COVID 19 PANORAMA DES PROJETS DE RECHERCHE FINANCÉS - MARS 2020 - JANVIER 2021 - ANR
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COVID 19 PANORAMA DES PROJETS DE RECHERCHE FINANCÉS MARS 2020 – JANVIER 2021
SOMMAIRE
04 28 I Rôle du système immunitaire dans les cas 51 68
Préface de Thierry Damerval les plus sévères : identification de biomarqueurs ÉPIDÉMIOLOGIE EFFETS DE L’EPIDEMIE ET DES MESURES DE
30 I Facteurs génétiques de susceptibilité aux 52 I Étude des schémas de transmission dans la population GESTION AUPRES DES DIFFERENTES POPULATIONS
06 formes graves 53 I Identification de facteurs prédictifs de l’évolution 69 I Bien-être et santé mentale
Introduction de Dominique Dunon-Bluteau, 31 I Mémoire immunitaire post-infection de la maladie chez les patients 69 I Populations vulnérables
Philippe Bouvet et Catherine Courtet 32 I Immunothérapies et approches vaccinales 54 I Effets de la gestion de la pandémie de Covid-19 70 I Inégalités sociales et inégalités de vie
sur l’accès aux soins des patients non covid
14 34 71
ÉTUDE PHYSIOPATHOLOGIQUE, DÉVELOPPEMENT DE TESTS DIAGNOSTIQUES 55 RISQUE, EXPERTISE, ACTION COLLECTIVE,
RECHERCHE DE MARQUEURS DE L’INFECTION 35 I Détection du génome viral PROTECTION CONTRE LES INFECTIONS VIRALES POLITIQUES PUBLIQUES
15 I Histoire naturelle de la maladie 36 I Tests immunologiques 72 I L’action publique à l’épreuve de la pandémie :
15 I Susceptibilités accrues à l’infection 36 I Analyse de l’air expiré 57 organiser et adapter
15 I Identification de biomarqueurs 36 I Stratégies de dépistage ORGANISATION DES SERVICES HOSPITALIERS 72 I Analyse des décisions et des mesures politiques
17 I Développement de modèles animaux ET DES SOINS 73 I Données, normes, expertise
17 I Études des atteintes respiratoires, cardiaques 38 58 I Gestion de l’épidémie, organisation des soins 73 I Démocratie et crise sanitaire
et inflammatoires dûes à l’infection du SARS-CoV-2 RECHERCHE DE MOLÉCULES ANTI-VIRALES et du travail
19 I Vers de nouvelles voies thérapeutiques 39 I Repositionnement de molécules 58 I Conditions de travail et santé des personnels de soins 74
39 I Criblage haut débit de molécules 58 I Gestion de l’épidémie et parcours de soins ORGANISATION, GESTION, INNOVATION
21 41 I Stratégies utilisant des nanoparticules
MEILLEURE CONNAISSANCE DE LA BIOLOGIE 41 I Des analogues de nucléosides 60 76
DU VIRUS SARS-COV-2 42 I Des acides nucléiques ÉTHIQUE MÉDICALE ET SCIENTIFIQUE ENJEUX SOCIAUX, ÉCONOMIQUES ET GÉOPOLITIQUES
22 I Développement d’un mime non-infectieux comme 42 I Les cribles génétiques 77 I Crise de l’emploi et conditions de télétravail
modèle d’étude du virus 43 I Stratégie anti-sens 62 77 I Épidémie, économie, globalisation
22 I Caractérisation structurale des protéines virales 43 I Les différentes approches pour contrôler PERCEPTIONS, COMPORTEMENTS,
23 I Interactome des protéines du SARS-CoV-2 l’entrée du virus dans les cellules COHÉSION SOCIALE
23 I Caractérisation des interactions protéines-ARN 63 I Les déterminants des perceptions,
45 des représentations et des comportements
25 MODÉLISATION DE LA DISSÉMINATION face à l’épidémie et aux mesures de prévention
CARACTÉRISATION DE LA RÉPONSE IMMUNITAIRE DU SARS-COV-2 64 I Sociabilités, discriminations, cohésion sociale
CHEZ LES PATIENTS INFECTES PAR SARS-COV-2 46 I Compréhension de la dissémination virale dans l’air 65 I Comment adapter les messages
26 I Études de la réponse antivirale précoce : 47 I Développement de modèles mathématiques de 65 I Attitudes des populations et stratégies vaccinales
cellules cibles et leurs réponses au virus prédiction de la dissémination virale 66 I Pratiques de prévention et pratiques sociales
26 I Réponse immunitaire innée à l’infection 48 I Données, modèles mathématiques et computationnels, 66 I Rituels de deuil, rapport au temps et à l’espace
du SARS-CoV-2 : activation et régulation méta-analyses pour la prise de décision sur les mesures 67 I Relations entre sociétés et animaux sauvages
23 I La stimulation du système inné sanitaires et les traitements
23 I La réponse hyper-inflammatoire induite par le SARS-CoV-2 49 I Emergence du risque zoonotique
23 I Réaction inflammatoire : interaction du virus
avec d’autres pathogènes ?
02 COVID 19 COVID-19 PANORAMA DES PROJETS DE RECHERCHE FINANCÉS COVID 19 COVID-19 PANORAMA DES PROJETS DE RECHERCHE FINANCÉS 03PRÉFACE
PRÉFACE
PRÉFACE
THIERRY DAMERVAL
PRÉSIDENT-DIRECTEUR GÉNÉRAL DE L’AGENCE
NATIONALE DE LA RECHERCHE (ANR)
Si, depuis une vingtaine d’années, de nombreux Le 20 avril, un deuxième appel est ouvert afin de La modélisation de la dissémination du virus dans
travaux de recherche mettaient en évidence permettre le dépôt et l’évaluation de projets en l’air dans différentes situations de la vie mobilise des (1) Les appels Flash ont été
l’augmentation des risques de développement de continu jusqu’au 28 octobre. L’appel Recherche-action approches expérimentales et théoriques. L’étude de mis en place afin d’attribuer
maladies infectieuses épidémiques, notamment due Covid-19 s’inscrivait dans le soutien de l’acquisition la propagation de l’infection virale permet d’apprécier des financements dans un
temps court pour des projets
à des pathogènes d’origine zoonotique, l’épidémie de des connaissances au service de la gestion de le risque nosocomial, d’élaborer des modèles
qui permettent le recueil de
Covid-19 qui s’est déclenchée en décembre 2019, en l’épidémie tout en prenant compte du renouvellement prédictifs ou de simulation de la diffusion de
données ou d’observations
Chine a surpris par son amplitude et par la rapidité continu des questions scientifiques qui marque son l’épidémie et de l’effet des mesures de prévention. et la mobilisation rapide des
de sa diffusion. évolution. recherches pour des besoins
Les représentations et les comportements sont urgents de recherche sur des
La diffusion accélérée de l’épidémie au niveau 234 projets ont pu être financés entre avril 2020 et déterminés par de nombreux facteurs : attitudes thématiques ciblées, notamment
mondial a constitué un défi pour la communauté janvier 2021. Aux financements de l’ANR se sont ajoutés vis-vis de la science, perception du risque, confiance liés à un événement ou une
scientifique. Il fallait à la fois caractériser le virus, les le soutien du fond d’urgence du MESRI et la à l’égard d’autrui et des institutions, mais aussi en catastrophe naturelle d’une
pathologies associées, les modes de contamination et contribution de différents partenaires, tels que la fonction des catégories sociales. Les effets de ampleur exceptionnelle :
de diffusion dans les populations, élaborer des modes Fondation pour la recherche médicale, la Fondation l’épidémie et des mesures de prévention sont étudiés Flash séisme Haïti, Flash Japon
– Great Tohoku Earthquake,
de prise en charge thérapeutique des patients, de France et plusieurs régions (Auvergne-Rhône-Alpes, du point de vue du bien-être ou de la santé mentale,
Flash Asile, Flash Ouragans….
explorer des stratégies vaccinales. Mais, une épidémie Centre-Val de Loire, Grand-Est, Hauts-de-France, des projets de vie, de l’accès à l’emploi, de la cohésion
de cette ampleur, en mettant à l’épreuve la vie sociale Occitanie, Pays de la Loire). Ces partenariats ont sociale et des solidarités, dans une perspective de (2) La recherche clinique et le
développement de vaccins ne
et relationnelle, l’ensemble des activités de production permis de mutualiser les moyens et de coordonner prise en compte des différentes populations,
font pas partie du périmètre
et de service, comme les modes de gouvernance, les efforts. notamment en terme d’accroissement des inégalités
d’action de ces appels à projets
questionne aussi les perceptions, les comportements, et des vulnérabilités. Le rôle de l’expertise scientifique, de l’ANR.
les conditions de mise en place des mesures et de La communauté scientifique s’est mobilisée pour l’impact des décisions publiques, l’analyse coût-
(3) Un rapport de l’OCDE
leur efficience. proposer des projets de recherche, mais elle s’est efficacité des mesures, les modalités de production
souligne le caractère holistique
aussi mobilisée pour évaluer les projets avec la plus des normes et des recommandations, sont autant de des appels à projets lancé par
Cette épidémie a constitué, et constitue encore, un grande rigueur. Les projets financés, grâce à ces deux travaux qui concourent à mieux comprendre les l’ANR sur la Covid-19.
défi sans précédent pour la recherche scientifique et premiers appels à projets, couvrent un vaste champ conditions de mise en œuvre des politiques.
s’est traduite par une mobilisation exceptionnelle de de recherche, alliant les recherches fondamentales
la communauté scientifique mondiale. et les perspectives d’application ou la production Des travaux sur l’organisation des services hospitaliers
de recommandations. et des soins mettent en évidence les pratiques, les
Dès février 2020, l’ANR, en synergie avec le ministère formes d’adaptation des services hospitaliers, mais
de l’Enseignement supérieur, de la Recherche et de L’identification de nouvelles pistes thérapeutiques aussi les conditions de travail des personnels ainsi
l’Innovation et avec Reacting a mis en place des outils nécessite une compréhension approfondie des que les dilemmes éthiques et moraux que peuvent
de financement pour accompagner la production mécanismes de l’infection et de son évolution, des rencontrer les équipes.
des connaissances, le recueil de données ou facteurs de risque, mais aussi des mécanismes de
d’observations au service de la gestion de l’épidémie. réplication du virus dans la cellule et de la réponse En mobilisant les différentes disciplines des sciences
immunitaire. L’élaboration de tests diagnostiques humaines et sociales, des sciences biologiques et
Les instruments de financement de l’ANR ont été plus faciles d’utilisation, la recherche de molécules médicales, physiques et chimiques, des mathématiques
adaptés pour répondre à l’urgence de la situation. Un antivirales s’appuyant sur le repositionnement de et de l’informatique, les 234 projets présentés dans ce
premier appel Flash (1) a été lancé le 6 mars et clôturé molécules et sur l’identification de nouvelles cibles panorama mettent en évidence les dynamiques
le 23 mars. Deux jours après réception des dossiers, thérapeutiques ou encore la recherche de matériaux scientifiques dans leurs multiples dimensions (3) et
44 projets bénéficiaient d’un fond d’amorçage. pour des masques respiratoires plus protecteurs font leur apport à la lutte contre l’épidémie.
La liste des projets financés a été publiée le 9 avril, aussi l’objet de travaux (2).
soit 5 semaines après la publication de l’appel.
04 COVID 19 COVID-19 PANORAMA DES PROJETS DE RECHERCHE FINANCÉS COVID 19 COVID-19 PANORAMA DES PROJETS DE RECHERCHE FINANCÉS 05INTRODUCTION
INTRODUCTION
L’IMPLICATION DE L’ANR DANS Les axes scientifiques choisis, à la fois pluri et interdiscipli-
naires, concernaient l’ensemble des disciplines suscep-
• Impact sur les pays en développement et les territoires
ultra-marins, et sur les relations Nord/Sud.
LE SOUTIEN À LA RECHERCHE tibles d’apporter des connaissances sur l’épidémie, les
conditions de sa gestion, mais aussi sur les caractéris-
• Modèles de sortie de crise sanitaire articulés avec la transi-
tion écologique et les objectifs de développement durable.
SUR LA COVID-19 tiques du virus, de la maladie et sur les thérapeutiques
potentielles.
L’appel Flash Covid-19 visait principalement les théma-
• Conditions de travail et conflits sociaux.
• Enjeux géopolitiques et impact sur les relations interna-
tionales.
tiques suivantes : • Observations environnementales additionnelles de l’épi-
démie (à l’exclusion des systèmes d’observation environ-
Études épidémiologiques et translationnelles. nementaux usuels).
• Histoire naturelle de la maladie (y compris les facteurs
Les premiers cas suspects de pneumonie sont détectés en sharing research data and finding relevant to the nCov anthropiques) et modes de transmission du virus. Les projets de développement vaccinaux et de recherche
décembre 2019 à Wuhan et attribués à une contamination outbreak » signée dès la fin janvier 2020 par des centaines • Diagnostic de l’infection, du portage asymptomatique, clinique interventionnelle, qui nécessitent des finance-
par un nouveau coronavirus dénommé SARS-CoV-2. d’institutions dans le monde dont l’ANR. de l’évolution de la réponse immune. ments de grande ampleur, n’étaient pas ciblés ; en effet
L’épidémie Covid-19 est déclarée « urgence de santé • Caractérisation clinique et prise en charge. des appels à projets européens ou encore le PHRC sont
publique internationale » fin janvier 2020 par l’OMS. En Les objectifs des appels Flash Covid-19 • Modèles numériques prédictifs et rétrospectifs. dédiés à ces thématiques.
France, la structure opérationnelle dédiée aux épidémies et RA-Covid-19
REACTing (Research and Action Targeting emerging Physiopathogénie de la maladie (interactions virus-hôte Quelques chiffres
infectious diseases – créée par l’Inserm en 2013 sous l’égide Les appels Flash sont des instruments spécifiques de et réponse immune).
d’Aviesan) bénéficie, dès le 10 février 2020, de premiers l’ANR permettant de financer des projets de recherche • Développement de modèles animaux et cellulaires. NOMBRE DE PROJETS SÉLECTIONNÉS, FINANCEMENTS
financements pour amorcer des projets de recherche sur dans un délai court et dans le respect des principes d’éva- • Cibles thérapeutiques et modèles d’évaluation de candi- ALLOUÉS ET TAUX DE SÉLECTION
la Covid-19. luation par les pairs. L’appel Flash Covid-19, ouvert du dats médicaments (n’incluant pas les vaccins).
6 mars au 23 mars 2020, avait pour objectif de soutenir les Appel Flash Covid-19 RA-Covid-19
Dès ce début de crise sanitaire mondiale, en articulation communautés scientifiques de recherche mobilisées sur Mesures de prévention et de contrôle de l’infection en 2020 2020 + 2021
avec le ministère de l’Enseignement supérieur, de la la Covid-19(1) et ainsi de renforcer les premières actions sou- milieu de soins (y compris les meilleurs moyens de proté-
Nombre de 259 614
Recherche et de l’Innovation (MESRI) et REACTing, l’ANR a tenues par REACTing. Mais cette initiative avait également ger les agents de santé) et en milieux communautaires. propositions éligibles
souhaité s’inscrire dans l’effort de recherche nationale pour objectifs de mobiliser la recherche au-delà des com- • Vulnérabilité et résilience des personnes, des collectifs et
Nombre de propositions 106 complets 128
pour contribuer à la gestion de la pandémie. munautés scientifiques déjà impliquées et, au-delà de la des organisations.
détaillées sélectionnées + 9 amorcés (4)
réponse à court terme, de produire des connaissances sur • Conditions d’efficience et conditions réelles de mise en
Taux de sélection 40,9 % 20,8 %
L’ANR a ainsi développé tout au long de 2020 un large dis- le plan épidémiologique, physiopathologique, sanitaire œuvre des actions d’information, de prévention, de soin et
positif pour accompagner les dynamiques scientifiques aussi bien que social et économique. de lutte. Budget alloué (en M€) 17,6 14,6
comportant à la fois des appels à projets spécifiques, l’affi- • Évaluation et modélisation de l’impact épidémiologique, Budget moyen alloué 153 114
chage d’une priorité Covid-19 dans l’appel à projets géné- L’appel « Recherche Action Covid-19 » (RA-Covid-19) ciblait économique et financier de l’épidémie et des mesures de (en K€)
rique et des initiatives en coopération internationale. l’acquisition de connaissances avec une application des prévention et de contrôle.
résultats, méthodes ou techniques dans les 3 à 12 mois ou Le nombre total de projets sélectionnés sur ces 2 appels
L’appel « Flash Covid-19 » est annoncé dès la deuxième quin- le recueil immédiat de données spécifiques à la période Éthique – Sciences humaines et sociales associées à la à projets est de 234 pour un financement global de
zaine de février 2020, afin de renforcer les premières actions épidémique et post-épidémique(2). Cet appel ouvert du réponse. 32,2 millions d’euros.
soutenues par REACTing et de mobiliser la recherche 20 avril au 28 octobre 2020 offrait la possibilité de déposer • Enjeux géopolitiques.
au-delà des communautés scientifiques déjà impliquées des projets au fil de l’eau et de développer des travaux sur • Ethique de la recherche et du soin et droits humains
dans la réponse à la crise sanitaire. Publié, le 6 mars 2020 les nouveaux thèmes apparus au cours de la pandémie et • Représentations, perceptions, attitudes, comportements
cette première initiative visait à soutenir des projets s’inscri- de la mise en place des mesures sanitaires ou écono- relatifs à l’épidémie.
vant dans une perspective de réponse immédiate à l’épidé- miques. Il s’agissait du premier appel de l’ANR visant le • Organisation des soins, politique de santé et acceptabi-
(1) La durée des projets devait être inférieure ou égale à 18 mois
mie et nécessitant l’acquisition ou le recueil d’informations soutien de la recherche-action comprenant une évalua- lité des décisions.
et le financement maximum accordé de 200 K€.
et de données. tion au fil de l’eau.
Le deuxième appel RA-Covid-19 reprenait les quatre axes (2) La durée des projets devait être inférieure ou égale à 12 mois
et le financement maximal accordé de 150 K€.
Afin de poursuivre le soutien à la production de connais- Les axes de recherche des appels de l’appel Flash Covid-19 (Études épidémiologiques ; Phy-
sances, l’appel « Recherche Action-Covid-19 », ouvert en Flash Covid-19 et RA-Covid-19 siopathogénie de la maladie ; Prévention et contrôle de (3) REACTing (REsearch and Action targeting emerging
continu, a permis une prise en compte de la diversité des l’infection ; Dynamiques sociales et économiques, enjeux infectious diseases), consortium multidisciplinaire rassem-
blant des équipes et laboratoires d’excellences des parte-
questions apparaissant au cours du développement de la Les recommandations de l’OMS, élaborées lors d’un forum éthiques) et proposait un 5e axe portant sur les enjeux
naires français (Inserm, IRD, Institut Pasteur, CEA, CNRS,
pandémie. des 12 et 13 février 2020 réunissant des experts internatio- globaux de l’épidémie Covid-19 :
CIRAD…), a été mis en place par l’Inserm en 2013 sous l’égide
L’Appel « Résilience Covid-19 » ouvert le 18 décembre 2020 naux de la santé en collaboration avec le GLOPID-R (Global d’Aviesan. Sa mission est de préparer, d’accélérer et de coor-
jusqu’au 2 mars 2021 prenait en compte les probléma- Research Collaboration for Infectious Disease Prepared- • Compréhension des facteurs écologiques, environne- donner la recherche sur les maladies émergentes et les épi-
tiques liées à la persistance de la pandémie. Ces appels à ness), ont constitué le socle de la réflexion pour l’élaboration mentaux et humains à l’origine de l’émergence de la pan- démies.
projets ont permis à la fois de mettre en place un dispositif des appels Flash Covid-19 et RA Covid. Ces appels ont été démie et identification de pratiques permettant de limiter (4) Grâce à une procédure spécifique, l’ANR a publié l’attribu-
accéléré de financement. Ils ont contribué également à définis par un comité de pilotage scientifique associant le les risques futurs (y compris accords internationaux). tion de fonds d’amorçage le 25 mars 2020, soit deux jours
accélérer la promotion et la mise en œuvre d’une « Science MESRI, REACTing (REsearch and Action targeting emer- • Impact macro et micro-économique et sur les flux après le dépôt des projets. Le résultat de l’appel Flash Covid-
ouverte » conformément à la déclaration conjointe « on ging infectious diseases)(3) et l’ANR. d’échanges de biens et services (y compris financiers) 19 a été publié le 9 avril 2020.
06 COVID 19 COVID-19 PANORAMA DES PROJETS DE RECHERCHE FINANCÉS COVID 19 COVID-19 PANORAMA DES PROJETS DE RECHERCHE FINANCÉS 07INTRODUCTION
INTRODUCTION
RÉPARTITION DES PROJETS FINANCÉS PAR AXES ET TAUX DE SÉLECTION
RÉPARTITION DES PROJETS
Axes (Flash-Covid-19 + 17 vagues RA-Covid-19) Nombre de projets financés % de projets financés SÉLECTIONNÉS PAR RÉGIONS
DANS LES APPELS FLASH
Études épidémiologique et translationnelles 45 19 %
COVID-19 ET RA COVID-19 HAUTS-DE-FRANCE
Physiopathologénie de la maladie 92 39 %
6
Prévention et contrôle de l’infection 38 16 %
Éthique, sciences humaines et sociales associés à la réponse 49 21 % NORMANDIE
GRAND-EST
ÎLE-DE-FRANCE
Enjeux globaux de la pandémie (uniquement RA-Cov) 10 4% 1
9
Total 234 100 % BRETAGNE
113
2
PAYS DE CENTRE
LA LOIRE VAL-DE-LOIRE
BOURGOGNE
7 4
FRANCHE-COMTÉ
1
NOUVELLE
GUYANE AQUITAINE AUVERGNE
RHÔNE-ALPES
RÉPARTITION DES PROJETS DÉPOSÉS ET SÉLECTIONNÉS 1
12
29
FEMMES/HOMMES PAR GRANDS AXES DANS LES APPELS FLASH
COVID-19 ET RA COVID-19
OCCITANIE
LA RÉUNION PROVENCE-ALPES
76 CÔTE D’AZUR
1 28
71 17
69
67 67
66 65
65
80 61 CORSE
55 1
70 52
51 50
Deux projets sont portés par des unités de recherche
49 48 françaises situées à l’étranger
60
39
50
35 34 35
33 33
31
40 29
24
Une mutualisation des RÉPARTITION DES FINANCEMENTS
30
financements grâce à la mise 6,55 M€ ANR + 16,0 M€ MESRI + 9,7 M€ en cofinancement
20 en place de partenariats
Outre l’ANR et le MESRI, ces appels projets soutenus Régions :
10 27
à projets ont bénéficié d’un grand en parti ou Auverge Rhône-Alpes
en totalité Centre Val de Loire,
nombre de cofinanceurs : la Fondation
0 Grand-Est, Hauts-de-
pour la Recherche Médicale, la millions d’euros
Études Physio Prévention Enjeux Tous axes 4,7 France, Occitanie,
Éthique et Fondation de France et six régions financés
épidémiolo- pathologie et contrôle de globaux de Pays de Loire
dynamique (Auvergne-Rhône-Alpes, Grand Est,
sociale giques de la maladie l’infection l’épidémie
Hauts de France, Occitanie, Pays
projets soutenus projets soutenus
de la Loire, Région Centre-Val de Loire). 26 22
en parti ou en parti ou
Cette synergie inédite illustre d’une en totalité en totalité
part, le souhait des cofinanceurs
millions d’euros millions d’euros
Déposés par des chercheuses Déposés par des chercheurs sollicités par l’ANR de contribuer à 3 2
financés financés
Sélectionnés et portés par des chercheuses Sélectionnés et portés par des chercheurs l’effort de recherche pour lutter contre
la pandémie de la Covid-19 et, d’autre
part, de coordonner leurs actions
de soutien.
08 COVID 19 COVID-19 PANORAMA DES PROJETS DE RECHERCHE FINANCÉS COVID 19 COVID-19 PANORAMA DES PROJETS DE RECHERCHE FINANCÉS 09INTRODUCTION
INTRODUCTION
L’implication des entreprises axes de recherches « Physiopathologie de la maladie », La plupart des projets de ce domaine mobilisent des cher- comprennent 42 équipes étrangères partenaires qui ont
« Études épidémiologiques et translationnelles » et l’axe cheurs en sciences humaines et sociales, certains sont mobilisé leurs propres financements nationaux : USA (9),
Dans les deux appels Flash Covid-19 et RA-Covid-19, les « Prévention et contrôle de l’infection ». Les questions portés par des chercheurs en santé publique, notamment Suisse (6), Canada (4), Italie (3), Belgique (2), Chine (2),
entreprises privées pouvaient être porteuses ou parte- scientifiques abordées dans ces axes peuvent être regrou- pour les domaines éthique et organisation des soins. Les Royaume uni (2), Suède (2), Viet Nam (2), Allemagne, Pays-
naires de projets. Parmi les projets financés, 17 comportent pées en quatre grands thèmes : questions abordées peuvent être regroupées en 7 grands Bas, Cambodge, Cameroun, Côte d’Ivoire, Japon, Laos,
un partenariat avec au moins une entreprise, 4 sont direc- • Les études sur la biologie du virus et la recherche de thèmes, parmi lesquels cinq sont essentiellement portés Mali, Taïwan, Thaïlande.
tement portés par une entreprise (1 dans le domaine molécules antivirales ; par des chercheurs en sciences humaines et sociales et
des tests diagnostiques et 3 en recherche thérapeutique). • Une meilleure connaissance de la physiopathologie de concernent 51 projets : Les actions complémentaires de l’ANR
Au total, 21 entreprises sont impliquées. l’infection avec en particulier les conséquences sur la réac- • perception, comportements, pratiques, cohésion sociale ; contre la pandémie Covid-19 en 2020
Les autres projets concernent les domaines suivants : tests tion immunitaire ; • effets de l’épidémie et des mesures de gestion auprès
diagnostiques (3), recherche de nouvelles approches vacci- • la modélisation de la dissémination virale et les études des différentes populations ; Priorité Covid-19 dans l’appel à projets générique
nales (1), pistes thérapeutiques (7), prévention (4) et dyna- épidémiologiques ; • risque, expertise, action collective, politiques publiques ;
miques sociales (2). • le développement de tests diagnostiques innovants et • enjeux sociaux, économiques et géopolitiques ; Publié fin juillet 2020, le Plan d’action 2021 de l’ANR affiche
de nouvelles mesures de protection. • innovation, gestion, organisation. une priorité générale « Covid-19 » sur l’ensemble de l’Appel
Des recherches en lien avec l’action, à projets générique 2021 (AAPG 2021). Complémentaires
les professionnels et les parties prenantes La plupart des projets de ces thèmes sont pluri Les deux thèmes suivants regroupent 14 projets qui sont aux projets courts financés par les appels Flash Covid-19 et
disciplinaires et associent différentes disciplines de la portés par des chercheurs en sciences humaines et RA-Covid-19 et dotés d’un budget plus élevé (300-700 K€),
Plusieurs projets portant sur l’analyse des effets de la biologie (biochimie, biologie cellulaire, physiologie, épi- sociales ou par des spécialistes de santé publique ou des les projets de l’AAPG 2021 permettront de développer des
pandémie sur les populations marginalisées et précaires démiologie, recherche clinique) ou d’autres disciplines médecins : travaux de plus grande ampleur sur une durée de 3-4 ans.
associent les bénéficiaires et les travailleurs sociaux, (physique, informatique, mathématique, sciences • éthique médicale et scientifique ; L’objectif est de mobiliser les communautés scientifiques
les centres d’hébergement (par exemple, les Centres humaines et sociales, sciences de l’environnement...). • organisation des services hospitaliers et des soins. françaises sur la pandémie Covid-19 et ses conséquences
régionaux pour l’enfance et l’adolescence inadaptées), Quinze projets proposent une collaboration avec des dans le cadre d’une approche globale et de produire des
ainsi que les bénévoles. entreprises. La diversité des disciplines des sciences humaines et connaissances dans tous les domaines de recherche pou-
Les effets de la gestion de l’épidémie sur l’organisation et sociales est mobilisée : anthropologie, ethnologie, sociolo- vant être concernés.
les parcours de soin, ou encore les dimensions éthiques Les approches utilisées sont très diversifiées et souvent gie, science politique, droit, philosophie, épistémologie, Une attention particulière est portée aux projets de
font l’objet de travaux qui associent les professionnels et multiples au sein d’un même projet. On peut citer des économie (politique, du développement, expérimentale, recherche qui s’inscriront dans la lutte contre la pandémie
les services de santé, les représentants d’associations de approches de biologie structurale (cristallographie, financière…), gestion, psychologie (clinique, sociale, cogni- ou qui permettront de mieux comprendre les facteurs
patients ou les patients eux-mêmes, les référents scienti- résonnance magnétique nucléaire), omics (protéomique, tive), psychopathologie. De nombreux projets rassemblent environnementaux, anthropiques, sanitaires, socio-écono-
fiques des établissements de recherche. transcriptomique, génomique), génétiques (cribles, déve- différentes disciplines. miques et comportementaux pouvant jouer un rôle dans
loppement de modèles murins), biologie cellulaire, immu- Les méthodes relèvent d’approches qualitatives (observa- l’émergence, la propagation des pandémies, de dévelop-
Les grandes dynamiques scientifiques nologie, virologie, épidémiologie, des développements tions, entretiens, journaux personnels, récits, groupes de per des moyens d’évaluation et de réduction des risques
soutenues dans les appels Flash Covid méthodologiques issus de la physique, modélisations discussion en ligne, analyse de discours…) et quantitatives et de surveillance des différents impacts, d’analyser et
et RA Covid mathématiques… (à partir d’enquête de panel, de suivi longitudinal…), mais d’accompagner les évolutions sociales, économiques,
aussi d’approches expérimentales (dont expérimentation environnementales, agricoles et industrielles liées à la ges-
Les projets financés couvrent différents domaines qui Certaines études s’appuient sur des cohortes ou des essais en ligne, expérience de terrain…). tion de la crise. La métropole, les territoires ultramarins et
vont des études physiopathologiques, de la connaissance cliniques déjà existant au moment du dépôt du projet. En l’international sont concernés. Il s’agit également d’ac-
de la biologie du virus SARS-CoV-2, à la caractérisation de particulier, les Cohortes APHP Covid, PED-COVID, COVIDeF, Les terrains d’étude et les types de données sont multiples : compagner la reprise économique en limitant l’impact
la réponse immunitaire des patients, jusqu’aux tests dia- CoV-CONTACT / Cov-CONTACT-SERO, TEMPO-Cohorte, • population générale aux différents âges et de différentes des activités humaines sur les changements globaux et
gnostiques et aux molécules antivirales. Les études épidé- Constances, EPIPAGE-ELT, Nutrinet, E3N-E4N, PAQUID, catégories sociales, patients, professionnels de santé, en développant des processus augmentant la résilience
miologiques, la modélisation de la dissémination du virus, 3C – Cohorte des 3 cités, AMI, Grippenet, les essais cliniques intervenants institutionnels, journalistes…; de la société. Les approches globales inter et transdiscipli-
la protection contre les infections, l’organisation des ser- DisCovery, Liliade, COVIDICUS, la Biobanque COLCOV19 • État et institutions publiques, écoles, scientifiques, naires sont encouragées.
vices hospitaliers et l’éthique médicale ou scientifique à Bordeaux, la biocollection (IBIS) et cohorte (ATLANREA) experts, agences, ONG et associations… ;
font aussi l’objet de travaux. Les dimensions sociales et du CHU de Nantes, la cohorte COVID l’hôpital de Lille, la • cohortes (Constances, Elf-EPipage, Nutrinet et E3N-E4N, Les projets déposés à l’automne 2021 suivent un processus
humaines sont largement abordées à travers l’étude des cohorte « French Covid» et de l’étude COVERAGE. REACTing…) ; d’évaluation en deux étapes et le résultat de la sélection
déterminants des perceptions et des comportements, des • web et réseaux sociaux… sera publié en juillet 2021.
effets de l’épidémie et des mesures sur les différentes Recherches sur les dimensions sociales
populations, des conditions de l’expertise et des politiques et économiques de la pandémie De nombreux projets proposent des comparaisons inter- Une 3e initiative spécifique : l’appel à projets
publiques, ainsi que du point de vue des enjeux sociaux, nationales avec différents pays (dont l’Italie, l’Allemagne, la Résilience Covid-19
économiques et géopolitiques. Plusieurs axes des appels à projets Flash Covid et Ra Covid Suisse, le Royaume-Uni, l’Autriche, le Canada, les Etats-
Outre les sciences biologiques et médicales et les sciences concernaient les dimensions humaines, sociales et éco Unis, l’Amérique du Sud, l’Afrique centrale, le Mali, la Nou- Suite à la recrudescence de la pandémie Covid-19 à l’au-
humaines et sociales, les projets mobilisent les mathé nomiques de la pandémie : deux axes parmi les quatre velle-Zélande, la Chine). tomne 2020 et à la mise en place du 2e confinement, une
matiques et la modélisation, les sciences physiques et proposés dans l’appel Flash (« Prévention et contrôle de troisième initiative spécifique, intitulée « Résilience Covid-
chimiques. l’infection » et « Ethique, sciences humaines et sociales Des projets en coopération internationale 19 », a été lancée le 18 décembre 2020 et clôturé le 2 mars
associées à la réponse ») et trois axes parmi les cinq de 2021. Son objectif est de financer rapidement des projets à
Recherches en biologie-santé sur le virus, l’appel Recherche action (« Prévention et contrôle de l’in- 1 5 % des projets financés dans les appels Flash Covid-19 et court terme prenant en compte les nouveaux développe-
la maladie Covid-19 et les modes de prévention fection », « Dynamiques sociales et économiques, enjeux RA-Covid-19 comprenaient au moins une équipe parte- ments de la pandémie. Cet appel vise à soutenir des pro-
Les appels FLASH et RA-COVID ont privilégié plusieurs éthiques », « Enjeux globaux de l’épidémie Covid-19 »). naire étrangère financée sur fonds propres. 30 projets jets ciblant des domaines pas encore ou peu défrichés
10 COVID 19 COVID-19 PANORAMA DES PROJETS DE RECHERCHE FINANCÉS COVID 19 COVID-19 PANORAMA DES PROJETS DE RECHERCHE FINANCÉS 11INTRODUCTION
INTRODUCTION
dans les appels précédents et qui nécessitent un finance- financés par la JST et trois projets franco-japonais se sont CE NUAGE DE MOTS EST ISSU DE L’ENSEMBLE DES TITRES
ment immédiat. Les projets doivent également avoir pour concrétisés. ET RÉSUMÉS DES PROJETS FINANCÉS DANS LES APPELS
objectif l’acquisition de connaissances avec une applica- Un colloque sino-européen associant l’agence chinoise À PROJETS FLASH COVID-19 ET RA-COVID-19
tion attendue en terme de méthodes, de techniques ou NSFC et Science Europe incluant l’ANR a eu lieu le 14
de recommandations dans les douze mois. décembre 2020 sur le thème « prévention et contrôle de Le corpus a été analysé après lemmatisation des mots de même
l’épidémie » avec l’objectif de développer des collabora- famille et nettoyage des mots communs (ex : le, la, de, du, et…)
Dans la continuité des appels Flash Covid-19 et RA - tions sino-européennes. Ces deux coopérations se prolon- n’apportant pas de plus-value à l’étude lexical.
Covid-19, et en cohérence avec les recommandations de geront en 2021.
l’OMS et les priorités de recherche établies par REACTing L’ANR cofinancera également en mars 2021 l’appel inter-
(aujourd’hui ANRS Maladies infectieuses émergentes), les national dans le domaine des sciences humaines et
axes de l’appel étaient les suivants : sociales « Recovery, renewal, and résilience in post-pande-
• physio-pathogénie et épidémiologie ; mic world » porté par la plateforme transatlantique qui
• prévention, contrôle de l’épidémie et dynamiques regroupe 11 agences de financement (6).
sociales ;
• impacts économiques et organisationnels sur les diffé- Des actions de diffusion
rents secteurs d’activité et les relations internationales.
Enfin, l’ANR prévoit en 2021 la publication d’un rapport
Le périmètre de l’appel était plus restreint que les appels d’étape sur des résultats obtenus par les projets financés
Covid-19 précédents et ciblait des thématiques de dans le cadre des appels Covid-19 avec l’organisation d’un
recherche encore inconnues durant l’été 2020, telles que colloque bilan en 2022.
le Covid-long ou l’impact de la Covid-19 sur la santé men-
tale. La durée maximale des projets était de 12 mois et d’un
budget maximal de 80 K€. 155 projets ont été déposés.
La sélection se tiendra la seconde quinzaine d’avril 2021.
Des coopérations avec les régions
L’ANR a également été associée à la dimension régionale
de la recherche sur la Covid-19 en tant qu’opérateur de
l’évaluatio n(5). Deux régions, qui ont participé au co-finan-
cement de l’appel Flash, ont organisé chacune un appel
« Résilience Covid-19 ». L’appel de la région Grand Est s’est
déroulé en juin 2020 et celui de la région Hauts-de-France
en novembre 2020, financés chacun à parts égales par la
région et par le MESRI (2 M€ pour chaque appel).
Les deux appels à projets « Résilience Grand-Est » (67 pro-
jets évalués pour 15 lauréats) et « Résilience Hauts de
France » (33 projets évalués pour 15 lauréats) avaient pour (5) Dans le cadre de ses prérogatives définies par décret,
objectifs d’évaluer l’impact territorial de la crise sanitaire, l’ANR peut « participer à des actions menées en commun ou
notamment sur le système de santé, l’économie, la société pour le compte des services de l’Etat, des collectivités territo-
et l’environnement et d’accompagner leur adaptation. Ils riales et de leurs groupements ou d’autres organismes
visaient également à encourager les collaborations entre publics ou privés, français ou étrangers ».
les acteurs privés et les différents laboratoires acadé- (6) Academy of Finland ; Croatian Science Foundation ;
miques régionaux dans la perspective de favoriser la rési- Department of Science, Technology and Innovation (Colom-
lience des territoires. bia): Federal Ministry of Education and Research / DLR Pro-
ject Management Agency (Germany) ; Fonds de recherche
Des coopérations internationales du Québec – Société et culture (Canada) ; French National
Research Agency ; International Development Research
Centre (Canada); National Research Foundation (South
Les actions internationales sur la Covid-19 s’inscrivent dans
Africa) ; National Science Centre (Poland) ; National Science
le cadre des collaborations existantes avec des agences Foundation (USA) ; São Paulo Research Foundation (Brazil) ;
partenaires de l’ANR. Social Sciences & Humanities Research Council (Canada) ;
L’ANR a privilégié la coordination et la collaboration entre Swiss National Science Foundation ; The German Research
projets issus d’appels de type « Flash nationaux » via des Foundation ; UK Research and Innovation – Arts and Humani-
interactions bilatérales avec des agences partenaires. Une ties Research Council ; UK Research and Innovation – Econo-
interaction avec la JST (Japan Science and Technology mic and Social Research Council.
Agency) a permis d’orienter des chercheurs français lau- (7) Lancement prévu fin mars, pour une réception des dos-
réats du Flash-Covid-19 vers des chercheurs japonais siers complets fixée au 30 juin 2021.
12 COVID 19 COVID-19 PANORAMA DES PROJETS DE RECHERCHE FINANCÉS COVID 19 COVID-19 PANORAMA DES PROJETS DE RECHERCHE FINANCÉS 13ÉTUDE PHYSIOPATHOLOGIQUE, RECHERCHE DE MARQUEURS DE L’INFECTION
ÉTUDE PHYSIOPATHOLOGIQUE, RECHERCHE DE MARQUEURS DE L’INFECTION
ÉTUDE PHYSIOPATHOLOGIQUE, Histoire naturelle de la maladie risque, en se basant sur l’état des télomères et de la sénes-
RECHERCHE DE MARQUEURS
cence de leurs cellules sanguines (PBMC), fournissant une
Le projet COVID A vise à mieux comprendre l’histoire base rationnelle pour l’utilisation des télomères comme
DE L’INFECTION
naturelle de l’infection et notamment dans sa phase ini- biomarqueurs pour la détection et le diagnostic précoce
tiale, au niveau de la population générale. Cette étude des formes graves d’infection par le SARS-oVc-2.
s’appuiera sur un système de surveillance clinique et viro-
logique déjà mis en place par le réseau Sentinelles, Santé Déterminer si la gravité de l’infection au SARS-CoV-2
publique France et le Centre National de Référence pour avec l’âge est associée à un dysfonctionnement
L’identification de nouvelles pistes Deux populations particulièrement à risques, suivre en temps réel les infections dues au SARS-CoV-2 télomérique. – COST
thérapeutiques nécessite une compréhension les patients en surpoids ou obèses et les vues en consultation de soins primaires (médecine géné- Appel à projets ANR : RA-Covid – Vague 14
rale et pédiatrie) en France métropolitaine. Cette étude Coordinateur : Delphine Benarroch-Popivker, UMR 7284 –
approfondie des différentes étapes de la personnes âgées, font l’objet d’études portant
permettra d’identifier les facteurs de risques de dévelop- Institute for Research on Cancer and Aging (IRCAN) –
maladie. sur les spécificités du tissu adipeux et sur les
per une forme légère, sévère ou fatale et de proposer une Université Nice Sophia Antipolis / Nice
caractéristiques des cellules sénescentes par
Le système de surveillance clinique prise en charge adaptée.
rapport à l’infection.
et virologique mis en place par le réseau La sénescence cellulaire est un processus clé du vieillisse-
Sentinelles, Santé publique France et le Centre Une meilleure connaissance de la cause du Évolution clinique et virologique des patients ment physiologique et de nombreuses pathologies liées à
National de Référence constitue une ressource décès par insuffisance respiratoire aiguë présentant une infection respiratoire aiguë due au l’âge. Le projet SENOCOVID s’intéresse à la susceptibilité
pour suivre en temps réel les infections suivies induite par le SARS-CoV-2 est fondamentale SARS-CoV2 (Covid-19) vus en consultation de soins des personnes âgées à contracter l’infection au SARS-
en consultation de soins primaires. pour guider les cliniciens dans la prise en charge primaires (médecine générale et pédiatrie) – COVID-A CoV-2. Il étudie la sénescence cellulaire pulmonaire
des patients COVID-19 gravement malades. Appel à projets ANR : Flash Covid comme cible pour contrôler la Covid-19. Il s’attache aussi à
L’identification de marqueurs moléculaires Coordinateur : Thierry Blanchon, Institut Pierre Louis quantifier l’accumulation des cellules sénescentes au
Plusieurs axes de recherches sont explorés
diagnostiques, pronostiques et prédictifs d’Epidémio logie et de Santé Publique – Sorbonne cours de l’infection, à déterminer la nature des cellules
qui associent des analyses histologiques
de réponse aux traitements est une étape Université / Paris sénescentes et les signatures moléculaires de cette sénes-
pulmonaires post-mortem couplées à des
nécessaire pour mieux comprendre les https://anr.fr/projet-ANR-20-COVI-0031 cence. L’analyse de l’impact d’une sénescence préexis-
données cliniques des patients, des analyses
mécanismes de l’infection et son évolution tante ou induite sur la réplication virale et les lésions
d’images de tomodensitométrie, des analyses
chez les patients. Sont étudiés notamment, le pulmonaires sera analysée au moyen de modèles expéri-
des fibrocytes pulmonaires, la caractérisation
microbiote de l’oropharynx et du tube digestif Susceptibilités accrues à l’infection mentaux.
de la réponse immunitaire humorale de la
comme source potentielle de biomarqueurs,
muqueuse pulmonaire en utilisant des lavages Comprendre les susceptibilités à l’infection peut aider à La sénescence cellulaire pulmonaire comme cible
les échantillons sanguins issus de cohorte,
bronchoalvéolaires, en étudiant les rôles de protéger les personnes vulnérables et à orienter le choix et pour contrôler la Covid-19 – SENOCOVID
les marqueurs mitochondriaux et pulmonaires,
l’inflammasome et des macrophages. le développement des traitements. L’obésité est un fac- Appel à projets ANR : RA-Covid – Vague 3
le virome respiratoire.
De nouvelles approches thérapeutiques sont teur aggravant de l’infection au SARS-CoV-2. Le tissu adi- Coordinateur : François Trottein, Institut Pasteur / Lille
Bien que fortement touchés par la pathologie, peux, infecté par le SARS-CoV-2, pourrait participer https://anr.fr/projet-ANR-20-COV3-0006
développées à partir de cellules de cordons
les poumons ne sont pas les seuls organes à la survenue de l’inflammation observée dans les formes
ombilicales ou utilisant des dérivés de la
infectés par le virus SARS-coV-2. L’atteinte sévères. Le projet COVIFAT a pour objectif de déterminer
mélatonine. Une étude observationnelle
d’autre organes pourraient modifier les
propose de valider l’efficacité d’un programme
la pathogenèse de l’infection du tissu adipeux par le SARS- Identification de biomarqueurs
réponses immunitaires des patients. Afin CoV-2. Il étudie si le virus infecte plus facilement le tissu
de télé-réhabilitation respiratoire pour des
d’analyser cette dissémination virale, il est adipeux de patients obèses par rapport aux patients sans Le projet ICOVID, va s’appuyer sur l’archivage exceptionnel
patients post COVID-19 porteurs de séquelles.
nécessaire de disposer de modèles animaux surpoids, s’il y a un tropisme particulier pour le tissu adi- d’échantillons sanguins des patients atteints du SARS-
Les bases de données médico-administratives
appropriés, murins et macaques. Les effets peux viscéral ou sous-cutané et quels sont les types cellu- CoV-2 depuis mars 2020 admis à l’Assistance Publique –
seront également utilisées afin d’identifier les laires cibles de SARS-CoV-2 au sein du tissu adipeux. Hôpitaux de Paris. L’objectif est de mener des études
du SARS-CoV-2 sur le système vasculaire,
troubles organiques à moyen terme chez les cas–témoins à partir de groupes définis rétrospective-
cardiovasculaire et le système nerveux central
sujets infectés par le SARS-CoV-2 Rôle du tissu adipeux au cours de la Covid-19 : de la physio ment en fonction de leur évolution clinique afin de définir
font aussi l’objet de travaux de recherche.
pathologie aux perspectives thérapeutiques – COVIFAT les paramètres immunomiques cinétiques caractérisant
Compte-tenu de la variabilité de la susceptibilité Appel à projets ANR : RA-Covid – Vague 3 – Financé les différents profils d’évolution. Cette recherche fonda-
à l’infection, Il est important de comprendre par la Fondation de France mentale doit également déboucher sur la définition de
les facteurs de risque des formes sévères Coordinateur : Olivier Bourron, UMR U955 – Institut Mondor biomarqueurs de sévérité et contribuer à la définition de
et d’identifier les causes de susceptibilité de Recherche Biomédicale (IMRB) – Inserm / Créteil nouvelles cibles thérapeutiques.
à l’infection pour protéger les personnes
vulnérables et orienter le choix des traitements. Un parallèle peut être établi entre la gravité de l’infection Immunopathologie de la Covid-19 à l’Assistance
par le SARS-CoV-2 et le vieillissement. Le projet COST vise Publique Hôpitaux de Paris – iCovid
à déterminer si la plus grande vulnérabilité de certains Appel à projets ANR : Flash Covid – Financé
patients à une infection grave par le SARS-CoV-2 est asso- par la Fondation de France et par l’ANR
ciée à un dysfonctionnement télomérique et si le traite- Coordinateur : Guy Gorochov, Centre d’Immunologie
ment à la dexaméthasone diminue la mortalité des et de Maladies Infectieuses – Inserm / Paris
patients en renforçant la protection des télomères, préve- https://anr.fr/projet-ANR-20-COVI-0025
nant ainsi la sénescence et le vieillissement des cellules.
Cette étude pourrait aider à identifier les patients à haut
14 COVID 19 COVID-19 PANORAMA DES PROJETS DE RECHERCHE FINANCÉS COVID 19 COVID-19 PANORAMA DES PROJETS DE RECHERCHE FINANCÉS 15Vous pouvez aussi lire
