Document de Référence SAPIENs - Mars 2021
←
→
Transcription du contenu de la page
Si votre navigateur ne rend pas la page correctement, lisez s'il vous plaît le contenu de la page ci-dessous
Version 2 mars 2021. Rédigée par Alexandra Carlin, Fondation SCI, Londres R-U. Avec le soutien d’Ascend West et du Fonds central d’innovation 2
Document de référence SAPIENs : Une méthode d’évaluation démographique relative aux Distributions de masse de médicaments Table des matières 1. Abréviations et définitions ...................................................................................................... 5 2. Introduction ............................................................................................................................ 6 2.1. Objectif du document de référence SAPIENs.................................................................. 6 2.2. Public cible ..................................................................................................................... 7 2.3. Qu’entendons-nous par « données démographiques modélisées » ? ............................. 8 2.4. Considérations sur l’utilisation des données modélisées de WorldPop dans la planification liée aux MTN.......................................................................................................... 9 2.4.1. Population modélisée 1 : Approche ascendante de WorldPop ................................. 9 2.4.2. Population modélisée 2 : Approche descendante de WorldPop ............................. 10 2.5. Options étendues de téléchargement de données modélisées destinées à la planification liée aux MTN ........................................................................................................................... 11 3. Phase 1 : Préparation des données ..................................................................................... 12 3.1. Formats de données SIG les plus courants .................................................................. 12 3.2. Où trouver des données SIG ?...................................................................................... 13 3.3. Manipulation des données SIG ..................................................................................... 13 3.3.1. Pourquoi manipuler les données SIG ? .................................................................. 13 3.3.2. Quel logiciel gratuit utiliser ? .................................................................................. 14 3.3.3. Comment sélectionner des régions par attribut parmi les données SIG ? .............. 14 3.3.4. Comment exporter des données au format GeoJSON ? ........................................ 15 3.4. Préparation du Manuel d’étude démographique SAPIENs ............................................ 15 4. Phase 2 : Collecte et gestion des données .......................................................................... 17 4.1. Population 1 : Demande de médicaments..................................................................... 19 4.2. Population 2 : Rapport sur le traitement ........................................................................ 19 4.3. Population modélisée 1 : Obtention des données d’approche ascendante de WorldPop sur l’interface web woprVision ................................................................................................. 20 4.3.1. Étape 1 – Aperçu du site ........................................................................................ 20 4.3.2. Étape 2 – Sélection du pays .................................................................................. 21 4.3.3. Étape 3 – Sélection de l’emplacement ................................................................... 22 4.3.4. Étape 4 – Sélection des groupes d’âge et de sexe ................................................ 23
4.3.5. Étape 5 – Sélection des paramètres d’incertitude .................................................. 24 4.3.6. Étape 6 – Sauvegarde des résultats de woprVision ............................................... 25 4.4. Population modélisée 2 : Obtention des données d’approche descendante de WorldPop sur le site web de WorldPop .................................................................................................... 26 4.4.1. Étape 1 – Téléversement de votre fichier de formes sur QGIS............................... 27 4.4.2. Étape 2 – Ajout du package de jeux de données wpgp à QGIS ............................. 27 4.4.3. Étape 3 – Téléchargement du jeu de données sélectionné sur la base du package de jeux de données wpgp .................................................................................................... 28 4.4.4. Étape 4 – Utilisation des jeux de données wpgp .................................................... 28 4.4.5. Étape 5 – Obtention de données démographiques à l’échelon de l’unité administrative ....................................................................................................................... 29 4.4.6. Étape 6 – Répétition de l’action pour toutes les layers agesexe nécessaires. ........ 34 4.4.7. Étape 7 – Extraction des données démographiques vers un fichier .csv. ............... 35 4.5. Nombre de traitements ................................................................................................. 36 4.6. Saisie des données dans le Manuel d’étude démographique........................................ 37 5. Phase 3 : Analyse et aides à la visualisation des données ................................................... 38 5.1. Feuille : 2. Collecte des données .................................................................................. 38 5.1.1. Total des préEAS, EAS et adultes .......................................................................... 38 5.1.2. Différences démographiques ................................................................................. 38 5.1.3. Couverture rapportée réalisée (EAS) ..................................................................... 39 5.2. Feuille : 3. Analyse des données................................................................................... 39 5.3. Feuille : 4. Outils de visualisation des données ............................................................. 42 6. Phase 4 : Transmission des données................................................................................... 44 6.1. Planification des programmes MTN et rédaction de rapports sur ceux-ci. ..................... 44 6.2. Chiffres à l’échelon national .......................................................................................... 47 7. Annexes ............................................................................................................................... 47 7.1. Annexe 1 : Sources démographiques facultatives destinées à des décisions à l’échelon national.................................................................................................................................... 47 7.1.1. Population 3 : Tierce partie (facultative) ................................................................. 48 4
1. Abréviations et définitions Unité administrative (Admin) – Unités territoriales d’un pays Adultes – Personnes âgées de plus de 15 ans EQD – Evaluation de la qualité des données RDC – République Démocratique du Congo ESPEN – Projet spécial élargi pour l’élimination des maladies tropicales négligées SIG – Système d’information géographique HDX – Humanitarian Data Exchange UMO – Unité de mise en œuvre JAP Package de demande jointe JRSM – Joint Request for Selected PC Medicines (Demande jointe relative à des médicaments de chimioprévention) JRF – Joint Reporting Forms (Formulaires de rapports conjoints) JSON – Java Script Open Notation FL – Filariose lymphatique DMM– Distribution de masse de médicaments MS – Ministère de la Santé ONG – Organisation non gouvernementale ONS – Office national de statistique MTN – Maladies tropicales négligées BCAH – Bureau de la coordination des affaires humanitaires CP – Chimioprévention Pré EAS – Enfants d’âge préscolaire (> 5 ans) EAS – Enfants d’âge scolaire (≥ 5-14 ans) FNUP – Fonds des Nations Unies pour la population OMS – Organisation mondiale de la Santé WOPR - WorldPop Open Population Repository (carte interactive d’estimation démographique) 5
2. Introduction L’Organisation mondiale de la Santé (OMS) recommande des cibles de couverture spécifiques pour la chimioprévention (CP) des maladies tropicales négligées (MTN) afin d’assurer l’efficacité des distributions de masses de médicaments (DMM)1. Un échec dans ce domaine, même pour un petit nombre de personnes infectées, peut perpétuer la propagation et miner les efforts d’éradication. Pour les unités de mise en œuvre actuelles et futures (UMO), des estimations démographiques globales précises et des données ventilées par âge et par sexe sont donc cruciales pour la planification et l’application des stratégies d’intervention liées à la CP. La rareté des recensements nationaux dans de nombreux pays frappés par des MTN endémiques empêche souvent les Ministères de la Santé (MS) de disposer de données démographiques précises. Et par conséquent l’absence d’une source démographique plus fiable ou les conséquences de données imprécises peuvent compliquer la lutte menée contre ces maladies. Pour s’attaquer à ce problème, un projet nommé SAPIENs a été conçu. Cet outil, dédié aux évaluations démographiques des zones peu étendues, a été mené par Ascend West et son Fonds central d’innovation. Ils ont examiné les données démographiques modélisées et mis au point une méthodologie destinée à aider les gestionnaires de données MTN. Ce document de référence SAPIENs résulte du projet homonyme. 2.1. Objectif du document de référence SAPIENs Là où des imprécisions ou des différences existent dans les données des programmes MTN, le document de référence est disponible. Il aide les gestionnaires de programmes MTN à évaluer et résoudre les problèmes de données démographiques officielles utilisées pour la planification et/ou l’évaluation des DMM. Le Document de référence SAPIENs décrit une méthode et des sources pertinentes d’évaluation des données démographiques actuelles et de comparaison de celles-ci avec trois autres sources démographiques, dont des données démographiques modélisées. Par ailleurs, il fournit d’autres conseils sur la transmission des résultats par l’intermédiaire d’un atelier, ainsi que des points de conclusion sur les prochaines étapes proposées aux programmes MTN. La République Démocratique du Congo (RDC) a servi d’exemple pour illustrer le processus de collecte des données. Ce pays a été choisi au hasard parmi les données démographiques modélisées disponibles à ce moment-là. Tout résultat illustré dans le Document de référence 1OMS (2011) Lutte contre les géohelminthiases chez les enfants d’âge scolaire : Guide à l’intention des responsables des programmes de lutte. 6
SAPIENs n’est pas lié à la RDC. Il a été créé sur la base de données fabriquées pour les besoins de ce document. Le document de référence SAPIENs inclut les processus suivants : • Introduction – elle présente les données démographiques modélisées utilisées dans ce Document de référence SAPIENs et leurs limites ; • Phase 1 : Préparation des données – elle aborde les données du Système d’information géographique (SIG) et le Manuel d’étude démographique. De même, elle aide à la collecte et à la préparation nécessaires à la finalisation de ce Manuel ; • Phase 2 : Collecte et gestion des données – aide au téléchargement des données démographiques à partir de toutes les sources et montre comment saisir les données collectées dans le Manuel d’étude démographique ; • Phase 3 : Analyse et outils de visualisation des données – explique comment interpréter les analyses et les outils de visualisation produits par le Manuel d’étude démographique ; • Phase 4 : Transmission des données – fournit des suggestions sur le partage des résultats avec les politiques et les décideurs. De nombreuses pages web ou des ressources en ligne mentionnées dans ce document sont disponibles uniquement en Anglais. Où cela est possible, des conseils sur la manière de modifier la langue des pages web sont offerts. Dans le cas contraire, il est toutefois recommandé d’utiliser l’option d’auto-traduction de Google Chrome pour traduire les pages dans la langue de votre choix. Pour des conseils sur l’auto-traduction de votre page web avec Google Chrome, rendez- vous ici ou cliquez sur le lien bit.ly/3b7XLGP. 2.2. Public cible Le Document de référence SAPIENs s’adresse aux gestionnaires de données MTN ou aux gestionnaires de données employés par un MS national. D’autres tierces parties intéressées telles que les gestionnaires de programmes des Organisations non gouvernementales (ONG) liées aux MTN et les chercheurs utiliseront profitablement les instructions de ce document. Veuillez toutefois noter que les tierces parties peuvent éprouver des difficultés à obtenir certaines données mentionnées dans ce dernier si elles ne sont pas disponibles en ligne comme le Joint Request for Selected PC Medicines (JRSM). Le cas échéant, des conseils sur d’autres sources destinées à la collecte sont fournis. Cependant, comme les tierces parties n’appartiennent pas au public cible, cela n’est pas garanti. 7
2.3. Qu’entendons-nous par « données démographiques modélisées » ? WorldPop2, un groupe de recherche de l’Université de Southampton contribue à la résolution de problèmes d’exactitude des données démographiques, surtout dans les régions où les informations issues d’un recensement national récent manquent. En collaboration avec les Offices nationaux de statistique (ONS), WorldPop a mis au point des méthodes revues par les pairs de modélisation géospatiale des données de répartition démographique. Plus particulièrement, ces modèles mesurent les populations en divisant un pays en carrés de 100 m2 et en imputant une valeur prédite à la population par carré. Par exemple, si d’après les informations fournies au modèle, le carré couvre un groupe d’immeubles situés dans une partie de la ville densément peuplée, ce carré atteindra une valeur démographique élevée. De même, la valeur démographique d’un carré situé au milieu d’une réserve naturelle ou d’une zone inhabitée, sera faible. Ainsi, la population totale d’une région correspond à la somme des valeurs démographiques de tous ses carrés. Etant donné que l’utilisation d’une grille carrée n’est liée à aucune frontière d’UMO en particulier, elle peut être adaptée rapidement. Il est également facile de recalculer les données démographiques modélisées si les frontières des UMO changent, par exemple en cas de redécoupages. Ce guide méthodologique fournira des instructions sur la manière de collecter deux types différents de jeux de données démographiques. Celles-ci sont modélisées à partir des ressources WorldPop : 1) Jeux de données liées à l’approche ascendante et 2) Jeux de données liées à approche descendante. Ces jeux de données sont créés par deux modèles statistiques différents : 1. Le modèle d’approche ascendante utilise des données issues de micro-recensements récents et des données géospatiales afin de façonner un modèle statistique d’estimation du nombre de personnes et les ventilations par âge/sexe dans toutes les régions non échantillonnées. Il recourt à des mesures d’incertitude pour combler les vides d’un recensement où une énumération complète est impossible ; 2. Le modèle d’approche descendante utilise des données issues de recensements nationaux actuels et des jeux de données géospatiales, d’ordinaire uniquement disponibles sous la forme de totaux démographiques par unité administrative3, afin de façonner un modèle statistique. Ce dernier ventile les résultats du recensement national pour donner une grille constituée de carrés de 100 m x 100 m ou de 1 km x 1 km. Avant de passer aux étapes suivantes de ce document méthodologique, nous vous conseillons de consacrer environ 30 minutes à la lecture de la page web du site de WorldPop. Dédiée à la 2Site web : https://www.worldpop.org/ [consulté le 29/10/2020] 3 Unités territoriales d’un pays 8
cartographie des populations, elle est accessible ici ici ou sur https://bit.ly/3nPBh0b. Cette page web est seulement disponible en Anglais. Veuillez donc la traduire à l’aide de l’option de traduction de Google Chrome mentionnée dans la section 2.1. Objectif du document de référence SAPIENs. Cette page fournit une explication détaillée des méthodes de modélisation démographique selon les approches ascendantes et descendantes. La page aborde aussi leurs avantages et inconvénients. En outre, une matrice de décision succincte éclaire l’utilisateur sur la méthode de modélisation la mieux adaptée. 2.4. Considérations sur l’utilisation des données modélisées de WorldPop dans la planification liée aux MTN (dernière mise à jour : 12/10/2020) Complétant la page web de WorldPop dédiée à la cartographie des populations accessible ici ou sur https://bit.ly/3nPBh0b, cette section mentionne des considérations majeures sur le choix des données démographiques modélisées de WorldPop. Celles-ci conviennent en particulier à la planification et/ou aux rapports liés aux MTN. 2.4.1. Population modélisée 1 : Approche ascendante de WorldPop 1. Le WorldPop Open Population Repository (WOPR) est accessible par la plateforme en ligne woprVision. Conçue par WorldPop en vue de faciliter le téléchargement des données liées à l’approche ascendante, elle est accessible ici ou sur https://bit.ly/3oS1MTY. Davantage de conseils sur l’utilisation de cette plateforme et la modification de la langue seront disponibles durant la Phase 2 : Collecte et gestion des données. Cependant, comme il faut généralement collecter des informations issues d’enquêtes de micro-recensement pour compléter le modèle d’approche ascendante, tous les pays n’ont probablement pas encore accès à des données démographiques par woprVision. Dans les cas où les données démographiques obtenues par approche ascendante n’existent pas, deux options se présentent : a. Vous pouvez utiliser d’autres données démographiques modélisées fournies par WorldPop, par exemple, celles liées à l’approche descendante ou les outils rapides de cartographie démographique tels que peanutButter, ou suivez le lien bit.ly/3sH6CoN ; b. Vous pouvez vous servir du Document de référence SAPIENs pour enquêter et réunir des preuves sur des problèmes relatifs aux données démographiques actuelles utilisées dans un programme MTN. Il s’agit de comparer toutes les données démographiques disponibles. Ces résultats peuvent être utilisés comme justification pour contacter le Fonds des Nations Unies pour la population (FNUP) ou WorldPop. 9
Ainsi, vous continuerez à examiner d’autres options relatives aux données démographiques éventuellement en possession du pays. 2. Même si l’approche ascendante fournit des estimations démographiques plus actualisées, souvent sur la base de données collectées par micro-recensement, elle ne remplace pas les données actualisées de recensement national. Il faudrait donc considérer l’approche ascendante comme une option offrant des données démographiques mieux actualisées. Elle repose sur une collecte de données abordable là où les données de recensement national sont soit indisponibles soit obsolètes (par exemple supérieures à 3 ans). 2.4.2. Population modélisée 2 : Approche descendante de WorldPop 1. Pour les populations modélisées selon l’approche descendante, il n’existe aucune donnée disponible pour la variance. Par conséquent, il est impossible de calculer les intervalles de confiance supérieurs et inférieurs. Il n’en va pas de même pour les données modélisées selon l’approche ascendante, là où elles peuvent être collectées. 2. Grâce à la méthode de modélisation, l’approche descendante repose sur des données démographiques existantes ajoutées au modèle. La qualité des résultats des populations modélisées dépend donc de la qualité des données. Dans le cas de l’approche descendante de WorldPop, il s’agit fréquemment de données issues d’un recensement national ou de projections/estimations officielles. Par conséquent, si elles sont obsolètes, elles peuvent déboucher sur des résultats de populations modélisées inexacts. Toutefois, en cas d’indisponibilité des données démographiques actuelles à une petite échelle géographique, les estimations obtenues par les modèles d’approche descendante pourraient mieux expliquer les distributions démographiques spatiales actuelles. 3. L’atout majeur du modèle d’approche descendante réside dans sa disponibilité dans tous les pays. De plus, il est possible de modifier la source démographique utilisée pour ces modèles à l’aide d’un code de programmation en R et de conseils fournis par WorldPop. Cette démarche nécessite toutefois une expérience étendue de la programmation en R et de la modélisation statistique. 4. En l’absence de plateforme de téléchargement telle que woprVision, les données démographiques modélisées par approche descendante seront d’ordinaire téléchargeables dans ce qu’on appelle un fichier « raster », qui ressemble à une photo. Les données raster forment une matrice de pixels organisés en grille, où chaque valeur de cellule de grille représente des données du monde réel, telles que la température. Davantage d’informations sur les données raster sont accessibles ici ou sur bit.ly/2OeqFvM. Afin de lire les fichiers raster, il faut utiliser un programme (par exemple un programme en R ou un logiciel QGIS) pour extraire les valeurs numériques du fichier raster. Ce processus est expliqué dans la section 4.4.Population modélisée 2 : Obtention des données d’approche descendante du site web de WorldPop. 10
2.5. Options étendues de téléchargement de données modélisées destinées à la planification liée aux MTN Ce document présente différentes méthodes de téléchargement de données modélisées de WorldPop. Pour vous aider à trouver l’option qui vous convient le mieux lors du téléchargement de la Population modélisée 1 : approche ascendante et Population modélisée 2 : approche descendante, une échelle des compétences est disponible dans le Tableau 1 ci-dessous. Ce tableau est organisé selon vos compétences (ou celles de votre équipe) relatives à la programmation en R. Les options vont de « Aucune expérience à expérience limitée » à « Expérience étendue » en passant par « Expérience moyenne ». Ce Document de référence SAPIENs va se focaliser sur l’accompagnement d’une personne dans l’option « Aucune expérience à expérience limitée », vu qu’elle est la plus accessible. Durant la Phase 2 : Collecte et gestion des données, si vous êtes capable de passer à l’étape « Expérience moyenne » ou « Expérience étendue », veuillez commencer la collecte des données de la Population modélisée 1 : approche ascendante et Population modélisée 2 : approche descendante en utilisant les conseils et les codes associés. Cependant, veuillez suivre le reste du Document de référence SAPIENs, comme il est écrit, sans modifications. Tableau1. Échelle des compétences représentant les options disponibles pour accéder aux données modélisées de WorldPop. Ces options dépendent des compétences en programmation en R. Aucune expérience à Expérience moyenne Expérience étendue expérience limitée de la programmation en R programmation en R programmation en R Servez-vous de la Servez-vous de la méthode Enquêtez sur la possibilité méthode de référence de référence SAPIENs de collecte des données SAPIENs pour collecter pour collecter des données issues de micro- des données démographiques recensements. Dès que la Population démographiques modélisées selon collecte a été effectuée, modélisée 1 : modélisées selon l’approche ascendante en modifiez le code du modèle Approche l’approche ascendante en vous basant sur l’interface de données d’approche ascendante vous basant sur l’interface woprVision. ascendante. Il est disponible woprVision. dans les articles de journaux de WorldPop avec les données de micro- recensement collectées. 11
Servez-vous de la Utilisez le code disponible Modifiez le code de méthode de référence sur le site web de l’approche descendante afin SAPIENs pour collecter WorldPop pour télécharger d’exécuter le modèle avec la des données les fichiers TIFF Population 1 : Demandes de Population démographiques d’approche descendante médicaments. Ce sont les modélisée 2 : modélisées selon au moyen de la données préliminaires approche l’approche descendante programmation en R. saisies ; il ne s’agit pas des descendante en vous basant sur les Programmation en R sur données de recensement jeux de données wpgp de GitHub disponible sur obsolètes. Le code de QGIS. https://bit.ly/3tfH03p ou ici. WorldPop est disponible sur worldpop.org/wprfpms. 3. Phase 1 : Préparation des données L’utilisation de chaque type de données modélisées de WorldPop passe obligatoirement par un fichier vectoriel numérique. Il est nécessaire à la représentation des frontières des UMO qui peuvent être utilisées dans les programmes SIG. Les données vectorielles correspondent à la façon dont les données géographiques ou spatiales sont stockées. Elles comprennent des lignes ou des arcs avec des points de départ et d’arrivée joints à des nœuds, créant par exemple une carte des frontières administratives. Davantage d’informations sur les données vectorielles sont accessibles ici ou sur bit.ly/3kzEOjo. 3.1. Formats de données SIG les plus courants Les fichiers SIG existent en plusieurs formats. Une introduction générale est disponible ici sur Wikipedia (bit.ly/3bRaMDD). La délimitation des frontières administratives se base sur un polygone bidimensionnel couvrant la région particulière du pays ou des pays qui nous intéressent. Ces informations sont fréquemment encodées dans trois sortes de fichiers de données : 1. Fichiers de formes : il s’agit du type de fichiers le plus courant. Il possède l’extension « .shp » ; 2. Géo-databases : une géo-database est une base de données optimisée destinée au stockage de données dans un espace géométrique. Ce type de base est souvent disponible pour le téléchargement comme fichier zip contenant un dossier classeur_nom.gdb qui inclut la base de données ; 3. Fichiers GeoJSON : GeoJSON est un format de fichiers conçu pour la représentation de caractéristiques géographiques simples. Son nom signifie JavaScript Object Notation (davantage de détails sur le format sont accessibles ici ou sur bit.ly/30aDgmh). 12
3.2. Où trouver des données SIG ? Les principales sources de collecte des données SIG proviennent de : l’ONS, le MS, d’autres institutions nationales, la plateforme de l’Humanitarian Data Exchange (HDX) (accessible ici ou sur https://data.humdata.org/fr/), ou encore la plateforme de la GADM (accessible ici ou sur https://gadm.org/4). La source à employer dépend du contexte. En général, nous vous conseillons d’essayer d’abord d’obtenir les données de votre département MTN au sein du MS. C’est particulièrement important si les frontières des UMO utilisées dans le programme MTN sont spécifiques à votre département MTN. Par exemple, si l’UMO est un district de santé, d’autres ministères ou agences gouvernementales peuvent ne pas utiliser les mêmes frontières pour chaque district. S’il n’est pas possible d’obtenir les données du MS, adressez-vous à d’autres sources gouvernementales. En effet, celles-ci sont chargées de définir et d’actualiser les frontières. Ces sources sont, par exemple, l’ONS ou l’administration foncière d’un pays. Certaines agences peuvent facturer des frais d’accès aux données. Si aucune donnée officielle n’est trouvée, la troisième option consiste à chercher des données disponibles en ligne, aussi appelées données Open Source. La plateforme de l’HDX, un regrouper utile de telles données est un outil de partage géré par le Bureau de la coordination des affaires humanitaires de l’ONU (BCAH). Pour accéder à cette plateforme, cliquez ici ou rendez-vous sur https://data.humdata.org/fr/. Dans la mesure où il s’agit d’une plateforme ouverte, nous conseillons de vérifier soigneusement l’actualité et la fiabilité des données sous- jacentes ou « métadonnées ». 3.3. Manipulation des données SIG 3.3.1. Pourquoi manipuler les données SIG ? Les données SIG actuellement en votre possession peuvent contenir plus que vos UMO choisies. Cela signifie qu’il faut extraire un sous-ensemble des données (par exemple uniquement les unités de mise en œuvre d’une certaine partie du pays et non du pays tout entier). D’autre part, vos données peuvent être dispersées sur plusieurs fichiers de données, ce qui implique qu’il faille les fusionner dans un seul fichier. De plus, le format des données peut différer de celui désiré. Pour la collecte des sources démographiques, Population modélisée 1 : Approche ascendante et Population modélisée 2 : Approche descendante, les données SIG doivent être au format GeoJSON. Par conséquent, si 4Site web : https://fr.wikipedia.org/wiki/GADM [consulté le : 02/03/2021] 13
vous avez obtenu des données qui ne sont pas dans ce format, convertissez-les suivant les indications de la section 3.3.4.Comment exporter des données au format GeoJSON 3.3.2. Quel logiciel gratuit utiliser ? Un certain nombre d’applications gratuites sont disponibles pour la manipulation et l’utilisation des données SIG, dont des programmes d’interface SIG ou des langages plus génériques tels que R ou Python. Pour un nouvel utilisateur, une application logicielle SIG est la plus accessible. Une comparaison de programmes est disponible ici ou sur https://bit.ly/2LtUNm3. Ce site web est en Anglais. Si vous avez besoin d’une autre langue, nous vous suggérons de recourir à l’option de traduction de Google Chrome mentionnée dans la section 2.1.Objectif du document de référence SAPIENs. Ce document explique comment se servir du logiciel SIG Open Source : QGIS. Il s’agit d’un package gratuit. De plus, le logiciel bénéficie d’une large communauté d’utilisateurs et d’une aide en ligne satisfaisante. Cliquez ici ou rendez-vous sur https://bit.ly/35Okdl5 pour télécharger QGIS. Pour changer la langue de la page de téléchargement, veuillez cliquer et changer la langue en utilisant le menu déroulant situé dans le coin supérieur droit (cercle vert, Figure 1). Une série de tutoriels d’introduction à QGIS sont disponibles en plusieurs langues ici ou sur bit.ly/304e54V. La langue officielle de QGIS est l’Anglais. Le package est donc uniquement disponible dans cette langue. Pour ajouter le contexte requis par l’utilisation de QGIS, des traductions françaises seront fournies entre parenthèses à côté des mots/termes en Anglais. Figure 1. Capture d’écran de la page web destinée au téléchargement du package QGIS et au changement de langue. 3.3.3. Comment sélectionner des régions par attribut parmi les données SIG ? La plupart du temps, un jeu de données relatives aux UMO contiendra les UMO du pays tout entier. Il se peut qu’une seule région vous intéresse. Par exemple, si une DMM a lieu dans l’est du pays ou si les données modélisées sont uniquement disponibles pour certaines régions du pays, vous devez limiter les données à ces régions. La manière la plus facile de sélectionner les régions consiste à utiliser les attributs des données. Supposons que vous ayez un jeu de données au format fichier de formes (.shp) contenant les frontières de toutes les UMO de la RDC, mais que seule l’estimation de la population du Kongo- Central, où vous planifiez une DMM imminente, vous intéresse. Supposons aussi qu’il existe pour 14
vos données une colonne qui indique la province correspondant aux différentes UMO. Cela définit souvent les frontières administratives dans les fichiers SIG. Utilisez alors les outils « Select Features by Value » (Sélectionnez les fonctionnalités par valeur) ou « Select Features by Expression » (Sélectionnez les fonctionnalités par expression) de QGIS pour sélectionner toutes les caractéristiques, par exemple toutes les UMO pour lesquelles les informations relatives à la province concernent la région souhaitée. Figure 2. Capture d’écran affichant le chemin d’accès et la fenêtre pop-up qui s’ouvre alors pour l’outil « Select Feature by Value ». Cliquez ici ou allez sur bit.ly/3r7K6VC, pour regarder des tutoriels QGIS. Ils expliquent comment effectuer ce type de sélection par attribut. 3.3.4. Comment exporter des données au format GeoJSON ? La plupart des données relatives aux frontières administratives (SIG) sont stockées sous la forme d’un fichier de formes (.shp) (ou shapefile). Pour d’autres conseils, un tutoriel sur la manière d’exporter un fichier de données au format GeoJSON est disponible ici ou sur bit.ly/3r7K6VC. 3.4. Préparation du Manuel d’étude démographique SAPIENs Les données démographiques collectées sont saisies dans le Manuel d’étude démographique. Ce manuel Excel a été créé pour être utilisé avec le Document de référence SAPIENs afin de standardiser la collecte des données, faciliter leur saisie, automatiser leur analyse et les aides à la visualisation nécessaires à la présentation des résultats. Une explication succincte au sujet des feuilles du Manuel d’étude démographique est disponible dans le Tableau 2 ci-dessous ou sur la « Feuille 1. Instructions » du Manuel. 15
Tableau2. Tableau figurant dans le Manuel d’étude démographique, Feuille : 1. Instructions assorties des contenus des feuilles et de phases supplémentaires contenues dans le Document de référence SAPIENs. Numéro Phase correspondante du Nom de la de la document de référence Que contient-il ? feuille feuille SAPIENs Le document inclut des instructions sur le Manuel d’étude démographique et des 1 Instructions ND tableaux de définition préliminaires nécessaires à la collecte des données. Cette partie inclut un canevas vide destiné à la collecte de toutes les données démographiques brutes issues de toutes les Collecte des Phase 2 : Collecte et gestion 2 sources démographiques. Basez-vous sur le données des données Document de référence SAPIENs, ainsi que sur quelques calculs préliminaires pour les analyses. Phase 3 : Analyse des données et aides à la Elle inclut quatre tableaux de résultats Analyse des visualisation des données, reprenant des calculs automatisés et un 3 données 5.1. Feuille : 2. Collecte des tableau supplémentaire destiné aux conseils données, 5.2. Feuille : 3. pour une analyse manuelle. Analyse des données Phase 3 : Analyse et outils Elle inclut quatre outils de visualisation des Outils de de visualisation des données automatisés sur la base des 4 visualisation données, 5.3. Feuille : 4. données de la phase 3. Feuille d’analyse des des données Outils de visualisation des données. données Elle contient un canevas vide destiné au listage des noms d’unités administratives et Variations du Phase 2 : Collecte et gestion enregistre les variations rencontrées dans les 5 nom d’admin des données documents. Celles-ci concernent les noms comparés avec la population 1 : Demande de médicaments. Préparation de la Phase 2 : Collecte des données : il faut remplir deux tableaux sur la Feuille : 1. Instructions du Manuel d’étude démographique SAPIENs. • Tableau d’enregistrement des sources démographiques : Enregistrez les sources officielles de toutes vos données démographiques sélectionnées dans le Tableau intitulé « Enregistrement des sources démographiques ». Le nom de source doit inclure le nom du document (par exemple JRSM ou rapport de données d’DMM), l’année des données et la plateforme de collecte [par exemple, le portail du Projet spécial élargi pour l’élimination des maladies tropicales négligées (ESPEN) ou HDX]. Par exemple, si les données de la Population 1 : Demande de médicaments ont été collectées depuis le JRSM de 2019 du portail d’ESPEN, la source peut être enregistrée sous le nom suivant « Données JRSM 2019 (portail d’ESPEN) ». 16
Figure 3. Capture d’écran du tableau de l’enregistrement de la source démographique trouvée sur la Feuille : 1. Instructions du Manuel d’étude démographique SAPIENs. • Définitions de l’unité programmatique : Enregistrez les noms des unités administratives de votre pays dans le tableau « Définitions des unités programmatiques de l’admin » inclus dans la Feuille 1 : Instructions. Par exemple, ce sera généralement Admin 1 : Région, Admin 2 : District, Admin 3 : Sous-district5. • Remarque : si vous avez besoin d’unités administratives plus petites que Admin 3, veuillez modifier les en-têtes des colonnes correspondantes (cellules B14, C14 et D14) et effectuer également la saisie brute des noms des unités administratives (cellules B15, C15, et D15). Figure 4. Exemple de définition de l’unité programmatique de l’admin tableau (inférieur) et manière dont cela s’affiche automatiquement à côté des colonnes Admin 1, Admin 2, et Admin 3 (supérieur). 4. Phase 2 : Collecte et gestion des données Durant la collecte des données, vous collecterez quatre sources démographiques et un jeu de données relatives aux nombres de traitements. Vous avez alors la possibilité de collecter une source démographique supplémentaire si les preuves sont nécessaires à des décisions prises à l’échelon national, et non des décisions programmatiques liées aux MTN. Des conseils sur la collecte de cette source sont disponibles dans l’Annexe 1 : Sources démographiques facultatives destinées à des décisions à l’échelon national. 5Admin 1, Admin 2, et Admin 3 sont des nomenclatures utilisées couramment dans une hiérarchie administrative. Par exemple, la région, le district, le sous-district. 17
1. Population 1 :Demande de médicaments – la source démographique utilisée durant les dépôts de demande de médicaments relatifs à l’DMM. 2. Population 2 :Rapport sur le traitement – la source démographique utilisée durant le rapport sur le traitement relatif à l’DMM. Il s’agit d’un rapport interne (MS) ou externe (ESPEN). Il convient de préférer la source démographique utilisée pour les rapports du MS si celle-ci diffère de celle du rapport fourni à ESPEN. 3. Population modélisée 1 – les résultats de la modélisation par approche ascendante de WorldPop. 4. Population modélisée 2 – les résultats de la modélisation par approche descendante de WorldPop. 5. Population 3 : Tierce partie – la source démographique utilisée par une organisation d’aide au développement ou un autre organisme fiable. Elle doit être utilisée pour des prises de décisions à l’échelon national. 6. Nombre de traitements – les nombres de traitements correspondant à la DMM planifiée sur la base de Population 1 : Demande de médicaments et Population 2 : Rapport sur le traitement. Ces données démographiques collectées devront être : 1. Population 1 : Demande de médicaments, Population 2 : le rapport sur le traitement et le nombre de traitements concernera la même DMM, ainsi que la DMM la plus récente et pour laquelle toutes ces données sont disponibles. Aussi, les données des Populations modélisées 1 et 2 seront collectées l’année de la DMM. Là où cette dernière dure deux ans, ce sera l’année de son lancement qui compte ; 2. Niveau administratif coïncidant avec les données collectées du fichier de formes trouvé dans la Phase 1 : Préparation des données. a. Remarque : Lors de la comparaison de différents fichiers, il est fréquent que les unités administratives ne correspondent pas à 100 %. Par conséquent, trouvez les sources dont les unités administratives se ressemblent le plus et enregistrez les différences d’orthographe, de nom ou les valeurs manquantes dans la feuille intitulée « Admin_Nom_Variations » de votre Manuel d’étude démographique. Par exemple, dans l’un des documents, un district pourrait s’appeler « Dingela » dans une source et « Dingila » dans d’autres sources ; 3. Ventilation par âge, surtout dans les groupes d’âge requis pour la planification de programmes MTN. Par exemple, dans le cas de la schistosomiase, la ventilation s’effectuera selon les critères PréEAS (> 5 ans), EAS (≥ 5-14 ans) et Adultes (15 ans et plus). 18
4.1. Population 1 : Demande de médicaments Les trois sources de collecte pour la Population 1 : Demande de médicaments liée aux programmes MTN sont : 1. Le portail d’ESPEN. Les données du Package de demande jointe (JAP) le plus récent relatif à la planification de programmes MTN peuvent souvent être téléchargées ici sur le portail d’ESPEN (https://bit.ly/2LCKr3a). Pour changer la langue de ce portail en français, anglais, portugais ou espagnol, servez-vous du menu déroulant situé dans le coin supérieur droit (cercle vert, Figure 5). Vous aurez besoin d’un document spécifique : la JRSM. Il s’agit de la feuille Excel que vous utilisez pour demander des médicaments à l’OMS. Ce document est donc fiable. Figure 5. Capture d’écran de l’en-tête de la page web d’ESPEN indiquant comment changer la langue de la page. 2. Les plans de traitement par CP liés aux programmes MTN nationaux. Données affectées à la projection des nombres de traitements liés au programme MTN sur un certain nombre d’années ; 3. Les autres données recommandées pour les programmes MTN nationaux. Autres données pouvant être utilisées par votre MS pour la planification de programmes MTN. Veuillez sélectionner l’une de ces options et collecter ces informations. Nous vous suggérons de sauvegarder ce fichier en utilisant le nom Population 1_PopSource_CCC_Annee. Donc, pour une JRSM de 2019 en RDC, nous aurions Population 1_JRSM_COD_2019. Les lettres « CCC » se rapportent aux trois lettres du code ISO pour ce pays. Les codes spécifiques par pays sont disponibles ici ou sur bit.ly/3kAKQQA. 4.2. Population 2 : Rapport sur le traitement Ces données démographiques correspondent aux UMO que vous avez choisies. Elles sont utilisées dans les mécanismes internes de rapport sur le traitement de votre pays après une DMM. Généralement, ces informations collectées ont été ventilées par groupes d’âge (PréEAS, EAS et Adultes). Ces groupes sont souvent mentionnés comme « populations cibles » pour ces DMM. En outre, ces données démographiques servent très fréquemment de base au calcul de la couverture rapportée pour cette DMM. Les informations sur la population sont contenues dans vos Joint Reporting Forms (JRF). Soit vous en avez la copie, soit vous pouvez les trouver sur le portail d’ESPEN. Si vous collaborez 19
avec le MS, demandez les JRF du programme MTN du MS ou accédez aux Joint Reporting Forms (JRF) disponibles sur le portail ESPEN. Nous vous suggérons de sauvegarder ce fichier en utilisant le nom Population 2_PopSource_CCC_Annee. Donc, pour une DMM de 2019 en RDC, nous aurions une Population 2_MS_COD_2019. 4.3. Population modélisée 1 : Obtention des données d’approche ascendante de WorldPop sur l’interface web woprVision Cette section présente les étapes d’obtention des estimations démographiques selon l’approche ascendante qui s’effectue sur la plateforme woprVision. Elle utilisera les données du fichier GeoJSON collectées durant la Phase 1 : Préparation des données. La plateforme woprVision est accessible ici en ligne ou sur https://apps.worldpop.org/woprVision/. Davantage de détails sur les options offertes par la plateforme sont accessibles au moyen de l’onglet Aide sur le site web de woprVision (cercle rouge – Figure 6). Pour changer la langue de la plateforme, servez-vous du menu déroulant situé dans le coin supérieur droit (cercle vert – Figure 6). Les langues disponibles sont le français, le portugais et l’espagnol. Figure 6. Capture d’écran de l’en-tête de la page web de woprVision (version bêta) indiquant comment changer la langue de la page. 4.3.1. Étape 1 – Aperçu du site Avant de commencer nous vous proposons des explications sur ce que vous allez voir sur le site web de woprVision. La Figure 7 ci-dessous montre ce à quoi vous avez accès. Trois onglets se trouvent au-dessus. Par défaut, le site web affichera toujours l’onglet carte. Vous pouvez également cliquer sur l’onglet Sauvegardé ou sur l’onglet Aide. L’onglet Aide contient des explications plus détaillées sur le site et sur son utilisation. L’onglet Sauvegardé compile des données recherchées durant une session. L’objectif de ce guide est d’aider à l’exportation des données. Il n’abordera donc pas la sauvegarde des données sur le web et dans l’onglet Sauvegardé. 20
Figure 7 - Aperçu du site web woprVision. La partie centrale montre la région du pays pour laquelle nous voulons obtenir des données alors que le panneau de gauche contient les options de contrôle des paramètres de données. Les étapes suivantes montrent comment les régler. 4.3.2. Étape 2 – Sélection du pays Nous devons d’abord sélectionner le pays sur lequel nous travaillons. Pour changer le pays, cliquez sur la flèche pointant vers le bas et surlignée en rouge dans la figure 8. Pour cet exemple, nous utiliserons la RDC représentée par ses trois lettres ISO de code du pays COD (https://bit.ly/3bNQEUy).6 Figure 8 – Sélection du pays – site web de woprVision 6Au moment de la rédaction de ce document (mars 2021), le site web de woprVision a fourni aux utilisateurs des données sur le Burkina Faso, le Mozambique, la Sierra Leone, le Ghana, le Nigeria, la Zambie et cinq provinces de la RDC. 21
Vous pouvez aussi lire