Dynamique et génétique des populations de primates en danger - Pascaline Le Gouar Nelly Ménard - Sciencesconf.org

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Dynamique et génétique des populations de primates en danger - Pascaline Le Gouar Nelly Ménard - Sciencesconf.org
17 avril 2018

   Dynamique et génétique des
populations de primates en danger

Pascaline Le Gouar
  Nelly Ménard
   Equipe PaysaClim
Dynamique et génétique des populations de primates en danger - Pascaline Le Gouar Nelly Ménard - Sciencesconf.org
Contexte de conservation

      Prés que ¾ des espèces de primates considérées
              comme menacées (IUCN 2008)

                           Menaces principales

   Modification de l’habitat       Prélèvement         Maladies
     et de leurs usages            par l’homme        émergentes

                     Fonctionnement des populations

       Démographie              Génétique         Comportement
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Question générale

  Comment les espèces sociales répondent aux
               perturbations?

        Comprendre ces réponses afin d’apporter des
          éléments de réflexion aux décideurs de la
                       conservation
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2 programmes principaux

  Le magot (Macaca
       sylvanus)
    vivant dans un
 écosystème forestier
     en mutation

                        Parc Ifrane

                                      Le gorille de plaine de
                                      l’Ouest (Gorilla gorilla
                                         gorilla) face aux
                                      maladies émergentes
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Mais pourquoi la station?

 Plateau génétique spécialisé pour
 l’étude de ADN dégradé issu de
 l’échantillonnage non invasif
 (marche en avant stricte)

 et la cantine bien évidemment!
Dynamique et génétique des populations de primates en danger - Pascaline Le Gouar Nelly Ménard - Sciencesconf.org
17 avril 2018

Ecosystème agro-sylvopastoral et
       magots au Maroc

Nelly Ménard
    CNRS
Equipe PaysaClim
Dynamique et génétique des populations de primates en danger - Pascaline Le Gouar Nelly Ménard - Sciencesconf.org
Le magot: singe des forêts tempérées
Dynamique et génétique des populations de primates en danger - Pascaline Le Gouar Nelly Ménard - Sciencesconf.org
Les habitats

      Espèce spécialiste pour la structure d’habitat
Dynamique et génétique des populations de primates en danger - Pascaline Le Gouar Nelly Ménard - Sciencesconf.org
Les habitats

      Espèce spécialiste pour la structure d’habitat
Dynamique et génétique des populations de primates en danger - Pascaline Le Gouar Nelly Ménard - Sciencesconf.org
Les habitats

      Espèce spécialiste pour la structure d’habitat
Les habitats

      Espèce spécialiste pour la structure d’habitat
Les habitats

      Espèce spécialiste pour la structure d’habitat
Interactions hommes/forêt/singes
                                     Mer méditerranée

                                                        Gouraya
                                          Alger

  Océan
  atlantique
                                   Djurdjuraendémique du
  Les magots: espèce à valeur patrimoniale
  Maghreb,
     Rabat en danger d’extinction.
                                                 Akfadou
  Objectif: comprendre l’influence de l’usage des forêts et des
  zones agro-pastorales par l’homme sur les populations de
  singes.

  Sites d’étude: écosystèmes
                  Moyen Atlas forestiers du Moyen Atlas (Maroc).

                         Maroc        Algérie           0   100 km

                      Populations de magots
Exploitation par l’homme

 Surpâturage: 800 000 moutons
Exploitation par l’homme

 Surpâturage: 800 000 moutons

 Ebranchage
Exploitation par l’homme

 Surpâturage: 800 000 moutons

 Ebranchage

 Mauvaises pratiques sylvicoles
Exploitation par l’homme

 Surpâturage: 800 000 moutons

 Ebranchage

 Mauvaises pratiques sylvicoles

 Utilisation excessive de
 toutes les ressources
 forestières
Exploitation par l’homme

 Surpâturage: 800 000 moutons

 Ebranchage

 Mauvaises pratiques sylvicoles

 Utilisation excessive de
 toutes les ressources
 forestières

 Mise en cultures des
 pâturages communaux
 traditionnels en bordure ou
 dans la forêt
L’écorçage
Les raids dans les cultures
Les questions de recherche
                      Ecologie comportementale
               Démographie et dynamique des populations
                      Génétique des populations
 Comprendre l’influence des perturbations anthropiques sur le
  fonctionnement des populations de singes et leur dynamique.
 Etudier les adaptations comportementales des individus face aux
  modifications de leurs habitats.
 Etudier l’influence de la fragmentation des habitats sur la diversité
  génétique des populations.
 Comprendre les modes de dispersion des animaux entre populations.
 Etudier le potentiel de restauration de corridors entre fragments
  d’habitats.
 Analyser les causes et l’ampleur des conflits hommes/singes en couplant
  sciences de l’écologie et sciences sociales.
          Implications pour la conservation de l’espèce
Statut des magots

    Effondrement des populations

    Changement des structures démographiques

    Le renouvellement des populations n’est plus assuré
Les causes

 Pression de pâturage :
 forte compétition alimentaire.

 Surexploitation de toutes
 les ressources forestières
 par l’homme.

 Braconnage massif:
 filières de revente vers l’Europe
 comme animaux de compagnie.
Les causes

 Pression de pâturage :
 forte compétition alimentaire.

 Surexploitation de toutes
 les ressources forestières
 par l’homme.

 Braconnage massif:
 filières de revente vers l’Europe
 comme animaux de compagnie.
Etudes en cours

Restauration de corridors

Fragmentation et génétique
des populations
Etudes en cours
  Projet « conflits hommes/singes »
17 avril 2018

    Impact des maladies sur le
fonctionnement des populations de
             Gorille

 Pascaline LE
   Gouar
     UR1
 Equipe PaysaClim
Le gorille et son habitat
Le gorille et son habitat
Le gorille et son habitat
Le gorille et son habitat
Le gorille et son habitat
Les maladies étudiées

                                       Maladie de peau de type pian

             Crash
          démographique                         Impact le potentiel
                                                 reproducteur des
                          Transmises par              mâles
                              contact
                          Commune avec
                             l’homme
Les questions de recherche

  Quels sont les impacts d’Ebola sur le               Quelles sont les modifications
  potentiel évolutif des populations de              sociale et démographique après
                 gorilles?                                        Ebola?
       Analyse de la diversité génétique
                                                    Analyse de la structure démographique
              avant/après Ebola
                                                              avant/après Ebola
Sélection certains génotypes dans la population :
                                                       Estimation des taux de survie et
        étude particulière sur les gènes
                                                        de dispersion (modèles CMR)
 du complexe majeur d’histocompatibilité (CMH)

  L’étude de la structure démographique, sociale, et génétique permet-elle de
           détecter une signature du passage de l’épizootie Ebola ?

   Quelles sont les capacités de récupération des populations affectées par
                                    Ebola ?
                     Modélisation du devenir des populations
                                                    ARN IDiPop 2012-2016 et sa suite
Les questions de recherche
     La présence de la maladie de Pian affecte-t-elle les choix de
                       dispersion des femelles?
            Analyse des taux d’émigration et immigration par groupe
      en fonction de la présence de la maladie (Thèse Alice Baudouin 2017)

       Probabilité de quitter                             Probabilité de rejoindre
       un groupe                                                       un groupe

       Nb individus affectés par le pian              Sans pian        Avec pian

    Existe-t-il un lien entre la présence de la maladie de pian et la
                          fitness des individus?
Comparaison de la variabilité des gènes CMH entre individus atteints et non atteints
    Analyse de la survie des individus en fonction de leur niveau d’infection
                    Projet PIAGO Défi émergent UR1 2018
Remerciements
Participants de l’équipe aux études sur les magots :
Nelly Ménard, Pascaline Le Gouar, Dominique Vallet, Yann Rantier,
Jean-Sébastien Pierre, Alain Butet, Aude Ernoult, Françoise Burel.
A. Foulquier, S. Dupé, A. Saintvannes, P. Motsch, G. Le Flohic, A. Delahaye
(stagiaires)

Partenaires:

Financements:
Participants de l’UMR aux projets gorilles :
Nelly Ménard, Pascaline Le Gouar, Dominique Vallet, Alice Baudouin, Armel
Salmon, Julien Boute, Jean-Sébastien Pierre.
 Nous remercions vivement:
 - l’équipe d’ECOFAC pour la logistique, l’assistance et les permissions pour travailler dans le
 parc d’Odzala: C. Aveling, B. Djoni-Djimbi, JM Froment, P Marshal, P Montuir, P Mortier, T
 Smith, J de Winter, P. Ngouembe, H. Ibata, G. Mpion, A. Itoua Malima, G. Mbiemi, G. Le Flohic
                                         - C. Genton, F Levrero, S Gatti, M Douadi, D Caillaud, R.
                                         Cristescu, E. Bigot, P. Besnard, P. Motsch, qui ont
                                         collecté les données lors de leur thèse

                                         - R. Andembo, J-B. Lépalé, S. Yaba NGouma, S. NGouma,
                                         R. Babena, F. Koyi, C. Boyoko, G. Ngoya, R. Ipépé, E.
                                         NGouanda, S. Obeyi , M. MBongouabeka, R. Mimiessi,
                                         R. Anengo pour leur aide sur le terrain
 Financements:
 - programme ECOFOR (Ministère de l’Ecologie, France)
 - programme Espèces-Phares program (DG Environnement, UE)
 -Programme ANR JC 2011 IDiPOP http://ecobio.univ-rennes1.fr/IdiPop/
                                     Festival Art et Nature
Le braconnage
Thank you
Le gorille des plaines de l’Ouest
                        Dispersion des femelles

      Les facteurs affectant la dispersion secondaire des femelles (thèse A.
      Baudouin 2017): prise en compte d’une maladie de peau (pian ou
      apparentée)
        Evolution et transmission du pian: l’exemple d’un enfant de Sergio

                                             janvier 2009             mars 2010
                                              (+ 4 mois)             (+ 1an 1/2)
Transmission par contact lors de
         l’allaitement
        (29 août 2008)

                                         MNHN – 19 mars 2018
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