Acquisitions nosocomiales de COVID-19 : les soignants certes, mais les patients ?

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Acquisitions nosocomiales de COVID-19 : les soignants certes, mais les patients ?
Acquisitions nosocomiales de COVID-19 :
   les soignants certes, mais les patients ?

 Jean-Christophe LUCET
 UHLIN, GH Bichat-Cl. Bernard, AP-HP, Paris
 IAME, UMR 1137, Université de Paris, France.

 Journée Claude Bernard, 17 novembre 2022
Acquisitions nosocomiales de COVID-19 : les soignants certes, mais les patients ?
Acquisition nosocomiale de COVID-19
Circonstances de transmission hospitalière
Acquisitions nosocomiales de COVID-19 : les soignants certes, mais les patients ?
Acquisition nosocomiale de COVID-19
Circonstances de transmission hospitalière
•   Communautaire ou nosocomial ?
•   Intrication de la circulation entre patients et soignants
•   Pas d’essai de type RCT sur les stratégies de prévention,
    individuelles ou collectives
•   Apport du NGS nécessaire à la compréhension de la circulation du
    SARS-CoV2

         Études descriptives ou avant-après
         Modélisations
Acquisitions nosocomiales de COVID-19 : les soignants certes, mais les patients ?
Nosocomial ou communautaire ?
 Revue de la littérature
 ( nov 2020)

 •   9 études
 •   3-5 j : indéterminé
 •   6-13 j : possible/probable
 •   > 13 : certain

 •   Fréquence : 0 à 15% des cas de
     COViD-19 hospitalisés

Abbas M et al, J Hosp Infect 2021
Acquisitions nosocomiales de COVID-19 : les soignants certes, mais les patients ?
Hospital-Acquired COVID-19
Inpatients, UK, Feb-Aug 2020
               11.3% infected after       LTCF, NH: 61,9%
               admission (peak at         Acute care: 9.7%
                17.6%, and 6.8%
                 after 14 hosp d.)

                                      Read JM et al, Lancet 2021
Acquisitions nosocomiales de COVID-19 : les soignants certes, mais les patients ?
Hospital-Acquired COVID
   Inpatients, England, Feb-Aug 2020

  • 34,4% des cas associés à une
    hospitalisation
  • 15,4% d’entre eux nosocomiaux
    probables ou certains
  • Et 5,1% dans les 14 jours après la sortie

Battacharya A et al, J Infect 2021
Acquisitions nosocomiales de COVID-19 : les soignants certes, mais les patients ?
Epidémies COVID-19 en EHPAD/SSR
Revue de la littérature ( 9/2020)
•   49 études (8502 EHPAD, 2999 épidémies)
•   Taux d’attaque parmi les résidents : 13% (surveillance
    multicentrique) à 45% (épidémie isolée, intervalle 19 à
    86%) :
       - 31% asymptomatiques, 37% hospitalisés
       - De 26% en EHPAD à 60% en SSR spécialisé
•   Mortalité : 23%
•   Cas index = résident 58%, soignant : 42%

                                               Hashan ER et al, eClin Med 2021
Acquisitions nosocomiales de COVID-19 : les soignants certes, mais les patients ?
Epidémies COVID-19 en EHPAD/SSR
Mortalité

                   Levin AT et al, Eur J Epidemiol 2022
Acquisitions nosocomiales de COVID-19 : les soignants certes, mais les patients ?
AP-HP, cas acquis en cours d’hospitalisation
 2778 cas nosocomiaux possibles recensés
   Entre le 1er octobre2020 et le 31/03/21
   Source : EOH (33 sites) + EDS (2sites)
   Rapporté à 2 474 027 JH complète

   Soit 1,1 cas /1000JH

 Rapprochement cas nosocomiaux et
  Activité COVID
   Entre 1octobre2020 et 31mars 2021                      Estimation des cas nosocomiaux : 14% des
   213 106 JH COVID
   Source : SIVIC
                                                          cas de COVID hospitalisés, stable selon les
                                                                           vagues
   10% des JH COVID total
                                                                  Remerciements : S Fournier EOH siège AP-HP
                          Service Prévention du risque infectieux - DPQAM
Acquisitions nosocomiales de COVID-19 : les soignants certes, mais les patients ?
Cas de COVID acquis au cours d’une                                Proportion de décès parmi les cas
hospitalisation (source EOH)                                      de COVID acquis, n=10%

                                                                          Imputabilité du
                                                                          COVID dans le
                                                                        décès non mesurée
                                                       Remerciements : S Fournier EOH siège AP-HP
                Service Prévention du risque infectieux - DPQAM
Prediction des acquisitions nosocomiales
Analyse en réseau
•    Cohorte 3 NHS trust Londres, 04/2020 – 04/2021, 465/21818 cas > 3
     jours (21%)
•    Cohortes de validation (Londres et Genève)
•    Variables patient (âge, sexe, spécialité, …), hôpital (prévalence COVID,
     durée séjour, …) et réseau (contact chambre, unité, bâtiment)

                                              Myall A et al, Lancet Dig Health 2022
Prediction des acquisitions nosocomiales
 Analyse en réseau
  Le risque est multifactoriel,
  Mais les interactions dans une
  unité sont le principal moteur des
Limites
  acquisitions
- descriptif, non explicatif
- Rôle des soignants, des visiteurs ?
- Impact de la vaccination ?
- Impact des nouveaux variants
- Impact du dépistage, des mesures
  de prévention, de la ventilation ?
Myall A et al, Lancet Dig Health 2022
Mesures de contrôle
Quelles mesures ?

•   Equipement de protection individuelle (masque médical ou FFP2,
    visière/lunettes, surblouse/tablier),
•   Hygiène des mains
•   Distance physique (chambre seule, salles de staff, lieux de pause, …)
•   Ventilation
•   Eviction des personnels soignants infectés, des visiteurs
•   Dépistage
•   Vaccination
Hospital-Acquired COVID
Risk of transmission
• Universal precautions (medical mask and HH)

                                          Birgand G et al, JAMA open, 2021
Hospital-Acquired COVID
Impact of universal mask wearing

                                   ↘ 70%
                                   ↘ 79%
                                   ↘ 77%

                                   ↗10% MM  ↘ x 3,5
                                   HCWs: ↘ by 3.4% per week
                                   ↘ by 1.3% per day
                                   …
                                   …
                                     Brooks JT, JAMA open, 2021
Mesures de contrôle : dépistage

Dépistage
• Actuellement recommandé : à
  l’admission ± J4
• Dépistage itératif ?
  - Modèle de microsimulation en EHPAD,
    MCO et PS
  - R0 de base 2.5
• Dépistage :
  - Tous les 3 j : Re = 0.97 (red 61%)
  - Une fois par sem : Re = 1.58 (red 31%)

                                             Chin ET et al, Clin Infect Dis 2021
Mesures de contrôle : dépistage
Dépistage
• Actuellement recommandé : à l’admission ± J4
• Dépistage itératif ?
  - Modèle stochastique SEIR en EHPAD

                                                  Holmdahl I et al,
                                                 JAMA open 2021
Hospital-Acquired COVID
Routes of transmission
• 5 hospital clusters  NGS and modelling
• 38 transmission events:
                        How caused
• 21% of infected individuals does transmission   occurs
                                    80% of acquired cases
                       between patients?
                       •   HCWs Hands/gloves (aka MDRO)?
Patient          20    •        Patient fomites?
                           Contaminated
                       •   Airborne?
    8                  •   Shared rooms?
                                  2

 HCW               8            HCW
                                           IIlingworth CJR et al, eLife 2021
Hospital-Acquired COVID
Risk factors for transmission
• Cluster in 3 units, 18 patients, 38 HCWs
                              Risk factors in HCWs (UV analysis):
                                - Nebulization
                                - Dyspnea, coughing patients
                                - Cumulative exposure time
                                - Interaction with infected colleague
                                - No eye protection

                                    Klompas M et al, Ann Int Med 2021
Hospital-Acquired COVID
Risk of transmission: shared room
• Universal precautions (medical mask and HH)
• Screening at hospital admission, repeat screening and if symptoms
• Risk of shared room:
   - 25/11,290 patients in shared room with positive PCR after hospital
     admission
   - 31/38 roommates: 12 (36%) pos PCR
   - Ct value < 21 in index case associated with transmission to roommates

                                                Karan A et al, Clin Infect Dis 2022
Hospital-Acquired COVID
Risk of transmission: shared room
• Cancer hospital, 57% of beds in shared bedrooms
• Testing at admission and every 3 days
• Universal masking and shielding
• Patients :
 - 112 cases après admission, including 49 in shared room
 - SAR 14/74 (19%)
 - Lower Ct value in index case associated with transmission to
   roommates (P= 0.07) ; 5/14 index cases received AGP
• HCWs :
 - 214 patients exposed to 105 infected HCWs :
 - Only 3 transmissions
                                         Chow K et al, Clin Infect Dis 2022
Hospital-Acquired COVID
Impact of combined preventive measures
• Universal masking (patients and HCWs), visits restriction, admission
  and repeat screening, eye protection, daily symptoms (Pts and HCWs)

     March 7 to May 30, 2020:
     - 697 community-acquired cases
     - 12 late onset (≥ 3 d.) cases  2
       probably hospital- acquired

                                              Rhee C et al, JAMA open, 2020
Hospital-Acquired COVID
Impact des variants
• 12 hôpitaux, Massachusetts, hiver 2020-21 vs 2021-22

                 Alpha                Omicron
                                     Malgré la vaccination et la poursuite
                                     des mesures de prévention …
                                     Poids :
                                     - De la prévalence dans les
                                        population et chez les soignants,
                                     - De la contagiosité d’Omicron

                                              Klompas M et al, JAMA 2022
Hospital-Acquired COVID
Frequent lapses in IPC
 • Not masking patients in shared rooms, or in presence of
   an HCW (source control)
 • Reluctance for using face shield (in addition to mask)
 • Incorrect or prolonged glove use  missed hand hygiene
   opportunities
 • Incorrect or prolonged gown use
 • HCWs interactions without mask:
  - Break rooms and friendly encounters (inside or outside the
    hospital)
  - Higher risk perception from (symptomatic) patients than from
    (asymptomatic) colleagues
Hospital-Acquired COVID and infections
A double challenge
View from the frontline:
 • Organisation:
  - Missing manpower with adequate training
  - Surge of COVID patients with suboptimal care
  - Transient COVID units, with non specialized HCWs, e.g. in ICU
  - Inter-ward and inter-hospital transfers
• Patients:
  - Higher severity of illness of ICU COVID patients
  - Higher care requirement (e.g. placement into proning position)
Hospital-Acquired COVID and infections
A double challenge
View from the frontline:
• HCWs:
   - Disruption of environmental cleaning
   - Double gloving, inadequate prolonged glove use
   - Inadequate prolonged gown use, double gowning
   - Staffing shortage, workload and fatigue  decreased
     vigilance

  No reason that MDR pathogen could be transmitted
  between patients by HCWs hands, but not SARS-CoV-2
Practices in IPC
Direct observations of masking technique
Fist wave, 3 units, March-April 2020

                                       Neuwirth MM et al, ARIC 2020
Practices in IPC
  Hand hygiene (automatic recording system)
  ID or cohort units, PPE with glove wearing

                 Wave 1       Wave 2
    Room exit

    Room entry

Huang F et al, J Hosp Infect 2021              Makhni S et al, JAMA IM, 2021
MDRO Outbreak
SARS and MRSA in a dedicated ICU, Hong-Kong 2003
MRSA screening at admission, then once a week

            Gloves and gowns               Concern of being infected
            worn all the time              by a deadly disease >>
                                           Infection prevention

                                     Yap FHY et al, Clin Infect Dis 2004
Practices in IPC
 Role of long-sleeved gowns?
  • Increasing incidence of:
     - CLABSI,
     - Colonisation/infection with GNB (x3)
     - Environmental contamination with GNB (11.5% vs 2.6%)
     - Suboptimal HH compliance, and perception of contamination by
       gown/gloves
          Short-sleeved
Long-sleeved  gowns;        gowns
      Enhanced
 - Reservoir       environmental
             of pathogens?         cleaning
                             (including SARS-CoV-2!)
 - Obstacle to hand hygiene (≈ long-sleeved white coat)

                                           Meda M et al, J Hosp Infect 2020
Learning from Previous Crises
    Barriers and facilitators to HCW’s adherence to IPC:
    20 qualitative studies for respiratory IDs (7 SARS, 3 H1N1, 2 MERS, 7 tuberc.)
Organisational:                                              Environmental:
-    Consistency of guidelines                               -    Physical environment
-    Clarity of guidelines                                   -    Availability of PPE
-    Changing guidelines
-    Workload and fatigue         Adherence to           Individual:
-    Support from (confidence     IPC guidelines         -       Knowledge
     in) the management                                  -       Attitudes (protection
-    Training program                                            with PPE)
-    Safety climate                                      -       Beliefs (fears, concerns)
                                                         -       Discomfort with PPE
Houghton C et al, Cochrane Library 2020
Learning from Previous Crises
    Barriers and facilitators to HCW’s adherence to IPC:
    20 qualitative studies for respiratory IDs (7 SARS, 3 H1N1, 2 MERS, 7 tuberc.)
Organisational:                                             Environmental:
-   Consistency of guidelines                               -    Physical environment
-   Clarity of guidelines                                   -    Availability of PPE
-   Changing guidelines
-   Workload and fatigue         Adherence to           Individual:
-   Support from (confidence     IPC guidelines         -       Knowledge
    in) the management                                  -       Attitudes (protection
-   Training program                                            with PPE)
-   Safety climate                                      -       Beliefs (fears, concerns)
                                                        -       Discomfort with PPE
Houghton C et al, Cochrane Library 2020
Perspectives
• Nous serons probablement confrontés à une pandémie
  similaire, peut-être avec un agent viral respiratoire à
  transmission aérienne prédominante
• Quelles mesures préventives « non pharmaceutiques » ?
  - Généraliser le port du masque : systématique en communauté et
    ES si symptômes respiratoires, et pour les soignants en période
    d’épidémie hivernale
  - Hygiène des mains
  - Généraliser les chambres seules,
  - Ventilation des locaux : renouvellement, aération, flux d’air
  - Favoriser la distance physique pour les soignants (salles de pause)
  - Anticipation : alerte, formation/information
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