COVID 19 PANORAMA DES PROJETS DE RECHERCHE FINANCÉS - MARS 2020 - AVRIL 2021 - ANR

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COVID 19
PANORAMA
DES PROJETS
DE RECHERCHE
FINANCÉS
MARS 2020 – AVRIL 2021
SOMMAIRE

04                                                              30 I Réaction inflammatoire : interaction du virus         54                                                            72
Préface de Thierry Damerval                                     avec d’autres pathogènes ?                                 ÉPIDÉMIOLOGIE                                                 EFFETS DE L’ÉPIDEMIE ET DES MESURES DE
                                                                31 I Rôle du système immunitaire dans les cas              55 I Étude des schémas de transmission dans la population     GESTION AUPRES DES DIFFERENTES POPULATIONS
06                                                              les plus sévères : identification de biomarqueurs          56 I Identification de facteurs prédictifs de l’évolution     73 I Bien-être et santé mentale
Introduction de Dominique Dunon-Bluteau,                        33 I Facteurs génétiques de susceptibilité aux             de la maladie chez les patients                               74 I Populations vulnérables : pratiques de prévention
Philippe Bouvet et Catherine Courtet                            formes graves                                              57 I Effets de la gestion de la pandémie de Covid-19          et actions d’accompagnement
                                                                34 I Mémoire immunitaire post-infection                    sur l’accès aux soins des patients non covid                  75 I Inégalités sociales et inégalités de vie
14                                                              35 I Immunité mucosale
ÉTUDE PHYSIOPATHOLOGIQUE,                                       36 I Immunothérapies et approches vaccinales               58                                                            77
RECHERCHE DE MARQUEURS DE L’INFECTION                                                                                      PROTECTION CONTRE LES INFECTIONS VIRALES                      RISQUE, EXPERTISE, ACTION COLLECTIVE,
15 I Histoire naturelle de la maladie                           38                                                                                                                       POLITIQUES PUBLIQUES
15 I Susceptibilités accrues à l’infection                      DÉVELOPPEMENT DE TESTS DIAGNOSTIQUES                       60                                                            78 I L’action publique à l’épreuve de la pandémie :
15 I Identification de biomarqueurs                             38 I Détection du génome viral                             ORGANISATION DES SERVICES HOSPITALIERS                        organiser et adapter
17 I Développement de modèles d’étude                           40 I Tests immunologiques                                  ET DES SOINS                                                  78 I Analyse des décisions et des mesures politiques
18 I Études des atteintes respiratoires, cardiaques,            40 I Analyse de l’air expiré                               61 I Gestion de l’épidémie, organisation des soins            79 I Données, normes, expertise
neurologiques et inflammatoires liées à l’infection             41 I Stratégies de dépistage                               et du travail                                                 79 I Démocratie et crise sanitaire
du SARS-CoV-2                                                                                                              61 I Conditions de travail et santé des personnels de soins
20 I Études des effets à long-terme de l’infection –            42                                                         62 I Gestion de l’épidémie et parcours de soins               81
Covid-long                                                      RECHERCHE DE MOLÉCULES ANTI-VIRALES                                                                                      ORGANISATION, GESTION, INNOVATION
22 I Vers de nouvelles voies thérapeutiques                     43 I Repositionnement de molécules                         63
                                                                43 I Criblage haut débit de molécules                      ÉTHIQUE MÉDICALE ET SCIENTIFIQUE                              83
23                                                              45 I Stratégies utilisant des nanoparticules                                                                             ENJEUX SOCIAUX, ÉCONOMIQUES ET GÉOPOLITIQUES
MEILLEURE CONNAISSANCE DE LA BIOLOGIE                           45 I Des analogues de nucléosides                          65                                                            84 I Emploi et conditions de télétravail
DU VIRUS SARS-COV-2                                             45 I Des acides nucléiques                                 PERCEPTIONS, COMPORTEMENTS,                                   84 I Épidémie, économie, globalisation
24 I Développement d’un mime non-infectieux comme               46 I Les cribles génétiques                                COHÉSION SOCIALE
modèle d’étude du virus                                         46 I Stratégie anti-sens                                   66 I Les déterminants des perceptions,
24 I Caractérisation structurale des protéines virales          47 I Les différentes approches pour contrôler              des représentations et des comportements
25 I Interactome des protéines du SARS-CoV-2                    l’entrée du virus dans les cellules                        face à l’épidémie et aux mesures de prévention
25 I Caractérisation des interactions protéines-ARN                                                                        67 I Sociabilités, discriminations, cohésion sociale
                                                                48                                                         69 I Comment adapter les messages
27                                                              MODÉLISATION DE LA DISSÉMINATION                           69 I Attitudes des populations et stratégies vaccinales
CARACTÉRISATION DE LA RÉPONSE IMMUNITAIRE                       DU SARS-COV-2                                              70 I Pratiques de prévention et pratiques sociales
CHEZ LES PATIENTS INFECTÉS PAR SARS-COV-2                       49 I Compréhension de la dissémination virale dans l’air   70 I Rituels de deuil, rapport au temps et à l’espace
28 I Études de la réponse antivirale précoce :                  50 I Développement de modèles mathématiques de             71 I Relations entre sociétés et animaux sauvages
cellules cibles et leurs réponses au virus                      prédiction de la dissémination virale                      71 I Mémoires et traces de la pandémie
28 I Réponse immunitaire innée à l’infection                    51 I Données, modèles mathématiques et computationnels,
du SARS-CoV-2 : activation et régulation                        méta-analyses pour la prise de décision sur les mesures
28 I La stimulation du système inné                             sanitaires et les traitements
29 I La réponse hyper-inflammatoire induite par le SARS-CoV-2   53 I Émergence du risque zoonotique

02                                 COVID-19 PANORAMA DES PROJETS DE RECHERCHE FINANCÉS                                                                        COVID-19 PANORAMA DES PROJETS DE RECHERCHE FINANCÉS                                 03
PRÉFACE

                                                                                                                                                                                                                                                PRÉFACE
                                                        PRÉFACE

                                                       THIERRY DAMERVAL
                                            PRÉSIDENT-DIRECTEUR GÉNÉRAL DE L’AGENCE
                                                NATIONALE DE LA RECHERCHE (ANR)

               Si, depuis une vingtaine d’années, de nombreux                  publiée le 9 avril, soit 5 semaines après la publication   de molécules et sur l’identification de nouvelles
               travaux de recherche mettaient en évidence                      de l’appel. Le 20 avril, un deuxième appel est ouvert      cibles thérapeutiques ou encore la recherche de               (1) Les appels Flash ont été
               l’augmentation des risques de développement de                  afin de permettre le dépôt et l’évaluation de projets      matériaux pour des masques respiratoires plus                 mis en place afin d’attribuer
               maladies infectieuses épidémiques, notamment due                en continu jusqu’au 28 octobre. L’appel « Recherche        protecteurs font aussi l’objet de travaux (2).                des financements dans un
                                                                                                                                                                                                        temps court pour des projets
               à des pathogènes d’origine zoonotique, l’épidémie               Action-Covid-19 », s’inscrivait dans le soutien de         La modélisation de la dissémination du virus dans
                                                                                                                                                                                                        qui permettent le recueil de
               de Covid-19, qui s’est déclenchée en décembre 2019              l’acquisition des connaissances au service de la           l’air dans différentes situations de la vie mobilise des
                                                                                                                                                                                                        données ou d’observations
               en Chine, a surpris par son amplitude et par la rapidité        gestion de l’épidémie, tout en prenant en compte le        approches expérimentales et théoriques. L’étude de            et la mobilisation rapide des
               de sa diffusion.                                                renouvellement continu des questions scientifiques         la propagation de l’infection virale permet d’apprécier       recherches pour des besoins
                                                                               qui marque son évolution. Une troisième initiative         le risque nosocomial, d’élaborer des modèles                  urgents de recherche sur des
               La diffusion accélérée de l’épidémie au niveau                  spécifique, intitulée « Résilience Covid-19 », a été       prédictifs ou de simulation de la diffusion de                thématiques ciblées, notamment
               mondial a constitué un défi pour la communauté                  lancée le 18 décembre 2020 et clôturée le 2 mars 2021,     l’épidémie et de l’effet des mesures de prévention.           liés à un événement ou une
               scientifique. Il fallait à la fois caractériser le virus, les   afin de financer rapidement des projets à court                                                                          catastrophe naturelle d’une
               pathologies associées, les modes de contamination et            terme, notamment concernant l’apparition de                Les représentations et les comportements sont                 ampleur exceptionnelle :
               de diffusion dans les populations, élaborer des modes           variants et la persistance de symptômes plusieurs          déterminés par de nombreux facteurs : attitudes               Flash séisme Haïti, Flash Japon
                                                                                                                                                                                                        – Great Tohoku Earthquake,
               de prise en charge thérapeutique des patients,                  mois après l’infection.                                    vis-à-vis de la science, perception du risque, confiance
                                                                                                                                                                                                        Flash Asile, Flash Ouragans…
               explorer des stratégies vaccinales. Mais une épidémie                                                                      à l’égard d’autrui et des institutions, mais aussi en
               de cette ampleur, en mettant à l’épreuve la vie sociale         279 projets ont pu ainsi être financés entre avril 2020    fonction des catégories sociales. Les effets de               (2) La recherche clinique et le
                                                                                                                                                                                                        développement de vaccins ne
               et relationnelle, l’ensemble des activités de production        et avril 2021. Aux financements de l’ANR se sont           l’épidémie et des mesures de prévention sont étudiés
                                                                                                                                                                                                        font pas partie du périmètre
               et de service comme les modes de gouvernance,                   ajoutés le soutien du fond d’urgence du MESRI et la        du point de vue du bien-être ou de la santé mentale,
                                                                                                                                                                                                        d’action de ces appels à projets
               questionne aussi les perceptions, les comportements,            contribution de différents partenaires, tels que la        des projets de vie, de l’accès à l’emploi, de la cohésion     de l’ANR.
               les conditions de mise en place des mesures et de               Fondation pour la recherche médicale, la Fondation         sociale et des solidarités, dans une perspective de
                                                                                                                                                                                                        (3) Un rapport de l’OCDE
               leur efficience.                                                de France et plusieurs régions (Auvergne-Rhône-            prise en compte des différentes populations,
                                                                                                                                                                                                        souligne le caractère holistique
                                                                               Alpes, Centre-Val de Loire, Grand-Est, Hauts-de-           notamment en termes d’accroissement des inégalités            des appels à projets lancé par
               Cette épidémie a constitué, et constitue encore, un             France, Occitanie, Pays de la Loire). Ces partenariats     et des vulnérabilités. Le rôle de l’expertise scientifique,   l’ANR sur la Covid-19.
               défi sans précédent pour la recherche scientifique et           ont permis de mutualiser les moyens et de                  l’impact des décisions publiques, l’analyse coût-
               s’est traduite par une mobilisation exceptionnelle de           coordonner les efforts.                                    efficacité des mesures, les modalités de production
               la communauté scientifique mondiale.                                                                                       des normes et des recommandations, sont autant de
                                                                               La communauté scientifique s’est mobilisée pour            travaux qui concourent à mieux comprendre les
               Dès février 2020, l’Agence nationale de la                      proposer des projets de recherche, mais elle s’est         conditions de mise en œuvre des politiques.
               recherche (ANR), en synergie avec le ministère de               aussi mobilisée pour évaluer les projets avec la plus
               l’Enseignement supérieur, de la Recherche et de                 grande rigueur. Les projets financés, grâce à ces deux     Des travaux sur l’organisation des services hospitaliers
               l’Innovation (MESRI) et avec REACTing (Research                 premiers appels à projets, couvrent un vaste champ         et des soins mettent en évidence les pratiques, les
               and Action Targeting emerging infectious diseases)              de recherche, alliant les recherches fondamentales         formes d’adaptation des services hospitaliers, mais
                a mis en place des outils de financement pour                  et les perspectives d’application ou la production         aussi les conditions de travail des personnels ainsi
               accompagner la production des connaissances,                    de recommandations.                                        que les dilemmes éthiques et moraux que peuvent
               le recueil de données ou d’observations au service                                                                         rencontrer les équipes.
               de la gestion de l’épidémie.                                    L’identification de nouvelles pistes thérapeutiques
                                                                               nécessite une compréhension approfondie des                En mobilisant les différentes disciplines des sciences
               Les instruments de financement de l’ANR ont été                 mécanismes de l’infection et de son évolution, des         humaines et sociales, des sciences biologiques et
               adaptés pour répondre à l’urgence de la situation.              facteurs de risque, mais aussi des mécanismes de           médicales, physiques et chimiques, des mathématiques
               Un premier appel « Flash Covid-19 » (1) a été lancé le          réplication du virus dans la cellule et de la réponse      et de l’informatique, les 279 projets présentés dans ce
               6 mars et clôturé le 23 mars. Deux jours après                  immunitaire. L’élaboration de tests diagnostiques          panorama mettent en évidence les dynamiques
               réception des dossiers, 44 projets bénéficiaient d’un           plus faciles d’utilisation, la recherche de molécules      scientifiques dans leurs multiples dimensions (3) et
               fond d’amorçage. La liste des projets financés a été            antivirales s’appuyant sur le repositionnement             leur apport à la lutte contre l’épidémie.

          04                               COVID-19 PANORAMA DES PROJETS DE RECHERCHE FINANCÉS                                                                                COVID-19 PANORAMA DES PROJETS DE RECHERCHE FINANCÉS          05
INTRODUCTION

                                                                                                                                                                                                                                                                                           INTRODUCTION
               L’IMPLICATION DE L’ANR DANS                                                                                                          défrichés dans les appels précédents, permettant l’acqui-
                                                                                                                                                    sition de connaissances avec une application attendue en
                                                                                                                                                                                                                        • organisation des soins, politique de santé et acceptabilité
                                                                                                                                                                                                                           des décisions.

               LE SOUTIEN À LA RECHERCHE                                                                                                            termes de méthodes, de techniques ou de recommanda-
                                                                                                                                                    tions dans les douze mois.                                          Le deuxième appel, RA-Covid-19, reprenait les quatre axes

               SUR LA COVID-19                                                                                                                      Les axes de recherche des appels
                                                                                                                                                    Flash Covid-19, RA-Covid-19 et Résilience
                                                                                                                                                                                                                        de l’appel Flash Covid-19 (Études épidémiologiques ; Phy-
                                                                                                                                                                                                                        siopathogénie de la maladie ; Prévention et contrôle de
                                                                                                                                                                                                                        l’infection ; Dynamiques sociales et économiques, enjeux
               DOMINIQUE DUNON-BLUTEAU, PHILIPPE BOUVET ET CATHERINE COURTET                                                                                                                                            éthiques) et proposait un cinquième axe portant sur les
                                                                                                                                                    Les recommandations de l’OMS, élaborées lors d’un forum             enjeux globaux de l’épidémie de Covid-19 :
                                                                                                                                                    des 12 et 13 février 2020 réunissant des experts internatio-
                                                                                                                                                    naux de la santé en collaboration avec le GLOPID-R (Global          • Compréhension des facteurs écologiques, environne-
               Les premiers cas suspects de pneumonie sont détectés en             Ces appels à projets permettaient à la fois des procédures       Research Collaboration for Infectious Disease Prepared-             mentaux et humains à l’origine de l’émergence de la pan-
               décembre 2019 à Wuhan, en Chine, et attribués à une                 de financement accélérées et la prise en compte des nou-         ness), ont constitué le socle de la réflexion pour l’élaboration    démie et identification de pratiques permettant de limiter
               contamination par un nouveau coronavirus dénommé                    velles questions scientifiques dès leur émergence.               des appels Flash Covid-19 et RA-Covid-19. Ces appels ont été        les risques futurs (y compris accords internationaux) :
               SARS-CoV-2. L’épidémie de Covid-19 est déclarée « urgence           Ils ont contribué à accélérer la promotion et la mise en         définis par un comité de pilotage scientifique associant le         • impact macro et micro-économique et sur les flux
               de santé publique internationale » fin janvier 2020 par             œuvre d’une « Science ouverte » conformément à la décla-         MESRI, REACTing (3) et l’ANR.                                       d’échanges de biens et services (y compris financiers) ;
               l’Organisation mondiale de la santé (OMS). En France, la            ration conjointe « Sharing research data and findings rele-      Les axes scientifiques choisis, à la fois pluri et interdiscipli-   • impact sur les pays en développement et les territoires
               structure opérationnelle dédiée aux épidémies REACTing              vant to the novel coronavirus (nCov) outbreak » signée dès       naires, concernaient l’ensemble des disciplines suscep-             ultra-marins, et sur les relations Nord/Sud ;
               (Research and Action Targeting emerging infectious                  la fin janvier 2020 par des centaines d’institutions dans le     tibles d’apporter des connaissances sur l’épidémie, les             • modèles de sortie de crise sanitaire articulés avec la transi-
               diseases – créée par l’Inserm en 2013 sous l’égide de               monde dont l’ANR.                                                conditions de sa gestion, mais aussi sur les caractéris-            tion écologique et les objectifs de développement durable.
               l’Alliance nationale pour les sciences de la vie et de la santé                                                                      tiques du virus, de la maladie et sur les thérapeutiques            • conditions de travail et conflits sociaux ;
               [Aviesan]) bénéficie, dès le 10 février 2020, de premiers           Les objectifs des appels                                         potentielles.                                                       • enjeux géopolitiques et impact sur les relations interna-
               financements pour amorcer des projets de recherche sur              Flash Covid-19, RA-Covid-19 et Résilience                        L’appel Flash Covid-19 visait principalement les théma-             tionales ;
               la Covid-19.                                                                                                                         tiques suivantes :                                                  • observations environnementales additionnelles de l’épi-
                                                                                   Les appels Flash sont des instruments spécifiques de                                                                                 démie (à l’exclusion des systèmes d’observation environ-
               Dès ce début de crise sanitaire mondiale, en articulation           l’ANR permettant de financer des projets de recherche            Études épidémiologiques et translationnelles :                      nementaux usuels).
               avec le ministère de l’Enseignement supérieur, de la                dans un délai court et dans le respect des principes d’éva-      • histoire naturelle de la maladie (y compris les facteurs
               Recherche et de l’Innovation (MESRI) et REACTing,                   luation par les pairs. L’appel Flash Covid-19, ouvert du         anthropiques) et modes de transmission du virus ;                   Le troisième appel, Résilience Covid-19, en cohérence avec
               l’Agence nationale de la recherche (ANR) a souhaité s’ins-          6 au 23 mars 2020, avait pour objectif de soutenir les com-      • diagnostic de l’infection, du portage asymptomatique,             les recommandations de l’OMS et les priorités de recherche
               crire dans l’effort de recherche national pour contribuer à         munautés scientifiques de recherche mobilisées sur la            de l’évolution de la réponse immune ;                               établies par REACTing, soutenait les thématiques relevant
               la gestion de la pandémie.                                          Covid-19(1) et ainsi de renforcer les premières actions soute-   • caractérisation clinique et prise en charge ;                    des trois axes suivants :
                                                                                   nues par REACTing. Mais cette initiative avait également         • modèles numériques prédictifs et rétrospectifs.                  • physiopathogénie et épidémiologie (Immunité muco-
               L’ANR a ainsi développé, tout au long de 2020, un large dis-        pour objectifs de mobiliser la recherche au-delà des com-                                                                            sale ; nouveaux modèles de recherche préclinique afin de
               positif pour accompagner les dynamiques scientifiques               munautés scientifiques déjà impliquées et, au-delà de la         Physiopathogénie de la maladie (interactions virus-hôte             valider des approches thérapeutiques innovantes, consé-
               comportant à la fois des appels à projets spécifiques, l’affi-      réponse à court terme, de produire des connaissances sur         et réponse immune) :                                                quences à moyen et à long termes de la Covid-19 chez les
               chage d’une priorité Covid-19 dans l’appel à projets géné-          le plan épidémiologique, physiopathologique, sanitaire           • développement de modèles animaux et cellulaires ;                patients infectés ; impact de la pandémie sur les patients
               rique et des initiatives en coopération internationale.             aussi bien que social et économique.                             • cibles thérapeutiques et modèles d’évaluation de candi-           souffrant de pathologies non Covid-19 et leur prise en
                                                                                                                                                    dats médicaments (n’incluant pas les vaccins).                      charge) ;
               L’appel « Flash Covid-19 » est annoncé dès la deuxième quin-        L’appel RA-Covid-19 ciblait l’acquisition de connaissances                                                                           • prévention, contrôle de l’épidémie et dynamiques
               zaine de février 2020, afin de renforcer les premières actions      avec une application des résultats, méthodes ou tech-            Mesures de prévention et de contrôle de l’infection en              sociales (organisation du système de santé, de soin et de
               soutenues par REACTing et de mobiliser la recherche                 niques dans les trois à douze mois, ou le recueil immédiat       milieu de soins (y compris les meilleurs moyens de proté-           prévention face à la pandémie Covid-19 ; conséquences à
               au-delà des communautés scientifiques déjà impliquées               de données spécifiques à la période épidémique et                ger les agents de santé) et en milieux communautaires :
               dans la réponse à la crise sanitaire. Publiée le 3 mars 2020,       post-épidémique (2). Cet appel, ouvert du 20 avril au            • vulnérabilité et résilience des personnes, des collectifs et
               cette première initiative visait à soutenir des projets s’inscri-   28 octobre 2020, offrait la possibilité de déposer des pro-      des organisation ;
               vant dans une perspective de réponse immédiate à l’épidé-           jets au fil de l’eau, et de développer des travaux sur les       • conditions d’efficience et conditions réelles de mise en
               mie et nécessitant l’acquisition ou le recueil d’informations       nouveaux thèmes apparus au cours de la pandémie et de            œuvre des actions d’information, de prévention, de soin et
                                                                                                                                                                                                                        (1) La durée des projets devait être inférieure ou égale à dix-
               et de données.                                                      la mise en place des mesures sanitaires ou économiques.          de lutte ;
                                                                                                                                                                                                                        huit mois et le financement maximum accordé de 200 K€.
                                                                                   Il s’agissait du premier appel de l’ANR visant le soutien de     • évaluation et modélisation de l’impact épidémiologique,
                                                                                                                                                                                                                        (2) La durée des projets devait être inférieure ou égale à douze
               Afin de poursuivre le soutien à la production de connais-           la recherche-action comprenant une évaluation au fil de          économique et financier de l’épidémie et des mesures de
                                                                                                                                                                                                                        mois et le financement maximal accordé de 150 K€.
               sances, l’appel « Recherche Action-Covid-19 (RA-Covid-19) »,        l’eau.                                                           prévention et de contrôle.
                                                                                                                                                                                                                        (3) REACTing (REsearch and Action targeting emerging
               ouvert en continu, a permis une prise en compte de la
                                                                                                                                                                                                                        infectious diseases), consortium multidisciplinaire rassem-
               diversité des questions apparaissant au cours du dévelop-           Une troisième initiative spécifique, intitulée Résilience        Éthique – Sciences humaines et sociales associées à la
                                                                                                                                                                                                                        blant des équipes et laboratoires d’excellences des parte-
               pement de la pandémie.                                              Covid-19, a été lancée le 18 décembre 2020 et clôturée le        réponse :                                                           naires français (Inserm, IRD, Institut Pasteur, CEA, CNRS,
                                                                                   2 mars 2021. Son objectif est de financer rapidement des         • enjeux géopolitique ;                                            CIRAD…), a été mis en place par l’Inserm en 2013 sous l’égide
               L’appel « Résilience Covid-19 », ouvert le 18 décembre 2020         projets à court terme prenant en compte les nouveaux             • éthique de la recherche et du soin et droits humains ;           d’Aviesan. Sa mission est de préparer, d’accélérer et de coor-
               jusqu’au 2 mars 2021, prenait en compte les probléma-               développements de la pandémie. Cet appel visait à soute-         • représentations, perceptions, attitudes, comportements            donner la recherche sur les maladies émergentes et les épi-
               tiques liées à la persistance de la pandémie.                       nir des projets ciblant des domaines pas encore ou peu           relatifs à l’épidémie ;                                             démies.

               06                                   COVID-19 PANORAMA DES PROJETS DE RECHERCHE FINANCÉS                                                                                  COVID-19 PANORAMA DES PROJETS DE RECHERCHE FINANCÉS                                         07
INTRODUCTION

                                                                                                                                                                                                                                                                                          INTRODUCTION
               court et long termes de la Covid-19 sur la santé mentale et       • impacts économique et organisationnel sur les différents
               le bien-être psychologique dans les différents groupes de         secteurs d’activité et les relations internationales.              RÉPARTITION DES PROJETS DÉPOSÉS ET SÉLECTIONNÉS
               population ; analyse et évolution des politiques de lutte, du     Les projets de développement vaccinaux et de recherche             FEMMES / HOMMES PAR GRANDS AXES DANS LES APPELS
               rôle des différents acteurs publics ou privés et des diffé-       clinique interventionnelle, qui nécessitent des finance-           FLASH COVID-19, RA COVID-19, RÉSILIENCE COVID-19 (en %)
               rents secteurs d’activité ; effet de l’épidémie sur les inéga-    ments de grande ampleur, n’étaient pas ciblés ; en effet
               lités, la vulnérabilité et la précarité des populations ;         des appels à projets européens ou encore le Programme
               évolution des formes de sociabilité, de cohésion sociale et       hospitalier de recherche clinique sont dédiés à ces théma-         80                                                                                  75
               des comportements collectifs) ;                                   tiques.
                                                                                                                                                                                                                                   71
                                                                                                                                                                                                                                                       67
                                                                                                                                                    70                                                         65
                                                                                                                                                                                                                    66
                                                                                                                                                                      64   64
               Quelques chiffres                                                                                                                                                                                                                                           61

                                                                                                                                                    60                                                                                                      56
               NOMBRE DE PROJETS SÉLECTIONNÉS, FINANCEMENTS ALLOUÉS ET TAUX DE SÉLECTION                                                                                                   52
                                                                                                                                                                                                                                                                      54
                                                                                                                                                                                                51
               Appel                                             Flash Covid-19 / 2020      RA-Covid-19 / 2020 + 2021             Résilience 2021                                     49
                                                                                                                                                                                48
                                                                                                                                                    50                                                                                            44
                                                                                                                                                                                                                                                                                46
               Nombre de propositions éligibles                                    259                            614                        147
               Nombre de propositions                                    106 complets                             128                         45                                                                                                                 39
               détaillées sélectionnées                                 + 9 amorcés (4)                                                             40      36   36                                  35   34                                 33
               Taux de sélection (en %)                                           40,9                           20,7                        30,6
                                                                                                                                                                                                                         29
               Budget alloué (en M€)                                               17,6                           14,6                        3,4   30                                                                        25
               Budget moyen alloué (en K€)                                         153                                114                    75,5

                                                                                                                                                    20
               Le nombre total de projets sélectionnés sur ces trois             279 projets montre la très forte mobilisation de la commu-
               appels à projets est de 279 pour un financement global de         nauté scientifique. Les appels RA-Covid-19 et Résilience
                                                                                                                                                    10
               35,6 millions d’euros.                                            ont permis la participation de nouveaux partenaires
               Ces 279 projets impliquent la participation de plus de            puisqu’environ 80 % des partenaires, qui participent aux
               700 partenaires (avec une moyenne de 2,5 partenaires              projets de ces deux appels ne participent pas à des projets         0
               pour Flash Covid-19, 2,65 pour RA-Covid-19 et 2,2 pour            financés dans l’appel Flash Covid-19.                                     Tous axes            Éthique et           Études              Physio-             Prévention          Enjeux
               Résilience-Covid-19), avec certains partenaires qui parti-                                                                                                       dynamique            épidémiolo-         pathologie          et contrôle         globaux de
               cipent à plusieurs projets compte tenu de leurs compé-                                                                                                           sociale              giques              de la maladie       de l’infection      l’épidémie
               tences dans le domaine des maladies infectieuses.                 (4) Grâce à une procédure spécifique, l’ANR a publié l’attribu-
               Cependant, la très grande majorité des partenaires ne par-        tion de fonds d’amorçage le 25 mars 2020, soit deux jours
               ticipent qu’à un seul projet (587 partenaires uniques).           après le dépôt des projets. Le résultat de l’appel Flash Covid-
               La participation de près de 600 partenaires uniques à ces         19 a été publié le 9 avril 2020.
                                                                                                                                                             Déposés par des chercheuses                                      Déposés par des chercheurs
                                                                                                                                                             Sélectionnés et portés par des chercheuses                       Sélectionnés et portés par des chercheurs
               APPELS À PROJETS, NOMBRE DE PARTENAIRES, NOMBRE DE PARTENAIRES UNIQUES À CET APPEL
               Appel à projets                                                            Nb. de partenaires                  Nb. de partenaires
                                                                                                                             uniques à cet appel
               Flash Covid-19                                                                           265                                  188
               RA-Covid-19                                                                              340                                  270
               Résilience                                                                                99                                   76
               Total des partenaires uniques (tous appels confondus)                                    587

               RÉPARTITION DES PROJETS FINANCÉS PAR AXES ET TAUX DE SÉLECTION
               Axes (Flash Covid-19 + 17 vagues RA-Covid-19 + Résilience)                  Nb. de projets financés          % de projets financés
               Études épidémiologique et translationnelles                                                      47                             16
               Physiopathologénie de la maladie                                                                 111                           40
               Prévention et contrôle de l’infection                                                            59                             21
               Éthique, sciences humaines et sociales associés à la réponse                                     49                             18
               Enjeux globaux de la pandémie (uniquement RA-Covid-19)                                           13                             5
               et Impacts économique et organisationnel (uniquement Résilience)
               Total                                                                                           279                           100

               08                                 COVID-19 PANORAMA DES PROJETS DE RECHERCHE FINANCÉS                                                                                COVID-19 PANORAMA DES PROJETS DE RECHERCHE FINANCÉS                                             09
INTRODUCTION

                                                                                                                                                                                                                                                                                                      INTRODUCTION
                                                                                                                                                                 L’implication des entreprises                                         Recherches en biologie-santé sur le virus,
                    RÉPARTITION
                         Lorem ipsum DES PROJETS                                                                                                                                                                                    la maladie Covid-19 et les modes de prévention
                    SÉLECTIONNÉS PAR RÉGIONS                                                                                                                     Dans les appels Flash Covid-19, RA-Covid-19 et Résilience,
                    DANS LES APPELS FLASH COVID-19,                                                                                                              les entreprises privées pouvaient être porteuses ou parte-         Ces appels ont privilégié plusieurs axes de recherches
                    RA-COVID-19 ET RÉSILIENCE                                                                                                                    naires de projets. Parmi les projets financés, 17 comportent       « Physiopathologie de la maladie », « Études épidémiolo-
                                                                                         HAUTS-DE-FRANCE                                                         un partenariat avec au moins une entreprise, 4 sont direc-         giques et translationnelles » et l’axe « Prévention et contrôle
                                                                                                                                                                 tement portés par une entreprise (1 dans le domaine des            de l’infection ». Les questions scientifiques abordées dans
                                                                                                   8
                                                                                                                                                                 tests diagnostiques et 3 en recherche thérapeutique). Au           ces axes peuvent être regroupées en quatre grands
                                                                      NORMANDIE
                                                                                                               GRAND-EST
                                                                                                                                                                 total, 21 entreprises sont impliquées.                             thèmes :
                                                                                         ÎLE-DE-FRANCE
                                                                          1                                                                                      Les autres projets concernent les domaines suivants : tests        • les études sur la biologie du virus et la recherche de
                                                                                                                       10                                        diagnostiques (3), recherche de nouvelles approches vacci-         molécules antivirales ;
                                                   BRETAGNE
                                                                                                 136
                                                                                                                                                                 nales (1), pistes thérapeutiques (7), prévention (4) et dyna-      • une meilleure connaissance de la physiopathologie de
                                                      3
                                                               PAYS DE               CENTRE-
                                                                                                                                                                 miques sociales (2).                                               l’infection avec en particulier les conséquences sur la réac-
                                                               LA LOIRE            VAL DE LOIRE
                                                                                                          BOURGOGNE-
                                                                                                                                                                                                                                    tion immunitaire ;
                                                                  8                     5
                                                                                                         FRANCHE-COMTÉ                                                                                                              • la modélisation de la dissémination virale et les études
                                                                                                                  1                                              Des recherches en lien avec l’action,                              épidémiologiques ;
                                                                                                                                                                 les professionnels et les parties prenantes                        • le développement de tests diagnostiques innovants et
                                                                                                                                                                                                                                    de nouvelles mesures de protection.
                                                                       NOUVELLE-
                              GUYANE                                   AQUITAINE                          AUVERGNE-                                              Plusieurs projets portant sur l’analyse des effets de la pan-
                                                                                                         RHÔNE-ALPES
                                 1                                                                                                                               démie sur les populations marginalisées et précaires asso-         La plupart des projets de ces thèmes sont pluri­
                                                                              13
                                                                                                             34                                                  cient les bénéficiaires et les travailleurs sociaux, les centres   disciplinaires et associent différentes disciplines de la
                                                                                                                                                                 d’hébergement (par exemple, les Centres régionaux                  biologie (biochimie, biologie cellulaire, physiologie, épi-
                                                                                                                                                                 pour l’enfance et l’adolescence inadaptées), ainsi que les         démiologie, recherche clinique) ou d’autres disciplines
                                                                                       OCCITANIE
                                                                                                                                                                 bénévoles.                                                         (physique, informatique, mathématique, sciences
                                                                                                                      PROVENCE-ALPES-
                             LA RÉUNION
                                                                                                                        CÔTE D’AZUR                              Les effets de la gestion de l’épidémie sur l’organisation et       humaines et sociales, sciences de l’environnement...).
                                 1                                                          33                                                                   les parcours de soins, ou encore les dimensions éthiques           Quinze projets proposent une collaboration avec des
                                                                                                                            22
                                                                                                                                                                 font l’objet de travaux qui associent les professionnels           entreprises.
                                                                                                                                                                 et les services de santé, les représentants d’associations
                                                                                                                                               CORSE             de patients ou les patients eux-mêmes, les référents               Les approches utilisées sont très diversifiées et souvent
                                                                                                                                                                 scientifi­ques des établissements de recherche.                    multiples au sein d’un même projet. On peut citer des
                                                                                                                                                 1
                    Deux projets sont portés par des unités de recherche                                                                                                                                                            approches de biologie structurale (cristallographie,
                    françaises situées à l’étranger                                                                                                                                                                                 résonnance magnétique nucléaire), omics (protéomique,
                                                                                                                                                                 Les grandes dynamiques scientifiques                               transcriptomique, génomique), génétiques (cribles, déve-
                                                                                                                                                                 soutenues dans les appels Flash Covid-19,                          loppement de modèles murins), biologie cellulaire, immu-
                                                                                                                                                                 RA-Covid-19 et Résilience                                          nologie, virologie, épidémiologie, des développements
                                                                                                                                                                                                                                    méthodologiques issus de la physique, modélisations
                                                                                                                                                                 Les projets financés couvrent différents domaines qui              mathématiques…
                                                                                                                                                                 vont des études physiopathologiques, de la connaissance
               Une mutualisation des                           RÉPARTITION DES FINANCEMENTS                                                                      de la biologie du virus SARS-CoV-2, à la caractérisation de        Certaines études s’appuient sur des cohortes ou des essais
               financements grâce à la mise                    9,95 M€ ANR + 16,0 M€ MESRI + 9,7 M€ en cofinancement                                             la réponse immunitaire des patients, jusqu’aux tests dia-          cliniques déjà existants au moment du dépôt du projet. En
               en place de partenariats                                                                                                                          gnostiques et aux molécules antivirales. Les études épidé-         particulier, les Cohortes APHP Covid, PED-COVID, COVIDeF,
                                                                                                                                                                 miologiques, la modélisation de la dissémination du virus,         CoV-CONTACT / Cov-CONTACT-SERO, TEMPO-Cohorte,
               Outre l’ANR et le MESRI, ces appels                                                 projets soutenus                     Régions :                la protection contre les infections, l’organisation des ser-       Constances, EPIPAGE-ELT, Nutrinet, E3N-E4N, PAQUID, 3C
                                                                                            27
               à projets ont bénéficié d’un grand                                                  en parti ou                          Auvergne-Rhône-Alpes,    vices hospitaliers et l’éthique médicale ou scientifique           – Cohorte des 3 cités, AMI, Grippenet, Licorne, Covimmunity,
                                                                                                   en totalité                          Centre-Val de Loire,
               nombre de cofinanceurs : la Fondation                                                                                                             font aussi l’objet de travaux. Les dimensions sociales et          healthcare claims, Curiosa les essais cliniques DisCovery,
                                                                                                                                        Grand-Est, Hauts-de-
               pour la recherche médicale, la                                                      millions d’euros                                              humaines sont largement abordées à travers l’étude des             Liliade, COVIDICUS, la Biobanque COLCOV19 à Bordeaux,
                                                                                            4,7                                         France, Occitanie,
               Fondation de France et six régions                                                  financés                                                      déterminants des perceptions et des comportements, des             la biocollection (IBIS) et cohorte (ATLANREA) du CHU de
                                                                                                                                        Pays de la Loire.
               (Auvergne-Rhône-Alpes, Centre-Val                                                                                                                 effets de l’épidémie et des mesures sur les différentes            Nantes, la cohorte COVID l’hôpital de Lille, la cohorte
               de Loire, Grand-Est, Hauts-de-France,                                                                                                             populations, des conditions de l’expertise et des politiques       « French Covid » et de l’étude COVERAGE.
                                                                                                   projets soutenus                           projets soutenus
               Occitanie, Pays de la Loire). Cette                                          26                                           22                      publiques, ainsi que du point de vue des enjeux sociaux,
                                                                                                   en parti ou                                en parti ou
               synergie inédite illustre d’une part,                                               en totalité                                en totalité        économiques et géopolitiques.
               le souhait des cofinanceurs sollicités                                                                                                            Outre les sciences biologiques et médicales et les sciences
                                                                                                   millions d’euros                           millions d’euros
               par l’ANR de contribuer à l’effort                                           3                                            2                       humaines et sociales, les projets mobilisent les mathé­
                                                                                                   financés                                   financés
               de recherche pour lutter contre la                                                                                                                matiques et la modélisation, les sciences physiques et
               pandémie de la Covid-19 et, d’autre                                                                                                               chimiques.
               part, de coordonner leurs actions
               de soutien.

               10                                 COVID-19 PANORAMA DES PROJETS DE RECHERCHE FINANCÉS                                                                                                COVID-19 PANORAMA DES PROJETS DE RECHERCHE FINANCÉS                                        11
INTRODUCTION

                                                                                                                                                                                                                                                                                          INTRODUCTION
                  Recherches sur les dimensions sociales                          • cohortes (Constances, Elfe-EPipage, NutriNet et E3N-            l’international sont concernés. Il s’agit également d’ac-         renewal, and résilience in post-pandemic world » porté
               et économiques de la pandémie                                      E4N, REACTing, EpiCov, Tracov…) ; données de rembourse-           compagner la reprise économique en limitant l’impact              par la plateforme transatlantique qui regroupe onze
                                                                                  ment de soins de santé, Système national des données de           des activités humaines sur les changements globaux et             agences de financement (6).
               Plusieurs axes des appels à projets Flash Covid-19 et              santé (SNDS) ou enquête Conditions de vie et aspirations          en développant des processus augmentant la résilience
               RA-Covid-19 et Résilience-Covid concernaient les dimen-            du Crédoc ;                                                       de la société. Les approches globales inter et transdiscipli-        Des actions de diffusion
               sions humaines, sociales et éc­o­nomiques de la pandé-             • Web et réseaux sociaux…                                         naires sont encouragées.
               mie : deux axes parmi les quatre proposés dans l’appel                                                                                                                                                 Enfin, l’ANR prévoit en 2021 la publication d’un rapport
               Flash Covid-19 (« Prévention et contrôle de l’infection » et       De nombreux projets proposent des comparaisons inter-             Les projets déposés à l’automne 2021 suivent un processus         d’étape sur des résultats obtenus par les projets financés
               « Éthique, sciences humaines et sociales associées à la            nationales avec différents pays (dont l’Italie, l’Allemagne, la   d’évaluation en deux étapes et le résultat de la sélection        dans le cadre des appels Covid-19 avec l’organisation d’un
               réponse ») et trois axes parmi les sept de l’appel RA-Co-          Suisse, le Royaume-Uni, la Suède, l’Autriche, le Canada, les      sera publié en juillet 2021.                                      colloque bilan en 2022.
               vid-19 (« Prévention et contrôle de l’infection », « Dyna-         États-Unis, l’Amérique du Sud, l’Afrique centrale, le Mali, la
               miques sociales et économiques, enjeux éthiques »,                 Nouvelle-Zélande, la Chine).                                         Des coopérations avec les régions
               « Enjeux globaux de l’épidémie Covid-19 »).
                                                                                     Des projets en coopération internationale                      L’ANR a également été associée à la dimension régionale
               La plupart des projets de ce domaine mobilisent des cher-                                                                            de la recherche sur la Covid-19 en tant qu’opérateur de
               cheurs en sciences humaines et sociales, certains sont             1 5 % des projets financés dans les appels Flash Covid-19 et      l’évaluatio n(5). Deux régions, qui ont participé au co-finan-
               portés par des chercheurs en santé publique, notamment             RA-Covid-19 comprenaient au moins une équipe parte-               cement de l’appel Flash, ont organisé chacune un appel
               pour les domaines éthique et organisation des soins. Les           naire étrangère financée sur fonds propres. 30 projets            Résilience. L’appel de la région Grand-Est s’est déroulé
               questions abordées peuvent être regroupées en sept                 comprennent 42 équipes étrangères partenaires qui ont             en juin 2020 et celui de la région Hauts-de-France en
               grands thèmes, parmi lesquels cinq sont essentiellement            mobilisé leurs propres financements nationaux : USA (9),          novembre 2020, financés chacun à parts égales par la
               portés par des chercheurs en sciences humaines et                  Suisse (6), Canada (4), Italie (3), Belgique (2), Chine (2),      région et par le MESRI (2 M€ pour chaque appel).
               sociales et concernent 67 projets :                                Royaume-Uni (3), Suède (2), Viêtnam (2), Allemagne (2),
               • perception, comportements, pratiques, cohésion sociale ;         Pays-Bas, Finlande, Cambodge, Cameroun, Côte d’Ivoire,            Les deux appels à projets « Résilience Grand-Est » (67 pro-
               • effets de l’épidémie et des mesures de gestion auprès            Japon, Laos, Mali, Taïwan, Thaïlande.                             jets évalués pour 15 lauréats) et « Résilience Hauts-de-
               des différentes populations ;                                                                                                        France » (33 projets évalués pour 15 lauréats) avaient pour
               • risque, expertise, action collective, politiques publiques ;                                                                       objectifs d’évaluer l’impact territorial de la crise sanitaire,
               • enjeux sociaux, économiques et géopolitiques ;                   Les actions complémentaires de l’ANR                              notamment sur le système de santé, l’économie, la société
               • innovation, gestion, organisation.                               contre la pandémie de Covid-19 en 2020                            et l’environnement et d’accompagner leur adaptation. Ils
                                                                                                                                                    visaient également à encourager les collaborations entre
               Les deux thèmes suivants regroupent seize projets qui                 Priorité Covid-19 dans l’appel à projets générique             les acteurs privés et les différents laboratoires acadé-
               sont portés par des chercheurs en sciences humaines et                                                                               miques régionaux dans la perspective de favoriser la rési-
               sociales ou par des spécialistes de santé publique ou des          Publié fin juillet 2020, le Plan d’action 2021 de l’ANR affiche   lience des territoires.
               médecins :                                                         une priorité générale « Covid-19 » sur l’ensemble de l’Appel
               • éthique médicale et scientifique ;                               à projets générique 2021 (AAPG 2021). Complémentaires                Des coopérations internationales
               • organisation des services hospitaliers et des soins.             aux projets courts financés par les appels Flash Covid-19 et
                                                                                  RA-Covid-19, et dotés d’un budget plus élevé (300-700 K€),        Les actions internationales sur la Covid-19 s’inscrivent dans
               La diversité des disciplines des sciences humaines et              les projets de l’AAPG 2021 permettront de développer des          le cadre des collaborations existantes avec des agences
               sociales est mobilisée : anthropologie, ethnologie, sociolo-       travaux de plus grande ampleur sur une durée de trois à           partenaires de l’ANR.
               gie, science politique, droit, philosophie, épistémologie,         quatre ans.
               économie (politique, du développement, expérimentale,                                                                                L’ANR a privilégié la coordination et la collaboration entre      (5) Dans le cadre de ses prérogatives définies par décret,
               financière…), gestion, ergonomie, psychologie (clinique,           L’objectif est de mobiliser les communautés scientifiques         projets issus d’appels de type « Flash nationaux » via des        l’ANR peut « participer à des actions menées en commun ou
               sociale, cognitive), psychopathologie. De nombreux pro-            françaises sur la pandémie de Covid-19 et ses consé-              interactions bilatérales avec des agences partenaires. Une        pour le compte des services de l’Etat, des collectivités territo-
               jets rassemblent différentes disciplines.                          quences dans le cadre d’une approche globale, et de pro-          interaction avec la JST (Japan Science and Technology             riales et de leurs groupements ou d’autres organismes
               Les méthodes relèvent d’approches qualitatives (observa-           duire des connaissances dans tous les domaines de                 Agency) a permis d’orienter des chercheurs français lau-          publics ou privés, français ou étrangers ».
               tions, entretiens, journaux personnels, récits, groupes de         recherche pouvant être concernés.                                 réats du Flash Covid-19 vers des chercheurs japonais finan-       (6) Academy of Finland ; Croatian Science Foundation ;
               discussion en ligne, analyses de discours…) et quantita-                                                                             cés par la JST et trois projets franco-japonais se sont           Department of Science, Technology and Innovation (Colom-
               tives (à partir d’enquêtes de panel, de suivis longitudi-          Une attention particulière est portée aux projets de              concrétisés.                                                      bia) ; Federal Ministry of Education and Research/ DLR Pro-
               naux…), mais aussi d’approches expérimentales (dont                recherche qui s’inscriront dans la lutte contre la pandémie                                                                         ject Management Agency (Germany) ; Fonds de recherche
               expérimentations en ligne, expériences de terrain…).               ou qui permettront de mieux comprendre les facteurs               Un colloque sino-européen associant l’agence chinoise             du Québec – Société et culture (Canada) ; French National
                                                                                  environnementaux, anthropiques, sanitaires, socio-écono-          NSFC (Natural Science Foundation of China) et Science             Research Agency ; International Development Research
                                                                                                                                                                                                                      Centre (Canada) ; National Research Foundation (South
               Les terrains d’étude et les types de données sont multiples :      miques et comportementaux pouvant jouer un rôle dans              Europe incluant l’ANR a eu lieu le 14 décembre 2020 sur le
                                                                                                                                                                                                                      Africa) ; National Science Centre (Poland) ; National Science
               • population générale aux différents âges et de différentes        l’émergence, la propagation des pandémies, de dévelop-            thème « prévention et contrôle de l’épidémie » avec pour
                                                                                                                                                                                                                      Foundation (USA) ; São Paulo Research Foundation (Brazil) ;
               catégories sociales, patients, professionnels de santé, inter-     per des moyens d’évaluation et de réduction des risques           objectif de développer des collaborations sino-euro-              Social Sciences and Humanities Research Council (Canada) ;
               venants institutionnels, journalistes, scientifiques, experts… ;   et de surveillance des différents impacts, d’analyser et          péennes. Ces deux coopérations se prolongeront en 2021.           Swiss National Science Foundation ; The German Research
               • État et institutions publiques, organisations de santé et        d’accompagner les évolutions sociales, économiques,                                                                                 Foundation ; UK Research and Innovation – Arts and Humani-
               hôpitaux, institutions patrimoniales, écoles, agences, ONG         environnementales, agricoles et industrielles liées à la ges-     L’ANR cofinance également l’appel international dans le           ties Research Council ; UK Research and Innovation – Econo-
               et associations… ;                                                 tion de la crise. La métropole, les territoires ultramarins et    domaine des sciences humaines et sociales « Recovery,             mic and Social Research Council.

               12                                  COVID-19 PANORAMA DES PROJETS DE RECHERCHE FINANCÉS                                                                                  COVID-19 PANORAMA DES PROJETS DE RECHERCHE FINANCÉS                                         13
ÉTUDE PHYSIOPATHOLOGIQUE, RECHERCHE DE MARQUEURS DE L’INFECTION

                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    ÉTUDE PHYSIOPATHOLOGIQUE, RECHERCHE DE MARQUEURS DE L’INFECTION
                                                                       ÉTUDE PHYSIOPATHOLOGIQUE,                                                                                  Histoire naturelle de la maladie                                risque, en se basant sur l’état des télomères et de la sénes-

                                                                       RECHERCHE DE MARQUEURS
                                                                                                                                                                                                                                                  cence de leurs cellules sanguines (PBMC), fournissant une
                                                                                                                                                                                  Le projet COVID-A vise à mieux comprendre l’histoire            base rationnelle pour l’utilisation des télomères comme

                                                                       DE L’INFECTION
                                                                                                                                                                                  naturelle de l’infection et notamment dans sa phase ini-        biomarqueurs pour la détection et le diagnostic précoce
                                                                                                                                                                                  tiale, au niveau de la population générale. Cette étude         des formes graves d’infection par le SARS-CoV-2.
                                                                                                                                                                                  s’appuiera sur un système de surveillance clinique et viro-
                                                                                                                                                                                  logique déjà mis en place par le réseau Sentinelles, Santé      Déterminer si la gravité de l’infection au SARS-CoV-2
                                                                                                                                                                                  publique France et le Centre national de référence pour         avec l’âge est associée à un dysfonctionnement
                                                                       L’identification de nouvelles pistes                  Deux populations particulièrement à risque,          suivre en temps réel les infections dues au SARS-CoV-2          télomérique – COST
                                                                       thérapeutiques nécessite une compréhension            les patients en surpoids ou obèses et les            vues en consultation de soins primaires (médecine géné-         Appel à projets ANR : RA-Covid-19 – Vague 14
                                                                                                                                                                                  rale et pédiatrie) en France métropolitaine. Cette étude        Coordinatrice : Delphine Benarroch-Popivker, UMR 7284 –
                                                                       approfondie des différentes étapes de la              personnes âgées, font l’objet d’études portant
                                                                                                                                                                                  permettra d’identifier les facteurs de risque de développer     Institute for Research on Cancer and Aging (IRCAN) –
                                                                       maladie.                                              sur les spécificités du tissu adipeux et sur les
                                                                                                                                                                                  une forme légère, sévère ou fatale et de proposer une prise     Université Nice Sophia Antipolis / Nice
                                                                                                                             caractéristiques des cellules sénescentes par
                                                                       Le système de surveillance clinique                                                                        en charge adaptée.
                                                                                                                             rapport à l’infection.
                                                                       et virologique mis en place par le réseau                                                                                                                                  La sénescence cellulaire est un processus clé du vieillisse-
                                                                       Sentinelles, Santé publique France et le Centre       Une meilleure connaissance de la cause               Évolution clinique et virologique des patients                  ment physiologique et de nombreuses pathologies liées à
                                                                       national de référence constitue une ressource         du décès par insuffisance respiratoire aiguë         présentant une infection respiratoire aiguë due au              l’âge. Le projet SENOCOVID s’intéresse à la susceptibilité
                                                                       pour suivre en temps réel les infections suivies      induite par le SARS-CoV-2 est fondamentale           SARS-CoV-2 (Covid-19) vus en consultation de soins              des personnes âgées à contracter l’infection au SARS-
                                                                       en consultation de soins primaires.                   pour guider les cliniciens dans la prise en charge   primaires (médecine générale et pédiatrie) – COVID-A            CoV-2. Il étudie la sénescence cellulaire pulmonaire
                                                                                                                             des patients Covid-19 gravement malades.             Appel à projets ANR : Flash Covid-19                            comme cible pour contrôler la Covid-19. Il s’attache aussi à
                                                                       L’identification de marqueurs moléculaires                                                                 Coordinateur : Thierry Blanchon, Institut Pierre-Louis          quantifier l’accumulation des cellules sénescentes au
                                                                                                                             Plusieurs axes de recherche sont explorés
                                                                       diagnostiques, pronostiques et prédictifs                                                                  d’épidémiologie et de santé publique – Sorbonne                 cours de l’infection, à déterminer la nature des cellules
                                                                                                                             qui associent des analyses histologiques
                                                                       de réponse aux traitements est une étape                                                                   Université / Paris                                              sénescentes et les signatures moléculaires de cette sénes-
                                                                                                                             pulmonaires post-mortem couplées à des
                                                                       nécessaire pour mieux comprendre les                                                                       https://anr.fr/projet-ANR-20-COVI-0031                          cence. L’analyse de l’impact d’une sénescence préexis-
                                                                                                                             données cliniques des patients, des analyses
                                                                       mécanismes de l’infection et son évolution                                                                                                                                 tante ou induite sur la réplication virale et les lésions
                                                                                                                             d’images de tomodensitométrie, des analyses
                                                                       chez les patients. Sont étudiés notamment le                                                                                                                               pulmonaires sera analysée au moyen de modèles expéri-
                                                                                                                             des fibrocytes pulmonaires, la caractérisation
                                                                       microbiote de l’oropharynx et du tube digestif                                                             Susceptibilités accrues à l’infection                           mentaux.
                                                                                                                             de la réponse immunitaire humorale de la
                                                                       comme source potentielle de biomarqueurs,
                                                                                                                             muqueuse pulmonaire en utilisant des lavages         Comprendre les susceptibilités à l’infection peut aider à       La sénescence cellulaire pulmonaire comme cible
                                                                       les échantillons sanguins issus de cohorte,
                                                                                                                             bronchoalvéolaires, en étudiant les rôles de         protéger les personnes vulnérables et à orienter le choix,      pour contrôler la Covid-19 – SENOCOVID
                                                                       les marqueurs mitochondriaux et pulmonaires,
                                                                                                                             l’inflammasome et des macrophages.                   et le développement des traitements. L’obésité est un fac-      Appel à projets ANR : RA-Covid-19 – Vague 3
                                                                       le virome respiratoire.
                                                                                                                             Les séquelles à long terme engendrées par            teur aggravant de l’infection au SARS-CoV-2. Le tissu adi-      Coordinateur : François Trottein, Institut Pasteur / Lille
                                                                       Bien que fortement touchés par la pathologie,                                                              peux, infecté par le SARS-CoV-2, pourrait participer            https://anr.fr/projet-ANR-20-COV3-0006
                                                                                                                             la Covid-19 sont présentes chez un grand
                                                                       les poumons ne sont pas les seuls organes                                                                  à la survenue de l’inflammation observée dans les formes
                                                                                                                             nombre de personnes infectées. Des projets de
                                                                       infectés par le virus SARS-CoV-2. L’atteinte                                                               sévères. Le projet COVIFAT a pour objectif de déterminer
                                                                                                                             recherche s’attachent à caractériser d’un point
                                                                       d’autre organes pourraient modifier les                                                                    la pathogenèse de l’infection du tissu adipeux par le SARS-     Identification de biomarqueurs
                                                                                                                             de vue clinique et physiologique ce syndrome.
                                                                       réponses immunitaires des patients.                                                                        CoV-2. Il étudie si le virus infecte plus facilement le tissu
                                                                                                                             Les conséquences du « Covid long » sur
                                                                       Afin d’analyser cette dissémination virale, il est                                                         adipeux de patients obèses par rapport aux patients sans        Le projet iCovid va s’appuyer sur l’archivage exceptionnel
                                                                                                                             l’organisation des soins et la prise en charge
                                                                       nécessaire de disposer de modèles animaux                                                                  surpoids, s’il y a un tropisme particulier pour le tissu adi-   d’échantillons sanguins des patients atteints du SARS-
                                                                                                                             des patients sont aussi abordés.                     peux viscéral ou sous-cutané et quels sont les types cellu-     CoV-2 depuis mars 2020 admis à l’Assistance publique –
                                                                       appropriés, murins et macaques. Des modèles in
                                                                       vitro comme des organoïdes seront aussi utilisés      De nouvelles approches thérapeutiques sont           laires cibles de SARS-CoV-2 au sein du tissu adipeux.           Hôpitaux de Paris. L’objectif est de mener des études
                                                                       afin de mieux comprendre les mécanismes               développées à partir de cellules de cordons                                                                          cas–témoins à partir de groupes définis rétrospective-
                                                                       d’infection du SARS-CoV-2 et des variants. Les        ombilicaux ou utilisant des dérivés de la            Rôle du tissu adipeux au cours de la Covid-19 : de la physio­   ment en fonction de leur évolution clinique afin de définir
                                                                       effets du SARS-CoV-2 sur le système vasculaire,       mélatonine. Une étude observationnelle               pathologie aux perspectives thérapeutiques – COVIFAT            les paramètres immunomiques cinétiques caractérisant
                                                                       cardiovasculaire et le système nerveux central        propose de valider l’efficacité d’un programme       Appel à projets ANR : RA-Covid-19 – Vague 3 – Financé           les différents profils d’évolution. Cette recherche fonda-
                                                                                                                                                                                  par la Fondation de France                                      mentale doit également déboucher sur la définition de
                                                                       font aussi l’objet de travaux de recherche.           de télé-réhabilitation respiratoire pour des
                                                                                                                                                                                  Coordinateur : Olivier Bourron, UMR U955 – Institut Mondor      biomarqueurs de sévérité et contribuer à la définition de
                                                                                                                             patients post-Covid-19 porteurs de séquelles.
                                                                       Compte tenu de la variabilité de la susceptibilité                                                         de recherche biomédicale (IMRB) – Inserm / Créteil              nouvelles cibles thérapeutiques.
                                                                                                                             Les bases de données médico-administratives
                                                                       à l’infection, Il est important de comprendre
                                                                                                                             seront également utilisées afin d’identifier les
                                                                       les facteurs de risque des formes sévères ou                                                               Un parallèle peut être établi entre la gravité de l’infection   Immunopathologie de la Covid-19 à l’Assistance
                                                                                                                             troubles organiques à moyen terme chez les
                                                                       de l’environnement tolérogène chez certaines                                                               par le SARS-CoV-2 et le vieillissement. Le projet COST vise     publique Hôpitaux de Paris – iCovid
                                                                                                                             sujets infectés par le SARS-CoV-2                    à déterminer si la plus grande vulnérabilité de certains        Appel à projets ANR : Flash Covid-19 – Financé
                                                                       populations, comme les plus jeunes, et d’identifier
                                                                       les causes de susceptibilité à l’infection pour                                                            patients à une infection grave par le SARS-CoV-2 est asso-      par la Fondation de France et par l’ANR
                                                                       protéger les personnes vulnérables et orienter                                                             ciée à un dysfonctionnement télomérique et si le traite-        Coordinateur : Guy Gorochov, Centre d’immunologie
                                                                       le choix des traitements.                                                                                  ment à la dexaméthasone diminue la mortalité des                et de maladies infectieuses – Inserm / Paris
                                                                                                                                                                                  patients en renforçant la protection des télomères, préve-      https://anr.fr/projet-ANR-20-COVI-0025
                                                                                                                                                                                  nant ainsi la sénescence et le vieillissement des cellules.
                                                                                                                                                                                  Cette étude pourrait aider à identifier les patients à haut

                                                                  14                           COVID-19 PANORAMA DES PROJETS DE RECHERCHE FINANCÉS                                                                    COVID-19 PANORAMA DES PROJETS DE RECHERCHE FINANCÉS                                      15
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