LICENCE EN SCIENCES DE LA VIE - Faculté des Sciences
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Faculté des Sciences
LICENCE EN SCIENCES DE LA VIE
3ème ANNEE
PRINCIPAL SITE : SITE DU DEPARTEMENT SCIENCES DE LA VIE
http://unice.fr/faculte-des-sciences/departements/sciences-de-la-vie/cursus-et-
formations/licence-svs/licence3-svs
( département sciences de la vie nice --à Cursus et formation à Licence SV)
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Licence Générale
Diplôme Bac +3
Licence Pro
Formations bac +5
Diplôme Bac +3
Vie Active : Master Master of Master
« Pro » Sciences Msc « Recherche »
Technicien
Assistant Ingénieur
Ingénieur d’études Cadre
Laboratoire Public Laboratoire Public et Privé
et Privé Double compétences :
Ingénieur Technico- Doctorat
commercial
La Formation L3 SV
PARCOURS Disciplinaires avec Spécialisation :
Parcours BMG : Biologie Moléculaire et Génétique – Mandon K.
BMG A : Animal ; BMG B : Végétal
Parcours BPN : Biochimie, Physiologie et Neurobiologie – Gréchez A.
Parcours BOE : Biologie des Organismes et Ecosystèmes – Forcioli D.
PARCOURS Pluridisciplinaire :
Parcours BIM : Biologie–Informatique–Mathématiques - Bailly-Bechet M.
Effectif limité à 20 étudiants
Enseignement - Préparation aux concours (entrée en L2) :
Parcours SC : Sciences et Culture
- Professeur des écoles
(entrée en L2SV) - Olivier Legrand
- Fonction publique
Licence spécifique SVT vers Master SVT
CAPES Bio
- Dimitri Garcia (L2SVT) - Michel Corsini (L3SVT)
Les parcours de la Licence SV :
Poursuite d’études en local
BMG-A/
BOE BIM BPN
BMG-V
Master of Sciences Master Recherche SV Master Pro IS
UCA (Msc) Sciences du Vivant Ingénierie de la Santé
BOOST Biocontrol 4 Parcours : UFR Médecine - 7 Parcours
Solutions for Plant - Génétique et - Qualité et Gestion des
health (09/2019) Développement (GD) Risques en Santé
MARRES Science, - Physio-Pathologie et - Ingénierie pour le
Conservation & Pharmacologie (P3) Vieillissement et l’Autonomie
Valorization of the - Neurosciences Cellulaires - Recherche Clinique
Marine Resources et Intégrées (NCI) Interventionnelle
(09/2018) - (Biologie, Informatique et - Génie Biomédical
Mathématiques (BIM)) - Data, Décision, Systèmes et
Master Pro GEDD eSante
- Msc BIOBANK Biobanks
- Gestion de
and Complex Data - Msc Flavor&Fragrance
l’Environnement et
Management (09/2016) - (Msc Modelife Quantitative
Développement Durable
Biology and Medecine)
(ST)
Les parcours de la Licence SV :
Poursuite d’études ou sortie métier
BMG-A/
BOE BIM BPN
BMG-V
Master of Sciences Master Recherche SV Master Pro IS
UCA (Msc) Sciences du Vivant Ingénierie de la Santé
BOOST 50 étudiants / an 45 étudiants / an dont 14
MARRES issus de la licence SV
- Msc
BIOBANK
Poursuite d’études
Doctorat : ED 85 SVS - 44 Doctorants en Ingénieur d’études -
1ère année, dont 15 issus du Master SV ; 90% en
emploi après thèse Cadre Laboratoire
ED 364 SFA Sciences Fondamentales et Public et Privé
appliquées
(2à 3 / an issus du Master SV )
UNICE PRO enquête Master SV
Enquête après 6 mois
Diplômés 2015 2016
Diplômés* 2015 2016
Taux Emploi 55 % (5/9) 80 % (4/5)
Etudes 73,5 72,4 CDI 20 % 25 %
Emploi 14,7 13,8 CDD 60 25
Recherche
Fonctionnaire 20 25
Emploi 11,8 6,7
Intérimaire 0 25
* Nombre de réponses : 29 étudiants
en 2014, 34 en 2015 et 31 en 2016
Enquête après 30 mois
Diplômés* 2013 2014 Diplômés 2013 2014
Etudes 55,8 47,3
Emploi 32,5 45,3 Taux Emploi 77,7 % 95%
Recherche Nbre Réponses 18 19
Emploi 9,3 2,4 CDI 14,28 22
CDD 57,1 33
* Nombre Réponses totales : 43 en 2013 ; 42 en Fonctionnaire 21,4 28
2014
Total
Les parcours de la Licence SV
Poursuite d’études au niveau national
790 formations publiques référencées accessibles à la suite
d’une licence Sciences de la Vie sur le répertoire du magazine
l’étudiant .
https://www.letudiant.fr/etudes/annuaire-enseignement-superieur/formation
Sciences de la Vie Sciences de la Terre
Biotechnologies : 103 Agronomie, Agriculture : 78
Génétique : 51 Agroalimentaire : 74
Microbiologie : 56 Environnement : 517
Physiologie : 75 Océanologie : 29
Neurosciences : 59
Site officiel :
Renseignez vous !
Trouvermonmaster.gouv.fr
L3SV Administration – Gestion
1) Compléter la fiche Pédagogique distribuée ici
et la rendre en fin d’Amphi (au plus tard
demain mardi 4 septembre au cours de la
permanence 15h30-17h30 – bât TP S. Nat, niveau II)
Obligatoire pour être inscrit à un groupe de TD et TP
+
2) Inscription aux Options via IP web
Du 3 au 17 septembre , dates à vérifier sur ent
Obligatoire pour être convoqué aux examens par la scolarité
Attention parcours BIM choix sous réserve d’acceptation au parcours
Mettre un 2ème choix sur la fiche
3) Aujourd’hui : Compléter la fiche du semestre S6 – même si
vous hésitez
Contrôle des Connaissances
- Dans le mois qui suit la rentrée, chaque UE devra vous donner
ses modalités de contrôle des Connaissances
- L’ensemble des modalités d’examen seront affichées sur le
fichier vous informant des groupes, edt……
- Tous les étudiants ayant échoué leur semestre en
session 1 peuvent passer la session 2
Ce n’est pas une chance pour vous !
- L’accès à la session 2 vous classe forcément derrière le dernier ayant obtenu
la session 1 (en cas d’accident ou ABJ a une UE les responsables de Master en
tiennent compte)
- L’accès au Master de votre choix risque d’être beaucoup plus difficile
* Un étudiant autorisé à passer la session 2, doit repasser
L’ENSEMBLE des UEs dont les notes étaient inférieures à
! 10/20 à la session 1.
- Une absence, même justifiée, entraîne un 0 au CI ou CT session
1. Un justificatif permet une neutralisation de la note pour un CCI
MAIS JAMAIS pour un CT.
- La note de session 2 remplace celle de la moyenne
de session 1 (et pas seulement celle du contrôle
terminal de la session 1) = vous perdez le contrôle
continu
* BONUS SPORT uniquement si la moyenne générale au
semestre est supérieure ou égale à 10/20* Statut particulier : règles données par le CEVU, non
négociables, et les dossiers gérés par la scolarité.
Dépôt des dossiers à la scolarité - Pour 1 semestre
- Pour l’année
- Tout UE acquise est acquise définitivement
- Tout semestre acquis l’est définitivement
- Vous avez 5 jours après la diffusion des résultats pour refuser la
compensation entre matière et entre semestre.
- Particulièrement important pour les redoublants et les
étudiants en UE avancées
- Pas de compensation intra-semestre pour les étudiants en
UEs avancéesL3SV Gestion – Emploi du temps
Tous parcours (sauf SC) : disponible site du département
Début des cours
Semaine du 3 sept : les 1er cours
Parcours BOE: CM PCGFA le lundi 3 sept à 13h (amphi biologie)
Parcours BIM-BMG-BPN: CM BSRE le Mardi 15h15 (Amphi Phy 2)
Reste semaine : à voir sur l’edt
Début des TD UE sciences
Semaine du 10/09 selon edt semestriel
Affichage composition groupe fin semaine du 3/09
Election d’un délégué par ParcoursEdT L3SV - Disponible sur doogle drive : https://docs.google.com/spreadsheets/d/ 1sO1SNz5nroZG5W542DD5sWmJQAR0HyNhDCfo6vY5ZVA/edit? usp=sharing (Adresse indiquée sur le site DSV) Pour l’instant, EdT est provisoire et sera finaliser après cet amphi en fonction de l’effectif total et par parcours: Le ficher comporte plusieurs onglets: UE du S5, liste inscrits, MCC, edt semestriel, edt hebdomadaire, planning TP et les onglets pour les groupes de TD / UE.
- La composition des groupes TD sera disponible en fin de semaine (le 9 sept au
plus tard).
(TP plus tard dans le semestre)
- Cette composition sera établie grâce aux fiches (remplissez les avec soin).
Ecrivez lisiblement vos nom et prénom
Attention covoiturage au sein d’un MEME parcours mais PAS entre
parcours (groupe constitué selon option)
Si plusieurs noms indiqués, souligner celui du binôme.
- Tout changement de groupe ne sera possible que par permutation, et
exclusivement par permutation pour les TP.- N° groupe de TD selon UE et peut changer d’une UE à l’autre
Etudiant A à groupe 1 en anglais,
groupe 3 en STAT
groupe 2 en SEG
- Non conservation du même numéro de groupe entre les TD et les TP
Raison: Mutualisation d’UE différentes au sein des parcours.
- Les TP se déroulent en fin de semestre (du 19 nov au 14 décembre inclus)
Tout changement de groupe pourra se faire EXCLUSIVEMENT par permutation
pour les TP.L3SV Objectifs et Compétences
BMG-A/
BOE BIM BPN
BMG-V
Acquérir une démarche expérimentale et
une rigueur scientifique en vue de
résoudre des problèmes de recherche
dans les domaines du parcours considéré
L1-L2 - Enseignement généraliste pour connaître l’ensemble
des domaines du vivant
L3 - Renforcer les notions et acquérir les outils
spécifiques au parcours choisi.
- Enseignements pratiques et sur projet renforcés.Semestre 5 : Modules Communs Tous Parcours
BMG - BPN - BIM - BOE
SEMESTRE 5
- Structure et expression des génomes et Marqueurs Moléculaires (4)
- Immunologie 1 (2)
- Statistiques (4)
- Épistémologie (2)
- Anglais Scientifiques (2)
Physiologie Intégrée Animale Physio. Comparée des Grandes
BMG – BPN – BIM – (4) Fonctions Animales - BOE -(4)
(SEMESTRE 6)
-Bioinformatique Appliquée à l’Analyse de Séquence (4)
- UE librePARCOURS BIM (Biologie Informatique Mathématiques)
Coordonnateur : Marc Bailly-Bechet
marc.bailly-bechet@unice.fr
l Pour qui ?
- les étudiants intéressés par les interfaces entre biologie et
informatique (big data, médecine personnalisée, )
- les étudiants plus intéressés par des TP sur ordinateur que
sur le terrain ou à la paillasse.
l Pour faire quoi ?
- Masters de bioinformatique
- Ecoles d’ingénieurs (INSA Lyon, Polytech Nice)
- Autres Masters en lien avec la biologie ou la médecine, et
le traitement de données, l’informatique...
l Pour aller où ?
- Nice : Polytech, Masters de santé, Master DE Biobanks…
- Ailleurs : partout en France !http://bit.ly/FormationsBioinfo
L3 BIM : UEs
Semestre 5
Tronc commun :
- Statistiques (4) / Immuno 1 (2) / SEG (4) / Epistémo (2) / Anglais (2)
UE partagées avec d’autres parcours :
- Physiologie intégrée animale (4)
- Biochimie Structurale et Régulations Enzymatiques (4)
UE spécifique :
- Initiation à la programmation (4)
1 UE au choix parmi :
Dynamique des populations (4) Neurologie Biologie Cognitive et
Comportementale (4)L3 BIM : UEs
Semestre 6
-Bioinformatique appliquée à l’analyse des séquences (4)
- Evolution moléculaire et phylogénèse (4)
- Algorithmique et Structure des Données (4)
- Projet de Programmation en python (4)
- Bases Mathématiques des Statistiques (4)
- Projet Pluridisciplinaire en Anglais (6)
1 UE au choix parmi :
Biologie des Neurobiologie et
Biotechnologies (4) Adaptations et Pathologies
Ecophysiologie (4) Cérébrales (4)Pour en savoir plus...
l Sur la bioinformatique et les bioinformaticiens:
- Société Française de Bioinformatique (https://www.sfbi.fr/)
- Association des jeunes bioinformaticiens (https://jebif.fr/fr/)
l Sur la formation, par moi :
- marc.bailly-bechet@unice.fr
-
l Sur la formation, par les anciens :
- Ils sont là !
- RV après cet amphi de présentation, sur le gazon devant le
chalet à l’entrée du parc, avec d’autres anciens.L3 BIM : Initiation à la programmation (IAP) q Cours/ TD • En salle machine : CRIPS (PV=Petit Valrose) 3ème étage (salles linux) • Lundi 10h15 et jeudi à 15h15 • Début : jeudi 6 septembre • Travail personnel (sur ordinateur) q Evaluation • Auto-évaluations • CCI Linux (27 septembre) et CCI Python (22 octobre) • Scripts à rendre • Examen CT (Linux et Python)
UE Statistiques (Tronc commun - 4 ECTS)
Coordonnateur : Marc Bailly-Bechet
marc.bailly-
bechet@unice.fr
Objectif : analyse de données expérimentales
• Statistiques descriptives, représentations graphiques,
tests d’hypothèse
• Interprétation des résultats d’articles scientifiques
• Connaissances théoriques et pratiques (projet)
Organisation
• 8 CM, 3 TD, 5 TP en salle informatique
• Début des enseignements par un TD la semaine du 10
septembre → besoin d’avoir travaillé en amont le cours
qui vous sera envoyé par email/mis sur Jalon.PARCOURS BMG : Biologie Moléculaire / Génétique
Animal BMG A – Végétal BMG B
Coordonnatrice : Karine MANDON
Objectif :
- Approfondir les notions et acquérir les outils de la génétique moléculaire, de la
biochimie et des biotechnologies
- Acquérir une démarche expérimentales en vu de résoudre des problèmes
scientifiques en génétique, développement, microbiologie, et Immunologie
- Ouverture vers les Biotechnologies : Secteurs phares des industries :
Pharmaceutique, Agro-alimentaire, Production végétale, Bioénergies.Master SV Génétique et Développement
Génétique et Développement
Poursuite :
Msc UCA BOOST Biocontrol Solutions for Plant Health
--------------
Masters Msc Biobank
Nice Master pro Ingéniérie de la Santé
Ø - Stage associés Parcours BMG - Institut de Biologie de Valrose
- Génétique du développement, Génétique
moléculaire, Biologie cellulaire et Immunologie
- Centre Méditérranéen de Médecine
- Stage de Microbiologie Moléculaire
Levure (iBV); Microbiologie et maladie
infectieuse (C3M); Ecologie Microbienne et
santé des plantes (INRA) - Institut de Pharmacologie
Moléculaire et Cellulaire
-
- Environnement et Santé - Institut de Recherche sur
des Plantes le Cancer et le vieillissement (IRCAN)Masters Nationaux Très nombreux : 106 Biotechnologies, 54 Génétiques, 49
Microbiologie….
Génétique, Immunologie
Aix-Marseille - Développement et Immunologie
- Génétique Humaine et Médicale
Partout en France Spécialité de Masters Biologie et Santé / Biologie Moléculaire et
Cellulaire, Biosanté (Toulouse) , Génétique et Biologie de la Cellule
Microbiologie
Paris Diderot - Infectiologie: Virologie, Microbiologie et Immunologie (Santé ex-Pasteur)
Lyon I - EcoSciences et Microbiologie (Ecologie Microbienne et Maintien des Sols)
Rennes - Microbiologie Fondamentale et Appliquée (alimentaire)
Biotechnologies
Montpellier - BIOTIN mention Biologie-Santé (Montpellier I, 2, Nîmes, Ecole des mines d’Alès)
Toulouse - Biochimie et BioTechnologies (Toulouse) Secteur Santé : outils de la biologie
moléculaire Génomique, Protéomique, Métabolomique) et partenariat avec les
secteurs émergeant Environnement, Agriculture , diagnostique
Valorisation des Plantes et Production Végétale
Bordeaux - Biologie et Santé (Bordeaux I, Segalen)
Spé : Biologie et Biotechnologies des Plantes (Bordeaux I, INRA)
(champignons comestibles et pathogènes de la Vigne)
Rennes - Sciences du Végétale (Master Recherche et Pro )Biologie Moléculaire et Génétique
A - Animal / B - Végétal
Karine Mandon
Semestre 5
- Biochimie Structurale et Régulations Enzymatiques (BSRE) (4)
- Signalisation Cellulaire (SC) (4)
- Génétique des Eucaryotes (GE) (2)
A B
Biologie des
Immunologie-2 (2) Interactions (2) MimosaSemestre 6
- Evolution Moléculaire et Phylogénèse (4)
- Biotechnologies (4)
- Régulation Génique Procaryotes (4)
Choix A Endocrinologie Générale (4) Biologie des Adaptations et
Ecophysiologie (4)
Biologie du Développement Biologie du Développement
Choix B
Animal (4) Végétal (4)
BMG-V
BMG-A
BMG-A / V Botanique Systématique
Techniques et Phylogénèse (4)
Imagerie
Choix C d’Exploration
Tissulaire (4)
Fonctionnelles (4) Biologie du Développement
Animal (4)PARCOURS BPN : Biochimie / Physiologie / Neurobiologie
Coordonnatrice : Aline GRECHEZ (grechez@unice.fr)
Parcours transdisciplinaire axé sur le domaine de la Physiologie et la NeurobiologieObjectifs: Acquérir une démarche et une rigueur scientifique pour:
Court terme: Insertion dans masters:
- Recherche SVS Nice :
- Spécialisation Pharmacologie et Physiopathologie
- Spécialisation Neurosciences
- Recherche nationaux (Neurosciences, Physiologie intégrative, Biochimie, Génomique,
Pharmacologie associant un aspect pathologique et en relation avec la santé humaine.
- Professionnel : Sciences du médicament, ingénierie de la santé, bioprocédés pour la
formulation – De double compétences: management, qualité
- Long terme:
Ingénieur ou chercheurs dans les laboratoires publics ou pharmaceutiques liés à ces
domainesPour cela: - Nécessité d’acquisition des connaissances scientifiques, techniques et méthodologiques de bases dans diverses disciplines scientifiques. - Développer une vision intégrée de l’organisation et du fonctionnement des parties d’un organisme vivant allant du génome aux fonctions physiologiques. - Comprendre les dysfonctionnements et appréhender les aspects pathologiques qui s’y rattachent. - Présence de nombreuses séances de TP à presque toutes les UE composant le parcours permettant d’appliquer la théorie à la pratique et développer une démarche expérimentale. -Ouverture du parcours sur domaines émergeants: électrophysiologie, métabolisme, imagerie tissulaire -Ouvrir les perspectives en découvrant les possibilités d’un rapprochement entre la chimie et la biologie.
Poursuites: Candidater en Masters Recherche (visée thèse) ou
Professionnel (visée monde industriel)
A l’université de Nice :
En relation directement avec le parcours BPN:
2 Spécialités :
Master SVS -Physiopathologie et Pharmacologie
-Neurociences
En relation moins directe avec le parcours BPN:
Master Ingénierie de la santé : Génie Biomédical, FOQUAL,
professionnel I2SAEn France Quelques exemples de masters : Domaines master professionnels : la qualité, la production, le développement de produits, le commercial, la recherche clinique, la réglementation, la gestion des projets, la valorisation, …
Exemples de candidatures acceptés en masters
Contenu année:
Semestre 5
6 UE communes (18 ECTS)
- Biochimie Structurale et Régulations Enzymatiques (4)
(Comprendre les relations qui existent entre la structure et la fonction des biomolécules)
-Signalisation Cellulaire (4)
(Etude des molécules impliquées dans la signalisation cellulaire en général)
- Neurobiologie Cognitive et Comportementale (2)
(Introduction aux bases neurobiologiques des fonctions mentales supérieures:
apprentissage, mémoire, régulation alimentaire)
Au choix
(Bases de la réponse immunitaire physiologique (partie pratique de
Immunologie 2 (2) l’UE Immunologie-1)).
Neurosciences Intégratives (2) (Approfondissement des bases neurobiologiques des
fonctions mentales supérieures: sommeil, coma,
langage)Semestre 6 2 UE communes (6 ECTS)
-Endocrinologie générale (4)
(Bases fondamentales en endocrinologie: notion hormones, glandes endocrines:
thyroide, surrénales, processus reproduction, aspect pathologiques)
- Techniques d’Exploration Fonctionnelle en Physiologie Animale (4)
(TP d’étude des fonctions à l’échelle de l’organisme, sensibilisation à l’éthique)
- Electrophysiologie et Pharmacologie (4)
(Etude du comportement des canaux comme senseurs de l’environnement cellulaire, et
base de la pharmacologie: pharmacovigilance et dynamique)
-Neurobiologie et Pathologies Cérébrales (4)
(Introduction aux principales pathologies cérébrales: Parkinson, Alzheimer, toxicomanie)
- Physiopathologie de la nutrition et du métabolisme (4)
(Etude de l’homéostasie métabolique: besoin énergétique, hibernation, hypoxie)
Au choix Biotechnologies (4) (transgénèse, épigénétique, systèmes hybrides)
Imagerie Tissulaire (4) (Initiation aux différentes techniques de microscopie)
Analyse Métabolites (Utiliser des techniques analytiques chimiques pour
résoudre un problème biologique)
Secondaires (4)PARCOURS BOE : Biologie des Organismes et des Ecosystèmes
Coordonnateur : Didier FORCIOLI forcioli@unice.fr
Anne Violette LAVOIR lavoir@unice.fr
Objectif :
Comprendre l’interaction du vivant avec son environnement,
à court et long terme,
à l’échelle de l’organisme, de la population, des communautés et de l’écosystème
(de l’écophysiologie à l’écologie en passant par la génétique évolutive)
Poursuites:
Msc UCA MARRES – Ressources Marines
BOOST - Protection des Plantes et
Agroenvironnement
Autres Masters Masters pro en gestion de l’environnement
Masters Recherche Ecologie EvolutionPoursuite :
Msc UCA / Masters nationaux à Nice
MARRES / BOOST
Gestion de l'Environnement M1/ GEDD ou AIR M2
Masters Nationaux
Masters Recherche
Ecologie, Biodiversité Evolution (UPMC, MNHN, Aix Marseille, Toulouse, Montpellier)
Biologie Intégrée, Ecotoxicologie (Perpignan, La Rochelle)
Océanologie (Paris , Marseille, Brest)
Ethologie (Rennes, Strasbourg)
etc…
Masters Pro
En Gestion de l'environnement (nombreuses universités)Semestre 5
TRONC COMMUN
Structure et expression des génomes et Marqueurs Moléculaires (4)
Immunologie 1 (2) Statistiques (4)
Épistémologie (2) Anglais Scientifique (2)
Physio. Comparée des Grandes Fonctions Animales (4)
- Dynamique des Populations (DP) (4)
Écosystèmes (4)
Biologie des Interactions (2)
A B
Biologie Comportementale Endocrinologie Comparée et
et Éthologie (BCE) (2) Communication Cellulaire (2)Semestre 6
- Bio-Informatique appliquée (4)
- UE libre (2)
- Biodiversité (3)
Introduction à l’Ecotoxicologie (2)
Biologie des Adaptations et Ecophysiologie (4)
Evolution Moléculaire et Phylogénèse (4)
Paléoenvironnement (2)
Stage Pratique/ Communication en
Choix A Bibliographique (4) Environnement (4)
Biologie du Développement Botanique Systématique et
Choix B
Animal (4) Phylogénèse (4)
Choix C Biologie du Développement Ecologie et Biologie Marine (3)
Végétal (3)Structure et Expression des Génomes et Marqueurs Moléculaires
Responsable : Mme Françoise Presse
Objectifs :
• Comprendre et savoir analyser la structure des génomes eucaryotes en utilisant les
raisonnements adéquats et en connaissant les concepts et méthodes appropriés.
• Comprendre comment l’expression d’un gène peut être régulée à différents niveaux.
Compétences :
• Scientifiques spécifiques de l’UE : savoir interpréter les cartographies physique et
génétique d’un génome, savoir analyser l’expression d’un gène et les mécanismes
régulateurs de cette expression en utilisant différents outils.
• Transversales : savoir analyser des résultats d’expériences en étant critique; savoir
rédiger ces analyses
Evaluation:
• 1 note de TP =10% de la note finale
• 1 examen de TP = 10% de la note finale
• 1 examen terminal = 80% de la note finaleCours : 8x 12h (Mme Françoise Presse et Mme Patricia Lebrun ) • Méthodes de cartographie des génomes • Analyse et clonage de grands fragments d’ADN • Expression génique et régulation chez les eucaryotes Travaux Dirigés : 7x 2h (Mr Dominique Colinet et Mme Françoise Presse) Exercices et analyse d’expériences à base de publications : A PREPARER ABOLUMENT A L’ AVANCE (sauf le 1er TD de révision). Les étudiants corrigeront les exercices en passant à tour de rôle au tableau. Travaux Pratiques : 3 jours continus de 8h • clonage dans des vecteurs d’expression eucaryote et procaryote d’un ADNc codant pour une enzyme • transfection de cellules eucaryotes et transformation bactérienne • criblage des clones bactériens par hybridation et PCR • analyse des protéines produites par électrophorèse SDS-Page et dosage enzymatique
UE Statistiques (Tronc commun - 4 ECTS)
Coordonnateur : Marc Bailly-Bechet
marc.bailly-bechet@unice.fr
Objectif : analyse de données expérimentales
• Statistiques descriptives, représentations graphiques,
tests d’hypothèse
• Interprétation des résultats d’articles scientifiques
• Connaissances théoriques et pratiques (projet)
Organisation
• 8 CM, 3 TD, 5 TP en salle informatique
• Début des enseignements par un TD la semaine du 10
septembre → besoin d’avoir travaillé en amont le cours
qui vous sera envoyé par email/mis sur Jalon.L3 BIM : Initiation à la programmation (IAP) q UE semestre 5, 4 ECTS q Pas de pré-requis en programmation nécessaire ! q Intervenants : • K. Robbe-Sermesant (krobbe@ipmc.cnrs.fr) • M. Bailly-Bechet, G. Bernot, M. Deprez, D. Kozlowski q Objectif : • Etre capable de réaliser un script de bioinformatique en python • Préparation au projet python du semestre 6 q 2 parties : • Introduction à Linux et Langage Shell • Introduction à la programmation en langage Python
L3 BIM : Initiation à la programmation (IAP)
q Cours/ TD
• En salle machine : CRIPS (PV=Petit Valrose)
3ème étage (salles linux)
• Lundi 10h15 et jeudi à 15h15
• Début : jeudi 6 septembre
• Travail personnel (sur ordinateur)
q Evaluation
• Auto-évaluations
• CCI Linux (27 septembre) et CCI Python (22 octobre)
• Scripts à rendre
• Examen CT (Linux et Python)L3-S5: Neurobiologie Cognitive et L3-S5: Neurosciences
Comportementale Intégratives
BPN BPN (opt)
SLZV5101: 2 ECTS SLZV5102: 2 ECTS
1 TP (25%) + 1 CT 2h (75%) 1 CT 2h (100%)
Responsable UE: Ingrid Bethus Responsable UE: Ingrid Bethus
Vol h (25h= 18h CM+4h TD+3h TP) Vol h (18h=12h CM + 6h TD)
Objectif: Introduction aux bases Objectif: Introduction à la
neurobiologiques des fonctions neurophysiologie Intégrée
mentales supérieures
-Emotions (6h) -Niveaux de conscience (Veille –sommeil)
-Plasticité neuronale : (6h)
apprentissage et mémoire (6h) -Physiopathologie de la
-Comportements dirigés vers un but (6h) neurotransmission(6h)DPSC - Dynamique des populations et structure des
communautés
Intervenants : Luisa Mangialajo, Elodie
Objectif :
Vercken
Elargir les connaissances de l’organisme aux
populations et aux communautés
Contenus :
notions de dynamique des populations et des communautés (principaux
modèles de croissance des populations animales et végétales; structure des
communautés et méthodes d’analyses).
Modalités : CM + TD ; 2 CCI (FACULTATIFS!!! 25%) + CT (50%)Biologie des Interactions
• Cours : contenu et dates
– Métazoaires (M. Poirié) :
• 2 Cours : 07/09 et 14/09
• 3 TD (C. Sabourault) : 12/09, 19/09 et 26/09
– Plantes et microorganismes (K. Mandon) :
• 2 cours : 21/09 et 28/09
• 2 TD : 03/10 et 10/10
• Contrôle des connaissances
– Un devoir à rendre pour le 05/11 (30% de la note) :
2 diapos sur un modèle d’interaction durable,
– Un devoir terminal 23/11(1h30, 70%)Evaluations
• Un travail personnel individuel à rendre (30%)
– Présentation PowerPoint (ou pdf) : 2 diapos
• Présentation d’un modèle d’interaction durable
(Attention, éviter les modèles traités en cours : guêpes parasitoïdes,
seiche-bactéries, symbioses légumineuses)
• Intérêt évolutif, particularités, références (3 max)
• Intégrer une figure provenant d’un article
• Format diapo paysage L=25,4cm; h=19,05cm
– À déposer sur Jalon ou à envoyer par mail au plus tard le 05/11
à 18h à Cecile.Sabourault@unice.fr
• Un examen terminal 23/11 à 13h (70%)Écosystèmes Patrice FRANCOUR Écosystème : une façon d’aborder l’organisation, la structuration et le fonctionnement des systèmes complexes. Une approche des grandes questions d’actualité (effet de serre, désertification, importance de l’écologie dans la vie de tous les jours etc). Également un moyen d’aborder des notions relatives à la démarche scientifique. Notre attente : une réflexion et une approche synthétique; cela sera développé à travers des échanges en cours, des TD et des devoirs de synthèse Écologie : une approche transversale – notions de physiologie, d’anatomie, de mathématiques, de statistiques, etc.
UE Physiologie Comparée des Grandes Fonctions Animales
Coordonnatrice : Marielle GUIBBOLINI
UE Obligatoire pour les L3-BOE
Objectif
Acquisition des concepts nécessaires à la compréhension
des grandes fonctions physiologiques de l’organisme
Programme
-Grandes Fonctions physiologiques:
Fonctions rénale, cardiovasculaire, respiratoire, digestive
Métabolisme, Thermorégulation, Osmorégulation, Milieu intérieur…
-Aspects Comparatifs et Relations morpho-fonctionnelles
permettant de comprendre le fonctionnement du vivant au travers
de l’Evolution des Vertébrés.
UE de 4 ECTS
UE de 52h : 32h CM + 8h TD + 12h TP
Exam : TP (30%) + CT (70%)UE Endocrinologie Comparée
Coordonnatrice : Marielle GUIBBOLINI
UE optionnelle pour les L3-BOE
Objectif
Compréhension des phénomènes endocriniens qui permettent aux
organismes d’être en bonne santé physiologique.
Programme
Notions de bases sur le fonctionnement du système endocrinien
permettant de comprendre les phénomènes de régulations hormonales
nécessaires pour qu’un individu soit dans les meilleures conditions
physiologiques possibles tout le long de sa vie, malgré l’influence de
facteurs environnementaux (stress, cycle saisonnier, photopériode,
alimentation, température…), pour assurer non seulement sa survie, mais
aussi le succès de la reproduction de l’espèce.
Illustrations prises dans le règne animal.
UE de 2 ECTS
UE de 24h : 12h CM + 4h TD + 8h TP
Exam TP (30%) + CT (70%)Les UEs des Grandes Fonctions Animales,
Endocrinologie Comparée et
d'Ecotoxicologie sont complémentaires.
Certaines substances toxiques sont appelées « des perturbateurs endocriniens », ce
qui signifie qu’elles perturbent le système endocrinien (ex: la thyroïde, la
reproduction…). La descendance peut en être affectée, notamment lorsque le sex
ratio est affecté, sans parler des malformations...
==> On ne peut évaluer correctement l’impact des conditions environnementales sur
un organisme donné sans en connaitre le fonctionnement, à savoir le
fonctionnement du rein, du coeur etc…, sans connaitre le fonctionnement du
système endocrinien et sans avoir des bases en Ecotoxicologie (sem 6)
Complémentarité et Nécessité d’aborder ces 3UEs, d’autant plus que :
-certains Masters en France, dans le domaine de l’environnement, le demandent aux
étudiants qui souhaitent s’inscrire.Attention :
N’oubliez pas de justifier vos choix d’option de
parcours au dos de la fiche IP
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