Klebsiella pneumoniae OXA-48 ICU epidemic among (mainly) COVID-19 patients - Chemais Monia, pharmacien biologiste, Microbiologie et Hygiène 01 ...

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Klebsiella pneumoniae OXA-48 ICU epidemic among (mainly) COVID-19 patients - Chemais Monia, pharmacien biologiste, Microbiologie et Hygiène 01 ...
Klebsiella pneumoniae OXA-48 ICU
epidemic among (mainly) COVID-19
patients
Chemais Monia, pharmacien biologiste,
                                        01 février 2022
Microbiologie et Hygiène
Klebsiella pneumoniae OXA-48 ICU epidemic among (mainly) COVID-19 patients - Chemais Monia, pharmacien biologiste, Microbiologie et Hygiène 01 ...
PRÉSENTATION DU CHR HAUTE SENNE
Trois sites :
• Le Tilleriau – Aigu
• Saint Vincent – Réadaptation
• Le Goéland – Palliatif

Quelques chiffres (2019) :
• 246 lits agrées
• 900 collaborateurs
• 8400 admissions
• 66.000 journées d’hospitalisation
• 7100 hospitalisations de jour

                                      01 février 2022
Klebsiella pneumoniae OXA-48 ICU epidemic among (mainly) COVID-19 patients - Chemais Monia, pharmacien biologiste, Microbiologie et Hygiène 01 ...
PRÉSENTATION DE L’UNITÉ DE SOINS INTENSIFS
Unité médico-chirurgicale :

•   Médical 60% et chirurgical 40% (digestif, urologique, thoracique, thoraco-vasculaire)

Quelques chiffres :

•   10 lits agrées

•   520 entrées à l’année

•   Durée moyenne de séjour : 4,5 jours

Points spécifiques en Hygiène Hospitalière

•   4 des 10 chambres sont des chambres d’isolement avec SAS.

•   Tout patient entrant à l’USI reçoit un dépistage systématique de MRSA par triple écouvillonnage et de BLSE, CPE et VRE par
    écouvillonnage rectal

                                                                                                         01 février 2022
Klebsiella pneumoniae OXA-48 ICU epidemic among (mainly) COVID-19 patients - Chemais Monia, pharmacien biologiste, Microbiologie et Hygiène 01 ...
EPISODE 1
Klebsiella pneumoniae OXA-48 ICU epidemic among (mainly) COVID-19 patients - Chemais Monia, pharmacien biologiste, Microbiologie et Hygiène 01 ...
LE PATIENT INDEX
                                                  14/08/2020
                                          Hospitalisation du cas index

Belgium COVID-19 Dashboard – Sciensano > Cases

72 ans
Diabète II, Obésité, ethylo-tabagisme
Pas d’infection au SARS-CoV-2
Chute et séjour prolongé au sol : Pneumopéritoine sur perforation caecale, volvulus du côlon ascendant, compliqué d’occlusions
Prise en charge chirurgicale : Hémicolectomie droite
Entrée à l’USI le 20/08/2020

                                                                                                                                 01 février 2022
Klebsiella pneumoniae OXA-48 ICU epidemic among (mainly) COVID-19 patients - Chemais Monia, pharmacien biologiste, Microbiologie et Hygiène 01 ...
OXA48BLS           OXA48BLS           OXA48BLSE      OXA48BLSE     OXA48BLSE
         E KLEPNE           E KLEPNE             KLEPNE        KLEPNE        KLEPNE                             OXA48BLS
          REDON             KT Dialyse         ASPBRONCH      ASPBRONC      ASPBRONC                            E KLEPNE
                              KTVC                                H             H                                HEMOC
                                                                             HEMOC
                 OXA48BLS                                                     URINE
                                                                                                     OXA48BLS
                 E KLEPNE                                                          OXA48BLS          E KLEPNE
                  Lamelle                                                          E KLEPNE            KTVC
                                                                                   EXPECTO

                                     MEM 1g                                                               Cipro/FE
TZP 4g 4x/jour                                    COL      TZP 4g 4x/jour   Tigé     Zavista/cefta
                                     3x/jour                                                                 P

                                                                                                                     01 février 2022
Klebsiella pneumoniae OXA-48 ICU epidemic among (mainly) COVID-19 patients - Chemais Monia, pharmacien biologiste, Microbiologie et Hygiène 01 ...
OXA48BLS           OXA48BLS                                            OXA48BLSE                                    OXA48BLSE      OXA48BLSE
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          REDON             KT Dialyse                                          ASPBRONC                                     ASPBRONC       ASPBRONC                                                  E KLEPNE
                              KTVC                                                  H                                            H              H                                                      HEMOC
                                                                                                                                             HEMOC
                 OXA48BLS                                                                                                                     URINE
                                                                                                                                                                                           OXA48BLS
                 E KLEPNE                                                                                                                                      OXA48BLS                    E KLEPNE
                  Lamelle                                                                                                                                      E KLEPNE                      KTVC
                                                                                                                                                               EXPECTO

                                  Bactériémie BLSEKLEPNE méroS colS

                                                                                     Bactériémie ENTCLO profil sauvage

                                                                                                                                             Bactériémie OXA48BLSEKLEPNE

                                                                                                                                                                                                           Bactériémie OXA48BLSEKLEPNE
                                                                                                                                             ZAVICEFTAS
                                                                      MEM 1g                                                                                                                    Cipro/FE
TZP 4g 4x/jour                                                                    COL                                    TZP 4g 4x/jour   Tigé                             Zavista/cefta
                                                                      3x/jour                                                                                                                      P

                                                                                                                                                                                                       01 février 2022
Klebsiella pneumoniae OXA-48 ICU epidemic among (mainly) COVID-19 patients - Chemais Monia, pharmacien biologiste, Microbiologie et Hygiène 01 ...
ECLOSION D’INFECTIONS ET DE PORTAGE À K.PNEUMONIAE
PRODUCTRICE D’OXA-48

                                           01 février 2022
Klebsiella pneumoniae OXA-48 ICU epidemic among (mainly) COVID-19 patients - Chemais Monia, pharmacien biologiste, Microbiologie et Hygiène 01 ...
ECLOSION D’INFECTIONS ET DE PORTAGE À K.PNEUMONIAE
PRODUCTRICE D’OXA-48

                                           01 février 2022
LA BACTÉRIE ÉPIDÉMIQUE
Klebsiella pneumoniae productrice de carbapénémase de type OXA48 et de
BLSE

Souches envoyées au CNR pour séquençage génomique

                                                        01 février 2022
ECLOSION D’INFECTIONS ET DE PORTAGE À K.PNEUMONIAE
PRODUCTRICE D’OXA-48

                                           01 février 2022
L’INVESTIGATION (1/2)
Les éléments critiques en faveur d’une transmission manuportée

1-Mauvaise utilisation des EPI rapportée
2-Equipement de protection COVID-19 complexe et lourd à mettre/défaire
3-Charge de travail accrue et circulation augmentée entre les chambres
4-Cohabitation de patients avec différents risques infectieux, COVID-19 ou non, colonisés ou non par la K. pneumoniae

                                                                                                                        01 février 2022
L’INVESTIGATION (2/2)
L’environnement
 Protocole
Eviers des chambres : triple écouvillonnage (brise-jet, orifice de trop- plein et orifice d’évacuation)
Les claviers d’ordinateurs des chambres sont écouvillonnés également
Recherche de bacilles gram négatif (entérobactéries et non-fermentants) uniquement

 Résultats

Chambre             Clavier                                          Evier Chambre                                  Evier WC            Evier SAS
       1 Negatif                     S. maltophilia                                                            Négatif         S. marcescens
       2 Negatif                     K. pneumoniae : OXA neg ( et P. aeruginosa et Citrobacter amalonaticus)
       3                             C. freundii , P. aeruginosa
       4 Negatif                     P. aeruginosa
       5 Negatif                     Negatif
       6 Negatif                     E. cloacae , P. aeruginosa
       7 Negatif                     K. pneumoniae : OXA neg ( et P. aeruginosa)
       8 Negatif                     P. aeruginosa                                                             Négatif         S. marcescens
       9 OXA48 K. pneumoniae         K. pneumoniae : OXA neg (Hafnia, C. freundii et Pseudomonas oleovorans)   Négatif         E. cloacae , S. marcescens
      10 Négatif                     P. aeruginosa , E. cloacae                                                Négatif         E. cloacae , P. aeruginosa
      11                             P. aeruginosa
  Bureau                             P. aeruginosa

                                                                                                                                   01 février 2022
MESURES DE CONTRÔLE DE L’ ÉPIDÉMIE
•   Dépistage deux fois par semaine des patients non colonisés par la K. pneumoniae épidémique
•   Standardisation de l’usage de la surblouse jetable avec les gants, pour tout patient USI pendant la
    période d’épidémie à K. pneumoniae productrice d’OXA-48
•   Augmentation de la disponibilité de la SHA au sein de l’unité
•   Nettoyage deux fois par jour des points de contact sur les portes
•   Retour de l’investigation de l’épidémie auprès de l’équipe USI
•   Formation EPI, précautions additionnelles
•   Renforcement du nettoyage à l’USI ainsi que des chambres « OXA-48 »
•   Supervision de la « remise en disponibilité » des chambres occupées par des patients colonisés par
    la K. pneumoniae productrice d’OXA-48
•   (PAS de dépistage du personnel)
•   Introduction de la demande d’augmenter le staff de nursing à l’USI

                                                                                    01 février 2022
ECLOSION D’INFECTIONS ET DE PORTAGE À K.PNEUMONIAE
PRODUCTRICE D’OXA-48

                                           01 février 2022
ECLOSION D’INFECTIONS ET DE PORTAGE À K.PNEUMONIAE
PRODUCTRICE D’OXA-48

                                           01 février 2022
MESURES DE CONTRÔLE DE L’ ÉPIDÉMIE
•   Dépistage deux fois par semaine des patients non colonisés par la K. pneumoniae épidémique
•   Standardisation de l’usage de la surblouse jetable avec les gants, pour tout patient USI pendant la
    période d’épidémie à K. pneumoniae productrice d’OXA-48
•   Augmentation de la disponibilité de la SHA au sein de l’unité
•   Nettoyage deux fois par jour des points de contact sur les portes
•   Retour de l’investigation de l’épidémie auprès de l’équipe USI
•   Formation EPI, précautions additionnelles
•   Renforcement du nettoyage à l’USI ainsi que des chambres « OXA-48 »
•   Supervision de la « remise en disponibilité » des chambres occupées par des patients colonisés par
    la K. pneumoniae productrice d’OXA-48
•   (PAS de dépistage du personnel)

•   Introduction de la demande d’augmenter le staff de nursing à l’USI  Cohortage des porteurs de la
    Klebsiella pneumoniae OXA-48 Arrêt de la transmission non contrôlée

                                                                                    01 février 2022
BILAN DE L’ ÉPIDÉMIE
7 patients (dont le patient index)

-       5 patients sur 7 ont plus de 70 ans, 1 personne de 63 ans, 1 personne de 56 ans

-       5 patients sur 7 sont COVID-19

-       5 patients sur 7 développent une infection à K.pneumoniae productrice d’OXA-48

-       3 patients sur 7 décèdent à l’USI :
    -     2 patients sur septicémie à K. pneumoniae productrice d’OXA-48
    -     1 patient sur détresse respiratoire sur pneumonie hypoxémiante COVID-19 (colonisation entérique transitoire)

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LES INFECTIONS À BACTÉRIES MULTI-RÉSISTANTES DURANT
           LA PANDÉMIE COVID-19
           L’expérience répétée de transmission non contrôlée de CPE à l’USI

Beatrice Tiri et al, Antimicrobial Stewardship Program, COVID-19, and Infection Control: Spread of Carbapenem-Resistant Klebsiella Pneumoniae Colonization in ICU COVID-19 Patients. What Did Not Work?
J Clin Med. 2020 Aug 25;9(9):2744
Rishma Amarsy et al, Outbreak of NDM-1-producing Klebsiella pneumoniae in the intensive care unit during the COVID-19 pandemic: Another nightmare, Am J Infect Control. 2021 Oct;49(10):1324-1326.
Eric Farfour et al, Carbapenemase-producing Enterobacterales outbreak: Another dark side of COVID-19, Am J Infect Control. 2020 Dec; 48(12): 1533–1536.    28 octobre 2021
G Montrucchio et al, Carbapenem-resistant Klebsiella pneumoniae in ICU-admitted COVID-19 patients: Keep an eye on the ball, J Glob Antimicrob Resist . 2020 Dec;23:398-400.
LES INFECTIONS À BACTÉRIES MULTI-RÉSISTANTES DURANT
 LA PANDÉMIE COVID-19
Des causes multiples (W Mędrzycka-Dąbrowska et al, 2021) :

• Equipement :
  •   fausse sécurité que procure l’équipement EPI et les mesures COVID-19
  •   Mauvaise utilisation des EPI rapportée
  •   Pénurie de matériel
• Un personnel confronté à une exceptionnelle charge de travail
  •   Impact sur la vigilance et la compliance aux procédures d’hygiène
  •   Personnel de renfort ne travaillant pas habituellement à l’USI
  •   Pénurie de personnel : Lien entre le ratio (nombre de soignants/nombre de patients) et le risque de
      transmission croisée de bactérie multi-résistante
• Diminution de l’encadrement de l’Equipe opérationnelle d’hygiène sur le terrain.

                                                                                              01 février 2022
LES INFECTIONS À BACTÉRIES MULTI-RÉSISTANTES DURANT
LA PANDÉMIE COVID-19
Les patients présentant un COVID-19 sévère sont plus susceptibles de développer une (co)infection
bactérienne :

-   Total de 221 patients COVID-19 : taux de co-infection bactérienne chez les COVID-19 sévères
    (USI + ventilation mécanique) 25,5% vs taux de co-infection bactérienne chez les COVID-19 NON-
    sévères 1,8% ; (p
LES INFECTIONS À BACTÉRIES MULTI-RÉSISTANTES DURANT
LA PANDÉMIE COVID-19
Augmentation de l’usage des antibiotiques chez les patients hospitalisés en période de pandémie
(Chih-Cheng Lai et al, 2021) :

-       99 patients COVID-19, plus de 70% reçoivent un traitement antibiotique (Chen N et al, 2020)
-       1099 patients COVID-19, 58% reçoivent une antibiothérapie IV (Guan WJ et al, 2020)
-       72 patients COVID-19, 84,7% reçoivent une antibiothérapie IV (Teich VD et al, 2020)
-       2010 patients COVID-19, 72,1% ont reçu une antibiothérapie (Rawson TM et al, 2020)
-       Causes probables de l’augmentation de la prescription d’antibiotiques :
    -     La présentation clinique courante de l’infection au SARS-CoV-2 (toux, fièvre et infiltrats radiologiques) correspond aussi à
          celle d’une pneumonie bactérienne communautaire, les cliniciens pourraient empiriquement ajouter un antibiotique malgré
          la suspicion d’un origine virale;
    -     Toutes les incertitudes concernant la COVID-19 ainsi que l'absence de traitements efficaces pourraient être des moteurs
          potentiels de prescription généralisée et excessive d'antibiotiques
    -     Une co-infection bactérienne est possible, ainsi qu’une infection bactérienne secondaire

                                                                                                            01 février 2022
LES INFECTIONS À BACTÉRIES MULTI-RÉSISTANTES DURANT
LA PANDÉMIE COVID-19
Augmentation de l’incidence des bactéries multi-résistantes pendant la pandémie COVID-19   (Lai CC et
al, 2021)

                                                      Hopital de Terni (Umbria, Italie)
                                                      554 lits
                                                      Unité USI de 14 lits

                                                      Etude rétrospective observationnelle pour
                                                      évaluer (1) l’incidence de la colonisation par
                                                      des     entérobactéries    résistantes    aux
                                                      carbapénèmes (CRE) et (2) de l'acquisition
                                                      de CRE dans l'unité de soins intensifs dans
                                                      l'ère pré-COVID-19, pendant la pandémie de
                                                      COVID-19 et dans l'ère post-COVID-19
                                                      (Tiri B et al, 2020)

                                                                                01 février 2022
LES INFECTIONS À BACTÉRIES MULTI-RÉSISTANTES DURANT
LA PANDÉMIE COVID-19
Les infections à entérobactéries productrices de carbapénèmases (CPE) chez les patients COVID-19
(Pintado et al, 2021)
Population étudiée : Patients ≥ 16 ans chez lesquels une infection à CPE est diagnostiquée entre le 1ier mars et le 31 mai 2020, à
l’Hôpital Universitaire Ramón y Cajal de Madrid

-   Infection à CPE : 30/2615 patients COVID-19 >< 24/4433 patients sans infection à SARS-CoV-2 (témoins)
-   Les infection à CPE étaient plus fréquentes chez les patients COVID-19 que chez les témoins (1,1% vs 0,5%, p 0,005).
-   L’usage d'antimicrobiens, la ventilation mécanique et l'admission en soins intensifs étaient plus fréquents chez les patients
    COVID-19 (p
EPISODE 2
LE RETOUR DE LA KLEBSIELLA PNEUMONIAE OXA-48

Patient Index 2 – 58 ans :
Hospitalisation 25/02/2021 à l’USI : Détresse respiratoire sur COVID-19
Dépistage de BMR (VRE/BLSE/CPE) une fois par semaine, négatifs
01/04/2021 : Klebsiella pneumoniae productrice d’OXA-48 détectée dans le frottis rectal
= Acquisition nosocomiale

Absence de patient porteur dans l’unité.

                                                                                 01 février 2022
LE RETOUR DE LA KLEBSIELLA PNEUMONIAE OXA-48
Investigation de l’environnement
 Protocole

Ecouvillonnage des éviers des chambres libérées et nettoyées
Eviers des chambres : triple écouvillonnage (brise-jet, orifice de trop- plein et orifice d’évacuation)
Recherche de bacilles gram négatif (entérobactéries et non-fermentants) uniquement

 Résultats
Chambre                                 Evier Chambre
      1 K. pneumoniae OXA48 + C. freundii OXA48
      2 Non investigué
      3 K. pneumoniae OXA48 + C. freundii OXA48 + E. coli OXA48 + E. cloacae OXA48
      4 E. coli OXA48 + E. cloacae OXA48
      5 Negatif
      6 K. pneumoniae OXA48 + E. cloacae OXA48
      7 Pos : KPNE OXA48 + S. marcescens OXA48
      8 Negatif
      9 Non investigué
     10 Non investigué
     11 Non investigué

                                                                                                          01 février 2022
MESURES DE CONTRÔLE DE LA DISSÉMINATION
Contrôle immédiat

• Condamnation des éviers de toutes les chambres
• Modification de la procédure de soins corporels à l’USI : usage de gants de toilette pré-imprégnés
  à UU, shampoo-cap

• Information du personnel et de la Direction
• Formation sur les biofilms, l’eau et les lavabos comme point de départ d’épidémies

                                                                                  01 février 2022
MESURES DE CONTRÔLE DE LA DISSÉMINATION
Contrôle à long terme
• Construction d’un plan de révision de l’architecture de l’USI, en accord avec les
  intensivistes.
• Validation du plan par le Comité d’hygiène hospitalière
• Accord de la direction au plan suivant :
  •   Conservation de la présence d’éviers en chambre USI
  •   Changement des éviers et syphons existants selon les recommandations du CSS 8580
  •   Signalement par affichage de l’usage autorisé du lavabo
  •   Mise en place d’un protocole de désinfection régulier des lavabo et syphons
  •   Mise en place de lave-pannes dans les chambres d’isolement de l’USI
  •   Etablissement d’une évacuation du dialysat dans une canalisation dédiée
  •   Modification de la procédure de gestion des excrétas et liquides biologiques à l’USI : usage de sachet à
      usage unique, avec absorbant, à éliminer dans les futs de déchets biologiques

                                                                                            01 février 2022
LITTÉRATURE
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Lai CC et al. Co-infections among patients with COVID-19: the need for combination therapy with non-anti-SARS-CoV-2 agents? J Microbiol Immunol Infect 2020;53:505–12 .
Lai CC et al, Increased antimicrobial resistance during the COVID-19 pandemic, Int J Antimicrob Agents 2021 Apr;57(4):106324.
Chen N et al. Epidemiological and clinical characteristics of 99 cases of 2019 novel coronavirus pneumonia in Wuhan, China: a descriptive study. Lancet 2020;395:507–13.
Wang D et al. Clinical characteristics of 138 hospitalized patients with 2019 novel coronavirus infected pneumonia in Wuhan, China. JAMA 2020;323:1061–9.
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Teich VD et al. Epidemiologic and clinical features of patients with COVID-19 in Brazil. Einstein (Sao Paulo) 2020;18:eAO6022.
Rawson TM et al. Bacterial and fungal coinfection in individuals with coronavirus: a rapid review to support COVID-19 antimicrobial prescribing. Clin Infect Dis 2020;71:2459–68.
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What Did Not Work? J Clin Med. 2020 Sep; 9(9): 2744.
V Pintado et al, Carbapenemase-producing Enterobacterales infections in COVID-19 patients, Infect Dis (Lond). 2021 : 1–10
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                                                                                                                                                      01 février 2022
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