Chaire d'Excellence en Recherche Translationnelle - BILAN

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Chaire d'Excellence en Recherche Translationnelle - BILAN
Chaire d’Excellence en
Recherche Translationnelle
                    BILAN
Chaire d'Excellence en Recherche Translationnelle - BILAN
LES PARTENAIRES DE LA CHAIRE
Chaire d'Excellence en Recherche Translationnelle - BILAN
© DUPONT-RENOUX

CONSTRUIRE UNE NOUVELLE DYNAMIQUE
L’ambition     de la Chaire d’Excellence en Recherche        Trois ans après son lancement, la fusée « Chaire
Translationnelle à Grenoble est de porter une nouvelle       d’Excellence » a été mise en orbite et progresse à
dynamique d’innovation et de rayonnement                     présent de manière autonome, portée par un
scientifique dans le domaine des Sciences du Vivant et       profond travail de restructuration de la recherche
de ses applications dans la lutte contre le cancer. Le       sur le cancer, de motivation et de fédération des
Cancer est aujourd’hui la première cause de mortalité        acteurs autour de nouveaux projets, par des
dans les pays développés et est au cœur de défis             résultats scientifiques significatifs et – last but not
scientifiques, technologiques, sociétaux et humains qui      least – par l’obtention de budgets de recherche
transforment profondément notre société.                     compétitifs. Ce succès n’est pas celui d’une
                                                             personne ou d’une thématique de recherche. C’est
À travers ses nombreux acteurs d’excellence coordonnés       le résultat de l’action de toute une communauté
par le CLARA, la Région Auvergne-Rhône-Alpes s’affirme       qui, à travers l’apport de la Chaire, s’est organisée
comme un poids lourd européen de la recherche sur le         et structurée pour être capable d’afficher de
Cancer.                                                      nouveaux programmes d’envergure nationale et
Le but de la Chaire d’Excellence est de fermement ancrer     internationale. La Chaire a pu s’implanter dans un
Grenoble dans ce paysage comme un foyer d’excellence         terrain très favorable notamment grâce à la
original et générateur d’idées nouvelles, tirant parti de    dynamique de l’IDEX de l’Université Grenoble Alpes
l’exceptionnelle densité et richesse multidisciplinaire du   et de ses valeurs de multidisciplinarité. Les thèmes
plateau scientifique et technologique grenoblois, une des    clés de cette réussite sont :
communautés de R&D les plus dynamiques d’Europe.             Porter haut les valeurs de la recherche
                                                             fondamentale : penser, créer, rêver, innover,
                                                             partager et tester des idées, faire naître de
                                                             nouveaux concepts,
     …Développer une recherche
     translationnelle dans le cancer broncho-                Penser et aborder le cancer dans sa réalité
     pulmonaire appuyée sur les compétences                  humaine et sociétale en suivant les trajectoires
     présentes au sein des équipes de                        de santé des patients des pathologies chroniques
     l'Institut Albert Bonniot et du CHU de                  aux cancers,
     Grenoble, avec l’objectif de renforcer la
     dynamique de recherche et de transfert                  Promouvoir une recherche de transfert orientée
     en oncologie à Grenoble, à l’interface                  vers la Médecine « 4P » : personnalisée,
     avec les autres pôles et disciplines                    prédictive, préventive et participative, faisant
     régionales stratégiques, en particulier                 appel aux ressources des données massives au
     les domaines des sciences de l’ingénieur                service des personnes,
     appliquées à la biologie, et dans les
     réseaux internationaux ».                               Créer de la multidisciplinarité, hors des silos
                                                             thématiques, en associant des chercheurs de
     Extrait du contrat d’objectifs de Chaire                tous les horizons et de toutes les formations,
     d’Excellence 2013                                       couvrant tout le continuum de la biologie depuis les
                                                             petites molécules jusqu’aux populations.
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LA CHAIRE D’EXCELLENCE EN CHIFFRES

                 45                                         3 projets
             Publications                                  innovants
           internationales                                   avec des
          10 600 citations                                industriels

1 équipe de recherche                     3,5 M€
14 personnes                               pour la
4 programmes                             recherche

                      300 personnes,
                      17 équipes,               4 Collaborations
                      4 plateformes           Intercontinentales

                                       3 grands projets
   1 Budget                            fédératifs :
      Feder                            IDEX, ITMO,
 Biobanque                             MSD Avenir

                                    Plateforme de Biologie
       8x                          Moléculaire de l’Arc Alpin :
       Effet levier                   7 000 analyses/an
                                      600 000 € pour le
                                    diagnostic moléculaire
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VISION : LE CANCER DANS SON ÉCOSYSTEME
Aujourd’hui,   l’émergence de la médecine moléculaire et des nouvelles thérapies
transforme profondément la cancérologie et en fait un modèle pour le développement de
la médecine au XXIème siècle. Le premier défi de la Chaire est de proposer une approche
innovante et fédératrice pour Grenoble afin de s’affirmer comme leader de ce
mouvement.

Cette vision est née de la rencontre entre l’intérêt de Pierre Hainaut pour l’épidémiologie
moléculaire et les spécificités Grenobloises. Elle met en avant le cancer comme
expression de l’écosystème dans lequel nous vivons. Dans l’expérience de nombreux
patients, le cancer s’inscrit souvent comme une rupture dans une trajectoire de santé
marquée par les maladies chroniques (pathologies métaboliques, respiratoires,
inflammatoires et immuno-infectieuses), souvent déterminées par des facteurs de risques
tels que le tabac, la qualité de l’air et de la nutrition, l’exercice physique, les rythmes de vie
et les disparités socio-économiques. Agir contre le cancer, c’est non seulement cibler la
maladie avec des thérapies innovantes mais aussi la prévenir en incurvant ces
trajectoires de santé vers un vieillissement favorable. Ceci requiert une approche
globale, conciliant la biologie moléculaire et cellulaire, la médecine dans sa dimension
systémique, l’épidémiologie, l’écologie et les sciences sociales, avec comme clé de voûte
l’utilisation intelligente des données multi-échelles pour anticiper l’évolution des
trajectoires et donner au patient des instruments pour devenir le pilote de sa santé.

Grenoble est un terrain idéal pour déployer cette vision. Le CHUGA est un grand hôpital
généraliste, où le cancer représente 25 % de l’activité et où les patients sont vus dans la
continuité de leurs trajectoires, reliant les pathologies chroniques au cancer. Les médecins
et les chercheurs grenoblois sont en pointe dans les maladies et les cancers des voies
respiratoires, les pathologies cardiovasculaires, inflammatoires et neurodégénératives, et
dans l’étude de la qualité de l’air. Sur le plan de la recherche en biologie, les forces
reconnues de Grenoble sont dans le domaine de l’épigénétique (comment
l’environnement fait-il émerger des phénotypes ?), des relations entre les cellules et
leur microenvironnement et de l’immunité/inflammation. Enfin, l’offre
multidisciplinaire de l’UGA renforcée par l’IDEX propose des ouvertures uniques sur les
sciences des données, les technologies de l’information et les sciences sociales.
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L’INSTITUT POUR L’AVANCÉE DES BIOSCIENCES
L’IAB    est depuis 1994 une marque importante dans le
paysage de la recherche à Grenoble. Structuré en Centre de
Recherche depuis 2007, l’Institut Albert Bonniot a offert un
cadre à des équipes d’excellence en biologie moléculaire et
cellulaire et a développé un socle solide de recherche
translationnelle avec le CHUGA. La première mission de la
Chaire a été de donner un nouveau souffle et une nouvelle
dimension à ce grand instrument de recherche et de transfert.

Dès le début 2014, sous l’impulsion de la Chaire, l’IAB s’est doté
d’une nouvelle stratégie scientifique, exprimée à travers 3
mots-clés : Épigénétique, Pathologies Chroniques et
Cancer. Ces trois mots-clés incarnent la vision du cancer dans
son écosystème qui porte la démarche de la Chaire. Elle met en
cohérence les expertises complémentaires d’un grand centre
de recherche et les rendent parfaitement lisibles dans
l’environnement grenoblois, régional, national et international.
Enfin, elle fédère les acteurs de la recherche moléculaire et
cellulaire à Grenoble, en offrant de nouveaux ponts                    Avec 300 personnes, 17
interdisciplinaires avec le CHUGA et avec les autres unités de
recherche sur le site Santé de Grenoble et au-delà.
                                                                         équipes, 4 plateaux
                                                                     techniques et plus de 15 M€
A l’été 2014, la stratégie a été validée par un Conseil
Scientifique International, qui a permis de reconstruire en
                                                                     de budget annuel, l’IAB est
profondeur la structure scientifique de l’IAB et d’y attirer de        le deuxième centre de
nouvelles équipes, des jeunes chercheurs et de nouvelles                recherche en santé en
thématiques. Labellisée avec grand succès par le Haut Conseil
pour l’Evaluation de la Recherche et de l’Enseignement                 Auvergne Rhône Alpes.
Supérieur (HCERES), la nouvelle structure s’est dotée d’une
nouvelle gouvernance, d’une direction de l’administration, des
finances et des ressources humaines, et d’un secrétariat de
direction chargé de la communication.

Dans sa nouvelle configuration depuis janvier 2016, l’IAB a
traduit cette profonde mutation en changeant de look et de
style : un nouveau nom, une nouvelle signature et une nouvelle
communication à travers un site web et les médias sociaux,
affirmant l’impact et les succès des chercheurs de l’IAB dans la
presse, la création de valeur et la coopération internationale.
Devenu l’Institut pour l’Avancée des Biosciences (et
conservant ainsi son acronyme « historique »), l’IAB est à
présent configuré pour s’affirmer comme un acteur
scientifique premier plan en France et en Europe.
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STRUCTURE SCIENTIFIQUE
L’Institut pour l’Avancée des Biosciences est structuré en trois départements très
complémentaires qui, collectivement, portent la stratégie scientifique. Le département
Signalisation et Chromatine regroupe 5 équipes fédérées autour de la thématique de
l’Epigénétique, de la structure de la chromatine à l’épigénétique médicale appliquée au
cancer. Le Département Microenvironnement, Plasticité Cellulaire et Signalisation
intègre l’une des plus fortes concentrations en Biologie Cellulaire en Auvergne Rhône Alpes,
avec des expertises reconnues sur les interactions cellules-matrices, le cytosquelette, le
microenvironnement, la signalétique cellulaire, les réponses cellulaires aux stress
mécaniques, les thérapies ciblées, les nanovecteurs et l’imagerie cellulaire. Enfin, le
département Prévention et Thérapie des Maladies Chroniques regroupe des équipes
dédiées à la pathologie moléculaire des cancers, à l’immunologie analytique et à
l’immunothérapie, à la parasitologie et à l’épidémiologie environnementale.

Portées par une équipe administrative et logistique intégrée, les équipes s’appuient sur 4
plateaux techniques d’excellence, dont une plateforme de Bioinformatique dédiée à
l’Epigénétique Médicale (EpiMed) et une plateforme de microscopie photonique pionnière
dans le domaine de l’optique adaptative et de l’optogénétique (MicroCell).

Cette structuration en départements met en valeur un arc de compétences qui couvre tout
le continuum biologique de la molécule aux populations. A travers l’affirmation de
leaders scientifiques très reconnus, cette structure promeut la visibilité et la reconnaissance
de l’IAB comme une marque forte dans le paysage de la recherche en région Auvergne-
Rhône-Alpes et en France.
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DE L’IAB À UNE STRATÉGIE DE SITE
À travers sa nouvelle stratégie scientifique et sa Ensemble, les deux instituts alignent des expertises et
structure lisible, l’IAB poursuit un objectif de site : être   des moyens complémentaires permettant de dessiner
le partenaire du CHUGA pour le développement de la             un vrai continuum de recherche et de transfert sur la
recherche biomédicale. Cette volonté explique le choix         thématique de la respiration et de l’air comme
d’élargir la « cible » pathologique de l’IAB aux maladies      déterminant essentiel des pathologies chroniques et
chroniques et à leurs transitions vers les cancers. Au-        du cancer. Cette thématique épouse de nombreuses
delà du positionnement innovant et démarqué de celui           forces grenobloises, sur l’hypoxie intermittente, la
des grands centres nationaux de recherche sur le               BCPO, les cancers du poumon, et la santé
cancer (tous axés sur les traitements de pointe), la           environnementale – tout en rencontrant des
stratégie de l’IAB « colle » à présent au plus près des        préoccupations de santé publique très présentes à
forces du CHUGA et à ses activités cliniques. Cette            Grenoble, telles que la qualité de l’air et l’exercice
volonté, affirmée dès le début de la Chaire, s’est             physique. Ce continuum d’expertise souligne une
d’abord déclinée par une image : pour les biologistes          vraie force de site dont la structuration a pour but de
d’aujourd’hui, un grand hôpital multidisciplinaire             faire émerger Grenoble comme un grand leader
comme le CHUGA est l’équivalent d’un grand télescope           national et international sur une thématique de
pour l’astronome : un instrument très puissant                 santé majeure au XXIème siècle. Cet alignement
pour capter en temps réel une infinité de                      des planètes se traduit par l’affichage de l’axe
données de santé pertinentes pour l’avancée des                « Pathologies chroniques et Cancer » comme un
biosciences.                                                   composant bien identifié du projet d’établissement du
                                                               CHUGA et du projet IDEX de l’UGA.
Le discours sur l’axe « Pathologie Chroniques –
Cancer » a immédiatement trouvé un écho dans la
communauté médicale grenobloise et a permis de
nouer et de renforcer des partenariats solides. Le cœur
de ces partenariats est l’alignement entre la vision et
les approches de l’IAB et celles du laboratoire HP2
Hypoxie PhysioPathologie, unité Inserm dirigée par
le Pr Jean Louis Pépin sur le site santé.

   Le programme LIFE (is MaDE of Choices) est
   une illustration de cette stratégie. Co-porté
   par Jean Louis Pépin et Pierre Hainaut, ce
   programme a été labellisé dans le cadre de
   l’appel d’offre « Cross Disciplinary Programs »
   (CDP) de l’IDEX UGA en 2017 et bénéficie d’un
   budget de 1,7 M€.

   Ce projet rassemble des expertises en biologie
   moléculaire, en médecine des maladies
   chroniques, en épidémiologie et santé
   publique, en urbanisme, en sciences sociales
   et en sciences des données, pour étudier de
   façon multidisciplinaire comment notre
   environnement et les écosystèmes dans
   lesquels nous vivons contribuent au
   développement et à la progression des
   pathologies chroniques vers les cancers.
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PATHOLOGIE MOLÉCULAIRE DES CANCERS ET
BIOMARQUEURS
L’essentiel des moyens financiers de la Chaire ont été consacrés à la création et au
développement d’une nouvelle équipe de recherche à l’IAB, l’équipe Pathologie Moléculaire
des Cancers et Biomarqueurs. Cette équipe est le résultat d’une démarche approfondie
pour intégrer l’expertise de Pierre Hainaut avec celles de l’IAB et proposer une démarche
scientifique alliant recherche fondamentale et dynamique de transfert. Aujourd’hui, forte de
14 personnes, l’équipe repose sur plusieurs chercheurs confirmés, dont Chantal Thibert et
Cécile Caron (Chargés de Recherche Inserm et CNRS) et Sakina Torch (Maître de Conférences
UGA) et a intégré en 2016 un jeune chercheur brillamment recruté au CNRS, Nicolas Reynoird.
Une partie importante du « noyau » de l’équipe est constituée de personnels recrutés en CDD
sur les moyens de la Chaire (2 ingénieurs, 2 jeunes chercheurs). L’équipe accueille et encadre
deux étudiants en thèse (dont un médecin) et plusieurs étudiants en Master. Enfin, elle intègre
des biologistes hospitaliers et des médecins : Denis Moro-Sibilot (PUPH, oncopneumologue),
Anne Mc Leer (MCUPH), Florence de Fraipont (PH) et Elisabeth Brambilla (PU émérite).

L’équipe développe 4 programmes dont le ciment commun est la biologie moléculaire du
gène suppresseur de tumeur TP53 (codant pour la protéine p53), le gène le plus souvent muté
dans les cancers.

                                          TP53 et cancérogenèse (PI : P Hainaut) étudie
                                          l’impact fonctionnel des mutations de TP53 afin de
                                          déterminer leur signification pronostique et de
                                          développer des thérapies visant à les corriger. Ce
                                          programme repose sur l’étude des mutations
                                          héréditaires (cause du Syndrome de Li et Fraumeni,
                                          une prédisposition familiale au cancer) et sur la
                                          caractérisation détaillée des mécanismes
                                          d’inactivation de TP53 par mutation ou par
                                          d’autres mécanismes (surexpression des isoformes
                                          de p53).
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Polarité cellulaire et métabolisme (PI C.
Thibert) : ce programme étudie le rôle du gène
LKB1/STK11 dans la dynamique des cellules
souches à travers la régulation de la polarité
cellulaire, de la différenciation et du
métabolisme énergétique des cellules. Il
s’intéresse particulièrement aux relations entre
LKB1 et p53, et à la mobilisation de ce dernier
dans le contrôle des fonctions métaboliques des
cellules. Ce programme développe le concept
que le cancer peut se décrire comme une
maladie du métabolisme.
                                             Méthyltransférases et Cancer (PI : N Reynoird)
                                             s’intéresse à la méthylation des lysines comme
                                             nouveau signal de modification de protéines
                                             impliquées dans la cancérogenèse. Cette
                                             approche innovante met en évidence de nouveaux
                                             circuits moléculaires dérégulés dans les cancers et
                                             potentiellement « ciblables » à des fins
                                             thérapeutiques. Un de ces effecteurs est p53, qui
                                             intègre de nombreux signaux de méthylation pour
                                             réguler la transcription et la suppression tumorale.

Pathologie       Moléculaire       des        Cancers
Pulmonaires (PI : P Hainaut) développe une
thématique forte à l’IAB, portée depuis des années
par les travaux d’Elisabeth et de Christian Brambilla.
Ce programme vise à développer de nouveaux
biomarqueurs pour la stratification des patients, la
décision thérapeutique, la détection précoce et le
développement        de    nouveaux       traitements.
S’appuyant sur les projets fondamentaux de
l’équipe, il cherche à comprendre l’hétérogénéité
des cancers et leur capacité à changer de phénotype
au cours de leur progression, notamment lors de la
rechute après traitement. Ce projet comprend une
approche systémique, visant à décrire de façon
intégrée l’ensemble des mécanismes moléculaires
qui contribuent à la cancérogenèse pulmonaire

                                                              L’équipe Pathologie
                                                           Moléculaire des Cancers en
                                                                   chiffres :

                                                                   14 personnes
                                                            4 collaborateurs au CHUGA
                                                         6 Contrats de recherche, 0,7 M€
                                                            54 articles de 2014 à 2017
                                                               2 étudiants en Thèse
                                                                  3 ll b      i
LA PLATEFORME DE GÉNÉTIQUE MOLÉCULAIRE DES
CANCERS DE L’ARC ALPIN
La Plateforme de Génétique Moléculaire des Cancers de l’Arc Alpin (PGMCAA) du CHU Grenoble Alpes
(CHUGA) participe à la mise en œuvre de la mesure 21 du Plan Cancer 2009-2013 (garantir un égal accès aux
traitements et aux innovations) et de l’objectif 6 du Plan Cancer 2014-2019 (conforter l’avance de la France dans
la médecine personnalisée) pour les patients du territoire de l’Arc Alpin (Départements 38, 73, 74 et 01 et pour
petite partie 05, 07 et 26). Elle a été créée en 2007 par le Pr Dominique Leroux, qui a assuré sa mise en place et sa
coordination jusqu’en fin 2014.
Cette mission est reprise par le Pr. Pierre Hainaut de manière effective depuis avril 2015. L’objectif est d’assurer le
développement de la plateforme sur le territoire Arc Alpin et de coordonner l’action des laboratoires du CHUGA
qui réalisent les tests de génétique moléculaire déterminants pour l’accès aux thérapies ciblées des cancers, en
conformité avec le cahier des charges des plateformes hospitalières labellisées par l’Institut National du Cancer.
Dans ce cadre, La Chaire contribue donc au développement de la Médecine Moléculaire à Grenoble.
                                                                         Au cours des 24 derniers mois, la plateforme
                                                                         a engagé plusieurs chantiers majeurs :
                                                                              - le passage au Séquençage de
                                                                                  nouvelle génération (NGS),
                                                                              - le développement de la
                                                                                  bioinformatique,
                                                                              - l’ouverture et la communication vers
                                                                                  l’ensemble de l’Arc Alpin.
                                                                         Ces chantiers ont pour objectif de permettre
                                                                         à la plateforme de pleinement jouer son rôle
                                                                         sur l’ensemble du territoire de santé
                                                                         concerné et de contribuer à faciliter l’accès à
                                                                         l’innovation thérapeutique au CHUGA et dans
                                                                         les autres centres de l’Arc Alpin.

La RCP Moléculaire
La mise en place depuis janvier 2016 d’une Réunion de
Concertation Pluridisciplinaire « Moléculaire » a permis
de dynamiser le dialogue entre médecins et biologistes
au service des patients. Les objectifs de la RCP sont de :
 - promouvoir l’accès des patients à l’innovation
     thérapeutique,
 - développer le potentiel d’identification de
     biomarqueurs moléculaires de la plateforme,
 - faciliter l’inclusion dans des essais de thérapies
     innovantes,
La Chaire a soutenu la RCP Moléculaire en 2016 en
contribuant à un budget afin de couvrir les demandes
d’analyses ne rentrant pas dans le cahier des charges de
l’INCa.

   Vers une nouvelle organisation de la Génomique
   Médicale
   La Chaire s’implique dans le futur de la génomique à
   visée médicale en participant de façon active au
   consortium AuraGen qui porte la candidature de la
   région Auvergne-Rhône-Alpes à la création d’un centre
   pilote de génomique médical à très haut débit dans le
   cadre du plan national France Génomique 2025.
GRANDS PROJETS STRUCTURANTS
Plusieurs grands projets collaboratifs et structurants ont été lancés au cours de la Chaire avec pour objectif de
développer des programmes multi-équipes et des partenariats stratégiques, ainsi que d’injecter des sommes
significatives dans la recherche. A ce jour, plus de 3,5 M€ ont été obtenus.

                                            PITCHER (Peritoneal Carcinomatosis Heterogeneity) est un
                                            programme conjoint de l’IAB, de l’Institut du Cancer des Hospices Civil
                                            de Lyon et du CNRS Marseille (PI : P Hainaut). Il analyse
                                            l’hétérogénéité moléculaire et cellulaire au cours du développement
                                            dans la cavité péritonéale de métastases des cancers du système
                                            digestif et de l’ovaire. PITCHER a été sélectionné pour le programme
                                            national Hétérogénéité Tumorale d’Aviesan ITMO cancer et
                                            bénéficiera d’un budget de 1,3 M€ de 2017 à 2020.

                                            ERICAN est un projet conjoint de l’IAB et du CRCL Lyon pour la
                                            Fondation MSD Avenir, sollicité par le CLARA. Il unit les forces des
                                            deux grands instituts de recherche cancer de la Région pour
                                            proposer un programme visant à comprendre comment les cellules
                                            cancéreuses s’adaptent aux contraintes du microenvironnement et
                                            du système immunitaire. Ce programme fait l’objet d’une demande
                                            de budget de 4,5 M€ sur 4 ans.

                                             P53 Metabolism est un programme entre l’IAB et le CNRS
                                             Montpellier pour développer un modèle computationnel des voies
                                             métaboliques contrôlées par p53 et de leur dérégulation dans les
                                             cancers (PI : L Le Cam, Montpellier). Ce programme est financé par
                                             l’appel d’offre Projets Libres de l’INCa à hauteur de 0,588 M€ (dont
                                             0,22 M€ à l’IAB) pour la période 2017-2019.

                                             LIFE (Is MaDE of Choices) est un projet de l’IDEX de l’UGA (Cross
                                             Discplinary Program ; PI : JL Pépin, co-PI : P Hainaut). Il vise à étudier
                                             au niveau moléculaire les déterminants environnementaux et
                                             sociaux des pathologies chroniques afin de prévenir leurs transitions
                                             vers le cancer. Financement : 1,7 M€.

                                             PatientMiner est un programme conjoint de l’UGA, de l’Université
                                             de Barcelone et de Viseo, une société basée à Grenoble (PI : P
                                             Hainaut). Financé dans le cadre de l’European Institute of Technology
                                             à hauteur de 0,49 M€, ce programme a pour but de développer un
                                             système intelligent d’analyse sémantique des données de santé
                                             (dossiers, registres) pour extraire les informations sur les trajectoires
                                             de multimorbidité.

                                             PAPHOS comprend deux programmes coordonné par ATOS et dont
                                             l’UGA est partenaire dans le cadre de l’EIT Heath (P Hainaut, JL
                                             Pépin). PAPHOS I vise à construire une plateforme « big data »
                                             interopérable de données de santé. PAHOS II a pour but d’intégrer
                                             des données de génomique sur cette plateforme. Financement en
                                             cours : 1,5 M€.
COOPÉRATIONS INTERNATIONALES

La Chaire a permis de développer des collaborations existantes et d’en développer de
nouvelles. Un effort particulier a été mené pour structurer des collaborations et des
partenariats internationaux hors Europe.
   USA Nouvelle coopération renforcée              Chine Sous l’égide du CLARA, accord de
   avec le NIH, Bethesda, pour l’étude du          collaboration avec l’Université TongJi de
   Syndrome de Li-Fraumeni et la                   Shanghai pour l’étude des cancers du
   classification des mutations de p53.            poumon.

   Brésil Continuation de collaborations              Malaisie Dans le cadre du programme
   « historiques » à Sao Paulo et Porto               Academic Icon de l’University of Malaya,
   Alegre sur le risque héréditaire de cancer         Kuala Lumpur, développement d’une
   dans la population brésilienne.                    cohorte de « cancers survivors » et suivi
                                                      de leurs pathologies chroniques .

                                 Mali Nouveau programme conjoint avec l’ICLy et
                                 la Fondation Mérieux pour l’étude des
                                 biomarqueurs des hépatites chroniques et des
                                 cancers du foie, soutenu par le programme
                                 COOPERA de la Région Auvergne-Rhône-Alpes.
LA CHAIRE COMME
UTILISATION       TREMPLIN
            DES RESSOURCES
Au terme de ces 3 années, la Chaire a mis en place un tremplin solide et est capable de
s’autofinancer pour la poursuite de ses activités. Elle a créé un socle sur lequel il est possible
de bâtir des actions d’envergure pour l’avenir de la recherche sur le cancer à Grenoble.

                                              Le premier objectif de l’après-Chaire est de
                                              porter pour le CHUGA une candidature à l’appel
                                              d’offre SIRIC de l’INCa en mai 2017. Ce programme
                                              a labellisé en 2012 8 sites de recherche intégrée à
                                              travers la France, dont 1 en région (Lyon).
                                              Grenoble proposera une candidature démarquée
                                              et originale, sur les transitions entre Pathologies
                                              Chroniques et Cancer, avec l’accent sur les
                                              interactions sociétales, la prévention, les
                                              biomarqueurs pour la détection précoce et le
                                              repositionnement des thérapies entre Pathologies
                                              Chroniques et Cancer. Ces thèmes sont en partie
                                              préfigurés dans le projet LIFE de l’IDEX.

Le deuxième objectif est de contribuer au
développement d’un projet d’Institut Hospitalo
Universitaire impulsé conjointement par le CHUGA et
l’UGA. L’IHU est une initiative du Programme des
Investissement d’Avenir pour créer de grands instituts de
formation et de recherche médicale pour promouvoir
l’innovation de rupture dans la prise en charge des
patients. Le projet grenoblois déclinera la prise en charge
multidisciplinaire de la multimorbidité et de sa transition
vers le cancer, appuyé sur l’innovation dans l’intégration
des donnés de santé, dans le développement de
biomarqueurs basés sur l’épigénomique et les approches
systémiques, et dans l’intégration des données sociales et
environnementales des trajectoires de multimorbidité et la
prévention de leurs transitions vers le cancer.

Le troisième objectif est de renforcer la dynamique de structuration du site par la prise de
leadership dans le montage de grands projets internationaux, dont les projets du programme
Horizon 2020 de l’Union Européenne. D’autre part, un programme d’attractivité sera mis en
place pour attirer sur le site des chercheurs jeunes ou confirmés soutenus par des
programmes d’excellence tels que l’ERC ou le programme ATIP-Avenir. Enfin, un travail de fond
à long terme sera initié sur la question des infrastructures de recherche et des bâtiments, afin
d’anticiper la rénovation complète de la structure immobilière de l’IAB pour au plus tard 2025.
UTILISATION DES RESSOURCES

22,5 % des ressources ont été consacrés à l’achat
d’équipement. Les acquisitions les plus significatives
sont un appareil SeaHorse XP96 pour la réalisation
d’études du métabolisme cellulaire et une rampe
d’équipement d’automatisation pour la mise en
routine de l’analyse génétique par séquençage à haut
débit sur la Plateforme de Génétique des Cancer de
l’Arc Alpin au CHUGA. D’autres équipements ont été
acquis pour le montage du laboratoire (petits
équipements, microscopes, congélateurs).

                                                       27,9 % des ressources ont été
                                                       dépensées en frais de fonctionnement,
                                                       comprenant des consommables de
                                                       laboratoire, des frais de déplacement et
                                                       de voyage, et l’accueil de visiteurs. Une
                                                       partie de ce budget a été consacrée à la
                                                       communication et au redéveloppement
                                                       de l’image de l’IAB, notamment en
                                                       faisant appel à un prestataire extérieur
                                                       pour aider à repenser l’image et la
                                                       signature de l’Institut.

50 % de la dotation globale de la Chaire a été
consacrée à l’engagement de personnels en CDD.
Un ingénieur a été recruté dès le début de la Chaire   Amélie Fauconnet, Chargée de la Com à l’IAB,
                                                       en pleine communication avec les médias
pour mettre en place le laboratoire et structurer la
logistique de l’équipe et mener des projets de
recherche sur P53 et ses isoformes (Sandrine
Blanchet). Un second ingénieur (Renaud
Blervaque) a été engagé pour développer des
projets translationnels en génomique. Deux jeunes
chercheurs ont complété l’équipe : Mme Amina
Amadou Yacouba, épidémiologiste moléculaire et
M. Nathanaël Lemonnier, biologiste des systèmes.
La Chaire a également contribué aux gratifications
de plusieurs stagiaires.
                                                       Sandrine Blanchet et Pierre Hainaut se
                                                       penchent sur de nouvelles expériences.
RÉSULTATS MARQUANTS ET PUBLICATIONS

                           JTO, 2016 Démonstration clinique dans une grande
                           étude internationale de la valeur prédictive des
                           mutations de TP53 pour la réponse des cancers du
                           poumon à la chimiothérapie par le cisplatine.

                           CSH Press, 2016 Première synthèse internationale de
                           l’interprétation des mutations de TP53 à la lumière des
                           données pan-génomiques.

                           GenesDev, 2016 Démonstration par Nicolas Reynoird
                           du rôle des méthyltransférases dans la coordination de
                           la réponse au stress et dans le développement du
                           cancer du pancréas.

                           Cancer Prev Res, 2016 La détection dans le sang de
                           l’ostéopontine, une protéine de la matrice
                           extracellulaire, permet de prédire le risque de cancer du
                           foie 2 à 6 ans avant le diagnostic clinique du cancer.

                           PNAS, 2015 L’application au cancer d’une technique
                           d’analyse issue des géosciences révèle des variations
                           isotopiques caractérisant les cancers du foie et
                           décelables dans le sang.

                           PNAS, 2014 La première application du séquençage
                           complet du génome dans le Syndrome de Li-Fraumeni
                           révèle de nouveaux mécanismes de transmission du
                           risque lié aux mutations de TP53.
chinks in the armor of cancer: potential for new
    2017                                                     therapies. Curr Opin Oncol 29, 33-34.
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PIERRE HAINAUT

Professeur, Biologie du cancer, Université Grenoble Alpes
Directeur, Institut pour l’Avancée des Biosciences (Centre de recherche UGA /
Inserm 1209 / CNRS 5309)
Responsable de l’équipe Pathologie Moléculaire des Cancers et Biomarqueurs

Pierre HAINAUT, né en 1958 en Belgique, est docteur en biologie de l'Université de Liège en
Belgique en 1987. Après des post-doctorats en France et au Royaume-Uni (1988-1994), il rejoint
l'Agence Internationale de Recherche sur le Cancer (IARC, Organisation mondiale de la santé) en
1994, où il a occupé le poste de responsable de la carcinogenèse moléculaire de 1999 à 2011. En
2012, il a rejoint l'Institut International de Recherche sur la Prévention (IPRI) en tant que directeur
de recherche. Depuis 2014, a été nommé Professeur de Biologie du Cancer et titulaire de la Chaire
d'Excellence en Recherche Translationnelle à l'Université Grenoble Alpes.

Depuis octobre 2014, il est Directeur de l'Institut pour l’Avancée des Biosciences (anciennement
Institut Albert Bonniot), un centre de recherche multi-thématique dédié à l'épigénétique, aux
maladies chroniques et au cancer. Il est également responsable de la Plateforme de génétique
moléculaire des Cancers de l’Arc Alpin au Centre Hospitalier Universitaire Grenoble Alpes.

Ses recherches portent sur les mutations TP53 et sur les biomarqueurs dans la transition des
maladies chroniques vers le cancer. De 1994 à 2011, il a dirigé le développement de la base de
données internationale du CIRC sur les mutations TP53, une source d'information sur les causes
et les conséquences des mutations affectant la protéine suppresseur de p53 dans le cancer.

Ses recherches actuelles portent sur les effets de gain de fonction dans le cancer du poumon et
sur les biomarqueurs pour la détection précoce des cancers du foie et du poumon, en particulier
dans les pays à faibles ressources. Pierre Hainaut est l'auteur de plus de 400 publications et de
50 chapitres de livres (h index: 83, Google Scholar).

Pierre HAINAUT a coédité deux livres sur p53 («25 ans de recherche p53» 2005, 2007, «p53 dans
les cliniques», Springer) et un manuel d'épidémiologie moléculaire («épidémiologie moléculaire:
principe et pratique», IARC Press, 2011 ).
Chaire d’Excellence en
                  Recherche Translationnelle

                   Pr. Pierre HAINAUT
                   Directeur
                   Institut pour l’Avancée des Biosciences
                   Site santé – Allée des Alpes
                   38700 La Tronche
                   Tél. 04 76 54 94 09
                   pierre.hainaut@univ-grenoble-alpes.fr

Pr. Pierre HAINAUT
Directeur
Institut pour l’Avancée des Biosciences
Site santé – Allée des Alpes
38700 La Tronche
Tél. + 33 (0) 4 76 54 94 63
pierre hainaut@univ grenoble alpes fr
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