PANDÉMIE DE COVID-19 : ASPECTS ÉPIDÉMIOLOGIQUES - PROFESSEUR RENÉ MIGLIANI - REMED
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Webinaire REMED - Mars 2021
Pandémie de Covid-19 :
Aspects épidémiologiques
Professeur René Migliani
migliani.rene@gmail.com
Plan de l’exposé • Définition d’une pandémie • Alerte et évolution en Chine • Les coronavirus • Évolution de la pandémie • Conclusion et perspectives
Plan de l’exposé • Définition d’une pandémie • Alerte et évolution en Chine • Les coronavirus • Évolution de la pandémie • Conclusion
Définition d’une pandémie
• Du grec « Pan » = tout et « Demos » = peuple
• Épidémie qui s’étend à la quasi-totalité d’un continent ou dans
plusieurs continents, parfois dans la totalité de la planète
• Pandémies généralement classées dans un premier temps
comme des épidémies, c’est-à-dire la propagation rapide
d’une maladie dans une ou plusieurs régions d’un pays
‒ Ébola : Épidémie de MVE en Guinée forestière en
décembre 2013
‒ Covid-19 : Épidémie dans la ville de Wuhan (province de
Hubéï) en Chine en 2019 puis diffusion pandémique dans
le monde entier
Émergence Épidémie
Foyer épidémique Chine
(Outbreak) (Epidemic)
Chine Chine
Wuhan
Pandémie Pandémie
Diffusion dans tous les continents Diffusion vers d’autres continents
(Pandemic) (Pandemic)
Chine
Plan de l’exposé • Définition d’une pandémie • Alerte et évolution en Chine • Les coronavirus humains • Évolution de la pandémie • Conclusion
Premiers temps de l’alerte en Chine et dans le Monde
Marché aux poissons de Wuhan 10 jours
Cas confinés
Par date de maladie (n = 44 672)
Par date de diagnostic (n = 44 762)
9 711 cas
43 décès
Enquête rétrospective Chine
1er cas 30 janvier
89 cas probables
Thaïlande
13 janvier
Cas index
8/12/2019
26/12 : 4 pneumonies atypiques 20/01
(3 dans une même famille) Fermeture Marché 7/01 COVID-19
notés par Dr Zhang J. Identification Maladie à
de l’hôpital de Wuhan
aux poissons Wuhan
du 2019-nCoV déclaration 30/01
Classe B
OMS déclare la Covid
27/12 : Dr Zhang déclare 31/12 : Commission de la santé Urgence de Santé Publique
de Wuhan alerte la Commission
12/01 23/01
des cas de pneumonie Séquençage de Portée Internationale
nationale de la santé et le CDC Confinement
atypique au CDC local du 2019-nCoV
chinois, et l'OMS est informée Ville de Wuhan
28 et 29/12 24/01 25-31/01 1-10/02
3 autres cas de pneumonie 13/01 : Premiers kits
Dr Li Wenliang† notés dans l’hôpital de Wuhan
30/12 : Début de recherche active
des cas dans la ville de Wuhan pour Test 2019-nCoV
15 autres villes
sous confinement
Fête nationale
Nouvel An lunaire
Congé obligatoire
dans tout le pays
Wu Z. JAMA 2020
État de la diffusion le jour de la déclaration
d’USPPI par l’OMS
20 pays et 4 continents touchés au 30 janvier 2020
Exposition de tous les premiers cas avec la Chine
USPPI : événement extraordinaire qui constitue un risque pour la santé Délais de déclaration USPPI
publique dans d’autres États en raison du risque de propagation • SARS-CoV-2 : 1 mois
internationale et qui requière une action internationale coordonnée • SARS-CoV-1 : 3 mois
OMS
Répartition spatiale de la Covid-19 en Chine
Nombre de cas cumulés déclarés le 4 février 2020
Pic épidémique en Chine
Province
de Hubeï
Évolution temporelle de la Covid-19 en Chine
Cas et décès quotidiens cumulés déclarés depuis le 4 janvier 2020
« Première vague »
5 000 1500
Cas Décès
Confinement
1 290
Chine
24 janvier 2020
en Chine Population ≥ 65 ans : 12,0 %
(Hubei +++) Létalité cumulée : 4,8 %
Changement de critères
4 000 de déclaration des cas 1200
19 461 (Rattrappage du nombre de
Cas cumulés 7/03 : 100 163
cas en 1 seule journée) Décès cumulé 7/03 : 4 828
3 décès par million d'habitants
Nombre de décès
3 000 900
Nombre de cas
Rattrappage du nombre
de décès et de cas de Hubei
2 000 en 1 seule journée 600
Dernier décès
4 mars 2021
Recrudescence des cas depuis le 1er novembre
1 000 à Hong-Kong ++ (> 5 700) 300
Recrudescence des cas dans la capitale et depuis janvier à Hebei (> 900)
351 276 236
136
58
0 0
04/01/2020
11/01/2020
18/01/2020
25/01/2020
01/02/2020
08/02/2020
15/02/2020
22/02/2020
29/02/2020
07/03/2020
14/03/2020
21/03/2020
28/03/2020
04/04/2020
11/04/2020
18/04/2020
25/04/2020
02/05/2020
09/05/2020
16/05/2020
23/05/2020
30/05/2020
06/06/2020
13/06/2020
20/06/2020
27/06/2020
04/07/2020
11/07/2020
18/07/2020
25/07/2020
01/08/2020
08/08/2020
15/08/2020
22/08/2020
29/08/2020
05/09/2020
12/09/2020
19/09/2020
26/09/2020
03/10/2020
10/10/2020
17/10/2020
24/10/2020
31/10/2020
07/11/2020
14/11/2020
21/11/2020
28/11/2020
05/12/2020
12/12/2020
19/12/2020
26/12/2020
02/01/2021
09/01/2021
16/01/2021
23/01/2021
30/01/2021
06/02/2021
13/02/2021
20/02/2021
27/02/2021
06/03/2021
OMSTransmission pré-symptomatique de la Covid-19 en Chine
77 paires de cas primaires et cas secondaires
• Contagion 1-2 jours avant les premiers symptômes
• Incubation moyenne : 5,2 jours (4,1-7,0), 95ème percentile 12,5 jours (maximum 14 j.)
• Taux de reproduction R0 : 2,2 (1,4-3,9) Modélisation
• Intervalle générationnel : 5,8 jours (4,8-6,8 jours) de l’épidémie
• 44 % (30 %-55%) de
contamination des cas
secondaires à la phase
pré-symptomatique
He X et al. Nature Medicine 2020, Li Q et al. NEJM 2020Tableau clinique de la Covid-19 en Chine
41 premiers cas Signes pour définition des cas
Huang C et al. Lancet 2020Caractéristiques de la Covid-19 en Chine
11 février 2020
Létalité %
Global
Age, en années
Sexe
Situation professionnelle
Travailleur de santé
Retraité
Chinese CDC 2020Plan de l’exposé • Définition d’une pandémie • Alerte et évolution en Chine • Les coronavirus • Évolution de la pandémie • Conclusion
Coronavirus humains
• Coronavirus saisonniers
‒ 4 coronavirus endémiques chez les humains : HCo229E, OC43, NL63, HKU1
‒ Responsables de « rhumes saisonniers » (hiver et printemps en zones tempérées)
‒ Problème pour les immunodéprimés et les nourrissons
Complications respiratoires à type de pneumonie en cas d'infection
• 2002-2003
‒ SARS-Cov apparu en Chine (Guangdong) transmis d’animal (Civette masquée) à
l’Homme puis transmission interhumaine Pandémie (31 juillet 2003 : 8 096 cas /
774 décès ; létalité 9,6 %) Syndrome Respiratoire Aigu Sévère (SARS)
• Depuis 2012
‒ MERS-Cov apparu en Arabie Saoudite (Djjedah) transmis d’animal (Dromadaire) à
l’Homme puis transmission interhumaine peu efficace Pandémie en cours
(31 mai 2020 : 2 526 cas / 881 décès ; létalité 34 %)
Syndrome Respiratoire du Moyen-Orient (MERS)
• Depuis 2019
‒ SARS-Cov-2 apparu mi-décembre 2019 en Chine à Wuhan Civette palmiste masquée
Syndrome Respiratoire sévère - Coronavirus disease (Covid)
‒ 26 janvier 2020 : Étude du génome de 10 coronavirus
• Taux d’iden té́ de 99,98 % Émergence récente
Sallard E et al. médecine / sciences 2020, Lu R et al. Lancet 2020 DromadaireSARS-Cov-2
• Acronyme du coronavirus 2 du syndrome respiratoire aigu sévère
• « Severe Acute Respiratory Syndrome Coronavirus 2 » en anglais
• Structure
• Adhésion cellules cibles
• Cible du système immunitaire
• Cible des vaccins
• Mutations Virus Variants
• Détruit 60°C en 30 minutes
• Détruit par désinfectants usuels
• 80 % d’ identité génétique avec le SARS
• 96 % d’identité avec un virus de chauve-
souris (Rhinolophus affinis)
Gautheret-Dejean A. 2020Covid-19 = Zoonose
• Cycle naturel hypothétique
Rhinolophus affinis
Sunda pangolin Manis javanica
Hassanin A et al. Mammalia 2021Modes de transmission du SARS-CoV-2 • Transmission aérienne (gouttelettes) +, manu-portée (objets, mains) • du risque : distance (15 min), air confiné
Modes de transmission du SARS-CoV-2 et prévention
• Gouttelettes, postillons d’une personne malade
‐ Masques : chirurgical, FFP2 pour les professionnels de santé
‐ Tousser et se moucher dans son coude ou un mouchoir jetable
‐ Lavage ou désinfection des mains (solution hydro-alcoolique)
‐ Désinfection des surfaces
• Contacts interhumains
‐ Distance physique inter-personnelle > 1,5 mètre, Confinement-Couvre-Feu
‐ Masque, Groupe ≤ 6 personnes, Pas de serrages de mains et d’embrassades
• Aérosols (« Airborne »)
‐ Pièce non ventilée Ventilation, Aération
‐ Espace public à forte densité Distance et masque, Aération
Ventilation
Morawska L et al. Clinical Infectious Diseases 2020Se défendre face à une pandémie virale respiratoire
Un seul type d’intervention ne suffit pas
« Modèle de l’Emmental suisse »
• Chaque intervention (« tranche de fromage ») a ses limites (« trous »)
• Conjuguer les interventions réduit les risques
• La désinformation limite l’efficacité globale de tout le dispositif
lieux très fréquentés
rapidement contacts
Aérer, rester dehors,
Consignes officielles
Eviter de se toucher
Mesures de soutien
malade, désinfecter
Filtrer l’air intérieur
Distance Physique
Porter un masque
Se laver les mains
Rester chez soi si
Limiter le temps
Tester et tracer
passé dans des
Quarantaine &
Confinement
Tousser dans
(> 2 mètres)
Vaccination
les surfaces
son coude
le visage
Souris de la désinformation
Responsabilité individuelle Responsabilité collective
MacKay Ian M. adapté Reason J. BMJ 2000, modifié D’Ortenzo E et al. Inserm Novembre 2020Risque de transmission du SARS-CoV-2
par des personnes asymptomatiques (15-30 % des infectés*)
En vert : risque faible En orange : risque modéré En rouge : risque fort
D’Ortenzo E et al. Dossier Inserm 16 novembre 2020, *INSQ Québec 18 décembre 2020Risque de transmission du SARS-CoV-2
de grande ampleur
• Regroupements de nombreuses personnes
‐ Mariage, Funérailles, Cultes religieux
‐ Chorales, Gymnase, Manifestations sportives
‐ Bars, Pubs, Restaurants
• Facteurs favorisant des contaminations de grande ampleur
‐ Contact prolongé
‐ Mauvaise ventilation
‐ Promiscuité
‐ Personne(s) infectieuse(s)
‐ Super-contaminateur(s) (« Superspreader(s) »)
• Corée du sud, Mulhouse …Plan de l’exposé • Définition d’une pandémie • Alerte et évolution en Chine • Les coronavirus • Évolution de la pandémie • Conclusion
Surveillance épidémiologique de la Covid-9 • Déclaration quotidienne des cas et décès de Covid-19
Surveillance biologique des SARS-CoV-2
• Réseau de laboratoires nationaux
• Réseau de laboratoires de référence OMS
7 en Région
Europe
OMS
2 en Région
Med. Or.
OMS
7 en Région
Pacifique
2 en Région Occ.
3 en Région
Afrique OMS
Amériques
OMS
OMSDescription de la pandémie de Covid-19
Janvier 2020 au 7 mars 2021
• Bilan cumulé mondial et par régions OMS
‐ Site OMS :
https://www.who.int/emergencies/diseases/nov
el-coronavirus-2019/situation-reports
‐ Site UJH :
https://gisanddata.maps.arcgis.com/apps/opsda
shboard/index.html#/bda7594740fd402994234
67b48e9ecf6
• Évolution temporelle de la Covid-19 (selon le TEMPS)
• Répartition spatiale de la Covid-19 (selon le LIEU)
• Caractéristiques des malades (selon la POPULATION)Répartition spatiale de la Covid-19 par région OMS
Nombre de cas/décès confirmés et vaccinations le 7 mars 2021
Monde Région Europe Région Asie
116 167 000 cas 34,2 % des cas du Sud Est
2 582 500 décès 34,2 % des décès 11,8 % des cas
Létalité 2,2 % Létalité 2,2 % 8,1 % des décès
Vacciné.es Létalité 1,5 %
Vacciné.es
93 300 000 Vacciné.es
292 000 000* 14 580 000
Région Pacifique
Occidental
1,4 % des cas
1,2 % des décès
Létalité 1,8 %
Région des Amériques Vacciné.es
44,4 % des cas 55 150 000
47,9 % des décès
Létalité 2,4 %
Vacciné.es
114 140 000 Région Afrique Région Méditerranée Orientale
2,5 % des cas 5,7 % des cas
2,9 % des décès 5,7 % des décès
Létalité 2,5 % Létalité 2,2 %
Vacciné.es Vacciné.es
565 000 13 690 000
OMS, CDC États-Unis, Santé Publique France, Sécurité publique Italie, CDC TaïwanNombre de pays et territoires touchés par la Covid-19
Janvier 2020 au 7 mars 2021
Alerte OMS Début vaccinations
31 décembre Décembre
250
USPPI OMS
30 janvier 220 220 222 223 223
216 216 216 216 216 218
213
Nombre cumulé mensuel de pays déclaran
203
200
des cas confirmés de Covid-19
150 Pays et territoires n’ayant déclaré aucun cas de Covid-19
• Europe OMS : Turkménistan, Archipel norvégien de Svalbard et Jan
Mayen en Arctique
100 • Afrique OMS : Territoire britannique de Sainte-Hélène au large de
l’Angola
58 • Pacifique occidental OMS : Corée du Nord et 11 micro-états et
50 territoires du Pacifique
28
0
Juillet
Jan 2020
Mai
Juin
Septembre
Août
Janvier 2021
Décembre
Avril
Octobre
Novembre
Mars
Mars
Février
Février
OMSÉvolution temporelle de la Covid-19
Nombre de cas déclarés entre le 4 janvier et le 7 mars 2021
Variant 501Y.V2
dit « Sud-Africain» 292 000 000
octobre 1ère doses
6 000 000
de vaccins
Pacifique occidental 7 mars
Variant P1
Asie du Sud-Est dit « brésilien»
5 000 000 Amériques
Variant B117 Fin décembre
Europe dit « anglais »
Méditerranée orientale mi-septembre
Nombre de cas hebdomadaires
4 000 000
Afrique
Monde Mise à jour 800 000 cas
en Turquie en semaine 50
3 000 000
2 000 000
1 000 000
0
S02
S03
S04
S05
S06
S07
S08
S09
S10
S11
S12
S13
S14
S15
S16
S17
S18
S19
S20
S21
S22
S23
S24
S25
S26
S27
S28
S29
S30
S31
S32
S33
S34
S35
S36
S37
S38
S39
S40
S41
S42
S43
S44
S45
S46
S47
S48
S49
S50
S51
S52
S53
S02
S03
S04
S05
S06
S07
S08
S01-20
S01-21
Semaines 2020
OMS, CDC Etats-Unis, Santé Publique France, Sécurité publique Italie, CDC TaïwanÉvolution temporelle de la Covid-19
Nombre de décès déclarés entre le 4 janvier et le 7 mars 2021
110 000
Pacifique occidental
100 000 Asie du Sud-Est
Amériques
90 000
Europe
80 000 Méditerranée orientale
Afrique
Nombre de décès hebdomadaires
70 000
Autres
60 000 Monde
50 000
40 000
30 000
20 000
10 000
0
S02
S03
S04
S05
S06
S07
S08
S09
S10
S11
S12
S13
S14
S15
S16
S17
S18
S19
S20
S21
S22
S23
S24
S25
S26
S27
S28
S29
S30
S31
S32
S33
S34
S35
S36
S37
S38
S39
S40
S41
S42
S43
S44
S45
S46
S47
S48
S49
S50
S51
S52
S53
S02
S03
S04
S05
S06
S07
S08
S09
S01-2020
S01-2021
Semaines 2020
OMS, CDC Etats-Unis, Santé Publique France, Sécurité publique Italie, CDC TaïwanSituation par régions OMS le 7 mars 2021
Cas Décès Cas Décès
Région Afrique Région Amériques
États-Unis
Afrique du sud
53 % des cas
69 % des décès
56 % des cas
42 % des décès
Région Méditerranée Région Europe
orientale
Russie
Iran
25 % des cas
41 % des décès
11 % des cas
R-U
14 % des décès
Région Sud-Est Région Pacifique
Asiatique occidental
Inde
82 % des cas
Philippines
36 % des cas
75 % des décès 42 % des décès
OMSRépartition spatiale de la Covid-19 dans le monde
Nombre de cas cumulés déclarés le 7 mars 2021
21 pays ≥ 1 million de cas
OMS, CDC États-Unis, Santé Publique France, Sécurité publique Italie, CDC TaïwanRépartition spatiale de la Covid-19 dans le monde
Taux de cas cumulés pour 100 000 habitants le 7 mars 2021
96 pays et territoires ≥ 2 000 cas pour 100 000 habitants
OMS, CDC États-Unis, Santé Publique France, Sécurité publique Italie, CDC TaïwanRépartition spatiale de la Covid-19 dans le monde
Nombre de décès cumulés déclarés le 7 mars 2021
13 pays ≥ 1 million de cas
OMS, CDC Etats-Unis, Santé Publique France, Sécurité publique Italie, CDC TaïwanRépartition spatiale de la Covid-19 dans le monde Décès cumulés par million d’habitants le 7 mars 2021 OMS, CDC Etats-Unis, Santé Publique France, Sécurité publique Italie, CDC Taïwan
Répartition spatiale de la Covid-19 en Afrique et SOI*
Nombre de cas cumulés déclarés le 7 mars 2021 * Sud Océan Indien
OMS, Ministère Santé EspagneRépartition spatiale de la Covid-19 en Afrique et SOI*
Décès cumulés par million d’habitants le 7 mars 2021 * Sud Océan Indien
OMS, Ministère Santé EspagneFacteurs associés au décès par Covid à l’hôpital
Classes d’âge âge
• Cohorte anglaise OpenSafely
Sexe
• 1er février au 25 avril 2020 Homme RR 80+ = 20,6
Obésité
• 17 425 445 adultes ≥ 18 ans Importance obésité
Tabagisme
• 5 683 décès hospitaliers par Covid Ancien fumeur
Ethnie
Toutes ethnies
• Estimation des RR de décès vs Blancs
Carence sociale
• Analyse multivariée Avec importance
Carence sociale
Diabète
Diabète non contrôlé
Cancer
Cancer < 1 an
Hémopathie maligne
Hémopathie
Insuffisance rénale
Ins. Rénale avancée
Asthme
Maladie Respiratoire Chronique
Cardiopathie Chronique Maladies
HTA ou Pression sanguine élevée
Hépatopathie Chronique chroniques
AVC ou Démence
Autre neuropathie
Transplantation
Splénectomie
Arthrite rhumatoïde /Lupus / Psoriasis
Autre immunodépression
Williamson EJ et al. Nature 2020Proportion des 65 ans et plus
Impact sur la létalité
% 65 ans et +
< 5,0 %
5,0 – 9,9 %
10,0 – 14,9 %
15,0 – 19,9 % Pays de l’Afrique sub-saharienne
≥ 20,0 %
Pas de données
65 ans et + < 5 % = quasi-totalité
Nations-UniesPlan de l’exposé • Définition d’une pandémie • Alerte et évolution en Chine • Les coronavirus • Évolution de la pandémie • Conclusion et Perspectives
• Première pandémie de cette importance après la pandémie de grippe de 1918-1920 en fin de deuxième guerre mondiale ‐ 117 millions de cas (7 mars 2021) ‐ 2,6 millions de décès • La pandémie la plus surveillée (déclaration quotidienne 15 mois) • Facteurs de risque de décès ‐ Sujets âgés +++ ‐ Co-morbidités ‐ Homme • Syndémie = Impact observé est modulée par plusieurs facteurs qui coexistent, vont interagir et s’exacerber les uns les autres : ‐ Niveau de développement ‐ Structure de la population ‐ Maladies chroniques non transmissibles ‐ Développement sanitaire ‐ Types de climat
• Les perspectives de contrôle de la pandémie dépendent de
deux facteurs majeurs :
‐ Diffusion et impact des « variantes » particulières du
SARS-CoV-2
‐ Vitesse de production et d’utilisation des vaccins par
l’ensemble des pays du monde
• Impacts économiques et sanitaires indirects très importants
• Impact des séquelles et chronicité de la Covid
• Difficile de situer précisément la sortie de la crise sanitaire
• Analyse de la crise sanitaire pour en tirer les enseignements
‐ Origine de l’émergence
‐ Approche « Une seule Santé » :
Animaux + Humains + Environnement
‐ et parce que …« Les maladies infectieuses sont les compagnes
constantes de notre vie »
« Il y aura donc des maladies nouvelles :
c’est un fait fatal »
Charles Nicolle 1930
« On ne doit pas tout craindre, mais tout préparer »
Richelieu
« Se faire battre est excusable, se faire surprendre
est impardonnable »
Napoléon BonaparteJe vous remercie de votre attention !
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