Congrès SFPMed 2020 - La Rosière

 
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Imagerie HyperSpectrale Médicale (MHSI)

                             Sommaire
                             • Introduction
                             • Principes
                             • Applications médicales
                                  ▪   Cancérologie
                                  ▪   Dermatologie
                                  ▪   Ophtalmologie
                                  ▪   Chirurgie guidée par l’image
                                  ▪   Oxymétrie de surface

Marc Faucheux                • Conclusions
Pas de conflit d’intérêt

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Introduction
▪ L’Imagerie HyperSpectrale (MHSI) ou Multispectrale est une modalité émergente dans le domaine médical.
   (Premier article en 1988, développements depuis 2004).

▪ Contrairement aux autres technologies d’imageries qui utilisent une seule longueur d’onde ou du RGB, HSI
   permet d’obtenir le spectre emis pour chaque point imagé de la ROI.

▪ Chaque image contient des data en 3D : 1 dimension spectrale et 2 dimensions spatiales.

▪ Les récentes avancées technologiques : des cameras hyperspectrales, des méthodes d’analyse d’images et
   les puissances de calculs atteintes aujourd’hui, permettent le développement d’outils de diagnostic
   medical.

▪ C’est une modalité label free, non ionisante et non invasive.

▪ HSI représente autour de 10 % du marché de l’imagerie optique médicale (> 2 B$)
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Introduction
▪ Quand on envoie de la lumière sur les tissus elle se propage et subit de la diffusion par les
  inhomogénéités des structures biologiques rencontrées et de l’absorption par les
  chromophores presents.
▪ L’absorption, la fluorescence et la diffusion, sont caractéristiques d’un tissue pathologique,
  sont différentes d’un tissu sain et changent au cours de l’evolution d’une maladie.
➢ La lumière refléchie, diffuse, transmise et de fluorescence du tissu, capturée par HSI
  contient des informations qualitatives et quantitatives de diagnostic de la maladie et de son
  evolution.
▪ Les images spectrales résolues spatialement produisent des informations tissulaire de :
   ▪ Morphologie
   ▪ Composition
   ▪ Physiologie.

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Principe
Chaque pixel du détecteur 2D collecte un spectre découpé en un grand nombre de bandes spectrales.

HSI génère un ensemble 3D de data spatiale et spectrale.

Après traitement on obtient en chaque point de l’image un spectre complet qui reflète l’interaction de la
lumière avec le tissu .

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Principe

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Principe

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Introduction
                                                 Whiskbroom       Pushbroom         Staring              Snapshot
Comparaison :
                Scanning                           2D spatial     1 D Spatial      1D Spectral               0

                Largeur spectrale détectée            +++            +++               ++                   +++

                Sélection de l                        non            non               oui                non/oui

                Résolution Spat et Spect              +++            +++               ++                    +

                Nombre de bandes spect.              Hyper          Hyper         Hyper/ Multi             Multi

                Temps d'acquisition datacube         long            long            moyen                 court

                Complexité du système                 +++            +++               ++                    +

                Coût                                   +              +               +++            ++ /+++ si l fixées

                Couplage optique                  camera lens     camera lens      camera lens         fundus camera
                                                  microscope      microscope    endoscope, µscope    endoscope, µscope
                                                                                   colposcope
                                                 Laser scanning                                     résolution temporelle

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Applications médicales
▪ L’Imagerie HyperSpectrale Médicale (MHSI) est essentiellement utilisée pour du
  diagnostic précoce de différents cancers, de la chirurgie guidée par l’image (niveau de
  sanguin et saturation en oxygène), du test pour infection des fluides (urine, sang,
  sperme) et pour des pathologies dentaires.

▪ Il est nécessaire d’avoir la signature spectrale des fluides et tissus sains.

▪ Nombreuses études dans le visible et maintenant dans le proche IR, technologies
  « Pushbroom », « Starring » et « Snapshot » avec des détecteurs CCD, CMOS et InGaAs,
  plus rares dans l’IR avec des détecteurs refroidis HgCdTe ou microbolomètre.

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Applications médicales
MHSI uses have been reported * or been suggested in braintissue
metabolic and hemodynamic monitoring, red blood cell counting,
histopathology and cytology, dermatology, pressure ulcers, colorectal
and gastric cancer, residual tumor identification during surgery,
cervical cancer, burn wounds, diabetic foot, tumor hypoxia, skin
cancer, hemorrhagic shock, skin bruises, ophthalmology, laparoscopic
surgery, intestinal ischemia, endoscopy, atherosclerosis, prostate
cancer, laryngeal disorders, cholecystectomy, ovarian cancer,
leucocytepathology, and nerve fiber identification.

* M. West et al., MITRE Technical report, 2019

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Applications médicales : Cancérologie
                                                               “In-Vivo and Ex-Vivo Tissue Analysis through Hyperspectral
                                                               Imaging Techniques: Revealing the Invisible Features of
                                                               Cancer”,M. Halicek et al., Cancers, (2019), 11, 756

✓ In Vitro exclus
                                                                                   “Hyperspectral data processing
                                                                                   improves PpIX contrast during
                                                                                   fluorescence guided surgery of
                                                                                   human brain tumors”, J.J. Bravo et
                                                                                   al.,Nature Scientific Report, 7:
                                                                                   9455, 2017

                               Col utérus           In vivo (Human)

                                                                                    Résultats : Open data base de HSI

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Applications médicales : Cancérologie
▪ Col de l’utérus (CIN) : HSI (avec illumination UV Vis) permet de détecter :
    ▪ Une augmentation de la vascularisation des vaisseaux subsurface

    ▪ Une diffusion anormale des cellules de l’épithélium

    * Etude clinique ancienne avec large panel, système « bricolé », images d’autofluorescence, ils obtienent
    une discrimination entre situation normale et cancéreuse (avec graduation) avec un bon SNR. et ainsi
    choisir les endroits de biopsie.

    ➢ Faisabilité et intérêt de MHI démontré

* « Multispectral digital colposcopy for in vivo detection of cervical cancer »J.M. Benavides et al., Optics Express, V 11,N10,
2003

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Applications médicales : Cancérologie

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Applications médicales : Cancérologie
▪ Plus récemment une étude pilote** (100 patientes) avec un appareil « LuViva » de Guided Therapeutics ,
    Détection de fluorescence et réflectance dans trois régions spectrales : 340 nm; 400 nm; 460 nm, sans
    utilisation d’acide acétique, temps de procédure : 1’, puis comparaison avec gold standard (VIA et Pap).

▪ Gold Standard : 26/100 anormal Pap (frottis), 37 positive VIA, 37 normal Pap

▪ HSI en situation clinique :
     ▪ Sensibilité de 92,3 % pour détection de lésions pré cancéreuses,

     ▪ Réduit de 37% des colposcopies et biopsies non nécessaires sans faux négatifs,

     ▪ Permet de différencier les VIA + des Pap -, avec une sensibilité de 81% et spécificité de 66%,

     ➢ Plus grand échantillon nécessaire pour conclure améliorer la calibration de l’appareil.

** « Multimodal hyperspectroscopy screening in women at risk of cervical cancer : results of a pilot study in a
developping country » O.A. Awolude et al;, Tropical Journal of Obstetric & Gynecology, V34, Issue 2, May-August 2017

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Applications médicales : Cancérologie

Guided is currently working on a planned, future application for
LuViva in early detection of cervical intraepithelial neoplasia
(CIN) that retains high true positive predictive rates while
                                                                   « LuViva » de Guided Therapeutics
reducing false positives. This figure compares a (top) normal
                                                                   marqué CE (2012), CFDA (2020),
colposcopy image and corresponding color map showing lack of
                                                                   Russie et Moyen Orient) FDA en
disease ("cool" colors) with a (bottom) colposcopy image
                                                                   cours
showing cervical dysplasia (CIN 3) and corresponding color map
based on spectroscopy results that correctly identifies both the
CIN ("hot" colors) and normal tissue.

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Applications médicales : mélanome
▪ Classifier avec MHSI les lésions n’est pas meilleur que les dermatologues avec techniques classiques (dermatoscopie
 RGB). Néanmoins HSI devrait apporter un plus, car on peut observer avec des l non visibles à l’oeil nu.
                                                                   * Figure 7 shows a gray scale image of a field of view of
                                                                   a melanoma lesion and example transmission spectra
                                                                   taken from within a nucleus and also interstitial areas.
                                                                   *"Differentiation of normal skin and melanoma using high resolution
                                                                   hyperspectral imaging," D.T. Dicker et al.,Cancer Biology & Therapy 5:8,
                                                                   1033-1038, August 2006

➢ Mais on manque de large datacube processing de bonne qualité et de méthodes statistiques de traitement des
   données, de deep learning etc… pour exploiter toute la richesse des infos des images hyperspectrales.

▪ Revenio group (Finlande) développe sous licence VTT un produit portable « Cutica »
pour détection des cancers de la peau, en test clinique, pas encore certifié ( 3 ans).
▪ A comparer avec Vivascope (réflectance confocale)

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Applications médicales : Rétine
▪ Un mapping de la saturation en oxygène des vaisseaux révèle les zones ischémiques dues
    au diabète ou des occlusions de vaisseaux (=> perte de vue).

▪ Classiquement les systèmes requiert plusieurs secondes d’acquisition (> 5s) une étude *
    (JPL,Caltech, 2 patients) utilisant     :
    ▪ Un système HSI snapshot dont le temps d’acquisition pour le data cube est 3 ms éliminant les artefacts
        de mouvements (dus aux mvts rapides de l’œil et forte illumination),

    ▪ 50 bandes spectrales entre 450 et 700 nm,

    ▪ Le système est couplé à une caméra fond d’œil.

    ▪ Algorithme de calibration et de traitement sophistiqué.
* William R. Johnson, Daniel W. Wilson, Wolfgang Fink, Mark S. Humayun M.D., and Gregory H. Bearman "Snapshot hyperspectral imaging in
ophthalmology," Journal of Biomedical Optics 12(1), 014036 (1 January 2007)

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Applications médicales : Rétine

                                        Spatial oxygen saturation maps. (a) Healthy
                                        male (29 years old) oxygen saturation map.
                                        Vascular separation from the background is
                                        seen as well as reasonable saturation values
                                        for veins versus arteries. (b) Zero-order color
                                        image. (c) Healthy male (58 years old)
                                        oxygen saturation map. (d) Zero-order color
                                        images.

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Applications médicales : Rétine
▪ une autre étude récente * (JPL,Caltech, 12 patients) utilisant : un système HSI snapshot (Techno Bayer par
    IMEC)

*Joel Kaluzny, Hao Li, Wenzhong Liu, Peter Nesper, Justin Park, Hao F. Zhang& Amani A. Fawzi (2016): Bayer Filter Snapshot Hyperspectral Fundus Camera for
HumanRetinal Imaging, Current Eye Research

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Applications médicales : Rétine

Visualization of hyperspectral datacube with false coloring applied to emphasize the different channels (50° field of view)

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Applications médicales : Rétine
Segmentation et mesure
de la saturation en oxygène
erreur moyenne sur 6 mesures
à 5’ d’intervalle : 1,4%

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Applications médicales : Rétine
On peut aussi obtenir la densité optique des pigments maculaires

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Applications médicales : Rétine
• Autre étude *
Résultats prometteurs d’une étude sur 19 patients (de MCI divers) pour détection précoce d’Alzheimer par HSI par analyse
 de la présence de biomarker (protéine spécifique présente dans la rétine avant que des plaques se forment dans le cerveau)
* “In Vivo Assessment of Retinal Biomarkers by Hyperspectral Imaging: Early Detection of Alzheimer’s Disease”,
More, S.S., et al. (2019) ACS Chemical Neuroscience

 • Produit en développement avec machine learning chez Retispec ,
 examen rapide (qq s) et peu couteux, évaluation clinique Toronto et Israël

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Applications médicales : chirurgie guidée par l’imagerie
▪ MHSI dans le proche IR peut aider le chirurgien à voir les tissus sous jacent à une couche
    de sang pendant l’opération notamment en microchirurgie
▪ MHSI facilite la détection de tumeur résiduelle car elle permet la distinction entre tissus
    sains et cancéreux.
▪ MHSI peut monitorer (3 image/s) le flux sanguin et la saturation en oxygène durant
    l’opération pour éviter la résection de tissus viables durant une résection de tumeur.
▪ MHSI a été explorée durant des chirurgies de : mastectomie, vésicule biliaire,
    néphrectomie, rénale, abdominale et intestinale.
▪ MHSI permet la visualisation de l’anatomie du réseau vasculaire et des organes.
« Medical hyperspectral imaging : a review » , G. Lu & B. Fei, Journal of Biomedical Optics 19(1), (1 January 2014)

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Applications médicales : chirurgie guidée par l’imagerie

                                                                                      Etude * sur 56 rats avec tumeur du sein inoculées
                                                                                      histopathologies sur 224 examens
                                                                                      Résultats : sensibilité 86 %, spécificité : 90-94 %

* « Medical hyperspectral imaging identifies residual tumor» , S.V. Panasyuk et al., Cancer Biology & Therapy, V6, Issue 3, 2007

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Applications médicales : chirurgie guidée par l’imagerie

▪ Beaucoup d’études in vivo sur modèle animal et ex vivo sur analyse de tissus ont montré
  l’intérêt de HSI intra-opérative.

▪ HSI in vivo peu nombreuses études mais capacités démontrées.

▪ Pour utilisation de routine en clinique, il faut s’intégrer aisément dans le work flow
  chirugical.

▪ Les développement technologiques de miniaturisation et l’amélioration de la robustesse
  devraient le permettre.

                       Congrès SFPMed 2020 – La Rosière 26
Applications médicales : Oxymétrie de surface

▪ Déterminer la perfusion d’oxyhémoglobine, le flux sanguin .

▪ Besoin pour cicatrisation (ulcère diabétique), chirurgie reconstructive, ischémie des
  membres, amputation…

▪ Besoin d’un système « point of care » :
   ▪ sans contact,

   ▪ sans injection,

   ▪ portable et léger,

   ▪ facile d’utilisation,

   ▪ robuste.
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Applications médicales : Oxymétrie de surface
▪ Système « Hyperview » de HyperMed

FDA cleared 2017
CE Mark 2018

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Conclusions

   –   Non ou mini invasive                                      Faible pénétration
   –   Non ionisante (/ Rayons X, gamma, nucléaire)              Validations d’algorithmes nécessaires
   –   Label free                                                Etudes cliniques et homologations couteuses
   –   Imagerie ex vivo, in vitro et in vivo                     Nouvelle technologie doit convaincre / Techno existantes
   –   Appareils petits, peu couteux?                                      Peu de produits certifiés pour la clinique
   –   Appareils « points of care »                              Appareils spécifiques pour chaque application

• Futur :
   –   Miniaturisation
   –   Bandes spectrales dans l’IR
   –   Combinaison de modalité, déjà montrée
   –   Deep & machine learning pour diagnostic amélioré
   –   Baisse des coûts des détecteurs due aux autres marchés plus porteurs

                                Congrès SFPMed 2020 – La Rosière 29
Conclusions

✓ L’Imagerie HyperSpectrale Médicale est une technique optique qui apporte beaucoup d’informations sur les
  tissus investigués.

✓ Beaucoup d’études dans des applications nombreuses, mais encore peu de produits.

✓ L’utilisation de cette modalité d’imagerie optique et l’arrivée sur le marché médical de nombreux produits
  dans les années qui viennent sont conditionnées par :
   – Le bon choix de la technologie hyperspectrale,
   – L’amélioration et la validation des algorithmes de traitement des données acquises,
   – Deep / machine learning
   – Le ratio coût / service rendu par rapport aux autres modalités optiques.

                              Congrès SFPMed 2020 – La Rosière 30
OCT
Autres domaines : Cardiologie

                                           Dr. Attizzani, University Hospitals in Cleveland   C7-XR OCT from LightLab Imaging Inc.

Dentaire

                                                                                              H.Schneider et al., Appl. Sci.2017,7, 472

                                Congrès SFPMed 2020 – La Rosière 31
Microscopie confocale endoscopique

                                           Coupe histologique d'épiderme marquée
                                           - en bleu, marquage des noyaux avec un intercalant de l'ADN, le DAPI
                                           - en vert, immunomarquage d'une protéine associée aux corps lamellaires
                                           - en rouge, immunomarquage de l'intégrine alpha6 au niveau de la couche
                                           basale
                                           R. Nachat-Kappes , 2010

                                                        Très faible pénétration
                                                        Grande résolution (qq 100 nm)
Noyau de cellules de glandes salivaires
                                                        Label free ou pas
Pas de 4 µ, barre= 10 µ                                 Sélectif
M. Robert-Nicoad et al;
Max Planck Institut, Gottingen
                 Congrès SFPMed 2020 – La Rosière 32
Microscopie confocale endoscopique
Microscopie confocale endoscopique

      « Optical Biopsy of Human Bladder Neoplasia With In Vivo Confocal
      Laser Endomicroscopy »
      G. Sonn et al., Journal of Urology, V 182, Issue 4, 2009, 1299-1305

                                        Congrès SFPMed 2020 – La Rosière 33
Tomographie Optique Diffuse (DOT)

A cranial ultrasound of a preterm infant revealing a left-sided
intraventricular hemorrhage and hemorrhagic parenchymal
infarct. (c) A three-dimensional DOT
image taken at a coronal section of the same preterm infant
showing regional blood volume (left) and oxygen saturation
(right). There is an increase in hemoglobin concentration and
decrease in oxygen saturation in the area corresponding to the
hemorrhage and infarct.
  “Diffuse optical tomography to investigate the newborn brain”,
  C.W. Lee etal., Pediatric Research volume 82, pages 376–386 (2017)
                                  Congrès SFPMed 2020 – La Rosière 34
Tomographie Optique Diffuse (DOT)
Cancer du sein

                                                                          Instrumental setup for the diffuse optical
                                                                          tomography (DOT) system, and DOT
                                                                          images acquired from a 53-year-old
                                                                          woman with a 2.2-cm (longest dimension)
                                                                          invasive ductal carcinoma. Bottom left
                                                                          depicts a three-dimensional tumor region
                                                                          (red). The images of rHb, rHbO 2 and rStO
                                                                          2 are for relative (i.e., tumor-to-normal
                                                                          ratio) deoxyhemoglobin and
                                                                          oxyhemoglobin concentration and tissue
                                                                          oxygenation, respectively. Black solid line
                                                                          in the images indicates the region
                                                                          identified as tumor. FD frequency domain,
                                                                          CCD charge-coupled-device camera

                 Forte pénétration
                 Label free                              “Macroscopic optical physiological parameters correlate with
                 Sélectif                                microscopic proliferation and vessel area breast cancer signatures”
                                                         S.H. Chung et al;, May 2015,Breast cancer research: BCR 17(1):72
                 Fonctionnelle
                 Faible résolution (cm)
                             Congrès SFPMed 2020 – La Rosière 35
Photo-Acoustique

Congrès SFPMed 2020 – La Rosière 36
Photo-Acoustique

Congrès SFPMed 2020 – La Rosière 37
Photo-Acoustique

Congrès SFPMed 2020 – La Rosière 38
Photo-Acoustique

Congrès SFPMed 2020 – La Rosière 39
Conclusions
               Lateral resolution vs penetration depth of several imaging techniques

Note: X-rays does not appear on the graph as they penetrate the whole body

                      Congrès SFPMed 2020 – La Rosière 40
Conclusions

Hyperspectral imaging is an optical method that provides a large amount of information
about the investigated object. Many of the articles show very promising results. It is clear
that choosing the appropriate hyperspectral imaging system for each medical field,
together with the most reliable hyperspectral image processing methods, are the main
goals of future studies, before hyperspectral imaging becomes a widely applicable
evaluation method in medicine.

The technology to create portable, snapshot hyperspectral cameras is already here. It will
onlybe a few years before the technology will appear in commercial devices, such as cell
phone andpalm-sized cameras.

                   Congrès SFPMed 2020 – La Rosière 41
Conclusions
• IOM bien placée :
  –   Pour le diagnostic (peut remplacer certaines biopsies)
  –   pour le screening (/mammographies Rx) et le monitoring des thérapies (biopsies)
  –   pour guidage des opérations
  –   Pour la théragnostic

                        Congrès SFPMed 2020 – La Rosière 42
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