   PEUT-ON IDENTIFIER DES BIOMARQUEURS PRÉCOCES D’ALTÉRATION PHYSIOLOGIQUE ?

                                  Restitution 18 avril 2019                                                                                                                   21
ANALYSE DU TRANSCRIPTOME HÉPATIQUE À 6 MOIS
                                      20
                                                                                                           • Effet du genre
                                                                                                           • Résultats similaires à 3 mois
                 PC2: 2% expl. var.

                                      10
                                                                                                           • Absence d’effet OGM
                                        0
                                                                                                           • Très faible variabilité dues
                                                                                                             aux régimes
R É S U LTAT S

                                      -10
                                                                                                           • Aucun effet des régimes sur
                                      -20
                                                                                                             le mirnome
                                                                                                           • Même résultat pour le
                                            -60 -40 -20   0   20   40   60
                                                                                                             transcriptome rénal
                                                PC1: 61% expl. Var.

                                                                                           6           4
                                                                             X−variate 2: 4% expl. var
                                                                                               2

                                       Séparation de l’effet maïs :
                                                                                           0

                                       variétés/environnement
                                                                              −4 −2        −6

                                                                                                               −4      −2            0            2     4
                                                                                                                            X−variate 1: 2% expl. var

                                                                                                                Restitution 18 avril 2019                   22
ANALYSE DU MÉTABOLOME PLASMATIQUE
                                                                                                                                                                              F E M E L L E S
                                        ISONK                                     NK11                                    NK33                                  NK-G11                                  NK-G33                              ISOMON                                MON11                           MON33

                  Time           90       135            180               90      135            180             90       135           180             90       135            180             90       135          180             90     135           180             90      135          180       90       135         180

                                            female
                 ISONK                                                                         X205 X198                   X19                                                                                         X210                   X10           X10         X210       X210        X210 X10   X210     X210        X210
                          male

                                                                                                                                                                                                                                                                                 X210 X205                       X210 X205
                                                                                      female                                                                                                                                                X10 X205      X10 X205                             X10 X205
R É S U LTAT S

                  NK11                                                                                                                                                                                                                         X19          X198
                                                                                                                                                                                                                                                                        X10      X19 X152
                                                                                                                                                                                                                                                                                                 X198
                                                                                                                                                                                                                                                                                                          X210   X19 X152    X205 X198
                                                                    male                                                                                                                                                                                                            X265                            X265

                                                                                                                             female
                  NK33                                                                                                                                                                                                                        X10           X268                 X210 X10      X10 X268   X210     X210        X268
                                                                                                           male

                                                                                                                                                                     female                                                                                                      X10 X205                        X210 X205
                 NK-G11                                                                                                                                                                                                                     X10 X19       X210 X10      X210
                                                                                                                                                                                                                                                                                 X152 X265
                                                                                                                                                                                                                                                                                               X210 X10   X210
                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 X19 X152
                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               X210
                                                                                                                                                  male

                                                                                                                                                                                                            female                                        X10 X210               X210 X10      X210 X10
                 NK-G33                                                                                                                                                                                                            X210     X210 X10
                                                                                                                                                                                                                                                            X205
                                                                                                                                                                                                                                                                        X210
                                                                                                                                                                                                                                                                                 X198 X205       X205
                                                                                                                                                                                                                                                                                                          X210   X210 X205   X210 X205
                                                                                                                                                                                          male

                                                     X10 X19 X159                           X10 X268 X19                                                                      X10 X268
                                                                                                                                                   X10 X159
                           X10 X159    X153 X10       X154 X205      X10 X159    X153 X10    X159 X154      X10 X159    X153 X10      X10 X268                 X153 X10       X19 X159     X10 X159    X153 X10      X10 X268                    female
                 ISOMON    X154 X153   X159 X154      X153 X160      X154 X153     X154      X205 X153      X154 X153   X159 X154       X159
                                                                                                                                                   X154 X153
                                                                                                                                                               X159 X154      X154 X205    X154 X153   X159 X154       X205
                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    X10
                                                                                                                                                     X175                                                                       male
                                                         X198                                   X265                                                                             X265
                                                                                              X10 X19                                                                          X10 X19
                                                     X10 X19 X159
                                                                                             X159 X154      X10 X159                  X10 X159                                X159 X154
                           X10 X159    X153 X10       X154 X205       X10 X159                                          X153 X10                    X10 X159                               X10 X159    X153 X10      X19 X205                                                         female
                 MON11     X154 X175     X159         X153 X210      X154 X175
                                                                                   X210      X205 X153      X154 X153
                                                                                                                        X159 X154
                                                                                                                                      X154 X153
                                                                                                                                                   X154 X175
                                                                                                                                                                              X205 X153
                                                                                                                                                                                           X154 X175   X159 X154       X210
                                                                                             X210 X160        X175                      X160                                  X210 X160
                                                                                                                                                                                                                                                                     male
                                                         X160
                                                                                                X265                                                                             X265
                                                     X10 X268 X19
                           X10 X159                                  X10 X159               X10 X268 X19    X10 X159                  X10 X268                                X10 X268     X10 X159
                                                      X159 X154                                                         X153 X10                   X10 X159                                            X153 X10      X268 X19
                 MON33     X154 X153   X153 X10
                                                      X153 X210
                                                                     X154 X153               X159 X154      X154 X153
                                                                                                                        X159 X154
                                                                                                                                      X159 X154
                                                                                                                                                   X154 X175
                                                                                                                                                                               X19 X159    X154 X153
                                                                                                                                                                                                       X159 X154       X205
                             X175                                      X175                  X205 X153        X175                      X153                                  X154 X153      X175
                                                         X160

                                                                                                                          M A L E S                                                                                                                                                                         Effet OGM
                                                                                                                                                                                                                                                                                                            Effet glyphosate
                                                                                                                                                                                                                                                                                                            Effet variété
                 La différenciation entre les régimes reposent sur quelques métabolites fréquemment retrouvés en concentration
                 différente entre les deux maïs (effet variété ou environnement) :
                           stachydrine, méthionine sulfoxyde, KMBA, 1-5 anhydro D sorbitol pour les males
                           stachydrine, ergothionéine, eugénol, 2-furoic acide pour les femelles
                                                                                                                                                  Restitution 18 avril 2019                                                                                                                                                           23
ANALYSE DU MÉTABOLOME
                                       URINAIRE

                           • Analyse globale :
R É S U LTAT S

                                  • Effet du genre
                                  • Pas de séparation des régimes à T90, T135
                                     et T180
                                  • Très faible variabilité due aux différents
                                     régimes

                           • Analyse PLS-DA
                                  • Séparation de l’effet variété/environnement
                                  • Quelques faibles variations entre les maïs

                 Restitution 18 avril 2019                                   24
RÉCAPITULATIF DES DONNÉES DE MULTI-OMIQUES

                                                                                                                  EFFECT
                                                                GMO                                              Glyphosate                          Variety and environment
    PARAMETER           ORGAN/FLUID             MALE                      FEMALE                   MALE                       FEMALE              MALE                         FEMALE
       Transcriptomic

                           LIVER                                                                                                        Gpx1, Sepw1, Selk, Stx18 Gpx1, Sepw1, RGD1563348

                                                                                                                                           RGD1563348, Gpx1,
                          KIDNEY                                                                                                                                             RGD1563348
                                                                                                                                              Sepw1, Selk

                                                                                                                                          stachydrine, methionine
                                                                                                                                             sulfoxide, 2-ceto-4-
                                                                                                                                                                       stachydrine, ergothioneine,
                          PLASMA                                                                                                            methylthiobutyric acid
       Metabolomic

                                                                                                                                                                        eugenol and 2-furoic acid
                                                                                                                                        (KMBA), 1-5 anhydro-d433
                                                                                                                                                    sorbitol
                                                                        glucuronic acid,                                                      cis-aconitic acid,
                                      citric acid / 2-oxoglutaric        indoxylsulfate/                                                      pantothenic acid,
                          URINE                                                                 indoxylsulfate                taurine                                      2-oxoglutaric acid
                                                  acid                dimethylamine and                                                  trigonelline, 2-oxoglutaric
                                                                        glycocholic acid                                                             acid

•    Coumoul X et al. (2019)The GMO90+ project: absence of biologically relevant difference between rats fed with MON810 or NK603 maize
     diets in comparison with their non-genetically modified near-isogenic controls, Tox Sci. 168: 315–338

                                                                                     Restitution 18 avril 2019                                                                                       25
CONCLUSION 2
EFFET GLYPHOSATE?
Quelques variations de faible valeur dans la concentration de metabolites urinaires qui ne sont pas
associées à une quelconque perturbation biologique

EFFET VARIÉTÉ ET ENVIRONNEMENT?
Un effet clairement observé en lien avec une majorité de differences statistiquement significatives
entre les régimes MON 810 et NK 603

EFFET OGM?
Seules les données de métabolome urinaire permettent de séparer plus ou moins facilement les
régimes mais sans lien avec un effet physio-pathologique

                                         Restitution 18 avril 2019                                    26
CONCLUSION GÉNÉRALE
Des résultats inattendus issus de l’analyse des croquettes
   • pesticides
                       Ne pas restreindre les analyses aux seuls OGM
   • glyphosate

Les analyses chez le rat en métabolomique et transcriptomique différencient
       le genre
       l’origine du maïs (variété génétique et environnement)
       mais ne discriminent pas un OGM de son contrôle non OGM
       Absence d’identification de biomarqueurs d’effet

Les résultats issus des expérimentations en muti-omiques renforcent la conclusion sur
l’absence d’effet d’une alimentation avec du maïs OGM par comparaison avec le contrôle non-OGM

Durée d’expérimentation : aucune valeur ajoutée d’une expérimentation à 6 mois par rapport
à 3 mois

Résultats d’une expérimentation recherchant un potentiel effet toxique de deux maïs
et non DES OGM
                                    Restitution 18 avril 2019                                27
ET QUELQUES RÉFLEXIONS …
Quid de l’essai réglementaire sur rongeur à 3 mois (regulation 503/2013) ?
   ü Caractérisation génétique et modifications de composition chimique (utilisation des approches ciblées et
      non ciblées)
   ü Décision au cas par cas
   ü Si absence de composés nouveaux potentiellement toxiques : inutilité d’une analyse non ciblée sur la
      base d’une alimentation des rats pendant 3 mois
   ü Si nouveaux composés exprimés par la plante : analyse toxicologique sur la base d’essais in vitro/in vivo
      (in silico)
   ü Approche compatible avec la règle des 3Rs (Replace, Reduce, Refine; Directive n° 2010/63/UE)
Quelle est l’utilité d’une nouvelle construction OGM proposée ?

Très souvent utilisation d’un couple OGM/pesticides. Toxicité des pesticides principalement
hors aliment

OGM et autres effets que ceux sur la santé humaine
   ü Impact sur la faune et la flore
   ü Impact sur les pratiques agricoles
   ü Impact économique
   ü Impact des pesticides associés
                                           Restitution 18 avril 2019                                        28
ET QUELQUES RÉFLEXIONS …
     « L’affaire Séralini »
          ü Erreur du comité éditorial de Food Chem Tox avec le processus de rétractation de l’article
          ü Erreur de communication de différentes instances scientifiques (pétitions, communications des académies…) avec la
             production d’un effet de victimisation
          ü L’expérimentation cible le NK603 et non LES OGM
          ü Peu de demandes sur les déclarations de conflits d’intérêts des auteurs
          ü Excellente organisation des « anti-OGM »
     Face à   l’hypermédiatisation de l’article de GE Séralini pourquoi le quasi-silence sur les résultats de GMO90+ ?
         ü     Une dévalorisation des résultats négatifs
         ü     Un mode de fonctionnement des média en circuit répétitif à partir d’un blog, d’un communiqué de l’AFP…
         ü     Une communication minimale de GMO90+ (colloque final…)
         ü     Un comparatif systématique des résultats de GMO90+ par rapport à ceux de GE Séralini (fausse controverse)

                 GE Séralini a perdu scientifiquement mais a gagné médiatiquement et politiquement

    Comment déjouer la méfiance envers les « sachants »?

«Douter de tout, ou tout croire, sont deux attitudes également commodes, qui l’une et l’autre nous dispensent de réfléchir.» Henri Poincaré

                                                         Restitution 18 avril 2019                                                     29
PRODUCTIONS ISSUES DE GMO90+
33 Réunions : consortium (9), cellule communicaton (11), projets EU (7), CS Risk’OGM (6) et un colloque final

Rapport final communiqué en février 2018: 123 pages + 16 Annexes (454 pages)
Données brutes publiées sur le site CADIMA
Communication : média, conférences
Publications scientifiques:
•   Schiemann et al. (2015) Archiv. Tox             Soumission:
•   Tardivel P et al. (2017) Metabolomics           •   R Mesnage et al Food Chem Tox. Relationship between faecal microbiota and plasma
•   Tardivel P et al. (2018) Inverse Problems           metabolome in rats fed NK603 and MON810 GM maize from the GMO90+ study
•   Bernillon S et al. (2018) Metabolomics
                                                    En préparation:
•   Chereau S et al. (2018) Food Chem Tox           •   H Robert et al. Effect of maïs based diet on the mastocyte density in the gut barrier
•   Coumoul X et al. (2019) Tox. Sciences           •   P.B Joly et al. How to study the toxic effects of long term/low doses exposition to new
                                                        food products?

    DEVENIR DES PERSONNES RECRUTÉES EN CDD
•    Bérengère Broux-Laporte (PhD) IR gestion du projet > recrutée en CDI par la société Europa au 01/07/2017
•    Kadidiatou Dandere (M2) IE qualiticienne > formatrice CDD puis recrutée en CDI par la société Areva S.A le 15/01/2018
•    Patrick Tardivel (agrégé math) IE doctorant > chercheur postdoctoral à l’Université de Wroclaw (PL)
•    Ludmila Juricek (PhD) IE biologie moléculaire > 2e post doc au CEA Fontenay-aux Roses
•    Yael Kaddouch-Amar (M2) AI biostatistiques > CDD IE à l’Institut Curie, CDI 05/2019 chez Asfalia

                                                        Restitution 18 avril 2019                                                             30
Merci à
   Jean-Philippe    Antignac               LABERCA-ONIRIS                           Elisabeth    Jeunesse          ENVT
   Natahlie         Arnich                 Anses                                    Caroline     Le Gall           Methodomics
   Robert           Barouki                INSERM-Université Paris Descartes        Bérengère    Laporte           INRA-Université Toulouse 3
   Laureline        Berthelot              INSERM-Hopital Cochin                    Julie        Laurent           Methodomics
   Simon            Broudin                Profilomic                               Yannick      Lippi             INRA-Université Toulouse 3
   Cecile           Canlet                 INRA-Université Toulouse 3               Ludmila      Juricek           INSERM-Université Paris Descartes
   Xavier           Coumoul                INSERM-Université Paris Descartes        Yael         Kaddouch-Amar     INSERM-Université Paris Descartes
   Bruno            Corman                 Profilomic                               Annick       Moing             INRA
   Jérome           Cotton                 Profilomic                               Marie-Line   Morvan            LABERCA-ONIRIS
   Jean-Pierre      Cravedi                INRA-Université Toulouse 3               Claire       Naylies           INRA-Université Toulouse 3
   Kadiatou         Dandere-Abdoulkarim    INRA-Université Toulouse 3               Florence     Richard-Forget    INRA-Université de Bordeaux
   Laurent          Debrauwer              INRA-Université Toulouse 3               Peter        Rogowsky          INRA-CNRS-ENS-Université de Lyon
   Christèle        Desdoits-Lethimonier   INSERM-Université Rennes                 Nicolas      Savy              CNRS-Université Toulouse3
   Franck           Fourès                 Anses                                    Rémi         Servien           CNRS-Université Toulouse3
   Pierre Antoine   Gourraud               Methodomics                              Marie        Tremblay-Franco   INRA-Université Toulouse 3
   Bernard          Jégou                  INSERM-Université Rennes

et aux membres du CS du programme Risk’OGM

                                                 Discussion
                                                                Restitution 18 avril 2019                                                              31
Vous pouvez aussi lire