Technologies innovantes - extrait du catalogue Imagerie médicale & radiologie diagnostique et interventionnelle

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Technologies innovantes - extrait du catalogue Imagerie médicale & radiologie diagnostique et interventionnelle
Technologies innovantes
{extrait du catalogue}
Imagerie médicale & radiologie diagnostique
et interventionnelle

       Journées Françaises de Radiologie
       Paris, Palais des Congrès
       16 - 19 octobre 2015
Technologies innovantes - extrait du catalogue Imagerie médicale & radiologie diagnostique et interventionnelle
Edito
    CVSTENE est le consortium de valorisation                    d’instituts membres de CVSTENE ou accompagnées
    thématique du numérique. Fondé par les acteurs               par nos partenaires. Il vous donnera un aperçu de leurs
    de la recherche numérique (CEA, CNRS, Institut               compétences, des opportunités de transfert ainsi que
    Mines Telecom, Inria, CDEFI et CPU), son objectif est        des thèmes possibles de collaboration.
    d’impulser des projets de transfert de technologies
    numériques. Nous sommes présents aux Journées                Nous remercions la Société Française de Radiologie
    Françaises de Radiologie pour vous présenter un              de nous inviter à venir à la rencontre de l’ensemble
    échantillon des technologies issues de nos laboratoires      des acteurs de la radiologie. Nous serons présents
    et de nos partenaires, en particulier pour cette             sur l’exposition (stand #102) et proposerons un
    manifestation, les sociétés d’accélération de transfert de   programme de démonstrations tout au long du congrès.
    technologies Conectus et IDF Innov.

    De nombreuses équipes de recherche développent et
                                                                   Pour toute question ou information complémentaire sur ces
    appliquent des méthodes innovantes en collaboration            technologies et, plus largement l’activité de CVSTENE sur cette
    avec des équipes médicales en France et dans                   thématique, n’hésitez pas à contacter :
    le monde. Dans ce cadre ou à terme, elles établissent          • Philippe Gesnouin, responsable du transfert technologique
    des partenariats de recherche et de transfert de               “santé, sciences de la vie, biotechnologie” chez Inria par mail à
                                                                   philippe.gesnouin@inria.fr ou
    technologies avec les industriels de l’imagerie,               • Clémentine Delphin, chef de projet CVSTENE par mail à
    grands groupes internationaux ou PME françaises.               clementine.delphin@inria.fr

    Ce catalogue expose un échantillon de technologies
    et des logiciels développés par des équipes

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Technologies innovantes - extrait du catalogue Imagerie médicale & radiologie diagnostique et interventionnelle
AIRWAYS                                                                          Anatoscope
   http://www-artemis.it-sudparis.eu/~fetita/airways.html                           http://www.anatoscope.com

• Reconstruction 3D des voies                                                    Anatoscope recale
respiratoires chez l’humain à partir                                             automatiquement des maquettes
d’acquisitions cliniques en TDM                                                  anatomiques 3D, complètes
• Extraction de marqueurs                                                        et indexées, sur des images
quantitatifs pour la caractérisation                                             médicales CT ou IRM.
de changements morphologiques                                                    Ceci facilite considérablement la
• Construction de modèles maillés                                                compréhension et la segmentation
patient-specifique                                                               d’images, ainsi que la construction
• Possibles simulations numériques          • Planning interventionnel :         de modèles personnalisés pour
d’écoulement pour une étude                 pose de stents, biopsies,            la simulation de traitements, la
fonctionnelle ou une utilisation en         simulations numériques               communication avec les patients,
planning chirurgical                        ▪• Etudes cliniques pour             la constitution d’atlas statistiques,
                                            l’évaluation de l’impact             l’impression 3D.
 Aspects innovants                         thérapeutique dans les                                                         Language
• Quantification par l’image                pathologies respiratoires             Aspects innovants                      C/C++
la morphologie des voies                                                         La construction automatique de
respiratoires du patient                     Licence                            modèles 3D patients-spécifiques           Licence
• Evaluation du « remodelage »              Propriétaire                         ouvre la porte à de multiples            Propriétaire
• Estimation de l’impact d’une                                                   applications de médecine
thérapie                                     Language                           personnalisée.                            Contact
• Planification et guidage de               C/C++                                                                         faure@anatoscope.com
l’intervention                                                                     domaines d’applications
                                             Contact                            • Imagerie médicale                       Partenaires académiques
 domaines d’applications                   catalin.fetita@telecom-sudparis.eu   • Orthopédie
• Diagnostic quantitatif assisté                                                 • Orthodontie
par ordinateur dans le cadre de              Partenaires académiques
l’asthme
• Suivi thérapeutique pour la
thermoplastie bronchique

Mots-clés                                                                        Mots-clés                                  INRIA Déploiement identité
                                                                                                                                    INRIA CORPO CMJN
                                                                                                                                                                 61269

[Diagnostic assisté par ordinateur] [Pathologies respiratoires] [Modélisation    [Recalage] [Image 2D] [Image 3D] [Simulation] [Impression 3D]
                                                                                                                                            DRAGON                           100%

                                                                                                                             C0                   C0
                                                                                                                             M20                  M100
                                                                                                                             J90                  J90    -   -           -
                                                                                                                             N0                   N0

                                                                                                                                                  -      -   -           -

spécifique au patient] [Marqueurs image]
                                                                                                                             -                    -      -   -           -

                                                                                                                                      R1-30/03/11

                                                                                                                                                                                    3   3
Technologies innovantes - extrait du catalogue Imagerie médicale & radiologie diagnostique et interventionnelle
Cement injection device
       for Vertebroplasty                                                               Deformetrica
       http://www.satt.conectus.fr                                                      http:// www.deformetrica.org                                                  Deformet!ca

    Telerobotic system allowing precise                                              Mesures avancées de
    control of both cement viscosity                                                 caractéristiques anatomiques à
    and injection duration for                                                       partir d’images IRM ;
    vertebroplasty surgical procedures                                               Construction de modèles
                                                                                     anatomiques spécifiques d’une
     TECHNOLOGY                                                                     pathologie donnée ;
    • Master-slave robotic system for                                                Personnalisation de modèles
    cement injection                                                                 pour le diagnostic différentiel, la
    • Automatic viscosity control                                                    planification chirurgicale, etc…
    throughout the procedure
    • Fine adjustments of injection                                                   Aspects innovants
    speed                                                                            • Applicable directement sur
    • Haptic feedback                                                                images ou segmentations issues
                                                                                                                               Licence
    • Easy operation by physicians                                                   des logiciels les plus courants
                                                                                                                              Inria – Non commerciale,
                                                                                     (FreeSurfer, FSL, etc..)
                                                                                                                              accord de licence possible
     APPLICATIONS                              Cement injection in vertebral body
                                                                                     • Fournit des marqueurs
    • Percutaneous vertebroplasty                                                    interprétables
                                                                                                                               Contact
    surgical procedures                                                              • Incorpore les techniques de
                                                 DEVELOPMENT STATUS                                                          stanley.durrleman@inria.fr
                                                                                     pointe en apprentissage statistique
     ADVANTAGES                                • Prototype available soon for       et analyse des formes
    • Radiologist precisely controls            demonstration on phantom                                                       Partenaires académiques
    injection speed with a finger               vertebrae                             domaines d’applications
    • Lessens risk of cement leakage                                                 • Etudes cliniques (détection de
    outside vertebral body by quickly            Contact                            biomarqueurs, quantification de
    reaching minimum viscosity                  mariya.savinova@satt.conectus.fr     l’effet d’un traitement)
    • Physician removed from                                                         • Diagnostic assisté par ordinateur
    radiation field                              Partership                         • Planification chirurgicale (ex.
    • Delays cement hardening for               ICube - Université de Strasbourg     stimulation cérébrale profonde)
    longer injection time                       CNRS -                                                                          INRIA Déploiement identité
                                                                                                                                        INRIA CORPO CMJN
                                                                                                                                                                     61269

                                                                                                                                                DRAGON                           100%

                                                                                                                                 C0                   C0
                                                                                                                                 M20                  M100
                                                                                                                                 J90                  J90    -   -           -
                                                                                                                                 N0                   N0

                                                                                                                                                      -      -   -           -

    KEYWORDS                                                                         Mots-clés
                                                                                                                                 -                    -      -   -           -

                                                                                                                                          R1-30/03/11

    [Robotic surgery] [Percutaneous] [Vertebroplasty] [Minimally invasive surgery]   [Anatomie] [Statistique] [Modèles] [Médecine personnalisée]
    [Spinal treatment]

4
Technologies innovantes - extrait du catalogue Imagerie médicale & radiologie diagnostique et interventionnelle
France Life Imaging – Information
  DROP                                                                                                                Analysis and Management
  http://www.mrf-registration.net                                                                                     https://project.inria.fr/fli/

Drop effectue la mise en                                                                                           Le nœud Information Analysis and          domaines d’applications
correspondance d’images                                                                                            Management (IAM) est le nœud             • Imagerie médicale
provenant de même ou plusieurs                                                                                     transversal de France Life Imaging       • Stockage et traitements
modalités en calculant un champ                                                                                    (FLI). FLI est une infrastructure        d’images médicales
de déformation non rigide /                                                                                        nationale à grande échelle qui a
déformable d’une manière rapide                                                                                    pour objectif de coordonner et            Contacts
et efficace.                                                                                                       d’harmoniser les réseaux des             christian.barillot@irisa.fr
Drop est un nouvel outil de                                                                                        ressources en imagerie in-vivo en        michel.dojat@ujf-grenoble.fr
recalage rapide et efficace                                                                                        France. Les objectifs principaux         michael.kain@inria.fr
se basant sur de nouveaux                                                                                          de IAM sont de construire une
algorithmes ne nécessitant pas de                                                                                  infrastructure d’archivage et de          Partenaires académiques
dérivée de fonction de coût.               domaine d’applications                                                 gestion de données d’imagerie
Le problème du recalage est               • Imagerie médicale                                                      in-vivo clinique et préclinique
fondamental en imagerie                                                                                            ainsi que de fournir des services
médicale, d’autant plus que les            Language                                                               d’analyse et de traitement
modalités d’imagerie disponibles          C                                                                        d’images.
sont de plus en plus nombreuses.
                                           Licence                                                                 Aspect innovant
 Aspect innovant                         Propriétaire                                                             Le nœud IAM permettra de
Il s’agit de trouver une                                                                                           construire une infrastructure
                                                                                                                                                            INRIA Déploiement identité           61269
                                                                                                                                                                    INRIA CORPO CMJN

                                                                                                                                                                            DRAGON                           100%

                                                                                                                                                             C0                   C0
                                                                                                                                                             M20                  M100
                                                                                                                                                             J90                  J90    -   -           -

transformation qui aligne au                                                                                       versatile de gestion et de
                                                                                                                                                             N0                   N0

                                           Contact
                                                                                                                                                                                  -      -   -           -

                                                                                                                                                             -                    -      -   -           -

                                                                                                                                                                      R1-30/03/11

mieux deux images ou volumes,             sriv-saclay@inria.fr                                                     traitement des données
acquis selon deux modalités                                                                                        permettant l’interopérabilité entre
différentes sur un même patient.           Partenaires académiques                                                sites de production de données
L’intérêt est de disposer ainsi                                                                                    de FLI et traitement des images
d’informations complémentaires                                                                                     produites.
dont la mise en relation apporte
une valeur ajoutée importante
pour l’interprétation.

Mots-clés                                                                                                          Mots-clés
[Outil de fusion] [Recalage] [Image 2D] [Image 3D] [Multi-modal]                                                   [Imagerie médicale] [Stockage d’images] [Traitements d’images]
                                                           INRIA Déploiement identité           61269
                                                                   INRIA CORPO CMJN

                                                                           DRAGON                           100%

                                                            C0                   C0
                                                            M20                  M100
                                                            J90                  J90    -   -           -
                                                            N0                   N0

                                                                                 -      -   -           -

                                                            -                    -      -   -           -

                                                                     R1-30/03/11

                                                                                                                                                                                                                    5
Technologies innovantes - extrait du catalogue Imagerie médicale & radiologie diagnostique et interventionnelle
IRM cardio-vasculaire par encodage 3D
      ImaginIT                                                                  non-cartésien
      http://radio.imginit.fr

    La société ImagIT propose une                                            Les séquences d’acquisition IRM
    solution de validation automatique                                       non-cartésiennes permettent
    de la qualité des images : détection                                     un échantillonnage du centre
    des images floues ou de mauvaise                                         de l’espace de Fourier à chaque
    qualité, tri des meilleurs images                                        temps de répétition de la
    d’une série, évaluation quotidienne                                      séquence. Grâce à cette propriété,
    de la bonne calibration des                                              il est possible de générer des
    systèmes d’acquisition... Elle est                                       images beaucoup plus rapidement
    intégrable par les radiologues                                           qu’en imagerie classique. Cette
    dans les workflow cliniques, et par                                      technique peut ainsi être mise à
    les industriels dans leurs systèmes                                      profit pour réaliser des images
    d’acquisition et de visualisation                                        avec des résolutions spatiales et
    d’images ainsi que pour les                                              temporelles extrêmement élevées
    vérifications de calibration.                                            dans le domaine cardio-vasculaire.
                                                Licence et BREVET
     Aspect innovant                          Propriétaire                   Aspects innovants
    La technologie permet une                  Brevet délivré US, EP         • Des schémas innovant                        Language
    identification rapide des zones            Demande de brevet en examen   d’encodage de l’espace de Fourier            Langage de programmation
    floues dans des images de grande           JP, CH                        peuvent être mise en place,                  Bruker PV6
    taille (ex. 3 milliards pixels /minute                                   comme des encodages pseudo-
    sur un ordinateur portable).                Contact                     aléatoires.                                   Contact
                                               bd-3s@idfinnnov.com           • Des images sont acquises                   miraux@rmsb.u-bordeaux2.fr
     domaines d’applications                                                avec des facteurs de sous-
    • Radiologie                                Partenaire académique       échantillonnages extrêmement                  Partenaires académiques
    • Anatomopathologie                                                      élevés en conservant une
                                                                             excellente qualité d’image.

                                                                              domaine d’applications
                                                                             • Imagerie bio-médicale

    Mots-clés                                                                Mots-clés
    [Flou] [Image] [Radio] [Anatomopathologie] [Qualité]                     [IRM] [Espace de Fourier] [Radial] [Image 4D] [Angle d’or]

                                                                                                                                    INRIA Déploiement identité           61269
                                                                                                                                            INRIA CORPO CMJN

                                                                                                                                                    DRAGON                           100%

                                                                                                                                     C0                   C0
                                                                                                                                     M20                  M100
                                                                                                                                     J90                  J90    -   -           -
                                                                                                                                     N0                   N0

6
                                                                                                                                                          -      -   -           -

                                                                                                                                     -                    -      -   -           -

                                                                                                                                              R1-30/03/11
Technologies innovantes - extrait du catalogue Imagerie médicale & radiologie diagnostique et interventionnelle
LCC-logDemons                                                                                                Longitudinal Atrophy pipeline
   https://team.inria.fr/asclepios/software/lcclogdemons/

LCC-logDemons is an accurate                                                                                 The longitudinal Atrophy Pipeline
and robust image diffeomorphic                                                                               is a computational tool for the
registration framework. It                                                                                   analysis of the brain atrophy
implements the symmetric Local                                                                               observed in time series of T1
Correlation Coefficient (LCC) as                                                                             magnetic resonance images.
a similarity measure, and thus it                                                                            It has been extensively validated
is unbiased with respect to local                                                                            on clinical data for the accurate
linear intensity bias of the images.                                                                         measurement of longitudinal
LCC-logDemons is suited for both                                                                             hippocampal atrophy and
inter and intra-subject registration,                                                                        ventricular enlargment.
and compares well with respect to
state-of-art methods.                                                                                        The pipeline is completely
Thanks to the stable and consistent                                                                          automated and was developed
scheme for the computation of               Contact                                                         in collaboration between IRCCS                 Contact
the Jacobian determinant of the            marco.lorenzi@inria.fr                                            Fatebenefratelli and Inria Sophia             marco.lorenzi@inria.fr
transformation, LCClogDemons                                                                                 Antipolis.
represents a reliable instrument            Partenaires académiques                                                                                        Partenaires académiques
for Tensor Based Morphometry                                                                                  Licence
(TBM).                                                                                                       Free license for research purposes.
                                                                                                             Redistribution with or without
 Licence                                                                                                    modification is not allowed
Free license for research purposes.                                                                          without the previous authorization
Redistribution with or without                                                                               of the developers
modification is not allowed
without the previous authorization
of the developers
                                                     INRIA Déploiement identité           61269                                                                     INRIA Déploiement identité           61269
                                                             INRIA CORPO CMJN                                                                                               INRIA CORPO CMJN

                                                                     DRAGON                           100%                                                                          DRAGON                           100%

                                                      C0                   C0                                                                                        C0                   C0
                                                      M20                  M100
                                                      J90                  J90    -   -           -                                                                  M20
                                                                                                                                                                     J90
                                                                                                                                                                                          M100
                                                                                                                                                                                          J90    -   -           -
                                                      N0                   N0                                                                                        N0                   N0

                                                                           -      -   -           -                                                                                       -      -   -           -

                                                      -                    -      -   -           -                                                                  -                    -      -   -           -

                                                               R1-30/03/11                                                                                                    R1-30/03/11

Mots-clés                                                                                                    Mots-clés
[Image] [Non-linear registration] [Brain] [Morphometry] [Atrophy] [Measures]                                 [Brain] [Morphometry] [Atrophy] [Rates] [Alzheimer] [Disease] [Clinical trials]

                                                                                                                                                                                                                            7
Technologies innovantes - extrait du catalogue Imagerie médicale & radiologie diagnostique et interventionnelle
MUSIC
       medInria                                                                     https://team.inria.fr/asclepios/
       http://med.inria.fr                                                          software/music

    medInria propose une interface                                               Plateforme multimodale pour
    intuitive de traitement d’images                                             l’imagerie cardiaque.
    médicales issu des équipes de
    recherche Inria de ce domaine.                                                Aspect innovant
    Il permet la visualisation                                                   Algorithmes pour la fusion
    conjointe de tous types d’images                                             et l’analyse de données
    médicales et surfaces, leur                                                  électrophysiologiques et imagerie
    filtrage, le traitement de données
    d’IRM de diffusion (estimation,                                               domaines d’applications
    tractographie). D’autres                                                     • Cardiologie interventionnelle
    applications concernent le                                                   • Cathéterisme cardiaque
    recalage d’images (linéaire et non             Languages C++, Qt/ITK/VTK    • Diagnostique
    linéaire) et la segmentation.                                                                                            Contact
                                                   Licence cœur BSD, choix de    Language                                 maxime.sermesant@inria.fr
     Aspects innovants                           licence pour les plugins       C++, basé sur medInria
    • Interface ergonomique et réactive                                                                                      Partenaires académiques
    • Architecture de plugins,                     Contact                       Licence & brevets
    facilement extensible                         olivier.commowick@inria.fr     Licence propriétaire
    • Algorithmes de haut niveau issus                                           Brevets délivrés US, EP
    de la recherche Inria                          Partenaires académiques
                                                  IHU Bordeaux, OFSEP
     domaines d’applications
    • Traitement et visualisation
    d’images médicales                                                                                                                INRIA Déploiement identité
                                                                                                                                              INRIA CORPO CMJN

                                                                                                                                                      DRAGON
                                                                                                                                                                           61269

                                                                                                                                                                                       100%

    • Recalage d’images, imagerie de
                                                                                                                                       C0                   C0
                                                                                                                                       M20                  M100
                                                                                                                                       J90                  J90    -   -           -
                                                                                                                                       N0                   N0

                                                                                                                                                            -      -   -           -

                                                                                                                                       -                    -      -   -           -

    diffusion                                                                                                                                   R1-30/03/11

    • Applications cliniques :
    cardiaque, cerveau

    Mots-clés                                                                    Mots-clés
    [imagerie médicale] [visualisation] [diffusion] [filtrage]                   [Imagerie cardiaque] [Guidage interventionnel]

8
Technologies innovantes - extrait du catalogue Imagerie médicale & radiologie diagnostique et interventionnelle
MRI-compatible surgical tool
   MIDWAY                                                                         positioning device
   http://perso.telecom-paristech.fr/~angelini/publications_angelini.html         http://www.satt.conectus.fr

Midway est un logiciel de                                                      • 3D Hall effect sensor allowing
traitement d’images IRM du                                                     object tracking in MRI field
cerveau pour le calcul de cartes                                               • Complete needle positioning
de différences et la détection                                                 device in development, other
de croissance de pathologie                                                    possible applications with the same
(en particulier pour le suivi des                                              electronics
tumeurs Gliome de bas grade). Les
avantages de la méthode Midway                                                  TECHNOLOGY
sont : l’ajustement du contraste                                               A 3D Hall effect CMOS sensor has              ADVANTAGES
entre les deux volumes d’IRM sans                                              been designed to measure the                 The practitioner and the
avoir à estimer le biais de champ,        une valeur ajoutée importante        magnetic field gradients inherent            hospital save time on
le calcul de la carte des différences     pour l’interprétation d’un           to the MRI.                                  procedures and improve
qui met en valeur les endroits            examen par rapport à un              This gradients can be seen as a              precision with a lowered risk
de changements importants,                examen de référence.                 graduation of space inside the MRI           of error.
l’analyse statistique des différences                                          tunnel. By measuring them, we
                                           domaine d’application
pour sélectionner les valeurs                                                  have shown that it is possible to             DEVELOPMENT STATUS
                                          • Imagerie médicale
significatives, liées au changement                                            compute in near real time, i.e. in           • Development of a complete
anatomique important autour                Language                           4ms, the position and orientation            user-friendly needle positioning
d’une région choisie, permettant          C++                                  of the micro magnetometer with a             device
de caractériser par exemple la                                                 submillimetric precision.                    • Test with phantom and
croissance d’une tumeur.                   Licence                                                                         animals to be done (sponsor:
                                          Propriétaire                          APPLICATIONS                               Pr. Afshin Gangi)
 Aspects innovants                                                            • Interventional MRI : tracking of
• Il s’agit de caractériser les            Contact
                                          elsa.angelini@telecom-paristech.fr   needle (cryotherapy, biopsy)                  Contact
changements importants entre                                                   tracking of devices (robots, HIFU            marc.beekenkamp@satt.conectus.fr
deux examens d’un même sujet.              Partenaires académiques            devices…)
• L’intérêt est de disposer ainsi         Institut Mines Télécom,              • Functional MRI : head movement              Partnership
d’informations complémentaires            Hôpital Lariboisière,                cancellation                                 Seeking partners for
dont la mise en relation apporte          Université Paris Diderot, CNRS                                                    co-development or licensing

Mots-clés                                                                      KEYWORDS
[Détection de changements] [IRM] [Gliome] [Croissance tumorale]                [3D Hall sensor] [Microelectronics] [CMOS]

                                                                                                                                                               9
Technologies innovantes - extrait du catalogue Imagerie médicale & radiologie diagnostique et interventionnelle
Nenuphar
   ND-SAFIR
   http://serpico.rennes.inria.fr/doku.php?id=software:nd-safir:index

ND-SAFIR est dédié à la                                                                                            Cette suite logicielle permet
restauration (ou débruitage)                                                                                       d’évaluer l’agressivité d’une
d’images 2D, 3D et de séquences                                                                                    tumeur ou sa réponse au
d’images 2D + T(emps) ou                                                                                           traitement. A partir de deux
3D + T(emps).                                                                                                      images initiales montrant la lésion
                                                                                                                   ciblée, elle permet de récupérer
 Aspect innovant                                                                                                  les paramètres de la lésion pour le
Cet algorithme non-itératif se                                                                                     modèle de prédiction spécifique
positionne parmi les meilleurs                                                                                     à chaque indication (métastases
algorithmes de débruitage publiés                                                                                  pulmonaires, méningiomes, ...).
                                                                                                                                                               Contact
pour traiter les images fixes ou les                                                                               L’évolution de la lésion est alors
                                                                                                                                                              Marie.Martin@inria.fr
séquences d’images                           Licence & brevet                                                     prédite jusqu’au temps voulu.
                                            Licence Inria, gratuite pour les                                                                                   PartenaireS académiqueS
 domaines d’applications                   académiques                                                             Aspect innovant
• Imagerie biomédicale                      Brevet délivré US, EP                                                  • Évaluation et prédiction sur le
• Photographies anciennes                                                                                          volume mais aussi sur la forme de
                                             Contact                                                              la métastase ou du méningiome.
 Languages                                 charles.kervrann@inria.fr                                              • Représentation 2D puis 3D à
C++, Java, Matlab disponible sous                                                                                  venir de cette évolution.
Windows, Linux et MacOS X                    Partenaires académiques

                                                                                                                    domaine d’applications
                                                                                                                   • Évaluation et surveillance
                                                                                                                   de l’évolution des métastases
                                                                                                                   pulmonaires et des méningiomes.

                                                                                                                    Language
                                                           INRIA Déploiement identité
                                                                   INRIA CORPO CMJN
                                                                                                61269
                                                                                                                   C++ (10000)
                                                                           DRAGON                           100%

                                                            C0                   C0
                                                            M20                  M100
                                                            J90                  J90    -   -           -
                                                            N0                   N0

                                                                                 -      -   -           -

                                                            -                    -      -   -           -

                                                                     R1-30/03/11

Mots-clés                                                                                                          Mots-clés
[Imagerie 2D et imagerie 3D] [Filtrage] [Restauration] [Débruitage] [Traitement                                    [Modélisation] [Santé] [Imagerie médicale] [Oncologie] [Cancer] [Equation aux
d’images] [Séquences d’images] [Vidéo-microscopie] [Fluorescence] [Biologie]                                       dérivées partielles]

10
Nilearn                                                                                                           OpenMEEG
   http://nilearn.github.io                                                                                          http://openmeeg.github.io

Librairie offrant les fonctionnalités                                                                              Simulation bioélectromagnétique
pour appliquer les outils de                                                                                       en régime quasi statique, par
Scikit-Learn à la neuroimagerie :                                                                                  éléments finis de frontières.
fonction d’aide pour charger et
mettre en forme les données,                                                                                        Aspects innovants
créer des images, visualiser des                                                                                   • Simulation électromagnétique de
résultats, estimer des modèles de                                                                                  haute précision
connectivité à partir de données              Language                                                            • Description géométrique
temporelles.                                 Python                                                                simplifiée des milieux
                                                                                                                   (conductivité constante par
 Aspect innovant                             Licence                                                             morceaux)
Librairie en pur Python, très facile         BSD
à installer, bien documentée, bien                                                                                  domaines d’applications                  Licence
testée. Contient des outils état de           Contact                                                             • Electroencéphalographie (EEG)           Libre CeciLL-B
l’art                                        bertrand.thirion@inria.fr                                             • Magnétoencéphalographie (MEG)
                                                                                                                   • Stimulation électrique                   Contact
 domaine d’applications                      PartenaireS académiqueS                                             fonctionnelle                             openmeeg-info@lists.gforge.inria.fr
• Utilisé pour l’imagerie cérébrale                                                                                • Intégration dans des logiciels
anatomique ou fonctionnelle                                                                                        tiers : Fieldtrip, Brainstorm              Partenaires académiques
(problèmes d’apprentissage,                                                                                        • Collaborations industrielles :
connectivité)                                                                                                      Oticon, BESA

                                                                                                                    LanguageS
                                                                                                                   C++, Linux / Windows / MacOS

                                                                                                                                                                          INRIA Déploiement identité           61269
                                                                                                                                                                                  INRIA CORPO CMJN

                                                                                                                                                                                          DRAGON                           100%

                                                                                                                                                                           C0                   C0
                                                                                                                                                                           M20                  M100
                                                                                                                                                                           J90                  J90    -   -           -
                                                                                                                                                                           N0                   N0

                                                                                                                                                                                                -      -   -           -

                                                           INRIA Déploiement identité           61269
                                                                   INRIA CORPO CMJN                                                                                        -                    -      -   -           -

                                                                           DRAGON                           100%
                                                                                                                                                                                    R1-30/03/11
                                                            C0                   C0
                                                            M20                  M100
                                                            J90                  J90    -   -           -
                                                            N0                   N0

                                                                                 -      -   -           -

                                                            -                    -      -   -           -

                                                                     R1-30/03/11

Mots-clés                                                                                                          Mots-clés
[Machine learning] [Connectivité fonctionnelle] [Statistiques]                                                     [Simulation en électromagnétisme] [Conductivité] [EEG] [MEG]

                                                                                                                                                                                                                                  11
Plateformes « Chimie & Imagerie
       OHS                                                                                               préclinique »
       http://www.hugotalbot.com/ohs-start-up/                                                           http://www.cgfl.fr/recherche/la-recherche-translationnelle.html

                                                                                                      La plateforme est dotée
     OHS a pour ambition de                                                                           d’appareillages de pointe
     démocratiser l’accès et l’utilisation                                                            (imageurs « petit animal »
     des simulations médicales dans                                                                   SPECT-CT, PET-CT, MRI, optique)
     l’ensemble ces centres hospitalo-                                                                permettant une approche
     universitaires. Le développement                                                                 complète de pharmaco-imagerie,
     de simulateurs pluridisciplinaires                                                               de la molécule à l’imagerie in vivo,
     et à bas coût est indispensable à                                                                dans un environnement dédié et
     l’émergence et à la généralisation                                                               dans le respect de la confidentialité
     de centres de simulation virtuelle.                                                              des expérimentations.
                                                                                                      Les prestations offertes couvrent
      Aspect innovant                                                                                depuis la chimie froide (modification
     La réalisation d’une simulation          Licence
                                                                                                      de biomolécules/marquage assurée          domaines d’applications
     médicale peut être longue et            Propriétaire
                                                                                                      par la business unit « Welience          • Imagerie médicale
     complexe. Notre projet repose                                                                    Bioconjugates ») jusqu’à l’acquisition   • Oncologie
     sur une technologie innovante            Contact
                                                                                                      et au traitement d’images.               • Cardiovasculaire
     de simulation : la plateforme           hugo.talbot@inria.fr
     SOFA. SOFA est un logiciel                                                                        Aspects innovants                       Contact
     open-source, à la pointe de l’état       Partenaire académique
                                                                                                      • Diversité des modalités                bcollin@cgfl.fr
     de l’art permettant de simuler et                                                                disponibles sur un seul site
     d’interagir en temps réel avec des                                                               • Approche multimodale (PET-MR            PartenaireS académiqueS
     modèles multiphysiques.                                                                          via l’Equipex IMAPPI, bimodalité
                                                                                                      nucléaire/optique)
      domaine d’applications                                                                         • Activité de R&D permanente en
     • Simulation medicale                                                                            chimie (méthodes de marquage
                                                                                                      originales), en oncologie (cancers
      Language
                                              INRIA Déploiement identité           61269
                                                      INRIA CORPO CMJN

                                                                                                      du sein agressifs), ou encore en
                                                              DRAGON                           100%

                                               C0                   C0
                                               M20                  M100
                                                                           -   -           -

     C++
                                               J90                  J90
                                               N0                   N0

                                                                    -      -   -           -

                                                                                                      cardiologie (oncocardiotoxicité des
                                               -                    -      -   -           -

                                                        R1-30/03/11

                                                                                                      molécules anticancéreuses).

     Mots-clés
     [Simulation médicale] [Formation]

12
Pyhrf                                                                                            Pixyl
   http://nilearn.github.io                                                                         http://www.pixyl.io

Librairie Permettant d’étudier                                                                   Pixyl met en place des solutions
le couplage neuro-vasculaire                                                                     automatiques pour l’analyse
en IRM fonctionnelle : elle                                                                      d’IRM cérébrales. Conçus pour les
permet d’extraire et d’étudier le                                                                applications d’essais cliniques, les
filtre temporel qui lie l’activité                                                               outils Pixyl permettent l’extraction
neuronale à sa résultante                                                                        automatique, reproductible et
hémodynamique.                                                                                   robuste de biomarqueurs de
                                                                                                 neuroimagerie pour arriver à une
 Aspects innovants                                                                              compréhension rapide, précise et
• Contient les techniques d’état                                                                 fiable de l’efficacité du traitement
de l’art pour l’IRM fonctionnelle                                                                de lésions cérébrales. Ceci est
quantitative                               Contact                                              crucial pour la prise de décision à
• Supporte le calcul parallèle            philippe.ciuciu@inria.fr                               tous les niveaux d’un essai clinique,
                                                                                                 et plus généralement dans l’aide au
 domaines d’applications                  PartenaireS académiqueS                              diagnostic et à la prédiction.            domaine d’applications
• Neuroimagerie cognitive                                                                                                                 • Imagerie médicale
(maladies cérébro-vasculaires)                                                                    Aspect innovant
• Comparaison de population                                                                      La localisation et la mesure              Language
                                                                                                 du volume d’une lésion sont              C++
 Language                                                                                       automatiquement récupérées
Python                                                                                           pour plusieurs pathologies, tel que       Licence
                                         INRIA Déploiement identité           61269
                                                                                                 les AVC chroniques, les traumas          Propriétaire
                                                 INRIA CORPO CMJN

 Licence                                                                                        crâniens, les SEP et les tumeurs.
                                                         DRAGON                           100%

                                          C0                   C0
                                          M20                  M100
                                          J90                  J90    -   -           -

                                                                                                                                           Contact
                                          N0                   N0

                                                               -      -   -           -

Cecill                                                                                           Une solution cloud permettra
                                          -                    -      -   -           -

                                                   R1-30/03/11

                                                                                                 aux utilisateurs de maximiser            contact@pixyl.io
                                                                                                 leur productivité et d’intégrer
                                                                                                 facilement les outils de Pixyl dans       Partenaires académiques
                                                                                                 leur propre workflow.

Mots-clés                                                                                        Mots-clés
[Statistique Bayésienne] [Modèles spatiaux]                                                      [MRI] [Segmentation] [Multi-Séquence] [Biomarqueurs]
[Fonction de réponse hémodynamique (FRH)]
                                                                                                                                                             INRIA Déploiement identité           61269
                                                                                                                                                                     INRIA CORPO CMJN

                                                                                                                                                                             DRAGON                           100%

                                                                                                                                                              C0                   C0
                                                                                                                                                              M20                  M100
                                                                                                                                                              J90                  J90    -   -           -
                                                                                                                                                              N0                   N0

                                                                                                                                                                                   -      -   -           -

                                                                                                                                                              -                    -      -   -           -

                                                                                                                                                                       R1-30/03/11

                                                                                                                                                                                                                     13
PROMETEE                                                                           Scikit-learn
       http://prometee.telecomnancy.eu                                                    http://scikit-learn.org

     PROMETEE (PeRceptiOn utilisateur             domaines d’applications              Librairie offrant les fonctionnalités
     pour les usages du MultimEdia               • Imagerie médicale                    état de l’art pour l’apprentissage
     dans les applicaTions mEdicalEs)            • Télésanté                            statistique en Python : modèles
     est un Living lab à destination des         • Télémédecine                         linéaires généralisés et régularisés,
     professionnels du monde médical.            • Téléchirurgie                        apprentissage non-supervisé,
     Il permet la conception et la mise          • Pré/post-traitements d’images        clustering apprentissage de
     en œuvre de tests subjectifs en             médicales                              covariance, méthodes d’ensemble,
     lien avec les usages d’images                                                      sélection de modèle, validation
     ou de vidéos dans le domaine                 Contact                              croisée.
     TIC et santé, en proposant un               jean-marie.moureaux@univ-lorraine.fr
     environnement normalisé (ITU                                                        Aspect innovant
     BT 500). Ces tests permettent                Partenaires académiques              Principal logiciel d’apprentissage
     de vérifier que la « qualité » des                                                 statistique en Python, avec une
     images/vidéos est compatible avec                                                  efficacité état de l’art et une
     les usages concernés comme par                                                     documentation de qualité
     exemple le diagnostic, la chirurgie
     endoscopique, ou encore la                                                          domaines d’applications
     mesure de volumes tumoraux…                                                        • Classification des textes et des
                                                                                        images.
      Aspect innovant                                                                  • Utilisé par Microsoft, Criteo,
     Notre expertise en matière de tests                                                Nuxeo, Tinyclues
     subjectifs nous permet de fournir
     des résultats d’évaluation de                                                       Languages                                    Contact
     performances d’outils logiciels ou                                                 Python/C                                      bertrand.thirion@inria.fr
     de matériels dédiés à des images/
     vidéos à caractère médical.                                                         Licence                                      PartenaireS académiqueS
                                                                                        BSD                                           Télécom SudParis, Université
                                                                                                                                      Louvain, Université Washington,
                                                                                                                                      Inria
     Mots-clés                                                                          Mots-clés
     [Qualité image/vidéo] [Imagerie médicale][Télésanté] [Télémédecine] [Tests         [Apprentissage statistique] [Optimisation] [Classification]
     subjectifs][Impact de pré/post-traitements]

14
SHAring NeurOImaging
   SegmentIt                                                                                         Resources
                                                                                                     http://shanoir.org

Logiciel de traitement et d’analyse                                                               Solution logicielle pour archiver,
d’images numériques médicales                                                                     structurer, gérer, visualiser
anatomiques et fonctionnelles :                                                                   et partager des données de
segmentation (par modèle                                                                          neuroimagerie. Adaptée aux projets
déformable), filtrage, recalage.                                                                  multicentriques, Shanoir est fournie
Estimation de la vascularisation et                                                               avec de nombreuses fonctionnalités
de la fonction rénale (En cours).                                                                 dédiées à la gestion de données
                                                                                                  et apporte une structuration
 Aspects innovants                                                                               appropriée des données avec une
• Outil de traitement d’images                                                                    accessibilité améliorée.
3D pour l’imagerie médicale
permettant une segmentation                                                                        Aspects innovants
automatique et semi-automatique.                                                                  • Garantit l’intégrité des données, les    Languages
• Outil novateur pour l’analyse de                                                                structure et gère leur provenance         J2EE (Jboss Seam), SQL
la vascularisation et la perfusion                                                                • Facilite la collaboration et le
des tissus (En cours).                                                                            partage des moyens d’acquisition           Licence & brevets
                                                                                                  en particulier pour les études            QPL 1.0
 domaines d’applications                  Licence                                               multicentriques                           Brevets délivrés US, EP
• Médecine, imagerie médicale :           Propriétaire                                            • Communique avec des logiciels           Demandes de brevets en
oncologie (mesure de la croissance                                                                externes (ex : medInria)                  examen EP
des tumeurs), néphrologie (étude           Contact                                                                                          Contacts
de la vascularisation ou de la            benjamin.taton@math.u-bordeaux1.fr                       domaines d’applications                 shanoir-contact@lists.gforge.inria.fr
fonction rénale)                                                                                  • Plateforme de recherche en              christian.barillot@inria.fr
                                           PartenaireS académiqueS                               imagerie et neuroinformatique
 Languages                                                                                       Neurinfo (Rennes, depuis 2009)             PartenaireS académiqueS
• C++ (30000)                                                                                     • Projet national OFSEP (Sclérose
• C++11                                                                                           en Plaque, depuis 2011)
• Unix                                                                                            • Projet national FLI (France Life
                                                                                                  Imaging, depuis 2014)

Mots-clés [Traitement du signal] [ Traitement d’images] [Santé] [Imagerie                         Mots-clés
médicale] [Segmentation d’images] [ Recalage d’images 2D et 3D multi-modales]
                                          INRIA Déploiement identité
                                                  INRIA CORPO CMJN
                                                                               61269
                                                                                                  [Neuroimagerie] [Base de données] [Partage de données] [Neuroinformatique]
[3D, Analyse d’images]                                                                            [Plateforme] [Application web]
                                                          DRAGON                           100%

                                           C0                   C0
                                           M20                  M100
                                           J90                  J90    -   -           -
                                           N0                   N0

                                                                -      -   -           -

                                           -                    -      -   -           -

                                                                                                                                                     INRIA Déploiement identité           61269

                                                    R1-30/03/11                                                                                              INRIA CORPO CMJN

                                                                                                                                                                     DRAGON                           100%

                                                                                                                                                      C0                   C0
                                                                                                                                                      M20                  M100
                                                                                                                                                      J90                  J90    -   -           -
                                                                                                                                                      N0                   N0

                                                                                                                                                                           -      -   -           -

                                                                                                                                                      -                    -      -   -           -

                                                                                                                                                                                                             15
                                                                                                                                                               R1-30/03/11
ShanoirUploader                                                                                         SOFA
        http://shanoir.org                                                                                      http://www.sofa-framework.org

  ShanoirUploader est une application                                                                        SOFA est une plateforme de
  bureau Java qui transfère des                                                                              recherche et développement
  données DICOM en toute sécurité                                                                            dédiée aux simulations physiques
  entre un PACS (Picture archiving                                                                           interactives, et en particulier à la
  and communication system) et                                                                               simulation médicale.
  une instance de serveur Shanoir.
  Les principaux objectifs de cette                                                                           Aspects innovants
  application sont de permettre les                                                                          • SOFA présente des modèles
  transferts de données en masse                                                                             physiques variés (mécaniques,
  entre différentes instances de serveur                                                                     thermique, électrique)
  distant et donc de réduire le temps                                                                        • SOFA regroupe des algorithmes
  d’attente des utilisateurs lors de                                                                         et des méthodes numériques
  l’import de données vers Shanoir.         • Projet national OFSEP (depuis 2011)                            visant des calculs temps-réels
                                            • Projet national FLI (depuis 2014)                              • SOFA est un logiciel modulaire
   Aspects innovants                                                                                        facilitant significativement le
  •Télécharger les données stockées          Language                                                       developpement de prototype
  sur un PACS, accessible via le            Java
  réseau local                                                                                                domaines d’applications                    Licence
                                             Licence
  • Anonymisation locale                                                                                     • Apprentissage et planification            Open Source avec certains
                                            QPL 1.0
  • Envoyez des données DICOM sur                                                                            d’interventions médicales                   modules propriétaires
  un serveur Shanoir                         Contacts                                                       • Simulation multi-physique
  • Utilisation asynchrone                  shanoir-contact@lists.gforge.inria.fr                            • Animation                                  Contact
                                            christian.barillot@inria.fr                                                                                  arnaud.laprevote@inria.fr
   domaines d’applications                                                                                   Languages
  • Toutes les entités utilisant une         PartenaireS académiqueS                                        • C++                                        PartenaireS académiqueS
  plateforme Shanoir                                                                                         • Cross-platform: Win, MacOS,
  • Plateforme de recherche en                                                                               Linux
  imagerie et neuroinformatique
  Neurinfo (depuis 2009)

  Mots-clés                                                                                                  Mots-clés                                                           INRIA Déploiement identité
                                                                                                                                                                                         INRIA CORPO CMJN
                                                                                                                                                                                                                      61269

  [Neuroimagerie] [Base de données] [Partage de données] [Neuroinformatique]                                 [Simulation multi-physique] [Temps-réel] [Applications médicales]
                                                                                                                                                                                                 DRAGON                           100%

                                                                                                                                                                                  C0                   C0
                                                                                                                                                                                  M20                  M100
                                                                                                                                                                                  J90                  J90    -   -           -
                                                                                                                                                                                  N0                   N0

                                                                                                                                                                                                       -      -   -           -

  [PACS] [Shanoir]
                                                                                                                                                                                  -                    -      -   -           -

                                                                                                                                                                                           R1-30/03/11

                                                     INRIA Déploiement identité           61269
                                                             INRIA CORPO CMJN

                                                                     DRAGON                           100%

                                                      C0                   C0
                                                      M20                  M100
                                                      J90                  J90    -   -           -
                                                      N0                   N0

                                                                           -      -   -           -

                                                      -                    -      -   -           -

16 16
                                                               R1-30/03/11
Technologie de mesure du temps de
   Nom
   transit colique
   url                                            Deformet!ca

La quantification du temps de              domaine d’application
transit colique est fréquemment           Gastro-entérologie
utilisée pour identifier l’origine
de symptômes de diarrhée et                BREVET
constipation. La méthode actuelle         Demande de brevet prioritaire
est basée sur l’ingestion de              déposée le 15 mai 2015.
marqueurs radio-opaques sur
plusieurs jours puis observation           Contact
de leur répartition par radio.            bd-3s@idfinnnov.com
Cette méthode nécessite des
équipements couteux, expose                Partenaires académiques
les patients à un rayonnement X
et n’est pas adaptée aux enfants
ou aux femmes enceintes. La
technologie proposée résout ces
problèmes avec des marqueurs
innovants pouvant être observés
sans radio avec un système de
détection léger.

 Aspect innovant
La technologie, en permettant
de s’affranchir de l’usage des
scanners à rayons X s’adapte à
tous les patients et autorise des
examens plus fréquents.

Mots-clés
[Détection de changements] [IRM] [Gliome] [Croissance tumorale]

                                                                          17
www.cvstene.fr/jfr2015
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