URFM (UR 629) Ecologie des Forêts Méditerranéennes - Département Ecologie des Forêts,Prairies et Milieux Aquatiques Centre PACA - Rapport ...
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Département
Ecologie des Forêts,Prairies et Milieux Aquatiques
Centre PACA
URFM (UR 629)
Ecologie des Forêts Méditerranéennes
Rapport d'évaluation pour l'AERES
I – Bilan 2006-2010
Octobre 2010
Bilan 1/39
Résumé
Depuis 2008, l'unité de recherches Ecologie des Forêts Méditerranéennes (URFM) a redéfini son
projet de recherche et son organisation. Nous développons des compétences en biologie des
populations, dendrométrie, écologie, écophysiologie, entomologie, génétique, mathématiques
appliquées, physique et sciences forestières, qui se combinent dans une démarche de recherche
pluridisciplinaire et finalisée, centrée sur un objet d'étude, pour aborder des questions générales en
écologie sur la réponse des écosystèmes complexes au changement global.
Notre projet sur les dynamique et le fonctionnement des forêts méditerranéennes intègre trois
grands thèmes de recherche, étroitement liés:
• l'étude de la dynamique, de l'utilisation de l'eau et du bilan de carbone dans les forêts
mélangées, hétérogènes en composition et en structure;
• une approche démo-génétique de la dynamique des populations à différentes échelles
spatiales;
• une approche de l'écologie du feu basée sur la connaissance des mécanismes physiques du
comportement et des impacts du feu.
Sur chacun de ces thèmes, nous allions démarche expérimentale et modélisation. Les productions de
l'unité sont avant tout académiques (publications de rang A) mais nous participons aussi activement
au transfert des connaissances sous diverses formes. L'unité est très fortement investie dans l'espace
européen de la recherche.
Executive Summary
In 2008, the research unit Ecology of the Mediterranean Forests (URFM) has defined a new project
and a new organisation. Based on our multidisciplinary expertise in dendrometry, ecology,
ecophysiology, entomology, forest sciences, genetics, mathematics, physics and population biology,
we develop a research project on the dynamics and function of the complex mediterranean forest
ecosystem in the context of global change.
Our project integrates three main lines of research, tightly connected one to the other:
• the study of forest dynamics, water use and carbon balance in the mixed forest ecosystems
that are heterogenous in their composition and structure;
• a demo-genetic approach of population dynamics at various spatial scales;
• a study of forest ecology based on the knowledge of the physics of fire behaviour and its
impacts on the ecosystem.
On each of these areas, we combine experimental approaches and process-based modelling. The
productions of URFM are mainly academic, but we also participate to the transfer of knowledge in
various ways. URFM is deeply involved in the European research Area.
Bilan 2/39
BILAN
1) Contexte et missions de l'unité
1.1. Situation, contexte national et international
La précédente évaluation de l'unité, qui n'était pas encore dans le cadre AERES, s'est déroulée en
2007. Le projet mis en place depuis le 1er Janvier 2008 relève d'une nouvelle ambition scientifique,
marquée par le changement du nom de l'unité, passé de Recherches Forestières Méditerranéennes à
Ecologie des Forêts Méditerranéennes, et par une ré-organisation interne. L'objectif général de nos
recherches est de comprendre et modéliser les dynamiques et le fonctionnement des forêts
méditerranéennes pour fournir des outils d'aide à leur gestion durable dans le contexte du
changement global. Notre projet s'inscrit dans une démarche de recherche finalisée
pluridisciplinaire dont la stratégie est explicitée ci-dessous.
Au sein du département Ecologie des Forêts, Prairies et Milieux Aquatiques (EFPA), il contribue
aux axes stratégiques A :« Améliorer le cadre de vie, préserver l'environnement et produire
durablement » et E :« Adapter les espèces, les pratiques et les systèmes de production à des
contextes changeants » de l'INRA, et s'inscrit pleinement dans le projet de programme sur
l’adaptation de l’agriculture et de la forêt au changement climatique de l'Institut. Au plan local, les
26 unités de recherches et unités expérimentales du centre INRA-PACA sont organisées autour de
trois grand pôles de compétences: l'URFM participe au pôle Adaptation au Changement Global
(ACG)1 qui regroupe des équipes en biologie et écologie, sciences physiques de l'environnement,
sciences humaines et sociales travaillant conjointement sur cette thématique, en partenariat avec la
Fédération de Recherche Ecosystèmes Continentaux et Risques Environnementaux (FR-
ECCOREV2). Nous avons localement des liens très étroits avec l'Unité Expérimentale Forestière
Méditerranéenne (UEFM), unité qui a son propre projet sur la protection des forêts contre les
ravageurs et qui réalise aussi du travail expérimental pour d'autres unités INRA ou extérieures.
Au niveau international, l'URFM est très fortement impliquée dans les réseaux de recherche
européens (membre du réseau d'excellence EVOLTREE, co-coordinateur du projet intégré FIRE
PARADOX) et développe des collaborations étroites avec des laboratoires d'excellence aux USA
(Los Alamos National Laboratory, LANL) et au Canada (Université de Vancouver). Parallèlement,
l'URFM entretient des collaborations régulières avec les pays du pourtour méditerranéen hors
Union Européenne. Ce contexte a conduit l'URFM à développer un partenariat privilégié avec le
Bureau pour la Méditerranée de l'European Forest Institute (EFIMED), porteur du Plan Stratégique
de Recherche sur les Forêts Méditerranéennes 2010-2020 3 dans lequel s'inscrit parfaitement le
projet de l'unité.
1.2. Un projet d'unité dans le champ des recherches finalisées
L'URFM mène un projet de recherches finalisées sur les forêts méditerranéennes, considérées
comme supports de recherches génériques et porteuses d'enjeux spécifiques pour l'application de
ces recherches.
1
F. Lefèvre est co-animateur du pôle ACG avec A. Chanzy (département EA)
2
http://eccorev.cerege.fr/
3
http://www.efimed.efi.int/portal/research/mfra/
Bilan 3/39
Du fait de leurs spécificités, les forêts méditerranéennes représentent un objet d'étude
particulièrement riche pour aborder des questions fondamentales en écologie, dans une perspective
dynamique : écosystèmes très diversifiés (y compris en terme de diversité génétique), en conditions
environnementales contraignantes et très hétérogènes (gradients altitudinaux, hétérogénéités micro-
locales sur les substrats karstiques), écosystèmes perturbés (feu, sécheresses, insectes, ...) avec des
dynamiques marquées (colonisations, extinctions, maturation).
Par ailleurs, le contexte de changement global, et de changement climatique en particulier, pose des
enjeux importants sur les forêts méditerranéennes, non seulement du fait des menaces spécifiques
attendues sur la région (aggravation des sécheresses estivales, augmentation des fréquences
d'événements extrêmes), mais aussi du fait de l'intérêt potentiel des ressources génétiques
méditerranéennes pour d'autres régions dans un futur proche 4. Enfin, certains aspects de la gestion
actuelle des forêts méditerranéennes présentent un intérêt pour d'autres forêts5.
Pour aborder ces questions scientifiques et les différents enjeux finalisés, l'unité combine approches
expérimentales et modélisation. La majeure partie de nos recherches se concentrent sur trois
écosystèmes modèles : les forêts mélangées à pin d'Alep-chêne soumises à de fortes contraintes
hydriques et au risque d'incendie, la cédraie comme modèle d'espèce introduite en évolution dans
son nouvel environnement, la hêtraie-sapinière d'altitude avec des processus de maturation,
d'extinction ou de colonisation en cours.
Les productions de l'unité sont diverses : productions académiques, outils et méthodes transférés
aux utilisateurs finaux, contributions à des expertises ou prospectives collectives (voir chapitre 4 et
annexes 2 & 3). Les chercheurs et ingénieurs de l'unité participent activement à ces différents types
d'activité.
2) Stratégie scientifique de l'unité
2.1. Un projet intégré sur les dynamiques et le fonctionnement des forêts méditerranéennes
L'axe de recherche pluridisciplinaire de l'URFM est l'étude des dynamiques et du fonctionnement
des forêts méditerranéennes. Pour ce rapport, nous avons décomposé cet axe de recherche en trois
thèmes (Figure 1) :
1. l'étude de la dynamique, de l'utilisation de l'eau et du bilan de carbone dans les forêts
mélangées, hétérogènes en composition et en structure;
2. une approche démo-génétique de la dynamique des populations à différentes échelles
spatiales;
3. une approche de l'écologie du feu basée sur la connaissance des mécanismes physiques du
comportement et des impacts du feu.
Ce choix de présentation ne reflète pas une véritable structuration de l'unité, le contour de ces
thèmes n'est évidemment pas étanche du fait même de nos ambitions pluridisciplinaires. C'est
pourquoi nous avons demandé une évaluation globale du projet d'unité.
4
En Novembre 2007, le colloque Changements Climatiques et Forêts Méditerranéennes organisé par l'association
Forêt Méditerranéenne a rassemblé de nombreux chercheurs et gestionnaires, français et étrangers, sur ce thème.
5
En Juin 2008 l'ensemble des gestionnaires de la Société Forestière de la Caisse des Dépôts et Consignation, premier
propriétaire forestier privé, sont venus voir les pratiques en cours dans la région méditerranéenne en terme de
sylvicultures adaptées à la sécheresse, de gestion de forêts mixtes en phase de maturation et de prévention des
incendies.
Bilan 4/39
Figure 1 : Le projet de l'URFM sur les dynamiques et le fonctionnement des
forêts méditerranéennes intègre trois grands thémes de recherche
Bilan 5/39Nos recherches font appel à des compétences multiples que l'on a classées selon trois grands domaines (Figure 2) : biologie des populations et évolution, écologie fonctionnelle et dynamique des communautés, physique et écologie du feu. La gestion des compétences scientifiques et techniques et la coordination des activités techniques sont réalisées dans chacun de ces domaines (voir chapitre 5). Il est nécessaire de rappeler ici l'originalité de la structure multidisciplinaire de l'unité, avec ses avantages et ses inconvénients. Du fait d'une masse critique limitée dans chaque discipline, les chercheurs doivent s'intégrer dans des réseaux spécialisés pour garder un niveau d'excellence dans leur domaine, tandis que l'interaction entre disciplines est trouvée au sein de l'unité (classiquement le schéma est inverse, avec des collaborations internes dans sa discipline et, éventuellement, des interactions avec d'autres disciplines au travers de collaborations externes). Il existe une masse critique minimale indispensable à la représentation d'une discipline dans l'unité. L'intégration entre les différentes disciplines de l'unité passe par une démarche de couplage entre processus, s'appuyant sur des approches complémentaires de modélisations (au sein d'une plateforme de modélisation facilitant le couplage de modèles) et d'expérimentations (sur des sites- ateliers partagés par les différentes disciplines). 2.2. Démarches pluridisciplinaires à l'URFM On distingue classiquement plusieurs niveaux d'intégration entre les disciplines, deux sont couramment pratiqués dans l'unité. La pluridisciplinarité (ou multidisciplinarité) fait co-exister le travail de plusieurs chercheurs aux compétences diverses sur un objet partagé, la complémentarité Bilan 6/39
entre les disciplines permettant de mieux comprendre ou modéliser le fonctionnement du système
étudié. Il s'agit souvent d'approches « hiérarchiques » où une discipline apporte à l'autre. C'est une
démarche fréquente dans notre projet :
− combiner physiologie et dynamique pour aborder l'effet des changements du climat sur les
changements de la dynamique;
− utiliser la connaissance de l'architecture des arbres pour modéliser le combustible puis la
propagation du feu;
− combiner les outils de la génétique inférentielle et la connaissance de la biologie des insectes
pour mieux caractériser la dynamique d'invasion de Megastigmus;
− combiner physique des écoulements turbulents et méthodes spatiales pour aborder la
dispersion des graines ou du pollen;...
A un niveau supérieur d'intégration, l'interdisciplinarité (ou métadisciplinarité), fait intervenir plus
d'échanges de connaissances et d'interactions qui enrichissent chacune des disciplines. Cela passe
souvent par le couplage de modèles. Un exemple caractéristique dans le projet de l'URFM est donné
par les modèles démo-génétiques : la dynamique des peuplements (croissance/compétition)
influence les processus de mortalité et reproduction qui déterminent la structure démographique
(densité), cette structure démographique impacte le système de reproduction et donc la qualité
génétique des graines qui en résultent, avec un effet retour de la qualité génétique (ex.
consanguinité) sur le potentiel de croissance. Cet exemple de rétro-action illustre l'intérêt pour le
modèle de dynamique d'intégrer l'effet de la qualité génétique (les prédictions changent quand le
potentiel de croissance n'est pas une constante) et l'intérêt pour le modèle génétique d'expliciter le
moteur de forces évolutives telles que la dérive ou la sélection (la structure du peuplement est un
facteur environnemental dont la dynamique est internalisée au système). Ce type de modèle démo-
génétique permet notamment d'accéder aux processus d'évolution dans des populations hors
d'équilibre ou des écosystèmes perturbés, comme sont beaucoup de forêts méditerranéennes.
Ces démarches s'appuient sur des collaborations internes entre chercheurs de l'unité. Les étudiants
doctorants peuvent être concernés par ces projets pluridisciplinaires : dans ce cas, nous cherchons
clairement à ancrer leur contribution dans une des disciplines concernées avec l'objectif de
développer des compétences fortes dans un domaine et une ouverture d'esprit à l'interdisciplinarité.
2.3. Partenariat scientifique international et national, écoles doctorales
Durant la période écoulée, les chercheurs de l'URFM se sont beaucoup investis dans les projets
internationaux, notamment européens (annexe 3 §2.5).
Au sein de ces projets, on trouve des collaborations particulièrement structurantes pour l'unité. La
collaboration avec le LANL est exemplaire de ce point de vue : en collaborant avec des équipes
spécialisées dans les modèles d'écoulement atmosphérique, nous avons contribué au développement
du modèle 3D de comportement du feu FIRETEC, cette collaboration nous a aussi permis d'accéder
à des moyens de calcul exceptionnels6, elle se renforce et s'étend sur de nouvelles thématiques
(couplage de modèles d'écoulement à grande échelle et de dispersion des graines). Dans le cadre du
Réseau d'Excellence EVOLTREE, une collaboration particulièrement étroite avec la plateforme de
biologie moléculaire du CNR de Florence nous a donné accès à des capacités de génotypages que
nous n'avions pas. Avec ces deux laboratoires, nous sommes actuellement engagés dans trois co-
directions de thèse.
Les collaborations se mesurent aussi en terme d'échanges de personnes : durant cette période, 17
6
Notre collègue R. Linn, responsable du groupe Atmospheric, Climate and Environmental Dynamics du LANL
évalue à un million d'heures CPU la contribution en temps de calcul que nous a alloué le LANL depuis le début de
nos collaborations !
Bilan 7/39doctorants, post-doctorants ou visiteurs ont séjourné au total plus de 10 équivalents années à
l'URFM, les doctorants, post-doctorants et chercheurs de l'unité faisant également des séjours à
l'étranger. Trente et une publications de rang A de l'unité (39%) ont des co-auteurs étrangers et nous
avons fait 13 communications orales invitées dans des colloques internationaux (voir chapitre 4).
Au plan national nous participons à quatre projets ANR, dont un que nous coordonnons, et plus de
20 projets nationaux ou régionaux (annexe 3 §2.6). Outre les projets de recherche, nos
collaborations avec les partenaires de la FR-ECCOREV (CEREGE, IMEP, CEMAGREF) se
concrétisent par l'acquisition d'équipements partagés (voir chapitre 5). En dehors de l'INRA
(département EFPA et pôle ACG du centre PACA) et de la FR-ECCOREV, nous avons des
collaborations régulières avec le Centre d'Ecologie Fonctionnelle et Evolutive (CEFE) de
Montpellier. Un autre réseau important pour l'unité est la communauté des modélisateurs travaillant
sur la plateforme CAPSIS7 : au-delà du partage d'outils de modélisation, cette plateforme,
originellement à l'initiative de Ph. Dreyfus et désormais coordonnée par F. de Coligny (AMAP,
Montpellier), est le support de collaborations transdisciplinaires entre équipes travaillant sur des
objets différents avec des questions partagées (par ex. modèles démo-génétiques chez les arbres et
les poissons).
Vis-à-vis des écoles doctorales, les chercheurs de l'unité se répartissent dans deux équipes d'accueil,
l'une rattachée à l'ED Sciences de l'Environnement (Aix-Marseille) l'autre rattachée à l'ED
SIBAGHE (Montpellier), ces deux écoles doctorales ayant des orientations complémentaires dans le
champ de l'écologie. Durant la période évaluée, l'université d'Avignon avait fait le choix de se
rattacher à l'ED SIBAGHE, cette politique est actuellement en révision. Nous avons participé à 45
h/an d'enseignement de niveau Master à Montpellier et Aix-Marseille, et 27 h/an de niveau Licence
sur Avignon. Nous avons également contribué à un module d'enseignement au Centre International
des Hautes Etudes Agronomiques Méditerranéennes (Sarragosse).
2.4. Partenariat non académique
Les partenaires non académiques de l'unité se situent non seulement au niveau national et au niveau
local, mais aussi au niveau international. Ce partenariat se concentre sur trois principaux domaines
d'application de nos recherches.
Dans le domaine de la conservation des ressources génétiques, l'unité anime la Commission
Nationale des Ressources Génétiques Forestières (CRGF8) qui regroupe, sous l'égide du ministère
en charge de l'agriculture, des représentants de la recherche, de la gestion des forêts publiques et
privées et du monde associatif pour définir la politique nationale dans le domaine. L'unité est très
active au sein du programme pan-européen EUFORGEN9 qui coordonne les activités de 31 pays
européens ainsi que du groupe de travail Ressources Génétiques du réseau FAO Silva
Mediterranea10. F. Lefèvre est membre du conseil scientifique de la Fondation pour la Recherche sur
la Biodiversité (FRB11) après avoir été membre du conseil scientifique du Bureau des Ressources
Génétiques (BRG). Les réalisations sont de différents ordres : publication de recommandations,
participation à des expertises collectives et documents de prospectives, production d'outils
opérationnels (annexe 3 §5'.3), d'outils pour la mise en oeuvre des programmes (annexe 3 §3.4/5.4),
préparation et gestion d'appels d'offre.
Dans le domaine des incendies de forêt l'unité contribue, depuis leur création à notre initiative, aux
7
http://capsis.cirad.fr/
8
http://agriculture.gouv.fr/conservation-des-ressources (F. Lefèvre président de la CRGF, B. Fady membre)
9
http://www.euforgen.org/ (F. Lefèvre coordonateur national, B. Fady animateur du réseau « conifères »)
10
http://www.fao.org/forestry/silvamed/fr/ et http://www.avignon.inra.fr/ForSilvaMed (C. Pichot a conçu et gère la
base de données ForSilvaMed, B. Fady et F. Lefèvre membres du groupe de travail)
11
http://www.fondationbiodiversite.fr/ (F. Lefèvre membre du conseil scientifique)
Bilan 8/39deux réseaux professionnels sur le brûlage dirigé et sur les coupures de combustible. Ce sont des
cercles privilégiés pour la restitution des nos résultats de recherche de projets nationaux et
européens. Ce dialogue avec les professionnels du feu a été étendu à l'échelle de l'Europe dans le
cadre du Projet Intégré FIRE PARADOX où des représentants des utilisateurs sont partenaires à
part entière du consortium (forestiers Sardes et portugais, pompiers catalans). La démarche finalisée
a permis de co-construire avec le utilisateurs des outils opérationnels comme l'éditeur de
combustible Fuel Manager [ACTI7] ou le simulateur de propagation du feu VESTA (annexe 3
§5.4.). Ce second logiciel a été réalisé en appui à l'Agence en environnement MTDA, partenaire
privilégié de l'unité de longue date. Enfin, le poste d'interface de F. Pimont sur la prévention des
incendies de forêt (2009-2011) a permis de consolider un autre partenariat important sur ce thème.
Dans le domaine de la sylviculture, le partenariat est local et national. Ph. Dreyfus a contribué à la
rédaction du Guide des sylvicultures de Montagne pour les Alpes du Sud françaises [OV2]. Nous
avons par ailleurs des relations très étroites avec l'Office National des Forêts (ONF) avec qui nous
avons co-construit plusieurs projets de recherche dont ils sont partenaires directs. Ces collaborations
concernent principalement les agences territoriales de l'ONF mais aussi l'échellon national. Lors de
la révision des plans d'aménagement des forêts où se situent nos sites d'étude, nous sommes
consultés par l'ONF.
4) Bilan global des réalisations
L'analyse quantitative de nos productions (détail en annexe 2) permet d'identifier 347 publications
dont un quart (89) est représenté par des productions scientifiques de rang A 12, soit 80 articles dans
des revues internationales ou nationales avec comité de lecture et neuf ouvrages scientifiques ou
chapitres de ces ouvrages (Figure 11). Si l'on regarde la distribution par grandes catégories : 26% de
nos productions sont des publications de rang A, 43% sont des contributions à des colloques (152
communications, ce qui est important), 14% sont des documents de diffusion des connaissances (50
documents comprenant notamment des guides techniques, des expertises et des études prospectives,
voir annexe 3), 9% sont des masters et thèses, 8% sont « autres » (catégorie essentiellement
constituée de livrables de projets européens dans lesquelles l'unité est très impliquée).
12
Pour l’AERES, une production scientifique de rang A est une publication dans une revue internationale avec comité
de lecture ou un chapitre d’ouvrage ou un ouvrage de recherche reconnu internationalement. Nous avons exclu de ce
décompte les publications de chercheurs contractuels ou d'étudiants correspondant à des travaux antérieurs à leur
venue à l'URFM, même s'ils sont affilés à notre unité sur ces articles, ainsi que les actes de colloques publiés dans
des ouvrages référencés sur le WoS, s'il n'ont pas fait l'objet d'une revue du texte intégral avec comité de lecture.
Bilan 9/3990
80
80
70
Nombre de publications 60 54 51
50
40 37 36
30 25 23
20 12 13
9
10 2 5
0
ACLN
INV
ACTN
TH
OV
AFF
ACTI
OS
AP
ACL
ASCL
COM
Type de publications
Figure 11 : Publications de l'unité selon la nomenclature AERES
4.1. Résultats vers le monde académique
La production académique de l'unité continue d'augmenter : 1,4 publications de rang A par an et par
DR-CR-IR, contre 1,1 pour la période précédente. La tendance se confirme en 2010 avec plus
d'articles et d'ouvrages publiés au cours des 6 premiers mois de l'année (25) que chacune des 4
années précédentes (Figure 12). Ce bon résultat en 2010 est notamment dû au nombre important
d'ouvrages et chapitres d'ouvrages de rang A produits avec les résultats du projet européen FIRE
PARADOX qui vient de s'achever. L'augmentation du nombre de publications devrait donc se
poursuivre en continuant les efforts entrepris, pour se situer à terme entre 20 et 25 publications par
an pour l'unité. Pour ce qui concerne les articles dans des revues internationales avec comité de
lecture (80 articles ACL), la production est de 1,1 article par an et par DR-CR-IR contre 0,8 pour la
période précédente.
30 25
Nombre de productions de rang A
25 20 Exceptionnelle
Nombre de publications
2 Excellente
20 Correcte
15 7 6
Acceptable
7
15 OS 1 Médiocre
10 5
ChOS 3 6 Non référencé
10
ACL
5 6 11 1 10
5 7
3
1 2
0 0 1 1
2006 2007 2008 2009 2010 2006 2007 2008 2009 2010
Années Années
Figure 12 : Évolution du nombre de Figure 13 : Évolution sur la période des notoriétés
publications de rang A (articles et moyennes des revues toutes disciplines confondues
Bilan 10/39ouvrages) sur la période (selon le référentiel de Désiré et al., 201013)
L'URFM est premier auteur de 48% de ces 80 publications. Notre important engagement partenarial
transparait par le très fort taux (90%) de co-publication avec des auteurs extérieurs à l'Unité. En
outre, 39% de nos publications ont des co-auteurs étrangers, ce qui témoigne de notre bonne
implication dans des coopérations internationales.
Les 80 articles de rang A ont été publiés dans 42 revues différentes à facteur d'impact, 8 d'entre elles
concentrent 40% de la production. L'essentiel de ces 80 articles est paru dans des revues de
notoriété correcte à excellente (Figure 13). Sur la base des quartiles calculés par ISI-Thompson, il
apparaît que la grande majorité de nos articles (64%) sont publiés dans des revues dont le facteur
d'impact est dans le premier quartile de la discipline et que la quasi totalité (91%) se trouve dans les
deux premiers quartiles. L'effort quantitatif fournit par l'unité pour augmenter le nombre de
publications de rang A s'accompagne donc aussi d'un effort qualitatif important qui devrait être
poursuivi et amplifié dans le futur. L'arrivée de jeunes chercheurs au sein de l'unité devrait aider à
aller dans ce sens.
Nous avons isolé le sous-ensemble des 70 publications de l'unité de rang A référencées par la
plateforme Web of Science à la date de ce rapport pour réaliser une analyse bibliographique
approfondie14. Cet échantillon exclus 10 articles actuellement « sous presse » ou « on line first ».
Sur le plan qualitatif, l'unité publie avant tout dans des revues relevant des sciences forestières et de
l'écologie, et ceci à parts égales (34%) (Figure 14). Ces deux champs disciplinaires sont complétés
par les domaines de la génétique et de l'évolution, de l'agronomie, de la conservation de la
biodiversité, de l'environnement et des sciences végétales. Si on compare avec le quadriennal
précédent, on note que les publications dans le domaine de l'écologie progresse encore puisque
l'unité publiait sur la période 2003-2006 majoritairement dans le domaine des sciences forestières
(38%), et l'écologie ne représentait que 22%, devant les sciences végétales (11%).
ECOLOGY 34% FRANCE 27%
FORESTRY 34% USA 17%
GENETICS & HEREDITY 19% SPAIN 16%
GERMANY 13%
EVOLUTIONARY BIOLOGY 17%
SWITZERLAND 10%
AGRONOMY 7%
ITALY 7%
BIODIVERSITY CONSERVATION 7%
CANADA 5%
ENVIRONMENTAL SCIENCES 7%
ENGLAND 5%
BIOCHEMISTRY & MOLECULAR BIOLOGY 6% AUSTRALIA 5%
PLANT SCIENCES 6% BELGIUM 4%
0% 10% 20% 30% 40% 0% 5% 10% 15% 20% 25% 30%
Figure 14 : Disciplines scientifiques des revues des Figure 15 : Pays d'origine des auteurs
publications de rang A de l'URFM citant les publications de l'URFM
Nos publications ont été citées 447 fois au total sur la période 2006-2010, le taux de citation moyen
par article étant de 6,39 et le h-index de 11 (11 articles sont cités au moins 11 fois). En excluant les
auto-citations, nos publications sont citées dans 347 articles qui se distribuent globalement en même
proportion dans les mêmes disciplines que celles dans lesquelles nous publions, avec toujours en
13
Désiré M., Magri MH., Solari A. 2010. Interprétation des facteurs d'impact du JCR Science Edition 2008 –
Référentiel de notoriétés 2008. pp220.
https://intranet.jouy.inra.fr/outils_scientifiques/information_scientifique_et_technique/notorietes_des_revues
14
Outil d'analyse bibliométrique en ligne du Web of Science
Bilan 11/39dominante les domaines des sciences forestières (32%) et de l'écologie (29%). Les premiers auteurs
de ces articles ne sont français que dans un peu plus d'un quart des cas (Figure 15), ce qui témoigne
d'un rayonnement international certain de nos travaux.
La contribution de l'unité à des colloques est importante, et représente en moyenne une trentaine de
communications par an. Il est à noter la part importante des communications invitées (25%) qui
témoigne de la notoriété des chercheurs de l'unité. Les chercheurs de l'unité se rendent
préférentiellement dans des colloques internationaux (72%). Enfin, 26% des communications font
l'objet de publications dans des actes (hors conférences invitées).
L'URFM a accueilli 26 Masters et 5 Thèses et 2 HDR ont été soutenues sur la période, ce qui porte
à 4 le nombre d'HDR dans l'unité pour 11 DR-CR 15. La distribution des encadrements d'étudiant
reste hétérogène d'une année sur l'autre en fonction des projets et des sujets en cours. L'unité
accueille actuellement 4 thèses dont deux sont en cours de finalisation.
Pendant la période, l'unité a accueilli 26 chercheurs en postdoc et CDD et autres visites d'au moins
une semaine, 17 étrangers et 9 français, certains étant venus plusieurs fois. Au total, cela représente
l'équivalent de 23 années ETP, à peu prêt également réparti en temps entre chercheurs français
(56%) et étranger (44%), ce qui est considérable et témoigne de l'attractivité de l'unité. Les
chercheurs étrangers accueillis dans l'unité, proviennent d'Europe (Espagne (3), Chypre, Finlande,
Serbie), du Maghreb (Tunisie (2), Algérie), de Russie et d'Amérique du Nord (USA (4) et Canada).
4.2. Résultats vers le monde socio-économique
L'Unité est en relation directe avec les gestionnaires des forêts publiques et privées et avec ceux des
espaces naturels. Nos productions vers le monde socio-économique comprennent d'abord la
construction de projets de recherche finalisés avec ces partenaires dans le cadre de structures
comme le GIS « Incendies de forêt » que l'URFM a animé pendant de nombreuses années, ou dans
le cadre du Réseau Mixte Technologique AFORCE « Adaptation des Forêts au Changement
Climatique », ou bien encore directement avec des grands opérateurs comme l'ONF (annexe 3
§4.1.). Les domaines d'application de ces productions sont la gestion forestière et la conservation
des ressources génétiques dans un contexte de changement climatique, ainsi que la prévention des
incendies de forêt. Des membres de l'unité participent à plusieurs instances de partenaires, y
compris des conseils scientifiques d'opérateurs de gestion. L'URFM fait un gros effort de transfert
de connaissances au travers d'articles dans des revues techniques et professionnelles (37) et par le
biais de guides techniques [OV2, OV11].
4.3. Résultats pour les pouvoirs publics
L'URFM produit des résultats pour les pouvoirs publics à l'échelon régional (régions PACA et
Languedoc-Roussillon), national (Ministères chargés de la Recherche, de l'Agriculture et de
l'Écologie) et international (Commission Européenne). Elle construit et anime des projets de
recherche-développement avec ces partenaires dans les domaines déjà évoqués, le plus souvent sous
l'angle de l'estimation des risques : incendie (risque journalier lié au stress hydrique de la
végétation), phytosanitaire (insectes ravageurs), santé public (allergie au pollen de cyprès), de
pollution génétique (peuplements de sapin ou de pin de Salzmann) (annexe 3 §4'.1.).
L'unité a contribué à quatre expertises scientifiques collectives et prospectives (Annexe 3 §6'.1)
contenant des recommandations aux instances publiques de niveau national ou européen. Ces
travaux concernent des sujets aussi divers que l'adaptation aux changements climatiques, la
15
Pour simplifier la présentation de ce bilan global, nous n'avons pas décomposé l'activité d'E. Klein entre notre projet
d'unité et celui de l'unité Biostatistiques et Processus Spatiaux (voir formulaire joint au rapport)
Bilan 12/39biodiversité, la conservation des ressources génétiques, la gestion intégrée du feu, le bois énergie [OV1, OV8, OV10]. 4.4. Résultats pour l'enseignement et la formation Comme évoqué précédemment, l'engagement de l'unité dans la formation par la recherche est forte avec 26 Masters encadrés et cinq thèses soutenues sur la période. Certains membres de l'unité interviennent dans des modules de Master qui parfois font l'objet de la rédaction d'ouvrages pédagogiques [OV12]. 4.5. Résultats relatifs à l'interaction avec la société L'URFM est particulièrement impliquée dans la diffusion de ces résultats au grand public au travers de conférences, manifestations, débats et nous répondons à de très nombreuses sollicitations venant des médias (annexe 3 §8.2). Les principaux sujets abordés sont l'impact des changements climatiques sur les écosystèmes forestiers méditerranéens et le rôle du feu dans la dynamique des forêts méditerranéennes. Il est à noter que les projets européens sont aussi l'occasion d'aller à la rencontre des médias au travers de conférences de presse, avec l'appui de services spécialisés en communication. A cet égard, le projet FIRE PARADOX comprenait comme partenaire l'Ecole de Communication et de Journalisme de Marseille. Par ailleurs, l'unité a collaboré à plusieurs reprises avec le service de communication de l'INRA Paris pour préparer des dossiers de presse, largement repris par les medias. Cette attitude pro active conduit à une communication mieux maitrisée. Bilan 13/39
5) Organisation et fonctionnement de l'unité en 2010 Bilan 14/39
5.1. Organigramme fonctionnel et gestion des compétences en 2010 Bilan 15/39
L'unité s'est réorganisée à la suite de la précédente évaluation. Nous sommes passés d'une structure
en cinq équipes disciplinaires à la définition d'un projet intégré faisant apparaître de façon explicite
les interactions entre disciplines. Pour renforcer cette intégration sur un schéma commun partagé,
nous avons également fait évoluer les modes d'animation scientifique avec la mise en place d'une
réunion scientifique mensuelle d'unité où sont traitées des questions d'intérêt général : analyse de
publications, coordination des réponses aux appels d'offre,... Le séminaire hebdomadaire du
vendredi, qui existait déjà auparavant, ouvert à l'ensemble du personnel (pas seulement
scientifique), ainsi que l'assemblée générale annuelle sur l'un des sites expérimentaux de l'unité en
forêt contribuent aussi fortement à cette intégration.
Parallèlement, comme cela a déjà été souligné, il est indispensable de maintenir le niveau des
compétences scientifiques et techniques dans chacune des disciplines. Nous avons donc défini trois
groupes correspondant aux trois domaines de compétences scientifiques et techniques mentionnés
au chapitre 2 (Figure 2, Figure 17). Les animateurs de ces groupes, assurent une animation
scientifique dans leur domaine (dont la forme est variable, les trois groupes n'ayant pas la même
dimension), une coordination des activités techniques « demandées » par les différents projets, ainsi
qu'une gestion prévisionnelle des compétences scientifiques et techniques dans le domaine.
L'organisation de la cellule SIG - Bases de données a été renforcée en y intégrant l'activité de
personnels de l'URFM et de l'Unité Expérimentale Forestière Méditerranéenne (UEFM) : la gestion
des compétences des agents URFM de cette cellule passe désormais par le CATI 16 Ecoinformatique
coordonné au niveau national par A. Bénard (INRA Nancy) et supervisé par C. Pichot dans le cadre
de sa mission Ecoinformatique pour la direction scientifique Environnement de l'INRA.
Un plan prévisionnel de formation est établi annuellement en lien avec la formation permanente de
l'INRA, pour les agents titulaires et non titulaires. D'autres actions de formation sont bien
évidemment envisagées en cours d'année.
Le conseil de service de l'unité, composé de membres élus et nommés pour deux ans, se réunit tous
les deux mois pour résoudre les différents aspects de la vie collective et assumer les missions
spécifiques qui lui sont confiées (par ex. avis sur les titularisations). Depuis 2010, le conseil de
service adopte un fonctionnement par groupes de travail ciblés sur quelques points particuliers, re-
discutés ensuite en séance pleinière.
5.2. Analyse des crédits obtenus et politique de financement
Dans le formulaire joint à ce rapport, la comparaison des ressources financières de l'unité entre
2008 et 2009 illustre l'importance mais aussi la fluctuation des crédits obtenus par l'unité. Nous
sommes très clairement dans un mode de fonctionnement de la recherche sur projet, plus de 25% du
budget de l'unité en tenant compte des salaires des titulaires (soit plus de 75% du budget hors
salaires des titulaires) est obtenu par réponse à appels à projets (les locaux devraient être ajoutés à
ces chiffres pour une analyse complète du budget de l'unité).
Nous avons choisi un mode de fonctionnement où chaque crédit obtenu par réponse à appel à projet
reste géré par le scientifique qui a obtenu le contrat. Cela permet d'assurer que les engagements pris
sont bien respectés et cela facilite la gestion administrative au moment des justifications notamment
(certains partenaires étant très exigeants à ce niveau). La subvention d'état ne permettant pas
d'assurer pleinement le « métabolisme de base » de l'unité17, nous faisons appel aux lignes non
16
Centre Automatisé de Traitement de l'Information
17
Le carburant et les réparations des véhicules, sans parler de renouvellement, représentent plus de 25% de la
subvention d'état et nous n'avons pas encore trouvé toutes les solutions comptables pratiques pour imputer ces coûts
directement sur les projets qui les utilisent
Bilan 16/39justifiées des contrats pour compléter le budget collectif prévisionnel annuel. Ce budget collectif,
discuté en début d'année en conseil de service, doit permettre d'assurer pleinement le métabolisme
de base, il comprend aussi une enveloppe d'incitation à la production scientifique destinée en
priorité à soutenir les frais éventuels de publication et les participations à des colloques à l'étranger
avec communication. Depuis deux ans, le département EFPA a mis en place une politique incitative
avec compléments de crédits liés aux publications des unités : la somme reçue par l'unité dans ce
cadre est mise dans l'enveloppe d'incitation à la production scientifique. Ce mode de
fonctionnement budgétaire est rendu possible par le bon esprit collectif de l'ensemble des
chercheurs de l'unité qui assurent une solidarité en cas de besoin.
5.3. Equipements utilisés et rôle dans leur développement
R. Huc s'est fortement investi depuis 2005 dans la coordination de l'installation et le pilotage du site
instrumenté de Fontblanche, dans le cadre de la FR-ECCOREV. Les équipes INRA, CNRS et
CEMAGREF travaillant sur ce site, qui comprend une tour à flux et six tours d'accès au couvert,
réalisent des mesures écophysiologiques, micrométéorologiques, dendrométriques, phénologiques
et minérales. Ce site s'intègre dans le réseau des Observatoires de Recherche en Environnement F-
ORE-T18. C'est le principal support expérimental des recherches sur le cycle de l'eau et le bilan de
carbone en forêt mélangée. Les collaborations avec le CEREGE, le CEFE, l'IMEP et le
CEMAGREF dans le cadre du projet ANR DROUGHT+ se sont appuyées sur cet équipement. Les
mesures prises sur ce site-atelier pin d'alep-chêne alimentent le modèle TREEGRASS.
Le développement des expérimentations sur le site du Mont Ventoux s'est poursuivi durant les
quatre dernières années. Cela représente pour l'URFM une véritable infrastructure expérimentale,
construite au fil du temps en partenariat avec l'ONF gestionnaire et les communes propriétaires des
lieux. C'est une infrastructure importante pour l'intégration des différentes disciplines ainsi que pour
le transfert auprès des partenaires non académiques. Ce site s'inscrit désormais dans le réseau de
sept Intensive Study Sites (ISS19) coordonné par l'URFM au sein du Réseau d'Excellence
EVOLTREE. Représentatifs des principaux types forestiers européens, ces sites étendus (quelques
milliers d'hectares) permettent d'étudier l'organisation et la dynamique de la biodiversité à plusieurs
niveaux d'organisation, du gène à la communauté (arbres, insectes, mycorhizes). L'unité a
développé pour ce réseau un système d'information, gestion des méta-données spatialisées et d'accès
aux données respectant la norme ISO1939 et la directive européenne INSPIRE. Le fonctionnement
du réseau des ISS est régi par un protocole d'accord signé par les 28 partenaires d'EVOLTREE et
valable jusqu'en 2016.
Pour gérer les données expérimentales ds sites ateliers, C. Pichot et la cellule SIG de l'URFM ont
mis en place un serveur de géomatique. Il s'est avéré que cela répondait à un besoin beaucoup
partagé par plusieurs unités du centre qui ont tout d'abord utilisé notre serveur pour leurs données.
Puis un projet inter-unités, et même inter-département, de création de plateau géomatique de centre
a été élaboré par les utilisateurs. Intégré au sein du pôle ACG, le plateau de géomatique a été
reconnu par la direction de l'INRA et vient d'être doté de moyens nouveaux.
En terme de biologie moléculaire, l'unité a choisi la stratégie de ne pas développer de laboratoire
propre mais de s'intégrer au Laboratoire de Biologie Moléculaire (LBM), plateau technique
regroupant les activités de quatre unités de recherche du centre INRA-PACA. L'URFM l'utilise pour
des opérations de génotypage à moyen débit. Ce laboratoire est situé à 4kms de nos locaux, mais les
avantages en terme de partage d'équipements, de compétences et d'expériences sont bien supérieurs
au petit inconvénient de l'éloignement. Ce plateau technique est régi par un comité d'utilisateur
18
http://www.gip-ecofor.org/f-ore-t/
19
http://www.evoltree.eu/index.php/iss
Bilan 17/39auquel participe A. Roig et par la réunion des directeurs d'unités concernés. B. Fady s'est investi dans le montage de projets pour l'achat de plusieurs équipements pour le LBM (séquenceur 96 capillaires MegaBace pour le génotypage à haut débit en 2008, séquenceur 48 capillaires ABI pour le génotypage et des séquençages ponctuels en 2010). Ces investissements ont été possibles grâce à notre lien avec la FR-ECCOREV : nos partenaires (CNRS IMEP) ont fait le choix de ne pas s'équiper en propre et de soutenir l'équipement du LBM pour venir y réaliser leurs propres génotypages : cela ne se limite pas à une prestation technique mais aussi à de véritables collaborations scientifiques. Dans le cadre du réseau EVOLTREE, la collaboration très étroite avec le CNR de Florence nous a permis d'accéder à de génotypage à plus haut débit. En plus de ces grands équipements partagés dont l'unité est pilote ou co-pilote, nous disposons de grands équipements plus spécifiques. La halle feu des Vignères, qui s’est développée dans les années 90, permet la réalisation de feux expérimentaux sur banc thermique avec une métrologie spécifique, en particulier l’étude de l’effet de pente sur la propagation du feu dans des litières. Ce laboratoire sert aujourd’hui de base pour préparer les feux de terrain (adaptations de l’acquisition et de l’instrumentation) et les mesures de biomasse et teneur en eau des échantillons (volumineux) de végétation collectés sur le terrain y sont également réalisées. Un phytotron et deux serres permettent d'appliquer des traitements liés à la sécheresse puis d’analyser des échanges gazeux en réponse à différent paramètres (CO2, VPD, éclairement, température). Compte tenu de l'importance de nos activités expérimentales en forêt, sur des sites de plus en plus concentrés mais néanmoins distants, le parc de véhicules de service est un équipement à part entière, souvent difficile à financer dans le cadre des contrats (tant à l'achat qu'à l'entretien). Nous avons mis en place une politique de renouvellement progressif du parc, depuis 2007 nous avons acheté quatre véhicules (le précédent achat datait de 2001). 5.4. Démarche qualité L'URFM est engagée dans une démarche qualité basée sur le système d'auto-évaluation mis en place à l'INRA. Pour mettre en oeuvre et suivre la démarche qualité de l'unité, nous avons constitué un groupe Qualité avec des représentants de chacun de nos domaines d'activité : expérimentation en forêt, biologie moléculaire et autres pratiques de laboratoire, métrologie, informatique, fonctions administratives. Ce groupe, animé par F. Courdier jusqu'en 2009 puis par D. Gounelle, est chargé de définir avec le directeur d'unité les actions prioritaires et de suivre leur mise en oeuvre. Il réalise également l'auto-évaluation qualité de l'unité. L'animateur de ce groupe est l'interlocuteur de l'unité auprès du département, du centre et de la Mission Qualité de l'INRA. Le groupe Qualité se réunit deux à trois fois par an. Ces réunions font l’objet d’un ordre du jour et d’un compte rendu. Des échanges réguliers par courrier électronique, des restitutions du travail du groupe lors des conseils de service ou dans le cadre des exposés hebdomadaires de l’unité permettent de mutualiser les avancées de chacun. La liste des actions dressées depuis 2004 fait l’objet d’une mise à jour et d’un bilan annuel pour redéfinir les objectifs à réaliser. L'utilisation du cahier de laboratoire est maintenant généralisée dans l'unité, y compris par les stagiaires. A titre d’illustration voici quelques actions marquantes, bénéficiant de l'appui du département dans le cadre de ses appels à proposition « Assurance Qualité ». La métrologie des balances mise en place par J. Maréchal a abouti après un inventaire précis du parc de balance au choix d’un prestataire de service. Depuis 2008, une vérification annuelle des balances est effectuée. L’unité a fait l’acquisition de masses de travail pour assurer un contrôle régulier des balances lors des campagnes de mesures. D’autre part, les agents de l’unité ont suivi une formation sur site à la métrologie des balances. Bilan 18/39
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