FORMATIONS DOCTORALES 2020-2021 - Ecole doctorale ...

FORMATIONS
DOCTORALES 2020-2021

Table des matières

Formations professionnalisantes et langues
Anglais                                                          Page 5
Français Langue Etrangères                                       Page 7
Doctorat et poursuite de carrière                                Page 8
La pédagogie par projet : Initiation et expérimentation          Page 10

Formations à la recherche et à la méthodologie de la recherche
Formation à l’expérimentation animale                            Page 12
Introduction aux nanotechnologies expérimentales                 Page 13
Débuter ses recherches en LSHS : panorama des ressources
documentaires                                                    Page 14
Initiation à Zotero                                              Page 16
Zotero atelier                                                   Page 18
Rendez-vous avec un bibliothécaire                               Page 20
Introduction aux enjeux liés aux données de la recherche         Page 21
Premiers pas sur HAL                                             Page 22
Introduction à l’identité numérique du chercheur                 Page 23
Rédaction d’articles en anglais                                  Page 24
Formation à la communication et à la médiation scientifique      Page 25

Qualité de la recherche
Intégrité scientifique dans les métiers de la recherche          Page 28
Conseils à l’expatriation                                        Page 30
Prévention et lutte contre les violences sexistes et sexuelles   Page 31
Info Compilatio                                                  Page 32
Protection des données à caractère personnel dans les
projets de recherche                                             Page 33

Culture élargie
Modélisation mathématique de phénomènes biologiques   Page35
Analyse informatique des données scientifiques        Page 36
Calcul Hautes performances                            Page 37

FORMATIONS PROFESSIONNALISANTES
           ET LANGUES

 Anglais
 Français Langue Étrangère
 Doctorat et poursuite de carrière
 La pédagogie par projet : Initiation et
  expérimentation

Anglais

Informations

       (1) Anglais de communication niveau Intermédiaire-avancé
       (2) Anglais de communication niveau faux débutant-intermédiaire
       (3) Cours hybride, Toeic et anglais de communication

Descriptif
(1) Visionnement de vidéos sélectionnées de la télévision américaine (séries, Youtube,
chansons...) Soutien et travail individualisé sur les points faibles de l'expression dans tout les
domaines (compréhension orale, expression orale, etc.) Discussion et débats sur des sujets
divers et de l'actualité.
(2) Révision des bases de grammaire et structure de la langue anglaise grâce à l'étude de
documents authentiques, (articles de presse, courtes vidéos et le vocabulaire lié à ceux-ci).
Participation à des débats et discussions à partir des documents étudiés. Travail systématique
et personnalisé sur l'expression écrite et orale ainsi que la compréhension écrite et orale.
Initiation à la rédaction.
(3) Préparation systématique et personnalisée à l'examen de Toeic. Possibilité de passer le
Toeic Officiel sur place à la fin d'année.
Travail sur les aspects divers de la langue (compréhension et expression orale,
compréhension et expression écrite). Discussions et débats sur des sujets divers et de
l'actualité ainsi que l'étude des documents authentiques (vidéos, articles de presse, etc.)
Objectifs de l’intervention

(1) Améliorer et renforcer le niveau d'anglais, surtout la compréhension et l'expression orale.
Enrichir le vocabulaire, apprendre des expressions et connaître la culture américaine.
Améliorer l'expression écrite.
(2) Construire une base solide de la langue (grammaire, syntaxe, vocabulaire). Savoir
s'exprimer correctement sur les sujets divers et variés. Savoir s'exprimer à l'écrit et
comprendre l'anglais oral avec plus de facilité.
(3) Obtenir au 785 (niveau B2) sur le test Toeic. Améliorer ses compétences en langue
anglaise.

Pré-requis :
(1)    Maitriser la base de la langue, pouvoir s'exprimer sur des sujets divers plus au moins
correctement (minimum : un niveau qui s'approche de B2)

(2)    Petite base et notions de la langue anglaise. (minimum : un niveau qui s'approche de
A2)

(3) Maitriser la base de la langue, pouvoir s'exprimer sur des sujets divers plus au moins
correctement (minimum : un niveau qui s'approche de B2)

Durée : 24 heures – 8 séances de 3 heures

Effectif par session : Jusqu'à 15 étudiants

Formateurs

Grill, Gary - responsable des trois formations, enseignant permanent à l'Institut Galilée

(1) Grill, Gary - Enseignant permanent à l'Institut Galilée

(2) Joseph O’Driscoll - Enseignant permanent à l'Institut Galilée

(3) Samira Berqoqi - Enseignante vacataire à l'Institut Galilée

Coordonnées :

(1)    grill@univ-paris13.fr

Tél : 01 49 40 40 48 ou 06 83 84 60 60

(2) joseph.odriscoll@univ-paris13.fr
(3) berqoqi_samira@yahoo.fr

Français Langue Etrangère

Informations
Ce cours vise à atteindre le niveau A2 du CECRL (niveau intermédiaire ou de survie) qui
évalue une compétence d'utilisateur élémentaire. A travers la mise en œuvre d'une approche
communicative et d'une démarche actionnelle, le cours s'articule autour d'une progression
grammaticale, lexicale et interculturelle, qui repose sur un ensemble d'activités de production
et de compréhension écrites et orales de niveaux A1-A2.

Descriptif
Objectifs de l’intervention : L'étudiant(e) sera ainsi amené(e) à développer des compétences
de communication, dans le cadre des quatre activités langagières (PE /PO/CE/CO) et à
produire, entre autres, des énoncés simples qui visent à satisfaire des besoins concrets et
immédiats.

Durée : 24 heures (6 séances de 4 h)

Effectif par session : 15 doctorants

Formateur
Moussion Frédéric / UFR LLSHS / Espace Langues
Mel : frederic.moussion@univ-paris13.fr
Tél : 06 67 38 82 98

Doctorat et poursuite de carrière

    MOOC
    https://phdooc.moocit.fr/courses/course-v1:PHDOOC+PHDOOC-001+4/about

    Objectifs d’apprentissage

    Le doctorat mène à une multitude de carrières mais de nombreux doctorants ne savent pas
    où s’informer. Ils se sentent isolés et manquent de temps pour préparer leur avenir. Pourtant
    les actions en faveur de la poursuite de carrière des docteurs se multiplient.

    L'objectif est de construire un espace d’information, d’échange et d’entraide sur la thématique
    de la poursuite de carrière des docteurs.

    Contenu et objectifs spécifiques

          Amener les doctorants et les docteurs à construire leur portefeuille de compétences
          Les sensibiliser aux carrières possibles après la thèse
          Leur donner les moyens d’élaborer leur projet professionnel
          Les amener à construire leurs outils de communication
          Les former à la démarche de recherche d’emploi
          Favoriser la création d’une communauté se basant sur le partage, la collaboration et
           l’entraide.
          Permettre aux participants de développer leur réseau

    Le MOOC s'organise en 5 Unités :

    Parcours

    Deux parcours de formation sont proposés :

   Le parcours “commun” demande environ 2 heures de travail par semaine. La validation de
    ce parcours se fait grâce à des quiz et des activités collaboratives.

   Le parcours “avancé” demande une charge de travail estimée à 4 heures par semaine. En
    plus du parcours commun, le participant doit réaliser deux évaluations par les pairs pour
    valider ce parcours.
   Les deux parcours sont entièrement réalisables en français et en anglais et les ressources
    recontextualisées.

    L’accès aux deux parcours “commun” et “avancé” est gratuit et ils sont tous deux réalisables
    à tout moment pendant la période d'animation du MOOC.

    Caractéristiques pédagogiques

    MOOC signifie « Massive Open Online Course », il s’agit d’un cours entièrement en ligne,
    gratuit, accessible à tous et limité dans le temps. L’apprentissage est autonome et s’articule
    autour de ressources et d’activités pédagogiques. Les participants forment une communauté
    d’apprenants, ils s’entraident et peuvent interagir avec les auteurs grâce aux forums.

    Il existe plusieurs types de MOOC, le modèle que nous avons choisi est le MOOC pour « social
    MOOC ». Ainsi, les apprenants sont encouragés à enrichir le contenu pédagogique et une
    grande place est laissée aux activités collaboratives et aux échanges.

    Un équipement information connecté à internet est nécessaire, ainsi qu'un niveau basique
    pour son utilisation.

La pédagogie par projets
                       Initiation et expérimentation

Informations
La formation d’une journée est consacrée à la conception et à la coordination de projets
étudiants en équipe.

Il s'agit d'acquérir des bases en pédagogie par projets, qui favorise l’autonomisation des
étudiants autour d’une idée à mettre en œuvre collectivement, en s’appuyant sur leurs
compétences complémentaires au sein du groupe. L’étudiant devient acteur de son
apprentissage, dans un but didactique, créatif ou professionnalisant.

Compétences développées
     Mettre les apprenants en situation de travail pour concevoir et réaliser un projet
      (organisation d’événements ou création d’un média universitaire par exemple) ;
     Favoriser la dynamique de groupe et l’autonomie des étudiants ;
     Pratiquer une pédagogie différenciée (déléguer et répartir les tâches selon les
      compétences des étudiants) ;
     Améliorer et évaluer la qualité des réalisations par étapes ;
     Accompagner et évaluer l’acquisition progressive de compétences.

L'organisation de la formation repose sur une mise en situation des doctorants eux-mêmes,
amenés à concevoir des projets pour leurs cours selon une progression par séquences et
séances successives, en mobilisant des moyens logistiques et des partenariats, en vue
d’acquérir les aptitudes utiles à l’organisation, à la coordination et à l’évaluation de réalisations
collectives.

Objectifs de l’intervention
     Comprendre les enjeux pédagogiques et les modalités d'accompagnement des projets
      en SHS ;
     Etre en mesure de familiariser les étudiants avec des méthodes de travail adaptées à
      leurs projets ;
     Accompagner les étudiant en encourageant leur autonomie ;
     Elaborer des outils d’évaluation des travaux de groupes.

Pré-requis
Être doctorant en sciences humaines et sociales (chargé de cours/TD ou souhaitant
enseigner).

Durée : 6 heures
Effectif par session : 15

Formatrice
Judith Mayer
Mel : judith.mayer@univ-paris13.fr
Téléphone : 06 30 02 14 87

FORMATIONS A LA RECHERCHE ET A LA
 MÉTHODOLOGIE DE LA RECHERCHE

 Formation à l’expérimentation animale

 Introduction aux nanotechnologies
  expérimentales

 Méthodologie de la recherche

  - Débuter ses recherches en Lettres et Sciences Humaines et
  Sociales - Panorama des ressources documentaires
  - Initiation à Zotéro, logiciel de gestion des références
  bibliographiques
  - Zotéro – atelier
  - Rendez-vous avec un bibliothécaire
  - Introduction aux enjeux liés aux données de la recherche

 Premiers pas sur HAL : devenez acteur de l’Open
  Access

 Introduction à l’identité numérique du chercheur
  et aux réseaux sociaux de la recherche

 Scientific writing and publication in English

 Formation à la communication et à la médiation
  scientifique

Formation à l’expérimentation animale

Certification à l’expérimentation animale

Inscription auprès de l’Ecole Doctorale Galilée

Introduction aux nanotechnologies expérimentales
Descriptif

Ces modules de formation sont destinés aux doctorants de l'Université Paris 13 qui
souhaitent utiliser un ou plusieurs équipements situés au sein de la Centrale de Proximité en
Nanotechnologies de Paris Nord (C(PN)2 ). Comme dans d'autres Centrales, l'accès à la
salle blanche nécessite une formation préalable dont l'objectif est la connaissance de
l’environnent et du fonctionnement d'une salle à atmosphère contrôlée. Ceci inclut les risques
et les particularités de son utilisation ainsi que les conduites à tenir pour la protection des
autres utilisateurs. Cette formation théorique et pratique est sanctionnée par une habilitation
qui est la première étape indispensable pour obtenir les droits d'accès à la salle blanche. Elle
concerne principalement l'école doctorale Galilée, cependant un module d'introduction aux
nanotechnologies à destination des doctorants de l'école doctorale Erasme pourrait être
envisagé au besoin sans la partie pratique.

Objectif de l’intervention

Découvrir l'environnement salle blanche - Habilitation
Nous proposons donc ici une nouvelle formation restructurée à destination des doctorants
qui ont besoin ou auront besoin d'accéder à la salle blanche. Le contenu de cette formation
permet tout d'abord de poser la problématique de la miniaturisation ainsi que les limites
physiques (quantiques) à cette miniaturisation. La problématique est ensuite posée en terme
de contamination et de tailles de nano-objets à fabriquer comparées aux tailles des
microparticules de l'air ambiant et celles dégagées par les utilisateurs. Ceci permet
d'expliquer la nécessité d'une salle blanche à atmosphère contrôlée. La description du
fonctionnement des espaces de travail à flux laminaire est également décrite. Une seconde
partie pratique permet d'acquérir l'attitude et le comportement à adopter en salle blanche.
Cette première formation ouvre l'accès à la salle blanche.
Module de caractérisation
Une deuxième formation permet l'accès à différents équipements scientifiques de
caractérisation situés au sein de la centrale. Chacun de ces équipements nécessitent une
formation spécifique avant son utilisation. Le module de caractérisation permet d'apprendre
à utiliser des équipements de caractérisation de surface tel qu'un profilomètre mécanique
(type KLA-TENCOR) et un microscope à force Atomique (AFM), un microscope optique.

Module Couches Minces Optiques – Optical Thin Film – Partie Théorique et Numérique
Le deuxième module de formation permet d'aborder les nanotechnologies sous l’angle des
couches minces qui est un domaine très recherché dans l’industrie de la photonique. Ce
module propose des des éléments théoriques et des simulations menées sous Matlab et
utiles. Il s’agit d’apprendre à concevoir des empilements multicouches (Anti-Reflet, mirroirs,
cavité laser) en calculant leur transmittance et réflectance par la méthode des matrices de
transfert.
Formateur :
Professeur Alexis FISCHER
Centrale de Proximité en Nanotechnologies de Paris Nord - C(PN)2
IUT de Villetaneuse - Laboratoire de Physique des Laser UMR CNRS 7538
Tel : 01 49 40 3082

Débuter ses recherches en
          Lettres et Sciences Humaines et Sociales
          Panorama des ressources documentaires
Descriptif
La recherche documentaire en doctorat implique la manipulation d’un grand nombre d’outils
(catalogues, bases de données, sites Web, archives ouvertes, etc.) et la fréquentation de
bibliothèques de tous types. Cette formation, de niveau initiation, vise à aider les doctorants
en début de cursus (en particulier les doctorants qui ont effectué leur cursus universitaire à
l’étranger et connaîtraient mal le paysage documentaire français) à appréhender la richesse
documentaire des fonds et des ressources disponibles utiles à leurs recherches, en ciblant les
grands réservoirs de documents scientifiques propres aux Lettres et Sciences humaines, tant
numériques que physiques.

Contenu
- Repérage dans le paysage des bibliothèques parisiennes, fonds spécialisés, conditions
d'accès : quelles bibliothèques utiliser pour ses recherches ?
- Typologie et présentation des différentes ressources en ligne ;
- Catalogues de bibliothèques (SUDOC, CCFr, WorldCat, KVK…)
- Bases de références bibliographiques,
- Bases donnant accès à des articles en texte intégral ou à des e-books (Cairn, JStor, etc.)
- Introduction au mouvement du libre accès à l’information scientifique (archives ouvertes,
revues en libre accès). Exemple : Persée, Openedition.org, Isidore.

Méthodes pédagogiques
Présentations générales et exercices pratiques.

Objectifs de l’intervention
A l’issue de la formation, les participants :
- Connaissent les bibliothèques ou centres de ressources essentiels pour leur domaine de
recherche
- Comprennent la typologie des ressources en ligne, et leurs principales fonctionnalités
respectives (recherche, tri…)

Durée : 2h30
Effectif par session : 10 maximum

Parallèlement à leur inscription, les participants sont invités à transmettre leur
thématique de recherche aux formateurs en amont de la séance à l’adresse
bu.formations@univ-paris13.fr

Pour les séances à distance, l’outil utilisé est Teams ; il est nécessaire d’avoir déjà ses
identifiants de l’Université (numéro d’étudiant-e et n° INE). Un lien de test sera envoyé aux
participants avant la séance.

Formatrices
Stéphanie Lamy – Bibliothèque Edgar Morin (Villetaneuse)
Tél : 01.49.40.44.66

Mathilde Gourret – Bibliothèque Edgar Morin (Villetaneuse)
Tél : 01.49.40.21.57

Mail : bu.formations@univ-paris13.fr

Initiation à Zotéro
 logiciel de gestion des références bibliographiques
Descriptif
Zotéro, logiciel libre de gestion bibliographique, permet de récupérer automatiquement des
références bibliographiques et PDF à partir des bases de données documentaires et
catalogues, de les organiser, de les intégrer dans un document sous forme de citation in-text
ou notes de bas de page et d’éditer des bibliographies dans un grand nombre de styles.
La formation proposée permet de prendre connaissance des fonctionnalités essentielles de
Zotéro.

Contenu
Installation de Zotéro
Récupération de données bibliographiques à partir de divers outils : Sudoc, bases de données
selon les disciplines des participants, internet
Intégration des PDF : automatique, semi-automatique
Organisation et tri des données : collections, marqueurs, recherches sauvegardées
Sauvegarde des données
Insertion et modification de citations et de bibliographies dans plusieurs styles ; récupération
de styles supplémentaires
Présentation des fonctionnalités du compte en ligne : synchronisation des données,
bibliothèques de groupes.

Méthodes pédagogiques
Présentations et exercices pratiques.
- Bibliothèque Edgar Morin (campus de Villetaneuse)
- Bibliothèque Jean Dausset – Bobigny
Formation organisée à la demande pour les doctorants en SHS ainsi qu’en Sciences de la Vie
du campus de Bobigny.
Formation intégrée au cursus des étudiants en DUMG.
Pour toute question, contactez Fanny Courquin aux coordonnées indiquées ci-dessous
ou à l’adresse bu.formations@univ-paris13.fr

Organisation
Objectifs de l’intervention :
A l’issue de la formation, les participants :
Savent installer Zotero et se repérer dans son interface
Savent utiliser les fonctionnalités de récupération de données bibliographiques et de PDF.
Savent utiliser les fonctionnalités d’organisation et de tri des références.
Savent produire des appels de citation dans un texte (Word et/ou LibreOffice), les modifier,
éditer une bibliographie, la modifier.
Connaissent les fonctionnalités de synchronisation et de partage de bibliothèques de
références.
Savent comment effectuer une sauvegarde de leur base.

Pré-requis : être à l’aise avec les outils informatiques

Durée : 2h30

Effectif par session : 10 maximum

Besoins, ressources nécessaires :
Séance sur site : la bibliothèque peut fournir des PC portables, les participants peuvent venir
avec leurs ordinateurs personnels. Toutefois en cas de difficulté technique que le formateur
ne pourrait pas résoudre rapidement ils seront invités à utiliser les PC de la bibliothèque.
Séances à distance : l’outil utilisé est Teams. Il est nécessaire d’avoir déjà ses identifiants de
l’Université (numéro d’étudiant-e et n° INE). Un lien de test sera envoyé aux participants avant
la séance.

Formatrices
Stéphanie Lamy – Bibliothèque Edgar Morin (Villetaneuse)
Tél : 01.49.40.44.63

Fanny Courquin – Bibliothèque Jean Dausset (Bobigny)
Tél : 01.48.38.84.66

Mail : bu.formations@univ-paris13.fr

Commentaires particuliers :
Inscriptions à effectuer sur le site de la bibliothèque, rubrique « visites et formations » :
https://www.univ-paris13.fr/visites-formations/

Zotéro – atelier
Descriptif

Zotero est un outil qui permet la collecte, le tri et la récupération de données bibliographiques
pour automatiser la rédaction des citations et bibliographies.
Une séance d’initiation ne suffit pas toujours pour devenir familier de l’outil ; par ailleurs,
l’usager régulier peut également avoir des questions précises. Cet atelier se propose de
répondre à ces deux besoins, pour des étudiants utilisant déjà Zotero.

Contenu

Le contenu est construit en fonction des questions des participants. Il est donc demandé à
ceux-ci de fournir aux formateurs, au moins 1 semaine avant la séance, la liste des points
qu’ils souhaiteraient aborder : révision de fonctionnalités, difficultés rencontrées…
Méthodes pédagogiques :
Exercices pratiques.

Bibliothèque Jean Dausset – Bobigny

Formation organisée à la demande pour les doctorants du campus de Bobigny – contacter la
bibliothèque à l’adresse bu.formations@univ-paris13.fr

Organisation

A l’issue de la formation, les participants :
Ont une meilleure maîtrise de Zotero.
Ont trouvé une solution aux problèmes qu’ils rencontraient.

Dans le cas contraire, le formateur propose, autant que possible, des pistes, ou bien une
réponse différée.

Pré-requis : Etre déjà utilisateur de Zotero ou avoir au minimum déjà suivi une formation
d’initiation

Durée : 2h

Effectif par session : 10 maximum

Besoins, ressources nécessaires :
Les participants fournissent aux formateurs, en amont de la séance, la liste des questions
qu’ils souhaitent voire traitées.
Les participants sont invités à venir avec leur ordinateur personnel. La bibliothèque peut
toutefois fournir des PC portables.
Pour les séances à distance, l’outil utilisé est Teams ; il est nécessaire d’avoir déjà ses
identifiants de l’Université (numéro d’étudiant-e et n° INE). Un lien de test sera envoyé aux
participants avant la séance.

Formatrices

Stéphanie Lamy – Bibliothèque Edgar Morin
Tél : 01.49.40.44.63

Fanny Courquin – Bibliothèque Jean Dausset
Tél : 01.48.38.84.68
Mail : bu.formations@univ-paris13.fr

Commentaires particuliers :
Inscriptions à effectuer sur le site de la bibliothèque, rubrique « visites et formations » :
https://www.univ-paris13.fr/visites-formations/

Rendez-vous avec un bibliothécaire
Descriptif

A la demande, les bibliothèques de Sorbonne Paris Nord proposent aux doctorants des
rendez-vous individualisés pour les accompagner dans leurs recherches documentaires :
identification des lieux-ressources à Paris et en Ile-de-France, bases de données disponibles
à USPN et leur utilisation, ressources scientifiques accessibles gratuitement en ligne, open
access, thésaurus et mots-sujets, élaboration de requêtes, localisation de documents
physiques…

Organisation

Objectifs de l’intervention :
Apporter aux doctorants, principalement en début de cursus, des éléments personnalisés pour
s’orienter dans leurs recherches documentaires.

Calendrier :
Rendez-vous fixés à la demande, sur site ou à distance selon les cas de figure.

Pré-requis : Aucun

Durée : selon les besoins exposés par les inscrits et la complexité de la demande, de 1h à 2h
en moyenne

Effectif par session : rendez-vous individualisés

Besoins, ressources nécessaires : les participants sont invités à transmettre leur thématique
ou sujet de thèse ainsi que la liste des recherches déjà effectuées au moins 1 semaine avant
l’atelier.

Formateurs

Chargés de secteurs documentaires à la bibliothèque et chargés de formations, en fonction
des disciplines des inscrits.

Contactez-nous à l’adresse suivante :
bu.formations@univ-paris13.fr

Introduction aux enjeux liés
                       aux données de la recherche
Descriptif

Dès le doctorat, commencez à gérer vos données de recherche en adoptant les bonnes
pratiques !
Comment les structurer, les documenter, les stocker et les partager ? Qu'est-ce qu'un plan de
gestion de données ? Par où commencer ? Pourquoi s'en inquiéter ? Cette formation donne
quelques pistes pour mieux se retrouver dans les normes, exigences et recommandations
pour la gestion des données produites dans le cadre de vos projets de recherche.

Contenu
Notions et contexte national / international
Cycle de vie de la donnée (collecte, traitement, stockage, diffusion, partage et réutilisation).
Outil de gestion et de publication de la donnée : plan de gestion (Data management plan),
entrepôts, data-papers....
Les services autour des données de la recherche

A l’issue de la formation, les participants :
Comprennent les enjeux liés à la gestion des données de la recherche
Ont des éléments de bonnes pratiques
Connaissent des outils permettant la gestion des données

Pré-requis : aucun

Durée : 1H30 heures

Effectif par session : 10

Formateur
Karim Boualem – Bibliothèque Edgar Morin
Mel : boualem@univ-paris13.fr
Tél : 01 49 40 21 03

Premiers pas sur HAL
                  devenez acteur de l’Open Access
Descriptif

Créée en 2001 et gérée par le Centre pour la Communication Scientifique Directe (CCSD),
HAL est la plateforme nationale de dépôt et de diffusion des publications scientifiques (archive
ouverte).
Depuis octobre 2016, la loi pour une République numérique permet de publier en open access
le texte d’un article dans sa version postprint dans un délai maximum de 6 ou 12 mois. Le
dépôt dans HAL permet de mettre en accès libre ses publications de niveau recherche pour
en augmenter la visibilité et l’impact.
Il offre les meilleures garanties de signalement et d’identification, de pérennité d’accès et de
respect des droits d’auteur. Cette formation propose d’accompagner les doctorants dans la
démarche de dépôt, et donc de contribuer à la visibilité de leurs travaux

Objectifs de l’intervention

Notions et enjeux de la science ouverte : enjeux éthiques, économiques, avantages concrets
pour le chercheur
Questions juridiques liées au dépôt en archive ouverte
Création d'un compte dans HAL
Étapes du dépôt

Services proposés par HAL : créer un IdHAL, un CV, partager une liste de publications,
extraire des listes bibliographiques, lier ses publications à Google, produire des statistiques…

Pré-requis : Aucun

Durée : 1H30 heures

Effectif par session : 10

Formateur

Karim Boualem – Bibliothèque Edgar Morin
Mel : boualem@univ-paris13.fr
Tél : 01 49 40 21 03

Introduction à l’identité numérique du chercheur et
        aux réseaux sociaux de la recherche
Descriptif

Les enjeux liés à l’identité numérique du chercheur sont multiples : visibilité, propriété
intellectuelle, communication avec les pairs, opportunités de partenariats, lien entre les
données de la recherche et leur producteur, contrôle de l’identité en ligne.

La séance se veut une introduction à ces enjeux, et aux outils permettant de gérer son identité.
L’identité en ligne va de pair avec, entre autres, l’utilisation des réseaux sociaux, qui peuvent
se révéler un outil précieux pour la diffusion de la recherche. Faciles d’accès, ils peuvent viser
un public à la fois général et spécialisé, ce qui permet de relayer les travaux du chercheur au-
delà de la sphère académique, mais aussi de tisser des liens entre les membres de la
communauté.
La formation se propose de recommander des outils, des stratégies et des bonnes pratiques
pour aider les chercheurs à maîtriser leur présence numérique et à accroître la visibilité et
l’impact de leur recherche.

   -   Contenu : Présentation des enjeux de l’identité numérique et des bonnes pratiques
       permettant de la contrôler dans le monde de la recherche
   -   Présentation des identifiants uniques et de leurs spécificités : IdHal, Orcid…
   -   Présentation des différents types de réseaux sociaux : généralistes, spécialisés
       (Twitter, Academia, Researchgate…), et leurs spécificités

La formation est basée sur des présentations magistrales, échanges avec les participants, et
séquences pratiques.

Pré-requis : aucun

Durée : 1H30 heures

Effectif par session : 10

Besoins, ressources nécessaires : aucun

Formateur

Karim Boualem – Bibliothèque Edgar Morin
Mel : boualem@univ-paris13.fr
Tél : 01 49 40 21 03

Scientific writing and publication in English
Descriptif

The publication of results is an important part of a scientist’s work, already essential for young
researchers during their PhD studies.
However, scientific article writing (in English) is a demanding process, and this course aims to
improve your knowledge and skills in writing up research articles for peer-reviewed journals.

The course, which will be held over 2 sessions (3 h each), will focus on the following topics:
- How to structure the content of a scientific article?
- How do reviewers judge your work?
- Improvement of English writing skills and style, with practical training in abstract writing.
- How to integrate the presentation of data and analyses into a paper?
- Which journal to choose?
- How to communicate with editors and reviewers during the process of publication?
- Ethics of publication.

During this course, students will improve their skills in scientific article writing.
To this end, they will gain knowledge on structure and content of such articles, on the general
process of publication, and on the interaction with editors and reviewers.
Most importantly, students will actively develop their writing skills in English, in particular in
abstract writing.
The training of these skills will expectantly contribute to efficiently write up scientific
publications, as part of the PhD thesis. Different aspects of publication ethics will be discussed.

Pré-requis

The course is directed to all PhD students, who intend to improve their writing skills of scientific
research articles in English.

Effectif par session : maximum 15 persons

Durée : 3 + 3 = 6 heures

Formateur

(Heiko G. RÖDEL (Pr)
Laboratoire d’Ethologie Expérimentale et Comparée UR 4443 (LEEC)
Université Sorbonne Paris Nord)

Mel : heiko.rodel@univ-paris13.fr
Tél. : 01 49 40 32 18

Formation à la communication et
                     à la médiation scientifique
Descriptif

Les DIM Sirteq, Math Innov, Qi², Elicit, STCN et Respore s’associent pour proposer à leurs
réseaux un cycle de formation à la communication scientifique, animé par l’association Traces
et The Conversation.
Le cycle de formation se déclinera en 5 sessions d’une heure trente

Au programme, des thématiques variées pour aborder différents angles de la communication
et de la médiation scientifique.

Vous êtes libre de participer à la ou les sessions qui vous intéressent, en fonction de vos
besoins spécifiques et/ou de vos centres d’intérêts.

 La communication grand public
Comment passer d’une présentation vers les pairs à une présentation grand public ?
Communiquer vers un public non-spécialiste n’est pas juste une question de simplification du
message : une bonne communication se concentre sur la contextualisation des messages et
la compréhension des exigences du public.
Comment ne pas tomber dans les pièges du jargon ? Comment capturer l’attention ? Comment
produire un impact durable ?

 Les réseaux sociaux
Communiquer sur les réseaux sociaux et développer l’engagement de sa communauté.
L’utilisation des réseaux sociaux dans toute démarche de communication ou médiation
scientifique apparaît comme un impératif. Si bien qu’on peut avoir tendance à oublier certaines
questions fondamentales : pour quels objectifs et quels publics sont-ils, chacun, les plus
adaptés ? Quel réseau est-il le plus pertinent d’utiliser en fonction de nos besoins ?

 Jeux de société
Atelier de prototypage en 60min et témoignage : questions / réponses avec un.e développeur
de jeux. Jeux sérieux, jeux éducatifs, gamification… Quels avantages et quels pièges dans
l’utilisation des jeux en médiation scientifique ? Est-il toujours vrai qu’un jeu peut rendre la
science plus accessible ? Quelles expertises faut-il mobiliser dans la conception et la diffusion
d’un jeu ?

 Communication vers les journalistes
Témoignage : questions / réponses avec un.e journaliste scientifique.
Comment apprendre à dialoguer avec un journaliste ? Discute-t-on de la même façon avec un
journaliste scientifique et un journaliste généraliste ? Comment construire une relation de
confiance entre chercheurs et journalistes ? Autant de questions qui pourront être abordées
lors d’un dialogue avec des journalistes professionnels.

 Atelier d’écriture avec le journaliste Benoît Tonson du média The Conversation
Comment présenter de façon attractive et vulgarisée son sujet de recherche ?
L’objectif de l’atelier ? Repartir avec un pitch d’une quinzaine de lignes pour présenter son
projet de recherche de façon vulgarisée et attractive ainsi qu’avec une base de plan pour un
article futur qui pourra être publié par The Conversation.

Prérequis

Merci de venir avec quelques lignes pour présenter votre sujet de recherche.

Lieux

- Espace des Sciences Pierre Gilles de Gennes (10 Rue Vauquelin, 75005 Paris) et
- Atelier d’écriture avec The Conversation
Institut Pasteur (28 Rue du Dr Roux, 75015 Paris).

Inscription

Toute demande d’inscription doit parvenir avant la date butoir de la session à l’attention de
Hasnaa El Ouazzani : sirteq@institutoptique.fr.
Merci de préciser la ou les sessions souhaitées.

QUALITÉ DE LA RECHERCHE

 Intégrité scientifique dans les métiers de la
  recherche Formation obligatoire
 Conseils à l’expatriation Formation obligatoire
 Prévention   et   Lutte   Contre   Les   Violences
  Sexistes Et Sexuelles Formation obligatoire

 Info Compilatio Formation obligatoire

 Protection des données à caractère personnel
  dans les projets de recherche

Intégrité scientifique dans
                       les métiers de la recherche

Formation obligatoire
MOOC
https://www.fun-mooc.fr/courses/course-v1:Ubordeaux+28007+session03/about

À propos du cours

Depuis la déclaration de Singapour sur l’intégrité scientifique en 2010, la communauté
scientifique internationale se mobilise pour que les exigences méthodologiques et éthiques de
la recherche soient plus clairement affirmées, dans un contexte où la course à la nouveauté
et l’introduction d’une logique concurrentielle renforcée multiplient les risques de dérive.
En outre, le renforcement de la réglementation et les enjeux de responsabilité sociale imposent
la connaissance et l’appropriation des principes fondamentaux de l’intégrité scientifique. Enfin,
la crise de la COVID-19 a suscité de nombreux débats qui renvoient à cette question de
l'intégrité de la recherche.

Les différents organismes de recherche en France ont multiplié les initiatives et leur
convergence a conduit à la signature de la charte de déontologie des métiers de la recherche
par la CPU (Conférence des Présidents d'Universités) et les principaux organismes en janvier
2015.
A la suite du rapport remis par le Pr. Pierre Corvol en 2016, "Bilan et propositions de mise en
œuvre de la charte nationale d’intégrité scientifique", plusieurs décisions ont été prises,
notamment :
- les écoles doctorales doivent veiller à ce que les doctorants bénéficient d'une formation à
l'éthique et à l'intégrité scientifique,
- les établissements ont nommé un référent à l'intégrité scientifique,
- un Office français de l'intégrité scientifique (OFIS) a été installé en 2017 auprès du HCERES.

Engagée dès 2012 sur cet enjeu avec l'adoption d'une charte, l'université de Bordeaux a, en
partenariat avec la CPU, le COMETS-CNRS, l’INSERM et l’INRA, développé la formation sur
l’intégrité scientifique que nous vous proposons sur FUN.
Bénéficiant du soutien de l'IdEx Bordeaux et du Collège des écoles doctorales, cette formation
a été conçue avec la Mission d'appui à la pédagogie et à l'innovation (MAPI) de l'université de
Bordeaux. Elle est depuis régulièrement complétée et actualisée.

Objectif

Diffuser une culture de l’intégrité scientifique au sein des établissements.
Plus qu’à transmettre des connaissances, il s’agit surtout de sensibiliser aux différents enjeux
associés à l’intégrité scientifique et de favoriser une démarche critique en proposant les
éléments de base nécessaires pour comprendre et porter les exigences de l’intégrité
scientifique.

Cette formation vise ainsi à

- vous informer sur les enjeux de l’intégrité scientifique,
- vous alerter sur les mécanismes qui peuvent pousser aux manquements,
- vous inciter à développer le sens des responsabilités et à vous comporter en vigie de
l’intégrité scientifique.

Format

Vous fixez vous-même votre propre rythme de travail et aurez accès à l’ensemble du contenu
pédagogique et des activités ludiques et collaboratives.
Vous y découvrirez une grande diversité de supports : vidéos campus, fil rouge des
enseignants, interviews d’experts, témoignages de doctorant•e•s, animations, mises en
situation interactives, sondages, tests de vérification des connaissances acquises, films,
discussions sur des forums pour enrichir votre expérience de formation, sans oublier des
ressources complémentaires pour vous permettre d’aller plus loin.

Prérequis

Aucun prérequis n'est nécessaire pour suivre ce cours.

Langues

Français et anglais
Tous les contenus, activités, et ressources originales du cours sont en français. Pour des
besoins liés à l'accessibilité, toutes les vidéos sont sous-titrées en français et des
transcriptions au format .rtf sont téléchargeables.
L'ensemble des contenus de cette formation est également proposé en anglais sur la version
anglaise du MOOC.

Conseil à l’expatriation

Formation obligatoire
Les informations vous seront transmises ultérieurement

Prévention et lutte contre
                les violences sexuelles et sexistes

Formation obligatoire
Descriptif

Les violences ont un impact physique, psychologique et professionnel sur la victime.
Alors qu'une femme sur 3 est ou sera confrontée à une situation de violences au cours de sa
vie, selon l'OMS.
Les lieux d'études et de travail ne sont pas épargnés avec 25% des gestes déplacés en leur
sein.

Objectifs de l’intervention

      Définir les violences sexistes et sexuelles
      Comprendre le mécanisme et les conséquences sur la victime
      Identifier les situations à risque et savoir orienter la victime

Pré-requis : aucun

Durée : 12h (2 journées x 6h ou 4 demi-journées x 3h)

Effectif par session : 15 personnes

Formatrices

Frédérique MARTZ, directrice
Mel : frederique.martz@women-safe.org

Axelle CORMIER, adjointe de direction
Mel : axelle.cormier@women-safe.org

Tél : 01.39.10.85.35

Info Compilatio

Formation obligatoire
Descriptif

En complément du tutoriel disponible sur le site du BRED, la bibliothèque universitaire propose
une heure de présentation de l’outil Compilatio : principes, navigation, test de l’outil.

La séance se veut généraliste et axée sur le fonctionnement technique et le paramétrage de
Compilatio ; l’analyse des rapports de plagiat eux-mêmes ne sera pas effectuée.

Contenu

Fonctionnement général de Compilatio : base de connaissance, ergonomie, options à choisir
Méthodes pédagogiques :
Présentation et exercice pratique.

Bibliothèque Jean Dausset – Bobigny :
Des sessions sur place peuvent être organisées à la demande pour des groupes, merci de
contacter le service formation (bu.formations@univ-paris13.fr)

Organisation

Objectifs de l’intervention :
A l’issue de la formation, les participants connaissent le but et le fonctionnement de Compilatio

Durée : 1h

Effectif par session : 10 maximum

Besoins, ressources nécessaires :
Pour les séances à distance, l’outil utilisé est Teams ; il est nécessaire d’avoir déjà ses
identifiants de l’Université (numéro d’étudiant-e et n° INE). Un lien de test sera envoyé aux
participants avant la séance.

Formatrice

Stéphanie Lamy – Bibliothèque Edgar Morin
Tél : 01.49.40.44.63
Mail : bu.formations@univ-paris13.fr

Commentaires particuliers :
Inscriptions à effectuer sur le site de la bibliothèque, rubrique « visites et formations » :
https://www.univ-paris13.fr/visites-formations/

Protection des données à caractère personnel dans
              les projets de recherche

Descriptif
Cette formation à destination des doctorants a pour objectif de leur permettre d’acquérir de
solides notions sur la législation relative à la protection des données personnelles (RGPD et
Loi Informatique et Libertés). Au cours de ce séminaire, les doctorants recevront un panorama
de la règlementation, ainsi que des conseils pratiques à mettre en œuvre dans le cadre de
leurs recherches.

Contenu :
Objectifs de l’intervention : A l’issue de cette formation, les participants seront à même de
reconnaitre les grandes notions de la protection des données, les responsabilités dans le
cadre de leurs recherches et les formalités à accomplir pour être en règle avec la législation.

Au cours de la session, les doctorants pourront travailler directement en atelier sur leurs
propres problématiques de recherche et recevoir des conseils personnalisés (sécurisation des
données, procédures à accomplir, méthodologies de collecte, outils à disposition, etc.).

Durée : 6 heures (en deux sessions de trois heures)

Effectif par session : 15-20 personnes max

Formateur
Timothée Bonnet, Délégué à la protection des données (DPO) de l’USPN

Mel : dpo@univ-paris13.fr
Tél :01 49 40 39 74

CULTURE ÉLARGIE

 Modélisation mathématique de phénomènes
  biologiques
 Analyse informatique des données scientifiques
 Initiation à l’utilisation de Cluster Haute
  Performances de Calcul (HPC)
 Calcul Hautes performances

Modélisation mathématique
                      de phénomènes biologiques

Descriptif

L’objectif de ce cours est de présenter quelques applications des mathématiques sur des
problèmes issus de la biologie.

Ce cours a vocation à s’adresser à des étudiants de plusieurs disciplines
(mathématiques/physique/biologie). Une partie importante du cours portera sur la
modélisation mathématique.

Le programme devrait s’articuler autour de 4 thèmes :
       - modèles compartimentaux en épidémiologie ;
       - modèles mathématiques de croissance de tumeur ;
       - comportement collectif de bactéries, chimiotactisme ;
       - dynamique des populations, phénomène d’invasion.

Objectifs de l’intervention

Une compétence visée importante sera la modélisation mathématique appliquée à la biologie
grâce à l’outil mathématique des équations aux dérivées partielles. De plus, les étudiants
acquerront des notions de mathématiques de base pour traiter les systèmes d’EDP abordés.
(En termes de compétences à acquérir)

Pré-requis

Les étudiants devront être motivé par un goût certain pour la modélisation.
Quelques notions de base sur les systèmes différentiels seront les bienvenues.

Durée : 12 heures

Effectif par session : 20

Formateur

Vauchelet Nicolas – LAGA, Université Sorbonne Paris Nord.
Mel : (vauchelet@math.univ-paris13.fr)
Téléphone : 0149403594

Analyse informatique des données scientifiques

Descriptif

Le module « Analyse informatique des données scientifiques » se composera de 8h de cours
et 16h de TP.

Contenu

Le programme de la formation se décompose en trois parties :
   1. Analyse exploratoire (9 h) : rappels de statistique, distribution de données, corrélations,
       réduction de dimensions et visualisation de données (ACP, ADL).
   2. Data Mining (9 h) : recherche de clusters pour la découverte de groupes homogènes,
       apprentissage automatique pour la classification et la prédiction d’observations,
       introduction aux réseaux de neurones artificiels.
   3. Applied multifactorial statistics with R (6 h, in English) : introduction to the use of
       multifactorial (generalized) linear (mixed effects) models ; interactions and post-hoc
       testing ; transformations ; application of model diagnostics ; permutation tests.

Chaque notion vue en cours sera illustrée par des exemples concrets en biologie : médecine,
écologie, éthologie, etc. Les TP porteront eux aussi sur l’analyse de données biologiques.

Objectifs de l’intervention

Les participants seront formés à l’analyse informatique de données scientifiques. Ils verront
un large panel d’outils, de l’analyse statistiques de base aux méthodes avancés de statistique
multifactorielles, en passant par des approches de visualisation de données et
d’apprentissage automatique. Au travers des Travaux Pratiques, ils se familiariserons aussi
avec deux langages de programmation, Python et R, qui sont actuellement les langages les
plus utilisés pour l’analyse de données scientifiques.

Prérequis

      Bases de statistique.
      Motivation pour l’analyse de données.
      Si possible, initiation dans un langage de programmation (en particulier R et/ou
       Python).

Durée : 24 heures

Effectif par session : 15 personnes

Formateurs
       Guénaël CABANES, MC, Laboratoire d’Informatique de Paris Nord
Mel : cabanes@univ-paris13.fr
       Nistor GROZAVU, MC, Laboratoire d’Informatique de Paris Nord
Mél : grozavu@univ-paris13.fr)
       Heiko G. RÖDEL, Pr, Laboratoire d'Ethologie Expérimentale et Comparée
Mél : rodel@univ-paris13.fr)

Calcul Hautes performances

Descriptif

- Yves Rozenholc : stats / proba / classification 3h
- Christophe Cérin : Intro au cloud 3h
- Mustapha Lebbah : Scalable machine learning 3h
- Nicolas Greneche : Magi + G5K 8h
- Mohamed Boubekeur : OpenMPI / OpenMP / Cuda 4h

Objectifs de l’intervention

Gérer ses expérimentations numériques dans les environnements HPC / Cloud

Pré-requis
Savoir utiliser un système d’exploitation Windows ou Linux

Durée : 20 heures

Formateurs
   -   Christophe Cérin, Professeur au LIPN (USPN) christophe.cerin@univ-paris13.fr
   -   Nicolas Greneche, IGR à la DSI (USPN) nicolas.greneche@univ-paris13.fr