Congrès SFPMed 2020 - La Rosière
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Imagerie HyperSpectrale Médicale (MHSI) Sommaire • Introduction • Principes • Applications médicales ▪ Cancérologie ▪ Dermatologie ▪ Ophtalmologie ▪ Chirurgie guidée par l’image ▪ Oxymétrie de surface Marc Faucheux • Conclusions Pas de conflit d’intérêt Congrès SFPMed 2020 – La Rosière 2
Introduction ▪ L’Imagerie HyperSpectrale (MHSI) ou Multispectrale est une modalité émergente dans le domaine médical. (Premier article en 1988, développements depuis 2004). ▪ Contrairement aux autres technologies d’imageries qui utilisent une seule longueur d’onde ou du RGB, HSI permet d’obtenir le spectre emis pour chaque point imagé de la ROI. ▪ Chaque image contient des data en 3D : 1 dimension spectrale et 2 dimensions spatiales. ▪ Les récentes avancées technologiques : des cameras hyperspectrales, des méthodes d’analyse d’images et les puissances de calculs atteintes aujourd’hui, permettent le développement d’outils de diagnostic medical. ▪ C’est une modalité label free, non ionisante et non invasive. ▪ HSI représente autour de 10 % du marché de l’imagerie optique médicale (> 2 B$) Congrès SFPMed 2020 – La Rosière 3
Introduction ▪ Quand on envoie de la lumière sur les tissus elle se propage et subit de la diffusion par les inhomogénéités des structures biologiques rencontrées et de l’absorption par les chromophores presents. ▪ L’absorption, la fluorescence et la diffusion, sont caractéristiques d’un tissue pathologique, sont différentes d’un tissu sain et changent au cours de l’evolution d’une maladie. ➢ La lumière refléchie, diffuse, transmise et de fluorescence du tissu, capturée par HSI contient des informations qualitatives et quantitatives de diagnostic de la maladie et de son evolution. ▪ Les images spectrales résolues spatialement produisent des informations tissulaire de : ▪ Morphologie ▪ Composition ▪ Physiologie. Congrès SFPMed 2020 – La Rosière 4
Principe Chaque pixel du détecteur 2D collecte un spectre découpé en un grand nombre de bandes spectrales. HSI génère un ensemble 3D de data spatiale et spectrale. Après traitement on obtient en chaque point de l’image un spectre complet qui reflète l’interaction de la lumière avec le tissu . Congrès SFPMed 2020 – La Rosière 5
Introduction Whiskbroom Pushbroom Staring Snapshot Comparaison : Scanning 2D spatial 1 D Spatial 1D Spectral 0 Largeur spectrale détectée +++ +++ ++ +++ Sélection de l non non oui non/oui Résolution Spat et Spect +++ +++ ++ + Nombre de bandes spect. Hyper Hyper Hyper/ Multi Multi Temps d'acquisition datacube long long moyen court Complexité du système +++ +++ ++ + Coût + + +++ ++ /+++ si l fixées Couplage optique camera lens camera lens camera lens fundus camera microscope microscope endoscope, µscope endoscope, µscope colposcope Laser scanning résolution temporelle Congrès SFPMed 2020 – La Rosière 8
Applications médicales ▪ L’Imagerie HyperSpectrale Médicale (MHSI) est essentiellement utilisée pour du diagnostic précoce de différents cancers, de la chirurgie guidée par l’image (niveau de sanguin et saturation en oxygène), du test pour infection des fluides (urine, sang, sperme) et pour des pathologies dentaires. ▪ Il est nécessaire d’avoir la signature spectrale des fluides et tissus sains. ▪ Nombreuses études dans le visible et maintenant dans le proche IR, technologies « Pushbroom », « Starring » et « Snapshot » avec des détecteurs CCD, CMOS et InGaAs, plus rares dans l’IR avec des détecteurs refroidis HgCdTe ou microbolomètre. Congrès SFPMed 2020 – La Rosière 9
Applications médicales MHSI uses have been reported * or been suggested in braintissue metabolic and hemodynamic monitoring, red blood cell counting, histopathology and cytology, dermatology, pressure ulcers, colorectal and gastric cancer, residual tumor identification during surgery, cervical cancer, burn wounds, diabetic foot, tumor hypoxia, skin cancer, hemorrhagic shock, skin bruises, ophthalmology, laparoscopic surgery, intestinal ischemia, endoscopy, atherosclerosis, prostate cancer, laryngeal disorders, cholecystectomy, ovarian cancer, leucocytepathology, and nerve fiber identification. * M. West et al., MITRE Technical report, 2019 Congrès SFPMed 2020 – La Rosière 10
Applications médicales : Cancérologie “In-Vivo and Ex-Vivo Tissue Analysis through Hyperspectral Imaging Techniques: Revealing the Invisible Features of Cancer”,M. Halicek et al., Cancers, (2019), 11, 756 ✓ In Vitro exclus “Hyperspectral data processing improves PpIX contrast during fluorescence guided surgery of human brain tumors”, J.J. Bravo et al.,Nature Scientific Report, 7: 9455, 2017 Col utérus In vivo (Human) Résultats : Open data base de HSI Congrès SFPMed 2020 – La Rosière 11
Applications médicales : Cancérologie ▪ Col de l’utérus (CIN) : HSI (avec illumination UV Vis) permet de détecter : ▪ Une augmentation de la vascularisation des vaisseaux subsurface ▪ Une diffusion anormale des cellules de l’épithélium * Etude clinique ancienne avec large panel, système « bricolé », images d’autofluorescence, ils obtienent une discrimination entre situation normale et cancéreuse (avec graduation) avec un bon SNR. et ainsi choisir les endroits de biopsie. ➢ Faisabilité et intérêt de MHI démontré * « Multispectral digital colposcopy for in vivo detection of cervical cancer »J.M. Benavides et al., Optics Express, V 11,N10, 2003 Congrès SFPMed 2020 – La Rosière 12
Applications médicales : Cancérologie Congrès SFPMed 2020 – La Rosière 13
Applications médicales : Cancérologie ▪ Plus récemment une étude pilote** (100 patientes) avec un appareil « LuViva » de Guided Therapeutics , Détection de fluorescence et réflectance dans trois régions spectrales : 340 nm; 400 nm; 460 nm, sans utilisation d’acide acétique, temps de procédure : 1’, puis comparaison avec gold standard (VIA et Pap). ▪ Gold Standard : 26/100 anormal Pap (frottis), 37 positive VIA, 37 normal Pap ▪ HSI en situation clinique : ▪ Sensibilité de 92,3 % pour détection de lésions pré cancéreuses, ▪ Réduit de 37% des colposcopies et biopsies non nécessaires sans faux négatifs, ▪ Permet de différencier les VIA + des Pap -, avec une sensibilité de 81% et spécificité de 66%, ➢ Plus grand échantillon nécessaire pour conclure améliorer la calibration de l’appareil. ** « Multimodal hyperspectroscopy screening in women at risk of cervical cancer : results of a pilot study in a developping country » O.A. Awolude et al;, Tropical Journal of Obstetric & Gynecology, V34, Issue 2, May-August 2017 Congrès SFPMed 2020 – La Rosière 14
Applications médicales : Cancérologie Guided is currently working on a planned, future application for LuViva in early detection of cervical intraepithelial neoplasia (CIN) that retains high true positive predictive rates while « LuViva » de Guided Therapeutics reducing false positives. This figure compares a (top) normal marqué CE (2012), CFDA (2020), colposcopy image and corresponding color map showing lack of Russie et Moyen Orient) FDA en disease ("cool" colors) with a (bottom) colposcopy image cours showing cervical dysplasia (CIN 3) and corresponding color map based on spectroscopy results that correctly identifies both the CIN ("hot" colors) and normal tissue. Congrès SFPMed 2020 – La Rosière 15
Applications médicales : mélanome ▪ Classifier avec MHSI les lésions n’est pas meilleur que les dermatologues avec techniques classiques (dermatoscopie RGB). Néanmoins HSI devrait apporter un plus, car on peut observer avec des l non visibles à l’oeil nu. * Figure 7 shows a gray scale image of a field of view of a melanoma lesion and example transmission spectra taken from within a nucleus and also interstitial areas. *"Differentiation of normal skin and melanoma using high resolution hyperspectral imaging," D.T. Dicker et al.,Cancer Biology & Therapy 5:8, 1033-1038, August 2006 ➢ Mais on manque de large datacube processing de bonne qualité et de méthodes statistiques de traitement des données, de deep learning etc… pour exploiter toute la richesse des infos des images hyperspectrales. ▪ Revenio group (Finlande) développe sous licence VTT un produit portable « Cutica » pour détection des cancers de la peau, en test clinique, pas encore certifié ( 3 ans). ▪ A comparer avec Vivascope (réflectance confocale) Congrès SFPMed 2020 – La Rosière 16
Applications médicales : Rétine ▪ Un mapping de la saturation en oxygène des vaisseaux révèle les zones ischémiques dues au diabète ou des occlusions de vaisseaux (=> perte de vue). ▪ Classiquement les systèmes requiert plusieurs secondes d’acquisition (> 5s) une étude * (JPL,Caltech, 2 patients) utilisant : ▪ Un système HSI snapshot dont le temps d’acquisition pour le data cube est 3 ms éliminant les artefacts de mouvements (dus aux mvts rapides de l’œil et forte illumination), ▪ 50 bandes spectrales entre 450 et 700 nm, ▪ Le système est couplé à une caméra fond d’œil. ▪ Algorithme de calibration et de traitement sophistiqué. * William R. Johnson, Daniel W. Wilson, Wolfgang Fink, Mark S. Humayun M.D., and Gregory H. Bearman "Snapshot hyperspectral imaging in ophthalmology," Journal of Biomedical Optics 12(1), 014036 (1 January 2007) Congrès SFPMed 2020 – La Rosière 17
Applications médicales : Rétine Spatial oxygen saturation maps. (a) Healthy male (29 years old) oxygen saturation map. Vascular separation from the background is seen as well as reasonable saturation values for veins versus arteries. (b) Zero-order color image. (c) Healthy male (58 years old) oxygen saturation map. (d) Zero-order color images. Congrès SFPMed 2020 – La Rosière 18
Applications médicales : Rétine ▪ une autre étude récente * (JPL,Caltech, 12 patients) utilisant : un système HSI snapshot (Techno Bayer par IMEC) *Joel Kaluzny, Hao Li, Wenzhong Liu, Peter Nesper, Justin Park, Hao F. Zhang& Amani A. Fawzi (2016): Bayer Filter Snapshot Hyperspectral Fundus Camera for HumanRetinal Imaging, Current Eye Research Congrès SFPMed 2020 – La Rosière 19
Applications médicales : Rétine Visualization of hyperspectral datacube with false coloring applied to emphasize the different channels (50° field of view) Congrès SFPMed 2020 – La Rosière 20
Applications médicales : Rétine Segmentation et mesure de la saturation en oxygène erreur moyenne sur 6 mesures à 5’ d’intervalle : 1,4% Congrès SFPMed 2020 – La Rosière 21
Applications médicales : Rétine On peut aussi obtenir la densité optique des pigments maculaires Congrès SFPMed 2020 – La Rosière 22
Applications médicales : Rétine • Autre étude * Résultats prometteurs d’une étude sur 19 patients (de MCI divers) pour détection précoce d’Alzheimer par HSI par analyse de la présence de biomarker (protéine spécifique présente dans la rétine avant que des plaques se forment dans le cerveau) * “In Vivo Assessment of Retinal Biomarkers by Hyperspectral Imaging: Early Detection of Alzheimer’s Disease”, More, S.S., et al. (2019) ACS Chemical Neuroscience • Produit en développement avec machine learning chez Retispec , examen rapide (qq s) et peu couteux, évaluation clinique Toronto et Israël Congrès SFPMed 2020 – La Rosière 23
Applications médicales : chirurgie guidée par l’imagerie ▪ MHSI dans le proche IR peut aider le chirurgien à voir les tissus sous jacent à une couche de sang pendant l’opération notamment en microchirurgie ▪ MHSI facilite la détection de tumeur résiduelle car elle permet la distinction entre tissus sains et cancéreux. ▪ MHSI peut monitorer (3 image/s) le flux sanguin et la saturation en oxygène durant l’opération pour éviter la résection de tissus viables durant une résection de tumeur. ▪ MHSI a été explorée durant des chirurgies de : mastectomie, vésicule biliaire, néphrectomie, rénale, abdominale et intestinale. ▪ MHSI permet la visualisation de l’anatomie du réseau vasculaire et des organes. « Medical hyperspectral imaging : a review » , G. Lu & B. Fei, Journal of Biomedical Optics 19(1), (1 January 2014) Congrès SFPMed 2020 – La Rosière 24
Applications médicales : chirurgie guidée par l’imagerie Etude * sur 56 rats avec tumeur du sein inoculées histopathologies sur 224 examens Résultats : sensibilité 86 %, spécificité : 90-94 % * « Medical hyperspectral imaging identifies residual tumor» , S.V. Panasyuk et al., Cancer Biology & Therapy, V6, Issue 3, 2007 Congrès SFPMed 2020 – La Rosière 25
Applications médicales : chirurgie guidée par l’imagerie ▪ Beaucoup d’études in vivo sur modèle animal et ex vivo sur analyse de tissus ont montré l’intérêt de HSI intra-opérative. ▪ HSI in vivo peu nombreuses études mais capacités démontrées. ▪ Pour utilisation de routine en clinique, il faut s’intégrer aisément dans le work flow chirugical. ▪ Les développement technologiques de miniaturisation et l’amélioration de la robustesse devraient le permettre. Congrès SFPMed 2020 – La Rosière 26
Applications médicales : Oxymétrie de surface ▪ Déterminer la perfusion d’oxyhémoglobine, le flux sanguin . ▪ Besoin pour cicatrisation (ulcère diabétique), chirurgie reconstructive, ischémie des membres, amputation… ▪ Besoin d’un système « point of care » : ▪ sans contact, ▪ sans injection, ▪ portable et léger, ▪ facile d’utilisation, ▪ robuste. Congrès SFPMed 2020 – La Rosière 27
Applications médicales : Oxymétrie de surface ▪ Système « Hyperview » de HyperMed FDA cleared 2017 CE Mark 2018 Congrès SFPMed 2020 – La Rosière 28
Conclusions – Non ou mini invasive Faible pénétration – Non ionisante (/ Rayons X, gamma, nucléaire) Validations d’algorithmes nécessaires – Label free Etudes cliniques et homologations couteuses – Imagerie ex vivo, in vitro et in vivo Nouvelle technologie doit convaincre / Techno existantes – Appareils petits, peu couteux? Peu de produits certifiés pour la clinique – Appareils « points of care » Appareils spécifiques pour chaque application • Futur : – Miniaturisation – Bandes spectrales dans l’IR – Combinaison de modalité, déjà montrée – Deep & machine learning pour diagnostic amélioré – Baisse des coûts des détecteurs due aux autres marchés plus porteurs Congrès SFPMed 2020 – La Rosière 29
Conclusions ✓ L’Imagerie HyperSpectrale Médicale est une technique optique qui apporte beaucoup d’informations sur les tissus investigués. ✓ Beaucoup d’études dans des applications nombreuses, mais encore peu de produits. ✓ L’utilisation de cette modalité d’imagerie optique et l’arrivée sur le marché médical de nombreux produits dans les années qui viennent sont conditionnées par : – Le bon choix de la technologie hyperspectrale, – L’amélioration et la validation des algorithmes de traitement des données acquises, – Deep / machine learning – Le ratio coût / service rendu par rapport aux autres modalités optiques. Congrès SFPMed 2020 – La Rosière 30
OCT Autres domaines : Cardiologie Dr. Attizzani, University Hospitals in Cleveland C7-XR OCT from LightLab Imaging Inc. Dentaire H.Schneider et al., Appl. Sci.2017,7, 472 Congrès SFPMed 2020 – La Rosière 31
Microscopie confocale endoscopique Coupe histologique d'épiderme marquée - en bleu, marquage des noyaux avec un intercalant de l'ADN, le DAPI - en vert, immunomarquage d'une protéine associée aux corps lamellaires - en rouge, immunomarquage de l'intégrine alpha6 au niveau de la couche basale R. Nachat-Kappes , 2010 Très faible pénétration Grande résolution (qq 100 nm) Noyau de cellules de glandes salivaires Label free ou pas Pas de 4 µ, barre= 10 µ Sélectif M. Robert-Nicoad et al; Max Planck Institut, Gottingen Congrès SFPMed 2020 – La Rosière 32
Microscopie confocale endoscopique Microscopie confocale endoscopique « Optical Biopsy of Human Bladder Neoplasia With In Vivo Confocal Laser Endomicroscopy » G. Sonn et al., Journal of Urology, V 182, Issue 4, 2009, 1299-1305 Congrès SFPMed 2020 – La Rosière 33
Tomographie Optique Diffuse (DOT) A cranial ultrasound of a preterm infant revealing a left-sided intraventricular hemorrhage and hemorrhagic parenchymal infarct. (c) A three-dimensional DOT image taken at a coronal section of the same preterm infant showing regional blood volume (left) and oxygen saturation (right). There is an increase in hemoglobin concentration and decrease in oxygen saturation in the area corresponding to the hemorrhage and infarct. “Diffuse optical tomography to investigate the newborn brain”, C.W. Lee etal., Pediatric Research volume 82, pages 376–386 (2017) Congrès SFPMed 2020 – La Rosière 34
Tomographie Optique Diffuse (DOT) Cancer du sein Instrumental setup for the diffuse optical tomography (DOT) system, and DOT images acquired from a 53-year-old woman with a 2.2-cm (longest dimension) invasive ductal carcinoma. Bottom left depicts a three-dimensional tumor region (red). The images of rHb, rHbO 2 and rStO 2 are for relative (i.e., tumor-to-normal ratio) deoxyhemoglobin and oxyhemoglobin concentration and tissue oxygenation, respectively. Black solid line in the images indicates the region identified as tumor. FD frequency domain, CCD charge-coupled-device camera Forte pénétration Label free “Macroscopic optical physiological parameters correlate with Sélectif microscopic proliferation and vessel area breast cancer signatures” S.H. Chung et al;, May 2015,Breast cancer research: BCR 17(1):72 Fonctionnelle Faible résolution (cm) Congrès SFPMed 2020 – La Rosière 35
Photo-Acoustique Congrès SFPMed 2020 – La Rosière 36
Photo-Acoustique Congrès SFPMed 2020 – La Rosière 37
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Photo-Acoustique Congrès SFPMed 2020 – La Rosière 39
Conclusions Lateral resolution vs penetration depth of several imaging techniques Note: X-rays does not appear on the graph as they penetrate the whole body Congrès SFPMed 2020 – La Rosière 40
Conclusions Hyperspectral imaging is an optical method that provides a large amount of information about the investigated object. Many of the articles show very promising results. It is clear that choosing the appropriate hyperspectral imaging system for each medical field, together with the most reliable hyperspectral image processing methods, are the main goals of future studies, before hyperspectral imaging becomes a widely applicable evaluation method in medicine. The technology to create portable, snapshot hyperspectral cameras is already here. It will onlybe a few years before the technology will appear in commercial devices, such as cell phone andpalm-sized cameras. Congrès SFPMed 2020 – La Rosière 41
Conclusions • IOM bien placée : – Pour le diagnostic (peut remplacer certaines biopsies) – pour le screening (/mammographies Rx) et le monitoring des thérapies (biopsies) – pour guidage des opérations – Pour la théragnostic Congrès SFPMed 2020 – La Rosière 42
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