EDITORIAL - BÜHLMANN Laboratories AG
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No 10, Juin 2020 VOX BÜHLMANN A Commitment to Diagnostics EDITORIAL Chères lectrices, chers lecteurs, Nous sommes heureux de vous présenter un nouveau numéro intéressant de VOX, en cette période extraordinaire. Avec le test AllplexTM2019-nCoV de Seegene, nous avons pu réagir à la pandémie de COVID-19 dès fin février et proposer le test en Suisse. Le test peut désormais être combiné avec le test AllplexTMRV Essential Assay et cela offrira une solution de dépistage extrêmement attrayante pour la prochaine saison de la grippe. Avec sa large gamme de tests de résistance aux antibiotiques multiplex, Seegene offre une solution automatisable et nettement plus rapide que la culture. Le nouvel CALEX®Cap Collection Set de BÜHLMANN est disponible depuis le 1er juin. Il permettra au patient de procéder à l’extraction de l'échantillon de selles simplement chez lui, puis de l'envoyer au laboratoire, ce qui économise beaucoup de temps et d'argent. Le même extrait pourra permettre le diagnostic de la calprotectine et/ou de l’élastase pancréatique ; il sera directement utilisable sur des automates avec les méthodes fCAL®turbo et fPELA®turbo, cette dernière maintenant aussi marquée CE-IVD. Les nouveaux tests Quantum Blue®Anti- Infliximab et Anti-Adalimumab ont CONTENU DE CETTE EDITION récemment été lancés pour étoffer • Nouveau: test AllplexTM2019-nCoV notre gamme de tests rapides TDM. pour les diagnostics Covid-19 EntroGen propose également de • Nouveau: option de combinaison nouveaux tests RT-PCR et NGS pour AllplexTM2019-nCoV et AllplexTMRV le diagnostic du cancer et, en outre, Essential Assay deux nouveaux kits d'isolement d'ADN. • Nouveau: tests de résistance aux Il existe enfin de nouveaux tests MDx antibiotiques multiplex de Seegene POC et de gros avantages techniques • Nouveau marquage CE-IVD disponi- pour la mise en place du revogene®. ble: BÜHLMANN CALEX®Cap Collection Set J'espère que vous apprécierez la lecture et que vous resterez en bonne • Nouveaux tests TDM: Quantum Blue®Anti-Infliximab et Quantum santé! Blue®Anti-Adalimumab Meilleures salutations • Nouveaux tests PCR et NGS en temps Dr. Thomas Hafen réel d'EntroGen CEO • Nouveaux tests MDx POC et points forts techniques pour le revogene®
Test AllplexTM2019-nCoV See- CoV-2 existants : vérification des limites (MPV), virus respiratoire syncytial (RSV), vi- gene - disponible depuis fin de détection et des performances cli- rus parainfluenza (PIV), adénovirus (AdV) février 2020 pour le dia- niques. De manière remarquable, le test et rhinovirus A / B / C (HRV). Comme avec AllplexTM2019-nCoV Seegene a atteint une le test AllplexTM2019-nCoV, les résultats gnostic COVID-19 en Suisse sensibilité et une spécificité de 100% sont interprétés automatiquement avec Après la découverte des premiers cas de pour les trois gènes cibles. le logiciel Seegene Viewer sur le BioRad coronavirus en Chine, Seegene a déve- CFX96™ et un résultat est obtenu dans 2 Vous pouvez trouver les données et plus loppé son propre test de coronavirus en heures après l'extraction des échantil- d'informations (sous le lien suivant) sur utilisant l'intelligence artificielle (IA) en lons. Le test montre les valeurs Ct indi- la page d'accueil de FIND: un temps record : seulement trois se- viduelles pour chaque agent pathogène maines. https://www.finddx.org/covid-19/sars- dans un seul canal sur l’appareil rt-PCR. cov2-eval-molecular/molecular-eval-re- Le test AllplexTM2019-nCoV permet la Ainsi, même dans les cas d’infections sults/ multiples, il est possible d’identifier les virus présents et leurs concentrations re- spectives.L'extraction et la configuration de la PCR peuvent être effectuées auto- matiquement sur le NIMBUS IVD ou STAR- let IVD. Avec le test AllplexTM2019-nCoV, un total de 10 cibles peuvent être détectées avec seulement deux tubes en peu de temps, ce qui fait de cette nouvelle com- binaison de tests une solution très rapi- de et économique pour les diagnostics de routine et cela offrira une réelle valeur ajoutée en particulier pour la prochaine saison de la grippe. détection et l'identification de 3 gènes L’approche innovante des cibles spécifiques COVID-19 (gène E, gène tests de résistance aux anti- RdRP, gène N) dans un seul tube, en moins biotiques multiplex Seegene de 2 heures après extraction des échan- Test AllplexTM2019-nCoV - Selon le Rapport mondial de l'OMS1 (04/2014), tillons. L'extraction et la configuration de nouveau combinable avec le des mesures sont nécessaires partout dans le la PCR peuvent être effectuées automa- test AllplexTMRV Essential monde, notamment un réseau efficace de la- tiquement sur le NIMBUS IVD ou STARlet boratoires capables d'identifier rapidement IVD et l'interprétation des résultats est Le test AllplexTM2019-nCoV peut la résistance et de collecter et transmettre les également automatisée avec le logiciel maintenant être combiné avec le informations obtenues pour les contre-mes- Seegene Viewer sur le BioRad CFX96™. test Allplex™RV Essential. Avec cette ures. Alternativement, d'autres machines d'ex- combinaison, Seegene offre une solution traction tierces peuvent également être de dépistage extrêmement attrayante L’OMS recommande un ciblage très précis utilisées pour le test. pour les virus les plus importants des principes actifs antibiotiques à utiliser en fonction des symptomes cliniques. Car Grâce à l'excellent partenariat de Seegene surtout quand les antibiotiques sont utilisés et à ses temps de réponse courts, nous dans de grandes quantités, la probabilité avons pu livrer les premiers tests Seegene augmente que les pathogènes développent COVID-19 aux laboratoires suisses dès fin une résistance. février 2020. Les tests en temps réel de résistance multi- Nous sommes reconnaissants et très sa- plex Seegene offrent la solution optimale car tisfaits qu'au 30 avril 2020, Seegene ils peuvent être effectués beaucoup plus ra- ait déjà livré plus de 200‘000 tests All- pidement que la culture classique et ils sont plexTM2019-nCoV pour les diagnostics CO- également automatisables. VID-19 en Suisse.Cela représente plus de 50% de tous les tests COVID-19 qui ont Le test Allplex™MG & AziR par ex. est un été effectués en Suisse jusqu'à ce jour. impliqués dans les maladies respiratoires. test PCR multiplex qui détecte et identifie la bactérie M. genitalium et les 6 mutations dif- Le test Seegene a également été évalué Comme le test AllplexTM2019-nCoV, le test férentes pouvant provoquer une résistance à avec succès par la plateforme FIND qui Allplex™RV Essential Assay (EA) est un test l'azithromycine. procède en partenariat avec l’OMS, sur le PCR multiplex en temps réel qui détecte campus de l'hôpital universitaire de Ge- Basé sur la technologie MuDT™ développée les 7 virus respiratoires suivants dans un nève (HUG), à l’évaluation indépendante par Seegene, ce test permet de contrôler l'in- seul tube: virus influenza A (Flu A), virus des différents tests moléculaires du SARS- fection MG et la résistance à l'azithromycine influenza B ( Grippe B), métapneumovirus
en un seul test et donne une valeur Ct pour C’est ce que le test rapide BÜHLMANN Quan- chaque pathogène. tum Blue® TDM offre : un outil de sui- En complément, Seegene a développé le nou vi thérapeutique générant un résultat quantitatif en quelques minutes permet- tant d’ajuster la thérapie anti-TNF aus- sitôt si besoin. En parallèle à son utilité reconnue dans la routine clinique, Quantum Blue® TDM est utilisé dans le monde entier en recherche pour sa fiabilité et sa facilité d'utilisation. Les tests rapides Quantum Blue® Anti-In- fliximab et Anti-Adalimumab de mesures des concentrations d'anticorps contre le veau test Allplex™MG & MoxiR, qui identi- médicament sont désormais disponibles fie également M. genitalium et 6 mutations (format RUO), en complément aux tests dans la région du gène parC et peut ainsi quantitatifs Quantum Blue® Infliximab et démontrer et caractériser la résistance à la Adalimumab de détermination des con- moxifloxacine. centrations résiduelles (niveaux basaux), Un autre test passionnant est le test All- Avec cette innovation révolutionnaire, plex™Entero-DR : il reconnaît et identifie un BÜHLMANN propose désormais le package total de 8 gènes de résistance aux antibio- complet pour Infliximab et Adalimumab tiques gram-positifs et gram-négatifs. TDM, compatible sur notre plate-forme Les autres tests basés sur la résistance aux Quantum Blue®, rapide et facile d’utili- antibiotiques sont par ex. Allplex™H. pylori & sation. ClariR Assay (4 cibles) ou Allplex™MTB / MDR / Globalement, avec les tests Quantum XDRe (5 cibles). Blue® pour la calprotectine fécale, BÜHL- Tous ces tests facilitent l'identification de MANN est le premier développeur de di- l'antibiotique approprié et permettent ainsi agnostic in vitro à offrir la solution de le traitement le plus efficace et le plus rapi- diagnostic complète basée sur des tests de pour le patient. Nous serons bien entendu rapides dans le domaine des maladies in- ravis de vous fournir plus d'informations sur sûre par le personnel du laboratoire. Le flammatoires de l'intestin (IBD). les tests. protocole d'extraction sur CALEX® prêt à Des versions marquées CE des tests Quan- l'emploi, qui est hautement comparable référence tum Blue® Anti-Infliximab et Anti-Adali- au gold standard (méthode d'extraction 1 Résistance aux antimicrobiens: rapport mondial mumab seront disponibles plus tard cette manuelle), peut être combiné directement sur la surveillance 2014, OMS année. avec tous les tests de calprotectine ou de p-élastase BÜHLMANN disponibles et économise ainsi beaucoup de travail et des coûts pour le laboratoire avec une procédure plus rapide et simplifiée. Nouvellement disponible: BÜHLMANN CALEX® Cap Collec- Quantum Blue® Anti-Infli- tion Set - maintenant dispo- ximab et Anti-Adalimumab nible avec la marque CE-IVD (RUO) BÜHLMANN a le plaisir de proposer le CALEX® Cap Collection Set, grâce auquel l'extracti- on des selles pour la calprotectine fécale et l’élastase pancréatique peut désormais être effectuée par le patient lui-même directe- ment, à la maison. Notamment pendant la pandémie de CO- VID-19, il est important de protéger le per- sonnel du laboratoire des agents infectieux tels que les virus et les bactéries dans les selles. Augmentez maintenant la sécurité de Les patients IBD traités par Infliximab et votre laboratoire, optimisez votre flux Adalimumab ne répondent souvent plus au Désormais, le patient pourra directement de travail et économisez du temps et des traitement au fil du temps. Un suivi théra- envoyer le CALEX® Cap avec l'extrait des selles coûts avec le CALEX® Cap Collection Set, peutique régulier des médicaments (TDM) est au laboratoire pour analyse. Le tampon, qui transfère la collecte et l'extraction la solution pour optimiser leur traitement et dans lequel l'échantillon de selles du patient des selles au domicile du patient ! Nous maintenir l’efficacité thérapeutique des pro- est prélevé, contient des agents viricides et sommes à votre disposition pour tout duits biologiques anti-TNF. bactéricides permettant une manipulation renseignement complémentaire.
EntroGen - Nouvelles du dia- gnostic du cancer Nouvelles sur le système revogene® PCR en temps réel DERNIÈRES EntroGen a lancé deux nouveaux tests PCR en POCT de Meridian NOUVELLES temps réel marqués CE-IVD. Tout d'abord, le Le système revogene® POCT extrêmement Lung Cancer RNA Panel pour le criblage de 47 innovant, vous amène de l'échantillon au BÜHLMANN fPELA® variants des gènes de fusion ALK, ROS1 et RET résultat final en seulement trois étapes et turbo: maintenant en combinaison avec la mutation MET-Exon avec seulement 2 minutes de travail pra- 14. Le deuxième test est le test de détecti- tique. Nous avons des nouvelles intéres- disponible avec on des mutations IDH1 et IDH2, pour le dia- santes à vous offrir. marquage CE-IVD gnostic des patients atteints de LMA. Dans la Meridian Bioscience a gamme NGS, deux nouveaux tests sont égale- récemment repris le Le test turbidi- système développé par GenePOC. BÜHLMANN métrique pour en est toujours le dis- une quantificati- tributeur exclusif en Suisse. on simplifiée et ment en cours de validation, compatibles Grâce au savoir-faire et à l'expérience de automatisée de avec la plateforme Illumina. Meridian, certaines fonctionnalités in- l'élastase pancréa- téressantes pourraient être intégrées au Le NGS Targeted Hotspot Panel pour la détecti- système revogene®. Par ex. le mode ePRO tique humaine, on de 16 mutations cliniquement pertinentes sur différents types de tumeurs. Ce panel off- : cela signifie qu’un «résultat positif pré- a été développé coce» pourra être fourni pendant le cours re la possibilité d'examiner différents types de la rt-PCR, s’il apparait dès 42 minutes. pour être réalisé d'échantillons dans une seule approche et pour des variants spécifiques. Autre nouveauté: le panel de résistance directement à Le test BRCA Complete inclue à présent les 4 Carba C Carbapanem, qui détecte les cinq partir d'extraits de nouvelles cibles exon CHEK2, PALB2, RAD51C gènes les plus importants dans la forma- et TP53 afin de couvrir le maximum de muta- tion de bactéries carbapénémases: KPC, selles provenant tions pertinentes au niveau clinique. NDM, VIM, OXA-48-LIKE et IMP. du tube d'extrac- Avec ce nouveau test, l'échantillon brut Ces deux kits NGS contiennent les réactifs est déposé directement, à l'aide d'une tion CALEX®Cap. nécessaires pour la purification, l'enrichis- sement et la préparation de la bibliothèque. pipette jetable, sur la cartouche (la « PIE Le même tampon ») , dans laquelle toutes les autres étapes Un logiciel convivial pour une interprétation (homogénéisation, lyse et amplification est utilisé pour simple des données est également fourni. par PCR en temps réel) seront ensuite ef- l’élastase pan- En plus des divers produits de diagnostic, fectuées de manière entièrement auto- EntroGen propose désormais deux kits d’ex- matique. créatique et pour traction d'ADN: Jusqu'à huit échantillons peuvent être la calprotectine Le pureNA Cell-Free DNA Isolation Kit (CE-IVD) pour l’extraction efficace de l'ADN à partir mesurés simultanément sur le revogene®. fécale. Du coup, Le multiplexage de jusqu'à 12 cibles est d'échantillons de plasma, sans cellule en cir- possible. Le revogene® est petit et com- les deux tests culation. Son utilisation permet un isolement très spécifique de petits fragments d'ADN pact, il possède un grand écran tactile peuvent être ef- User-friendly, un lecteur de codes-barres (100-500 pb) dans un volume d'élution ré- intégré et des connexions USB. De plus, fectués à partir duit. EntroGen propose ce nouveau kit d'ex- traction gratuitement, pour les clients qui le revogene® peut être connecté à un LIS du même tube (système d'information de laboratoire) utilisent déjà les kits Cell-Free ctDNA Detec- pour la transmission électronique des ré- d'extraction. L'ap- tion Kits de EntroGen (ctBRAF, ctEGFR, ctRAS), pour atteindre une efficacité d'extraction sultats. plication est déjà maximale. Les tests suivants sont actuellement dis- établie sur de ponibles, avec marquage CE-IVD: Carba C, Le pureNA Genomic DNA Isolation Kit pour C. difficile, GBS DS, GBS LB et Strep A / C / nombreux appa- une purification rapide de l'ADN pur et hau- tement concentré.Les deux kits d'isolement G. Les prochains produits dans le pipeline reils d'analyse de sont: H. Pylori/antimicrobal resistance, d'ADN sont idéaux pour utilisation dans les Bacterial GI smart panel et Respiratory Chimie Clinique. diagnostics PCR en temps réel et NGS. smart panel. BÜHLMANN Laboratories AG Phone +41 61 487 12 12 Baselstrasse 55 Fax +41 61 487 12 34 CH – 4124 Schönenbuch /Basel info@buhlmannlabs.ch Switzerland www.buhlmannlabs.ch
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