Stages soutenus par le GIS Fruits en 2018 Liste des sujets proposés
←
→
Transcription du contenu de la page
Si votre navigateur ne rend pas la page correctement, lisez s'il vous plaît le contenu de la page ci-dessous
Stages soutenus par le GIS Fruits en 2018
Liste des sujets proposés
Le GIS Fruits soutient des stages étudiants de 6 mois, niveau Master 2 sur le thème des fruits et
finance pour cela des bourses de stages réalisés dans des labos INRA. Les sujets acceptés :
- s’inscrivent dans les axes thématiques du GIS,
- sont construits en partenariat entre au moins 3 membres du GIS,
- et le stagiaire est co-encadré par un maître de stage INRA.
>Axes thématiques du GIS : http://www.gis-fruits.org/Le-GIS-Fruits/Axes-thematiques
>Partenaires du GIS : http://www.gis-fruits.org/Le-GIS-Fruits/Membres-fondateurs
Durée : 6 mois
Niveau : Stage de fin d’études BAC + 5 (Option Ingénieur, ou Master 2)
Profil du stage : Recherche appliquée
Pour tout renseignement complémentaire :
gis.fruits@inra.fr
1/42Sujet de stage Nom du porteur INRA Centre INRA Unité Partenaires impliqués Axes
Nouvelle-
Cartographie fine de la région du QTL à effet majeur pour la date de floraison et les
Elisabeth Dirlewanger Aquitaine- BFP CEP, CTIFL 4
besoins en froid chez le cerisier
Bordeaux
Analyse des liens entre des pratiques économes en produits phytosanitaires et en
Françoise Lescourret et Provence-Alpes-
intrants, le développement des monilioses, la qualité des fruits et leur aptitude à la PSH UMR Qualisud (Univ. Avignon), CTIFL 3+5
Daniel Plenet Côte d’Azur
conservation en post-récolte en vergers de pêche - nectarine
Quelles seront les conséquences du changement climatique sur le développement des Provence-Alpes- UERI Gotheron et
Marie Launay GRAB (ITAB), CTIFL 3-4
monilioses sur fleurs et rameaux d'abricotiers ? Côte d’Azur Agroclim
Acquisition de références sur le développement architectural du prunier d'Ente pour une Evelyne Costes et Maria- Occitanie- CTIFL Lanxade, BIP, Montpellier
AGAP 5
application à la conduite en verger densifié Martha Fernandez Montpellier SupAgro
Evaluation multi-sites en culture de cassis d'une méthode de lutte augmentative contre Provence-Alpes- La Morinière, CTIFL, Afidem,
Philippe Kreiter ISA 4
la cochenille par des lâchers de Rhizobius lophantae Côte d’Azur Agrocampus Ouest
Caractérisation de l'effet inhibiteur de composés de surface de pêches sur la germination Bénédicte Quilot-Turion et Provence-Alpes-
GAFL CTIFL, Terralia 3
des conidies et le pouvoir pathogène de Monilinia laxa Marie-Noëlle Corre Côte d’Azur
SAM multicaractère - Quelles perspectives et quel modèle économique ? Exemple de Provence-Alpes- Montpellier SupAgro, CEP - AOP pêche-
Jean-Marc Audergon GAFL transversalité
l'abricotier Côte d’Azur abricot
Etude des mécanismes impliqués dans la dormance hivernale chez le pommier par Occitanie-
Fernando Andres-Lalaguna AGAP Montpellier SupAgro, SUDEXPE 4
l'analyse de la dynamique de dépots de callose et de l'expression de gènes candidats Montpellier
Effets de la scarification des sols sur la qualité physique et biologique des sols en verger Provence-Alpes- Station expérimentale La Pugère,
Yvan Capowiez EMMAH 5
de pommiers Côte d’Azur GRCETA de Basse Durance
Etude du comportement de Dysaphis plantaginae , le puceron cendré du pommier, en Provence-Alpes-
Laurent Gomez PSH CTIFL, Montpellier Supagro 3-5
présence de plantes de service, en environnement contrôlé Côte d’Azur
Impact d'une conduite de culture à faible niveau d'irrigation sur la qualité technologique
Provence-Alpes-
des fruits : cas d'étude d'une culture en conditions contrôlées de tomates et de leurs David Page SQPOV et CTCPA CTCPA, Montpellier Supagro 4-6
Côte d’Azur
transformations par des procédés traditionnels ou innovants
Développement d'un outil de prévision spatio-temporelle des dates de différents stades Provence-Alpes-
Christian Pichot URFM Montpellier SupAgro, CTIFL 4
phénologiques chez le pommier variété Golden Delicious Côte d’Azur
Nouvelle-
Bases génétiques de la balance entre floraison et développement végétatif et de son
Béatrice Denoyes Aquitaine- BFP Terralia, Agro Campus Ouest 4
interaction avec l'environnement chez le fraisier
Bordeaux
Fonctionnement et maitrise des bioagresseurs Axe 3
Adaptation et anticipation du changement climatique Axe 4
Systèmes Axe 5
Méthodologie Transversalité
2/42PROPOSITION DE STAGE 2017-2018
Le GIS Fruits souhaite soutenir des stages étudiants de 6 mois, niveau Master 2 sur le thème des fruits et
offre pour cela de financer des bourses de stages réalisés dans des labos INRA. Le sujet proposé doit :
i) s’inscrire dans les axes thématiques du GIS : Axe 4 ‘Adaptation et anticipation du changement
climatique’
ii) être construit en partenariat entre au moins 3 membres du GIS* : INRA,
iii) le stagiaire doit être encadré ou co-encadré par un maître de stage INRA.
* Les trois partenaires proposant le stage ne doivent pas appartenir à la même unité.
>Axes thématiques du GIS : http://www.gis-fruits.org/Le-GIS-Fruits/Axes-thematiques
>Partenaires du GIS : http://www.gis-fruits.org/Le-GIS-Fruits/Membres-fondateurs
Organismes partenaires : (1) INRA (2) CEP (3) Ctifl
Dont une des deux écoles membres du GIS le cas échéant : Montpellier Supagro ou Agrocampus Ouest.
Lieux du stage : INRA Bordeaux-UMR Biologie du Fruit et Pathologie
Durée : 6 mois
Dates : Janvier- Juin 2018
Niveau : Stage de fin d’études BAC + 5 (Option Ingénieur, ou Master 2)
Profil du stage : Recherche appliquée
3 / 42INTITULE DU STAGE : Cartographie fine de la région du QTL à effet majeur pour la date de floraison et
les besoins en froid chez le cerisier
Contexte et problématique :
Les prédictions climatiques convergent pour confirmer l’accélération du réchauffement climatique (rapport du
GIEC, 2013). Dans ce contexte, de nombreuses questions ayant trait à l’adaptation des espèces fruitières au
changement climatique se posent. En effet, dans les zones tempérées une augmentation des températures
en automne ou en hiver entraine un ralentissement du processus de levée de dormance, provoquant des
désordres phénologiques et une diminution de la production. De même, une augmentation des températures
au printemps se traduit par une avancée significative des dates de floraison et de débourrement entrainant
des risques accrus de dégâts par le gel. Les espèces fruitières pérennes, et le cerisier en particulier, sont
extrêmement sensibles aux températures, et il existe donc un risque non négligeable d’impact du
changement climatique sur la productivité et la qualité des fruits. Ce risque est majeur chez le cerisier car la
quasi-totalité des variétés cultivées actuellement nécessitent des quantités de froid importantes (besoins en
froid) pour lever la dormance des bourgeons. En effet, chez cette espèce, les variétés avec de très faibles
besoins en froid fleurissent généralement plus précocement et sont donc plus sensibles au gel printanier. Le
réchauffement climatique pourrait ainsi mettre en péril la production de cerise dans certaines régions dans
les années à venir. Compte-tenu de la longueur des processus d’amélioration variétale de cette espèce,
environ 25 ans de la sélection de l’hybride à la commercialisation de la nouvelle variété, il est essentiel
d’intégrer dès à présent dans les programmes d’amélioration, des critères liés à l'adaptation au changement
climatique pour permettre le choix de géniteurs correspondant mieux aux conditions environnementales
futures.
Une descendance de cerisier doux issue du croisement entre une variété tardive ‘Regina’ et une variété plus
précoce ‘Garnet’, comprenant 117 individus, a été étudiée pendant plusieurs années pour la date de
floraison et les besoins en froid. Les régions du génome (Quantitative Trait Loci, QTL) impliquées dans le
contrôle de ces caractères ont été recherchées et un QTL à effet majeur, expliquant respectivement 36% et
11% de la variation observée pour la date de floraison et pour les besoins en froid, a été identifié sur le
groupe de liaison 4 avec un intervalle de confiance de moins de 1 cM (Castède et al. 2014). Cette recherche
de QTL a été réalisée en utilisant une carte génétique comprenant 700 marqueurs SNP sur laquelle ont été
positionnés de nombreux gènes candidats (Castède 2014, Castède et al. 2015).
Objectifs généraux du stage / Résultats attendus :
L’objectif du projet sera d’étudier finement la région de ce QTL contrôlant la date de floraison et les besoins
en froid. Les analyses porteront sur l’étude de la descendance Regina x Garnet élargie avec 1400 individus
supplémentaires. La carte génétique sera complétée en génotypant 100 individus de cette descendance en
utilisant une nouvelle puce de 15 000 SNP. Les nouveaux marqueurs identifiés dans la région du QTL seront
ensuite génotypés sur l’ensemble de la descendance. Les individus recombinants seront alors identifiés et
phénotypés. Cette approche devrait permettre de réduire la région d’intérêt et de limiter le nombre de gènes
candidats localisés dans cette région. Pour la recherche de gènes candidats on utilisera la séquence du
génome de la variété Regina qui a été assemblé très récemment dans l’équipe.
A terme, les résultats devraient permettent de mieux comprendre les mécanismes impliqués dans les
caractères étudiés (date de floraison et besoin en froid) et de mettre en place une sélection assistée par
marqueurs efficace et utilisable en haut débit pour la création de nouvelles variétés adaptées aux conditions
climatiques des prochaines années.
Publications de l’équipe d’accueil et/ou relative au sujet (et/ou au projet dans lequel s’insère le stage) (En
gras, les personnes de l’équipe A3C de l’UMR BFP):
Hernández Mora, J. R., Micheletti, D., Bink, M., Van de Weg, E., Cantín, C., Nazzicari, N., Caprera, A., Dettori, M. T.,
Micali, Banchi, Campoy, J. A., Dirlewanger, E., Lambert, P., Pascal, T., Troggio, Bassi, D., Rossini, L., Verde, Quilot-
Turion, B., Laurens, F., Arus, P., Aranzana (2017). Integrated QTL detection for key breeding traits in multiple peach
progenies. BMC Genomics, 18: 404.
Fouche M, Le-Dantec L, Wenden B, Barreneche T, Quero-Garcia J, Gasic K, Barac G, Saski C, Iezzoni A, Fernandez
F, Sargent D, Silva H, Atkins M, Illeck L, Dirlewanger E (2017) The Sweet Cherry Genome: a new sequencing project
International Plant & Animal Genome XXV / January 14-18, 2017 - San Diego, CA, USA
Lambert P, Campoy JA, Pacheco I, Mauroux JB, Da Silva Linge C, Micheletti D, Bassi D, Rossini L, Dirlewanger E,
Pascal T, Troggio M, Aranzana MJ, Patocchi A, Arús P (2016) Identifying SNP markers tightly associated with six major
genes in peach [Prunus persica (L.) Batsch] using a high-density SNP array with an objective of marker-assisted
selection (MAS). Tree Genetics & Genomes 12 :121,
4 / 42Castède S, Campoy JA, Le Dantec L, Quero-García J, Barreneche T, Wenden B, Dirlewanger E. (2015) Mapping of
candidate genes involved in bud dormancy and flowering time in sweet cherry (Prunus avium). PlosOne10(11):
e0143250, DOI
Castède S, Campoy JA, Quero-García J, Le Dantec L, Lafargue M, Barreneche T, Wenden B, Dirlewanger E.
(2014) Genetic determinism of phenological traits highly affected by climate change in Prunus avium: flowering date
dissected into chilling and heat requirements. New Phytologist 202:703-715.
Campoy JA, Klagges C, Quero-García J, Guzman A; Mansur L, Gratacós E, Silva H, Rosyara UR, Iezzoni A, Meisel L,
Dirlewanger E. (2013) Construction and comparative analyses of highly dense linkage maps of two sweet cherry intra-
specific progenies of commercial cultivars. PLoS ONE 8(1): e54743.
Dirlewanger E, Quero-García J, Le Dantec L, Lambert P, Ruiz D, Dondini L, Illa E, Quilot-Turion B, Audergon JM,
Tartarini S, Letourmy P, Arús P (2012) Comparison of the genetic determinism of two key phenological traits, flowering
and maturity dates, in three Prunus species: peach, apricot and sweet cherry. Heredity 109:280–292.
ACTIVITES DOMINANTES CONFIEES AU STAGIAIRE :
- biologie moléculaire
analyses de marqueurs SNP
- analyses génétiques : construction de cartes génétiques haute densité
- analyses bioinformatiques
PROFIL REQUIS :
- Dernière année de Formation Supérieure BAC + 5
- Connaissances : biologie moléculaire et génétique, logiciel R, bioinformatique
- Compétences opérationnelles :
- Langues : Anglais
INDEMNISATION (SUR BUDGET INRA-GIS FRUITS) :
Selon la règlementation en vigueur pour 2018 (environ 550 €/mois)
AVANTAGES PROPOSES (le cas échéant) :
- restauration :
CONTACTS MAITRE DE STAGE INRA :
(1) Maître de stage INRA
Nom et fonction du responsable à contacter :
Dirlewanger Elisabeth, Directrice de Recherche, Directrice de l’équipe ‘Adaptation du Cerisier au
Changement Climatique’ de l’UMR BRP
Adresse :
UMR1332 Biologie du Fruit et Pathologie,Equipe (A3C)
Centre de Recherche de Bordeaux
71, avenue Edouard Bourlaux - CS 20032
33882 Villenave d'Ornon Cedex – France
Tél. : 05 57 12 24 61
Site web (équipe et/ou projet) : https://www6.bordeaux-aquitaine.inra.fr/bfp
Mail : elisabeth.dirlewanger@inra.fr
5 / 42UMT
IQUAR
PROPOSITION DE STAGE 2017-2018
Le GIS Fruits souhaite soutenir des stages étudiants de 6 mois, niveau Master 2 sur le thème des fruits et
offre pour cela de financer des bourses de stages réalisés dans des labos INRA. Le sujet proposé doit :
i) s’inscrire dans les axes thématiques du GIS,
ii) être construit en partenariat entre au moins 3 membres du GIS*,
iii) le stagiaire doit être encadré ou co-encadré par un maître de stage INRA.
* Les trois partenaires proposant le stage ne doivent pas appartenir à la même unité.
>Axes thématiques du GIS : http://www.gis-fruits.org/Le-GIS-Fruits/Axes-thematiques
>Partenaires du GIS : http://www.gis-fruits.org/Le-GIS-Fruits/Membres-fondateurs
Organismes partenaires : (1) INRA PSH (2) UMR Qualisud, Université d’Avignon (3)
CTIFL
Dont une des deux écoles membres du GIS le cas échéant : Montpellier Supagro ou Agrocampus Ouest.
Lieux du stage : Inra PSH Avignon
Durée : 6 mois
Dates : 1/03/2018 au 30/09/2018 (à définir avec le stagiaire)
Niveau : Stage de fin d’études BAC + 5 (Option Ingénieur, ou Master 2)
Profil du stage : Recherche appliquée
INTITULE DU STAGE : Analyse des liens entre des pratiques économes en produits
phytosanitaires et en intrants, le développement des monilioses, la qualité des fruits
et leur aptitude à la conservation en post-récolte en vergers de pêche - nectarine
Contexte et problématique :
Dans le cadre de l’UMT IQUAR « Innover pour améliorer la qualité après récolte des fruits et légumes frais »,
un des objectifs est d’améliorer les connaissances sur le lien entre les conditions de culture, l’état des fruits
à la récolte en termes de qualité et de sensibilité aux maladies et l’évolution de ces états dans des
conditions de conservation standard ou innovantes. Un des sujets étudiés est notamment l’impact de
techniques de production économes en intrants (produits phytopharmaceutiques, eau et azote) sur
l’élaboration de la qualité des nectarines ainsi que leur sensibilité aux monilioses, qui définissent les états
des produits à la récolte. En fonction de ces caractéristiques, il s’agit de rechercher des stratégies de
conservation optimales en post-récolte (conditions de température et d’humidité variables, techniques
innovantes…). Une thèse CIFRE devrait débuter sur ce sujet en 2018 qui s’appuierait tout particulièrement
sur le couplage entre un modèle d’élaboration de la qualité des fruits et un modèle épidémiologique des
monilioses sous l’influence des pratiques culturales, ainsi que sur le développement d’un modèle d’évolution
des fruits en post-récolte.
Objectifs généraux du stage / Résultats attendus :
L’objectif du stage est de mettre en œuvre et d’analyser des expérimentations permettant de moduler les
caractéristiques des fruits à la récolte grâce à des itinéraires techniques contrastés (systèmes économes en
produits phytosanitaires vs système conventionnel, combinés avec une gestion différenciée de l’irrigation et
de la charge en fruits, etc.). Après une caractérisation précise de leur état (calibre, composition biochimique
en sucres et acides, microfissures, intensité des dégâts sur les fruits…), la sensibilité aux monilioses des
différents lots de fruits sera étudiée sous des conditions standard de conservation.
6 / 42Il s’agit aussi de préciser les protocoles d’observations et de mesures permettant de suivre en dynamique
l’évolution des caractéristiques des fruits (en pré et post-récolte), en interaction avec les besoins
nécessaires pour le paramétrage des différents modèles utilisés dans le cadre du travail de thèse.
Publications de l’équipe d’accueil et/ou relatives au sujet (et/ou au projet dans lequel s’insère le stage) :
Bussi, C., Plénet, D., Merlin, F., Guillermin, A., Mercier, V., 2015. Limiting brown rot incidence in peach with tree training
and pruning. Fruits 70, 303-309.
Etienne, A., Genard, M., Lobit, P., Mbeguie-A-Mbeguie, D., Bugaud, C., 2013. What controls fleshy fruit acidity? A review
of malate and citrate accumulation in fruit cells. J. Exp. Bot. 64, 1451-1469.
Fishman, S., Genard, M., 1998. A biophysical model of fruit growth: simulation of seasonal and diurnal dynamics of
mass. Plant Cell Environ. 21, 739-752.
Gibert, C., Chadoeuf, J., Nicot, P., Vercambre, G., Genard, M., Lescourret, F., 2009. Modelling the effect of cuticular
crack surface area and inoculum density on the probability of nectarine fruit infection by Monilinia laxa. Plant
Pathology 58, 1021-1031.
Lescourret, F., Moitrier, N., Valsesia, P., Genard, M., 2011. QualiTree, a virtual fruit tree to study the management of fruit
quality. I. Model development. Trees-Structure and Function 25, 519-530.
Mercier, V., Bussi, C., Plénet, D., Lescourret, F., 2008. Effects of limiting irrigation and manual pruning on brown rot
incidence in peach. Crop Protection 27, 678-688.
Plénet, D., Hilaire, C., Blanc, P., Borne, S., Bouvery, F., Bussi, C., Courthieu, N., Gallia, V., Greil, M.-L., Hostalnou, E.,
Labeyrie, B., Mercier, V., Millan, M., Montrognon, Y., Monty, D., Pinet, C., Rouet, P., Ruesch, J., 2017. EcoPêche -
Conception et évaluation multisite de vergers de pêche – nectarine économes en produits phytosanitaires et en
intrants. Rapport technique de la campagne 2016. INRA Avignon - INRA Gotheron - INRA Bordeaux - CTIFL -
SEFRA - SERFEL - Sica CENTREX, p. 177.
ACTIVITES DOMINANTES CONFIEES AU STAGIAIRE :
- Une analyse bibliographique sur la problématique étudiée et l’identification des variables mobilisées par les
différents modèles afin de définir des protocoles de mesures permettant le paramétrage des modèles (en
interaction avec le doctorant).
- La participation à la conduite expérimentale d’un essai système (site Inra Avignon) et la mise en œuvre de
techniques (gestion de l’irrigation, éclaircissage…) susceptibles de créer un fort gradient dans les
caractéristiques des fruits à la récolte.
- La mise en œuvre des protocoles d’observations et de mesures permettant d’analyser le fonctionnement
des différents systèmes (grilles d’observation des bioagresseurs, utilisation des données de capteurs pour
piloter l’irrigation, variables pour caractériser la croissance des arbres et des fruits, variables de la qualité
biochimique des fruits, évolution des symptômes de monilioses, etc.),
- L’analyse des données recueillies afin d’établir des relations entre itinéraires techniques – croissance des
arbres et des fruits – sensibilité aux monilioses – aptitude à la conservation des fruits.
PROFIL REQUIS :
- Dernière année de Formation Supérieure BAC + 5
- Connaissances : agronomie, sciences du végétal
- Compétences opérationnelles : outils informatiques, statistiques, expérimentation
- Langues : Français et Anglais
- Permis de conduire (le cas échéant) : oui
INDEMNISATION INRA (SUR BUDGET GIS FRUITS) :
Selon la règlementation en vigueur pour 2018 (environ 550 €/mois)
AVANTAGES PROPOSES (le cas échéant) :
- logement : non
- restauration : restaurant d’entreprise sur le site Inra Paca Avignon
- déplacements : déplacements sur le centre Ctifl de Saint Rémy et l’Université d’Avignon
7 / 42CONTACT MAITRE DE STAGE INRA :
Nom et fonction du responsable à contacter : Françoise LESCOURRET (Directrice de Recherche) et Daniel
PLENET (Ingénieur de recherche)
Adresse : INRA UR1115 Plantes et Systèmes de culture Horticoles (PSH), 228 route de l’aérodrome,
Domaine Saint Paul – site Agroparc, CS 40509, 84914 Avignon cedex 9
Tél. : 04 32 72 24 53 (F. Lescourret) ou 04 32 72 24 66 (D. Plénet)
Site web (équipe et/ou projet) : http://www6.paca.inra.fr/psh
Mail : françoise.lescourret@inra.fr et daniel.plenet@inra.fr
8 / 42PROPOSITION DE STAGE 2017-2018
Le GIS Fruits souhaite soutenir des stages étudiants de 6 mois, niveau Master 2 sur le thème des fruits et
offre pour cela de financer des bourses de stages réalisés dans des labos INRA. Le sujet proposé doit :
i) s’inscrire dans les axes thématiques du GIS,
ii) être construit en partenariat entre au moins 3 membres du GIS*,
iii) le stagiaire doit être encadré ou co-encadré par un maître de stage INRA.
* Les trois partenaires proposant le stage ne doivent pas appartenir à la même unité.
>Axes thématiques du GIS : http://www.gis-fruits.org/Le-GIS-Fruits/Axes-thematiques
>Partenaires du GIS : http://www.gis-fruits.org/Le-GIS-Fruits/Membres-fondateurs
Organismes partenaires : (1) INRA (2) GRAB (ITAB) (3) CTIFL
Dont une des deux écoles membres du GIS le cas échéant : Montpellier Supagro ou Agrocampus Ouest.
Lieux du stage : INRA UERI Gotheron - 26 320 Saint-Marcel-lès-Valence et INRA Agroclim – 84000
Avignon
Durée : 6 mois
Dates : Janvier/Mars à Juillet/Septembre
Niveau : Stage de fin d’études BAC + 5 (Option Ingénieur, ou Master 2)
Profil du stage : Recherche appliquée
INTITULE DU STAGE : Quelles seront les conséquences du changement climatique
sur le développement des monilioses sur fleurs et rameaux d’abricotiers ?
Contexte et problématique :
Les principales variétés d’abricotiers cultivées sont assez sensibles à différentes maladies (Parveaud et al.,
2012), et en particulier aux monilioses qui peuvent anéantir la récolte en provoquant le dessèchement des
rameaux à fleurs. En France, les monilioses sur fleurs et rameaux d’abricotiers sont généralement dues à
Monilinia laxa, mais certaines années la présence de Monilinia fructicola a pu être constatée (Bel, 2015).
Ainsi, la culture de l’abricotier demande une protection fongicide encadrant la floraison. Cependant, cette
protection fongicide n’est pas toujours suffisante lorsque les conditions climatiques sont favorables au
développement de la maladie, et on considère que les monilioses sur fleurs et rameaux sont le principal
verrou technique à la culture de l’abricotier en Agriculture Biologique.
Les contaminations par les monilioses vont dépendre de différents facteurs : le stade phénologique de
l’arbre (réceptivité florale), la floribondité de l’arbre, la présence de l’inoculum (conidies) et les conditions
climatiques lors de la floraison. Une étude sur cerisiers en conditions contrôlées (Tamm et al., 1995) a
permis de proposer un modèle des risques de pourcentage de fleurs atteintes par Monilinia laxa en fonction
des températures et des durées d’humectation. Des expérimentations en conditions de terrain en verger
d’abricotiers en 2017, ont permis de valider l’allure générale des courbes de Tamm sur abricotier (Dam,
2017).
Le réchauffement climatique, et en particulier les températures hivernales plus clémentes, modifie les
périodes de floraison des abricotiers (Andreini et al., 2014). Le risque de contamination par les monilioses
dans les prochaines décennies sera donc impacté par le changement climatique de deux manières. D’une
part l’évolution de la température et de l’humectation augmentera ou au contraire réduira les risques
d’infection par le pathogène. D’autre part l’effet du climat sur la phénologie de l’abricotier modifiera la
synchronie entre la floraison de l’hôte et la disponibilité d’inoculum infectieux. La question centrale du stage
sera donc d’estimer quelles seront les conséquences du changement climatique sur le développement des
monilioses sur fleurs.
9 / 42Objectifs généraux du stage / Résultats attendus :
Les objectifs du stage se décomposent en 4 étapes :
1. participer à des expérimentations pour acquérir des données sur la moniliose de l’abricotier due à
Monilinia laxa (sur fleurs et/ou rameaux) et ainsi appréhender le pathosystème étudié. Le stagiaire devra
collecter de nouvelles données (mars - avril 2018) sur des nouveaux dispositifs expérimentaux (réseau de
vergers d’abricotiers, expérimentation arbres pièges en pots placés en verger) afin de fixer certains
paramètres du modèle.
2. concevoir un modèle de risque climatique de maladie sur fleurs. La démarche consiste à s’appuyer
sur le modèle de contamination par Monilinia laxa sur fleur proposé par Tamm et al. (1995) et testé en
verger d’abricotier (Dam, 2017). Sachant que le modèle doit être calibré pour l’abricotier, cela inclut d’en
revoir les paramètres (notamment en mobilisant les données acquises à l’étape 1).
3. estimer les risques futurs de moniliose sur abricotier à l’aide du modèle élaboré et de séries
climatiques correspondant à des scenarios plus ou moins pessimistes d’émission de gaz à effet de serre.
Les données climatiques futures seront extraites de la base Météo-France DRIAS pour les régions de
production de l’abricotier en Rhône-Alpes.
4. combiner ces prédictions avec un modèle phénologique permettant de prendre en compte l’évolution
du climat sur l’avancement ou le recul des dates de floraison de 3 variétés d’abricotiers (de précocités
variées) dans le futur.
Le travail sera essentiellement basé à l’INRA – UERI Gotheron dans la Drôme. Puis pour l’analyse des
données d’épidémiologie, et la mise en regard avec les données climatiques du futur, le stagiaire effectuera
certaines périodes de son stage sur l’INRA Agroclim Avignon. Il devra également travailler sur les jeux de
données collectés en 2017. Il sera co-encadré par Laurent Brun et Marie Launay, en collaboration étroite
avec Claude-Eric Parveaud (GRAB) et Baptiste Labeyrie (CTIFL) dans le cadre du projet FEDER ClimArbo.
Publications de l’équipe d’accueil et/ou relative au sujet (et/ou au projet dans lequel s’insère le stage) :
Equipes d’accueil :
Andreini, L., de Cortazar-Atauri, I.G., Chuine, I., Viti, R., Bartolini, S., Ruiz, D., Campoy, J.A., Legave, J.M.,
Audergon, J.M., Bertuzzi, P., 2014. Understanding dormancy release in apricot flower buds (Prunus
armeniaca L.) using several process-based phenological models. Agricultural and Forest Meteorology 184,
210-219.
Bel J.-G., 2015. Effets d’une nouvelle méthode de protection physique sur le microclimat et le
développement des monilioses de l’abricotier sur fleurs et fruits. Mémoire de Master 2 Agrosciences, Gestion
de la Qualité des Productions Végétales, Université d’Avignon.
Dam, D., 2017. Identification des facteurs intervenant dans le développement du Monilia sur fleurs et
rameaux d’abricotiers et recherche de résistances génétiques. Mémoire de fin d’étude ingénieur ENSAIA,
54p.
Launay, M., Caubel, J., Bourgeois, G., Huard, F., Garcia de Cortazar-Atauri, I., Bancal, M.-O., Brisson, N.,
2014. Climatic indicators for crop infection risk: Application to climate change impacts on five major foliar
fungal diseases in Northern France. Agriculture, Ecosystems & Environment 197, 147-158.
Parveaud C.E., Broquaire J.M., Mercier V., Gomez C., Brun L., Clauzel G., Guillermin A., Audergon J.M.,
2012. Apricot susceptibility to blossom rot (Monilinia spp.) and leaf rust (Tranzschelia spp.) under low-input
production system. Proceedings of the 15th International Conference on Organic Fruit-Growing ‘eco.fruit’,
Hohenheim, Germany, 20-22 February 2012, 352-355.
Autres références :
Tamm, Minder, et Flückiger. 1995. « Phenological Analysis of brown rot blossom blight of sweet cherry
caused by Monilia laxa ». Phytopathology 85 (4): 401‑408.
10 / 42ACTIVITES DOMINANTES CONFIEES AU STAGIAIRE :
- Notations expérimentales sur les nouveaux dispositifs en mars – avril 2018
- Prise en main du modèle de contamination sur fleurs et propositions d’amélioration.
- Analyse des jeux de données plante, notation maladie et conditions climatiques.
- Interrogation des bases de données climatiques et extraction des données.
- Modélisation du risque climatique du futur, de la phénologie de la plante hôte
PROFIL REQUIS :
- Dernière année de Formation Supérieure BAC + 5
- Connaissances : connaissances de base en phytopathologie, en statistique et modélisation
- Compétences opérationnelles : rigueur dans la gestion et l’exploitation des données, aptitude au travail en
équipe, goût pour l’expérimentation de terrain et la modélisation mathématique.
- Langues : anglais lu.
- Permis de conduire (le cas échéant) : pas indispensable.
INDEMNISATION (SUR BUDGET INRA-GIS FRUITS) :
Selon la règlementation en vigueur pour 2018 (environ 540 €/mois)
AVANTAGES PROPOSES (le cas échéant) :
- logement : Il est possible de loger sur l’UERI Gotheron (6 chambres stagiaires ; salle à manger et cuisine).
Si logement sur place, participation aux frais de 80 €/mois.
- restauration : Sur place au niveau des logements stagiaires ou à la cantine d’entreprise.
- déplacements : Déplacements entre Gotheron et Avignon, seront pris en charge par le labo d’accueil.
CONTACTS MAITRE DE STAGE INRA :
(1) Maître de stage INRA
Nom et fonction du responsable à contacter : Marie Launay
Adresse
US1116 AgroClim
INRA, Centre de recherche PACA
228, route de l’Aerodrome, CS 40509, Domaine Saint Paul, Site Agroparc
84914 Avignon Cedex 9
Mail : marie.launay@inra.fr
11 / 42PROPOSITION DE STAGE 2017-2018
Le GIS Fruits souhaite soutenir des stages étudiants de 6 mois, niveau Master 2 sur le thème
des fruits et offre pour cela de financer des bourses de stages réalisés dans des labos INRA.
Le sujet proposé doit :
i) s’inscrire dans les axes thématiques du GIS,
ii) être construit en partenariat entre au moins 3 membres du GIS*,
iii) le stagiaire doit être encadré ou co-encadré par un maître de stage INRA.
* Les trois partenaires proposant le stage ne doivent pas appartenir à la même unité.
>Axes thématiques du GIS : http://www.gis-fruits.org/Le-GIS-Fruits/Axes-thematiques
>Partenaires du GIS : http://www.gis-fruits.org/Le-GIS-Fruits/Membres-fondateurs
Organismes partenaires : (1) INRA (2) Ctifl (3) BIP (4) Montpellier SupAgro ou AgroCampus Ouest
Axe Thématique du GIS : Approche système aux 3 échelles : parcelle, exploitation agricole et territoire (Axe 5)
Lieux du stage : Ctifl, Centre de Lanxade (Prigonrieux, 24)
Co-encadrement INRA / Ctifl
Durée : 6 mois
Dates : Mi-février à mi-août 2018
Niveau : Stage de fin d’études BAC + 5 (fin de cycle Ingénieur)
Profil du stage : Recherche appliquée
INTITULE DU STAGE : Acquisition de références sur le développement architectural
du prunier d’Ente pour une application à la conduite en verger densifié
Contexte et problématique : Avec une production annuelle moyenne de 45 000 tonnes, la filière Pruneau
ème
d’Agen est le leader européen de la production de pruneaux, et se situe au 3 rang mondial derrière les
Etats-Unis et le Chili. Si la qualité du Pruneau d’Agen, caractérisée par son IGP, fait l’objet d’une forte
reconnaissance tant sur le marché intérieur qu’à l’export, la filière est confrontée à une forte concurrence
internationale, notamment sud-américaine, basée sur des fruits de qualité certes inférieure mais obtenus
avec des coûts de production plus faibles. Ce contexte difficile, marqué par une offre mondiale fluctuante
gênant la filière française sur ses marchés export, a exigé une réaction énergique de la profession. Celle-ci
s’est concrétisée par le lancement d’un ambitieux « Plan de Reconquête de la Compétitivité », porté par le
Bureau Interprofessionnel du Pruneau (BIP), dont l’objectif est d’asseoir le positionnement de la filière
française dans la durée, en s’employant entre autres à réduire les coûts de production aux niveaux verger et
séchage. La densification des vergers est l’’une des voies pressenties pour augmenter leur rentabilité
économique et pérenniser la rémunération des pruniculteurs. Sur la base de l’expérience de l’évolution des
vergers de pommier, le BIP a confié au Ctifl la mission de définir un modèle de verger de prunier d’Ente à
haut rendement, préservant la qualité du pruneau définie par son IGP.
Pour expérimenter les modalités de ce qui pourrait devenir le verger de prune d’Ente de demain, une
plateforme technique BIP-Ctifl a commencé d’être mise en place en 2016 au centre Ctifl de Lanxade. Trois
axes de recherche y sont travaillés :
- L’expérimentation de systèmes de conduite à haut rendement, suffisamment pérennes sur la durée tant
sur les plans agronomique qu’économique.
- L’optimisation du fonctionnement de ces systèmes de conduite par un pilotage de l’équilibre
rendement/qualité ; ceci pour maintenir l’avantage concurrentiel de qualité du Pruneau d’Agen.
- L’évaluation de matériel végétal (porte-greffes et variétés) pour anticiper l’évolution du verger sur le long
terme
12 / 42Objectifs généraux du stage / Résultats attendus : Contrairement au verger de pommier, pour lequel
l’arboriculteur dispose d’un choix de modes de conduite relativement éprouvés et bien documentés, le
verger de prunier d’Ente densifié est aujourd’hui totalement à inventer. Pour ce faire, on ne peut pas se
contenter de transférer en l’état au prunier les modes de conduite du pommier : les caractéristiques de
développement de l’arbre propres à l’espèce doivent être prises en compte, de même que les contraintes
technico-économiques de la production (récolte mécanique notamment). Le stage contribuera à cet objectif
ère ème
par l’acquisition, sur des arbres en 1 et 2 feuille, des premières références sur le développement
architectural des arbres et l’établissement de la production, en fonction de leur densité de plantation, des
techniques de taille et de formation appliquées, et des facteurs porte-greffe et variété. L’objectif de ce travail
à terme (et au-delà de ce stage) est d’identifier les règles qui régissent le développement spatial de l’arbre et
l’établissement de ses points de floraison et de fructification, afin de fournir des éléments objectifs de
réflexion pour orienter la définition de protocoles de taille pertinents adaptés à chacun des systèmes de
conduite testés.
Le travail s’appuiera sur les dispositifs expérimentaux mis en en place à Lanxade sur les trois volets de la
plateforme BIP-Ctifl, et bénéficiera au cours de ce stage de l’appui scientifique et méthodologique de
l’équipe A.F.E.F. (Architecture et Fonctionnement des Espèces Fruitières) de l’UMR AGAP de l’Inra de
Montpellier, notamment pour un transfert des outils d’acquisition de données et logiciels mis au point par les
experts Inra de la modélisation du développement architectural des arbres.
Les livrables attendus pour ce stage sont une base de données des caractéristiques morphologiques des
arbres et un rapport de synthèse qui comprendra, d’une part les premières conclusions sur le
développement des arbres selon les facteurs étudiés, et d’autre part une synthèse détaillée des
développements possibles à ce type d’étude, intégrant notamment l’exploitation des outils logiciels mis au
point par l’UMR PIAF de l’Inra de Clermont-Ferrand.
Publications de l’équipe d’accueil et/ou relative au sujet (et/ou au projet dans lequel s’insère le stage) :
COSTES E., CRESPEL L., DENOYES B., MOREL P., DÉMENÉ M.N., LAURI P.E., WENDEN B., 2014. Bud
relative organization and branching patterns along shoots in Rosaceae species: a review. Frontiers in Plant
Science. Section Plant Biophysics and Modeling. doi: 10.3389/fpls.2014.00666
NEGRÓN C., CONTADOR M.L., LAMPINEN B.D., METCALF S.G., GUÉDON Y., COSTES E., DEJONG T.M.,
2014. How different pruning severities alter shoot structure: a modelling approach in young ‘Nonpareil’ almond
trees. Funtional Plant Biology 42, 325–335.
SELEZNYOVA A., THORP G., WHITE M., TUSTIN S., COSTES E., 2003. Structural development of branches of
‘Royal Gala’ apple grafted on different rootstock/interstock combinations. Annals of Botany 91(5):1-8.
COSTES E., GUÉDON Y., FOURNIER D., 1999. Analysis and modelling of fruit tree axillary shoot and flowering
distribution. Fruits, 54, 431-440.
GODIN C., COSTES E., SINOQUET H., 1999. A method for describing plant architecture which integrates
topology and geometry. Annals of Botany, 84, 343-357.
DOUROUX B., 1993. Recherche sur les bourgeons végétatifs et floraux du prunier d’Ente (Prunus domectica L cv.
Agen). Introduction à une méthode prévisionnelle des récoltes et au concept de la qualité des fleurs. Thèse :
Biologie et physiologie végétales. Clermont-Ferrand : Université Blaise Pascal, 299.
ACTIVITES DOMINANTES CONFIEES AU STAGIAIRE :
Le stagiaire sera basé à Prigonrieux sur le centre Ctifl de Lanxade (près de Bergerac, 24). Il sera amené à
faire quelques séjours à Montpellier (34) pour bénéficier de l’expertise de l’équipe AFEF de l’UMR AGAP.
Les tâches demandées au stagiaire seront les suivantes :
- Recherche bibliographique concernant l’intérêt des études menées sur l’architecture des arbres et leur
contribution à la définition de pratiques en arboriculture fruitière
- Formation, auprès de l’Inra de Montpellier, à l’utilisation d’un digitaliseur et à la formalisation des
protocoles d’acquisition des données de terrain pour une exploitation par les logiciels statistiques et de
modélisation
- Sur un choix d’arbres judicieusement choisis, relevé des variables descriptives du développement des
structures de l’arbre (données quantitatives et spatiales) et du positionnement des organes végétatifs et
florifères sur les unités de croissance : mesure des longueurs et diamètres des troncs, branches et
13 / 42pousses, des angles d’insertion et de courbure, comptage du nombre d’entre-nœuds et de points de
floraison, relevé du rang des organes florifères sur les unités de croissance.
Les arbres étudiés seront choisis pour représenter une gamme typologique variée selon les critères de
gabarit et degré de ramification du scion, méthode de taille et de formation, densité de plantation, variété
et porte-greffe.
Les effectifs étudiés par type d’arbre seront définis comme un compromis entre représentativité
statistique de l’échantillon et faisabilité pratique des notations.
Comme support de l’étude, le stagiaire disposera des dispositifs suivants :
• Un verger en 1ère feuille mis en place selon divers systèmes de conduite, différant par leur densité de
plantation et leur taille de formation
• Un verger en 1ère feuille issu de plants obtenus par diverses méthodes de greffage, différant par leur
croissance et leur degré de ramification
• Un verger en 1ère feuille sur lequel sont testés 7 variétés en combinaison de 2 porte-greffes
• Un verger en 2ème feuille, mis en place dans un objectif mur fruitier, avec 4 variantes de protocoles
de taille et formation appliquées dès la plantation
Les outils d’acquisition des données comprendront un digitaliseur et divers outils de mesure classiques.
- Saisie des résultats sur tableur et avec le logiciel PIAFdigit (développé par l’Inra Clermont-Ferrand),
analyse statistique sous R, traitement par le logiciel VPlants
- Proposition de suites à donner
- Rédaction d’un rapport de synthèse
Le stage sera co-encadré par Evelyne Costes (Inra) et Maria-Martha Fernandez (Ctifl), et bénéficiera d’un
co-pilotage par Maud Delavaud (Pôle verger du BIP). Sur le centre Ctifl de Lanxade le stagiaire sera placé
sous les responsabilités scientifique de M.M. Fernandez et administrative de K. Giresse (Cheffe du Centre
Ctifl de Lanxade).
PROFIL REQUIS :
- Dernière année de Formation Supérieure BAC+5 (si possible cursus Grande Ecole d’Ingénieurs Agronomes)
- Connaissances : Agronomie, Biologie végétale, Statistiques
- Compétences opérationnelles :
Goût pour le travail de terrain, persévérance et ténacité même pour des travaux en extérieur
Capacité à effectuer des relevés avec rigueur dans l’observation et la transcription
Goût pour les chiffres et leur traitement. Si possible, intérêt pour le sujet de l’étude
Capacités d’organisation et d’initiative. Curiosité intellectuelle
Capacité à utiliser Excel et Word. Si possible, aisance pour l’utilisation de logiciels nouveaux
L’aisance à travailler en hauteur (3 m) est impérative.
- Langues étrangères : Anglais (au moins lu)
- Permis de conduire : Permis B indispensable et goût pour la conduite (le stagiaire sera amené à faire
plusieurs déplacements entre Prigonrieux et Montpellier en voiture de fonction).
INDEMNISATION (SUR BUDGET INRA-GIS FRUITS) :
Selon la règlementation en vigueur pour 2018 (environ 550 €/mois)
AVANTAGES PROPOSES (le cas échéant) :
- Logement : Facilités de logement sur Prigonrieux (maison des stagiaires du Ctifl de Lanxade)
pour un loyer avantageux (colocation)
- Restauration : A la charge du stagiaire. Pas de restauration collective sur place
- Déplacements : A prévoir entre Prigonrieux et Montpellier
(avec éventualité de devoir rester plusieurs jours consécutifs sur Montpellier)
+ Possibilité de quelques déplacements ponctuels sur le Sud-Ouest (visites de
vergers professionnels organisées par le BIP)
Frais de déplacement remboursés
14 / 42CONTACTS MAITRES DE STAGE :
(1) Maître de stage INRA
Nom et fonction du responsable à contacter : Evelyne COSTES, PhD, Responsable de l’équipe AFEF
Adresse : UMR AGAP 1334 - Campus CIRAD, TA-A-108/03, Avenue Agropolis, 34 398 Montpellier Cedex 5
Tél. : 04 67 61 75 08
Site web (équipe et/ou projet) : https://umr-agap.cirad.fr
Mail : costes@supagro.inra.fr
(2) Maître de stage Ctifl
Nom et fonction du responsable à contacter : Maria-Martha FERNANDEZ, Responsable filière prune
Adresse : Ctifl, Centre de Lanxade, 28 route des Nébouts, 24 130 Prigonrieux
Tél. : 05 53 58 00 77 / 05 53 58 00 05
Site web (équipe et/ou projet) : http://www.ctifl.fr/
Mail : Fernandez@ctifl.fr
15 / 42PROPOSITION DE STAGE 2017-2018
Le GIS Fruits souhaite soutenir des stages étudiants de 6 mois, niveau Master 2 sur le thème des fruits et
offre pour cela de financer des bourses de stages réalisés dans des labos INRA. Le sujet proposé doit :
i) s’inscrire dans les axes thématiques du GIS,
ii) être construit en partenariat entre au moins 3 membres du GIS*,
iii) le stagiaire doit être encadré ou co-encadré par un maître de stage INRA.
* Les trois partenaires proposant le stage ne doivent pas appartenir à la même unité.
>Axes thématiques du GIS : http://www.gis-fruits.org/Le-GIS-Fruits/Axes-thematiques
>Partenaires du GIS : http://www.gis-fruits.org/Le-GIS-Fruits/Membres-fondateurs
Organismes partenaires : (1) INRA (2) La Morinière (3) Ctifl (4) Afidem
(5) Agrocampus Ouest ou Montpellier Supagro
Axe Thématique du GIS : Connaissance du fonctionnement et maîtrise des bioagresseurs (Axe 3)
Lieux du stage : Station d’expérimentation fruitières « La Morinière » 37800 Saint Epain
Co-encadrement INRA / Station d’expérimentation La Morinière
Durée : 6 mois (ou plus, selon disponibilités du stagiaire)
Dates : Mars à août 2018
Niveau : Stage de fin d’études BAC + 5 (Ingénieur ou Master 2)
Profil du stage : Recherche appliquée
INTITULE DU STAGE : Evaluation multi-sites en culture de cassis d’une méthode de
lutte augmentative contre la cochenille par des lâchers de Rhizobius lophantae
Contexte et problématique : Les cochenilles diaspines affectent une variété de cultures fruitières pérennes
de manière économiquement préjudiciable, avec un potentiel de dégâts allant de la baisse des rendements
à la mortalité de la culture. Sont concernées notamment les cultures de cassis, qui subissent depuis
plusieurs années un fort développement des populations de la cochenille Pseudaulacaspis pentagona
(cochenille blanche du mûrier), ravageur devenu très préoccupant pour la filière et contre lequel les solutions
chimiques à disposition sont limitées et d’efficacité insuffisante. Comme alternative à la protection chimique,
une stratégie de diminution des populations de cochenilles par des lâchers de coccinelles Rhizobius
lophantae est proposée, cette espèce présentant des données de prédation et une polyphagie sur
cochenilles diaspines intéressantes. Sous l’impulsion des professionnels du cassis, l’intérêt de ce prédateur
naturel dans la régulation de la cochenille est travaillé depuis 2013 par la station régionale d’expérimentation
fruitière La Morinière. Les résultats obtenus ont conduit à définir les modalités d’une méthode de lutte
augmentative par des lâchers de Rhizobius, visant à réguler les cochenilles en renforçant les populations de
l’auxiliaire dans l’environnement des cassissiers. L’efficacité de cette méthode de biocontrôle est
expérimentée depuis 2016 à travers un essai multi-sites mené en parcelles producteurs dans le cadre du
projet RhizoDia.
Construit autour de cinq partenaires (Ctifl, La Morinière, Chambre d’agriculture de Côte d’Or, Inra PACA,
Koppert France), le projet RhizoDia est subventionné par l’ONEMA et bénéficie du soutien financier de
l’Afidem.
Objectifs généraux du stage / Résultats attendus : Sur la base d’un dispositif expérimental permettant la
comparaison avec un programme de lutte chimique de référence et un témoin non traité contre la cochenille,
la première année du projet RhizoDia a donné des résultats encourageants quoique partiels : l’incidence
positive des lâchers de R.lophanthae sur les populations de cochenilles a été mise en évidence sur trois
sites sur cinq ; de même, à l’issu des deux lâchers effectués, seuls trois sites d’introduction sur cinq (les plus
infestées par la cochenille) sont colonisés par l’auxiliaire. Ces résultats n’ont pas pu être confirmés en
16 / 42deuxième année du projet, qui a été gênée dès la sortie d’hiver par une forte diminution des populations de
cochenilles enregistrée sur l’ensemble des sites indépendamment des lâchers.
L’identification morphologique et génétique des auxiliaires collectés a montré que la plupart des Rhizobius
capturés sont d’origine génétique proche, quelle que soit leur provenance (parcelles d’introduction ou de
référence). Parmi les coccinelles indigènes quatre espèces dominent, dont la très majoritaire et compétitive
coccinelle asiatique (Harmonia axyridis). L’exploration des autres auxiliaires et notamment des parasitoïdes,
localement très nombreux, a également débuté et devra se poursuivre.
Le stage proposé s’inscrit dans la dernière année de réalisation du projet, qui devrait permettre, dans le
meilleur des cas de conclure sur l’efficacité de la stratégie de biocontrôle testée, pour une mise en pratique
par les producteurs de cassis, ou si cet objectif n’est pas atteint, de dégager des conclusions documentées
ouvrant sur la proposition de verrous techniques ou scientifiques à lever pour pouvoir statuer sur la poursuite
de l’étude.
Les actions à mener dans le cadre de ce stage porteront sur i) l’évaluation de l’efficacité des lâchers de
Rhizobius contre la cochenille, ii) l’appréciation des capacités de survie hivernale des coccinelles introduites,
iii) l’évaluation de l’intérêt de la mise en place d’abris pour le maintien hivernal de l’auxiliaire sur les
parcelles, iv) la caractérisation génétique des auxiliaires par l’exploitation de la portion de génome
mitochondrial COI. Les éléments de synthèse des trois années de résultats du projet sont également
attendus, pour servir de base à la production d’un guide méthodologique (la rédaction de ce guide étant
quant à elle hors champ du travail du stagiaire).
Pour atteindre ces objectifs, le stagiaire bénéficiera (i) sur le site de la Morinière, de l’encadrement
méthodologique et technique de Philippe Guignebault en concertation avec Maria-Martha Fernandez (CTIFL
Lanxade) et (ii) de l’expertise de Philippe Kreiter et Nicolas Ris (INRA PACA, UMR 1355, équipe RDLB) en
termes d’appui à la veille bibliographique, à l’identification des espèces prédatrices, à l’analyse des résultats
et à la correction du rapport
Publications de l’équipe d’accueil et/ou relative au sujet (et/ou au projet dans lequel s’insère le stage) :
DALSTEIN MC, GUIGNEBAULT P, KREITER P. 2015. Management of Pseudaulacaspis pentagona in
French Blackcurrant. Poster présenté au XIth Symposium Rubus and Ribes. Asheville, USA
KREITER P., COQUELET C. & THAON M. 2002. La Cochenille blanche du mûrier, principal ravageur des
cassissiers en région Rhône-Alpes, Bulletin de la société Linnéenne de Lyon, 6 : 251-252.
KREITER P. & DIJOUX L. 1998. La cochenille blanche du mûrier en verger de pêcher Un exemple de lutte
dans les Alpes-Maritimes, Phytoma - La défense des végétaux, 501 : 36-40
ACTIVITES DOMINANTES CONFIEES AU STAGIAIRE :
Le stagiaire sera basé sur la Station d’Expérimentation Fruitière La Morinière (37) et sera amené à faire
quelques séjours à Sophia Antipolis (06) pour bénéficier de l’expertise de l’équipe Recherche et
Développement en Lutte Biologique (RDLB) de l’Institut Sophia-Agrobiotech.
Il aura pour support de travail 4 sites producteurs situés dans le Val-de-Loire, et sera aussi en charge du
ème
traitement des données collectées sur le 5 site d’étude localisé en Bourgogne.
Les tâches qui lui seront demandées seront les suivantes :
- Recherche bibliographique sur le contexte de l’étude
- En respectant les protocoles établis, participation à l’ensemble des travaux de terrain du projet
RhizoDia, à savoir :
• Réalisation des lâchers
• Notation de l’infestation des cassissiers par la cochenille
• Dénombrement des populations de cochenilles
• Réalisation de frappages et dénombrement des populations d’auxiliaires
- Sur le site de l’équipe RDLB, formation aux techniques de caractérisation génétique et à la lecture de
leurs résultats. Application aux échantillons collectés
17 / 42Vous pouvez aussi lire
