Coronavirus : Que nous a appris l'épidémie récente ? - B Guery, CHRU Lille
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Coronavirus : Que nous a appris l’épidémie récente ?
B Guery, CHRU Lille
13 Juin 2012 Homme, 60 ans Hôpital Privé de Jeddah Fièvre, toux, expectoration, et dyspnée Transfert en réanimation à J1 Décès à J11: SDRA et insuffisance rénale
Historique
Séquençage du nouveau
coronavirus réalisé en
Octobre 2012
Cas confirmés
Jordanie, Qatar, Arabie
Saoudite, Emirats Arabes
Angleterre, France, Allemagne,
Italie, Tunisie
Autriche …….
UK, Allemagne
France, Italie, Autriche…
Middle east
909 cas, 331 décès (36%)
Que nous a appris cette épidémie?
Virus
Histoire naturelle du virus
Technique de laboratoire
Emergence problématique majeure
Surveillance de l’émergence
Prise en charge thérapeutique
Caractère limité de l’arsenal thérapeutique
CRF international
Cout des infections émergentes
CORONAVIRUS
Isolé du poulet (1937)
Virus ARN monocaténaire
(27-32 kb)
100-150 nm
Projections membranaires
de 20 nm
Séquençage complet du génome et relation avec les autres coronavirus connus HCoV-EMC/ 2012 est un nouveau virus assez proche des coronavirus de la chauve souris et très différent du SARS-CoV.
14 chameaux prélevés le 17 octobre 2013
3 positifs par 3 méthodes RT-PCR indépendantes
Tous les chameaux avaient une réponse anticorps
Confirme une infection touchant l’homme et les chameaux mais ne peut
savoir qui est à l’origine ou si un 3ème acteur est impliqué.
Diagnostic viral Identification rapide des patients Gestion secteur hospitalier Enquête autour d’un cas
Que nous a appris cette épidémie?
Virus
Histoire naturelle du virus
Technique de laboratoire
Emergence problématique majeure
Surveillance de l’émergence
Prise en charge thérapeutique
Caractère limité de l’arsenal thérapeutique
CRF international
Cout des infections émergentesDiversité spécifique en agents infectieux
Que reste-t-il à découvrir ?
Présentation
Nombre cumulé d’espèces de virus
40-560 nouveaux virus
IRD
Institut de recherche
pour le développement
• établissement public à caractère
scientifique et technologique
Virus VIH (LAV)
(EPST)
Lentivirus (1983)
• placé sous la double tutelle des
ministères chargés de la Recherche
et de la Coopération
Virus Chigunkunya, Virus Monkeypox, Virus Ebola, Virus Hendra,
Togavirus (1956) Orthopoxvirus (1972) Filovirus (1976-7) Paramyxovirus (1994)Diversité spécifique en agents infectieux
Que reste-t-il à découvrir ? III -
Nombre cumulé d’espèces de virus
Nombre cumulé de familles de virusPrésentation
EID origins correlated with
Socio-economic,
Environmental
Ecological factors,
Emerging disease hotspots
Nature Vol 451| 21 February 2008Epizooties issues animaux sauvages Epizooties issues animaux domestiques
Pathogènes résistants aux drogues Pathogènes transmis par vecteurs
Nature Vol 451| 21 February 2008Imprévisibilité des émergences
Présentation
IRD
Institut de recherche
pour le développement
• établissement public à caractère
scientifique et technologique (EPST)
• placé sous la double tutelle des
ministères chargés de la Recherche
et de la CoopérationA timeline of major pandemics transmissible through the respiratory tract
1956
2014 2 billions de voyageurs/an
Mise en place de système de
surveillance
Promed
Global Public Health Intelligence Network
Système internet sécurisé identifiant toute source informelle
liée à de potentielles épidémies.
Plus de 60% des alertes initiales sont issues de sources non
officielles
Early Alert and Response System (EARS)www.healthmap.org
Collaboration internationale
Au décours du SARS, volonté affichée de
collaboration internationale en temps réelle
Investigation
Management
Virologie
Persistance de deux obstacles majeurs
Confiance entre les états
AnticipationConfiance
Délai entre la collaboration et le partage de données
(MERS)
Acceptation des publications
Partage de matériel virologique et biologique (brevets et
potentiels molécules en développement)
Supranational Reference Laboratory Network
Surveillance de la tuberculose MDR
Assure l’accès à des laboratoires avec un haut niveau de
sécurité dans l’ensemble des régions OMSAnticipation
Eviter le « saut d’espèce » Fièvre de la vallée du Rift
plutôt que d’en payer les Barrage d’Assouan (1970)
conséquences pullulation des moustiques
Coopération entre (Aedes, Culex, Mansonia),
épidémiologie animale et et de certaines mouches
humaine (simulies, culoïdes)
Connaissance des concentrations humaines et
écosystèmes animales favorisant les
Modification induites par contaminations.
l’homme 200 000 infectés, 600 DC
Produits alimentaires issus Barrage de Diama (1987)
de l’animal
224 victimes.
Rôle du commerceQue nous a appris cette épidémie?
Virus
Histoire naturelle du virus
Technique de laboratoire
Emergence problématique majeure
Surveillance de l’émergence
Prise en charge thérapeutique
Caractère limité de l’arsenal thérapeutique
CRF international
Cout des infections émergentes8422 cas, 916 décès (11%)
Thérapeutique
Techniques de
screening haut
débitL’utilisation de ces CRF permettra une harmonisation des méthodes de collection des échantillons, des définitions, des objectifs avec une standardisation permettant l’optimisation de l’exploitation
Que nous a appris cette épidémie?
Virus
Histoire naturelle du virus
Technique de laboratoire
Emergence problématique majeure
Surveillance de l’émergence
Prise en charge thérapeutique
Caractère limité de l’arsenal thérapeutique
Cout des infections émergentesCout des infections émergentes
80 billions de US$Cout des infections émergentes
UK H1N1 Influenzae
1.8 billion $
Dont 675 million $ achat oseltamivir et zanamivir
USA H1N1 Influenzae
1.3 billion $ achat oseltamivir et zanamivirConclusion Anticipation Nécessité de travailler en interpandémique Communication en temps réel Planification internationale & nationale Eveil de la communauté médicale et infectiologique Systèmes d’alerte sensibles mais les plus spécifiques possibles Réponse coordonnée et rapide
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