FORMATION SCIENCES HALIEUTIQUES ET AQUACOLE - Promotion 2021 Présentation des mémoires de fin d'études - Agrocampus Ouest
←
→
Transcription du contenu de la page
Si votre navigateur ne rend pas la page correctement, lisez s'il vous plaît le contenu de la page ci-dessous
Pôle halieutique
FORMATION SCIENCES HALIEUTIQUES ET AQUACOLE
Promotion 2021
Présentation des mémoires de fin d’études
Calendriers des soutenances (14, 15, 16 et 17 septembre)
Bienvenue
1. Présentation et organisation de la formation, en quelques mots 3
2. Présentation des sujets et résumés par option 4
• Aquaculture 4
• Gestion des pêches et des écosystèmes continentaux et côtiers 11
• Production et valorisation halieutique 16
• Ressources et écosystèmes aquatiques 18
3. Calendrier des soutenances 23
2La spécialisation en halieutique a pour objectif de former les cadres du secteur de la pêche et de
l’aquaculture, dans l'optique d'une pêche responsable, d'une aquaculture durable, d'une gestion
intégrée des zones côtières et des milieux aquatiques.
Il s'agit d'une formation pluridisciplinaire, qui a pour objet de fournir les bases nécessaires à la
compréhension :
• de la dynamique des ressources vivantes et des écosystèmes aquatiques,
• du fonctionnement des systèmes d'exploitation, de l’amont à l’aval des filières.
Après un enseignement théorique, les étudiants poursuivent leur formation par un stage de fin
d’études qui se conclut par la rédaction d’un mémoire basé sur un travail d’ingénieur, une étude
approfondie d’une problématique.
Le stage fait également l’objet d’une soutenance orale et d’une discussion/évaluation devant un
jury. Cette soutenance est généralement publique. Y assister est souvent une bonne occasion de
s’informer sur une problématique d’actualité et ses derniers développements.
Vous êtes cordialement conviés à y participer.
NB : Les soutenances signalées en CONFIDENTIELLE ne sont pas ouvertes au public et les
soutenances indiquées RESTREINTES ne sont ouvertes qu’aux étudiants.
3Sujets et résumés par option
AQUACULTURE (AQUA)
Amélioration des protocoles de la chaîne de production des embryons de truites arc-en-ciel
de Viviers de Sarrance et rédaction d’un guide des bonnes pratiques pour répertorier
l’ensemble des protocoles de production, par Victor BAILHACHE, le 15 septembre à 10h30.
Résumé : Viviers de Sarrance (64) produit annuellement 120 millions d’embryons de truite arc-
en-ciel dont une bonne partie est exportée internationalement. Dans la chaîne de production,
des défauts de protocoles ont été détectés et entraînent une variabilité de la qualité des
embryons produits. Ce rapport traite de la façon dont la résolution de ces problèmes a été
envisagée et menée pendant le stage. La résolution est passée par deux axes de travail
distincts : l’amélioration des protocoles défectueux et considérés comme prioritaires puis la
rédaction d’un guide des bonnes pratiques qui répertorie tous les protocoles de la chaîne de
production.
Intérêt potentiel de nouvelles techniques d'élevage ostréicole : approche zootechnique,
biologique et socio-économique (Programme NOUSYSTOS), par Virgile BASUYAU, 15
septembre à 10h30.
Résumé : Depuis quelques années, la filière ostréicole voit l’émergence de nouveaux systèmes
d’élevage, visant à optimiser les rendements par rapport au modèle de production classique : la
culture en poche en surélévation sur table. Le programme Nousystos teste la rentabilité
économique de systèmes pendulaires australiens, de poches XXL et de poches mobiles à
flotteurs. Sont suivis : la croissance, la survie, les indices de longueur et de forme et le taux de
chair des lots en fin de cycle, sur deux parcs de productivité différente. Ces tests portent sur les
phases de pré-grossissement et de grossissement. Le rendement d'élevage des différents
systèmes et la qualité de la production permet le calcul du rendement économique pour
chaque structure testée. L'expérimentation montre que les nouveaux systèmes (plus onéreux)
permettent une économie sur les interventions humaines particulièrement pour le pré-
grossissement, et une valeur plus importante de la production en grossissement, sous réserve
de valorisation. Le programme Nousystos s'étend de mars à octobre 2021 : les résultats
présentés dans ce rapport sont donc provisoires. Le calcul de la rentabilité économique ne sera
fait que pour les lots ayant terminé leur cycle.
4Etude de l’alimentation et du comportement des holothuries Holothuria forskali et
Parastichopus regalis, par Benoit BERLIZOT, le 16 septembre à 10h30.
Résumé : Face à l’effondrement des stocks d’holothuries en Asie et au début du déclin des
stocks européens, il est nécessaire de développer l’aquaculture d’holothuries en Europe.
Holothuria forskali et Parastichopus regalis sont des espèces potentiellement éligibles à une
aquaculture européenne. Les connaissances sur ces espèces sont très réduites, et l’étude de
leur alimentation est nécessaire afin d’adapter les protocoles et techniques d’élevage sur ces
espèces.
Influence de la teneur en mercure et sélénium de l’aliment sur la régulation des fonctions
anti-oxydantes, des processus d’inflammation et de détoxication chez la truite arc-en-ciel
(Oncorhynchus mykiss), par Axelle BRAUN, le 15 septembre à 14h00.
Résumé : L’objectif de cette étude était de mieux comprendre les interactions entre le
sélénium et le mercure chez la truite arc-en-ciel (Oncorhynchus mykiss) afin d’évaluer la
possibilité de substituer les farines et huiles de poissons dans les aliments aquacoles par des
coproduits de thon. Le travail s’est focalisé sur un essai nutritionnel de 6 mois avec différents
régimes expérimentaux plus ou moins supplémentés en mercure et en sélénium. Un suivi des
paramètres zootechniques, la réalisation de PCR quantitatives ciblant des gènes spécifiques et
des tests biochimiques ont été réalisés sur les juvéniles nourris avec les différents régimes.
Enfin, l’effet de la teneur en sélénium et en mercure dans le régime alimentaire sur la
croissance, le développement et le métabolisme des juvéniles a été étudié.
An assistant tool to design new aquaculture productions based on species abiotic
requirements, par Grégoire BUTRUILLE, le 15 septembre à 8h30.
Résumé : Producing new species and promoting polyculture can enhance aquaculture
sustainability. This implies to highlight an already available farming system that
suits the species ecological requirements or to design a new one from scratch.
Our tool (R package and script) provides useful pieces of information to develop
indoor and outdoor freshwater aquacultures by considering species ecological
niches. Using the large amount of biogeographic and abiotic information available
in public databases to provide initial guidelines to start new production allows us
to propose a pragmatic and operational tool even for species for which
physiological requirements are still unknown such as currently non-produced
species. Overall, we argue that the assistant tool can act as a stepping stone to
promote new aquatic productions which are required to enhance aquaculture
sustainability.
5Modélisation dynamique des flux d’azote et phosphore d’un système d’élevage en
aquaculture multi-trophique intégrée, par CHAMBERON Ines, le 14 septembre à 16h00.
Résumé : A partir d’une expérience d’élevage en aquaculture multi-trophique intégrée (AMTI)
réalisée en claires ostréicoles, un modèle dynamique du devenir de l’azote et du phosphore a
été construit avec le logiciel Stella. Ces deux éléments sont des nutriments essentiels des
quatre espèces élevées dans ce système : daurade royale, crevette impériale, huître et
palourde. L’objectif de ce modèle est de montrer les interactions entre les espèces et les
performances environnementales des AMTI de manière générale.
Les pratiques agroécologiques dans les étangs à vocation piscicole : approche comparative de
trois scénarios de polyculture, par Jésabel LAITHIER, le 17 septembre à 8h30.
Résumé : Un agro-écosystème est composé de deux volets bien distincts : le système
écologique et le système socio-économique. C’est la jonction entre ces deux systèmes qui
forme l’agro-écosystème. Les pratiques piscicoles et plus particulièrement les pratiques
d'empoissonnement qu'ont les gérants des étangs peuvent faire pression tel un levier sur
l’agro-écosystème. En effet, la combinaison de différentes espèces introduites dans un étang en
polyculture est un levier important sur lequel les gérants peuvent agir. Pour comprendre
l'ampleur et l'intérêt du choix des espèces introduites, une étude comparative de trois
approches de polyculture a été réalisée dans des systèmes de production en étang. Ici, l'objectif
est de comprendre comment différents paramètres évoluent et peuvent influencer l’agro-
écosystème étang au travers d’une pratique de gestion comme le choix de l’association entre
plusieurs espèces en polyculture.
Evaluation multicritère et analyse de la durabilité des exploitations aquacoles, par Quentin
LATOURRE, le 17 septembre à 10h30.
Résumé : L’INRAE est impliquée dans le projet européen SIMTAP (Self-sufficient Integrated
Multi Trophic AquaPonics), qui a pour objectif d’étudier l’aquaculture dans la zone
méditerranéenne, notamment les systèmes d’Aquaculture Multi Trophique Intégré (AMTI), et
son rôle est d’analyser la durabilité des exploitations aquacoles. Ce stage se concentre sur
l’étude de la durabilité de deux exploitations (une polyculture d’élevage et un système AMTI du
projet) par une méthode d’Evaluation Multi Critère (EMC) et une Analyse du Cycle de Vie (ACV),
afin d’identifier les points faibles et les points forts de la durabilité de ces exploitations. Cette
analyse utilise un modèle DEXi, qui permet de réaliser l’EMC, et qui nécessite de créer un arbre
de décision alimenté par de nombreuses données, qu’elles soient économiques,
environnementales ou sociales, récoltées par des enquêtes auprès des aquaculteurs.
6Maternal contribution of the auts2 gene to neurodevelopment in medaka (Oryzias latipes),
par Constance MERDRIGNAC, le 15 septembre à 16h00.
Résumé : The AUTS2 gene is involved in central nervous system establishment and various
neurodevelopment disorders including autism spectrum disorders, schizophrenia, development
delay and brain malformations. In rainbow trout (Oncorhynchus mykiss), dysregulation of the
maternal expression of several neurodevelopment genes, including auts2, is associated with
developmental, emotional, and cognitive impairments. In this context, current research aims at
studying maternal auts2 contribution to neurodevelopment and behavioural phenotypes in a
model fish species, the medaka (Oryzias latipes). Within this project, the aim of my internship
was (i) to select markers of neurodevelopment, (ii) to develop a state-of-the-art method to
localise auts2 expression in early stages of medaka embryonic development, in order to (iii)
molecularly phenotype medaka neurodevelopment in presence of absence of maternal auts2
contribution.
Evaluation des effets potentiels des métaux libérés par les anodes galvaniques sur
l’ormeau Haliotis tuberculata, par Laureen NIVELAIS, le 16 septembre à 16h00.
Résumé : Les anodes galvaniques sont largement utilisées sur les infrastructures maritimes afin
de les protéger de la corrosion. Ces dernières sont constituées d’alliage à base d’aluminium
ou de zinc et vont s’oxyder à la place de l’acier à protéger. La quantité totale d’anode
présente sur l’ensemble des infrastructures maritimes est estimée à 5039,7 T. Au cours de la
dégradation de l’anode, des métaux sont libérés dans l’environnement pouvant entrainer des
effets toxiques sur le vivant. Une évaluation du risque de toxicité pour l’ormeau Haliotis
tuberculata a été réalisée à partir de la méthode REACH. Des effets sur la croissance sont
visibles dès une concentration moyenne en aluminium de 457.8 ± 86.8 μg.L-1. Cette
concentration est supérieure à celle estimée dans le milieu naturel, les produits de
dégradation des anodes ne semblent pas présenter de risque pour l’ormeau.
Élaboration d’un guide de bonne pratique pour l’élevage d’une crevette tropicale d’eau
douce, Macrobrachium rosenbergii, en zone tempérée, par Martin QUERO, le 16 septembre à
8h30.
Résumé : Macrobrachium rosenbergii est une crevette tropicale qui est actuellement peu
cultivée en Europe. Cela est dû à des conditions de survie particulières car cette espèce ne peut
vivre que dans des eaux chaudes. Dans le Sud de la France, cela correspond à une courte
période de 4 à 5 mois. Ce mémoire met en avant les pratiques nécessaires à l’élevage de cette
crevette ainsi que les contraintes et les problèmes lors de son élevage en zone tempérée.
7Influence des paramètres physico-chimiques de l’eau sur la qualité morphologique et
radiologique des alevins de daurade royale (Sparus aurata) élevés en circuits recirculés, par
Adeline ROBIN, le 16 septembre à 10h30. Soutenance à Huis clos
Résumé : Ecloserie de daurades royales (Sparus aurata) depuis plus de vingt ans, la Ferme
Marine du Douhet, devenue récemment les Fermes Marines du Soleil, travaille sur
l’amélioration de la qualité d’eau de ses systèmes fonctionnant en recirculation.Ce projet de fin
d’études fait partie intégrante d’un projet ambitieux de plusieurs années visant à optimiser la
qualité des alevins. Après avoir rédigé un état de l’art sur les valeurs seuils actualisées des
paramètres physico-chimiques de l’eau à respecter pour assurer une bonne qualité des alevins,
l’objectif du projet est d'étudier l’ajustement de ces paramètres pour permettre une meilleure
qualité morphologique et radiologique des alevins de daurades royales.
Optimisation des pratiques d’élevage sur le naissain d’ormeau européen (Haliotis
tuberculata), par Natacha RUBINSTEIN, le 16 septembre à 14h00.
Résumé : Différentes voies d’amélioration des pratiques d’élevage du naissain d’ormeau
européen (Haliotis tuberculata) ont été étudiées. L’étude s’est focalisée sur 3 éléments-clés de
l’élevage en nurserie en cherchant l’optimisation de la fixation, de la croissance et de la survie
du naissain d’ormeau. Les différents facteurs (biotiques et abiotiques) influençant la croissance
et la survie du naissain durant cette période ont été étudiés. L’impact de la densité
immédiatement après la fixation en nurserie a également fait l’objet d’expérimentation
adapter au mieux les pratiques d’élevage.
Enfin, un travail sur la fertilisation des cultures d’algues a été conduit pour améliorer le taux de
protéines d’Ulvella lens qui conditionne la croissance initiale des ormeaux.
Etude de l’écosystème bactérien du sédiment d’une ferme d’élevage de Arenicola marina, par
Nicolas SCHLICK, le 17 septembre à 10h30. Soutenance à Huis clos
Résumé : La Ferme Marine de Noirmoutier produit des arénicoles (Arenicola marina) pour
Hemarina. Hemarina utilise l’hémoglobine de ces vers pour différentes applications
biomédicales : préservation de greffons, transporteurs d’oxygène thérapeutiques, pansements
oxygénants... Les arénicoles sont élevées en bassins, en circuit ouvert, dans une couche de
sable d’environ 30 à 50cm. L’écosystème bactérien du sédiment peut influencer les
performances zootechniques des polychètes en élevage. Au cours de cette étude, différents
paramètres environnementaux ont été mesurés (quantité de matière organique, type de
matière organique, granulométrie du sédiment, profondeur de la couche oxique) et la
composition bactérienne du sédiment de plusieurs bassins, ainsi que la diversité fonctionnelle
de l’écosystème bactérien. Ces analyses ont permis de mettre en évidence des différences de
composition bactériennes entre les bassins et avec le milieu naturel. Les paramètres
8environnementaux ont permis d’expliquer ces différences. Certains ordres (Flavobacterales
notamment) sont largement présents dans les bassins, alors que d’autres (Desulfobacterales
Desulfobulbales) sont largement absentes. Des hypothèses ont été émises quant aux bactéries
les plus profitables pour les arénicoles, ainsi que la manière d’optimiser les conditions
environnementales pour accroître leur développement.
Etude des facteurs de production et des paramètres d'élevage en circuit recirculé permettant
d'obtenir une truite arc-en-ciel (Oncorhynchus mykiss) dont la qualité organoleptique et
technologique répond à la demande du marché, par Eugénie TARDIEU, le 14 septembre à
16h00.
Résumé : La ferme urbaine aquaponique BIGH à Bruxelles élève en circuit recirculé des truites
arc-en-ciel (Oncorhynchus mykiss) depuis décembre 2020. L’enjeu pour cet élevage qui a
démarré récemment est de produire efficacement, à moindre coût et pour une consommation
en eau et en pigments restreinte, une truite saumonée de bonne qualité technologique et dont
la qualité organoleptique satisfait la demande du marché. Une étude de l’effet de certains
paramètres d’élevages sur l’épuration du goût de vase et la coloration de la chair est réalisée
afin de répondre à cet enjeu. Celle-ci est mise en parallèle avec les résultats d’une enquête
traduisant les préférences des consommateurs bruxellois potentiels.
Recherche de variants génétiques et analyses transcriptomiques chez la truite arc-en-
ciel : Application à la Septicémie Hémorragique Virale, par Valentin THOMAS, le 17 septembre
à 14h00.
Résumé : La septicémie hémorragique virale (SHV) est une maladie à déclaration en France
et des lignées isogéniques de truites élevées par INRAE présentent des phénotypes contrastés
de résistance à cette maladie. Le but principal est de détecter les mécanismes liés à la
résistance à la SHV. Un QTL lié à la résistance a été précédemment détecté ; c’est pourquoi
les analyses du stage ont été focalisées sur cette zone. Le premier objectif a été de créer un
catalogue de SNP des 19 lignées isogéniques afin de répertorier les SNP aux génotypes
contrastés entre lignées résistantes et sensibles. Le second objectif a été de faire une analyse
transcriptomique d’une lignée sensible et d’une lignée résistante après un challenge
pathologique afin de détecter les gènes différentiellement exprimés après une infection
expérimentale.
9Etude de faisabilité d’un élevage du ver tube Diopatra biscayensis, par Laura VASSEUR, le 14
septembre à 14h00.
Résumé : L’espèce de ver tube Diopatra biscayensis, majoritaire en Charente-Maritime, est une
ressource exploitée par quelques pêcheurs à pied professionnels et vendue comme appât pour
la pêche de loisir. Pour pallier à la demande et développer de nouvelles opportunités
d’exploitation (pénéiculture, nouvelles molécules d’intérêt), ce travail a pour objectif d’évaluer
les premières solutions zootechniques pour l’élevage de cette espèce. Les conditions favorables
ont été étudiées pour induire leur reproduction (accélération de la maturation des gamètes,
déclenchement de la ponte) et optimiser la croissance de cet organisme (sédiment oxygéné ou
non, élevage en système clos et en claire ostréicole). Ces premiers résultats sont encourageants
pour le développement de ce nouveau type d’élevage.
10GESTION DES PECHES ET DES ECOSYSTEMES CONTINENTAUX
ET COTIERS (GPECC)
Analyse rétrospective des adaptations de la conchyliculture en baie des Veys face aux
contraintes environnementales, économiques et institutionnelles, par Nathan BOUGUET, le 16
septembre à 14h00.
Résumé : Installée à la fin des années 1960, la conchyliculture en baie des Veys est reconnue au
niveau national pour son potentiel de production. L’essor de cette activité a été marqué par
une succession de difficultés et crises liées à l’état du milieu naturel : classement sanitaire
insalubre, limitation de la productivité et épisodes de mortalité massive. Les professionnels ont
évolué dans un cadre réglementaire renforcé tout en essayant d’assurer la rentabilité de leur
entreprise. Après une phase d’identification détaillée de ces évènements, des entretiens ont
été menés auprès des professionnels afin de comprendre les stratégies d’adaptation qu’ils ont
mises en place et le rôle de ces changements technico-économiques dans la trajectoire de la
conchyliculture en baie des Veys.
Etude des pontes de seiches et de calmars sur les engins de pêche de la baie d’Aigues-Mortes
dans le cadre du projet InOvo, par Judith CLERC, le 16 septembre à 10h30.
Résumé : Le projet InOvo a pour objectif la création de structure de ponte pour les seiches et
les calmars, utilisables en autonomie par les pêcheurs professionnels. Des enquêtes par
questionnaire ont été réalisées auprès des professionnels de la pêche exerçant sur les sites
Natura 2000 du Parc Naturel Régional de Camargue. Leurs objectifs sont d’affiner les modalités
de mise à l’eau des structures et de définir le devenir des œufs pondus sur les engins de pêche.
Evaluation du DLAL FEAMP 2014-2020 pour le Pays de Cornouaille, par Marthe DE CHERADE
DE MONTBRON, le 14 septembre à 14h00.
Résumé : Le programme de développement local par les acteurs locaux (DLAL) financé par le
Fonds Européen pour la pêche et l’aquaculture (FEAMP) et mené entre 2014 et 2020, a pour
objectif de soutenir le développement durable de la pêche et de l’aquaculture à l’échelle locale.
Il a été déployé sur l’ensemble du littoral breton pendant la programmation 2014-2020 du
FEAMP, et dans le pays de Cornouaille en particulier, vingt-cinq projets ont pu être
accompagnés et financés. En fin de programmation, l’évaluation menée lors de ce stage permet
de faire le point sur les actions menées et leur impact sur le territoire du pays de Cornouaille, et
d’y porter un regard critique, afin de préparer au mieux la candidature suivante.
11Analyse de l’activité des flottilles de pêche et des mesures d’accompagnement dans le cadre
de la crise sanitaire liée à la COVID-19 : exemple de la France et comparaison Européenne, par
Camille DUBRANA, le 17 septembre à 14h00.
Résumé : Le mémoire s’inscrit dans le cadre d’un programme de recherche (COPECO) dont
l’objectif est d’évaluer les impacts de la crise sanitaire liée à la COVID-19 sur les filières des
produits de la mer (PDM) en France. Le travail a porté spécifiquement sur l’identification et la
comparaison des différentes mesures d’accompagnement mises en œuvre à l’échelle
européenne et nationale pour atténuer les effets de la crise sur les flottilles de pêche. Un focus
a été réalisé sur l’indemnisation aux arrêts temporaires d’activité mis en œuvre dans le cadre
du Fond Européen pour les Affaires Maritimes et la Pêche (FEAMP). D’autre part, on a cherché
à identifier les anomalies d’activité des navires de pêche en analysant la distribution de jours de
mer pour notamment caractériser les périodes d’arrêts liés à la crise sanitaire. Enfin, une
analyse préliminaire des aides allouées dans le cadre du FEAMP a été réalisée.
La pêche à la senne du thon albacore en Océan Indien : Quelles données pour quelle gestion ?
par Bastien GRASSET, le 17 septembre à 14h00. Soutenance restreinte
Résumé : Le quota de thon albacore de l'Océan Indien a été fixé en 2017 à 29 501 tonnes. Les
12 navires Français actifs dans la zone se partagent ce quota en pêchant tout au long de l'année
et en transmettant les données de capture à la Direction des Pêches Maritimes et de
l'Aquaculture. Ces données ont une fiabilité inégale entravant le suivi de ce quota à tous les
niveaux (français, européen, régional). Afin de pérenniser l'activité halieutique et de répondre
aux contraintes réglementaires, le stage a pour but de mettre en place un modèle de suivi de
quota du thon albacore dans la zone. Il permettra également de proposer des mesures de
gestion à court et à long terme afin d'endiguer le problème de la fiabilité inégale de la donnée.
Identification de zones de moindre contrainte pour l’implantation de parcs éoliens offshore
flottants : une approche par la sensibilité des activités maritimes appliquée à la ferme pilote
de Groix & Belle-Île, par Clara JARRY-LEVY, le 16 septembre à 16h00.
Résumé : Le mémoire vise à fournir une analyse spatialisée des activités maritimes (transport
de passagers et de marchandises, activités nautiques, pêche professionnelle) présentes en
Bretagne sud dans le cadre d’un projet de parc éolien offshore flottant (PEOF). L’objectif du
travail est double ; il s’agit d’étudier, d’une part, les interactions spatio-temporelles entre les
activités maritimes à l’échelle saisonnière en amont de l’implantation du parc. D’autre part, il
est question d’élaborer et de mettre en application une démarche méthodologique destinée à
évaluer la sensibilité de ces activités au regard d’un tel projet. La représentation cartographique
de la sensibilité doit permettre d’identifier des zones de moindre contrainte pour l’éventuelle
implantation future de PEOF.
12Implication des pêcheurs professionnels dans la gestion des ressources halieutiques :
exemple du projet de soutien à la population de seiche commune (Sepia officinalis) dans les
pertuis charentais, par Salomé KHATIB, le 16 septembre à 8h30.
Résumé : La seiche commune (Sepia officinalis) est une espèce phare exploitée par une grande
diversité d’engins en Charente- Maritime. La diminution récente et progressive des
débarquements, et la volonté des pêcheurs de s’engager dans des programmes de pêche
durable ont fait émerger ce projet de soutien à la population de seiche par un soutien à sa
reproduction et au recrutement, avec l’appui du comité départemental des pêches de Charente
– Maritime.
Ce projet est divisé en 2 axes distincts : la multiplication de supports de pontes adaptés
dans des zones immergées entre l’île de Ré, La Rochelle et l’île d’Oléron ; et la mise en
incubation dans des paniers ostréicoles d'œufs de seiches pondus sur des engins de pêche
dormants (casiers et filets).
Les objectifs de ce projet sont de suivre le développement des œufs avec ces différents
dispositifs afin de déterminer les conditions environnementales et le matériel les plus adaptés
pour maximiser le taux d’éclosion mais également pour faciliter la mise en place d’une gestion
en autonomie par les professionnels.
Analyse de la performance de l’Accord relatif aux Pêches dans le sud de l’Océan Indien et de
la gestion de ses stocks cibles : le béryx (Beryx spp.), la légine (Dissostichus spp.) et
l'hoplostète orange (Hoplostethus spp.), par Thibault PIVETTA, le 16 septembre à 8h30.
Résumé : Ce rapport rend compte des performances d’une ORGP récente, l’Accord relatif aux
Pêches dans le Sud de l’Océan Indien (APSOI) dans sa zone de compétence. Sur la base de
précédentes évaluations d’autres ORGP, des indicateurs de performance seront synthétisés.
Ces derniers, en comparaison avec les résultats d’autres ORGP permettront de rendre compte
de l’état global de son fonctionnement, intrinsèquement lié à ses performances. Dans un
second temps, cette étude évaluera les Mesures de Conservation et de Gestion actuelles
associées aux stocks de trois espèces cibles sous sa compétence : le béryx (Beryx spp.), la légine
(Dissostichus spp.) et l'hoplostète orange (Hoplostethus spp.).
Etude de l’impact socio-économique du cantonnement de pêche Nord-Adour, par Rémy
PORTE, le 15 septembre à 16h00.
Résumé : Depuis des années, la préoccupation quant aux espèces migratrices est devenue, en
France, une question centrale dans la gestion des espèces halieutiques en danger. Des
recherches ont mis en évidence l’impact certain mais non mesuré des filets calés sur la côte au
nord de l’estuaire de l’Adour dans les prises accidentelles de salmonidés. C’est ainsi, en 2015, et
avec force de proposition, que le CRPMEM a voté la mise en place d’une mesure de restriction
de pêche au niveau de la côte au nord de l’estuaire de l ’Adour. En parallèle, les professionnels
13exprimaient la volonté de mesurer les impacts de ce cantonnement. Ainsi la question de cet
impact notamment socio-économique s’est posée dans le volet 1 du projet connaissance des
Migrateurs en Mer porté par le Centre Aquaculture Pêche Environnement en Nouvelle-
Aquitaine.
Marquage des engins de pêche en mer et usages de loisirs : Etat des lieux des interactions et
définition de solutions adaptées dans le Parc naturel marin du Golfe du Lion, par Hugo PRUAL,
le 17 septembre à 10h30.
Résumé : En Occitanie, au sein du Parc naturel marin du golfe du Lion, de nombreuses activités
et usages se pratiquent dans la bande côtière. La plaisance, la plongée et la pêche
professionnelle petit métier se développent sur ce même espace maritime. Le Parc s’investit
pour assurer une cohabitation durable et partagée des différents usagers ainsi qu’à la réduction
des conflits. Soumis à réglementation, le marquage des engins de pêche en mer est un sujet aux
divers enjeux. Ces derniers peuvent être sécuritaires, économiques ou concernant la
préservation et de la gestion de la ressource. Un état des lieux des pratiques de la signalisation
des engins de pêche auprès des professionnels de la pêche a été mené en parallèle d’un tour
d’horizon des usagers et des acteurs sur cette thématique. Avec ce spectre d’acteurs, l’intérêt
est porté sur la réalité des conflits potentiels et ainsi proposer des pistes de solutions adaptées.
Etude de la pêcherie au casier et caractérisation du stock de homard dans les côtes d’Armor,
pour répondre aux attentes des pêcheurs, dans le but d’une gestion plus fine, par Romain PY,
le 16 septembre à 10h30.
Résumé : Pour répondre aux attentes des pêcheurs, nous avons étudié la pêcherie de
caseyeurs costarmoricains. Nous avons étudié une série historique de débarquements de
homards aux casiers dans le département. Des métriques ont été définies pour évaluer cette
pêcherie. Pour caractériser le stock, un protocole d’auto-échantillonnage des homards par les
pêcheurs a été mis en place. Une des finalités de ce stage est de créer un document
individualisé par pêcheur qui regroupe ses informations. Il a fallu rendre accessible les résultats
du stage aux professionnels.
14Contribution à la caractérisation de la pêche de loisir en mer dans les Antilles françaises, par
Solène ROPERS, le 14 septembre à 16h00.
Résumé : Le projet RECREAFISH lancé par Ifremer en 2020 a pour objectif de répondre au
manque de données sur la pêche de loisir aux Antilles françaises. Il se compose de 2 enquêtes
complémentaires : une étude de cadrage et une enquête « carnets de pêche » nécessitant
l’implication de pêcheurs récréatifs volontaires. L’objectif de ces travaux est de proposer une
méthode permettant d’analyser les données issues des carnets de pêche, en s’affranchissant au
maximum des biais liés à la sollicitation de panélistes aux profils variés (modes de pêche,
fréquence des sorties, ...). La méthodologie retenue a été testée sur le panel martiniquais des
premiers mois d’enquêtes (mars, avril et mai 2021). Les résultats préliminaires permettent de
dégager des axes d’amélioration pour la suite de l’enquête qui se déroule sur 12 mois pour
chaque territoire.
Les prud’homies de pêche : d’institution coutumière à acteur de la cogestion. Les conditions
nécessaires pour cette mutation : cas d'étude du Var, par Sara SPADONI, le 15 septembre à
16h00.
Résumé : Les prud’homies de pêche sont des institutions corporatives méditerranéennes
françaises, qui proposent un modèle original de régulation de l'effort de pêche à travers une
gestion portée par les pêcheurs eux-mêmes.
Ces institutions sont aujourd’hui en crise. Cette étude vise à comprendre, pour le territoire
maritime du Var, la perception du rôle des prud’homies et de leurs limites, afin de proposer
une adaptation de leurs outils de gestion, que sont les règlements prud’homaux, pour favoriser,
ainsi, un renouvellement de la légitimité de cette structure dans une cogestion halieutique.
15RESSOURCE PRODUCTION ET VALORISATION HALIEUTIQUE
(PVH)
Étude de l’impact de la perte de la certification MSC par les bolincheurs membres de
l’Association des Bolincheurs de Bretagne pêchant la sardine (Sardina Pilchardus) dans le
Golfe de Gascogne et en Mer d'Iroise sur la filière sardine Française, par Camille BIECHY, le 15
septembre à 10h30.
Résumé : En 2019, les sardines (Sardina Pilchardus) pêchées par les bolincheurs membres de
l’Association des Bolincheurs de Bretagne (ABB) ont perdu la certification MSC. Cette étude vise
à comprendre comment la perte de la certification a impacté les acteurs de la filière sardine
Française. La méthode utilisée consiste à combiner analyse de données et entretiens avec les
professionnels pour discerner les différents niveaux d’impacts et expliquer leur cause.
Création d’un dispositif numérique d’information destiné aux premiers acheteurs dans un
contexte de circuit-court : le cas de Poiscaille, par Thibault LE GUEN, le 15 septembre à 14h00.
Résumé : Les informations collectées par les premiers acheteurs sur les marchandises sont
cruciales pour leur commercialisation. La start-up Poiscaille, acteur majeur dans le e-commerce
des produits halieutiques, travaille sans intermédiaires. De plus, ses engagements quant à la
fraîcheur l’obligent à vendre ses produits en ligne avant même leur réception. Les détails de
pêche transmis par les pêcheurs sont donc décisifs pour informer correctement la clientèle. Or,
dans un contexte de croissance forte, synonyme de charge de travail accrue, les acheteurs ont
un souhait : recevoir les informations produits dans un format numérique. Le but est de
diminuer le temps alloué à la transcription des données, le tout grâce à la technologie et la
coopération des marins partenaires. Pour ce faire, après avoir identifié les besoins de
l'entreprise et ceux des pêcheurs de son réseau, un outil numérique de télédéclaration fut
développé. Enfin, cette étude à conduit à l’élaboration de diverses recommandations destinées
à faciliter le déploiement à venir de ce dispositif.
Concilier valorisation de coproduits et qualités nutritionnelles et organoleptiques :
optimisation d’une rillette de truite fumée, par Perrine MEUNIER, le 16 septembre à 14h00.
Soutenance à Huis clos
Résumé : Le groupe Mytilimer est spécialisé dans les produits de la mer, bruts et transformés.
L’étude s’inscrit dans une mission d’optimisation de la gamme conserverie, portée par une
volonté de retrait des additifs et d’amélioration des valeurs nutritionnelles. Seul le travail
effectué sur la rillette de truite fumée est présenté. Dans un premier temps des essais de
16plusieurs bases texturantes sans additifs ont été réalisés. Une fois la base texturante validée,
des essais ont été menés sur l’aromatisation de la rillette. A l’issu des expérimentations, deux
recettes ont été retenues : rillette de truite fumée au poivre vert et rillette de truite fumée au
yuzu.
Optimisation des rendements de production : Quelles méthodes de gestion de la
matière première permettent de limiter les pertes ? par Marie NAITALI, le 15 septembre à
16h00.
Résumé : Dans le domaine des conserves de poisson, les pertes de matières sont un enjeu
majeur, d’autant plus fort que le prix de la matière première ne cesse d’augmenter. Cette
mission avait donc pour objectifs de développer et mettre en place des outils de gestion de la
matière afin de limiter les pertes et ainsi augmenter les rendements de production. Tout
d’abord, une analyse des flux et l’identification des points d’amélioration a donné lieu à
l’élaboration d’une méthode kanban afin de faciliter le transfert d’information au secteur de
l’engrillage. Par ailleurs, une adaptation du traitement de la matière (ici la température du
poisson) sur ligne permet de simplifier les conditions de travail des opérateurs et augmenter
les rendements A noter que ce type d’amélioration nécessite un investissement de la part de
l’entreprise, de l’ensemble des collaborateurs et des opérateurs.
Par
17RESSOURCES ET ECOSYSTEMES AQUATIQUES (REA)
Diagnostic de l’état de la pêcherie de Manche Orientale en intégrant la perception des
pêcheurs, par Nicolas ANDRIALOVANIRINA, le 15 septembre à 8h30.
Résumé : La Manche Orientale abrite une importante pêcherie multi spécifique et multi engins.
Malgré la mise en place de plan de gestion à l’initiative de la PCP, les captures sont en
diminution notamment les poissons plats. Afin de remédier à cela, les recommandations des
scientifiques visent à une gestion multi spécifique dans le cadre d’une approche écosystémique.
Dans ce contexte, l’étude de la perception des pêcheurs pourrait améliorer la compréhension
de la dynamique des ressources exploitées. La présente étude a comme objectif de
réaliser un diagnostic de l’état de la pêcherie en Manche Orientale en prenant en compte la
perception des pêcheurs avec d’autres méthodes quantitatives (l’analyse des données de
production et la modélisation écosystémique avec le modèle OSMOSE). L’analyse a montré que
80%desespèceslesplusexploitéesontconnu un changement de régime avec une baisse des
captures sur la période 2007–2014. L’enquête avec les pêcheurs a permis de mieux comprendre
leurs stratégies d’adaptation à l’évolution ressources et a montré que leurs perceptions sont
souvent cohérentes avec l’étude des changements de régime mais aussi avec les
simulations OSMOSE.
Development and comparison of tools to support the assessment of glass eels catch
opportunities, par Mathilde BENEZECH, le 15 septembre à 10h30.
Résumé : Following the decline of glass eel recruitment since the 70s and the implementation
of the Eel Regulation in 2007, France has put in place a Management Plan in 2008 aiming to
reduce fishing mortality on glass eels by 60%. To meet this objective, a Scientific Council has
developed recruitment models to support decision-making in catch quotas setting. However,
since 2015 the objective is no longer reached, raising questions about models' performance and
about assumptions made on past and future recruitment trends. Hence, this study aims to
improve the expertise on the issue of glass eel catches by addressing the limitations of the two
current models by (1) proposing alternative models to the two already existing and (2)
proposing new criteria to evaluate models’ performance. One of the new models proves to be
more appropriate to achieve the management objective while limiting the impact for the
fishery.
18Estimation des taux de migration et de mortalité à partir de marques électroniques : Vers un
modèle d'évaluation spatialisé des stocks de bar européen ? par Edel LHEUREUX, le 14
septembre à 14h00.
Résumé : La méconnaissance de la structuration spatiale de la population de bar européen
(Dicentrarchus labrax) a mené à la réalisation de campagnes de marquages avec des marques
électroniques enregistrant la température et la profondeur. Grâce à ces données, les
trajectoires des individus marqués ont pu être reconstruites. Le but de cette étude est d’utiliser
ces données individuelles dans un modèle de population spatialisé décrivant la dynamique de
poissons marqués. Ce modèle permet l’estimation des migrations saisonnières entre les stocks
et des mortalités par pêche. A terme, ces estimations pourraient être utilisées dans un modèle
de dynamique de population spatialisé afin d’améliorer l’évaluation des stocks de bar
européen de la façade Atlantique.
Caractérisation de la dynamique de dévalaison de l’anguille européenne dans un canal de
drainage camarguais, par Esther MOLLIER, le 15 septembre à 8h30.
Résumé : La migration d’avalaison, ou dévalaison, constitue la dernière phase continentale du
cycle de l’anguille européenne. La compréhension de ce phénomène est essentielle à la réussite
des plans de gestion qui se doivent de garantir un taux d'échappement d'au moins 40% de la
biomasse pristine de pré-adultes. Depuis 1993, la population d’anguilles d’un canal de drainage
camarguais, le canal du Fumemorte, fait l’objet d’un suivi scientifique. À partir des 20 années
de données de capture-marquage-recapture (CMR) et plus récemment celles d’un suivi
télémétrique par radio-identification (Radio Frequency Identification – RFID) permettant de
suivre les déplacements des anguilles dans le canal, le patron de migration de l'anguille
européenne a été étudié. En s'appuyant sur des modèles bayésiens, l'analyse de l'influence du
mois, de l’année et des facteurs environnementaux permet de mieux comprendre la
dynamique de cette espèce au sein d'un habitat encore trop peu étudié.
Gradients de variabilité spatiale et inter-annuelle de la diversité taxinomique et fonctionnelle
zooplanctonique dans le golfe du lion, par Amélie NITHARD, le 16 septembre à 16h00.
Résumé : Le plancton se trouve à la base du réseau trophique et a une importance primordiale
dans la régulation des écosystèmes. Les communautés zooplanctoniques constituent
également de très bons indicateurs de changements environnementaux. Le but principal de ce
stage est donc d’étudier la distribution des communautés zooplanctoniques d’été de 2013-2019
dans le golfe du Lion. Dans un premier temps il s’agit de définir les groupes taxinomiques
et fonctionnels majeurs du golfe du Lion puis d’étudier leur variabilité spatiale et temporelle
(interannuelle). Puis de déterminer parmi ces groupes lesquels sont les plus sensibles aux
changements environnementaux tels que la température, la salinité, les vents, la concentration
19en chlorophylle a, etc. Cela permettrait d’identifier des groupes et/ou des zones d’intérêt pour
la surveillance des milieux marins et du maintien du Bon Etat Ecologique (BEE) dans le cadre du
programme Habitat Pélagique, mis en place par la DCSMM (Directive Cadre pour la Surveillance
des Milieux Marins).
La modification des engins de pêches peut-elle réduire l'impact de la pêche
sur les ressources halieutiques ? - Cas d’étude de la mer du nord, par Thomas OUTREQUIN, le
16 septembre à 14h00.
Résumé : La réglementation portant sur les engins de pêche est parfois considérée comme
d’importance secondaire. Elle détermine pourtant le niveau d’impact à l’échelle de chacun des
stocks exploités et à l’échelle de l’écosystème. Dans la présente étude on montre qu’elle
pourrait constituer un premier pas vers l’Approche écosystémique de pêches (AEP). L’étude
porte sur la mer du nord, à l’échelle de l’écosystème. Elle a été réalisée à l’aide d’un modèle
d’interaction entre flottilles (modèle FLBEIA), et sur 9 stocks d’importance halieutique forte.
On montre ainsi qu’une nette augmentation des maillages conduit à une réduction globale de
l’impact de la pêche. Des règles de de compromis possibles, entre maximisation des captures
et minimisation des impacts, sont identifiées.
Investigating temporal and spatial impacts of mixed fisheries’ fleets on the Celtic Sea
ecosystem in the frame of climate change through trophic modeling, par Mikaela POTIER, le
16 septembre à 16h00.
Résumé : Nowadays, climate change (CC) and fisheries have visible impacts on marine
ecosystems. Ecosystem modeling, as the Ecopath with Ecosim (EwE) framework, is a key tool to
study those impacts and to think about an ecosystem approach to fisheries. This study focuses
on the Celtic Sea, a shelf ecosystem exploited for centuries by many countries, which is an area
of highly “mixed fisheries”: one gear type can fish many different species. The existence of
mixed fisheries leads to thinking not of a management by single-species quotas but of a
management by fishing fleets. An ecosystem model already exists for this area but does not
take into account the complexity of mixed fisheries. The aim of this study is to modify this
model to include a finer definition of Celtic Sea fleets in order to study the impacts of each fleet
on the Celtic Sea and their interactions via the food web in the frame of CC. The new model is
here used to simulate different CC and fisheries management scenarios and to investigate the
temporal and spatial impact of scenarios through different ecosystem indicators.
20Modélisation de la distribution spatiale de la sardine du Golfe de Gascogne (Sardina
pilchardus) par intégration de données commerciales et scientifiques : enjeux et limites, par
Florian QUEMPER, le 14 septembre à 16h00.
Résumé : En vue d’assurer une gestion durable des ressources marines, une connaissance fine
de la dynamique spatio-temporelle des espèces exploitées est nécessaire. Les campagnes
scientifiques fournissent des données standardisées afin de nourrir les modèles de distribution
d’espèce. Néanmoins, l’information apportée par ces données reste limitée puisque
l’échantillonnage est restreint dans le temps et dans l’espace. Les données de débarquements
(logbooks) couplées aux données de position des navires de pêche (VMS) constituent une
source d’information additionnelle qui peut être mobilisée pour cartographier la distribution
des espèces à une résolution spatio-temporelle fine. Le développement d’un modèle spatio-
temporel combinant les deux sources de données et prenant en compte le comportement de
ciblage des pêcheurs a déjà permis d’inférer la distribution de plusieurs espèces bentho-
démersales du golfe de Gascogne (GdG - e.g. la sole, la baudroie, le merlan). Cette étude vise à
évaluer l’intérêt de l’approche intégrée dans le cas d’une espèce pélagique (la sardine du GdG),
dont l’écologie, la dynamique de flottille et la nature des données de campagne diffèrent des
cas étudiés jusqu’à maintenant.
Nous présentons les défis méthodologiques propres à l’application de l’approche intégrée au
cas de la sardine du GdG - flottilles côtières, comportement de ciblage important, saisonnalité
des pêcheries -, et le modèle utilisé pour combiner les différentes sources de données et
cartographier la sardine. Sur les mois de campagne, les cartes sont essentiellement drivées par
les données scientifiques. En dehors de ces mois, les données commerciales apportent de
l’information dans le rayon d’action des flottilles. Toutefois, une grande partie de la zone
d’étude n’est pas recouverte par les flottilles commerciales et
les cartes obtenues fournissent une image partielle de la distribution de la sardine.
Evaluation de la robustesse d’un modèle conceptuel, synthèse de représentations diverses de
la mer de Barents et exploration de scénarios par des méthodes qualitatives, par Arthur
VALANCE, le 15 septembre à 14h00.
Résumé : La modélisation qualitative est performante pour l’analyse de systèmes possédant de
nombreux compartiments regroupés en secteurs variés et entretenant des interactions
multiples et souvent complexes. Dans le cadre du plan de gestion intégrée de la mer de
Barents, cette modélisation est un outil offrant des perspectives intéressantes pour la
construction de modèles conceptuels socio-écologiques, inspirés des points de vue divers des
parties prenantes Ce mémoire s’intéresse d’abord aux effets de scénarios combinés appliqués
à un modèle commun résumant les points de vue divers des parties prenantes. La sensibilité
de ce modèle est ensuite testée par rapport à l’ajout de connexions incertaines et une
comparaison avec les modèles individuels est explorée. Nous montrons que le modèle
commun est assez robuste aux incertitudes et qu’il résume relativement bien les diverses
représentations de la mer de Barents.
21Vous pouvez aussi lire
