NOTRE OFFRE 2018 DE SERVICES ET DE R&D - Le partenaire de vos projets de recherche en santé à Nantes - Université ...

 
NOTRE OFFRE 2018 DE SERVICES ET DE R&D - Le partenaire de vos projets de recherche en santé à Nantes - Université ...
NOTRE OFFRE 2018
                      DE SERVICES ET DE R&D

      Le partenaire
  de vos projets de
recherche en santé
          à Nantes
NOTRE OFFRE 2018 DE SERVICES ET DE R&D - Le partenaire de vos projets de recherche en santé à Nantes - Université ...
UNE PORTE D’ENTRÉE UNIQUE POUR VOS
PROJETS EN SANTÉ
La SFR-Santé François Bonamy
UN FED 4203/UMS Inserm 016/CNRS 3556/CHU Nantes

ü coordonne les activités de 19 plates-formes de R&D à Nantes
ü accompagne vos projets des phases in vitro aux développements
  précliniques et cliniques

                                                     + 200 équipements
                                                  143 ingénieurs-techniciens
                                                    + 40 publications/an
                                                    4 brevets + 2 licences
                                                     7 labellisations IBiSA
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NOS DOMAINES D’APPLICATIONS

 IMMUNOBIOTHÉRAPIES           MÉDECINE RÉGÉNÉRATRICE
CANCER, TRANSPLANTATION        BIOTHÉRAPIES, BIOMATÉRIAUX

                          +

RADIOPHARMACEUTIQUES          MÉDECINE PERSONNALISÉE
   MÉDECINE
   MÉDECINE NUCLÉAIRE,
            NUCLÉAIRE,         GÉNÉTIQUE, BIOINFORMATIQUE
 RAYONNEMENTS
 RAYONNEMENTS IONISANTS
              IONISANTS       BIOMARQUEURS, ÉPIDÉMIOLOGIE
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NOTRE OFFRE TECHNOLOGIQUE

     MODÈLES CELLULAIRES ET GÉNIQUES
     Cellules souches • Collection d’échantillons • Génie-génétique • Vecteurs viraux
     précliniques et cliniques

     ANALYSES IN VITRO, IMAGERIE CELLULAIRE & TISSULAIRE
     Cytométrie • Tri cellulaire • Radiomarquage • Microscopie à fluorescence et
     électronique • Histologie

     MODÈLES IN VIVO ET EXPÉRIMENTATION (PRÉ)CLINIQUE
     Animaleries rongeurs et grands animaux • Transgénèse • Radio-immunothérapie •
     Exploration fonctionnelle sur le petit animal • Immuno-monitorage clinique

     ANALYSES–OMIQUES, PURIFICATION & CRIBLAGE
     Génomique • Protéomique fonctionnelle • Lipidomique et Biomarqueurs •
     Bio-informatique • Production & Purification de protéines et peptides
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QUELQUES EXEMPLES DE PROJETS

                           Caractérisation de Lymphocytes B
 IMMUNOBIOTHÉRAPIES        régulateurs dans l’asthme

           MÉDECINE        Du développement embryonnaire à la
       RÉGÉNÉRATRICE       régénération du disque intervertébral

           MÉDECINE        Mécanismes physiopathologiques d’une
       PERSONNALISÉE
                       +

                           maladie cardiovasculaire héréditaire

                   S
RADIOPHARMACEUTIQUE        Caractérisation de radio-pharmaceutiques
                           ciblant le cancer de la prostate
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DES ÉQUIPEMENTS ET DES COMPÉTENCES
                                                                                    Liste non exhaustive

                                                           Microscopie à fluorescence et histologie
                                                           2 microscopes confocaux
                                                           1 microscope super-résolution
                                                           1 vidéomicroscope
                                                           1 scanner de lames

                                                                        Microscopie électronique
                                                                        et microtomographie

Génomique                                                                  Protéomique fonctionnelle
2 séquenceurs haut-débit (NGS)                                              3 SPR
1 station de génotypage et profilage                                        1 microcalorimètre
d'expression                                                                1 spotteur
2 scanners de microarray                                                    1 scanner puces à protéines
                                                                            3 analyseurs biophysiques
                                                                            1 lecteur label free et α-screen
   Spectrométrie de masse
                                                          Cytométrie
      3 GC-MS & 1 GC-C-IRMS
                                                          4 analyseurs multiparamétriques
 1 UPLC-MS/MS & 1 UPLC-HRMS
                                                          1 analyseur avec passeur de plaques haut-débit
                                                          1 trieurs jet-in-air Influx
                                       Cellules souches   1 trieur FACS ARIA III
                                                          1 cytomètre imageur ISX
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NOTRE RÉSEAU DE PLATES-FORMES

                             iPSC          GenoCellEdit        CPV            DTC          UTCG            CRB
   Modèles cellulaires       Cellules
                                             Edition à     Production        Transfert                  Collections
        et géniques          souches                                                      Thérapie
                                             façon du      de vecteurs      clinique de                d’échantillons
                          pluripotentes                                                   Cellulaire
                                             génome          viraux        Biothérapies                   humains
                             induites

                           Cytocell        MicroPICell        SC3M
    Analyses in vitro,                       Histologie      Histologie
 Imagerie cellulaire &    Cytométrie
                                 -                -         MET & MEB
             tissulaire                    Microscopie à      Micro-      Radioactivité
                          Tri cellulaire
                                           fluorescence    tomographie    Radiochimie
                                                                          Radiobiologie
                          Therassay          CIMNA            TRIP         Exp. in vivo     UTE            LGA
       Modèles in vivo     Exploration
   et expérimentation                        Immuno-                                                    Animalerie
                          fonctionnelle                    Transgénèse                    Animalerie
                                            monitorage                                                    grands
         (pré)clinique     sur le petit                        rat                         Rongeurs
                                              clinique                                                   animaux
                             animal

                          GenoBiRD           IMPACT        Spec. Masse        P2R
    Analyses–omiques,                                                      Protéines
                          Génomique                        Biomarqueurs
purification & criblage       &
                                           Protéomique
                                                                  -     recombinantes
                                           fonctionnelle                  Production
                           Bioinfo.                         Lipidomique
                                                                          Purification
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NOUS CONTACTER
facilities-sfr@univ-nantes.fr

                                  Structure Fédérative de
                                  Recherche en santé
                                  François Bonamy
                                  Institut de Recherche en Santé
                                  de l'Université de Nantes
                                  (IRS-UN)
                                  8, quai Moncousu
                                  BP 70721
                                  44007 Nantes Cedex 01

                          www.sfrsante.univ-nantes.fr
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MODÈLES CELLULAIRES ET GÉNIQUES
             NOTRE OFFRE

     Vous recherchez des échantillons biologiques, des vecteurs de thérapie génique, des outils
     d’édition du génome ou des cellules souches ?

                                                                                         CELLULES SOUCHES & THÉRAPIE
                                                                                                 CELLULAIRE
                                                                                 Culture et cryoconservation de cellules
                                                                                 souches pluripotentes humaines et
                                   GÉNIE GÉNÉTIQUE & VECTORISATION               animales

                                                                                 Reprogrammation de cellules adultes en
                                 Production de vecteurs viraux de grade
                                                                                 cellules souches pluripotentes
                                 préclinique (qualité recherche) et
                                 clinique                                        Différenciation in vitro des cellules souches
  RESSOURCES BIOLOGIQUES                                                         en cellules spécialisées (cœur, foie, …)
                                 Conseil (design, utilisation) sur le choix
                                 des vecteurs viraux                             Transfert à la clinique de protocoles de
  Collections d’échantillons                                                     production cellulaire issus de la recherche
    biologiques humains          Conseil sur la stratégie CrispR                 expérimentale
                                 Type de Cas9, vecteurs, sgRNA, protocoles
sérum, plasma, cellule, urine…                                                   Délivrance de produits de biothérapie
                                                                                 cellulaire conformes aux plus hauts
                                 Design, validation fonctionnelle in silico et
                                                                                 standards de qualité, de sécurité et de
                                 construction de sgRNA et ADN donneur
                                                                                 traçabilité
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ANALYSES IN VITRO, IMAGERIE CELLULAIRE ET TISSULAIRE
          NOTRE OFFRE

Vous souhaitez cribler des molécules et            Vous avez besoin de technologies
observer l’expression de biomarqueurs ?            d’imagerie cellulaire ou d’histologie ?

        PURIFICATION ET CARACTÉRISATION                    IMAGERIE CELLULAIRE & TISSULAIRE
         DE POPULATIONS CELLULAIRES PAR                             (HISTOLOGIE)
                   CYTOMÉTRIE
                                                 Analyse simultanée de l’expression de biomarqueurs
   Tri cellulaire                                (Tissue Micro Array)
   Imagerie en cytométrie                        Coloration, immunomarquage, hybridation in situ
   Détection de molécules membranaires,          Création de lames virtuelles de tissus
   intracellulaires et intranucléaires           Analyse de tissus en 3D

   Détection, tri et phénotypage de LT par       Analyse intracellulaire de tissus vivants en
   tétramères CMH/peptide                        microscopie électronique

   Etude de l'apoptose, du cycle cellulaire et   Observation de la structure de biomatériaux ou de
   de la prolifération cellulaire                tissus calcifiés par MEB

   Dosage multiplex de cytokines et              Criblage de processus biologiques (High Content
   phospho-protéines                             Screening)
                                                 Microscopie à fluorescence
MODÈLES IN VIVO ET EXPÉRIMENTATION (PRÉ)CLINIQUE
     NOTRE OFFRE

Vous souhaitez étudier des modèles                    Vous avez besoin d’identifier l’activité biologique
de pathologies ou des voies de                        d’extraits de plantes, de composés
signalisation ?                                       pharmaceutiques ou nutritionnels ?

                                                          EXPLORATION FONCTIONNELLE IN VIVO,
     MODÈLES ANIMAUX DE PATHOLOGIE                        EX VIVO, IN VITRO
     HUMAINE                                             Fonctions cardio-vasculaire,
                                                         métabolique, digestive et musculaire
      Modèles précliniques de grands animaux
      d’allo- et de xéno-transplantation,                Allergie
      chirurgie expérimentale                            Analyse du comportement

      Modèles murins de pathologie humaine               Radiopharmaceutique

      Développement de rats transgéniques                 IMMUNOMONITORAGE
      (microinjection, lentivirus) et de rats KO et
      KI (CRISPR)                                        Techniques d’analyse des réponses
                                                         immunes
      Hébergement de souris et rats en secteurs          Immunophénotypage
      de confinement A1 et élevage de souris
                                                         Dosage multiplex de cytokines et
                                                         phospho-protéines
ANALYSES –OMIQUES, PURIFICATION & CRIBLAGE
              NOTRE OFFRE

   Vous avez des projets de séquençage, de                              Vous avez besoin d’une étude globale
   génotypage ou d'analyse d'expression des                             des interactions biomoléculaires ?
   génomes ?

                                                  PROTÉOMIQUE FONCTIONNELLE

                                      Recherche de biomarqueurs
                                      Profils d’expression protéiques, de                  SPECTROMÉTRIE DE MASSE
                                      phosphorylation, de signalisation ou
                                      d’interaction                                   Matrices biologiques
 GÉNOMIQUE & BIO-INFORMATIQUE
                                      Recherche de nouveaux agents thérapeutiques     Profils d’expressions de lipides,
                                      potentiels
Séquençage de génomes/exomes,                                                         lipoprotéines et métabolites
produits de PCR, détection de         Structure-Activity Relationship
                                                                                      Analyses quantitatives ciblées de
variants génétiques                   Détermination des paramètres d’interaction      lipides, acides aminés, protéines,
Transcriptomique : puces à ADN,       Affinité, Kin, Koff, stœchiométrie, …           xénobiotiques...
RNA-seq, DGE-Seq                                                                      Analyses cinétiques
Génotypage haut-débit                                                                 Analyses structurales et élémentaires
Mise à disposition de ressources de              PROTEINES RECOMBINANTES
                                                                                      Mesures de masses exactes
calcul et de stockage (cluster,
                                         Développement de systèmes de
cloud), traitement et analyse de
                                         production procaryotes ou eucaryotes.
données « omiques »
                                         Purification de la protéine d'intérêt
                                         Production de CMH/peptide humains ou
                                         murins
CARACTÉRISATION DE LYMPHOCYTES B RÉGULATEURS DANS L’ASTHME
               EXEMPLE

                                      1.    UTE                       Purification des
                                                                                                     2.   Cytocell
                                                                      Lymphocytes B
                                           Modèle sain                                                    Tri des LB
                                                                      totaux
                                           de souris                                                      IL10+ vs IL10-

7.   CRB
     Echantillons de patients asthmatiques
     plasma, PBMC, expectorations

             Absence de lymphocyte B                                                         3.     GenoBiRD
      CD9    régulateur chez les patients
             asthmatiques
                                                                                                    Génomique comparative
                                                                                                    lymphocyte B IL10+ vs IL10-
                                                                                                    Biomarqueur spécifique
                                                                                            CD9 lymphocyte B régulateur
                6.   Therassay
                     Analyse de la fonction respiratoire
                     pléthysmographie, Flexivent

                             Retour d’une fonction pulmonaire                     4.     Cytocell
                             normale par rétablissement d’un                             Purification des lymphocytes CD9+
                             équilibre immunitaire favorable.                            Phénotypage (Récepteurs, Sous-type, …)

                                                           5.   UTE
                                                                Injection des LB CD9+ dans un
                                                                modèle de souris asthmatique
DU STADE EMBRYONNAIRE À LA RÉGÉNÉRATION DU DISQUE INTERVERTÉBRAL
               EXEMPLE

                        1.   CRB                         2. UTE                3.    SC3M
                             Biopsies de patients           Modèle de souris        Caractérisation en histologie
                                                            présentant une          biomarqueurs, état des tissus,
                                                            dégénérescence          progression de la dégénérescence
                                                            discale

                                                                   A.
                                                                                                      4.    iPSC
                                                                                                           Production et
10.    Spec. Masse                                           Caractérisation                               différenciation des
      Profil protéomique                                     de la maladie                                 progéniteurs humains
                                                                                                              Comprendre le
                                                                                                              développement du disque
                                                                                                              chez l’homme
                                                        C.                         B.
9.    IMPACT
                                                                               Thérapie
     Interactions protéiques                      Perspectives
                                                     futures                   cellulaire            5.    Cytocell
      Comment activer le programme                                                                         Purification par tri des
      transcriptionnel de différenciation                                                                  cellules régénératrices
      en cellule du disque
                                                                                                           du disque

            8.    GenoBiRD
                                                                                               6.   SC3M/MicroPICell
                 Analyse single cell
                                            7.   GenoCellEdit                                       Caractérisation de l’identité et
                                                 Marquage génétique des                             du comportement cellulaire
                                                 progéniteurs                                       des iPSC différenciées
MÉCANISMES PHYSIOPATHOLOGIQUES D’UNE MALADIE CARDIOVASCULAIRE
              EXEMPLE
               +

                                                      1.   iPSC
                   CRB                                     Reprogrammation
               Échantillons de sang                        cellulaire
               et d’urine du patient
               contrôles intrafamiliaux                                                       2.   GenoBiRD
                                                                                                   Séquençage de l’ADN des
                                                                                                   cellules reprogrammées pour
                                                         Etude de la famille                       vérifier la mutation du clone
                                                            d’un patient
                                                          présentant un QT
6.   GenoCellEdit                                        long et ayant subi
     Correction de la mutation dans                        une mort subite                          3.    Cytocell
     les cellules du patient                                                                             Vérification de la
     Création d’un modèle                                                                                pluripotence des cellules
     isogénique
     mutation dans les cellules saines

                                                                               4.   MicroPICell
                                 5.      Therassay
                                                                                    Vérification de la structure des
                                         Electrophysiologie
                                         mesure de PA
                                                                                    cellules
                                                                                    cellules musculaires, présence des
                                              Comprendre l’influence du             sarcomères
                                              médicament sur le profil
                                              électrique
CARACTÉRISATION DE RADIO-PHARMACEUTIQUES CIBLANT UN CANCER
            EXEMPLE

                                                                 Cyclotron - Arronax
                                     Radioactivité               Production du radioélément
                                    Fabrication de
                                    vecteur radiomarqué

    UTE                                                                   CARACTÉRISATION DU VECTEUR
   Modèle murin de cancer
   de la prostate
   sous-cutané et orthotopique
                                                                              P2R
                                                                             Production du vecteur
        ETUDE IN VIVO DE BIODISTRIBUTION ET
               PHARMACO-CINÉTIQUE                                             IMPACT
                                                                             Test d’affinité du vecteur
                                                                             anticorps et dérivés

Cytocell                             MicroPICell
Tri des cellules                     Immunohistochimie des                    Spec. Masse
sanguines à froid                    organes d’intérêt à froid               Analyse structurale du
                                                                             vecteur

                                 Radioactivité – Arronax+
                                 Mesure de la radioactivité
                                 sur coupe
iPSC
             CELLULES SOUCHES PLURIPOTENTES INDUITES

ü Plate-forme dédiée à la culture et aux techniques spécifiques des cellules souches      CONTACT
  pluripotentes (humaines et non humaines) et plus particulièrement à la
  reprogrammation de cellules adultes en cellules souches pluripotentes induites                  02 28 08 01 46
  (iPSC).
                                                                                                  laurent.david@univ-nantes.fr
ü Un outil de choix pour les approches de médecine régénératrice, de recherche de
  nouveaux médicaments et l'étude de maladies génétiques.
                                                                                          MOTS-CLÉS
                                                                                          •       Cellules souches pluripotentes
NOTRE OFFRE DE SERVICES/R&D                              NOS TECHNOLOGIES                 •       Physiopathologie
•   Reprogrammation à façon de cellules adultes          Secteur dédié de culture         •       Modèle pour criblage
    d'intérêt en cellules souches pluripotentes (iPSC)   cellulaire [L2]                          pharmacologique
•   Caractérisation de cellules souches                  Equipements de culture           •       Thérapie cellulaire
    pluripotentes : caryotypes, recherche de             cellulaire dédiés à la culture
    marqueurs, capacités de différenciation, etc.        des cellules souches
                                                         pluripotentes :
•   Expertise sur les cellules souches pluripotentes :
    étude de faisabilité, conseil, élaboration de        •   3 PSM (Poste de Sécurité
    plans expérimentaux, aide à la décision (choix           Microbiologique)
    technologique)
                                                         •   4 incubateurs dont 2
•   Mise à disposition de cellules souches                   incubateurs trigaz
    pluripotentes (PSC) humaines, murines et de rats         permettant de placer les             Laboratoires ass
                                                             cellules en hypoxie                                  ociés
•   Formation spécialisée de haut niveau aux
    techniques de culture cellulaire de                  •   1 cryoconservateur -150°C
    reprogrammation de cellules souches                                                       •     CRTI - Centre de
    pluripotentes (iPSC)                                 •   2 microscopes inversés                en TransplantatioRecherche
                                                                                                   Immunologie       n et
                                                         •   2 loupes
GenoCellEdit
           ÉDITION À FAÇON DU GÉNOME

ü Plate-forme promouvant l'édition à façon du génome des cellules, en particulier    CONTACT
  avec le système CRISPR.

ü Une solution complète, depuis le conseil dans la conception du projet jusqu'à la           02 40 08 74 10
  vectorisation de l'outil, en passant par la formation technique.                           jean-marie.heslan@univ-nantes.fr

                                                                                     MOTS-CLÉS
                                                                                     •       Thérapie génique
NOTRE OFFRE DE SERVICES/R&D                           NOS TECHNOLOGIES               •       CRISP-R
•   Design in silico de sgRNA ciblant un site         •   Parc d’équipements de      •       Transgénèse
    génomique d'intérêt                                   biologie moléculaire
                                                      •   Parc d’équipements de
•   Validation fonctionnelle in cellulo de sgRNA
                                                          biologie cellulaire
•   Design du donneur ADN pour modifier à façon
    le génome et sa détection

•   Vectorisation : plasmides, ARN, vecteurs viraux

•   Conseil sur la stratégie, le type de Cas9, les
    vecteurs et leur utilisation                                                             Laboratoires ass
                                                                                                             ociés

                                                                                         •    CRTI - Centre de
                                                                                              Transplantation Recherche en
                                                                                                             et Immunologie
CPV
            PRODUCTION DE VECTEURS VIRAUX

ü Un service intégré de développement d’un vecteur viral « candidat médicament »                  CONTACT
  depuis la preuve de concept jusqu’à la production de lots précliniques caractérisés
  pour les études de toxicologie règlementaire.                                                           02 28 08 04 33/40
ü Un service accompagné de l’expertise technique et réglementaire acquise depuis                          veronique.blouin@univ-nantes.fr
  20 ans dans le domaine de la thérapie génique.

                                                                                                  MOTS-CLÉS
                                                                                                  •       Vecteurs viraux/transfert de gènes/
NOTRE OFFRE DE SERVICES/R&D                                NOS TECHNOLOGIES                               virus adéno-associés/ adénovirus/
                                                                                                          clonage plasmides/baculovirus
•   Production de grade recherche de vecteurs              •    Production de vecteurs AAVr
    viraux                                                      - Par transfection transitoire    •       Biothérapies innovantes
    − Adénovirus-Associés (AAV) de sérotypes de 1 à 10rh          de cellules HEK293 avec         •       Procédés compatibles BPF
      et de nombreux variants                                     des plasmides
    − Adénovirus de sérotype 5                                  - Par infection de cellules       •       Développement de gènes
    − Baculovirus recombinants (AcMNPV)                           d’insectes avec des                     médicaments
                                                                  baculovirus recombinants
•   Clonage moléculaire
                                                               Purification selon les besoins
•   Immortalisation de cellules primaires                       - Gradient de densité (CsCl)
                                                                - Chromatographie par
•   Développement des méthodes analytiques                         échange d’ions ou affinité
    associées                                                                                             Laboratoires ass
                                                                - Filtration tangentielle (TFF)                           ociés
Une équipe R&D développe des procédés innovants de
production et purification ainsi que les méthodes          •    Contrôle Qualité
analytiques permettant de caractériser ces vecteurs
viraux.                                                                                               •
                                                           •    Outils et méthodes                         Inserm UMR1089
L'utilisation de la technologie baculovirus/cellules            analytiques de
d’insectes en suspension permet de répondre à des
besoins de fortes quantités de « vecteurs médicaments ».
                                                                caractérisation (quantité et
                                                                qualité) des vecteurs viraux
Les procédés de production et les contrôles qualité
développés sont directement transférables au sein d’un
établissement pharmaceutique.
DTC
           TRANSFERT CLINIQUE DE BIOTHÉRAPIES

ü Plate-forme Développement et Transfert à la Clinique                                         CONTACT
ü Adapte les protocoles de thérapie cellulaire issus des laboratoires de recherche aux
  contraintes d'une utilisation clinique.                                                              02 28 08 02 37
                                                                                                       marc.gregoire@nantes.inserm.fr

                                                                                               MOTS-CLÉS
                                                                                               •       Thérapie cellulaire
NOTRE OFFRE DE SERVICES/R&D                               NOS TECHNOLOGIES                     •       Transfert clinique
•   Optimisation des protocoles élaborés en               •   Equipements de culture           •       Production cellulaire
    recherche en les élevant à un niveau « grade              cellulaire dédiés et qualifiés
    clinique ». Pour cette activité, la plate-forme                                            •       Différenciation cellulaire
                                                          •   Elutriation : centrifugation
    travaille en collaboration avec l'unité de
    production thérapeutique en charge de la                  permettant de faire un tri
    production des cellules.                                  spécifique des cellules sans
                                                              sensibiliser les récepteurs
                                                              membranaires
•   Purification de cellules sanguines humaines           •   Système qualité de
    (notamment monocytes et lymphocytes) dans                 traçabilité et de
    les conditions les plus proches de la clinique afin       standardisation suivant la
    de faciliter un éventuel transfert dès la phase           norme ISO 9001
                                                                                                       Laboratoires ass
    initiale d’un projet de recherche                                                                                  ociés
                                                                                                   •     CRCINA - Centre
•   Production de cellules dendritiques et de                                                            en Cancérolog     de Recherche
                                                                                                                       ie et Immunolog
    macrophages par différenciation de monocytes                                                         Nantes Angers                ie
    humains                                                                                        •    CIC biothérapies
                                                                                                                             BT 0503
L'ouverture de la plate-forme est proposée aux
équipes de recherche académiques.
UTCG
           UNITÉ DE THÉRAPIE CELLULAIRE ET GÉNIQUE

ü Unité dédiée à l’ingénierie cellulaire et plus particulièrement, à la production de   CONTACT
  cellules humaines manipulées ex vivo selon les Bonnes Pratiques de Fabrication
  ou Good Manufacturing Practices (BPF-GMP) de produits de thérapies cellulaire et              02 40 08 31 18
  génique destinés à être administrés à des patients dans le cadre d’une recherche
  biomédicale, à la demande de promoteurs ou au titre de prises en charges                      brigitte.dreno@univ-nantes.fr
  médicales de routine (contextes autologue et allogénique)

                                                                                        MOTS-CLÉS
                                                                                        •       Thérapie cellulaire
NOTRE OFFRE DE SERVICES/R&D                            NOS TECHNOLOGIES                 •       Thérapie génique
•   Développement                                      • Cryopréservation               •       Médicament de thérapie innovante
    - Mise au point d’outils cellulaires               • Banking
    - Création de modèles d’étude et de dispositifs                                     •       Production GMP
      de production                                    • Clonage
•   Transfert technologique                            • Tests fonctionnels
    - Validation : stabilité PTC, transposition
      d’échelle, MP grade clinique, QC
    - Encadrement : e.g. dossier réglementaire,
•   Optimisation
    - Adaptation et amélioration de process :
      rendement, efficacité, facilité, temps,                                                   Laboratoires ass
      exigences réglementaires, …                                                                               ociés
•   Production
    - Production de thérapie cellulaire
    - Médicament de thérapie Innovante                                                      •    CIC biothérapies
                                                                                                                      BT 0503
    - Conditionnement vaccins
•   Contrôle qualité
CRB
           COLLECTIONS D’ÉCHANTILLONS HUMAINS

ü Centre de Ressources Biologiques                                                             CONTACT
ü Gère de manière professionnelle et règlementaire des collections d’échantillons
                                                                                                       02 53 48 22 02
  biologiques humains à visée de recherche, pour des équipes académiques ou des
  laboratoires privés.                                                                                 crb@chu-nantes.fr

ü Structure hospitalière certifiée NF S96/900 (référentiel qualité Afnor pour les CRB).
                                                                                               MOTS-CLÉS
                                                                                               •       Echantillons biologiques humains
NOTRE OFFRE DE SERVICES/R&D                               NOS TECHNOLOGIES                     •       Données cliniques et biologiques
• Mise en place et gestion de bio-collections              • Centrifugation                    •       Bio-collections
• Réception de prélèvements frais ou                       • Gradient de ficoll                •       Cohortes
  d’échantillons congelés                                  • Extraction semi-automatique       •       Multi-thématique
                                                             de l’ADN
• Préparation d’échantillons de diverses natures :                                             •       Recherche en santé médicale
  ADN, ARN, cellules mononucléées du sang,                 • Extraction d’ARN à partir de
  liquide cérébrospinal, plasma, sérum,                      tubes PAXgene
  splénocytes, urine, etc.                                 • Spectrophotométrie
• Stockage organisé des échantillons et                    • Robot de distribution et de
  localisation informatisée à l’unité                        normalisation
                                                                                                       Laboratoires ass
• Conservation dans des congélateurs (-25°C ±              • Logiciels pour la gestion des                             ociés
  10°C et -80°C ± 15°C) ou dans des cuves d’azote            collections, la traçabilité des       •     Unités d’investiga
                                                                                                                             tion clinique
  liquide (
CytoCell
           CYTOMÉTRIE ET TRI CELLULAIRE

ü Plateforme proposant un ensemble de prestations axées autour de la cytométrie de           CONTACT
  flux multi-paramétrique, du tri cellulaire et de l’imagerie en cytométrie.
                                                                                                     06 42 03 49 31 – 07 84 20 50 89
ü Permet de caractériser et séparer des populations de cellules, procaryotes comme
                                                                                                     nadege.marec@univ-nantes.fr
  eucaryotes, ou de particules (vésicules, nanoparticules, organites…) pour la                       nicolas.jouand@univ-nantes.fr
  recherche fondamentale et/ou clinique.

                                                                                             MOTS-CLÉS
                                                                                             •       Cytométrie en flux
NOTRE OFFRE DE SERVICES/R&D                             NOS TECHNOLOGIES                     •       Cytométrie en image
•   Immunophénotypage sur échantillons                  • 4 cytomètres analyseurs            •       Analyse multi-paramétrique
    biologiques (jusqu’à 15 fluorochromes) :              standard (2 lasers, 4 PMTs) :
    expertise sur la création de panels                   comptage en valeur abs.            •       Tri cellulaire
    multiparamétriques
                                                        • 4 cytomètres analyseurs
•   Détection de molécules membranaires,                  multi-paramétriques (3/4
    intracellulaires (cytokines, phosphoprotéines) et     lasers
MicroPICell
           HISTOLOGIE – MICROSCOPIE À FLUORESCENCE

ü Plate-forme d’imagerie cellulaire et tissulaire in vitro                                           CONTACT
ü Propose un accompagnement ou une prise en charge des projets de recherche                                  02 28 08 03 28
  fondamentale et préclinique : histologie animale et végétale, caractérisation
  fonctionnelle à l’échelle cellulaire et moléculaire par fluorescence, analyse d’image                      philippe.hulin@univ-nantes.fr
  et modélisation.

                                                                                                     MOTS-CLÉS
                                                                                                     •       Microscopie de pointe : imagerie
NOTRE OFFRE DE SERVICES/R&D                                  NOS TECHNOLOGIES                                multidimensionnelle (temps, 3D,
                                                                                                             multi spectral, super résolution)
•   Préparation d’échantillons allant de l’inclusion,        •   Histologie : préparation,
    congélation et coupe des échantillons jusqu’à                numérisation et partage de          •       Criblage moyen et haut débit
    la mise en œuvre de techniques de coloration                 lames
                                                                                                     •       Préparation avancée de tissus
    et d’immuno-marquages                                    •   Criblage : microscopes et
                                                                                                     •       Traitement et analyse d’image
•   Caractérisation de nouveaux matériaux                        analyses d’image automatisés
    (quantum dots, microsphères etc..) et de tissus              en environnement contrôlé
                                                                 (incubation, impression de
    animaux ou végétaux                                          protéines)
•   Mesures de changement d’environnement
                                                             •   Localisation spatiale haute
    localisée spatialement : hypoxie, ions, pH,                  résolution : microscopie de
    calcium                                                      super résolution par illumination
•   Phénotypes moléculaire et cellulaire : imagerie              structurée, microscopie plein               Laboratoires ass
    multidimensionnelle et quantification par                    champ avec apotome pour                                     ociés
                                                                 champ large
    analyse d’image
                                                             •   Dynamique moléculaire et
•   Prestations spécifiques : microfluidique,                    cellulaire vidéo « time lapse »,
    déconvolution spectrale confocale, imagerie                                                          •    SFR-Santé Franço
                                                                 microscopie confocale rapide,                                is   Bonamy
    confocale à très haute résolution temporelle,                mesures de temps de vie de
    mesures de temps de vie de fluorescence,                     fluorescence, microfluidique
    impression 3D
SC3M
           HISTOLOGIE – MET & MEB – MICROTOMOGRAPHIE – CATWALK

ü Plate-forme proposant un ensemble de techniques spécifiques pour l’analyse
  d’organismes vivants ou de matériaux.                                                   CONTACT
ü Traite un très vaste panel d’échantillons allant de l’échelle macroscopique à
  microscopique.                                                                                  02 40 41 29 44/99
                                                                                                  sc3m@univ-nantes.fr
ü Ces différentes technologies peuvent être employées de façon complémentaire ou
  indépendamment les unes des autres.
                                                                                          MOTS-CLÉS
                                                                                          •       Tissus squelettiques
NOTRE OFFRE DE SERVICES/R&D                             NOS TECHNOLOGIES                  •       Histologie
•   Plateau technique d’histologie spécialisé dans le   •   Histologie                    •       MET
    traitement des tissus durs et squelettiques             - Tissus mous et calcifiés    •       MEB
    - Analyse de ces tissus en microscopie                  - Inclusions en résine, en
                                                              paraffine et congélation    •       Microtomographie
      photonique (hybridation in situ,
      immunohistochimie, colorations)                       - Colorations spécifiques     •       Analyse 2D et 3D
                                                            - Immunohistologie et         •       Analyse quantifiée de la marche
•   Plateau de microscopie électronique :                     hybridation in situ                 (rat, souris)
    - Microtomographie et analyse d’images              •   MicroCT : microtomographie
      intracellulaires de tissus vivants (MET), de la       aux rayons X
      topographie de surface et de l’homogénéité
      chimique d’échantillons (MEB)                     •   MEB : microscopie
    - Analyse extérieure et intérieure d’un                 électronique à balayage
                                                                                                  Laboratoires ass
      échantillon en 3D (microtomographie, i.e.         •   EDX : microanalyse en                                 ociés
      micro-scanner)                                        dispersion d’énergie
•   Plateau technique « Catwalk » :                     •   ME T: microscopie
    - Analyse des troubles de la marche sur des             électronique à transmission       •    Inserm UMR 1229
      modèles de souris/rats : motricité, activité                                                                 -Rm   eS
      spontanée, coordination motrice,                  •   Analyse d’images
      biomatériaux, dégénérescence liée à l’âge,        •   Catwalk : CW XT10,6,
      molécules d’intérêt thérapeutique                     ImageJ, Prism5
Plateau technique de radioactivité
           RADIOCHIMIE – RADIOBIOLOGIE – EXPERIMENTATIONS IN VIVO

ü Plateau technique destiné à la recherche, à l’enseignement et ouvert aux                CONTACT
  entreprises.
                                                                                                  02 28 08 04 90
ü Offre l’accès à 10 salles d’expérimentation permettant l'utilisation de radioactivité
  dans des conditions de travail en conformité avec la réglementation et les principes            scr@univ-nantes.fr
  de radioprotection.

                                                                                          MOTS-CLÉS
                                                                                          •       Produits radiopharmaceutiques
NOTRE OFFRE DE SERVICES/R&D                              NOS TECHNOLOGIES                 •       Métabolisme
•   Radiochimie et radiopharmacie :                      • Equipements spécifiques :
                                                            - Boite-à-gants (6)           •       Modèles animaux
    radiomarquage, purification et analyse,
    automatisation                                          - Animalerie autonome         •       Imagerie
                                                              blindée
• Radiobiologie : biologie moléculaire, culture et          - PSM Blindé (5 mm), PSM      •       Irradiation
  pharmacologie cellulaire (normoxie et hypoxie),             KSP12 double filtration
  irradiation de cellules                                   - Chambre à hypoxie
                                                            - HPLC, MS, HPTLC
• Modèles animaux : validation préclinique de               - Microtome
  radiopharmaceutiques, études de
  biodistribution, protocoles de radio-                  • Détecteurs :
  immunothérapie, études du métabolisme,                   - Compteur gamma (1)
  irradiation, imagerie de tissus et petits animaux        - Compteurs beta à                     Laboratoires ass
                                                                                                                  ociés
                                                             scintillation liquide (2)
• Missions liées à la réglementation : constitution et     - Cyclone Plus et Image            •     CRCINA - Centre
                                                                                                    en Cancérolog     de Recherche
  suivi du dossier d'autorisation, gestion des sources       Eraser                                               ie et Immunolog
                                                                                                    Nantes Angers                ie
  et des déchets, contrôles périodiques                    - Activimètre
  réglementaires, etc.                                     - Compteur puits NaI               •    Cyclotron Arrona
                                                                                                                   x
                                                           - Détecteurs radioactivité         •    CHU Nantes
                                                             en flux continu (HPLC)
                                                           - Autoradiographe
                                                             numérique Beaver
Therassay
           EXPLORATION FONCTIONNELLE DU PETIT ANIMAL

ü Plate-forme d’exploration des fonctions et des pathologies sur le petit animal            CONTACT
ü Accompagne des projets pour valider à un niveau préclinique de nouvelles cibles                   02 28 08 00 81
  d’intérêt thérapeutique, évaluer des effets thérapeutiques/protecteurs de molécules
  d’intérêt, caractériser les effets fonctionnels d’un produit (action, cible, dose...)             maud.chetiveaux@univ-nantes.fr

                                                                                            MOTS-CLÉS
                                                                                            •       Modèles animaux
NOTRE OFFRE DE SERVICES/R&D                              NOS TECHNOLOGIES                   •       Développement médicament
•   Modèles animaux de pathologies (asthme,              •   Métabolisme : FPLC et          •       Nutrition santé
    hypertension, diabète, motricité digestive…)             cages métaboliques
                                                                                            •       Criblage
•   Etude des effets pharmacologiques et/ou              •   Vasculaire : artériographe,
    nutritionnels de molécules sur :                         chambres hypoxiques, tail-
    - l’homéostasie des glucides et des lipides              cuff télémétrie
    - la fonction vasculaire                             •   Cardiaque : écho-doppler,
    - la fonction respiratoire                               ECG
    - la fonction digestive et son système nerveux
                                                         •   Asthme et allergie :
•   Etude de l’effet de molécules/extraits sur               Flexivent, pléthysmographie
    l’activité électrique ou contractile cardiaque
                                                         •   Musculaire : actimètre, grip           Laboratoires ass
•   Etude de la fonction musculaire [e.g. analyse du         test, rotarod, analyseur de                            ociés
    comportement, tests de contraction, flux                 marche
    calciques, tests d’anxiété/dépression]                                                      •      Inserm UMR 1087
                                                         •   Digestif : chambre de                    6291-institut du /CNRS UMR
•   Etude des effets toxiques, antitumoraux et                                                                        thorax
                                                             ussing, endomicroscope             •
    immunomodulateurs de molécules et suivi de la            confocal                                 Inserm UMR 1235
                                                                                                                       -TENS
    progression tumorale                                                                        •    Inserm UMR 1089
                                                         •   Cancer : imageur
                                                             bioluminescent
                                                         •   Criblage : Luminex
CIMNA
           IMMUNOMONITORAGE CLINIQUE

ü Centre d’ImmunoMonitorage Nantes-Atlantique
                                                                                             CONTACT
ü Des prestations techniques destinées à la recherche clinique et thérapeutique
                                                                                                     02 40 08 42 88
ü Des techniques d’analyse des réponses immunes dans le cadre de pathologies ou
  de thérapeutiques impliquant le système immunitaire (auto-immunité, cancer,                        regis.josien@univ-nantes.fr
  infection, transplantation, allergologie…).

                                                                                             MOTS-CLÉS
                                                                                             •       Immuno-monitorage
NOTRE OFFRE DE SERVICES/R&D                            NOS TECHNOLOGIES                      •       Recherche clinique
•   Identification et quantification des populations   •   Cytomètres de flux : 2            •       Validation de méthode
                                                           cytomètres de flux BD
    cellulaires immunes circulantes par cytométrie         FACSCanto II (8 couleurs), 1      •       ISO15189
    en flux (8-10 couleurs)                                cytomètre de flux Beckman
                                                           Coulter Navios (10 couleurs)      •       Cytométrie en flux
•   Analyse fonctionnelle (prolifération, cytokines
    intracellulaires) par cytométrie en flux                                                 •       Analyse Multiplex
                                                       •   Lecteurs ELISPOT : bioreader
•   Préparation de PBMC                                    5000-pro-S BIOSYS GmbH, iSpot     •       Elispot
•   Mesure de molécules solubles par ELISA et essai        AID
    multiplex (Luminex)
                                                       •   Microcytomètre Luminex
•   Analyse fonctionnelle par ELISPOT
                                                       •   Dosage multiplex : appareils              Laboratoires ass
•   Validation de méthode (ISO15189)
                                                           nécessaires à la préparation
                                                                                                                     ociés
L'ensemble des prestations est réalisé au                  des plaques, Luminex 100,
Laboratoire d’Immunologie du CHU de Nantes                 Magpix                                •    Laboratoire d’im
                                                                                                                         m
dont la majorité des analyses répond aux                                                              du CHU de Nan unologie
                                                       •   Lecteur Elisa : ELx800 Biotek                                tes
exigences de la norme ISO15189                                                                   •    CRTI - Centre de Re
                                                       •   1 compteur de cellules : Sysmex                                   cherche en
                                                                                                      Transplantation
                                                                                                                        et Immunologie
                                                       •   Pièce de culture cellulaire
                                                           équipée
TRIP
           TRANSGÉNÈSE RAT

ü Plate-forme Transgénèse Rat et ImmunoPhénomique
                                                                                       CONTACT
ü Développe des modèles à façon de rats transgéniques, knock-out ou knock-in pour
  l’étude de pathologies humaines ou pour des études de gènes et de fonctions                  02 40 08 74 15
  biologiques particulières                                                                    ignacio.anegon@univ-nantes.fr
ü Activités d’immunophénotypage, d’analyse de la réponse immune de modèles de
  rats génétiquement modifiés et de R&D
                                                                                       MOTS-CLÉS
                                                                                       •       Rat transgénique
NOTRE OFFRE DE SERVICES/R&D                          NOS TECHNOLOGIES                  •       Rat Knock-Out
•   Production de rats transgèniques par             •   Microinjection de zygotes     •       Rat Knock-In
    microinjection d’ADN (incluant les BAC) ou de
    vecteurs lentiviraux                             •   Electroporation de zygotes    •       Ciblage de gènes
                                                     •   Génotypage :                  •       CRISPR nucléases
•   Génération de rats KO et KI par microinjection
    ou électroporation de CRISPR-Cas9 nucléases          - PCR
                                                                                       •       Modèles animaux
    +/- ADN donneur                                      - électrophorèse capillaire
                                                         - Southern blot               •       Immunophénomique
•   Immunophénotypage et analyse de la réponse
    immune de modèles de rats trangéniques, KO           - LAM-PCR
    ou KI
                                                     •   Tri single cell
•   Tri de cellules B spécifiques d’antigènes et
    production d’anticorps monoclonaux humains à     •   Immunophénotypage                     Laboratoires ass
    partir de rats humanisés                             - Cytométrie en flux                                  ociés
    Génotypage                                           - Western Blot                    •
•                                                                                                CRTI - Centre de
                                                         - Dosage ELISA                          Transplantation Recherche en
•   R&D: développement de technologies                                                                          et Immunologie
    innovantes et transfert vers l’académique ou         - Immunohistochimie               •    Institut de Transpl
    l’industrie                                                                                 Urologie-Néphrol antation-
                                                                                                                  ogie (ITUN)
•   Formation, diffusion scientifique
Unité thérapeutique expérimentale
           ANIMALERIE RONGEURS

ü Plate-forme mutualisée accueillant rongeurs (rats et souris) et lagomorphes dans des      CONTACT
  animaleries protégées en A1 ou en A2
                                                                                                    02 28 08 03 82
ü Permet l’hébergement d’animaux destinés à la recherche publique ou privée
                                                                                                    marie.liabeuf@univ-nantes.fr

                                                                                            MOTS-CLÉS
                                                                                            •       Rongeurs, lagomorphes
NOTRE OFFRE DE SERVICES/R&D                            NOS TECHNOLOGIES                     •       Hébergement
•   Hébergement des rats et souris en portoirs         •   Portoirs ventilés                •       Elevage
    ventilés ou isolateurs
                                                       •   Isolateurs                       •       Expérimentation animale
•   Hébergement de lapins                              •   Equipements
                                                           d’expérimentation et de
•   Elevage à façon de souris ou de rats                   chirurgie (Postes à
    transgéniques                                          isoflurane, microscopes,
                                                           PSM)
•   Mise à disposition de structures et de matériels   •   D’autres équipements sont
    de pointe en expérimentation animale                   présents et disponibles via la
                                                           plate-forme d’exploration
•   Soutien à l’expérimentation animale                    fonctionnelle sur le petit               Laboratoires ass
                                                           animal Therassay                                         ociés
•   Conseils sur la réglementation en
    expérimentations animale (soutien à la
    rédaction des projets, mise en place de
    formations…)                                                                                •    SFR-Santé Franço
                                                                                                                     is   Bonamy
LGA
           ANIMALERIE GRANDS ANIMAUX

ü Animalerie académique possédant une expertise dans le domaine chirurgical et             CONTACT
  d’immuno-intervention sur les primates et les porcs
                                                                                                   02 40 08 74 10
ü Propose un accompagnement par un personnel formé, dans un travail en
  collaboration, en partenariat ou en prestation, pouvant aller de la conception à la              gilles.blancho@chu-nantes.fr
  réalisation du projet en passant par son autorisation éthique règlementaire.

                                                                                           MOTS-CLÉS
                                                                                           •       Modèles précliniques grands
NOTRE OFFRE DE SERVICES/R&D                            NOS TECHNOLOGIES                            animaux
•   Modèles expérimentaux pré-cliniques d’allo- et     •   Expérimentation animale         •       Transplantation
    de xéno-transplantation                                - Chirurgie ouverte et          •       Immuno-intervention
                                                             coelioscopique (urologie,
•   Enseignement de procédures chirurgicales                                               •       Immuno-monitoring
                                                             gynécologie, gastro-
    variées dans différentes disciplines                     entérologie, ophtalmologie,   •       Formations chirurgicales
•   Evaluation de dispositifs chirurgicaux                   cardiologie), biopsies
                                                             d’organes                     •       Test de dispositifs chirurgicaux
•   Modèles précliniques d’immunisation                    - Endoscopie, échographie
•   Modèles précliniques d’hypersensibilité retardée       - Plasmaphérèse, perfusion/
    (DTH)                                                    reconditionnent d’organes
•   Modèles précliniques d’administration de               - Neurostimulation
    molécules (cytokines, anticorps monoclonaux,                                                   Laboratoires ass
    etc.)
                                                       •   Suivi des animaux                                       ociés
                                                           - Analyses hématologiques et        •     CRTI - Centre de
•   Suivi et immuno-monitorage d’animaux traités :           biochimiques                            Transplantation Recherche en
                                                                                                                    et Immunologie
    PK/PD, toxicologie réponses immunitaires, etc.         - Populations cellulaires par       •    Ecole de Chirurg
                                                             cytométrie en flux                                      ie et de
                                                                                                    Pratiques Interven
                                                           - ELISA                                  de Nantes         tionnelles
                                                           - Immuno-histo-fluorescence
                                                           - qPCR
GenoBiRD
          GÉNOMIQUE HAUT DÉBIT – BIOINFORMATIQUE

ü Plate-forme contribuant à l’amélioration des connaissances dans les domaines de la   CONTACT
  génomique et de la bioinformatique appliqués aux sciences du vivant (pas de
  limitation en terme d’espèces)                                                               02 28 08 01 60
ü Propose la mise à disposition d’équipements, de compétences, de savoir-faire et de           pf-genomique@univ-nantes.fr
  formations nécessaires à la réalisation de vos projets.                                      pf-bird@univ-nantes.fr

                                                                                       MOTS-CLÉS
                                                                                       •       ADN/ARN/Génomique/
NOTRE OFFRE DE SERVICES/R&D                          NOS TECHNOLOGIES                          Transcriptomique/
                                                                                               Séquençage haut-débit/
• Conduite de projets                                •   HiSeq2500 et MiSeq                    Génotypage/SNPs/qPCR/NGS
  - génomique : séquençage de génomes/                   (Illumina)
    exomes, détection de variants génétiques                                           •       Bioinformatique/Analyse et gestion
                                                     •   Station GeneTitan                     de données/Workflows/Portail
  - transcriptomique : puces à ADN, RNA-seq,             (Affymetrix)                          Galaxy/Cloud/e-infrastructure
    DGE-seq
  - génotypage haut-débit                            •   Séquenceur 48 Capillaires
                                                         AB3730 (Life)
• Prestations séquençage et génotypage capillaire    •   Cluster de calcul 512 cœurs
   - détection de mutations
                                                     •   Parc « à disposition »
   - séquençage de produits de PCR
                                                         - MiSeq
• Mise à disposition de ressources                       - TapeStation                         Laboratoires ass
  - expérimentales (séquençage, contrôle                 - Bioanalyzer                                         ociés
     qualité, qPCR…)                                     - Scanners de lames
  - bioinformatiques (Cluster, Galaxy, Cloud)              (Agilent, InnoScan900)          •    Inserm UMR 1087
                                                         - Sonicateur                           6291-institut du /CNRS UMR
                                                                                                                thorax
• Formation                                              - Appareil qPCR LC480             •    LS2N
   - introduction au langage de programmation R          - Nanodrop
   - analyse de données RNA-seq sur Galaxy               - Cluster de 944 cœurs
   - formation aux équipements à disposition             - Cloud OpenStack 160
                                                           cœurs
IMPACT
           PROFILS D’EXPRESSIONS – CRIBLAGE

ü Plate-forme Interactions Modéculaires Puces ACTivités                                    CONTACT
ü Offre un ensemble unique au niveau national de technologies de pointe dédiées à                  02 51 12 56 24
  l’étude globale des interactions biomoléculaires, depuis le criblage jusqu’à la
  caractérisation des molécules                                                                    pierre.weigel@univ-nantes.fr

ü Activités en protéomique fonctionnelle pour répondre aux besoins des laboratoires
  académiques et privés dans le domaine de la santé et des biotechnologies                 MOTS-CLÉS
                                                                                           •       Biomarqueurs
NOTRE OFFRE DE SERVICES/R&D                               NOS TECHNOLOGIES                 •       Criblage
•   Recherche de biomarqueurs                             •   Profiling                    •       Interaction médicament/cible
    - Profils d’expression protéiques                         - Puces à protéines
    - Profils de phosphorylation, de signalisation ou         - SPR imaging                •       Phosphorylation
      d’interaction                                           - Technologie alpha          •       Analyses des données
•   Recherche de nouveaux agents thérapeutiques           •   Criblage
    potentiels                                                - SPR–SPRi
    - Structure-Activity Relationship                         - ITC
•   Détermination des paramètres d’interaction                - BRET–FRET
    - Affinité, Kin, Koff, stœchiométrie, contributions       - Label free
      enthalpique et entropique                               - Technologie alpha
•   Traitement des données                                                                         Laboratoires ass
    - Analyses statistiques sous Galaxy
                                                          •   Caractérisation/validation                           ociés
                                                              - SPR                            •     CRCINA - Centre
    - Définition de profils différentiels (médecine           - iTC                                                    de Recherche
                                                                                                     en Cancérolog
      personnalisée)                                          - Label free                           Nantes Angers
                                                                                                                   ie et Immunolog
                                                                                                                                  ie
    - Approches bioinformatiques d’intégration des            - Fluorescence
      données                                                                                  •    CNRS UMR 6286
                                                              - Dichroisme circulaire                             -UFIP
                                                                                               •    Cancéropôle G
                                                                                                                 rand Ouest
                                                          •   Analyse de données
                                                              - Galaxy
Spectrométrie de masse
           LIPIDOMIQUE ET BIOMARQUEURS

ü Plate-forme dédiée à l’exploration des maladies métaboliques et des risques                CONTACT
  cardiovasculaires associés, par l'exploration ciblée ou non ciblée (in vivo et in vitro)
  des composants des lipoprotéines humaines et animales (lipides et apolipoprotéines)                    02 28 08 03 75
ü Etudie également la mesure des flux métaboliques et lipoprotéiques via l'utilisation                   mikael.croyal@univ-nantes.fr
  de traceurs enrichis en isotopes stables

                                                                                             MOTS-CLÉS
                                                                                             •           Lipoprotéine
NOTRE OFFRE DE SERVICES/R&D                              NOS TECHNOLOGIES                    •           Lipide
La plate-forme de spectrométrie de masse propose         Isolement/fractionnement :          •           Apolipoprotéine
divers types d'analyses dans tous types de matrices      ultracentrifugation,
biologiques (in vivo, in vitro, animales et humaines).   électrophorèse                      •           Isotope stable
•   Analyses non ciblées                                 Séparation : chromatographie        •           Cinétique
    Lipidomique, métabolomique                           liquide (UPLC), de                  •           Métabolisme
                                                         convergence (UPC² ) et
•   Analyses quantitatives ciblées                                                           •           Lipidomique
                                                         gazeuse (GC)
    Lipides, acides aminés, protéines,
    xénobiotiques...                                     Sources d’ionisation :
                                                         electrospray, impact
•   Analyses cinétiques
                                                         électronique, ionisation
    Protocoles impliquant l'utilisation de traceurs      chimique
    enrichis en isotopes stables (fluxomique,                                                            Laboratoires ass
    protéines et métabolites)                            Détection : spectromètres de                                    ociés
                                                         masse haute résolution (temps               •     Plate-forme Cor
•   Analyses structurales et élémentaires                                                                                 saire-
                                                         de vol [TOF], secteur                             Biogenouest
    Mesures de masses exactes                            magnétique) et basse                    •         Centre de Rech
                                                                                                                          erch
                                                         résolution (quadripôle [Q]).                     Nutrition Humaine e en
                                                         Spectrométrie de masse en                                          de l’Ouest
                                                         tandem (Q-TOF, QqQ)                     •        INRA UMR 1280-P
                                                                                                                          hAN
P2R
            PROTÉINES RECOMBINANTES

ü Plate-forme de production de protéines recombinantes                                      CONTACT
ü Propose son expertise pour la réalisation de projets de production et/ou purification             02 28 08 03 78
  de protéines recombinantes utilisées dans la recherche en santé et pour la
  production de complexes CMH/peptide et protéines apparentées                                      p2r.pf@univ-nantes.fr
ü Accessible aux équipes académiques et aux entreprises dans le cadre de prestations
  de service ou de collaborations scientifiques
                                                                                            MOTS-CLÉS
                                                                                            •       Ingénierie des protéines
NOTRE OFFRE DE SERVICES/R&D                              NOS TECHNOLOGIES                   •       Protéines recombinantes
•   Etude de faisabilité de production et/ou             •   Production eucaryote           •       CMH/peptides
    purification d’une protéine d’intérêt : définition       - Equipements de culture
    de la stratégie, production de lots pilotes                cellulaire                   •       Chromatographie liquide
•   Production                                               - Bioréacteur à usage          •       Formation
    - Procaryote : expression sous forme soluble.              unique CelligenBlu™
      Préparation de corps d’inclusion en bactéries      •   Chromatographie liquide
      et tests de renaturation                               - 6 stations de purification
    - Eucaryote : expression transitoire ou stable en          (FPLC et HPLC)
      cellules de mammifères. Production moyenne             - Exclusion stérique
      échelle en bioréacteur (10-20L)                        - Affinité
    Purification                                             - Echangeuse d’ions
•                                                                                                   Laboratoires ass
    - Clarification par filtration tangentielle et           - Interactions hydrophobes                             ociés
      filtration frontale                                    - Phase inverse
    - Purification des protéines/peptides par                - Mixed mode
      chromatographie liquide                                                                   •    CRCINA - Centre
                                                                                                     en Cancérolog     de Recherche
                                                                                                                   ie et Immunolog
•   Contrôle qualité : pureté des protéines purifiées                                                Nantes Angers                ie
    et dosage des endotoxines
•   Formation sur les équipements de production et
    de chromatographie
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