Université de Montpellier

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Université de Montpellier
Université de M ont pellier (Campus Triolet)

Réseau Ecologie des Interactions Durables + Réseau Immunologie des Invertébrés

R E I D - I M M U N I N V 2019
                          20 - 23 mai
pr o g r a mme & in f o s

https:/ / reid-immuninv-2019.edu.umontpellier.fr/

     in sc r ipt io n o bl ig at o ir e
pa r t ic ipat io n g r at u it e po u r l es ét u d ia n t s o u d o c t o r a n t s in sc r it s a v a n t l e 12/ 04/ 19
per ma n en t s / po st -d o c t o r a n t s     : 72€ a v a n t / 90€   a pr ès l e 12/ 04/ 19
c l ô t u r e d e s in s c r i p t i o n s   : 06/ 05/ 19
c o n t ac t   ︳r eid -2019@l ist es .ir d .f r
                                                                                                                              réalisation ︳communication ISEM

                  Le comité d’organisation de REID+IM M UNINV-2019 :
           unités BGPI︳CBGP︳CEFE︳DGIMI︳IH PE︳IPM E︳ISEM ︳M IVEGEC
Comité d’organisation

Sponsors :
Université de Monpellier, INRA, Labex Cemeb, Agropolis Fondation, Région Occitanie,
Memmert
Plan d’accès

Localisation du Campus Triolet de l’Université de Montpellier :
https://www.google.com/maps/place/B%C3%A2timent+5+FDS/@43.6326216,3.8615398,18z/data=!
4m8!1m2!2m1!1suniversit%C3%A9+de+montpellier+campus+triolet+batiment+5!3m4!1s0x12b6aed
eee23c881:0x646263ce2c15978b!8m2!3d43.6330504!4d3.8621501

Il est devenu impossible/interdit de rentrer ou se garer sur le campus Triolet en voiture et
particulièrement difficile de se garer aux alentours. Il vaut mieux privilégier une arrivée par le tram
(ligne 1, arrêt des Universités Sciences et Lettres). Il existe plusieurs parkings relais le long de cette
ligne avec des solutions ‘TRAM+parkings’ très intéressantes (la journée de parking vient avec un billet
de tram AR (voir http://www.tam-voyages.com/presentation/?rub_code=1&thm_id=8).

Plan d’accès à pied au Campus Triolet, à partir de l’arrêt de tram « Universités Sciences et
Lettres » :

              Bât 4, salle A, Buffet

Bât 5 : amphis 5.03 & 5.04 ; TD
5.17 (pause café)

       Tram Ligne 1, direction
       Mosson
       Stop: Université des
       Sciences et Lettres
REID-IMMUNINV 2019, Université de Montpellier, Campus Triolet
Lundi      REID-IMMUNINV (Amphi 5.03)
20/05/19   14:00 – 15:45   Ecology and evolution:
                           Spatio-temporal dynamics
           16:15 – 17:45   Ecology and evolution:
                           Within-host dynamics and
                           immune responses
Mardi      REID-IMMUNINV (Amphi 5.03)
21/05/19    9:15 – 10:30   Immuno-ecology and
                           evolution
           11:00 – 12:30   Applications
           14:15 – 16:45   The microbiome
                           perspective
           18:30 – 20:30   Buffet & session poster
Mercredi   REID / IMMUNINV (Amphi 5.03)               TMT (Amphi 5.04)
22/05/19    9:15 – 11:30    Spécial IMMUNINV           9:30 – 14:40 Epidémiologie et
           11:30 – 12:30    Spécial REID                            surveillance
                                                      14:40 – 18:00 Ecologie, Microbiote &        CLONALITÉ (Salle 4.A)
                                                                    Symbiose, Discussion          14:00 – 17:00
                                                                    générale
Jeudi                                                 TMT (Amphi 5.04)
23/05/19                                              9:30 – 12:00    Mécanisme Moléculaire,
                                                                      Compétence Vectorielle et
                                                                      Lutte
                                                      14:00 – 15:40   Tiques & Société
Programme REID-IMMUNINV 2019, Université de Montpellier,
Campus Triolet
Lundi 20/05/19
REID-IMMUNINV: Ecology and evolution: Spatio-temporal dynamics (Amphi 5.03)
14:00   Elisabeth FOURNIER: Influence de la biodiversité cultivée sur l’évolution des populations d’agents
        pathogènes : le cas de l’interaction riz / pyriculariose dans l’agrosystème traditionnel des terrasses du
        YuanYang
14:15   Antoine PERRIN: Perte versus Fragmentation de l’habitat, quelle réponse des parasites ?
14:30   Nathalie ZEBALLOS: Conséquences éco-évolutives de compromis de traits d'histoire de vie dans des
        systèmes hôtes- parasites spatialement structurés
14:45   Julie ISAIA: Les sources d’hétérogénéité d’infection chez les vecteurs de la malaria aviaire
15:00   Giacomo ZILIO: Spatial selection and experimental evolution of parasite dispersal strategies
15:15   Louise NOERGAARD: Infection in patchy populations : partitioning pathogen invasion success and
        dispersal under different phases of host colonisation
15:30   Romain PIGEAULT: Dynamique de distribution spatiale et temporelle de Plasmodium au sein de l’hôte
        vertébré : impact sur la transmission
15:45   Pause café (salle TD 5.17)
Ecology and evolution: Within-host dynamics and immune responses (Amphi 5.03)
16:15   Samuel ALIZON: Within-host ecological dynamics of HPV in genital infections : the PAPCLEAR study
16:30   Cybèle PRIGOT-MAURICE: I will fight better once I meet you twice : on the trail of immune priming
        against Salmonella in the common woodlouse
16:45   Benjamin GOURBAL: Innate immune memory, a new paradigm in vertebrate immunity: molecular bases
        beyond phenotypes in the vector snail Biomphalaria glabrata
17:00   Delphine DESTOUMIEUX-GARZON: L’élimination des hémocytes détermine le succès parasitaire des
        Vibrio pathogènes de l’huitre Crassostrea gigas
17:15   Elisabeth HUGUET: Intégration de bracovirus dans les génomes de lépidoptères hôte et non hôte
17:30   Alexandra CERQUEIRA DE ARAUJO: Etude de l'évolution de domestications virales récentes au sein de
        guëpes parasitoides Campopleginae via des approches fonctionnelles et génomiques
Mardi 21/05/19
REID-IMMUNINV: Immuno-ecology and evolution (Amphi 5.03)
09:15   Guillaume MITTA: Cracking the code of the Pacific oyster mortality syndrome
09:30   Nicolas NEGRE: Réponse immunitaire de Spodoptera frugiperda (Lepidoptera: Noctuidae) à l'infection
        par différents organismes entomopathogènes
09:45   Louise HUOT: Dissecting the immune response of a lepidopteran pest to
        an entomopathogenic nematobacterial complex
10:00   Mariana GALAVAO FERRARINI: Development of a Dual-RNAseq strategy to unravel the molecular bases
        of host-symbiont interactions
10:15   François LALLIER: Le rôle de l’immunité et de l’apoptose dans la régulation de la symbiose entre la
        moule Bathymodiolus azoricus et ses endosymbiotes chimiosynthétiques
10:30   Pause café (salle TD 5.17)
Applications (Amphi 5.03)
11:00   Aurélie PERRIN: Les densovirus : le renouveau d’un agent de lutte biologique contre les Aedes urbains
        vecteurs d’arboviroses
11:15   Louis GOUAGNA: Beyond mating competitiveness: Behavioural and physiological determinants of
        sterile male fitness in support of SIT against Aedes albopictus
11:30   Jordan VACHERON: Invasion et mise à mort d’un insecte nuisible par Pseudomonas protegens CHA0
11:45   Edwige GUISSOU: Déterminants génétiques de la période d’incubation extrinsèque de Plasmodium
        falciparum chez les anophèles vecteurs
12:00   Angélique BESSON-BARD: Analysis of the cross‐regulation between immunity, growth and iron
        homeostasis in plants
12:15   Manon VILLA: Résistance aux antipaludiques et transmission
12:30   Buffet
The microbiome perspective (Amphi 5.03)
14:15   Florian BINETRUY: Co-diversification history of ticks and their microbiome
14:30   Camille HUOT: Microbiota structure and dynamics in planorbid snails, vector of the human parasites
        Schistosoma spp
14:45   Bessem CHOUAIA: Developmental stages and gut microenvironments influence gut microbiota
        dynamics in the invasive beetle Popillia japonica Newman (Coleoptera: Scarabaeidae)
15:00   Simon FELLOUS: Microbial warfare between competing Drosophila species hints for evolution-proof
        crop protection
15:15   Natacha KREMER: Impact of polymicrobial interactions on Drosophila physiology
15:30   Pause café (salle TD 5.17)
16:00   Manon FALLET: Transgenerational response to early microbial exposure in the oyster Crassostrea gigas
        and positive impact on survival capacities to juvenile mortality syndrome
16:15   Alexis BENARD: Rapid evolution of symbiotic association in response to stress
16:30   Robin GUILHOT: How to disentangle symbiont effects on host resource acquisition and plasticity and
        why it matters for their evolution
16:45   Photo Participants REID-IMMUNINV ; Discussion : Future REID, IMMUNINV 2020

18:30 Buffet & session poster
        Annia ALBA: Pseudosuccinea columella – Fasciola hepatica interaction: on the mechanistic and immunobiological
        bases of the snail host resistance/susceptibility to its parasitic trematode
        Sylvain Benhamou: Influence of bacterial symbionts on host niche and ecological diversification: a metabolic
        approach in whitefly model
        Lucas Bonometti: Local patterns of virulence and resistance in wild host-pathogen populations.
        Magali Eychenne: Production de mutants perte de fonction chez la noctuelle ravageur de culture, Spodoptera
        frugiperda grâce à CRISPR/Cas9.
        Elisabeth Fournier: Le projet ANR GANDALF (2013-2017) : un projet fédérateur pour le groupe « Champignons » du
        REID
Benjamin Herran: Impact of the Wolbachia endosymbiont on the AGH pathway in Armadillidium vulgare
Damien Lassalle: Diversity of beta pore forming toxin family members in the interaction between the snail
Biomphalaria glabrata and the trematode parasite Schistosoma mansoni
Clémentine Leroy: Snail-Trematodes interactions: how seasonal dynamics of parasite transmission are affected by
water management in a complex wetland network?
Lourdes Mateos-Hernández: Anti-α-Gal antibodies in dogs: Potential role in red meat allergy and protection
against tick-borne pathogens
Noureddine Mechouk: Summer Abundance of Ixodes ricinus infesting lizards in Ain Kerma (El Tarf), Northeast
Algeria
Noureddine Mechouk: Molecular evidence of bacteria in Melophagus ovinus sheep keds and Hippobosca equina
forest flies collected from sheep and horses in northeastern Algeria.
Daniel Oyanedel-Trigo: Multifaceted adaptations of vibrios to their molluscan host, the oyster Crassostreae gigas.
Jordan Rossi: Analysis of the role of nitric oxide (NO) in the cross‐regulation between immunity, growth and iron
homeostasis in plants
Marion Varoqui: Conséquences de l’échelle de la compétition sur le maintien de diversité : Evolution
expérimentale du parasite Tetranychus urticae sous hard versus soft selection
Carole VINCENT-MONEGAT: 4IN: an Interactive database for Insect Innate Immunity
Mercredi 22/05/19
Sessions parallèles
spécial IMMUNINV (Amphi 5.03)
09:30   Isabelle DARBOUX: Les longs ARNs non codant : de nouveaux régulateurs de l’immunité chez les
        lépidoptères ?
09:45   Armel GALLET: The DH31/CGRP enteroendocrine peptide triggers intestinal contractions favoring the
        elimination of opportunistic bacteria
10:00   Camille HOUDELET: The MALDI-BeeTyping, an innovative method to monitor the impact of a gut
        pathogen on bee health
10:15   Maxime LEPRETRE: Proteomic characterization of the zebra mussel immune system by proteogenomics
        and comparative proteomics in hemocytes and plasma
10:30   Pause café (salle TD 5.17)
11:00   Julien ORLANS: PGRP-LB, acteur majeur du maintien et du contrôle de l’endosymbiose chez le charançon
        des céréales
11:15   Christine PAILLARD: Transcriptomic analysis of clam Extra Pallial Fluids reveals immunity and
        cytoskeleton alterations in the first week of Brown Ring Disease development
spécial REID (Amphi 5.03)
11:30   Florian CHARRIAT: Analyse guidée par la structure de l'évolution des effecteurs dans les lignées de
        Pyricularia oryzae infectant les céréales
11:45   Pilar ALDA: Distribution, history and phylogenetic relationships of Galba species, a group of cryptic and
        world-wide freshwater snails
12:00   Antonio VASQUEZ: Who is responsible for fasciolosis transmission in the West Indies? A snail given
        response
12:15   Elisabeth HERNIOU: Prevalence and diversity of ssRNA+ honey bee-infecting viruses in wild
        hymenoptera
12:30   Buffet

Réunions groupes
CLONALITÉ : hétérogénéité phénotypique (salle 4.A)
14:00   Alain GIVAUDAN: Présentation du groupe de réflexions : hétérogénéité clonale (variation phénotypique)
        chez les procaryotes
14:15   François DELAVAT: Development of genetic tools to study the phenotypic heterogeneity within a Vibrio
        harveyi strain pathogen of molluscs
14:45   Leyla SLAMTI: The stationnary phase regulator CpcR controls cell differenciation and cry gene expression
        in Bacillus thuringiensis
15:15   Alice GUIDOT: Spontaneous mutations in a regulatory gene induce phenotypic heterogeneity and
        adaptation of Ralstonia solanacearum to changing environments
15:40   Pause café (salle TD 5.17)
16:00   Amaury PAYELLEVILLE: Whole genome DNA methylation (Methylome), transcriptomic and phenotypic
        analysis revealed involvement of Dam DNA methyltransferase in gene regulation in Photorhabdus
        luminescens
16:30   Julien BRILLARD: DNA methylation and the Redox regulator OxyR: an epigenetic story in the
        entomopathogenic bacterium Xenorhabdus?
16:45   Discussion générale / conclusion
17:00   Clôture de la journée
TIQUES et MALADIES des TIQUES (TMT)
Epidémiologie & Surveillance (Amphi 5.04)
09:30   Olivier PLANTARD: Ixodes frontalis, une espèce de tique fréquente et facile à collecter au drap ou au
        drapeau quand on sait où la chercher !
09:50   Maggy JOUGLIN: Première détection et identification moléculaire de l'espèce zoonotique Anaplasma
        capra sur Cervidés captifs en France
10:10   Laurence MALANDRIN: Collecte et identification des tiques dans une Réserve zoologique
10:30   Pause café (salle TD 5.17)
11:00   Valentin OLLIVIER: Le chevreuil sentinelle du risque de la contamination humaine par les maladies à
        tiques ?
11:20   Karine CHALVET-MONFRAY: Bilan de 5 ans de suivi mensuel d’un réseau d’observatoires d’Ixodes ricinus
11:40   Raphaël ROUSSEAU: Identification des pâtures à risque pour l’ehrlichiose bovine en Wallonie (Belgique)
12:00   Sébastien GRECH-ANGELINI: Première détection d’anticorps dirigés contre le virus de la fièvre
        hémorragique de Crimée-Congo chez des ruminants corses
12:30   Buffet
14:00   Achille Sougrinoma OOUEDRAOGO: Cross border transhumance, a dissemination way of ticks and tick-
        borne pathogens in West Africa
14:20   Albert AGOULON: Influence de la meteorologie sur la dynamique des populations des stades libres des
        tiques Ixodes ricinus et I. frontalis : Determination des fenetres temporelles optimales par l’approche des
        cross correlation maps
Ecologie, Microbiote et Symbiose (Amphi 5.04)
14:40   Karen MCCOY: Evaluating functional dispersal and its eco-epidemiological implications in a nest
        ectoparasite
15:00   Thomas POLLET: The concept of scale in tick microbial community ecology
15:20   Emilie LEJAL: Microbiote de tique ou microbiote de kit ?
15:40   Pause café (salle TD 5.17)
16:10   Marie BUYSSE: Diversité, répartition, tropisme tissulaire et mode de transmission de Rickettsia lusitaniae
        chez les tiques molles Ornithodoros spp.
16:30   Olivier DURON: Quelle importance de la diversité microbienne chez les tiques?
16:50   Discussion générale TMT
18:00   clôture de la journée
20:00   Restaurant (au frais des participants)
Jeudi 23/05/19
Mécanisme Moléculaire, Compétence Vectorielle et Lutte (Amphi 5.04)
09:30   Rémi PEREIRA DE OLIVEIRA: Etude de la compétence vectorielle des tiques molles du genre
        Ornithodoros pour le virus de la Peste Porcine Africaine en Europe
09:50   Lourdes MATEOS HERNANDEZ: Neuronal Basis of Tick-Pathogen Interactions
10:10   Claude RISPE: Deciphering the synganglion transcriptome of Ixodes ricinus
10:30   Manon LEMASSON: Etude des mécanismes moléculaires de la compétence vectorielle d’Ixodes ricinus
        pour deux flavivirus
10:50   Pause café (salle TD 5.17)
11:20   Camille MIGNE: Variabilité Génétique des virus transmis par les tiques et identification de nouvelles
        cibles pour la lutte antivirale
11:40   Nathalie BOULANGER: Mesure de la compétence vectorielle des tiques par protéomique
12:00   Buffet
Tiques & Société (Amphi 5.04)
14:00   Jonas DURAND: CiTIQUE, les sciences participatives au service de tous
14:20   Julie FIGONI: Surveillance de la Borréliose de Lyme en France entre 2005 et 2017
14:40   Costanza PUPPO: Prévention et prise en charge de la maladie de Lyme : de la complexité et de la
        nécessité d’intégrer divers déterminants psychosociaux
15:00   Magalie RENE-MARTELLET: Intérêt des données de téléphonie mobile et des sciences participatives pour
        l’estimation et la compréhension du risque de transmission de maladies liées à l’environnement :
        Application aux maladies transmises par les tiques
15:20   Laure MATTHEWS-MARTIN: Etude des risques associés aux tiques dans les parcs urbains et périurbains
        en région lyonnaise
15:40   Fin des TMT2019
Résumés pour REID-IMMUNINV, CLONALITÉ, TMT, POSTERS, par ordre alphabétique de
conférencier (souligné)

 REID-IMMUNINV

Within-host ecological dynamics of HPV in genital infections : the PAPCLEAR study
Samuel Alizon & PAPCLEAR team
MIVEGEC, CNRS, IRD, Université de Montpellier
samuel.alizon@cnrs.fr
Human papillomaviruses (HPVs) are among the most oncogenic microbes infecting humans. They are responsible for nearly
all cervical cancers and for a significant fraction of anal, head-and-neck, and other cacners. Most HPV genital infections are
‘acute’, that is non-persistent. Yet, for HPVs, as for many other oncoviruses, there is a striking gap between our detailed
understanding of chronic infections and our limited data on the early stages of infection. The clinical study PAPCLEAR has
started two year ago to follow the whole course of HPV infections in young women. The main data we collect are virus
loads (via qPCR), immune cell counts (via FACS) and cytokine densities (via MSD) in the cervix area, vaginal microbiota and
systemic antibodies. The goal is to combine this longitudinal data to within-host population dynamics models inspired from
ecology in order to infer parameters and even compare models. A better understanding of HPV kinetics in acute infections,
especially the associated immune response, can have important implications in the context of mass vaccination. I will
present early results from the clinical study along with models for HPV ecological and evolutionary dynamics.

Distribution, history and phylogenetic relationships of Galba species, a group of cryptic and world-wide
freshwater snails
Pilar Alda, Manon Lounnas, Antonio Alejandro Vázquez, Patrice David, Philippe Jarne, Jean-Pierre Pointier,
Sylvie Hurtrez-Boussès
MIVEGEC, University of Montpellier, CNRS, IRD, Montpellier, France
pilaralda@gmail.com
Cryptic species are a major problem in systematics, biogeography and disease dynamics—especially if they are invasive or
transmit parasites or pathogens. We studied a group of cryptic freshwater snails that invade almost all continents and
transmit liver flukes to humans and livestock. We aim to clarify the distribution, history and phylogenetic relationships of
Galba species based on a sound approach that included morphology, molecular markers, the widest scale sampling to date
in the Americas and data retrieved from GenBank. Our results indicate that the genus Galba comprises five species. Galba
cousini differs from other species on both shell morphology and internal anatomy (a derived trait), and is also probably the
only outcrossing Galba species and has the most restricted distribution within the group. The other four species—G.
truncatula, G. viator, G. humilis and G. schirazensis—are morphologically similar (cryptic species), but each constitute a
unique phylogenetic clade. These species differ in amount of genetic diversity, geographic distribution and invasiveness.
Our analysis suggests that the genus Galba originated in North America around 5.6 Myr. We also discuss the possibility that
the Galba ancestor switched to more amphibious habitats favoring these species in avoiding competition with other
freshwater snails. Thereafter, selection might have stabilized a phenotype well adapted to these habitats, explaining why
this group remains in a morphological stasis. We finally highlight that identifying Galba species requires molecular markers
and that sampling should be geographically extended, especially in North America, Eurasia and Africa, to clarify their
distribution and interactions.

Rapid evolution of symbiotic association in response to stress
ALEXIS BÉNARD, ANGELO JACQUET, FABRICE VAVRE, NATACHA KREMER
43 bd du 11 novembre 1918, Bât. Grégoire Mendel - 69622 VILLEURBANNE cedex
alexis.benard@univ-lyon1.fr
Animals live in symbiosis with tightly regulated bacterial communities that strongly impact their phenotype. While bacteria
were classically associated with pathogenesis, recent work on microbiota shows that they can also be beneficial. For
instance, the maternally-inherited bacterium Wolbachia is known to interfere with RNA-viruses replication, a property
currently used to reduce the spread of mosquito-vectored viruses. Wolbachia is beneficial in case of viral infection, but its
presence within host cells also induces direct costs. Because virulence and viral protection are density-dependent, a tight
regulation of the Wolbachia density is generally observed within host cells, selecting for an optimal bacterial density. When
a stress occurs, it can impact the host directly, but also indirectly through a modification of its symbiotic community. To
study the evolution of symbiotic associations in response to stress and to determine how they can adapt to new
environments, we performed experimental evolution of flies, infected or not by Wolbachia, under different stress
conditions. The aim of this project is to understand: 1) how stresses influence the physiology of both partners and how the
bacterial population is impacted? 2) what is influence of plasticity and selection in the return or not to the optimal density?
3) what are the mechanisms involved in the responses to stress? We will focus here on the direct impact of oxidative stress
and/or viral stress on various host and bacterial life-history traits. These results pave the way for understanding the
evolutionary and physiological mechanisms that occur in symbiotic interactions in response to stress.

                                                                                                                             1
Analysis of the cross‐regulation between immunity, growth and iron homeostasis in plants
Pauline Trapet, Jordan Rossi, Agnès Klinguer, Laure Avoscan, Sylvie Mazurier, Philippe Lemanceau, David
Wendehenne and Angélique Besson-Bard
UMR 1347 Agroécologie, AgroSup Dijon, CNRS, INRA, Univ. Bourgogne, Univ. Bourgogne Franche-Comté, F-
21000 Dijon, France
angelique.besson-bard@u-bourgogne.fr
The existence of a tightly regulated balance between growth and immunity in plants has recently emerged. In this study,
we challenged this concept thanks to the biological model pyoverdine-Arabidopsis thaliana. Pyoverdine is a siderophore
produced by the plant growth promoting rhizobacteria Pseudomonas fluorescens C7R12. Under iron deficiency, P.
fluorescens excretes the iron free form of pyoverdine (apo‐pyo) in the soil. Once chelated with iron (ferri‐pyo), the complex
is internalized by the bacteria. We demonstrated that Arabidopsis thaliana plants treated by apo‐pyo in a medium
containing or not iron internalize pyoverdine. Interestingly, apo‐pyo-treated plants did not show a typical growth reduction
induced by iron deficiency. Accordingly, the expression of genes related to growth, development and iron uptake/transport
was induced, these latter being involved in the growth improvement induced by apo‐pyo under iron deficiency. In contrast,
a strong down-regulation of the expression of genes related to immunity was observed. Furthermore, the resistance to the
fungal pathogen Botrytis cinerea conferred by iron deficiency was partially impaired following apo‐pyo treatment. The
overexpression of the HBI1 transcription factor, known to be involved in the growth‐immunity tradeoff, was linked to the
above observations. These apo‐pyo effects were not observed after treatment of plants under iron sufficient conditions,
indicating that apo‐pyo effects are dependent on the plant iron status. To conclude, this work draws first elements of
pyoverdine effects on plant physiology. In a larger view, this work supports the recent concept of the existence of a cross‐
regulation between growth, immunity and iron homeostasis in plants.

Co-diversification history of ticks and their microbiome
Florian Binetruy, Marie Buysse, Roxanne Barosi and Olivier Duron
Centre IRD, 911 avenue Agropolis, 34394 Montpellier
florian.binetruy@ird.fr
Macroorganisms are typically colonized by an aggregate of microorganisms that resides within their body. In arthropods,
microorganisms use a large panel of lifestyle strategies to spread and persist within host populations: while some are
pathogens, moving from through infectious (horizontal) transmission, some others, at the opposite of the continuum,
behave as mutualists, undergoing exclusive maternal (vertical) transmission. This web of interactions can structure
complex within-host microbial communities but their composition remains nevertheless highly variable: host species, life
stage, feeding status and a wide array of environmental constraints are known key drivers of their structure. Another
possible driver, albeit rarely investigated, is the phylogenetic relatedness within a clade of host species: related host
species are likely to share similar physiology/ecology and may thus harbour similar microbial communities. Here we
examined this issue through the characterization of the core microbial communities hosted by tick species of genus
Amblyomma from South America and Africa. To this aim, the phylogeny of Amblyomma was first determined through a
nuclear DNA segment encompassing 18S-28S genes and the associated microbial communities were further characterized
through 16S rRNA MiSeq barcoding. Analysis of these dataset will offer excellent opportunities to tackle questions about
the impact of host phylogenetic barriers on structuring microbial communities.

Etude de l’évolution de domestications virales récentes au sein de guêpes parasitoïdes Campopleginae via
des approches fonctionnelles et génomiques
Cerqueira de Araujo, Alexandra ; Leobold, Matthieu ; Bézier, Annie ; Drezen, Jean-Michel ; Josse, Thibaut ;
Huguet, Elisabeth
Institut de Recherche sur la Biologie de l'Insecte - UMR 7261, Université François-Rabelais Tours, UFR Sciences
et Techniques, Avenue Monge, Parc de Grandmont, 37200 Tours, France
alexandra.cerqueiradearaujo@etu.univ-tours.fr
Les Nudivirus sont connus pour s’être intégrés dans le génome de centaines d’espèces de guêpes parasitoïdes. Chez les
Braconidae ayant intégré un virus appartenant au genre Betanudivirus, les guêpes utilisent l’intégration virale pour
accomplir leur cycle de vie parasite dans leur hôte lépidoptère en altérant le système immunitaire de celui-ci grâce à des
particules virales, injectées pendant l’oviposition, contenant des cercles d’ADN. Plus récemment, des gènes nudiviraux
appartenant au genre Alphanudivirus ont été endogénéisés dans le génome d’une guêpe ichneumonide, appartenant à la
sous-famille des Campopleginae, nommée Venturia canescens. A la différence de ce qui est retrouvé chez les Braconidae,
Venturia canescens produit des Virus-Like-Particles (VLPs), des particules semblables aux particules virales, qui ne
contiennent pas de cercles d’ADN mais, à la place, contiennent des facteurs de virulence d’origine protéique. Très
récemment, des gènes nudiviraux impliqués dans la formation des VLPs ont été identifiés chez une autre espèce de guêpe
Campopleginae : Campoplex capitator, phylogénétiquement proche de Venturia canescens, offrant ainsi la possibilité
d’utiliser des approches fonctionnelles et génomiques afin de mieux appréhender les mécanismes précoces impliqués dans
la domestication virale et de déterminer si les mêmes trajectoires évolutives ont été empruntées pour aboutir à la
production de VLPs. Il sera présenté ici les approches fonctionnelles (cinétique d’expression et interférence ARN),

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génomiques (séquençage haut débit de longs fragments d’ADN) et moléculaires utilisées dans le but d’étudier l’évolution
de symbioses virales récentes chez les guêpes parasitoïdes Campopleginae.

Analyse guidée par la structure de l'évolution des effecteurs dans les lignées de Pyricularia oryzae infectant
les céréales
Charriat F, Ravel S, Gracy J, Cros-Arteil S, Fournier E, Kroj T, Gladieux P
Campus International de Montferrier-Baillarguet
florian.charriat@inra.fr
Les champignons pathogènes des plantes sécrètent des petites protéines, appelée effecteurs, qui leur permettent de
modifier la physiologie et l’immunité de leur hôte à leur propre avantage. La principale difficulté pour analyser l’évolution
et la fonction des répertoires d’effecteurs est leur extrême richesse et diversité nucléotidique, qui interdisent la définition
de famille multigéniques. Afin de contourner ce verrou méthodologique, nous nous sommes concentré sur une famille
d'effecteurs récemment identifiée, les effecteurs MAX, qui présentent une conservation de structure tridimensionnelle
plutôt que de séquence. Les effecteurs MAX sont présents dans le champignon pathogène des céréales Pyricularia oryzae,
qui représente une menace pour la sécurité alimentaire du fait de sa capacité à s’adapter à de nouveaux hôtes. Notre
objectif était de comprendre comment les changements dans le répertoire et la séquence des effecteurs MAX participe à
l’adaptation de P. oryzae de nouveaux hôtes. Plus de 200 génomes de P. oryzae représentatifs de ses dix principales lignées
hôtes spécifiques ont été assemblés et annotés, et nous avons développé un nouveau pipeline utilisant des données
transcriptomiques et protéiques afin d’améliorer la prédiction des effecteurs MAX. Des analyses d’orthologie et les
annotations fonctionnelles révèlent une variation importante de la composition du répertoire d’effecteurs MAX au sein et
entre les lignées, ainsi que de fréquentes insertions d’éléments transposables, relativement au reste de l’effectome ou du
génome. Nos résultats permettent aussi d’identifier des événements de perte ou de gain d’effecteurs potentiellement
impliqués dans les changements d’hôtes, qui font l’objet d’une validation expérimentale.

Developmental stages and gut microenvironments influence gut microbiota dynamics in the invasive beetle
Popillia japonica Newman (Coleoptera: Scarabaeidae)
Bessem Chouaia, Giuseppe Mazza, Sumer Alali, Matteo Callegari, Elena Crotti, Daniele Daffonchio, Alberto
Alma, Francesco Paoli, Pio Federico Roversi, Leonardo Marianelli, Matteo Montagna
Department of Molecular Sciences and Nanosystems, Ca' Foscari University of Venice, Via Torino, 155. 30172,
Venice
bessem.chouaia@unive.it
Popillia japonica Newman (Coleoptera: Scarabaeidae) is a highly polyphagous invasive beetle originating from Japan. This
insect is highly resilient and able to rapidly adapt to new vegetation. Insect-associated microorganisms can play important
roles in insect physiology, helping their hosts to adapt to changing conditions and potentially contributing to an insect’s
invasive potential. Such symbiotic bacteria can be part of a core microbiota that is stably transmitted throughout the host’s
life cycle or selectively recruited from the environment at each developmental stage. The aim of this study was to
investigate the origin, stability and turnover of the bacterial communities associated with an invasive population of P.
japonica from Italy. Our results demonstrate that soil microbes represent an important source of gut bacteria for P.
japonica larvae, but as the insect develops, its gut microbiota richness and diversity decreased substantially, paralleled by
changes in community composition. Notably, only 16.75% of the soil bacteria present in larvae are maintained until the
adult stage. We further identified the micro-environments of different gut sections as an important factor shaping
microbiota composition in this species, likely due to differences in pH, oxygen availability and redox potential. In addition,
P. japonica also harbored a stable bacterial community across all developmental stages, consisting of taxa well-known for
the degradation of plant material, namely the families Ruminococcacae, Christensenellaceae and Lachnospiraceae.
Interestingly, the family Christensenallaceae had so far been observed exclusively in humans. However, the
Christensenellaceae OTUs found in P. japonica belong to different taxonomic clades within this family.

Les longs ARNs non codant : de nouveaux régulateurs de l’immunité chez les lépidoptères ?
Fabrice Legeai, Stéphanie Robin, Véronique Jouan, Cécile Clouet, Mylène Ogliastro et Isabelle Darboux
UMR 1333 INRA - Université de Montpellier, Diversité, Génomes & Interactions Microorganismes-Insectes
(DGIMI), 34095 Montpellier Cedex 5 - FRANCE
isabelle.darboux@inra.fr
Les longs ARN non codants (lncRNAs) sont considérés comme une nouvelle catégorie de facteurs régulateurs de
l’expression génique, impliqués dans de nombreux processus biologiques cruciaux. Ces molécules sont définies comme des
ARNs d’une taille supérieure à 200 nucléotides, dépourvus de la capacité à coder pour des protéines, et caractérisés par
une haute spécificité cellulaire d’expression. Ils sont en outre peu conservés entre espèces. Si les lncRNAs de mammifères
font l’objet de recherches approfondies du fait de leur implication dans de nombreuses pathologies humaines, leur
importance potentielle dans les interactions insectes-pathogènes reste encore très peu abordée. Nous avons développé
une approche de séquençage à haut débit pour identifier le répertoire de lncRNAs différentiellement exprimés (DE) lors
d’une infection virale des chenilles de la légionnaire d’automne, Spodoptera frugiperda. Nous avons évalué l’influence de

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deux paramètres sur le l’expression des lncRNAs : la spécificité tissulaire (hémocytes vs corps gras) et la spécificité de la
réponse à un type de virus (polydnavirus vs densovirus). Nous avons ainsi identifiés 4273 transcrits non codant,
correspondant à 3186 loci, exprimés dans les hémocytes et corps gras. Nous avons également montré que les 2
pathogènes viraux induisent la régulation de plusieurs lncRNAs dont certains sont spécifiques d’un seul virus et/ou d’un
seul tissu. Ces résultats suggèrent que les lncRNAs pourraient représenter des régulateurs essentiels de l’infection virale
chez S. frugiperda.

L’élimination des hémocytes détermine le succès parasitaire des Vibrio pathogènes de l’huitre Crassostrea
gigas.
Tristan Rubio, Daniel Oyanedel-Trigo, Yannick Labreuche, Eve Toulza, Xing Luo, Maxime Bruto, Cristian
Chaparro, Marta Torres Bejar, Julien de Lorgeril, Philippe Haffner, Jeremie Vidal-Dupiol, Arnaud Lagorce, Bruno
Petton, Guillaume Mitta, Annick Jacq, Frédérique Le Roux, Guillaume Charrière et Delphine Destoumieux-
Garzón
IHPE UMR5244 Université de Montpellier, CNRS, Ifremer, Université de Perpignan Via Domitia. Place Eugène
Bataillon cc80, 34090 Montpellier cedex 5
ddestoum@ifremer.fr
Les espèces de Vibrio ont établi des relations allant du mutualisme au parasitisme avec les mollusques. A ce jour, les
facteurs hôtes et pathogènes qui déterminent l'issue des infections à Vibrio restent mal compris. Nous avons étudié ces
mécanismes chez l’huitre Crassostrea gigas en utilisant deux espèces de Vibrio pathogènes. Nous observons que les
hémocytes de l'huitre contrôlent efficacement l’infection par les souches non pathogènes dans l’hémolymphe. A l’inverse,
toutes les souches pathogènes échappent à ce contrôle grâce à leurs propriétés cytotoxiques envers les hémocytes. En
analysant les réponses transcriptionnelles de l'hôte et des bactéries lors d’infections expérimentales, nous avons identifié
des mécanismes de lyse des hémocytes distincts chez Vibrio crassostreae et V. tasmaniensis. Dans les infections à V.
crassostreae, la cytotoxicité dépend du contact direct avec les cellules immunitaires et nécessite un gène ancestral codant
pour une protéine de fonction inconnue, R5-7. En revanche, chez V. tasmaniensis, qui a perdu ce gène ancestral, la
cytotoxicité est dépendante de la phagocytose et nécessite un système de sécrétion de type 6 (T6SS) et la sécrétion
intracellulaire d’effecteurs. Ces mécanismes de cytotoxicité sont nécessaires à la virulence. Ainsi, l'issue des infections
dépend de déterminants moléculaires propres à chaque espèce de Vibrio pathogène mais qui convergent pour éliminer les
hémocytes, permettant ainsi l'échappement aux défenses cellulaires de leur hôte.

Transgenerational response to early microbial exposure in the oyster Crassostrea gigas and positive impact
on survival capacities to juvenile mortality syndrome.
Manon Fallet1, Bruno Petton2, Julien de Lorgeril3, Sébastien Comarmond1, Cristian Chaparro1, Eve Toulza1,
Jean-Michel Escoubas3, Yannick Gueguen3, Guillaume Mitta1, Jérémie Vidal-Dupiol3, Christoph Grunau1,
Caroline Montagnani3, Céline Cosseau1
1 IHPE, Univ. Montpellier, CNRS, Ifremer, Univ. Perpignan Via Domitia, Perpignan France
2 IFREMER, UBO CNRS IRD, LEMAR UMR 6539, Argenton, France
3 IHPE, Univ. Montpellier, CNRS, Ifremer, Univ. Perpignan Via Domitia, Montpellier France

manon.fallet@gmail.com
Since 2008, Crassostrea gigas juvenile oysters are subjected to drastic episodes of mortalities due to the «Pacific Oyster
Mortality Syndrome» (POMS) a disease primary triggered by a viral infection (Ostreid herpes virus 1 µVar) which induces
immunosuppression in the host and leads to the colonization of the oyster tissues by consortium of opportunistic and/or
pathogenic bacteria. In order to generate oysters with improved survival capacities when faced to the disease, we
stimulated them during their larval development with an environmental microflora. For this purpose, we exposed larvae
during their first 10 days of life to an environmental seawater microflora. Three months later, we challenged the juvenile
oysters with an experimental model of pathogenesis (contact with naturally infected oysters during a period of disease)
and monitored their mortalities. We found that oysters previously exposed to non-infectious microflora have better
survival rates than controls. Moreover, offspring (F1) of exposed oysters (F0) also displays a better survival which is also
true for the next generation (F2). To decipher mechanisms beyond survival improvement we performed RNA-sequencing,
16S barcoding, genetic and epigenetic analyses. RNA-seq and barcoding analyses in offspring of exposed oysters (F1)
revealed the impact of the treatment on oyster microbiota on the immune response. These results echo recent advances
on host-microbiota relationships showing that early interactions with the host immune system can shape beneficial host-
microbiota relationships contributing to the host health status. Ongoing analyses of genetic and epigenetic data will allow
us to further explore their respective contribution to the observed heritable phenotype.

Microbial warfare between competing Drosophila species hints for evolution-proof crop protection
Antoine Rombaut, Anne Xuéreb, Robin Guilhot, Kenza Qitout, Romain Gallet, Patricia Gibert and Simon Fellous
CBGP - INRA Montpellier
simon.fellous@inra.fr

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Despite the importance of deciphering the mechanisms of niche separation between species, the influence of symbiotic
microbes in competition remains seldom studied. Microbe-mediated niche partitioning may be particularly important in
fruit-flies, such as the agricultural pest Drosophila suzukii, which larvae rely on exo-symbiotic microbes for fruit
consumption. We discovered that ovipositing D. suzukii females avoid fruits previously exposed to the ubiquitous species
D. melanogaster. Using axenic strains, we further unveilled that microbes carried by D. melanogaster are responsible for
this repellency that appears mediated by short-scale taste perception. Comparison among D. suzukii populations indicates
the behavior is present in populations from both the native and invasive ranges but depends on its microbiota. It further
points to core bacterial symbionts of D. melanogaster as causative agents of the repellency. We mimicked natural
oviposition by the two species in fresh berries: mortality of D. suzukii larvae increased in the simultaneous presence of
both larvae and symbionts of D. melanogaster, which explains D. suzukii behavior in evolutionary terms. Our study
highlights how symbiotic microbes may determine interspecific interactions and niche partitioning through niche
construction and behavior. We believe repellents based on the avoidance of costly conditions frequently experienced by
target insects may be evolution-proof. Indeed, insects that would become resistant to the repellent would pay an
ecological cost in non-protected sites where they would dismiss repellency signals and be exposed to harmful conditions.

Influence de la biodiversité cultivée sur l’évolution des populations d’agents pathogènes : le cas de
l’interaction riz / pyriculariose dans l’agrosystème traditionnel des terrasses du YuanYang
E. Fournier, S. Ali, H. Adreit, S. Cros-Arteil, P. Gladieux, B. Jin, I. Meusnier, J. Milazzo, S. Ravel, D. Tharreau, H.
Huang, J-B. Morel
UMR BGPI Inra-CIRAD-Montpellier SupAgro, TA A 54/K, Campus International de Baillarguet, F34398
Montpellier cedex 5
elisabeth.fournier@inra.fr
Dans les agrosystèmes modernes, l’utilisation d’un petit nombre de variétés dans des paysages homogènes favorise
l’émergence de génotypes d’agents pathogènes virulents contournant les résistances des plantes et causant des dégâts
importants. La diversification des paysages variétaux représente un levier pour contraindre l’évolution des agents
pathogènes. Pour mieux comprendre l’influence de la biodiversité cultivée sur la structure et l’évolution des populations
pathogènes, nous étudions un agrosystème rizicole traditionnel du Sud de la Chine : les terrasses du YuanYang. Dans ce
système où de très nombreuses variétés de riz (majoritairement de type indica, avec quelques variétés japonica) sont
cultivées conjointement depuis des siècles, aucune crise sanitaire majeure n’a été rapportée. Nous avons d’abord confirmé
la très forte diversité génétique des riz dans la zone, générant un paysage variétal très hétérogène pour les populations
pathogènes. En prenant l’exemple de l’interaction du riz avec le champignon Pyricularia oryzae (agent de la pyriculariose),
nous avons ensuite montré que la culture en sympatrie de riz indica et japonica, dont les systèmes immunitaires sont très
contrastés, entraîne une adaptation locale des populations de P. oryzae, conduisant à une protection réciproque de ces
deux types de riz. Nous avons aussi montré qu’au sein des riz indica, la très forte diversité intra- et inter-variétale
sélectionne des génotypes de P. oryzae généralistes et possiblement maladaptés. Enfin, l’introduction récente dans la zone
d’une variété moderne à base génétique réduite provoque localement des baisses importantes de diversité cultivée, dont
nous avons mesuré les conséquences sur la structure des populations de P. oryzae.

The DH31/CGRP enteroendocrine peptide triggers intestinal contractions favoring the elimination of
opportunistic bacteria
Olivia Benguettat, Rouba Jneid, Julie Soltys, Rihab Loudhaief, Alexandra Brun-Barale, Dani Osman, Armel Gallet
Institut Sophia Agrobiotech, UMR CNRS 7254/INRA 1355/UNS; 400 route des Chappes, BP 167; 06903 Sophia
Antipolis Cedex - France
gallet@unice.fr
The digestive tract is the first organ affected by the ingestion of foodborne bacteria. While commensal bacteria become
resident, opportunistic or virulent bacteria are eliminated from the gut by the local innate immune system. Here we
characterize a new mechanism of defense, independent of the immune system, in Drosophila melanogaster. We observed
strong contractions of longitudinal visceral muscle fibers for the first 2 hours following bacterial ingestion. We showed that
these visceral muscle contractions are induced by immune reactive oxygen species (ROS) that accumulate in the lumen and
depend on the ROS-sensing TRPA1 receptor. We then demonstrate that both ROS and TRPA1 are required in a subset of
anterior enteroendocrine cells for the release of the DH31 neuropeptide, which activates its receptor in the neighboring
visceral muscles. The resulting contractions of the visceral muscles favors quick expulsion of the bacteria, limiting their
presence in the gut. Our results unveil a precocious mechanism of defense against ingested opportunistic bacteria,
whether they are Gram-positive like Bacillus thuringiensis or Gram-negative like Erwinia carotovora carotovora. Finally, we
found that the human homolog of DH31, CGRP, has a conserved function in Drosophila.

Development of a Dual-RNAseq strategy to unravel the molecular bases of host-symbiont interactions
Mariana Galvao Ferrarini, Nicolas Parisot, Agnès Vallier, Justin Maire, Benjamin Gillet, Sandrine Hughes, Carole
Vincent-Monégat, Anna Zaidman-Rémy et Abdelaziz Heddi
BF2i, INSA-Lyon, 11 Av. Jean Capelle, Villeurbanne
mariana.galvao-ferrarini@insa-lyon.fr

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One peculiar attribute to insects, including insect pests and disease vectors, is their ability to establish long-term
relationships with heritable nutritional intracellular bacteria (endosymbionts) that supplement their diet with limiting
nutrients and thereby improve their adaptive and invasive powers. These symbiotic associations have been extensively
studied on a physiological, ecological and evolutionary levels; however, few studies have focused on the molecular
dialogue between the host and its associated endosymbionts to identify the genes and pathways directly involved in this
symbiosis. The first studies in this field are based on the separate analysis of the insect and the endosymbionts, making it
difficult to decipher the genetic mechanisms underlying their interaction. Indeed, obtaining high-throughput data
simultaneously on the different symbiotic partners is a major technological bottleneck, and to overcome this issue, we
have developed a host-symbiont metatranscriptomic approach, called Dual-RNAseq. We applied this innovative technique
for the study of the metamorphosis and the life cycle of a symbiotic holometabolous insect pest, the cereal weevil
Sitophilus oryzae. In cereal weevils, endosymbiotic bacteria Sodalis pierantonius are secluded in specialized host cells,
called bacteriocytes that form the bacteriome organ. During the insect’s life cycle, this organ undergoes a drastic
reorganization and the bacterial load changes continuously. Using Dual-RNAseq at twelve stages of the cereal weevil’s
development, we are unraveling the molecular bases of this symbiotic reorganization - which includes de-regulation of
genes invoved in cell motility and cell adhesion - as well as the network of interactions between the two symbiotic partners
in this process.

Beyond mating competitiveness: Behavioural and physiological determinants of sterile male fitness in
support of SIT against Aedes albopictus
David Damiens, Clélia Oliva and Louis-Clément Gouagna.
Institut de Recherche pour le Développement (IRD)
louis-clement.gouagna@ird.fr
Currently, control of diseases spread by Aedes mosquitoes, e.g. chikungunya, dengue, and Zika, relies on broad-spectrum
insecticide sprays. With the evolution of insecticide resistance in mosquitoes, and the environmental and health risks
associated with harmful pesticide use, new vector control technologies are being developed. Unlike many genetic
approaches being developed nowadays, the Sterile Insect Technique (SIT) has probably the highest safety and no
environmental footprint. In this technology, radiation-induced sterile male insects are released into natural populations to
mate with the wild females, reducing the mosquito population so that there are fewer mosquitoes to pass on the
pathogen. If female population is drastically suppressed, disease transmission reduction resulting from sterile male
releases could be significant. The fitness and behaviour of sterile males are often given a great deal of consideration in the
design of the SIT, as behaviorally inappropriate design can potentially lead to failures in SIT programs. Here, a number of
investigations carried out in La Reunion Island on measuring behavioral and physiological determinant of sterile males
fitness will be used to illustrate the research supporting the design of sterile male release strategies against Ae. albopictus.

Innate immune memory, a new paradigm in invertebrate immunity: molecular bases beyond phenotypes in
the vector snail biomphalaria glabrata.
Silvain Pinaud, Richard Galinier, David Duval, Benjamin Gourbal
IHPE UMR 5244, CNRS, IFREMER, UM, UPVD 58 Avenue Paul Alduy, Bat R, Université de Perpignan, F-66860
PERPIGNAN CEDEX, FRANCE
benjamin.gourbal@univ-perp.fr
Discoveries made over the past ten years have provided evidences that invertebrate antiparasitic response may be primed
in a sustainable manner, leading to the failure of a secondary encounter with the same pathogen. This phenomenon called
“immune priming” or "innate immune memory" was mainly phenomenological and the underlying molecular mechanisms
remained to be investigated in invertebrate organisms. In order to achieve this ambitious goal, we focused our
investigations on the Lophotrochozoan snail, Biomphalaria glabrata, in which a specific genotype-dependent innate
immune memory was recently reported. We demonstrated that immune memory response in B. glabrata is associated
with a shift from a cellular to a humoral immune response, and we seek for the mechanisms supporting the genotype-
dependent specificity. We confirm the ability of Biomphalaria snails to distinguish different parasite genotypes but also
different parasite stages of the same genotype. We show for the first time the involvement of putative pathogen
recognition receptors (PRRs) that varies in quality and/or quantity following homologous and heterologous immune
challenges. We investigate the molecular and epigenetic support of this process in Biomphalaria/Schistosoma system and
try to reconcile mechanisms with phenomena, thereby exerting a yet unknown type of immunological memory upon re-
infection in invertebrates. This prompted us to revisit the artificial dichotomy between innate and memory immunity in
invertebrate systems and open the way to new questions on how the pathogen pattern is stored and recall in invertebrate
immune system: Would memory of the pathogen exposure be written in the epigenome?

Spontaneous mutations in a regulatory gene induce phenotypic heterogeneity and adaptation of Ralstonia
solanacearum to changing environments
Anthony Perrier, Xavier Barlet, David Rengel, Philippe Prior, Stéphane Poussier, Stéphane Genin & Alice Guidot
Laboratoire des Interactions Plantes Micro-organismes (LIPM) - UMR CNRS-INRA 2594/441- Chemin de Borde-
Rouge - Auzeville BP 52627 - 31326 Castanet Tolosan Cedex FRANCE

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alice.guidot@inra.fr
An evolution experiment with the bacterial plant pathogen Ralstonia solanacearum revealed that several adaptive
mutations conferring enhanced fitness in plants arose in the efpR gene encoding a regulator of virulence and metabolic
functions. In this study, we found that an efpR mutant systematically displays colonies with two morphotypes: the type S
(‘smooth’, similar to the wild-type) and the type EV (‘efpR variant’). We demonstrated that the efpH gene, a homolog of
efpR, plays a key role in the control of phenotypic heterogeneity, the ΔefpR-ΔefpH double mutant being stably locked into
the EV type. Using mixed infection assays, we demonstrated that the type EV is metabolically more proficient than the type
S and displays fitness gain in specific environments whereas the type S has a better fitness into the plant environment. We
provide evidence that this efpR-driven phenotypic heterogeneity is a general feature of strains of the R. solanacearum
species complex and could occur in natural conditions. This study highlights the importance of phenotypic heterogeneity in
this plant pathogen as an adaptive trait to changing environments.

How to disentangle symbiont effects on host resource acquisition and plasticity and why it matters for their
evolution
Robin Guilhot, Simon Fellous
CBGP – INRA Montpellier
robin.guilhot@inra.fr
Microbial symbionts can either provide resources to their hosts or mediate host plasticity through physiological signaling.
Symbionts that improve resource availability would be beneficial in all environments, which favors the evolution of stable
mutualism. However, when symbiont affects plasticity, fitness consequences would depend on the environmental context,
with consequences on coevolution. In order to separate symbiont effects on host resources and plasticity, we propose a
new multivariate framework based on the analysis of trade-offs between fitness components. We applied the framework
to a series of experiments on the symbiosis between bacteria, yeasts and three fruit-fly species, Drosophila melanogaster,
D. simulans and D. suzukii. In particular, we focused on the trade-off between speed of larval development and adult size
that is largely documented in holometabolous insects. We found evidence for symbiont effects on both host resources
availability and developmental plasticity. Taking into account host sex, genotype and species revealed a major effect of
host species on whether yeast affects plasticity or not. Besides, evidence suggests Drosophila's bacterial symbionts may
influence plasticity more than yeast does. Further developments of the framework will enable the simultaneous analysis of
a greater number of fitness components and should encompass other types of variation (e.g. genetic). Until our
framework's evolutionary predictions are tested, its results can be used to improve the mass-production of insect (e.g. for
the sterile insect technique) so as to fine-tune insect vigor and phenotype to contextual needs.

Déterminants génétiques de la période d’incubation extrinsèque de Plasmodium falciparum chez les
anophèles vecteurs
Edwige Guissou, Bienvenue K. Yameogo, Dari F. A. Da, Domonbabele F.d.S. Hien, Rakiswende S. Yerbanga,
Kounbobr R. Dabiré, Anna Cohuet, Thierry Lefèvre
Unité MIVEGEC IRD-Montpellier 911 Av Agropolis BP 64501 34394 Montpellier cedex 5
IRSS, Direction Régionale, 399, Avenue de la Liberté 01 BP 545 Bobo-Dioulasso 01
edwigeguissou@yahoo.fr
La période d'incubation extrinsèque (PIE) du plasmodium est un facteur déterminant de l’intensité de la transmission du
paludisme. De nombreuses études ont montré que la PIE est fortement dépendante de la température. Par contre, on ne
sait toujours pas dans quelle mesure la variation génétique du parasite et/ou du moustique peut influencer la PIE.
L'objectif de notre étude était d'utiliser le système anophèle/plasmodium pour étudier les déterminants génétiques du
temps de développement de Plasmodium falciparum (P.f) chez les anophèles. Trois espèces vectrices ont été
expérimentalement infectées par le sang de quatre isolats naturels de P.f. La PIE a été estimée en utilisant une approche
non destructive basée sur la détection de parasites dans des boules de coton imbibées d'une solution de glucose 10%. Nos
résultats indiquent que la PIE médiane globale de P.f à 27 °C était de 12 jours. Bien que cette période ait été similaire chez
les trois espèces de moustiques, elle a varié de façon significative entre les isolats de parasite. Il y’avait aussi une
interaction espèces-isolats sur la PIE. Enfin nous avons constaté que les parasites qui se développaient les plus vite étaient
aussi ceux qui induisaient la plus forte mortalité chez les moustiques, suggérant ainsi l’existence d’un trade-off entre deux
traits clés de la transmission. Davantage de travaux seront nécessaires afin de confirmer que certains clones de parasites
se développent plus vite dans certaines espèces de moustiques que d’autres. Les résultats de ces travaux fourniront des
renseignements importants sur la lutte contre le paludisme.

Prevalence and diversity of ssRNA+ honey bee-infecting viruses in wild hymenoptera
Bigot D; Gayral, P. ; Lopez-Vaamonde C.; Herniou E.A.
IRBI, UMR 7261 CNRS-Université de Tours
elisabeth.herniou@univ-tours.fr
Honey bee decline stems from multiple interacting environmental and biotic factors, such as pesticides and management
practices, as well as parasites and microbial diseases. In this context, bees are becoming a prominent model in viral
ecology. Wild bees have been shown to carry a variety of honey bee viruses, in particular bumble bees that seem

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