Indexation et référencement des publications scientifiques - J'écris mon premier article scientifique - F-CRIN
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Programme Formation-action
J’écris mon premier article scientifique
11 & 12 Mars 2020 Hôpital Ste Anne – Paris
Indexation et référencement
des publications scientifiques
Patrick Devos
Cellule bibliométrique du CNCR
Plan
• Caractérisation d’une publication
• Les bases de données internationales
• Indices de notoriété d’une revue
• Choix d’une revue
• Visibilité d’un article
Différents types de publications :
Résultats d’une recherche :
o Etude clinique
o Essai thérapeutique
Article Original
o Etude épidémiologique (Journal Article)
o …..
Revue de littérature Review
Lettre Letter
Editorial Editorial
D’autres types disponibles…
Contenu d’une publication
• Un contenu : titre, résumé, introduction, méthodologie, …
• Une liste d’auteurs
Eléments très
• Des mots-clés (MESH Terms par exemple) importants
pour le
• Une liste d’adresses référencement
• Un journal ( avec ses indices de notoriété)
• Une liste de références
• Un nombre de citationsExemple d’article dans Pubmed :
Références / Citations
• Une publication fait référence à d’autres publications
• Le nombre de citations d’une publication correspond au nombre de fois où elle a été
citée par d’autres publications.
• Mesure l’impact scientifique d’une publication : plus un article est cité, plus il est
considéré comme important par la communauté.
• Dépend de l’ancienneté de la publication et du champ disciplinaire
• Disponible dans certaines bases payantes mais apparition d’alternatives (par exemple
Pubmed ou CrossRef)Les 3 grandes bases historiques de référencement
Spécifique du domaine médical Pluri-thématique Pluri-thématique
Plus de 5000 revues Plus de 13 000 revues Plus de 22 000 revues
30 000 000 de références Adresses de tous les auteurs Adresses de tous les auteurs
Terminologie MESH Institutions normalisées Institutions normalisées
(Organization-Enhanced) (Institution Prolfile)
Gratuite
Utilisée par l’OST et l’INSERM Utilisée par le CNRS
Indices de citations Indices de citations
Peu d’adresses et non normalisées Abonnement payant Abonnement payant
Indices de citations peu connusLa base Pubmed
• Avantages :
o Une des bases les plus utilisée en Sciences Biomédicales
o 30 millions de références depuis 1950,
o 5600 journaux indexés Medline, 2300 indexés Pubmed Central, …
o Outils d’extraction automatique disponibles
o Très complète (MESH, GRANTS, GENE, …)
o Gratuite !!!
• Limites :
o Couvre mal certains domaines (technologies, sciences sociales)La base Pubmed
Champ de recherche
D’autres champsPubmed, Medline, PMC
Pubmed
Interface de recherche dans
les bases biblios de la NLM
Medline est la base majoritaire dans Pubmed*
MEDLINE Pubmed
Central Pubmed = 14,9 Millions docs
Base historique des revues Archive ouverte
indexées par la NLM (MeSH Terms) gérée par la NLM Pubmed Not Medline = 3.79 %
PMC / Pubmed = 13.97 %
*Source : Journal Article[ptyp] OR Review[ptyp] OR Editorial[ptyp], Période 2000-2018La base Web of Science (WoS) , Clarivate Analytics
• Avantages
o Base historique, indicateurs les plus connus : facteur d’impact
o Utilisée par les classements de Shanghai, CWTS Leiden, Highly Cited Researchers, utilisé en France par
l’OST, l’ANR, l’INSERM…
o Classification disciplinaire fine : Web of science categories
o Utilisation d’institutions unifiées : Organization-Enhanced
• Limites
o Choix d’un sélection de revues (avec IF)
o Couverture internationale mais biaisée vers anglo-saxone
o Couverture multidisciplinaire mais inégale entre les disciplines (très déficiente en SHS ! )
o Recherche par mots-clés peu pertinente (Keyword +)Interface de recherche
Exemple : PHRC, Article dans Radiology – Visibilité ?
234 citations
Highly Cited paper
Importance de l’indexation
!!!La base Scopus , ELSEVIER
• Avantages
o Couverture plus large que celle de Wos (en revues nationales, en sciences sociales et sciences de
l’ingénieur)
o Utilisée par les classements internationaux de THE et QS, utilisée en France par le CNRS
o Classement des revues en accès libre : SJR
o Recherche par mots-clés plus aisée en santé (MESH et EMTREE)
o Utilisation d’institutions unifiées : Institution Profiles
• Limites
o Comme le Wos, biais en faveur de la littérature anglo-saxone et couverture incomplète en
sciences humaines
o Classification disciplinaire trop large (ex : Medicine)Interface de recherche
La base CrossRef
CrossRef : le portail de recherche
Les indicateurs liés aux revues
Indicateurs liés aux journaux : quelques exemples
• Journal Impact Factor
• 5-Year Journal Impact Factor
Beaucoup d’indicateurs disponibles,
• Eigenfactor Score
produits par diverses sociétés ou
• CiteScore
laboratoires, certains payants,
• Source Normalized Impact per Paper (SNIP)
d’autres non.
• Scimago Journal Rank (SJR)
• Classification SIGAPSL’Impact Factor de Clarivate Analytics
• Indice de citation d’une revue calculé par la société Clarivate Analytics
• Disponible dans le Journal of Citations Report (JCR)
• Actualisé tous les ans
• Variantes : Quartiles InCites, catégories SIGAPS, …. Citable Documents : Article et Review
Nombre de citations,en 2018, des articles parus en 2016 et 2017
IF2018 =
Nombre d′ articles parus en 2016 et 2017
Nombre de citations,en 2018, des articles 2016 et 2017 46289
IF2018 (NEJM) = = = 70.670
Nombre d′ articles parus en 2016 et 2017 655Limites de l’Impact Factor
Distribution très asymétrique….
L’IF correspond à un nombre
moyen de citations
• Très utilisé et … très controversé (DORA !!)
P5 P10 P25 P50 P75 P90 P95
• Mesure le rayonnement d’une revue et pas l’impact d’un article C2017 0 1 14 35 74.5 139.8 243
• Très variable d’une discipline à l’autre
Moyenne = 67.5
• Avantage les revues anglo-saxonnes Médiane = 35Le CiteScore (Elsevier)
Gratuit et disponible à https://www.scopus.com/sources /
Prise en compte de tous les
types de documents !
22Le SJR - Scimago
Scimago Journal Ranking - Gratuit et disponible à : http://www.scimagojr.com
Basé sur l’algorithme PageRank (Google). Plus complexe qu’un simple comptage
SJR accounts for both the number of citations received by a title and the importance or prestige of the titles where such citations
come from. It is a variant of the eigenvector centrality measure used in network theory. Such measures establish the importance of
a node in a network based on the principle that connections to high-scoring nodes contribute more to the score of the node.La classification SIGAPS
• Basée sur l’IF des revues
• Problème : l’IF varie fortement d’une discipline à une autre
• Classification statistique, par discipline, en 5 catégories (A à E)
correspondant aux percentiles de l’IF.
• Revues non recensées par l’ISI (actes de congrès, par exemple),
sont affectées à la catégorie NC.
Avec cette classification, chaque discipline a 10%
de journaux en catégorie A, 15% in B, 25% in C, …En pratique ….
Comment choisir la revue ???
• Choisir en fonction des thématiques de la revue
• Vérifier qu’elle est bien indexée dans les principales bases internationales
• Vérifier qu’elle a un IF ou un CiteScore
• Open Access ?? Exigence des financeurs (EU, ANR, …)
Attention aux revues prédatricesComment choisir la revue ???
Vérifier qu’elle est bien indexée : exemple PubmedVisibilité de l’article • Beaucoup de recherches faites sur le titre et/ou le résumé • Le titre doit être explicite et contenir les mots essentiels • Importance du résumé (Objectif / Méthodologie / Résultats) • Importance des mots-clés (si revue indexée Medline, utiliser les MESH terms) • Envisager l’Open Access
Les MESH Terms
• Arborescence hiérarchique
• Mots-clés normalisés
A privilégier si revue indexée MedlineEn résumé… • Bien choisir la revue • Etre vigilant sur le titre et le résumé (contenu public de l’article) • Utiliser les bons mots-clés
Comité National de
Coordination de la Recherche
1bis, rue Cabanis – 75014 Paris
www.cncr.fr
@CNCRecherche
contact@cncr.frVous pouvez aussi lire
