PLATEFORME ESA : EXEMPLE DE LA SURVEILLANCE DES VIRUS INFLUENZA PORCINS - Laure Dommergues, La Coopération agricole Gaëlle Simon, Anses
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PLATEFORME ESA : EXEMPLE DE LA SURVEILLANCE DES VIRUS INFLUENZA PORCINS Laure Dommergues, La Coopération agricole Gaëlle Simon, Anses Les Plateformes d’épidémiosurveillance 1 22/03/2022
Problématiques liées à la grippe chez le porc Santé Animale Santé Publique ✓ Bien-être, performances, usage de ✓ Zoonose médicaments, persistance dans certains élevages ✓ Gravité similaire à la grippe saisonnière, + fréquent pour les personnes travaillant au ✓ Zoonose inverse contact des porcs ✓ Co-circulations de plusieurs sous-types viraux ✓ Risque pandémique → émergences de nouveaux virus réassortants Les Plateformes d’épidémiosurveillance 2 22/03/2022
A l’origine de la surveillance • 2009 : pandémie à virus influenza A multi-réassortant d’origine porcine Virus H1N1pdm jamais détecté chez le porc avant d’émerger chez l’Homme Défaut de surveillance OIE/FAO/OMS : appel à une meilleure surveillance des virus influenza porcins Création du Laboratoire National de Référence Influenza Porcin à l’Anses Regroupement des acteurs de la santé animale en France • 2011 : Résavip opérationnel • 2013 : Appui de la plateforme ESA Réseau national de surveillance Le tout sans contrainte règlementaire des virus influenza A chez le porc Les Plateformes d’épidémiosurveillance 3 22/03/2022
Objectifs du réseau Améliorer les connaissances virologiques et épidémiologiques Décrire la diversité et la dynamique des virus influenza A Être réactif pour une action ciblée si circulant chez le porc en France nécessaire métropolitaine Orienter les travaux de recherche Les Plateformes d’épidémiosurveillance 4 22/03/2022
Un dispositif de surveillance évènementielle • Dans les élevages, chaque année • 70 vétérinaires bénévoles • 300 visites d’élevages (avec signes cliniques sur les porcs) • En région • Animateurs régionaux • Laboratoires agréés (diagnostic de 1ère intention) • Au niveau national • Coordination du réseau par LCA • Analyses de 2ème intention au LNR IP pour identifier les virus détectés • Financement des analyses de 1ère intention par l’Etat Les Plateformes d’épidémiosurveillance 5 22/03/2022
Résavip dans la plateforme ESA : le Groupe de Suivi Virus Influenza Porcins • Groupe de travail multidisciplinaire Aider Résavip à atteindre ses objectifs Proposer des évolutions de fonctionnement (validation nécessaire par le Copil ESA) Validation technique et scientifique des contenus Organisation d’évènements au nom de Résavip → diffusion d’information Les Plateformes d’épidémiosurveillance 6 22/03/2022
Le LNR Influenza Porcin, Unité Virologie Immunologie Porcines (UVIP) Anses-Ploufragan, au cœur de la surveillance Epidémiosurveillance Recherche Identification des virus (2ème intention) Caractérisations approfondies (3ème intention) + Analyses des données de virologie et Evolutions virales d’épidémiologie Transmissions intra-/inter-espèce Bilans nationaux multi-sources Interactions hôte-pathogène Enquêtes sérologiques Complexe Respiratoire Porcin Expertise Réseaux internationaux Référence Réseau de laboratoires agréés Développement Contrôles de réactifs & matériaux Outils de diagnostic Appui scientifique & technique Méthodes pour la recherche Les Plateformes d’épidémiosurveillance 7 22/03/2022
Suivi des évolutions virales en aval de la surveillance diversité virale croissante et transmissions inter-espèces H1N1 H1N1pdm H1avN2 #E HA H1N2 NA H3N2 swIAV = virus à ARN segmenté Dérives antigéniques pandémie Réassortiments génétiques H1N1pdm H1avN2 #E H1avN1 H1huN2 H1huN2v ?? H1avN2 H3N2 H1avN2#E, A, B H1huN1 H1avN2#F H1avN2#E H1avN1#A, B, C, D H1huN2#A, C H1avN1 #A, B, C, D Evolutions virales in situ Réassortants avec gènes du H1N1pdm#A, B H1huN2 #A, B, C 2 lignages enzootiques H1N1pdm H1pdmN1#A, B H1avN2 #A, B, C, D, E, F 4 génotypes H1pdmN2 Nouveau virus majoritaire H1huN1 Co-infections, Réassortiments H3N2#A, B Evolutions ? H1N1pdm Evolutions virales in situ + importations X ? lignages enzootiques H1pdmN1 3 lignages enzootiques X ? génotypes H3N2 17 génotypes Les Plateformes d’épidémiosurveillance 8 22/03/2022
Surveillance des swIAV au service de la Santé Publique - infection zoonotique H1avN2 #E ✓ Août 2021, un patient en réanimation SARS-CoV-2 négatif ; IAV positif mais sous-type indéterminé > séquençage au Centre National de Référence des virus respiratoires (CNR) ✓ Virus A/H1N2v (humain) très proche du virus H1avN2 #E (porcin) préalablement identifié par le LNR IP Informations virologiques, épidémiologiques et diagnostiques fournies au CNR et à Santé Publique France (SPF) Exposition supposée : intervention ponctuelle dans un élevage 4 jours avant le début des symptômes ✓ Enquêtes épidémiologiques - chez l’Homme (SPF/CNR) : personnes co-exposées et contacts > pas de transmission inter-humaine - dans l’élevage incriminé (Anses) : passage d’un virus H1avN2 #E à une période incluant la date d’exposition ✓ Infection zoonotique au sein d’un élevage contaminé sans expression clinique chez les porcs Signalements à l’OMS et l’ECDC (CNR/SPF) et au réseau OFFLU (OIE/FAO) (LNR) Les Plateformes d’épidémiosurveillance 9 22/03/2022
Conséquences immédiates de l’infection zoonotique ✓ Révision des questionnaires relatifs aux expositions aux animaux en cas de suspicion de grippe zoonotique (SPF) ✓ Information de la filière porcine et de Résavip en amont du communiqué de presse de l’Agence Régionale de Santé (DGAl, LNR IP) ✓ Saisines conjointes DGAl-DGS - vers la e HCSP et la HAS : EPI, définition et prise en charge des cas d’infections zoonotiques, vaccination - vers l’Anses : évaluation des risques pour la santé animale et pour la santé publique Faire évoluer le fonctionnement de Résavip? ✓ Renforcer l’implication des laboratoires vétérinaires via la réalisation des analyses de 2ème intention ✓ Nécessité de réaliser des analyses de 3ème intention pour caractériser les virus identifiés ✓ Renforcer les échanges avec les acteurs de la surveillance de la grippe chez l’Homme Les Plateformes d’épidémiosurveillance 10 22/03/2022
Conclusion • Points forts ✓ Objectifs de Résavip atteints : connaissances ↗, communication au sein de la filière ✓ Ancrage de Résavip sur le terrain en élevage : réseau mobilisable ✓ Plus de 10 ans de fonctionnement malgré l’absence de contrainte réglementaire • Pistes d’amélioration ✓ Définition de critères d’alerte vis-à-vis d’un virus influenza porcin émergent pouvant constituer un nouveau danger pour la santé animale et/ou la santé publique ✓ Poursuivre le rapprochement entre SPF et le GS-VIP ✓ Identifier des modalités de financement pérennes du dispositif Les Plateformes d’épidémiosurveillance 11 22/03/2022
Remerciements GS-VIP Céline Dupuy Séverine Hervé Nicolas Rose Gaëlle Simon Laure Dommergues Emmanuel Garin Et 1911 éleveurs Olivier Toulouse 171 vétérinaires bénévoles Sébastien Wendling 16 animateurs régionaux Alexandra Grasteau 8 laboratoires agréés 1 laboratoire de référence Les Plateformes d’épidémiosurveillance 12 22/03/2022
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